SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_023433853.1 NCBI__GCF_000496075.1:WP_023433853.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4cpdA Alcohol dehydrogenase tadh from thermus sp. Atn1
36% identity, 99% coverage: 1:387/392 of query aligns to 1:343/346 of 4cpdA

query
sites
4cpdA
M
 
M
R
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
V
W
 
F
H
 
E
G
 
N
S
 
K
H
 
E
D
 
R
V
 
V
R
 
A
V
 
V
D
 
K
T
 
E
V
 
V
P
 
N
D
 
A
P
 
P
E
 
R
I
 
L
M
 
Q
N
 
H
P
 
P
R
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
L
I
 
V
E
 
R
V
 
V
T
 
H
S
 
L
T
 
A
A
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
L
H
|
H
L
 
L
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
V
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
-
M
 
V
M
 
L
S
 
P
G
 
G
D
 
S
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
M
 
V
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
V
 
E
E
 
A
T
 
V
G
 
G
P
 
E
K
 
G
-
 
I
S
 
Q
T
 
D
L
 
L
Q
 
Q
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
W
V
 
V
V
 
V
V
 
G
P
 
P
F
 
F
T
 
H
I
 
I
S
 
A
C
|
C
G
 
G
S
 
T
C
|
C
F
 
P
F
 
Y
C
|
C
K
 
R
K
 
R
H
 
H
L
 
Q
Y
 
Y
S
 
N
A
 
L
C
|
C
D
 
E
N
 
R
S
 
G
N
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
x
G
L
 
V
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
H
 
P
L
 
M
T
 
F
G
 
G
G
 
N
Y
 
L
P
 
Q
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
I
V
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
D
 
N
I
 
V
G
 
N
P
 
L
I
 
R
V
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
N
M
 
L
D
 
S
D
 
P
D
 
E
Q
 
R
V
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
A
S
 
G
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
S
T
|
T
G
 
A
W
 
Y
M
 
G
A
 
G
A
 
L
V
 
I
N
 
Q
A
 
G
D
 
Q
I
 
L
E
 
R
E
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
V
W
 
I
G
 
G
C
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
F
 
M
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
S
 
V
A
 
A
L
 
Q
L
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
|
D
H
x
R
Y
 
I
P
 
P
N
 
E
R
|
R
L
 
L
A
 
E
L
 
R
A
 
A
R
 
A
K
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
I
V
 
P
I
 
I
D
 
N
Y
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
E
H
 
N
V
 
P
L
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
V
M
 
R
E
 
S
M
 
E
S
 
T
G
 
N
G
 
D
L
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
D
A
 
L
V
 
V
I
 
L
D
 
E
A
|
A
V
|
V
G
 
G
M
 
-
E
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
-
I
 
-
K
 
-
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
A
 
A
D
 
A
S
 
T
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
S
E
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
E
A
 
M
V
 
V
R
 
R
K
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
V
S
 
S
I
 
A
P
x
V
G
 
G
V
|
V
Y
 
D
G
 
N
G
 
A
F
 
P
L
 
S
D
 
F
K
 
P
F
 
F
P
 
P
T
 
L
G
 
A
A
 
S
L
 
G
M
 
L
E
 
V
K
 
K
G
 
D
L
 
L
Q
 
T
V
 
F
K
 
R
T
 
I
G
 
G
Q
x
L
T
x
A
H
 
N
V
 
V
Q
 
H
H
 
L
Y
 
Y
I
 
I
S
 
D
E
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
A
R
 
L
I
 
L
E
 
A
D
 
S
G
 
G
E
 
R
I
 
L
D
 
Q
T
 
P
T
 
E
F
 
R
L
 
I
I
 
V
S
 
S
H
 
H
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
E
N
 
L
F
|
F
K
 
-
N
 
-
N
 
D
Q
 
R
D
 
K
D
 
E
W
 
A
T
 
L
K
|
K
V
 
V
V
 
L
L
 
L

Q52078 Formaldehyde dismutase; EC 1.2.98.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 2:375/392 of query aligns to 5:380/399 of Q52078

query
sites
Q52078
R
x
K
A
x
S
L
x
V
T
x
V
W
x
Y
H
|
H
G
|
G
S
x
T
H
x
R
D
|
D
V
x
L
R
|
R
V
|
V
D
x
E
T
|
T
V
|
V
P
|
P
D
x
Y
P
|
P
E
x
K
I
x
L
-
x
E
M
x
H
N
|
N
P
x
N
R
|
R
D
x
K
-
x
L
-
x
E
-
x
H
-
x
A
A
x
V
I
|
I
I
x
L
E
x
K
V
|
V
T
x
V
S
|
S
T
|
T
A
x
N
I
|
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
|
D
L
x
Q
H
|
H
L
x
I
Y
|
Y
D
x
R
G
|
G
-
x
R
-
x
F
V
x
I
I
x
V
P
|
P
G
 
-
M
 
-
M
 
-
S
x
K
G
|
G
D
x
H
I
x
V
L
|
L
G
|
G
H
|
H
E
|
E
F
x
I
M
x
T
G
|
G
R
x
E
V
|
V
V
|
V
E
|
E
T
x
K
G
|
G
P
x
S
K
x
D
S
x
V
T
x
E
L
|
L
Q
x
M
K
x
D
-
x
I
G
|
G
Q
x
D
R
x
L
V
|
V
V
x
S
V
|
V
P
|
P
F
|
F
T
x
N
I
x
V
S
x
A
C
|
C
G
|
G
S
x
R
C
|
C
F
x
R
F
x
N
C
|
C
K
|
K
K
x
E
H
x
A
L
x
R
Y
x
S
S
x
D
A
x
V
C
|
C
D
x
E
N
|
N
S
x
N
N
 
-
P
 
-
V
x
L
E
x
V
N
|
N
Q
x
P
D
|
D
I
x
A
T
x
D
E
x
L
G
|
G
L
x
A
Y
x
F
G
|
G
H
x
F
A
x
D
V
x
L
S
x
K
A
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
G
|
G
Y
x
W
P
x
S
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
A
|
A
E
|
E
Y
|
Y
V
|
V
R
x
L
V
|
V
P
|
P
F
x
Y
S
x
A
D
|
D
I
x
Y
G
x
M
P
x
L
I
x
L
V
x
K
V
x
F
P
x
G
D
|
D
-
x
K
-
x
E
-
x
Q
G
x
A
M
|
M
D
x
E
D
x
K
D
x
I
Q
x
K
V
x
D
L
|
L
-
x
T
F
x
L
L
x
I
S
|
S
D
|
D
I
|
I
L
|
L
P
|
P
T
|
T
G
|
G
W
x
F
M
x
H
A
x
G
A
x
C
V
|
V
N
x
S
A
|
A
D
x
G
I
x
V
E
x
K
E
x
P
G
|
G
D
x
S
T
x
H
V
|
V
A
x
Y
V
x
I
W
x
A
G
|
G
C
x
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
|
G
L
x
R
F
x
C
A
|
A
V
x
A
Q
x
A
S
x
G
A
|
A
L
x
R
L
|
L
M
x
L
G
|
G
A
|
A
A
|
A
R
x
C
V
|
V
I
|
I
A
x
V
I
x
G
D
|
D
H
x
Q
Y
x
N
P
|
P
N
x
E
R
|
R
L
|
L
A
x
K
L
|
L
A
x
L
R
x
S
K
x
D
L
x
A
G
|
G
A
x
F
D
x
E
V
x
T
I
|
I
D
|
D
Y
x
L
K
x
R
Q
x
N
T
x
S
H
x
A
V
x
P
L
|
L
-
x
R
E
x
D
A
x
Q
L
x
I
M
x
D
E
x
Q
M
x
I
S
x
L
G
|
G
G
x
K
L
x
P
G
x
E
P
x
V
D
|
D
A
x
C
V
x
G
I
x
V
D
|
D
A
|
A
V
|
V
G
|
G
M
x
F
E
|
E
S
x
A
H
|
H
G
|
G
F
x
L
A
x
G
P
x
D
D
x
E
T
x
A
V
 
-
L
 
-
D
 
-
N
|
N
I
x
T
K
x
E
Q
x
T
T
x
P
V
x
N
G
|
G
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
A
|
A
L
|
L
R
x
N
E
x
S
A
x
L
L
x
F
M
x
D
A
x
V
V
|
V
R
|
R
K
x
A
G
|
G
G
|
G
R
x
A
V
x
I
S
x
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
V
x
I
Y
|
Y
G
x
V
G
|
G
F
x
S
L
 
-
D
|
D
K
x
P
F
x
D
P
|
P
T
x
V
-
x
N
-
x
K
-
x
D
-
x
A
-
x
G
-
x
S
-
x
G
-
x
R
-
x
L
-
x
H
-
x
L
-
x
D
-
x
F
G
|
G
A
x
K
L
x
M
M
x
W
E
x
T
K
|
K
G
x
S
L
x
I
Q
x
R
V
x
I
K
x
M
T
|
T
G
|
G
Q
x
M
T
x
A
H
x
P
V
|
V
Q
x
T
H
x
N
Y
|
Y
I
x
N
S
x
R
E
x
H
L
|
L
L
x
T
K
x
E
R
x
A
I
|
I
E
x
L
D
x
W
G
x
D
E
x
Q
I
x
M
D
x
P
-
x
Y
-
x
L
T
x
S
T
x
K
F
x
V
L
x
M
I
x
N
S
x
I
H
x
E
R
x
V
L
x
I
P
x
T
L
|
L
E
x
D
E
x
Q
A
|
A
P
|
P
K
x
D
G
|
G
Y
|
Y
Y
x
A
N
x
K
F
|
F

Sites not aligning to the query:

2dphA Crystal structure of formaldehyde dismutase
34% identity, 95% coverage: 2:375/392 of query aligns to 4:379/398 of 2dphA

query
sites
2dphA
R
 
K
A
 
S
L
 
V
T
 
V
W
 
Y
H
 
H
G
 
G
S
 
T
H
 
R
D
 
D
V
 
L
R
 
R
V
 
V
D
 
E
T
 
T
V
 
V
P
 
P
D
 
Y
P
 
P
E
 
K
I
 
L
-
 
E
M
 
H
N
 
N
P
 
N
R
 
R
D
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
H
-
 
A
A
 
V
I
 
I
I
 
L
E
 
K
V
 
V
T
 
V
S
 
S
T
 
T
A
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
Q
H
|
H
L
 
I
Y
 
Y
D
 
R
G
 
G
-
 
R
-
 
F
V
 
I
I
 
V
P
 
P
G
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
K
G
 
G
D
 
H
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
I
M
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
T
 
K
G
 
G
P
 
S
K
 
D
S
 
V
T
 
E
L
 
L
Q
 
M
K
 
D
-
 
I
G
 
G
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
V
 
S
V
 
V
P
 
P
F
|
F
T
 
N
I
 
V
S
 
A
C
|
C
G
 
G
S
 
R
C
|
C
F
 
R
F
 
N
C
|
C
K
 
K
K
 
E
H
 
A
L
 
R
Y
 
S
S
 
D
A
 
V
C
|
C
D
 
E
N
 
N
S
 
N
N
 
-
P
 
-
V
x
L
E
 
V
N
 
N
Q
 
P
D
 
D
I
 
A
T
 
D
E
 
L
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
H
 
F
A
 
D
V
 
L
S
 
K
A
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
G
Y
 
W
P
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
D
 
D
I
 
Y
G
 
M
P
 
L
I
 
L
V
 
K
V
 
F
P
 
G
D
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
M
 
M
D
 
E
D
 
K
D
 
I
Q
 
K
V
 
D
L
 
L
-
 
T
F
 
L
L
 
I
S
|
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
|
P
T
|
T
G
 
G
W
 
F
M
 
H
A
 
G
A
 
C
V
 
V
N
 
S
A
 
A
D
 
G
I
 
V
E
 
K
E
 
P
G
 
G
D
 
S
T
 
H
V
 
V
A
 
Y
V
 
I
W
x
A
G
|
G
C
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
R
F
 
C
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
R
L
 
L
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
C
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
x
G
D
|
D
H
x
Q
Y
 
N
P
 
P
N
 
E
R
|
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
A
 
L
R
 
S
K
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
F
D
 
E
V
 
T
I
 
I
D
 
D
Y
x
L
K
 
R
Q
 
N
T
 
S
H
 
A
V
 
P
L
 
L
-
 
R
E
 
D
A
 
Q
L
 
I
M
 
D
E
 
Q
M
 
I
S
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
P
G
 
E
P
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
M
 
F
E
 
E
S
 
A
H
|
H
G
 
G
F
 
L
A
 
G
P
 
D
D
 
E
T
 
A
V
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
N
I
 
T
K
 
E
Q
 
T
T
 
P
V
 
N
G
 
G
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
S
A
 
L
L
 
F
M
 
D
A
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
I
S
 
G
I
 
I
P
|
P
G
|
G
V
x
I
Y
 
Y
G
 
V
G
 
G
F
 
S
L
 
-
D
 
D
K
 
P
F
 
D
P
 
P
T
 
V
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
F
G
 
G
A
 
K
L
 
M
M
 
W
E
 
T
K
 
K
G
 
S
L
 
I
Q
 
R
V
 
I
K
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
M
T
x
A
H
 
P
V
 
V
Q
 
T
H
 
N
Y
 
Y
I
 
N
S
 
R
E
 
H
L
 
L
L
 
T
K
 
E
R
 
A
I
 
I
E
 
L
D
 
W
G
 
D
E
 
Q
I
 
M
D
 
P
-
 
Y
-
 
L
T
 
S
T
 
K
F
 
V
L
 
M
I
 
N
S
 
I
H
 
E
R
 
V
L
 
I
P
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
Q
A
 
A
P
 
P
K
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
A
N
 
K
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4jlwA Crystal structure of formaldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
35% identity, 95% coverage: 2:375/392 of query aligns to 3:378/395 of 4jlwA

query
sites
4jlwA
R
 
R
A
 
G
L
 
V
T
 
V
W
 
Y
H
 
L
G
 
G
S
 
P
H
 
G
D
 
K
V
 
V
R
 
E
V
 
V
D
 
Q
T
 
N
V
 
I
P
 
P
D
 
Y
P
 
P
E
 
K
I
 
M
M
 
Q
N
 
D
P
 
P
R
 
Q
D
 
G
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
H
-
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
L
E
 
R
V
 
V
T
 
V
S
 
S
T
 
T
A
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
Q
H
|
H
L
 
M
Y
 
V
D
 
R
G
 
G
V
 
R
I
 
T
P
 
T
G
 
A
M
 
P
M
 
-
S
 
E
G
 
G
D
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
I
M
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
T
 
I
G
 
G
P
 
R
K
 
G
-
 
V
S
 
E
T
 
T
L
 
M
Q
 
K
K
 
I
G
 
G
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
V
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
T
 
N
I
 
V
S
 
A
C
|
C
G
 
G
S
 
H
C
|
C
F
 
R
F
 
T
C
|
C
K
 
K
K
 
E
H
 
Q
L
 
H
Y
 
T
S
 
G
A
 
V
C
|
C
D
 
L
N
 
T
S
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
A
E
 
R
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
A
S
 
G
A
 
G
L
 
A
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
H
 
D
L
 
M
T
 
-
G
 
G
G
 
G
Y
 
W
P
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
D
 
D
I
 
F
G
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
N
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
A
M
 
M
D
 
E
D
 
K
D
 
I
Q
 
R
V
 
D
L
 
L
-
 
T
F
 
C
L
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
|
T
G
 
G
W
 
Y
M
 
H
A
 
G
A
 
A
V
 
V
N
 
T
A
 
A
D
 
G
I
 
V
E
 
G
E
 
P
G
 
G
D
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
V
 
I
W
 
A
G
 
G
C
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
F
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
L
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
G
D
|
D
H
 
V
Y
 
N
P
 
P
N
 
T
R
|
R
L
 
L
A
 
A
L
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
Q
G
 
G
A
 
F
D
 
E
V
 
I
I
 
A
D
 
D
Y
 
L
-
 
S
K
 
K
Q
 
D
T
 
T
H
 
P
V
 
L
L
 
H
E
 
E
A
 
Q
L
 
I
M
 
A
E
 
A
M
 
L
S
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
P
G
 
E
P
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
M
 
F
E
 
E
S
 
A
H
x
R
G
 
G
F
x
H
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
A
T
 
T
V
|
V
L
 
L
D
 
N
N
 
S
I
 
L
K
 
-
Q
 
-
T
 
-
V
 
M
G
 
G
F
 
I
G
 
T
A
 
R
D
 
V
S
 
A
G
 
G
H
 
K
A
 
I
L
 
G
R
 
I
E
x
P
A
 
G
L
|
L
M
 
Y
A
 
V
V
 
T
R
 
E
K
 
D
G
 
P
G
 
G
R
 
A
V
 
V
S
 
D
I
 
A
P
 
A
G
 
A
V
 
K
Y
 
H
G
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
S
D
 
I
K
 
R
F
 
F
P
 
G
T
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
-
M
 
W
E
 
A
K
 
K
G
 
S
L
 
H
Q
 
S
V
 
F
K
 
H
T
 
T
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
H
 
P
V
 
V
Q
 
M
H
 
K
Y
 
Y
I
 
N
S
 
R
E
 
Q
L
 
L
L
 
M
K
 
Q
R
 
A
I
 
I
E
 
M
D
 
W
G
 
D
E
 
R
I
 
I
D
 
K
T
 
I
T
 
A
F
 
D
L
 
I
I
 
V
S
 
G
-
 
V
H
 
E
R
 
V
L
 
I
P
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
G
N
 
E
F
 
F

1kolA Crystal structure of formaldehyde dehydrogenase (see paper)
34% identity, 95% coverage: 2:375/392 of query aligns to 3:378/396 of 1kolA

query
sites
1kolA
R
 
R
A
 
G
L
 
V
T
 
V
W
 
Y
H
 
L
G
 
G
S
 
S
H
 
G
D
 
K
V
 
V
R
 
E
V
 
V
D
 
Q
T
 
K
V
 
I
P
 
D
D
 
Y
P
 
P
E
 
K
I
 
M
M
 
Q
N
 
D
P
 
P
R
 
R
D
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
E
-
 
H
-
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
L
E
 
K
V
 
V
T
 
V
S
 
S
T
 
T
A
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
Q
H
|
H
L
 
M
Y
 
V
D
 
R
G
 
G
V
 
R
I
 
T
P
 
T
G
 
A
M
 
Q
M
 
V
S
 
-
G
 
G
D
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
I
M
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
V
V
 
I
E
 
E
T
 
K
G
 
G
P
 
R
K
 
D
-
 
V
S
 
E
T
 
N
L
 
L
Q
 
Q
K
 
I
G
 
G
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
V
 
S
V
 
V
P
 
P
F
|
F
T
 
N
I
 
V
S
 
A
C
|
C
G
 
G
S
 
R
C
|
C
F
 
R
F
 
S
C
|
C
K
 
K
K
 
E
H
 
M
L
 
H
Y
 
T
S
 
G
A
 
V
C
|
C
D
 
L
N
 
T
S
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
A
E
 
R
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
A
S
 
G
A
 
G
L
 
A
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
H
 
D
L
 
M
T
 
-
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
P
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
D
 
D
I
 
F
G
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
R
-
 
D
-
 
K
G
 
A
M
 
M
D
 
E
D
 
K
D
 
I
Q
 
R
V
 
D
L
 
L
-
 
T
F
 
C
L
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
|
T
G
 
G
W
 
Y
M
 
H
A
 
G
A
 
A
V
 
V
N
 
T
A
 
A
D
 
G
I
 
V
E
 
G
E
 
P
G
 
G
D
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
V
 
V
W
 
A
G
|
G
C
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
F
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
L
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
G
D
|
D
H
x
L
Y
 
N
P
 
P
N
 
A
R
|
R
L
 
L
A
 
A
L
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
A
L
 
Q
G
 
G
A
 
F
D
 
E
V
 
I
I
 
A
D
 
D
Y
 
L
K
 
S
-
 
L
Q
 
D
T
 
T
H
 
P
V
 
L
L
 
H
E
 
E
A
 
Q
L
 
I
M
 
A
E
 
A
M
 
L
S
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
P
G
 
E
P
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
A
I
 
V
D
 
D
A
|
A
V
|
V
G
 
G
M
 
F
E
 
E
S
 
A
H
x
R
G
 
G
F
x
H
-
 
G
-
 
H
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
A
T
 
T
V
|
V
L
 
L
D
 
N
N
 
S
I
 
L
K
 
M
Q
 
Q
T
 
V
V
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
T
R
 
R
K
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
S
 
G
I
 
I
P
|
P
G
 
G
V
x
L
Y
 
Y
-
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
L
L
 
S
D
 
I
K
 
R
F
 
F
P
 
G
T
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
-
M
 
W
E
 
A
K
 
K
G
 
S
L
 
H
Q
 
S
V
 
F
K
 
H
T
 
T
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
H
 
P
V
 
V
Q
 
M
H
 
K
Y
 
Y
I
 
N
S
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
M
K
 
Q
R
 
A
I
 
I
E
 
M
D
 
W
G
 
D
E
 
R
I
 
I
D
 
N
T
 
I
T
 
A
F
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
G
-
 
V
H
 
Q
R
 
V
L
 
I
P
 
S
L
 
L
E
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
G
N
 
E
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P46154 Glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase; FALDH; FDH; Formaldehyde dismutase; EC 1.2.1.46; EC 1.2.98.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 2:375/392 of query aligns to 5:380/399 of P46154

query
sites
P46154
R
 
R
A
 
G
L
 
V
T
 
V
W
 
Y
H
 
L
G
 
G
S
 
S
H
 
G
D
 
K
V
 
V
R
 
E
V
 
V
D
 
Q
T
 
K
V
 
I
P
 
D
D
 
Y
P
 
P
E
 
K
I
 
M
M
 
Q
N
 
D
P
 
P
R
 
R
D
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
E
-
 
H
-
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
L
E
 
K
V
 
V
T
 
V
S
 
S
T
 
T
A
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
|
D
L
x
Q
H
|
H
L
 
M
Y
 
V
D
 
R
G
 
G
V
 
R
I
 
T
P
 
T
G
 
A
M
 
Q
M
 
V
S
 
-
G
 
G
D
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
I
M
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
V
V
 
I
E
 
E
T
 
K
G
 
G
P
 
R
K
 
D
-
 
V
S
 
E
T
 
N
L
 
L
Q
 
Q
K
 
I
G
 
G
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
V
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
T
 
N
I
 
V
S
 
A
C
|
C
G
 
G
S
 
R
C
|
C
F
 
R
F
 
S
C
|
C
K
 
K
K
 
E
H
 
M
L
 
H
Y
 
T
S
 
G
A
 
V
C
|
C
D
 
L
N
 
T
S
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
A
E
 
R
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
A
S
 
G
A
 
G
L
 
A
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
H
 
D
L
 
M
T
 
-
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
P
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
L
R
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
D
 
D
I
 
F
G
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
R
-
 
D
-
 
K
G
 
A
M
 
M
D
 
E
D
 
K
D
 
I
Q
 
R
V
 
D
L
 
L
-
 
T
F
 
C
L
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
M
 
H
A
 
G
A
 
A
V
 
V
N
 
T
A
 
A
D
 
G
I
 
V
E
 
G
E
 
P
G
 
G
D
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
V
 
V
W
 
A
G
 
G
C
 
A
G
 
G
P
 
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
F
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
L
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
G
D
|
D
H
 
L
Y
 
N
P
 
P
N
 
A
R
|
R
L
 
L
A
 
A
L
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
A
L
 
Q
G
 
G
A
 
F
D
 
E
V
 
I
I
 
A
D
 
D
Y
 
L
K
 
S
-
 
L
Q
 
D
T
 
T
H
 
P
V
 
L
L
 
H
E
 
E
A
 
Q
L
 
I
M
 
A
E
 
A
M
 
L
S
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
P
G
 
E
P
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
M
 
F
E
 
E
S
 
A
H
x
R
G
|
G
F
x
H
-
 
G
-
 
H
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
A
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
S
I
 
L
K
 
M
Q
 
Q
T
 
V
V
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
T
R
 
R
K
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
S
 
G
I
 
I
P
|
P
G
|
G
V
x
L
Y
 
Y
-
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
L
L
 
S
D
 
I
K
 
R
F
 
F
P
 
G
T
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
-
M
 
W
E
 
A
K
 
K
G
 
S
L
 
H
Q
 
S
V
 
F
K
 
H
T
 
T
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
H
 
P
V
 
V
Q
 
M
H
 
K
Y
 
Y
I
 
N
S
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
M
K
 
Q
R
 
A
I
 
I
E
 
M
D
 
W
G
 
D
E
 
R
I
 
I
D
 
N
T
 
I
T
 
A
F
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
G
-
 
V
H
 
Q
R
 
V
L
 
I
P
 
S
L
 
L
E
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
G
N
 
E
F
 
F

5ylnA Zinc dependent alcohol dehydrogenase 2 from streptococcus pneumonia - apo form
29% identity, 99% coverage: 1:389/392 of query aligns to 5:343/348 of 5ylnA

query
sites
5ylnA
M
 
M
R
 
K
A
 
A
L
 
Y
T
 
T
W
 
Y
H
 
V
G
 
K
S
 
P
H
 
G
D
 
L
V
 
A
R
 
S
V
 
F
D
 
V
T
 
D
V
 
V
P
 
D
D
 
K
P
 
P
E
 
V
I
 
I
M
 
R
N
 
K
P
 
P
R
 
T
D
 
-
A
 
A
I
 
I
I
 
V
E
 
R
V
 
I
T
 
V
S
 
K
T
 
T
A
 
T
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
L
 
I
Y
 
I
D
 
K
G
 
G
V
 
D
I
 
V
P
 
P
G
 
T
M
 
C
M
 
Q
S
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
G
M
 
I
G
 
G
R
 
I
V
 
V
V
 
E
E
 
E
T
 
V
G
 
G
P
 
E
K
 
G
-
 
V
S
 
S
T
 
N
L
 
F
Q
 
K
K
 
K
G
 
G
Q
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
I
P
 
S
F
 
C
T
 
V
I
 
C
S
 
A
C
|
C
G
 
G
S
 
K
C
|
C
F
 
Y
F
 
Y
C
|
C
K
 
K
K
 
K
H
 
G
L
 
I
Y
 
Y
S
 
A
A
 
H
C
|
C
D
 
E
N
 
D
S
 
E
N
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
G
 
G
Y
 
W
-
 
I
-
 
F
-
 
I
P
 
D
G
 
G
G
 
M
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
H
S
 
A
D
 
D
I
 
N
G
 
T
P
 
L
I
 
Y
V
 
H
V
 
T
P
 
P
D
 
E
G
 
D
M
 
L
D
 
S
D
 
D
D
 
E
Q
 
A
V
 
L
L
 
V
F
 
M
L
 
L
S
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
-
 
E
M
 
I
A
 
G
A
 
V
V
 
L
N
 
K
A
 
G
D
 
K
I
 
V
E
 
E
E
 
P
G
 
G
D
 
C
T
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
W
 
I
G
 
G
C
 
S
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
Q
L
 
F
M
 
Y
G
 
S
A
 
P
A
 
A
R
 
K
V
 
L
I
 
I
A
 
M
I
 
V
D
 
D
H
 
L
Y
 
D
P
 
D
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
L
K
 
S
L
 
F
G
 
G
A
 
A
-
 
T
-
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
N
D
 
S
Y
 
S
K
 
D
Q
 
P
T
 
E
H
 
K
V
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
E
L
 
I
M
 
Y
E
 
D
M
 
L
S
 
T
G
 
D
G
 
G
L
 
R
G
 
G
P
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
 
I
E
 
P
S
 
A
H
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
T
L
 
F
D
 
D
N
 
F
I
 
C
K
 
Q
Q
 
K
T
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
D
G
 
G
R
 
T
V
 
V
S
 
A
I
 
N
P
 
C
G
 
G
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
G
 
K
F
 
P
L
 
V
D
 
E
K
 
-
F
 
F
P
 
D
T
 
L
G
 
D
A
 
K
L
 
L
M
 
W
E
 
I
K
 
R
G
 
N
L
 
I
Q
 
N
V
 
V
K
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
T
 
V
H
 
S
V
 
T
Q
 
-
H
 
N
Y
 
T
I
 
T
S
 
P
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
S
G
 
H
E
 
K
I
 
I
D
 
E
T
 
P
T
 
E
F
 
K
L
 
L
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
Y
L
 
F
P
 
K
L
 
L
E
 
S
E
 
E
A
 
I
P
 
E
K
 
K
G
 
A
Y
 
Y
Y
 
E
N
 
V
F
 
F
K
 
S
N
 
K
N
 
A
Q
 
A
D
 
D
D
 
H
W
 
H
T
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
I
K
 
E
T
 
N

1vj0A Crystal structure of alcohol dehydrogenase (tm0436) from thermotoga maritima at 2.00 a resolution
30% identity, 89% coverage: 25:371/392 of query aligns to 28:349/366 of 1vj0A

query
sites
1vj0A
P
 
P
R
 
R
D
 
G
A
 
S
I
 
I
-
 
L
I
 
V
E
 
E
V
 
I
T
 
L
S
 
S
T
 
A
A
 
G
I
 
V
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
V
H
|
H
L
 
M
Y
 
F
D
 
R
G
 
G
V
 
E
I
 
D
P
 
P
G
 
R
M
 
V
M
 
P
S
 
L
G
 
P
D
 
I
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
G
M
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
E
 
E
-
 
V
T
 
N
G
 
G
P
 
E
K
 
K
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
N
-
 
G
S
 
E
T
 
L
L
 
L
Q
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
W
P
 
N
F
 
R
T
 
G
I
 
I
S
 
T
C
|
C
G
 
G
S
 
E
C
|
C
F
 
Y
F
 
W
C
|
C
K
 
K
-
 
V
-
 
S
K
 
K
H
 
E
L
 
P
Y
 
Y
S
 
L
A
x
C
C
 
P
D
 
N
N
 
R
S
x
K
N
 
V
P
 
Y
V
 
G
E
 
I
N
 
N
Q
 
R
D
 
G
I
 
C
T
 
S
E
 
E
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
Y
S
 
P
H
 
H
L
 
L
T
 
R
G
 
G
G
 
C
Y
 
Y
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
S
A
 
S
E
 
H
Y
 
I
V
 
V
R
 
L
V
 
D
P
 
P
F
 
E
S
 
T
D
 
D
I
 
V
G
 
L
P
 
K
I
 
V
V
 
S
V
 
E
P
 
K
D
 
D
G
 
D
M
 
L
D
 
D
D
 
-
D
 
-
Q
 
-
V
 
V
L
 
L
F
 
A
L
 
M
S
 
A
D
 
M
I
x
C
L
 
S
P
 
G
T
 
A
G
x
T
W
 
A
M
 
Y
A
 
H
A
 
A
V
 
F
N
 
D
A
 
E
D
 
Y
I
 
P
E
 
E
E
 
S
-
 
F
-
 
A
G
 
G
D
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
V
V
 
I
W
 
Q
G
 
G
C
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
G
V
 
V
Q
 
V
S
 
I
A
 
A
L
 
R
L
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
I
D
 
A
H
 
G
Y
 
S
P
 
P
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
K
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
-
 
T
I
 
L
D
 
N
Y
 
R
K
 
R
Q
 
E
T
 
T
H
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
K
A
 
A
L
 
I
M
 
M
E
 
D
M
 
I
S
 
T
G
 
H
G
 
G
L
 
R
G
 
G
P
 
A
D
 
D
A
 
F
V
 
I
I
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
T
G
 
G
M
 
-
E
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
-
I
 
-
K
 
-
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
D
G
 
S
H
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
S
M
 
E
A
 
L
V
 
L
R
 
R
K
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
F
V
 
Y
S
 
S
I
 
V
P
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
A
G
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
V
D
 
P
K
 
Q
F
 
D
P
 
P
T
 
V
G
 
P
A
 
F
L
 
K
M
 
V
E
 
Y
K
 
E
G
 
W
L
 
L
Q
 
V
V
 
L
K
 
K
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
W
-
 
V
T
 
S
H
 
D
V
 
T
Q
 
S
H
 
H
Y
 
F
I
 
V
S
 
K
E
 
T
L
 
V
L
 
S
K
 
I
R
 
T
I
 
S
E
 
R
D
 
N
G
 
Y
E
 
Q
I
 
L
D
 
-
T
 
L
T
 
S
F
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
A
 
A
P
 
N
K
 
K
G
 
A

Sites not aligning to the query:

3fplA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of c. Beijerinckii adh by t. Brockii adh (see paper)
33% identity, 60% coverage: 27:263/392 of query aligns to 26:244/351 of 3fplA

query
sites
3fplA
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
E
 
R
V
 
P
T
 
L
S
 
A
T
 
V
A
 
S
I
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
H
|
H
-
 
T
L
 
V
Y
 
F
D
 
E
G
 
G
V
 
A
I
 
L
P
 
-
G
 
G
M
 
D
M
 
R
S
 
K
G
 
N
D
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
M
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
T
 
V
G
 
G
P
 
S
K
 
E
-
 
V
S
 
K
T
 
D
L
 
F
Q
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
V
P
 
P
F
 
C
T
 
T
I
 
-
S
 
-
C
 
-
G
 
-
S
 
-
C
 
-
F
 
-
F
 
-
C
 
-
K
 
-
K
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
T
N
 
P
P
x
D
V
 
W
E
 
R
N
x
S
Q
 
L
D
 
E
I
x
V
T
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Q
G
 
Q
H
 
H
A
x
S
V
 
N
S
 
G
A
 
M
L
 
L
F
 
A
G
 
G
-
 
W
-
 
K
Y
 
F
S
 
S
H
 
N
L
 
F
T
 
K
G
 
D
G
 
G
Y
 
V
P
 
F
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
Y
 
Y
V
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
F
 
D
S
 
A
D
 
D
I
 
M
G
 
N
P
 
L
I
 
A
V
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
D
M
 
M
D
 
P
D
 
L
D
 
E
Q
 
N
V
 
A
L
 
V
F
 
M
L
 
I
S
 
T
D
|
D
I
 
M
L
 
M
P
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
M
 
H
A
 
G
A
 
A
V
 
E
N
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
W
 
L
G
 
G
C
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
A
I
 
V
D
 
G
H
 
S
Y
 
R
P
 
P
N
 
V
R
 
C
L
 
V
A
 
D
L
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
Y
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
-
 
T
D
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
Y
 
Y
K
 
K
Q
 
D
T
 
G
H
 
P
V
 
I
L
 
E
E
 
S
A
 
Q
L
 
I
M
 
M
E
 
N
M
 
L
S
 
T
G
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
A
I
 
I
D
 
I
A
 
A
V
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7xy9A Cryo-em structure of secondary alcohol dehydrogenases tbsadh after carrier-free immobilization based on weak intermolecular interactions (see paper)
34% identity, 61% coverage: 25:263/392 of query aligns to 25:245/344 of 7xy9A

query
sites
7xy9A
P
 
P
R
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
E
 
R
V
 
P
T
 
L
S
 
A
T
 
V
A
 
A
I
 
P
C
|
C
G
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
I
H
 
H
-
 
T
L
 
V
Y
 
F
D
 
E
G
 
G
V
 
A
I
 
I
P
 
-
G
 
G
M
 
E
M
 
R
S
 
H
G
 
N
D
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
M
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
T
 
V
G
 
G
P
 
S
K
 
E
-
 
V
S
 
K
T
 
D
L
 
F
Q
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
-
T
 
-
I
 
-
S
 
-
C
 
-
G
 
-
S
 
-
C
 
-
F
 
-
F
 
-
C
 
-
K
 
-
K
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
A
N
 
N
S
 
T
N
 
P
P
 
D
V
 
W
E
 
R
N
 
T
Q
 
S
D
 
E
I
 
V
T
 
Q
E
 
R
G
 
G
L
 
Y
Y
x
H
G
 
Q
H
|
H
A
 
S
V
 
G
S
 
G
A
 
M
L
 
L
F
 
A
G
 
G
-
 
W
-
 
K
Y
 
F
S
 
S
H
 
N
L
 
V
T
 
K
G
 
D
G
 
G
Y
 
V
P
 
F
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
Y
 
F
V
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
F
 
D
S
 
A
D
 
D
I
 
M
G
 
N
P
 
L
I
 
A
V
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
M
 
I
D
 
P
D
 
L
D
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
F
 
M
L
 
I
S
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
P
 
T
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
x
H
A
 
G
A
 
A
V
 
E
N
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
W
 
L
G
 
G
C
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
A
I
 
V
D
 
G
H
 
S
Y
 
R
P
 
P
N
 
V
R
 
C
L
 
V
A
 
D
L
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
Y
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
-
 
T
D
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
Y
 
Y
K
 
K
Q
 
D
T
 
G
H
 
P
V
 
I
L
 
E
E
 
S
A
 
Q
L
 
I
M
 
M
E
 
N
M
 
L
S
 
T
G
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
A
I
 
I
D
 
I
A
 
A
V
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

O58389 L-threonine 3-dehydrogenase; L-ThrDH; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see 2 papers)
28% identity, 92% coverage: 1:362/392 of query aligns to 9:321/348 of O58389

query
sites
O58389
M
 
M
R
 
K
A
 
T
L
 
K
T
 
P
W
 
G
H
 
Y
G
 
G
S
 
A
H
 
E
D
 
L
V
 
V
R
 
E
V
 
V
D
 
D
T
 
-
V
 
V
P
 
P
D
 
K
P
 
P
E
 
-
I
 
-
M
 
-
N
 
G
P
 
P
R
 
G
D
 
E
A
 
V
I
 
L
I
 
I
E
 
K
V
 
V
T
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
L
 
I
Y
 
Y
D
 
E
G
 
W
-
 
N
-
 
E
-
 
W
V
 
A
I
 
Q
P
 
S
G
 
R
M
 
I
M
 
K
S
 
P
G
 
P
D
 
Q
I
 
I
L
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
M
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
T
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
G
-
 
V
S
 
E
T
 
G
L
 
I
Q
 
E
K
 
V
G
 
G
Q
 
D
R
 
Y
V
 
V
V
 
S
V
 
V
P
 
E
F
 
T
T
 
H
I
 
I
S
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
K
C
|
C
F
 
Y
F
 
A
C
|
C
K
 
R
K
 
R
H
 
G
L
 
Q
Y
 
Y
S
 
H
A
 
V
C
|
C
D
 
Q
N
 
N
S
 
T
N
 
K
P
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
H
 
V
A
 
D
V
 
T
S
 
D
A
 
G
L
 
V
F
 
F
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
R
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
A
S
 
Q
D
 
N
I
 
I
-
 
W
-
 
K
G
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
S
V
 
I
P
 
P
D
 
P
G
 
-
M
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
Q
 
E
V
 
Y
L
 
A
F
 
T
L
 
L
S
 
Q
D
x
E
I
 
P
L
 
L
P
 
G
T
 
N
G
 
A
W
 
-
M
 
V
A
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
L
A
 
A
D
 
G
I
 
P
E
 
I
E
 
S
G
 
G
D
 
K
T
 
S
V
 
V
A
 
L
V
 
I
W
 
T
G
 
G
C
 
A
G
 
G
P
 
P
V
x
L
G
 
G
L
 
L
F
 
L
A
 
G
V
 
I
Q
 
A
S
 
V
A
 
A
L
 
K
L
 
A
M
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
Y
R
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
S
D
x
E
H
 
P
Y
 
S
P
 
D
N
 
F
R
|
R
L
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
-
 
Y
V
 
V
I
 
I
D
 
N
Y
 
P
K
 
F
Q
 
E
T
 
E