SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_024851784.1 NCBI__GCF_000526715.1:WP_024851784.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3oetH D-erythronate-4-phosphate dehydrogenase complexed with NAD
40% identity, 99% coverage: 3:372/374 of query aligns to 4:375/378 of 3oetH

query
sites
3oetH
K
 
K
I
 
I
V
 
L
I
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
N
V
 
M
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
M
 
L
F
 
F
S
 
S
H
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
K
L
 
A
I
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
R
D
 
P
I
 
I
N
 
P
A
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
L
K
 
N
D
 
H
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
M
V
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
V
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
P
V
 
I
S
 
N
F
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
A
V
 
T
V
 
A
G
 
G
L
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
V
D
 
D
Q
 
E
H
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
K
D
 
Q
Q
 
A
H
 
G
I
 
I
H
 
G
F
 
F
Y
 
S
S
 
A
A
 
A
Q
 
P
G
 
G
C
 
C
N
|
N
A
 
A
N
 
I
S
 
A
V
|
V
S
 
V
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
I
 
F
S
 
S
C
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
R
K
 
D
G
 
G
F
 
F
Q
 
S
L
 
L
K
 
R
D
 
D
K
 
R
S
 
T
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
|
G
V
 
V
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
K
 
S
L
 
R
L
 
L
E
 
Q
Q
 
T
K
 
R
A
 
L
R
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
R
V
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
C
D
|
D
P
|
P
P
|
P
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
R
 
R
E
 
G
G
 
D
L
 
E
P
 
G
H
 
D
F
 
F
V
 
R
N
 
T
L
 
L
Q
 
D
T
 
E
A
 
L
L
 
V
-
 
Q
S
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
L
S
 
T
F
 
F
H
|
H
T
|
T
P
|
P
L
 
L
T
 
Y
T
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
P
H
x
Y
P
 
K
S
x
T
Y
 
L
Q
 
H
L
 
L
L
 
A
N
 
D
S
 
E
T
 
T
N
 
L
F
 
I
H
 
R
L
 
R
V
 
L
T
 
K
P
 
P
S
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
|
A
A
x
C
R
|
R
G
 
G
G
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
N
T
 
A
I
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
R
W
 
L
T
 
N
Q
 
A
T
 
G
P
 
Q
T
 
P
L
 
L
S
 
S
N
 
V
I
 
V
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
W
E
|
E
N
 
G
E
|
E
P
 
P
N
 
D
I
 
L
N
 
N
E
 
V
S
 
A
L
 
L
Y
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
I
A
x
G
T
 
T
P
 
S
H
|
H
I
 
I
A
|
A
G
 
G
H
 
Y
A
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
G
K
 
K
I
 
A
K
 
R
G
 
G
S
 
T
S
 
T
M
 
Q
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
V
 
A
L
 
Y
C
 
S
Q
 
A
H
 
F
W
 
I
N
 
G
E
 
R
T
 
E
P
 
Q
Q
 
R
N
 
V
H
 
A
W
 
L
Q
 
E
E
 
T
K
 
L
V
 
L
P
 
P
H
 
A
P
 
P
K
 
E
T
 
F
P
 
G
L
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
-
L
 
L
E
 
H
K
 
G
P
 
P
F
 
L
-
 
D
Q
 
Q
T
 
P
T
 
T
L
 
L
F
 
K
N
 
R
I
 
L
V
 
A
R
 
H
Q
 
L
C
 
V
Y
 
Y
D
 
D
P
 
V
L
 
R
T
 
R
D
 
D
D
 
D
Y
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
S
 
-
T
 
-
R
 
K
I
 
V
N
 
A
E
 
G
V
 
I
Y
 
P
K
 
G
K
 
E
F
 
F
E
 
D
Y
 
K
Y
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
N
Y
 
Y
P
 
L
T
 
E
H
 
R
H
 
R
E
 
E
W
 
W
T
 
S
Q
 
S
F
 
L
D
 
Y
V
 
V
K
 
M
S
 
C
G
 
D
R
 
D
L
 
E
A
 
T
A
 
A
E
 
A
N
 
A
S
 
L
C
 
L
I
 
C
K
 
K
A
 
-
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
N
V
 
A
L
 
V

5dt9A Crystal structure of a putative d-erythronate-4-phosphate dehydrogenase from vibrio cholerae
37% identity, 99% coverage: 3:371/374 of query aligns to 5:376/379 of 5dt9A

query
sites
5dt9A
K
 
K
I
 
I
V
 
L
I
 
I
D
 
D
D
 
E
A
 
N
V
 
M
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
E
 
A
M
 
L
F
 
F
S
 
S
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
I
L
 
L
I
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
R
D
 
T
I
 
L
N
 
T
A
 
A
E
 
D
T
 
D
V
 
L
K
 
I
D
 
D
A
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
M
V
 
I
R
 
R
S
 
S
R
 
V
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
L
-
 
A
N
 
K
G
 
A
S
 
N
T
 
R
V
 
L
S
 
K
F
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
A
V
 
T
V
 
A
G
 
G
L
 
M
D
 
D
H
 
H
I
 
V
D
 
D
Q
 
Q
H
 
A
Y
 
L
L
 
L
A
 
R
D
 
E
Q
 
R
H
 
G
I
 
I
H
 
F
F
 
F
Y
 
T
S
 
A
A
 
A
Q
 
P
G
 
G
C
 
C
N
|
N
A
 
K
N
 
V
S
 
G
V
 
V
S
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
I
 
F
S
 
S
C
 
V
L
 
L
L
 
M
Y
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
Q
K
 
Q
G
 
G
F
 
F
Q
 
S
L
 
V
K
 
F
D
 
D
K
 
K
S
 
T
I
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
V
 
A
G
|
G
N
x
Q
V
|
V
G
 
G
K
 
S
L
 
Y
L
 
L
E
 
A
Q
 
K
K
 
C
A
 
L
R
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
N
 
N
D
|
D
P
 
P
P
 
P
R
x
K
Q
 
Q
E
 
A
R
 
Q
E
 
G
G
 
D
L
 
E
P
 
R
H
 
E
F
 
F
V
 
T
N
 
E
L
 
L
Q
 
E
T
 
T
A
 
L
L
 
L
S
 
K
-
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
T
F
 
L
H
|
H
T
|
T
P
|
P
L
 
I
T
 
T
T
 
R
E
 
G
G
 
G
A
 
E
H
x
W
P
 
P
S
x
T
Y
 
H
Q
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
D
S
 
A
T
 
A
N
 
I
F
 
L
H
 
E
L
 
Q
V
 
L
T
 
R
P
 
S
S
 
D
T
 
Q
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
|
A
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
N
T
 
A
I
 
A
W
 
L
T
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
Q
Q
 
Q
T
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
F
S
 
T
N
 
A
I
 
V
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
F
E
 
E
N
 
F
E
|
E
P
 
P
N
 
Q
I
 
V
N
 
D
E
 
M
S
 
E
L
 
L
Y
 
L
Q
 
P
A
 
L
A
 
L
D
 
A
I
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
|
A
G
|
G
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
G
K
 
K
I
 
A
K
 
R
G
 
G
S
 
T
S
 
T
M
 
M
V
 
I
Y
 
F
E
 
N
V
 
S
L
 
Y
C
 
C
Q
 
E
H
 
F
W
 
L
N
 
G
E
 
S
T
 
A
P
 
H
Q
 
C
N
 
A
H
 
N
W
 
P
Q
 
A
E
 
S
K
 
L
V
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
A
K
 
P
T
 
V
P
 
P
L
 
K
I
 
V
T
 
Y
D
 
-
L
 
L
E
 
E
K
 
R
P
 
A
F
 
W
-
 
D
Q
 
E
T
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
R
N
 
T
I
 
L
V
 
T
R
 
Q
Q
 
I
C
 
I
Y
 
Y
D
 
D
P
 
V
L
 
R
T
 
K
D
 
D
D
 
D
Y
 
A
A
 
Q
I
 
F
R
 
R
S
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
-
N
 
R
E
 
E
V
 
I
Y
 
H
K
 
Q
-
 
P
-
 
G
K
 
A
F
 
F
E
 
D
Y
 
L
Y
 
M
R
 
R
R
 
K
H
 
H
Y
 
Y
P
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
W
 
W
T
 
D
Q
 
R
F
 
R
D
 
E
V
 
Y
K
 
S
S
 
A
G
 
V
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
G
N
 
A
S
 
D
C
 
C
-
 
H
-
 
L
-
 
A
-
 
P
I
 
L
K
 
A
A
 
K
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
Q
V
 
V

2o4cA Crystal structure of d-erythronate-4-phosphate dehydrogenase complexed with NAD (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:372/374 of query aligns to 2:380/380 of 2o4cA

query
sites
2o4cA
K
 
R
I
 
I
V
 
L
I
 
A
D
 
D
D
 
E
A
 
N
V
 
I
P
 
P
Y
 
V
A
 
V
Q
 
D
E
 
A
M
 
F
F
 
F
S
 
A
H
 
D
L
 
Q
G
 
G
E
 
S
I
 
I
T
 
R
L
 
R
I
 
L
P
 
P
G
 
G
R
 
R
D
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
R
E
 
A
T
 
A
V
 
L
K
 
A
D
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
V
T
 
T
Q
 
E
V
 
V
N
 
S
E
 
R
S
 
A
L
 
A
L
 
L
N
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
P
V
 
V
S
 
R
F
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
C
V
x
T
V
 
I
G
 
G
L
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
L
D
 
D
Q
 
L
H
 
D
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
D
 
E
Q
 
A
H
 
G
I
 
I
H
 
A
F
 
W
Y
 
S
S
 
S
A
 
A
Q
 
P
G
 
G
C
 
C
N
|
N
A
 
A
N
 
R
S
 
G
V
|
V
S
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
L
S
 
G
C
 
C
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
L
 
M
A
 
A
E
 
E
E
 
V
K
 
R
G
 
G
F
 
A
Q
 
D
L
 
L
K
 
A
D
 
E
K
 
R
S
 
T
I
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
|
G
V
 
A
G
|
G
N
x
Q
V
|
V
G
 
G
K
 
G
L
 
R
L
 
L
E
 
V
Q
 
E
K
 
V
A
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
M
 
W
T
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
C
D
|
D
P
|
P
P
|
P
R
 
R
Q
 
Q
E
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
P
L
 
D
P
 
G
H
 
E
F
 
F
V
 
V
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
T
 
R
A
 
L
L
 
L
S
 
A
-
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
S
F
 
L
H
|
H
T
|
T
P
|
P
L
 
L
T
 
N
T
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
S
x
T
Y
 
R
Q
 
H
L
 
L
L
 
L
N
 
D
S
 
E
T
 
P
N
 
R
F
 
L
H
 
A
L
 
A
V
 
L
T
 
R
P
 
P
S
 
G
T
 
T
I
 
W
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
|
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
V
D
 
D
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
E
 
R
T
 
R
I
 
L
W
 
L
T
 
E
Q
 
G
T
 
G
P
 
A
T
 
D
L
 
L
S
 
E
N
 
V
I
 
A
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
W
E
 
E
N
 
G
E
|
E
P
 
P
N
 
Q
I
 
A
N
 
D
E
 
P
S
 
E
L
 
L
Y
 
A
Q
 
A
A
 
R
A
 
C
D
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
|
A
G
|
G
H
 
Y
A
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
G
K
 
K
I
 
L
K
 
R
G
 
G
S
 
T
S
 
A
M
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
E
 
Q
V
 
A
L
 
Y
C
 
C
Q
 
A
H
 
-
W
 
W
N
 
R
E
 
G
T
 
I
P
 
A
Q
 
E
N
 
R
H
 
V
W
 
S
Q
 
L
E
 
Q
K
 
D
V
 
V
P
 
-
H
 
L
P
 
P
K
 
E
T
 
T
P
 
W
L
 
L
I
 
A
T
 
G
D
 
L
L
 
Q
E
 
L
K
 
N
P
 
P
F
 
G
-
 
C
-
 
D
-
 
P
Q
 
A
T
 
W
T
 
A
L
 
L
F
 
A
N
 
T
I
 
L
V
 
C
R
 
R
Q
 
A
C
 
V
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
L
 
R
T
 
S
D
 
D
D
 
D
Y
 
A
A
 
A
I
 
F
R
 
R
S
 
R
T
 
S
R
 
L
I
 
T
N
 
G
E
 
D
V
 
S
Y
 
A
K
 
T
K
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
A
F
 
F
E
 
D
Y
 
A
Y
 
L
R
|
R
R
 
K
H
 
H
Y
 
Y
P
 
P
T
 
P
H
 
R
H
 
R
E
 
E
W
 
I
T
 
T
Q
 
G
F
 
L
D
 
R
V
 
V
K
 
A
S
 
T
G
 
G
R
 
G
L
 
Q
A
 
A
A
 
E
E
 
L
N
 
Q
S
 
R
C
 
V
I
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
A
N
 
Q
V
 
L
L
 
V

Q9I3W9 Erythronate-4-phosphate dehydrogenase; EC 1.1.1.290 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:372/374 of query aligns to 2:380/380 of Q9I3W9

query
sites
Q9I3W9
K
 
R
I
 
I
V
 
L
I
 
A
D
 
D
D
 
E
A
 
N
V
 
I
P
 
P
Y
 
V
A
 
V
Q
 
D
E
 
A
M
 
F
F
 
F
S
 
A
H
 
D
L
 
Q
G
 
G
E
 
S
I
 
I
T
 
R
L
 
R
I
 
L
P
 
P
G
 
G
R
 
R
D
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
R
E
 
A
T
 
A
V
 
L
K
 
A
D
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
V
T
 
T
Q
 
E
V
 
V
N
 
S
E
 
R
S
 
A
L
 
A
L
 
L
N
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
P
V
 
V
S
 
R
F
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
x
C
V
 
T
V
 
I
G
 
G
L
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
L
D
 
D
Q
 
L
H
 
D
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
D
 
E
Q
 
A
H
 
G
I
 
I
H
 
A
F
 
W
Y
 
S
S
 
S
A
 
A
Q
 
P
G
 
G
C
|
C
N
 
N
A
 
A
N
 
R
S
 
G
V
 
V
S
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
L
S
 
G
C
 
C
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
L
 
M
A
 
A
E
 
E
E
 
V
K
 
R
G
 
G
F
 
A
Q
 
D
L
 
L
K
 
A
D
 
E
K
 
R
S
 
T
I
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
N
x
Q
V
|
V
G
 
G
K
 
G
L
 
R
L
 
L
E
 
V
Q
 
E
K
 
V
A
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
M
 
W
T
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
C
D
|
D
P
 
P
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
E
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
P
L
 
D
P
 
G
H
 
E
F
 
F
V
 
V
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
T
 
R
A
 
L
L
 
L
S
 
A
-
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
S
F
 
L
H
 
H
T
|
T
P
 
P
L
 
L
T
 
N
T
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Y
 
R
Q
 
H
L
 
L
L
 
L
N
 
D
S
 
E
T
 
P
N
 
R
F
 
L
H
 
A
L
 
A
V
 
L
T
 
R
P
 
P
S
 
G
T
 
T
I
 
W
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
|
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
V
D
 
D
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
E
 
R
T
 
R
I
 
L
W
 
L
T
 
E
Q
 
G
T
 
G
P
 
A
T
 
D
L
 
L
S
 
E
N
 
V
I
 
A
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
W
E
 
E
N
 
G
E
 
E
P
 
P
N
 
Q
I
 
A
N
 
D
E
 
P
S
 
E
L
 
L
Y
 
A
Q
 
A
A
 
R
A
 
C
D
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
|
G
H
 
Y
A
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
G
K
 
K
I
 
L
K
 
R
G
 
G
S
 
T
S
 
A
M
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
E
 
Q
V
 
A
L
 
Y
C
 
C
Q
 
A
H
 
-
W
 
W
N
 
R
E
 
G
T
 
I
P
 
A
Q
 
E
N
 
R
H
 
V
W
 
S
Q
 
L
E
 
Q
K
 
D
V
 
V
P
 
-
H
 
L
P
 
P
K
 
E
T
 
T
P
 
W
L
 
L
I
 
A
T
 
G
D
 
L
L
 
Q
E
 
L
K
 
N
P
 
P
F
 
G
-
 
C
-
 
D
-
 
P
Q
 
A
T
 
W
T
 
A
L
 
L
F
 
A
N
 
T
I
 
L
V
 
C
R
 
R
Q
 
A
C
 
V
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
L
 
R
T
 
S
D
 
D
D
 
D
Y
 
A
A
 
A
I
 
F
R
 
R
S
 
R
T
 
S
R
 
L
I
 
T
N
 
G
E
 
D
V
 
S
Y
 
A
K
 
T
K
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
A
F
 
F
E
 
D
Y
 
A
Y
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
H
Y
 
Y
P
 
P
T
 
P
H
 
R
H
 
R
E
 
E
W
 
I
T
 
T
Q
 
G
F
 
L
D
 
R
V
 
V
K
 
A
S
 
T
G
 
G
R
 
G
L
 
Q
A
 
A
A
 
E
E
 
L
N
 
Q
S
 
R
C
 
V
I
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
A
N
 
Q
V
 
L
L
 
V

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
28% identity, 66% coverage: 27:272/374 of query aligns to 30:300/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
P
 
P
G
 
D
R
 
E
D
 
D
I
 
R
N
 
L
A
 
V
E
 
E
T
 
L
V
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
K
T
 
P
Q
 
K
V
 
V
N
 
T
E
 
R
S
 
R
L
 
V
L
 
I
N
 
E
G
 
S
S
 
A
-
 
P
T
 
K
V
 
L
S
 
K
F
 
V
V
 
I
G
 
A
S
 
R
T
 
A
V
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
Q
 
V
H
 
E
Y
 
A
L
 
A
A
 
K
D
 
E
Q
 
K
H
 
G
I
 
I
H
 
E
F
 
V
Y
 
V
S
 
N
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
C
 
A
N
x
S
A
 
S
N
 
R
S
 
S
V
|
V
S
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
A
I
 
V
S
 
G
C
 
L
L
 
M
L
 
F
Y
 
S
L
 
V
A
 
A
E
 
R
E
 
K
K
 
I
G
 
A
F
 
F
Q
 
A
L
 
D
K
 
R
D
 
K
K
 
M
S
 
R
I
 
E
G
 
G
I
 
V
-
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
I
G
 
E
N
 
L
V
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
T
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
x
G
-
x
F
-
x
G
-
x
R
-
x
I
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
L
 
V
E
 
A
Q
 
K
K
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
N
V
 
I
L
 
L
L
 
L
N
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
 
Y
P
 
P
R
 
N
Q
 
E
E
 
E
R
 
R
-
 
A
-
 
K
E
 
E
G
 
V
L
 
N
P
 
G
H
 
K
F
 
F
V
 
V
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
T
 
T
A
 
L
L
 
L
S
 
K
-
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
T
F
 
I
H
 
H
T
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
V
T
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
E
P
 
S
S
x
T
Y
 
Y
Q
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
S
 
E
T
 
E
N
 
R
F
 
L
H
 
K
L
 
L
V
 
M
T
 
K
P
 
K
S
 
T
T
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
x
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
T
 
N
I
 
A
W
 
L
T
 
V
Q
 
K
T
 
A
P
 
L
T
 
K
L
 
E
S
 
G
N
 
W
I
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
G
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
F
E
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
L
I
 
P
N
 
K
E
 
D
S
 
H
L
 
P
Y
 
L
Q
 
T
A
 
K
A
 
F
D
 
D
-
 
N
-
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
A
H
 
S
A
 
T
L
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
I
 
E
K
 
R
G
 
A
S
 
G
S
 
V
M
 
E
V
 
V
Y
 
A
E
 
E
V
 
K
L
 
V
C
 
V
Q
 
K

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
25% identity, 62% coverage: 34:266/374 of query aligns to 41:304/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
E
 
E
T
 
K
V
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
T
R
x
M
S
x
L
R
 
S
T
 
E
Q
 
R
V
 
I
N
 
D
E
 
Q
S
 
E
L
 
V
L
 
F
-
 
E
N
 
N
G
 
A
S
 
P
T
 
R
V
 
L
S
 
R
F
 
I
V
 
V
G
 
A
S
 
N
T
x
Y
V
x
A
V
|
V
G
|
G
L
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
Q
 
V
H
 
E
Y
 
E
L
 
A
A
 
T
D
 
R
Q
 
R
H
 
G
I
 
I
H
 
Y
F
 
V
Y
 
T
S
 
N
A
 
T
Q
 
P
G
 
D
C
 
V
N
x
L
A
 
T
N
 
N
S
 
A
V
x
T
S
 
A
E
 
D
Y
 
H
V
 
A
I
 
F
S
 
A
C
 
L
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
L
 
T
A
 
A
E
 
R
E
 
H
K
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
K
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
G
 
G
F
 
Y
Q
 
E
L
 
L
K
 
Y
D
 
G
K
 
K
S
 
T
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
V
x
F
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
Q
L
 
A
L
 
I
E
 
A
Q
 
R
K
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
F
G
 
N
M
 
M
T
 
R
V
 
I
L
 
L
L
 
Y
N
 
Y
D
x
S
P
x
R
P
 
T
R
 
R
Q
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
E
 
E
R
 
K
E
 
E
G
 
L
L
 
G
P
 
A
H
 
E
F
 
Y
V
 
R
N
 
P
L
 
L
Q
 
E
T
 
E
A
 
V
L
 
L
S
 
K
-
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
S
 
I
F
 
L
H
x
A
T
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
T
 
K
E
 
E
G
x
T
A
 
M
H
 
Y
P
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
L
 
M
L
 
I
N
 
N
S
 
E
T
 
E
N
 
R
F
 
L
H
 
K
L
 
L
V
 
M
T
 
K
P
 
P
S
 
T
T
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
T
 
K
I
 
A
W
 
L
T
 
I
Q
 
K
T
 
A
P
 
L
T
 
K
L
 
E
S
 
G
N
 
W
I
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
G
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
F
E
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
Y
I
 
Y
N
 
N
E
 
E
S
 
E
L
 
L
Y
 
F
Q
 
S
A
 
L
A
 
D
D
 
N
I
 
V
A
 
V
-
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
S
H
 
A
A
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
A
K
 
R
I
 
E
K
 
A
G
 
M
S
 
A
S
 
E
M
 
L
V
 
V

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
27% identity, 65% coverage: 27:268/374 of query aligns to 30:295/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
P
 
P
G
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
K
N
 
L
A
 
L
E
 
A
T
 
A
V
 
V
K
 
P
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
T
V
 
V
N
 
D
E
 
A
S
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
A
G
 
A
S
 
A
-
 
P
T
 
K
V
 
L
S
 
K
F
 
I
V
 
V
G
 
A
S
 
R
T
 
A
V
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
Q
 
V
H
 
D
Y
 
A
L
 
A
A
 
T
D
 
A
Q
 
R
H
 
G
I
 
V
H
 
L
F
 
V
Y
 
V
S
 
N
A
 
A
Q
 
P
G
 
T
C
 
S
N
|
N
A
 
I
N
 
H
S
 
S
V
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
S
 
S
E
 
R
Y
 
Q
V
 
I
I
 
P
S
 
A
C
 
A
L
 
D
L
 
A
Y
 
S
L
 
L
A
 
R
E
 
E
E
 
H
-
 
T
-
 
W
-
 
K
-
 
R
-
 
S
-
 
S
-
 
F
K
 
S
G
 
G
F
 
T
Q
 
E
L
 
I
K
 
F
D
 
G
K
 
K
S
 
T
I
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
L
G
 
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
E
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
I
R
 
A
G
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
A
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
L
 
A
N
 
Y
D
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
P
 
P
P
 
A
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
R
 
Q
E
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
-
H
 
E
F
 
L
V
 
L
N
 
S
L
 
L
Q
 
D
T
 
D
A
 
L
L
 
L
S
 
A
-
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
S
F
 
V
H
 
H
T
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
T
 
P
E
 
E
G
 
T
A
 
A
H
 
G
P
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
L
 
L
L
 
I
N
 
D
S
 
K
T
 
E
N
 
A
F
 
L
H
 
A
L
 
K
V
 
T
T
 
K
P
 
P
S
 
G
T
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
A
I
 
A
W
 
L
T
 
A
Q
 
D
T
 
A
P
 
I
T
 
T
L
 
G
S
 
G
N
 
H
I
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
G
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
F
E
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
N
 
C
I
 
T
N
 
D
E
 
S
S
 
P
L
 
L
Y
 
F
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
D
 
Q
-
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
H
 
S
A
 
T
L
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
I
 
D
K
 
R
G
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
D
V
 
V
Y
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
27% identity, 65% coverage: 27:268/374 of query aligns to 31:296/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
P
 
P
G
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
K
N
 
L
A
 
L
E
 
A
T
 
A
V
 
V
K
 
P
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
T
V
 
V
N
 
D
E
 
A
S
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
A
G
 
A
S
 
A
-
 
P
T
 
K
V
 
L
S
 
K
F
 
I
V
 
V
G
 
A
S
x
R
T
 
A
V
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
Q
 
V
H
 
D
Y
 
A
L
 
A
A
 
T
D
 
A
Q
 
R
H
 
G
I
 
V
H
 
L
F
 
V
Y
 
V
S
 
N
A
 
A
Q
 
P
G
 
T
C
 
S
N
|
N
A
 
I
N
 
H
S
 
S
V
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
S
 
S
E
 
R
Y
 
Q
V
 
I
I
 
P
S
 
A
C
 
A
L
 
D
L
 
A
Y
 
S
L
 
L
A
 
R
E
 
E
E
 
H
-
 
T
-
 
W
-
 
K
-
 
R
-
 
S
-
 
S
-
 
F
K
 
S
G
 
G
F
 
T
Q
 
E
L
 
I
K
 
F
D
 
G
K
 
K
S
 
T
I
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
L
G
 
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
E
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
I
R
 
A
G
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
A
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
L
 
A
N
 
Y
D
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
P
 
P
P
 
A
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
R
 
Q
E
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
-
H
 
E
F
 
L
V
 
L
N
 
S
L
 
L
Q
 
D
T
 
D
A
 
L
L
 
L
S
 
A
-
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
S
F
 
V
H
 
H
T
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
T
 
P
E
 
E
G
 
T
A
 
A
H
 
G
P
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
L
 
L
L
 
I
N
 
D
S
 
K
T
 
E
N
 
A
F
 
L
H
 
A
L
 
K
V
 
T
T
 
K
P
 
P
S
 
G
T
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
A
I
 
A
W
 
L
T
 
A
Q
 
D
T
 
A
P
 
I
T
 
T
L
 
G
S
 
G
N
 
H
I
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
G
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
F
E
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
N
 
C
I
 
T
N
 
D
E
 
S
S
 
P
L
 
L
Y
 
F
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
D
 
Q
-
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
 
G
G
x
A
H
 
S
A
 
T
L
 
A
E
 
E
A
 
A
K
x
Q
I
 
D
K
 
R
G
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
D
V
 
V
Y
 
A
E
 
E

4njoA Crystal structure of cofactor(NAD+) bound 3-phosphoglycerate dehydrogenase in entamoeba histolytica (see paper)
27% identity, 73% coverage: 3:274/374 of query aligns to 4:289/302 of 4njoA

query
sites
4njoA
K
 
K
I
 
I
V
 
V
I
 
V
D
 
I
D
 
T
A
 
E
V
 
K
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
Q
 
E
E
 
N
M
 
A
F
 
V
S
 
K
H
 
G
L
 
I
G
 
R
E
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
E
I
 
K
P
 
A
G
 
G
R
 
H
D
 
E
I
 
V
N
 
V
A
 
M
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
I
E
 
E
T
 
R
V
 
I
K
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
D
T
 
K
Q
 
I
V
 
D
N
 
E
E
 
E
S
 
I
L
 
I
L
 
K
N
 
A
G
 
G
S
 
E
T
 
K
V
 
V
S
 
K
F
 
I
V
 
I
G
 
V
S
 
R
T
 
A
V
 
G
V
x
A
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
Q
 
I
H
 
E
Y
 
A
L
 
C
A
 
N
D
 
Q
Q
 
G
H
 
K
I
 
I
H
 
V
F
 
V
Y
 
M
S
 
N
A
 
T
Q
 
P
G
 
G
C
 
Q
N
|
N
A
 
R
N
 
N
S
 
G
V
|
V
S
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
C
I
 
I
S
 
G
C
 
M
L
 
M
L
 
I
Y
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
K
-
 
G
L
 
F
A
 
K
E
 
E
E
 
G
K
 
K
G
 
G
F
 
R
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
C
G
 
G
V
 
C
G
|
G
N
x
Y
V
|
V
G
 
G
K
 
K
L
 
R
L
 
V
E
 
K
Q
 
E
K
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
I
L
 
K
L
 
V
N
 
Y
D
|
D
P
 
P
P
x
F
R
 
I
Q
 
T
E
 
T
R
 
E
E
 
N
G
 
Q
L
 
V
P
 
K
H
 
K
F
 
I
V
 
E
N
 
E
L
 
L
Q
 
F
T
 
E
A
 
-
L
 
-
S
 
E
A
 
C
D
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
S
F
 
L
H
|
H
T
x
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
T
 
K
E
 
E
-
 
T
G
 
K
A
 
G
H
 
K
P
 
I
S
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
N
 
K
S
 
K
T
 
L
N
 
P
F
 
Y
H
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
G
T
 
G
I
 
M
L
 
I
I
 
C
N
 
N
A
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
K
G
 
E
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
I
T
 
R
I
 
I
W
 
M
T
 
R
Q
 
E
T
 
R
P
 
E
T
 
D
L
 
L
S
 
I
N
 
Y
I
 
I
I
 
T
D
|
D
C
 
V
W
 
A
E
 
P
N
 
T
E
x
S
P
 
K
N
 
V
I
 
F
N
 
N
E
 
N
S
 
E
L
 
-
Y
 
F
Q
 
K
A
 
G
A
 
R
D
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
-
 
I
H
x
K
I
 
I
A
x
G
G
 
A
H
 
E
A
 
T
L
 
E
E
 
E
A
 
S
K
 
N
I
 
I
K
 
N
G
 
A
S
 
G
S
 
M
M
 
A
V
 
A
Y
 
A
E
 
S
V
 
Q
L
 
I
C
 
C
Q
 
D
H
 
F
W
 
F

4njmA Crystal structure of phosphoglycerate bound 3-phosphoglycerate dehydrogenase in entamoeba histolytica (see paper)
27% identity, 73% coverage: 3:274/374 of query aligns to 4:289/303 of 4njmA

query
sites
4njmA
K
 
K
I
 
I
V
 
V
I
 
V
D
 
I
D
 
T
A
 
E
V
x
K
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
Q
 
E
E
 
N
M
 
A
F
 
V
S
 
K
H
 
G
L
 
I
G
 
R
E
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
E
I
 
K
P
 
A
G
 
G
R
 
H
D
 
E
I
 
V
N
 
V
A
 
M
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
I
E
 
E
T
 
R
V
 
I
K
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
V
I
 
I
V
 
V
R
|
R
S
|
S
R
 
D
T
 
K
Q
 
I
V
 
D
N
 
E
E
 
E
S
 
I
L
 
I
L
 
K
N
 
A
G
 
G
S
 
E
T
 
K
V
 
V
S
 
K
F
 
I
V
 
I
G
 
V
S
x
R
T
 
A
V
x
G
V
x
A
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
Q
 
I
H
 
E
Y
 
A
L
 
C
A
 
N
D
 
Q
Q
 
G
H
 
K
I
 
I
H
 
V
F
 
V
Y
 
M
S
 
N
A
 
T
Q
 
P
G
 
G
C
 
Q
N
|
N
A
 
R
N
 
N
S
 
G
V
 
V
S
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
C
I
 
I
S
 
G
C
 
M
L
 
M
L
 
I
Y
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
K
-
 
G
L
 
F
A
 
K
E
 
E
E
 
G
K
 
K
G
 
G
F
 
R
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
C
G
 
G
V
 
C
G
 
G
N
 
Y
V
 
V
G
 
G
K
 
K
L
 
R
L
 
V
E
 
K
Q
 
E
K
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
I
L
 
K
L
 
V
N
 
Y
D
 
D
P
 
P
P
 
F
R
 
I
Q
 
T
E
 
T
R
 
E
E
 
N
G
 
Q
L
 
V
P
 
K
H
 
K
F
 
I
V
 
E
N
 
E
L
 
L
Q
 
F
T
 
E
A
 
-
L
 
-
S
 
E
A
 
C
D
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
S
F
 
L
H
 
H
T
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
T
 
K
E
 
E
-
 
T
G
 
K
A
 
G
H
 
K
P
 
I
S
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
N
 
K
S
 
K
T
 
L
N
 
P
F
 
Y
H
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
G
T
 
G
I
 
M
L
 
I
I
 
C
N
 
N
A
 
T
A
 
A
R
|
R
G
 
K
G
 
E
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
I
T
 
R
I
 
I
W
 
M
T
 
R
Q
 
E
T
 
R
P
 
E
T
 
D
L
 
L
S
 
I
N
 
Y
I
 
I
I
 
T
D
|
D
C
 
V
W
 
A
E
 
P
N
 
T
E
x
S
P
 
K
N
 
V
I
 
F
N
 
N
E
 
N
S
 
E
L
 
-
Y
 
F
Q
 
K
A
 
G
A
 
R
D
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
-
 
I
H
x
K
I
 
I
A
 
G
G
x
A
H
 
E
A
 
T
L
 
E
E
 
E
A
 
S
K
 
N
I
 
I
K
 
N
G
 
A
S
 
G
S
 
M
M
 
A
V
 
A
Y
 
A
E
 
S
V
 
Q
L
 
I
C
 
C
Q
 
D
H
 
F
W
 
F

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
23% identity, 71% coverage: 29:292/374 of query aligns to 35:330/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
R
 
R
D
 
E
I
 
V
N
 
L
A
 
L
E
 
E
T
 
K
V
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
T
R
 
M
S
 
L
R
 
S
T
 
E
Q
 
K
V
 
I
N
 
D
E
 
R
S
 
E
L
 
V
L
 
F
N
 
D
G
 
A
S
 
A
-
 
P
T
 
R
V
 
L
S
 
R
F
 
I
V
 
V
G
 
A
S
 
N
T
 
Y
V
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
Q
 
I
H
 
E
Y
 
E
L
 
A
A
 
T
D
 
K
Q
 
R
H
 
G
I
 
I
H
 
Y
F
 
V
Y
 
T
S
 
N
A
 
T
Q
 
P
G
 
D
C
 
V
N
x
L
A
 
T
N
 
D
S
 
A
V
x
T
S
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
W
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
A
E
 
R
Y
 
H
V
 
V
I
 
V
S
 
K
C
 
G
L
 
D
L
 
K
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
S
E
 
G
K
 
E
-
 
W
-
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
F
-
 
L
G
 
G
F
 
Y
Q
 
D
L
 
V
K
 
Y
D
 
G
K
 
K
S
 
T
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
|
G
V
x
F
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
Q
L
 
A
L
 
I
E
 
A
Q
 
K
K
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
F
G
 
G
M
 
M
T
 
R
V
 
I
L
 
L
L
 
Y
-
 
T
-
x
A
-
x
R
N
x
S
D
 
R
P
x
K
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
E
 
E
R
 
K
E
 
E
G
 
L
L
 
G
P
 
A
H
 
E
F
 
F
V
 
K
N
 
P
L
 
L
Q
 
E
T
 
E
A
 
L
L
 
L
-
 
R
S
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
S
 
V
F
 
L
H
 
A
T
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
T
 
K
E
|
E
G
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
S
x
T
Y
 
Y
Q
 
H
L
 
M
L
 
I
N
 
N
S
 
E
T
 
E
N
 
R
F
 
L
H
 
R
L
 
L
V
 
M
T
 
K
P
 
P
S
 
T
T
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
T
 
K
I
 
A
W
 
L
T
 
I
Q
 
R
T
 
A
P
 
L
T
 
K
L
 
E
S
 
G
N
 
W
I
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
G
I
 
L
D
|
D
C
 
V
W
 
F
E
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
Y
I
 
Y
N
 
D
E
 
E
S
 
E
L
 
L
Y
 
F
Q
 
A
A
 
L
A
 
D
D
 
N
I
 
V
A
 
V
-
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
S
H
 
A
A
 
T
L
 
F
E
 
G
A
 
A
K
 
R
I
 
E
K
 
G
G
 
M
S
 
A
S
 
E
M
 
L
V
 
V
Y
 
A
E
 
K
V
 
N
L
 
L
C
 
I
Q
 
A
H
 
F
W
 
K
N
 
N
-
 
G
E
 
E
T
 
V
P
 
P
Q
 
P
N
 
T
H
 
L
W
 
V
Q
 
N
E
 
R
K
 
E
V
 
V
P
 
L
H
 
K
P
 
V
K
 
R
T
 
R
P
 
P

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
25% identity, 65% coverage: 34:276/374 of query aligns to 93:370/466 of P87228

query
sites
P87228
E
 
E
T
 
K
V
 
I
K
 
K
D
 
G
A
 
V
D
 
H
A
 
A
L
 
I
I
 
G
V
 
I
R
 
R
S
 
S
R
 
K
T
 
T
Q
 
R
V
 
L
N
 
T
E
 
R
S
 
R
L
 
V
L
 
L
N
 
E
G
 
A
S
 
A
-
 
D
T
 
S
V
 
L
S
 
I
F
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
C
T
 
F
V
 
C
V
 
I
G
 
G
L
 
T
D
 
N
H
 
Q
I
 
V
D
 
D
Q
 
L
H
 
D
Y
 
F
L
 
A
A
 
A
D
 
E
Q
 
R
H
 
G
I
 
I
H
 
A
F
 
V
Y
 
F
S
 
N
A
 
S
Q
 
P
G
 
Y
C
 
A
N
 
N
A
 
S
N
 
R
S
 
S
V
 
V
S
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
G
C
 
Y
L
 
I
L
 
I
Y
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
K
 
V
G
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
N
-
 
K
-
 
V
-
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
C
F
 
W
Q
 
E
L
 
I
K
 
R
D
 
G
K
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
V
 
Y
G
 
G
N
 
H
V
 
I
G
 
G
K
 
S
L
 
Q
L
 
L
E
 
S
Q
 
V
K
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
A
L
 
M
G
 
G
M
 
L
T
 
H
V
 
V
L
 
V
L
 
Y
N
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
M
-
 
P
-
 
L
P
 
G
P
 
S
R
 
A
Q
 
K
E
 
Q
R
 
L
E
 
S
G
 
S
L
 
L
P
 
P
H
 
E
F
 
L
V
 
L
N
 
H
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
V
S
 
S
F
 
L
H
 
H
T
 
V
P
 
P
L
 
A
T
x
S
T
 
P
E
 
E
G
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
S
 
T
Y
 
K
Q
 
N
L
 
M
L
 
I
N
 
S
S
 
S
T
 
K
N
 
E
F
 
F
H
 
A
L
 
A
V
 
M
T
 
K
P
 
E
S
 
G
T
 
S
I
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
T
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
I
T
 
P
I
 
A
W
 
L
T
 
V
Q
 
D
T
 
A
P
 
S
T
 
K
L
 
S
S
 
G
N
 
K
I
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
A
I
 
I
D
 
D
C
 
V
W
 
Y
E
 
P
N
 
S
E
 
E
P
 
P
N
 
A
I
 
G
N
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
S
E
 
E
S
 
L
L
 
T
Y
 
H
Q
 
C
A
 
K
A
 
N
D
 
I
I
 
I
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
I
A
 
G
G
 
G
H
 
S
A
 
T
L
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
I
 
Y
K
 
N
G
 
I
S
 
G
S
 
I
M
 
E
V
 
V
Y
 
S
E
 
E
V
 
A
L
 
L
C
 
T
Q
 
R
H
 
Y
W
 
I
N
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
28% identity, 60% coverage: 34:259/374 of query aligns to 45:297/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
E
 
E
T
 
S
V
 
I
K
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
H
A
 
F
L
 
I
I
 
G
V
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
V
 
L
N
 
T
E
 
E
S
 
D
L
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
A
S
 
A
-
 
E
T
 
K
V
 
L
S
 
V
F
 
A
V
 
I
G
 
G
S
 
A
T
 
F
V
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
T
D
 
N
H
 
Q
I
 
V
D
 
D
Q
 
L
H
 
D
Y
 
A
L
 
A
A
 
A
D
 
K
Q
 
R
H
 
G
I
 
I
H
 
P
F
 
V
Y
 
F
S
 
N
A
 
A
Q
 
P
G
 
F
C
 
S
N
|
N
A
 
T
N
 
R
S
 
S
V
 
V
S
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
G
C
 
E
L
 
L
L
 
L
Y
 
L
L
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
E
A
 
A
E
 
N
E
 
A
K
 
K
G
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
W
-
 
N
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
S
F
 
F
Q
 
E
L
 
A
K
 
R
D
 
G
K
 
K
S
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
V
 
Y
G
|
G
N
x
H
V
x
I
G
 
G
K
 
T
L
 
Q
L
 
L
E
 
G
Q
 
I
K
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
Y
V
 
V
L
 
Y
L
 
F
-
x
Y
-
x
D
-
x
I
-
 
E
N
 
N
D
 
K
P
 
L
P
 
P
R
 
L
Q
 
G
E
 
N
R
 
A
E
 
T
G
 
Q
L
 
V
P
 
Q
H
 
H
F
 
L
V
 
S
N
 
D
L
 
L
Q
 
L
T
 
N
A
 
M
L
 
-
S
 
-
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
S
F
 
L
H
|
H
T
x
V
P
|
P
L
 
-
T
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
E
H
 
N
P
 
P
S
|
S
Y
 
T
Q
 
K
-
 
N
L
 
M
L
 
M
N
 
G
S
 
A
T
 
K
N
 
E
F
 
I
H
 
S
L
 
L
V
 
M
T
 
K
P
 
P
S
 
G
T
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
|
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
T
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
-
T
 
-
I
 
-
W
 
-
T
 
-
Q
 
-
T
 
I
P
 
P
T
 
A
L
 
L
S
 
A
N
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
A
I
 
A
I
 
I
D
|
D
C
 
V
W
 
F
E
 
P
N
 
T
E
|
E
P
 
P
N
 
A
I
 
T
N
 
N
E
 
S
S
 
D
L
 
P
Y
 
F
Q
 
T
A
 
S
A
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
N
D
 
V
I
 
L
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
G
H
 
S
A
 
T
L
 
Q
E
 
E
A
 
A
K
 
Q

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
24% identity, 69% coverage: 1:259/374 of query aligns to 1:287/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
M
 
L
K
 
R
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
D
 
S
D
 
D
A
 
S
V
 
L
P
 
D
Y
 
P
A
 
C
Q
 
C
E
 
R
M
 
K
F
 
I
S
 
L
H
 
Q
L
 
D
G
 
G
E
 
G
I
 
L
T
 
Q
L
 
V
I
 
V
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
D
 
N
I
 
L
N
 
S
A
 
K
E
 
E
T
 
E
V
 
L
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
L
K
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
N
 
T
E
 
A
S
 
D
L
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
A
S
 
A
-
 
E
T
 
K
V
 
L
S
 
Q
F
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
R
T
 
A
V
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
Q
 
L
H
 
E
Y
 
A
L
 
A
A
 
T
D
 
R
Q
 
K
H
 
G
I
 
I
H
 
L
F
 
V
Y
 
M
S
 
N
A
 
T
Q
 
P
G
 
N
C
 
G
N
 
N
A
 
S
N
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
I
 
C
S
 
G
C
 
M
L
 
I
L
 
M
Y
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
K
-
 
K
-
 
F
K
 
M
G
 
G
F
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
N
D
 
G
K
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
I
x
L
G
 
G
V
 
L
G
 
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
R
L
 
E
L
 
V
E
 
A
Q
 
T
K
 
R
A
 
M
R
 
Q
G
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
L
 
I
L
 
G
N
x
Y
D
|
D
P
|
P
P
 
I
R
x
I
Q
 
S
E
 
P
R
 
-
E
 
E
G
 
V
L
 
S
P
 
A
H
 
S
F
 
F
V
 
G
N
 
V
L
 
Q
Q
 
Q
T
 
L
A
 
P
L
 
L
S
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
W
-
 
P
-
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
F
 
V
H
|
H
T
|
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
T
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
P
S
 
S
Y
 
T
Q
 
T
-
 
G
L
|
L
L
 
L
N
 
N
S
 
D
T
 
N
N
 
T
F
 
F
H
 
A
L
 
Q
V
 
C
T
 
K
P
 
K
S
 
G
T
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
I
 
A
W
 
L
T
 
L
Q
 
R
T
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
G
P
 
Q
T
 
C
L
 
A
S
 
G
N
 
A
I
 
A
I
 
L
D
 
D
C
 
V
W
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
I
 
R
N
 
D
E
 
R
S
 
A
L
 
L
Y
 
V
Q
 
D
A
 
H
A
 
E
D
 
N
-
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
H
 
S
A
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
Q

1ybaA The active form of phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
27% identity, 60% coverage: 34:259/374 of query aligns to 45:297/406 of 1ybaA

query
sites
1ybaA
E
 
E
T
 
S
V
 
I
K
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
H
A
 
F
L
 
I
I
 
G
V
 
L
R
|
R
S
|
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
V
 
L
N
 
T
E