SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_022601414.1 NCBI__GCF_000473955.1:WP_022601414.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q168G2 Propionyl-CoA carboxylase beta chain; EC 6.4.1.3 from Roseobacter denitrificans (strain ATCC 33942 / OCh 114) (Erythrobacter sp. (strain OCh 114)) (Roseobacter denitrificans) (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:517/517 of query aligns to 1:510/510 of Q168G2

query
sites
Q168G2
M
 
M
S
 
K
N
 
D
Q
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
Q
V
 
L
K
 
E
E
 
D
L
 
R
I
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
R
 
R
I
 
I
E
 
D
S
 
A
Q
 
Q
H
 
H
K
 
G
K
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
V
S
 
D
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
F
D
 
D
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
 
T
H
 
H
R
 
R
S
 
C
V
 
T
N
 
D
F
 
F
G
 
N
I
 
M
D
 
Q
K
 
D
E
 
Q
S
 
K
Y
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
W
G
|
G
T
 
T
I
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
V
S
 
S
E
 
E
T
 
T
F
 
H
A
 
S
M
 
K
K
 
K
I
 
I
C
 
C
K
 
K
I
 
I
M
 
M
D
 
D
Q
 
M
A
 
A
M
 
M
K
 
Q
M
 
N
G
 
G
A
|
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
N
D
 
D
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
E
 
E
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
N
 
N
I
 
I
L
 
M
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
V
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
M
I
 
I
F
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
M
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
I
I
 
F
M
 
M
T
 
V
R
 
K
G
 
D
T
 
S
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
F
 
F
L
 
V
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
N
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
T
 
S
Q
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
T
H
 
H
A
 
T
T
 
R
K
 
K
S
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
A
H
 
D
F
 
A
A
 
A
V
 
F
D
 
E
T
 
N
E
 
D
E
 
V
D
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
A
L
 
E
I
 
V
R
 
R
H
 
R
L
 
L
M
 
V
S
 
D
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
N
 
N
N
 
N
M
 
R
E
 
E
E
 
K
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
R
D
 
P
C
 
F
E
 
F
D
 
D
P
 
D
I
 
P
D
 
D
R
 
R
L
 
I
E
 
E
D
 
P
S
 
S
L
 
L
N
 
D
D
 
T
I
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
D
E
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
T
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
Y
 
K
E
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
H
A
 
K
I
 
L
I
 
A
D
 
D
N
 
E
G
 
G
E
 
D
F
 
F
L
 
Y
E
 
E
V
 
I
H
 
Q
K
 
E
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
I
R
 
R
F
 
L
N
 
E
G
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
L
K
 
V
M
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
C
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
D
A
 
S
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
E
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
T
 
T
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
S
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
M
V
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
T
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
C
 
V
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
R
G
 
A
D
 
D
V
 
F
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
T
E
 
E
V
 
I
I
 
I
F
 
H
A
 
R
K
 
G
E
 
D
V
 
L
A
 
G
A
 
D
S
 
P
E
 
E
N
 
K
P
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
I
A
 
A
E
 
Q
K
 
H
E
 
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
Y
K
 
E
K
 
E
V
 
R
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
N
 
V
A
 
A
A
 
S
R
 
E
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
Q
P
 
P
R
 
R
N
 
S
T
 
T
R
 
R
F
 
K
R
 
R
I
 
V
I
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
Q
 
A
Q
 
S
L
 
L
Q
 
R
T
 
N
K
 
K
K
 
S
L
 
V
T
 
Q
N
 
M
P
 
P
A
 
W
K
 
K
K
 
K
H
 
H
D
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

3n6rB Crystal structure of the holoenzyme of propionyl-coa carboxylase (pcc) (see paper)
62% identity, 99% coverage: 8:517/517 of query aligns to 1:506/506 of 3n6rB

query
sites
3n6rB
V
 
L
K
 
E
E
 
Q
L
 
L
I
 
E
A
 
D
L
 
R
R
 
R
E
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
R
 
R
I
 
I
E
 
D
S
 
A
Q
 
Q
H
 
H
K
 
G
K
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
V
S
 
D
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
F
D
 
D
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
 
T
H
 
H
R
 
R
S
 
C
V
 
T
N
 
D
F
 
F
G
 
N
I
 
M
D
 
Q
K
 
D
E
 
Q
S
 
K
Y
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
W
G
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
V
S
 
S
E
 
E
T
 
T
F
 
H
A
 
S
M
 
K
K
 
K
I
 
I
C
 
C
K
 
K
I
 
I
M
 
M
D
 
D
Q
 
M
A
 
A
M
 
M
K
 
Q
M
 
N
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
N
D
 
D
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
|
A
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
E
 
E
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
N
 
N
I
 
I
L
 
M
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
V
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
M
I
 
I
F
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
M
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
I
I
 
F
M
 
M
T
 
V
R
 
K
G
 
D
T
 
S
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
F
 
F
L
 
V
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
N
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
T
 
S
Q
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
T
H
 
H
A
 
T
T
 
R
K
 
K
S
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
A
H
 
D
F
 
A
A
 
A
V
 
F
D
 
E
T
 
N
E
 
D
E
 
V
D
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
A
L
 
E
I
 
V
R
 
R
H
 
R
L
 
L
M
 
V
S
 
D
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
N
 
N
N
 
N
M
 
R
E
 
E
E
 
K
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
R
D
 
P
C
 
F
E
 
F
D
 
D
P
 
D
I
 
P
D
 
D
R
 
R
L
 
I
E
 
E
D
 
P
S
 
S
L
 
L
N
 
D
D
 
T
I
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
D
E
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
T
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
Y
 
K
E
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
H
A
 
K
I
 
L
I
 
A
D
 
D
N
 
E
G
 
G
E
 
D
F
 
F
L
 
Y
E
 
E
V
 
I
H
 
Q
K
 
E
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
I
R
 
R
F
 
L
N
 
E
G
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
L
K
 
V
M
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
C
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
D
A
 
S
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
E
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
T
 
T
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
|
F
L
 
L
P
|
P
G
 
G
T
 
T
G
 
S
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
M
V
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
T
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
C
 
V
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
R
G
 
A
D
 
D
V
 
F
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
T
E
 
E
V
 
I
I
 
I
F
 
H
A
 
R
K
 
G
E
 
D
V
 
L
A
 
G
A
 
D
S
 
P
E
 
E
N
 
K
P
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
I
A
 
A
E
 
Q
K
 
H
E
 
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
Y
K
 
E
K
 
E
V
 
R
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
N
 
V
A
 
A
A
 
S
R
 
E
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
Q
P
 
P
R
 
R
N
 
S
T
 
T
R
 
R
F
 
K
R
 
R
I
 
V
I
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
Q
 
A
Q
 
S
L
 
L
Q
 
R
T
 
N
K
 
K
K
 
S
L
 
V
T
 
Q
N
 
M
P
 
P
A
 
W
K
 
K
K
 
K
H
 
H
D
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

8xl5B Structure of human propionyl-coa carboxylase in complex with propionyl-coa (pcc-pco)
63% identity, 97% coverage: 15:517/517 of query aligns to 11:507/507 of 8xl5B

query
sites
8xl5B
R
 
R
E
 
R
Q
 
T
A
 
A
R
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I
E
 
D
S
 
A
Q
 
Q
H
 
H
K
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
P
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
V
E
 
E
I
 
S
D
 
D
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
R
S
 
C
V
 
A
N
 
D
F
 
F
G
 
G
I
 
M
-
 
A
-
 
A
D
 
D
K
 
K
E
 
N
S
 
K
Y
 
F
L
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
F
|
F
T
 
T
V
 
V
F
 
F
G
|
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
S
E
 
G
T
 
A
F
 
H
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
I
 
I
C
 
C
K
 
K
I
 
I
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
T
M
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
S
 
S
G
|
G
G
|
G
A
|
A
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
Q
 
L
R
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
L
I
 
I
F
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
|
A
G
|
G
G
|
G
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
T
I
 
F
M
 
M
T
 
V
R
 
K
G
 
D
T
 
T
S
 
S
Y
 
Y
M
 
L
F
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
N
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
T
H
 
H
A
 
T
T
 
T
K
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
R
A
 
A
V
 
F
D
 
E
T
 
N
E
 
D
E
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
L
K
 
C
L
 
N
I
 
L
R
 
R
H
 
D
L
 
F
M
 
F
S
 
N
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
N
 
S
N
 
S
M
 
Q
E
 
D
E
 
P
P
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
R
D
 
E
C
 
C
E
 
H
D
 
D
P
 
P
I
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
V
D
 
P
S
 
E
L
 
L
N
 
D
D
 
T
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
L
E
 
E
P
 
S
N
 
T
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
M
 
M
Y
 
V
E
 
D
V
 
I
I
 
I
G
 
H
A
 
S
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
E
G
 
R
E
 
E
F
 
F
L
 
F
E
 
E
V
 
I
H
 
M
K
 
P
D
 
N
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
F
 
M
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
V
A
 
G
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
K
K
 
V
M
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
C
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
S
S
 
S
R
 
V
K
 
K
A
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
F
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
G
|
G
F
|
F
L
 
L
P
|
P
G
 
G
T
 
T
G
 
A
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
R
H
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
F
G
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
T
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
Y
G
|
G
G
|
G
A
 
A
Y
 
Y
C
 
D
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
C
G
 
G
D
 
D
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
|
V
M
 
M
G
 
G
P
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
K
A
 
G
S
 
H
E
 
E
N
 
N
P
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
I
K
 
E
V
 
K
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
N
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
V
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
E
 
Q
P
 
P
R
 
S
N
 
S
T
 
T
R
 
R
F
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
C
R
 
C
A
 
D
L
 
L
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
T
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
Q
N
 
R
P
 
P
A
 
W
K
 
R
K
 
K
H
 
H
D
 
A
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

8xl4B Structure of human propionyl-coa carboxylase in complex with acetyl- coa (pcc-aco)
63% identity, 97% coverage: 15:517/517 of query aligns to 11:507/507 of 8xl4B

query
sites
8xl4B
R
 
R
E
 
R
Q
 
T
A
 
A
R
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I
E
 
D
S
 
A
Q
 
Q
H
 
H
K
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
P
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
V
E
 
E
I
 
S
D
 
D
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
R
S
 
C
V
 
A
N
 
D
F
 
F
G
 
G
I
 
M
-
 
A
-
 
A
D
 
D
K
 
K
E
 
N
S
 
K
Y
 
F
L
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
F
|
F
T
 
T
V
 
V
F
|
F
G
|
G
G
 
G
S
|
S
L
 
L
S
 
S
E
 
G
T
 
A
F
 
H
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
I
 
I
C
 
C
K
 
K
I
 
I
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
T
M
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
S
 
S
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
Q
 
L
R
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
L
I
 
I
F
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
G
|
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
T
I
 
F
M
 
M
T
 
V
R
 
K
G
 
D
T
 
T
S
 
S
Y
 
Y
M
 
L
F
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
N
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
T
H
 
H
A
 
T
T
 
T
K
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
R
A
 
A
V
 
F
D
 
E
T
 
N
E
 
D
E
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
L
K
 
C
L
 
N
I
 
L
R
 
R
H
 
D
L
 
F
M
 
F
S
 
N
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
N
 
S
N
 
S
M
 
Q
E
 
D
E
 
P
P
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
R
D
 
E
C
 
C
E
 
H
D
 
D
P
 
P
I
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
V
D
 
P
S
 
E
L
 
L
N
 
D
D
 
T
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
L
E
 
E
P
 
S
N
 
T
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
M
 
M
Y
 
V
E
 
D
V
 
I
I
 
I
G
 
H
A
 
S
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
E
G
 
R
E
 
E
F
 
F
L
 
F
E
 
E
V
 
I
H
 
M
K
 
P
D
 
N
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
F
 
M
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
V
A
 
G
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
K
K
 
V
M
 
A
A
 
S
G
 
G
V
x
C
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
S
S
 
S
R
 
V
K
 
K
A
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
F
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
|
P
G
|
G
F
|
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
A
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
R
H
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
F
G
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
T
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
C
 
D
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
C
G
 
G
D
 
D
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
K
A
 
G
S
 
H
E
 
E
N
 
N
P
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
I
K
 
E
V
 
K
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
N
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
V
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
E
 
Q
P
 
P
R
 
S
N
 
S
T
 
T
R
 
R
F
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
C
R
 
C
A
 
D
L
 
L
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
T
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
Q
N
 
R
P
 
P
A
 
W
K
 
R
K
 
K
H
 
H
D
 
A
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

8xl3B Structure of human propionyl-coa carboxylase at apo-state (pcc-apo)
63% identity, 97% coverage: 15:517/517 of query aligns to 11:507/507 of 8xl3B

query
sites
8xl3B
R
 
R
E
 
R
Q
 
T
A
 
A
R
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
R
 
R
I
 
I
E
 
D
S
 
A
Q
 
Q
H
 
H
K
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
P
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
V
E
 
E
I
 
S
D
 
D
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
R
S
 
C
V
 
A
N
 
D
F
 
F
G
 
G
I
 
M
-
 
A
-
 
A
D
 
D
K
 
K
E
 
N
S
 
K
Y
 
F
L
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
S
E
 
G
T
 
A
F
 
H
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
I
 
I
C
 
C
K
 
K
I
 
I
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
T
M
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
Q
 
L
R
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
L
I
 
I
F
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
T
I
 
F
M
 
M
T
 
V
R
 
K
G
 
D
T
 
T
S
 
S
Y
 
Y
M
 
L
F
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
N
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
T
H
 
H
A
 
T
T
 
T
K
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
R
A
 
A
V
 
F
D
 
E
T
 
N
E
 
D
E
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
L
K
 
C
L
 
N
I
 
L
R
 
R
H
 
D
L
 
F
M
 
F
S
 
N
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
N
 
S
N
 
S
M
 
Q
E
 
D
E
 
P
P
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
R
D
 
E
C
 
C
E
 
H
D
 
D
P
 
P
I
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
V
D
 
P
S
 
E
L
 
L
N
 
D
D
 
T
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
L
E
 
E
P
 
S
N
 
T
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
M
 
M
Y
 
V
E
 
D
V
 
I
I
 
I
G
 
H
A
 
S
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
E
G
 
R
E
 
E
F
 
F
L
 
F
E
 
E
V
 
I
H
 
M
K
 
P
D
 
N
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
F
 
M
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
V
A
 
G
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
K
K
 
V
M
 
A
A
 
S
G
 
G
V
x
C
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
S
S
 
S
R
 
V
K
 
K
A
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
F
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
|
F
L
 
L
P
|
P
G
 
G
T
 
T
G
 
A
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
R
H
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
F
G
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
T
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
C
 
D
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
C
G
 
G
D
 
D
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
K
A
 
G
S
 
H
E
 
E
N
 
N
P
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
I
K
 
E
V
 
K
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
N
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
V
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
E
 
Q
P
 
P
R
 
S
N
 
S
T
 
T
R
 
R
F
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
C
R
 
C
A
 
D
L
 
L
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
T
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
Q
N
 
R
P
 
P
A
 
W
K
 
R
K
 
K
H
 
H
D
 
A
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

7ybuC Human propionyl-coenzyme a carboxylase (see paper)
63% identity, 97% coverage: 15:517/517 of query aligns to 11:507/507 of 7ybuC

query
sites
7ybuC
R
 
R
E
 
R
Q
 
T
A
 
A
R
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
R
 
R
I
 
I
E
 
D
S
 
A
Q
 
Q
H
 
H
K
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
P
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
V
E
 
E
I
 
S
D
 
D
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
R
S
 
C
V
 
A
N
 
D
F
 
F
G
 
G
I
 
M
-
 
A
-
 
A
D
 
D
K
 
K
E
 
N
S
 
K
Y
 
F
L
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
S
E
 
G
T
 
A
F
 
H
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
I
 
I
C
 
C
K
 
K
I
 
I
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
T
M
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
Q
 
L
R
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
L
I
 
I
F
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
T
I
 
F
M
 
M
T
 
V
R
 
K
G
 
D
T
 
T
S
 
S
Y
 
Y
M
 
L
F
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
N
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
T
H
 
H
A
 
T
T
 
T
K
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
R
A
 
A
V
 
F
D
 
E
T
 
N
E
 
D
E
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
L
K
 
C
L
 
N
I
 
L
R
 
R
H
 
D
L
 
F
M
 
F
S
 
N
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
N
 
S
N
 
S
M
 
Q
E
 
D
E
 
P
P
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
R
D
 
E
C
 
C
E
 
H
D
 
D
P
 
P
I
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
V
D
 
P
S
 
E
L
 
L
N
 
D
D
 
T
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
L
E
 
E
P
 
S
N
 
T
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
M
 
M
Y
 
V
E
 
D
V
 
I
I
 
I
G
 
H
A
 
S
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
E
G
 
R
E
 
E
F
 
F
L
 
F
E
 
E
V
 
I
H
 
M
K
 
P
D
 
N
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
F
 
M
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
V
A
 
G
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
K
K
 
V
M
 
A
A
 
S
G
 
G
V
x
C
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
S
S
 
S
R
 
V
K
 
K
A
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
F
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
|
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
A
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
R
H
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
F
G
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
T
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
C
 
D
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
C
G
 
G
D
 
D
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
K
A
 
G
S
 
H
E
 
E
N
 
N
P
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
I
K
 
E
V
 
K
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
N
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
V
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
E
 
Q
P
 
P
R
 
S
N
 
S
T
 
T
R
 
R
F
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
C
R
 
C
A
 
D
L
 
L
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
T
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
Q
N
 
R
P
 
P
A
 
W
K
 
R
K
 
K
H
 
H
D
 
A
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

8pn7A Engineered glycolyl-coa carboxylase (g20r variant) with bound coa (see paper)
60% identity, 99% coverage: 5:517/517 of query aligns to 1:506/506 of 8pn7A

query
sites
8pn7A
L
 
L
E
 
E
K
 
K
V
 
L
K
 
E
E
 
E
L
 
R
I
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
R
E
 
E
R
 
K
R
|
R
I
 
L
E
 
E
S
 
A
Q
 
Q
H
 
H
K
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
H
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
F
D
 
D
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
 
Q
H
 
H
R
 
R
S
 
S
V
 
T
N
 
D
F
 
F
G
 
G
I
 
M
D
 
E
K
 
K
E
 
Q
S
 
K
Y
 
I
L
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
W
G
 
G
T
 
T
I
 
V
A
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
T
V
 
V
Y
 
F
V
 
L
F
 
F
A
 
S
Q
 
K
D
 
D
F
 
F
T
 
T
V
 
V
F
|
F
G
|
G
G
 
G
S
|
S
L
 
S
S
 
S
E
 
E
T
 
A
F
 
H
A
 
A
M
 
A
K
 
K
I
 
I
C
 
V
K
 
K
I
 
V
M
 
Q
D
 
D
Q
 
M
A
 
A
M
 
L
K
 
K
M
 
M
G
 
R
A
 
A
P
 
P
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
F
D
 
D
S
 
A
G
|
G
G
 
G
A
|
A
R
 
R
I
|
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
H
A
 
G
E
 
E
I
 
V
F
 
F
Q
 
R
R
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
V
I
 
I
F
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
D
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
M
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
I
I
 
F
M
 
M
T
 
V
R
 
R
G
 
D
T
 
T
S
 
S
Y
|
Y
M
 
M
F
 
F
L
 
V
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
N
E
 
E
D
 
V
V
 
V
T
 
T
Q
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
H
 
H
A
 
T
T
 
S
K
 
K
S
 
S
G
 
S
V
 
I
A
 
A
H
 
D
F
 
G
A
 
S
V
 
F
D
 
E
T
 
N
E
 
D
E
 
V
D
 
E
G
 
A
L
 
I
K
 
L
L
 
Q
I
 
I
R
 
R
H
 
R
L
 
L
M
 
L
S
 
D
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
N
 
N
N
 
N
M
 
I
E
 
E
E
 
G
P
 
V
P
 
P
L
 
E
V
 
I
D
 
E
C
 
S
E
 
F
D
 
D
P
 
D
I
 
V
D
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
D
D
 
K
S
 
S
L
 
L
N
 
D
D
 
T
I
 
L
I
 
I
P
 
P
D
 
D
E
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
K
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
Y
 
G
E
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
R
A
 
R
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
E
G
 
G
E
 
D
F
 
F
L
 
F
E
 
E
V
 
I
H
 
Q
K
 
A
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
G
R
 
R
F
 
V
N
 
E
G
 
G
Q
 
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
L
K
 
V
M
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
S
N
 
D
A
 
A
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
D
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
F
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
G
|
G
F
|
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
A
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
I
L
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
F
A
 
A
Y
 
Y
G
 
S
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
I
T
 
I
L
 
T
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
C
 
I
V
 
V
M
 
M
S
 
A
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
V
R
 
G
G
 
A
D
 
D
V
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
x
I
I
 
I
F
 
F
A
x
R
K
 
A
E
 
E
V
 
I
A
 
G
A
 
D
S
 
A
E
 
D
N
 
K
P
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
R
E
 
T
A
 
K
E
 
E
Y
 
Y
K
 
E
K
 
D
V
 
R
F
 
F
A
 
L
N
 
S
P
 
P
Y
 
F
N
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
E
Y
 
R
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
M
P
 
P
R
 
H
N
 
S
T
 
T
R
 
R
F
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
G
Q
 
M
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
K
 
K
K
 
E
L
 
M
T
 
E
N
 
Q
P
 
P
A
 
R
K
 
K
K
 
K
H
 
H
D
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

1vrgA Crystal structure of propionyl-coa carboxylase, beta subunit (tm0716) from thermotoga maritima at 2.30 a resolution
60% identity, 99% coverage: 6:517/517 of query aligns to 5:515/515 of 1vrgA

query
sites
1vrgA
E
 
D
K
 
K
V
 
I
K
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
K
A
 
K
L
 
I
R
 
E
E
 
K
Q
 
E
A
 
I
R
 
E
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
P
R
 
E
R
 
K
I
 
V
E
 
E
S
 
K
Q
 
Q
H
 
H
K
 
R
K
 
A
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
S
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
P
G
 
G
S
 
T
F
 
F
E
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
M
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
R
S
 
N
V
 
T
N
 
Y
F
 
F
G
 
G
I
 
L
D
 
D
K
 
K
E
 
V
S
 
K
Y
 
L
L
 
P
G
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
E
I
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
K
V
 
V
Y
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
V
 
V
F
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
G
E
 
E
T
 
M
F
 
H
A
 
A
M
 
K
K
 
K
I
 
I
C
 
V
K
 
K
I
 
L
M
 
L
D
 
D
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
K
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
N
D
 
D
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
|
A
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
Q
 
L
R
 
R
N
 
N
I
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
V
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
T
G
 
V
I
 
I
F
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
I
I
 
V
M
 
M
T
 
V
R
 
D
G
 
Q
T
 
T
S
 
A
Y
 
R
M
 
M
F
 
F
L
 
I
T
 
T
G
|
G
P
 
P
K
x
N
V
|
V
V
 
I
K
 
K
T
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
E
V
 
I
T
 
S
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
M
V
 
V
H
 
H
A
 
N
T
 
Q
K
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
N
A
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
L
V
 
A
D
 
D
T
 
N
E
 
D
E
 
E
D
 
K
G
 
A
L
 
M
K
 
S
L
 
L
I
 
V
R
 
R
H
 
T
L
 
L
M
 
L
S
 
S
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
S
N
 
N
N
 
N
M
 
A
E
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
E
D
 
D
C
 
P
E
 
D
D
 
T
P
 
S
I
 
L
D
 
E
R
 
T
L
 
P
E
 
E
D
 
D
S
 
I
L
 
L
N
 
-
D
 
D
I
 
I
I
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
K
A
 
G
Y
 
Y
D
 
D
M
 
V
Y
 
R
E
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
K
A
 
R
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
H
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
F
E
 
E
V
 
V
H
 
Q
K
 
P
D
 
Y
Y
 
F
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
I
 
I
I
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
F
 
I
N
 
Q
G
 
G
Q
 
K
S
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
K
 
V
M
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
D
A
 
S
S
 
S
R
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I
R
 
R
F
 
F
C
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
L
T
 
T
L
 
F
V
 
V
D
 
D
V
 
T
P
 
P
G
 
G
F
x
Y
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
V
G
 
A
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
R
H
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
S
E
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
I
T
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
C
 
I
V
 
A
M
 
M
S
 
G
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
G
G
 
A
D
 
D
V
 
M
N
 
V
Y
 
L
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
S
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
N
V
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
E
A
 
A
S
 
S
E
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
E
A
 
E
T
 
T
A
 
R
A
 
R
E
 
K
K
 
L
E
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
K
 
Q
V
 
Q
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
N
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
D
 
M
V
 
V
I
 
I
E
 
D
P
 
P
R
 
R
N
 
E
T
 
T
R
 
R
F
 
K
R
 
Y
I
 
I
I
 
M
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
Q
 
V
L
 
C
Q
 
E
T
 
T
K
 
K
K
 
V
L
 
E
T
 
Y
N
 
R
P
 
P
A
 
K
K
 
K
K
 
K
H
 
H
D
 
G
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

3ib9A Propionyl-coa carboxylase beta subunit, d422l (see paper)
56% identity, 99% coverage: 7:517/517 of query aligns to 8:521/521 of 3ib9A

query
sites
3ib9A
K
 
K
V
 
L
K
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
R
A
 
R
L
 
R
R
 
I
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
H
G
 
A
G
 
G
G
 
S
E
 
A
R
 
R
R
 
A
I
 
V
E
 
E
S
 
K
Q
 
Q
H
 
H
K
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
D
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
V
E
 
E
I
 
L
D
 
D
M
 
E
F
 
F
V
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
R
S
 
S
V
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
L
D
 
D
K
 
A
E
 
N
S
 
R
Y
 
P
L
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
T
 
T
I
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
P
V
 
V
Y
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
F
|
F
T
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
A
L
 
L
S
 
G
E
 
E
T
 
V
F
 
Y
A
 
G
M
 
Q
K
 
K
I
 
I
C
 
V
K
 
K
I
 
V
M
 
M
D
 
D
Q
 
F
A
 
A
M
 
L
K
 
K
M
 
T
G
 
G
A
 
C
P
 
P
V
 
V
I
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
D
 
D
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
|
A
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
G
G
 
A
Y
 
Y
A
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
Q
 
R
R
 
R
N
 
N
I
 
T
L
 
H
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
L
I
 
V
F
 
V
G
 
G
P
|
P
C
 
C
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
I
T
 
T
D
 
D
F
 
F
N
 
T
I
 
V
M
 
M
T
 
V
R
 
D
G
 
Q
T
 
T
S
 
S
Y
x
H
M
 
M
F
|
F
L
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
D
V
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
G
Q
x
F
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
R
V
 
T
H
 
H
A
 
N
T
 
S
K
 
T
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
H
A
 
M
V
 
A
D
 
G
T
 
D
E
 
E
E
 
K
D
 
D
G
 
A
L
 
V
K
 
E
L
 
Y
I
 
V
R
 
K
H
 
Q
L
 
L
M
 
L
S
 
S
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
S
N
 
N
N
 
N
M
 
L
E
 
S
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
F
D
 
P
C
 
E
E
 
E
D
 
A
P
 
D
I
 
L
D
 
A
R
 
V
L
 
T
E
 
D
D
 
E
S
 
D
-
 
A
-
 
E
L
 
L
N
 
D
D
 
T
I
 
I
I
 
V
P
 
P
D
 
D
E
 
S
P
 
A
N
 
N
R
 
Q
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
Y
 
H
E
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
E
A
 
H
I
 
V
I
 
L
D
 
D
N
 
D
G
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
F
E
 
E
V
 
T
H
 
Q
K
 
P
D
 
L
Y
 
F
A
 
A
Q
 
P
N
 
N
I
 
I
I
 
L
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
G
R
 
R
F
 
V
N
 
E
G
 
G
Q
 
R
S
 
P
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
N
 
M
K
 
Q
M
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
C
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
T
A
 
A
S
 
S
R
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
F
 
T
C
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
N
I
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
L
T
 
T
L
 
F
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
|
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
V
G
 
D
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
H
G
 
D
G
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
R
H
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
L
V
 
I
T
 
T
V
 
V
T
 
I
L
 
T
R
 
R
K
 
K
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
C
 
L
V
 
V
M
 
M
S
 
G
S
 
S
K
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
G
G
 
A
D
 
D
V
 
L
N
 
N
Y
 
L
A
 
A
W
 
W
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
V
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
A
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
N
V
 
I
I
 
L
F
 
H
A
 
R
K
 
R
E
 
T
V
 
I
A
 
A
-
 
D
A
 
A
S
 
G
E
 
D
N
 
D
P
 
A
A
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
A
E
 
R
K
 
L
E
 
I
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
K
 
E
K
 
D
V
 
A
F
 
L
A
 
L
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
N
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
E
Y
 
R
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
D
 
A
V
 
V
I
 
I
E
 
M
P
 
P
R
 
S
N
 
D
T
 
T
R
 
R
F
 
R
R
 
H
I
 
I
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
K
 
K
K
 
R
L
 
E
T
 
S
N
 
L
P
 
P
A
 
P
K
 
K
K
 
K
H
 
H
D
 
G
N
 
N
L
 
I
P
 
P
L
 
L

1xnyA Biotin and propionyl-coa bound to acyl-coa carboxylase beta subunit from s. Coelicolor (pccb) (see paper)
56% identity, 99% coverage: 7:517/517 of query aligns to 8:521/521 of 1xnyA

query
sites
1xnyA
K
 
K
V
 
L
K
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
R
A
 
R
L
 
R
R
 
I
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
H
G
 
A
G
 
G
G
 
S
E
 
A
R
 
R
R
 
A
I
 
V
E
 
E
S
 
K
Q
 
Q
H
 
H
K
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
D
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
G
 
G
S
 
S
F
 
F
E
 
V
E
 
E
I
 
L
D
 
D
M
 
E
F
 
F
V
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
R
S
 
S
V
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
L
D
 
D
K
 
A
E
 
N
S
 
R
Y
 
P
L
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
T
 
T
I
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
P
V
 
V
Y
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q