SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_022671115.1 NCBI__GCF_000420385.1:WP_022671115.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 4 hits to proteins with known functional sites (download)

2x65B Crystal structure of t. Maritima gdp-mannose pyrophosphorylase in complex with mannose-1-phosphate. (see paper)
41% identity, 74% coverage: 1:362/487 of query aligns to 2:332/334 of 2x65B

query
sites
2x65B
M
 
M
K
 
K
N
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
C
 
A
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
 
G
T
x
E
R
|
R
L
 
F
W
 
W
P
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
T
K
 
P
L
 
E
M
 
T
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
N
 
G
G
 
N
K
 
K
S
 
S
L
 
L
F
 
M
Q
 
R
L
 
W
T
 
T
I
 
F
E
 
E
R
 
R
N
 
V
I
 
L
E
 
E
L
 
E
C
 
M
D
 
D
S
 
P
F
 
K
I
 
D
I
 
V
S
 
I
V
 
V
N
 
V
E
 
T
E
 
H
Q
 
K
Y
 
D
F
 
Y
L
 
V
V
 
E
L
 
R
D
 
T
Q
 
K
I
 
K
E
 
E
E
 
L
L
 
P
T
 
E
I
 
L
H
 
P
D
 
D
S
 
E
Q
 
N
I
 
I
T
 
I
A
 
A
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
E
T
 
P
E
 
M
A
 
K
K
 
K
N
 
N
T
 
T
A
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
C
A
 
F
F
 
I
A
 
G
S
 
T
L
 
K
S
 
L
V
 
A
D
 
D
E
 
D
D
 
D
E
 
E
I
 
P
L
 
V
F
 
L
I
 
V
T
 
L
P
 
P
A
 
A
D
 
D
H
|
H
L
 
R
I
 
I
K
 
P
N
 
D
S
 
T
D
 
K
K
 
K
Y
 
F
K
 
W
E
 
K
A
 
T
V
 
V
L
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
L
E
 
D
L
 
-
A
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
K
Y
 
Y
-
 
D
-
 
G
L
 
L
V
 
F
T
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
V
P
 
P
T
 
T
E
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
G
 
G
Y
|
Y
G
|
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
T
 
I
E
 
G
D
 
-
S
 
E
G
 
E
N
 
L
G
 
E
N
 
E
H
 
G
V
 
V
L
 
H
S
 
K
V
 
V
E
 
A
K
 
Q
F
 
F
H
 
R
E
|
E
K
|
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
E
T
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
 
K
Y
 
F
L
 
V
E
 
E
L
 
S
N
 
G
A
 
-
S
 
-
H
 
-
S
 
-
T
 
-
P
 
-
I
 
-
T
 
R
Y
 
F
L
 
L
W
 
W
N
|
N
S
|
S
G
 
G
M
 
M
F
 
F
M
 
L
F
 
W
K
 
K
A
 
A
G
 
R
V
 
E
Y
 
F
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
K
 
K
R
 
V
Y
 
C
A
 
E
P
 
P
E
 
S
V
 
I
Y
 
Y
E
 
-
E
 
E
S
 
N
L
 
L
K
 
K
S
 
D
F
 
V
E
 
D
N
 
P
R
 
R
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
N
 
N
D
 
F
N
 
E
Q
 
E
I
 
L
R
 
K
I
 
-
K
 
K
D
 
A
M
 
Y
K
 
E
N
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
S
I
 
I
S
 
S
I
 
V
D
|
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
K
 
K
S
 
S
K
 
K
K
 
K
I
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
D
F
 
F
Y
 
E
W
|
W
S
 
S
D
 
D
V
 
L
G
 
G
S
 
N
F
 
W
D
 
S
S
 
S
L
 
-
V
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
I
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
D
 
E
N
 
G
E
 
Y
N
 
T
N
 
E
K
 
E
A
 
S
E
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
I
I
 
L
D
 
V
S
 
D
K
 
S
N
 
D
N
 
R
F
 
V
Y
 
F
F
 
V
S
 
K
D
 
T
R
 
H
D
 
N
K
 
K
L
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
S
D
 
D
F
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
C
K
 
K
K
 
E
G
 
E
Q
 
Y
T
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
V
 
V
K
x
R
E
 
E
I
 
V
V
 
V
N
 
K
Q
 
K
L
 
L

2x65A Crystal structure of t. Maritima gdp-mannose pyrophosphorylase in complex with mannose-1-phosphate. (see paper)
41% identity, 74% coverage: 1:362/487 of query aligns to 2:332/334 of 2x65A

query
sites
2x65A
M
 
M
K
 
K
N
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
C
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
E
R
 
R
L
 
F
W
 
W
P
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
T
K
 
P
L
 
E
M
 
T
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
N
 
G
G
 
N
K
 
K
S
 
S
L
 
L
F
 
M
Q
 
R
L
 
W
T
 
T
I
 
F
E
 
E
R
 
R
N
 
V
I
 
L
E
 
E
L
 
E
C
 
M
D
 
D
S
 
P
F
 
K
I
 
D
I
 
V
S
 
I
V
 
V
N
 
V
E
 
T
E
 
H
Q
 
K
Y
 
D
F
 
Y
L
 
V
V
 
E
L
 
R
D
 
T
Q
 
K
I
 
K
E
 
E
E
 
L
L
 
P
T
 
E
I
 
L
H
 
P
D
 
D
S
 
E
Q
 
N
I
 
I
T
 
I
A
 
A
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
E
T
 
P
E
 
M
A
 
K
K
 
K
N
 
N
T
 
T
A
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
C
A
 
F
F
 
I
A
 
G
S
 
T
L
 
K
S
 
L
V
 
A
D
 
D
E
 
D
D
 
D
E
 
E
I
 
P
L
 
V
F
 
L
I
 
V
T
 
L
P
 
P
A
 
A
D
 
D
H
|
H
L
 
R
I
 
I
K
 
P
N
 
D
S
 
T
D
 
K
K
 
K
Y
 
F
K
 
W
E
 
K
A
 
T
V
 
V
L
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
L
E
 
D
L
 
-
A
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
K
Y
 
Y
-
 
D
-
 
G
L
 
L
V
 
F
T
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
V
P
 
P
T
 
T
E
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
G
 
G
Y
|
Y
G
|
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
T
 
I
E
 
G
D
 
-
S
 
E
G
 
E
N
 
L
G
 
E
N
 
E
H
 
G
V
 
V
L
 
H
S
 
K
V
 
V
E
 
A
K
 
Q
F
 
F
H
 
R
E
|
E
K
|
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
E
T
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
 
K
Y
 
F
L
 
V
E
 
E
L
 
S
N
 
G
A
 
-
S
 
-
H
 
-
S
 
-
T
 
-
P
 
-
I
 
-
T
 
R
Y
 
F
L
 
L
W
 
W
N
|
N
S
|
S
G
 
G
M
 
M
F
 
F
M
 
L
F
 
W
K
 
K
A
 
A
G
 
R
V
 
E
Y
 
F
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
K
 
K
R
 
V
Y
 
C
A
 
E
P
 
P
E
 
S
V
 
I
Y
 
Y
E
 
-
E
 
E
S
 
N
L
 
L
K
 
K
S
 
D
F
 
V
E
 
D
N
 
P
R
 
R
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
N
 
N
D
 
F
N
 
E
Q
 
E
I
 
L
R
 
K
I
 
-
K
 
K
D
 
A
M
 
Y
K
 
E
N
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
S
I
 
I
S
 
S
I
 
V
D
|
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
K
 
K
S
 
S
K
 
K
K
 
K
I
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
D
F
 
F
Y
 
E
W
 
W
S
 
S
D
 
D
V
 
L
G
 
G
S
 
N
F
 
W
D
 
S
S
 
S
L
 
-
V
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
I
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
D
 
E
N
 
G
E
 
Y
N
 
T
N
 
E
K
 
E
A
 
S
E
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
I
I
 
L
D
 
V
S
 
D
K
 
S
N
 
D
N
 
R
F
 
V
Y
 
F
F
 
V
S
 
K
D
 
T
R
 
H
D
 
N
K
 
K
L
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
S
D
 
D
F
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
C
K
 
K
K
 
E
G
 
E
Q
 
Y
T
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
V
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
V
 
V
N
 
K
Q
 
K
L
 
L

2x60A Crystal structure of t. Maritima gdp-mannose pyrophosphorylase in complex with gtp. (see paper)
41% identity, 74% coverage: 1:362/487 of query aligns to 2:332/333 of 2x60A

query
sites
2x60A
M
 
M
K
 
K
N
 
A
L
 
L
I
 
I
L
|
L
C
x
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
|
G
T
x
E
R
|
R
L
 
F
W
 
W
P
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
T
K
 
P
L
 
E
M
 
T
P
 
P
K
|
K
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
N
 
G
G
 
N
K
 
K
S
 
S
L
 
L
F
 
M
Q
 
R
L
 
W
T
 
T
I
 
F
E
 
E
R
 
R
N
 
V
I
 
L
E
 
E
L
 
E
C
 
M
D
 
D
S
 
P
F
 
K
I
 
D
I
 
V
S
 
I
V
 
V
N
x
V
E
 
T
E
 
H
Q
 
K
Y
 
D
F
 
Y
L
 
V
V
 
E
L
 
R
D
 
T
Q
 
K
I
 
K
E
 
E
E
 
L
L
 
P
T
 
E
I
 
L
H
 
P
D
 
D
S
 
E
Q
 
N
I
 
I
T
 
I
A
 
A
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
E
|
E
T
 
P
E
 
M
A
 
K
K
 
K
N
|
N
T
 
T
A
 
A
P
 
P
A
|
A
I
 
C
A
 
F
F
 
I
A
 
G
S
 
T
L
 
K
S
 
L
V
 
A
D
 
D
E
 
D
D
 
D
E
 
E
I
 
P
L
 
V
F
 
L
I
 
V
T
 
L
P
 
P
A
|
A
D
 
D
H
 
H
L
 
R
I
 
I
K
 
P
N
 
D
S
 
T
D
 
K
K
 
K
Y
 
F
K
 
W
E
 
K
A
 
T
V
 
V
L
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
L
E
 
D
L
 
-
A
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
K
Y
 
Y
-
 
D
-
 
G
L
 
L
V
 
F
T
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
V
P
 
P
T
 
T
E
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
T
 
I
E
 
G
D
 
-
S
 
E
G
 
E
N
 
L
G
 
E
N
 
E
H
 
G
V
 
V
L
 
H
S
 
K
V
 
V
E
 
A
K
 
Q
F
 
F
H
 
R
E
 
E
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
E
T
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
 
K
Y
 
F
L
 
V
E
 
E
L
 
S
N
 
G
A
 
-
S
 
-
H
 
-
S
 
-
T
 
-
P
 
-
I
 
-
T
 
R
Y
 
F
L
 
L
W
 
W
N
 
N
S
 
S
G
 
G
M
 
M
F
 
F
M
 
L
F
 
W
K
 
K
A
 
A
G
 
R
V
 
E
Y
 
F
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
K
 
K
R
 
V
Y
 
C
A
 
E
P
 
P
E
 
S
V
 
I
Y
 
Y
E
 
-
E
 
E
S
 
N
L
 
L
K
 
K
S
 
D
F
 
V
E
 
D
N
 
P
R
 
R
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
N
 
N
D
 
F
N
 
E
Q
 
E
I
 
L
R
 
K
I
 
-
K
 
K
D
 
A
M
 
Y
K
 
E
N
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
S
I
 
I
S
 
S
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
K
 
K
S
 
S
K
 
K
K
 
K
I
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
D
F
 
F
Y
 
E
W
 
W
S
 
S
D
 
D
V
 
L
G
 
G
S
 
N
F
 
W
D
 
S
S
 
S
L
 
-
V
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
I
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
D
 
E
N
 
G
E
 
Y
N
 
T
N
 
E
K
 
E
A
 
S
E
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
I
I
 
L
D
 
V
S
 
D
K
 
S
N
 
D
N
 
R
F
 
V
Y
 
F
F
 
V
S
 
K
D
 
T
R
 
H
D
 
N
K
 
K
L
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
S
D
 
D
F
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
C
K
 
K
K
 
E
G
 
E
Q
 
Y
T
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
V
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
V
 
V
N
 
K
Q
 
K
L
 
L

2x5zA Crystal structure of t. Maritima gdp-mannose pyrophosphorylase in complex with gdp-mannose. (see paper)
41% identity, 74% coverage: 1:362/487 of query aligns to 2:332/333 of 2x5zA

query
sites
2x5zA
M
 
M
K
 
K
N
 
A
L
 
L
I
 
I
L
|
L
C
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
E
R
 
R
L
 
F
W
 
W
P
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
T
K
 
P
L
 
E
M
 
T
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
N
 
G
G
 
N
K
 
K
S
 
S
L
 
L
F
 
M
Q
 
R
L
 
W
T
 
T
I
 
F
E
 
E
R
 
R
N
 
V
I
 
L
E
 
E
L
 
E
C
 
M
D
 
D
S
 
P
F
 
K
I
 
D
I
 
V
S
 
I
V
 
V
N
x
V
E
 
T
E
 
H
Q
 
K
Y
 
D
F
 
Y
L
 
V
V
 
E
L
 
R
D
 
T
Q
 
K
I
 
K
E
 
E
E
 
L
L
 
P
T
 
E
I
 
L
H
 
P
D
 
D
S
 
E
Q
 
N
I
 
I
T
 
I
A
 
A
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
E
|
E
T
 
P
E
 
M
A
x
K
K
 
K
N
|
N
T
 
T
A
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
C
A
 
F
F
 
I
A
 
G
S
 
T
L
 
K
S
 
L
V
 
A
D
 
D
E
 
D
D
 
D
E
 
E
I
 
P
L
 
V
F
 
L
I
 
V
T
 
L
P
|
P
A
 
A
D
|
D
H
|
H
L
 
R
I
 
I
K
 
P
N
 
D
S
 
T
D
 
K
K
 
K
Y
 
F
K
 
W
E
 
K
A
 
T
V
 
V
L
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
L
E
 
D
L
 
-
A
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
K
Y
 
Y
-
 
D
-
 
G
L
 
L
V
 
F
T
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
V
P
 
P
T
 
T
E
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
G
 
G
Y
|
Y
G
|
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
T
 
I
E
 
G
D
 
-
S
 
E
G
 
E
N
 
L
G
 
E
N
 
E
H
 
G
V
 
V
L
 
H
S
 
K
V
 
V
E
 
A
K
 
Q
F
 
F
H
 
R
E
|
E
K
|
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
E
T
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
 
K
Y
 
F
L
 
V
E
 
E
L
 
S
N
 
G
A
 
-
S
 
-
H
 
-
S
 
-
T
 
-
P
 
-
I
 
-
T
 
R
Y
 
F
L
 
L
W
 
W
N
|
N
S
|
S
G
 
G
M
 
M
F
 
F
M
 
L
F
 
W
K
 
K
A
 
A
G
 
R
V
 
E
Y
 
F
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
K
 
K
R
 
V
Y
 
C
A
 
E
P
 
P
E
 
S
V
 
I
Y
 
Y
E
 
-
E
 
E
S
 
N
L
 
L
K
 
K
S
 
D
F
 
V
E
 
D
N
 
P
R
 
R
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
N
 
N
D
 
F
N
 
E
Q
 
E
I
 
L
R
 
K
I
 
-
K
 
K
D
 
A
M
 
Y
K
 
E
N
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
S
I
 
I
S
 
S
I
 
V
D
|
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
K
 
K
S
 
S
K
 
K
K
 
K
I
 
V
K
 
R
V
 
V
I
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
D
F
 
F
Y
 
E
W
|
W
S
 
S
D
|
D
V
 
L
G
 
G
S
 
N
F
 
W
D
 
S
S
 
S
L
 
-
V
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
I
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
D
 
E
N
 
G
E
 
Y
N
 
T
N
 
E
K
 
E
A
 
S
E
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
I
I
 
L
D
 
V
S
 
D
K
 
S
N
 
D
N
 
R
F
 
V
Y
 
F
F
 
V
S
 
K
D
 
T
R
 
H
D
 
N
K
 
K
L
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
S
D
 
D
F
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
C
K
 
K
K
 
E
G
 
E
Q
 
Y
T
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
V
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
V
 
V
N
 
K
Q
 
K
L
 
L

Query Sequence

>WP_022671115.1 NCBI__GCF_000420385.1:WP_022671115.1
MKNLILCGGSGTRLWPLSRKLMPKQFLKLFNGKSLFQLTIERNIELCDSFIISVNEEQYF
LVLDQIEELTIHDSQITAYDSLLTTHSLQFLLETEAKNTAPAIAFASLSVDEDEILFITP
ADHLIKNSDKYKEAVLKAKELALKGYLVTFGITPTEPNTGYGYIETEDSGNGNHVLSVEK
FHEKPDLKTAKQYLELNASHSTPITYLWNSGMFMFKAGVYLEELKRYAPEVYEESLKSFE
NRQKINDNQIRIKDMKNIPSISIDYAVMEKSKKIKVIKSEFYWSDVGSFDSLVREMAVSN
DNENNKAEEIEIDSKNNFYFSDRDKLIATIGLEDFIVIDTNDALLIAKKGQTQQVKEIVN
QLKETHNSLLTTHSIVHRPWGTYEVLVEDKGYKIKRIIVKPGKRLSLQKHFHRNEHWIVV
SGTAEVTVGNKTFLLRPNESTYIKMGELHRLANPGKIPVILIEAQVGEYVEENDIERVED
DYRRNQQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory