SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_022529842.1 NCBI__GCF_000469325.1:WP_022529842.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 1 hits to proteins with known functional sites (download)

P69831 PTS system galactitol-specific EIIC component; EIIC-Gat; Galactitol permease IIC component from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 6:448/465 of query aligns to 4:437/451 of P69831

query
sites
P69831
D
 
E
A
 
V
I
 
M
M
 
R
Y
 
Y
I
 
I
V
 
L
N
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
T
V
 
V
M
 
M
I
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
V
M
 
I
L
 
I
I
 
I
F
 
F
G
 
S
L
 
K
C
 
I
M
 
L
R
 
G
V
 
M
P
 
K
F
 
A
S
 
G
K
 
D
A
 
C
L
 
F
R
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
H
V
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
G
F
 
F
I
 
V
G
 
G
L
 
I
N
 
G
A
 
L
T
 
V
V
 
I
S
 
G
I
 
L
L
 
M
T
 
L
S
 
D
V
 
S
M
 
I
N
 
G
P
 
P
A
 
A
I
 
A
K
 
K
N
 
A
M
 
M
I
 
A
A
 
E
I
 
N
A
 
F
H
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
H
V
 
V
I
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
P
 
P
S
 
G
A
 
S
S
 
S
A
 
P
I
 
M
A
 
T
Y
 
W
G
 
A
T
 
S
A
 
Q
V
 
I
G
 
A
V
 
L
S
 
V
M
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
I
 
V
I
 
A
M
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
Q
 
R
T
 
M
T
 
T
Q
 
R
T
 
V
I
 
V
D
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
I
W
 
W
D
 
N
F
 
I
W
 
W
H
 
H
F
 
M
A
 
T
F
 
F
S
 
T
G
 
G
S
 
A
L
 
L
V
 
L
Y
 
H
Q
 
L
L
 
A
T
 
T
H
 
G
D
 
S
I
 
W
V
 
M
L
 
I
S
 
G
L
 
M
F
 
A
L
 
G
A
 
V
S
 
V
V
 
I
N
 
H
M
 
A
I
 
A
V
 
F
I
 
V
M
 
Y
V
 
K
I
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
W
M
 
F
A
 
A
P
 
R
L
 
D
S
 
T
E
 
R
K
 
N
Y
 
F
L
 
F
N
 
E
L
 
L
P
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
A
I
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
Y
 
T
A
 
S
G
 
A
S
 
Y
F
 
M
V
 
G
P
 
P
S
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
L
I
 
V
N
 
D
W
 
A
I
 
I
L
 
I
E
 
E
R
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
R
I
 
I
H
 
K
L
 
F
N
 
S
A
 
A
E
 
D
D
 
D
F
 
I
N
 
Q
K
 
R
R
 
K
F
 
F
G
 
G
D
 
P
W
 
F
G
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
V
L
 
T
L
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
V
I
 
M
G
 
G
C
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
I
I
 
L
A
 
A
Y
 
G
V
 
Y
A
 
D
A
 
V
P
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
L
 
L
L
 
Q
M
 
L
G
 
A
V
 
V
T
 
K
L
 
T
S
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
M
V
 
L
I
 
L
T
 
M
P
 
P
K
 
R
M
 
V
A
 
I
A
 
K
L
 
P
L
 
I
L
 
M
Q
 
D
G
 
G
V
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
I
S
 
A
N
 
K
A
 
Q
I
 
A
T
 
R
G
 
S
W
 
R
T
 
L
Q
 
Q
K
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
G
 
G
K
 
Q
R
 
E
K
 
F
L
 
L
Y
 
-
I
 
I
G
 
G
M
 
L
D
 
D
T
 
P
A
 
A
V
 
L
G
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
H
P
 
T
V
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
S
C
 
A
A
 
S
T
 
L
L
 
I
M
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
T
L
 
I
I
 
L
F
 
I
A
 
A
F
 
V
I
 
C
L
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
F
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
F
I
 
G
G
 
D
L
 
L
V
 
A
G
 
T
F
 
I
V
 
G
F
 
F
M
 
F
F
 
V
P
 
A
L
 
M
I
 
A
V
 
V
S
 
A
V
 
V
V
 
H
H
 
R
G
 
G
D
 
N
F
 
L
F
 
F
R
 
R
S
 
T
F
 
L
I
 
I
I
 
S
G
 
G
A
 
V
I
 
I
N
 
I
V
 
M
I
 
S
L
 
I
G
 
T
L
 
L
W
 
W
I
 
I
G
 
A
T
 
T
N
 
Q
L
 
T
A
 
I
P
 
G
L
 
L
I
 
H
T
 
T
K
 
Q
-
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
N
A
 
A
A
 
G
K
 
A
F
 
L
P
 
-
I
 
-
P
 
-
K
 
K
G
 
A
S
 
G
S
 
G
L
 
M
I
 
V
S
 
A
S
 
S
I
 
M
D
 
D
H
 
Q
G
 
G
S
 
G
D
 
S
P
 
P
F
 
I
P
 
T
W
 
W
L
 
L
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
-
 
F
-
 
S
-
 
P
A
 
Q
N
 
N
Y
 
I
K
 
P
W
 
G
L
 
F
A
 
I
Y
 
I
I
 
I
L
 
G
G
 
A
I
 
I
A
 
Y
L
 
L
C
 
T
A
 
G
V
 
I
L
 
F
V
 
M
L
 
T
W
 
W
N
 
R
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_022529842.1 NCBI__GCF_000469325.1:WP_022529842.1
MKYIVDAIMYIVNLGPTVMIPIVMLIFGLCMRVPFSKALRGGLMVGIGFIGLNATVSILT
SVMNPAIKNMIAIAHINLKVIDVGWPSASAIAYGTAVGVSMIPLGILINIIMLLTQTTQT
IDVDIWDFWHFAFSGSLVYQLTHDIVLSLFLASVNMIVIMVIADRMAPLSEKYLNLPGIS
IPHGYAGSFVPSAIVINWILERIPGVNKIHLNAEDFNKRFGDWGEPTLLGFVIGCIIGAI
AYVAAPGVSIPDKVGKILLMGVTLSAVMVITPKMAALLLQGVVPVSNAITGWTQKKFSGK
RKLYIGMDTAVGIGSPVVLACATLMIPVALIFAFILPGNQFLPTIGLVGFVFMFPLIVSV
VHGDFFRSFIIGAINVILGLWIGTNLAPLITKAARAAKFPIPKGSSLISSIDHGSDPFPW
LLVQVANYKWLAYILGIALCAVLVLWNRHHIVADAKAGAAKADAQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory