SitesBLAST

SitesBLAST – Find functional sites

SitesBLAST

Comparing WP_020176204.1 NCBI__GCF_000385335.1:WP_020176204.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A9C5 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
65% identity, 100% coverage: 3:469/469 of query aligns to 2:469/469 of P0A9C5

query
sites
P0A9C5

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Y398 (= Y398) modified: O-AMP-tyrosine

Sites not aligning to the query:

1 modified: Initiator methionine, Removed

P0A1P6 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
64% identity, 100% coverage: 3:469/469 of query aligns to 2:469/469 of P0A1P6

query
sites
P0A1P6

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E130 (= E131) binding Mn(2+)
E132 (= E133) binding Mn(2+)
E208 (= E209) binding ATP
E213 (= E214) binding Mn(2+)
E221 (= E221) binding Mn(2+)
NG 265:266 (= NG 265:266) binding L-glutamate
H270 (= H270) binding Mn(2+)
HMS 272:274 (≠ HQS 272:274) binding ATP
R322 (= R322) binding L-glutamate
E358 (= E358) binding Mn(2+)
R360 (= R360) binding L-glutamate

1fpyA Crystal structure of glutamine synthetase from salmonella typhimurium with inhibitor phosphinothricin (see paper)
64% identity, 100% coverage: 3:469/469 of query aligns to 1:468/468 of 1fpyA

query
sites
1fpyA

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binding adenosine-5'-diphosphate: G127 (= G129), E129 (= E131), E207 (= E209), T223 (≠ L224), F225 (= F226), H271 (= H272), S273 (= S274), R355 (= R356), E357 (= E358)
binding manganese (ii) ion: E129 (= E131), E131 (= E133), E212 (= E214), E220 (= E221), H269 (= H270), E357 (= E358)
binding phosphinothricin: E131 (= E133), E212 (= E214), G265 (= G266), H269 (= H270), R321 (= R322), E327 (= E328), R359 (= R360)

1f1hA Crystal structure of glutamine synthetase from salmonella typhimurium with thallium ions (see paper)
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1f1hA

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binding adenosine-5'-diphosphate: E129 (= E131), E207 (= E209), H210 (= H212), E220 (= E221), T223 (≠ L224), F225 (= F226), H271 (= H272), S273 (= S274), R355 (= R356)
binding manganese (ii) ion: E129 (= E131), E131 (= E133), E212 (= E214), E220 (= E221), H269 (= H270), E357 (= E358)

P77961 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa)
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P77961

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2lgsA Feedback inhibition of fully unadenylylated glutamine synthetase from salmonella typhimurium by glycine, alanine, and serine (see paper)
60% identity, 100% coverage: 3:469/469 of query aligns to 1:445/445 of 2lgsA

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2lgsA

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binding glutamic acid: E125 (= E133), N258 (= N265), G259 (= G266), G261 (= G268), H263 (= H270), R315 (= R322), R349 (= R360)
binding manganese (ii) ion: E123 (= E131), E125 (= E133), E206 (= E214), E214 (= E221), H263 (= H270), E347 (= E358)

1lgrA Interactions of nucleotides with fully unadenylylated glutamine synthetase from salmonella typhimurium (see paper)
60% identity, 100% coverage: 3:469/469 of query aligns to 1:445/445 of 1lgrA

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1lgrA

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binding adenosine monophosphate: E201 (= E209), T217 (≠ L224), F219 (= F226), H265 (= H272), S267 (= S274), R345 (= R356)
binding manganese (ii) ion: E123 (= E131), E125 (= E133), E206 (= E214), E214 (= E221), H263 (= H270), E347 (= E358)

3ng0A Crystal structure of glutamine synthetase from synechocystis sp. Pcc 6803
58% identity, 100% coverage: 2:469/469 of query aligns to 1:465/465 of 3ng0A

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active site: D51 (= D52), E130 (= E131), E132 (= E133), E213 (= E214), E221 (= E221), H270 (= H270), R340 (= R340), E359 (= E358), R361 (= R360)
binding phosphoaminophosphonic acid-adenylate ester: Y126 (= Y127), E130 (= E131), K209 (= K210), I224 (≠ L224), F226 (= F226), H272 (= H272), S274 (= S274), R340 (= R340), R345 (= R345), R357 (= R356)
binding manganese (ii) ion: E130 (= E131), E132 (= E133), E213 (= E214), E221 (= E221), H270 (= H270), E359 (= E358), R361 (= R360)

A0R079 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
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A0R079

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K14 (= K12) modified: Isoglutamyl lysine isopeptide (Lys-Gln) (interchain with Q-Cter in protein Pup)

2whiA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with a purine analogue inhibitor and l-methionine-s- sulfoximine phosphate. (see paper)
52% identity, 100% coverage: 2:469/469 of query aligns to 2:476/476 of 2whiA

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2whiA

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