SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_025274425.1 NCBI__GCF_000527155.1:WP_025274425.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ovkA Crystal structure maba bound to NADPH from m. Smegmatis (see paper)
62% identity, 100% coverage: 1:234/234 of query aligns to 9:242/242 of 5ovkA

query
sites
5ovkA
M
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
|
N
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
F
 
L
E
 
A
K
 
A
N
 
D
G
 
G
D
 
H
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
|
R
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
D
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
C
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
S
D
 
A
S
 
A
V
 
V
N
 
D
A
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
K
Q
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
H
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
T
 
S
D
 
K
D
 
D
T
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
R
F
 
F
E
 
E
N
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
N
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
F
R
 
R
C
 
C
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
S
 
S
S
 
R
K
 
T
M
 
M
L
 
Q
R
 
R
A
 
K
K
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
F
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
S
G
 
G
M
 
M
L
 
W
G
 
G
N
 
I
A
 
G
G
 
N
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
S
 
K
R
 
A
N
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
E
D
 
R
Q
 
I
R
 
Q
K
 
A
A
 
G
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
F
I
 
I
P
 
P
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
V
A
 
G
Q
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
G
T
 
A
A
 
V
T
 
S
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
E
D
 
D
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
N
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
G
M
 
M
G
 
G
H
 
H

5ovlA Crystal structure of maba bound to NADP+ from m. Smegmatis (see paper)
62% identity, 100% coverage: 1:234/234 of query aligns to 8:241/241 of 5ovlA

query
sites
5ovlA
M
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
|
N
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
F
 
L
E
 
A
K
 
A
N
 
D
G
 
G
D
 
H
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
|
R
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
D
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
C
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
S
D
 
A
S
 
A
V
 
V
N
 
D
A
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
K
Q
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
H
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
T
 
S
D
 
K
D
 
D
T
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
R
F
 
F
E
 
E
N
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
N
T
|
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
F
R
 
R
C
 
C
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
S
 
S
S
 
R
K
 
T
M
 
M
L
 
Q
R
 
R
A
 
K
K
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
F
I
|
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
S
G
 
G
M
 
M
L
 
W
G
 
G
N
 
I
A
 
G
G
 
N
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
|
L
V
 
I
G
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
S
 
K
R
 
A
N
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
V
x
I
E
 
D
T
 
T
D
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
E
D
 
R
Q
 
I
R
 
Q
K
 
A
A
 
G
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
F
I
 
I
P
 
P
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
V
A
 
G
Q
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
G
T
 
A
A
 
V
T
 
S
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
E
D
 
D
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
N
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
G
M
 
M
G
 
G
H
 
H

P71534 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase MabA; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Acetoacetyl-CoA reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; Beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100; EC 1.1.1.36 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
62% identity, 100% coverage: 1:234/234 of query aligns to 22:255/255 of P71534

query
sites
P71534
M
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
N
|
N
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
F
 
L
E
 
A
K
 
A
N
 
D
G
 
G
D
 
H
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
|
R
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
D
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
C
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
S
D
 
A
S
 
A
V
 
V
N
 
D
A
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
K
Q
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
H
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
S
D
 
K
D
 
D
T
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
R
F
 
F
E
 
E
N
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
N
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
F
R
 
R
C
 
C
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
S
 
S
S
 
R
K
 
T
M
 
M
L
 
Q
R
 
R
A
 
K
K
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
F
I
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
S
G
 
G
M
 
M
L
 
W
G
 
G
N
 
I
A
 
G
G
 
N
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
S
 
K
R
 
A
N
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
V
x
I
E
 
D
T
 
T
D
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
E
D
x
R
Q
 
I
R
 
Q
K
 
A
A
 
G
Y
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
F
I
 
I
P
 
P
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
V
A
 
G
Q
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
G
T
 
A
A
 
V
T
 
S
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
E
D
 
D
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
N
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
G
M
 
M
G
 
G
H
 
H

P9WGT3 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase MabA; 3-ketoacyl reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Acetoacetyl-CoA reductase; Beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; Mycolic acid biosynthesis A; EC 1.1.1.100; EC 1.1.1.36 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 7 papers)
61% identity, 100% coverage: 1:234/234 of query aligns to 14:247/247 of P9WGT3

query
sites
P9WGT3
M
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
|
T
G
 
G
G
 
G
N
 
N
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
F
 
L
E
 
A
K
 
A
N
 
D
G
 
G
D
 
H
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
|
R
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
C
|
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
S
D
 
D
S
 
A
V
 
V
N
 
D
A
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
T
Q
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
H
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
 
L
T
 
S
D
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
K
F
 
F
E
 
E
N
 
K
V
 
V
L
 
I
N
 
N
T
 
A
N
 
N
L
 
L
T
|
T
G
 
G
A
 
A
W
 
F
R
 
R
C
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
S
 
S
S
 
R
K
 
S
M
 
M
L
 
Q
R
 
R
A
 
N
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
M
I
 
I
F
 
F
I
 
I
S
x
G
S
|
S
V
 
V
V
 
S
G
 
G
M
x
S
L
 
W
G
 
G
N
 
I
A
 
G
G
 
N
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
S
S
 
K
R
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
x
Y
V
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
|
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
E
D
 
R
Q
 
I
R
 
Q
K
 
Q
A
 
G
Y
 
A
L
 
L
D
 
Q
T
 
F
I
 
I
P
 
P
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
V
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
G
T
 
V
A
 
V
T
 
S
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
E
D
 
D
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
N
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
G
M
 
M
G
 
G
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1uznA Maba from mycobacterium tuberculosis (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:234/234 of query aligns to 6:239/239 of 1uznA

query
sites
1uznA
M
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
|
N
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
F
 
L
E
 
A
K
 
A
N
 
D
G
 
G
D
 
H
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
|
R
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
C
 
V
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
S
D
 
D
S
 
A
V
 
V
N
 
D
A
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
T
Q
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
H
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
 
L
T
 
S
D
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
K
F
 
F
E
 
E
N
 
K
V
 
V
L
 
I
N
 
N
T
 
A
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
F
R
 
R
C
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
S
 
S
S
 
R
K
 
S
M
 
M
L
 
Q
R
 
R
A
 
N
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
M
I
 
I
F
 
F
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
S
G
 
G
M
 
L
L
 
W
G
 
G
N
 
I
A
 
G
G
 
N
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
S
S
 
K
R
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
E
D
 
R
Q
 
I
R
 
Q
K
 
Q
A
 
G
Y
 
A
L
 
L
D
 
Q
T
 
F
I
 
I
P
 
P
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
V
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
G
T
 
V
A
 
V
T
 
S
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
E
D
 
D
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
N
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
G
M
 
M
G
 
G
H
 
H

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
45% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 5:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
R
 
K
T
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
F
 
F
E
 
V
K
 
A
N
 
R
G
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
V
x
T
T
 
S
H
 
E
R
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
E
A
 
A
P
 
I
E
 
S
G
 
G
L
 
Y
Y
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
F
Q
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
K
D
 
D
S
 
A
D
 
Q
S
 
S
V
 
I
N
 
D
A
 
S
A
 
V
F
 
L
E
 
A
Q
 
S
I
 
I
E
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
I
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
x
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
F
 
W
E
 
E
N
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
V
W
 
F
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
M
S
 
C
K
 
A
M
 
M
L
 
M
R
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
S
R
 
K
S
 
S
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
T
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
K
 
A
A
 
G
Y
 
I
L
 
L
D
 
S
T
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
N
R
 
R
L
 
P
A
 
G
Q
 
D
P
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
A
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
44% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 6:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
R
 
K
T
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
N
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
F
 
L
E
 
A
K
 
A
N
 
R
G
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
V
x
T
T
 
S
H
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
Q
A
 
A
P
 
I
E
 
S
G
 
D
L
 
Y
Y
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
Q
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
P
D
 
A
S
 
S
V
 
I
N
 
E
A
 
S
A
 
V
F
 
L
E
 
E
Q
 
K
I
 
I
E
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
E
Q
 
E
F
 
W
E
 
N
N
 
D
V
 
I
L
 
I
N
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
W
 
F
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
M
S
 
R
K
 
A
M
 
M
L
 
M
R
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
S
R
 
K
S
 
S
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
K
 
A
A
 
G
Y
 
I
L
 
L
D
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
T
 
A
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
x
E
I
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
44% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 5:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
R
 
K
T
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
F
 
L
E
 
A
K
 
A
N
 
R
G
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
V
x
T
T
 
S
H
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
Q
A
 
A
P
 
I
E
 
S
G
 
D
L
 
Y
Y
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
Q
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
P
D
 
A
S
 
S
V
 
I
N
 
E
A
 
S
A
 
V
F
 
L
E
 
E
Q
 
K
I
 
I
E
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
E
Q
x
E
F
 
W
E
 
N
N
 
D
V
 
I
L
 
I
N
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
W
 
F
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
M
S
 
R
K
 
A
M
 
M
L
 
M
R
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
S
R
 
K
S
 
S
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
K
 
A
A
 
G
Y
 
I
L
 
L
D
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
T
 
A
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
x
E
I
x
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 6:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
R
 
K
T
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
F
 
L
E
 
V
K
 
A
N
 
R
G
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
T
 
T
H
 
A
R
x
T
G
 
S
S
 
E
G
 
S
A
 
G
P
 
A
E
 
Q
G
 
A
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
Y
 
K
G
 
G
V
 
L
Q
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
P
D
 
A
S
 
S
V
 
I
N
 
E
A
 
S
A
 
V
F
 
L
E
 
E
Q
 
N
I
 
V
E
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
F
 
W
E
 
N
N
 
D
V
 
I
L
 
I
N
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
W
 
F
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
M
S
 
R
K
 
A
M
 
M
L
 
M
R
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
S
R
 
K
S
 
S
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
T
D
 
D
D
 
E
Q
 
Q
R
 
R
K
 
A
A
 
G
Y
 
T
L
 
L
D
 
A
T
 
A
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
A
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 6:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
R
 
K
T
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
F
 
L
E
 
V
K
 
A
N
 
R
G
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
T
 
T
H
 
A
R
 
T
G
 
S
S
 
E
G
 
N
A
 
G
P
 
A
E
 
K
G
 
N
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
Y
 
K
G
 
G
V
 
L
Q
 
M
C
 
L
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
S
 
P
D
 
A
S
 
S
V
 
I
N
 
E
A
 
S
A
 
V
F
 
L
E
 
E
Q
 
N
I
 
I
E
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
F
 
W
E
 
N
N
 
D
V
 
I
L
 
I
N
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
W
 
F
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
M
S
 
R
K
 
A
M
|
M
L
 
M
R
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
C
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
S
R
 
K
S
 
S
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
K
 
A
A
 
G
Y
 
I
L
 
L
D
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
A
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
x
A
G
x
S
N
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
44% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 5:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
R
 
K
T
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
F
 
L
E
 
A
K
 
A
N
 
R
G
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
|
A
V
x
T
T
 
S
H
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
Q
A
 
A
P
 
I
E
 
S
G
 
D
L
 
Y
Y
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
Q
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
S
 
P
D
 
A
S
 
S
V
 
I
N
 
E
A
 
S
A
 
V
F
 
L
E
 
E
Q
 
K
I
 
I
E
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
V
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
E
Q
 
E
F
 
W
E
 
N
N
 
D
V
 
I
L
 
I
N
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
W
 
F
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
M
S
 
R
K
 
A
M
 
M
L
 
M
R
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
S
R
 
K
S
 
S
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
K
 
A
A
 
G
Y
 
I
L
 
L
D
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
T
 
A
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
42% identity, 99% coverage: 1:232/234 of query aligns to 3:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
S
 
T
R
 
K
T
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
Q
F
 
L
E
 
A
K
 
E
N
 
E
G
 
G
D
 
Y
R
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
N
H
 
Y
R
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
K
A
 
E
P
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
V
-
 
D
-
 
S
Y
 
F
G
 
A
V
 
I
Q
 
Q
C
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
D
S
 
A
D
 
D
S
 
E
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
M
F
 
I
E
 
K
Q
 
E
I
 
V
E
 
V
A
 
S
D
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
E
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
Q
Q
 
E
F
 
W
E
 
D
N
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
N
C
 
C
A
 
I
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
P
K
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
K
 
R
F
 
S
G
 
G
R
 
A
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
A
L
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
T
R
 
K
S
 
S
I
 
A
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
E
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
E
Q
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
Q
Y
 
M
L
 
L
D
 
T
T
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
K
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
T
 
T
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
K
A
 
A
G
 
K
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
T
I
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 6:243/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
R
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
F
 
L
E
 
I
K
 
Q
N
 
D
G
 
G
D
 
Y
R
 
F
V
 
V
A
 
V
V
 
G
T
 
T
H
x
A
R
x
T
G
 
S
S
 
E
G
 
S
A
 
G
P
 
A
E
 
Q
G
 
K
L
 
L
Y
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
A
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
R
D
 
N
S
 
L
D
 
D
S
 
E
V
 
I
N
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
V
E
 
S
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
D
 
N
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
D
 
K
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
M
 
M
S
 
S
E
 
E
E
 
D
Q
 
D
F
 
W
E
 
D
N
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
K
G
 
A
A
 
V
W
 
Y
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
R
A
 
V
S
 
L
S
 
K
K
 
G
M
 
M
L
 
T
R
 
K
A
 
A
K
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
|
I
S
|
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
A
M
 
H
L
 
F
G
 
A
N
 
N
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
V
 
E
G
 
A
L
 
F
A
 
S
R
 
R
S
 
S
I
 
L
T
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
E
 
A
T
 
T
D
 
E
M
|
M
T
 
T
A
 
D
E
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
E
D
 
D
Q
 
I
R
 
R
K
 
K
A
 
K
Y
 
M
L
 
S
D
 
D
T
 
Q
I
 
V
P
 
A
A
 
L
K
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
T
 
A
A
 
V
T
 
S
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
V
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
Y
M
 
M

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 6:243/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
R
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
F
 
L
E
 
I
K
 
Q
N
 
D
G
 
G
D
 
Y
R
 
F
V
 
V
A
 
V
V
 
G
T
 
T
H
 
A
R
x
T
G
 
S
S
 
E
G
 
S
A
 
G
P
 
A
E
 
Q
G
 
K
L
 
L
Y
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
A
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
R
D
 
N
S
 
L
D
 
D
S
 
E
V
 
I
N
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
V
E
 
S
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
D
 
N
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
D
 
K
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
M
 
M
S
 
S
E
 
E
E
 
D
Q
 
D
F
 
W
E
 
D
N
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
K
G
 
A
A
 
V
W
 
Y
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
R
A
 
V
S
 
L
S
 
K
K
 
G
M
 
M
L
 
T
R
 
K
A
 
A
K
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
A
M
 
H
L
 
F
G
 
A
N
 
N
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
V
 
E
G
 
A
L
 
F
A
 
S
R
 
R
S
 
S
I
 
L
T
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
D
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
D
E
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
E
D
 
D
Q
 
I
R
 
R
K
 
K
A
 
K
Y
 
M
L
 
S
D
 
D
T
 
Q
I
 
V
P
 
A
A
 
L
K
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
T
 
A
A
 
V
T
 
S
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
V
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
Y
M
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
45% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 13:253/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
R
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
F
 
L
E
 
G
K
 
R
N
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
D
 
E
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
E
T
 
T
H
 
L
R
 
K
G
 
A
S
 
N
G
 
G
A
 
V
P
 
-
E
 
E
G
 
G
L
 
-
Y
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
V
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
S
S
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
V
N
 
A
A
 
A
A
 
T
F
 
L
E
 
E
Q
 
H
I
 
I
E
 
Q
A
 
Q
D
 
H
L
 
L
G
 
G
P
 
Q
V
 
P
E
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
V
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
F
 
W
E
 
F
N
 
D
V
 
V
L
 
V
N
 
N
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
N
G
 
S
A
 
L
W
 
Y
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
L
S
 
R
K
 
G
M
 
M
L
 
T
R
 
K
A
 
A
K
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
|
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
A
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
G
 
G
L
 
F
A
 
T
R
 
R
S
 
A
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
R
 
R
N
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
V
x
I
E
 
D
T
|
T
D
 
D
M
|
M
T
|
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
P
D
 
E
D
 
A
Q
 
Q
R
 
R
K
 
E
A
 
A
Y
 
L
L
 
L
D
 
G
T
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
V
A
 
V
T
 
G
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
T
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 9:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
R
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
L
F
 
L
E
 
A
K
 
E
N
 
R
G
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
T
 
T
H
 
A
R
x
T
G
 
S
S
 
E
G
 
S
A
 
G
P
 
A
E
 
Q
G
 
A
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
G
Y
 
K
G
 
G
V
 
M
Q
 
A
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
S
 
P
D
 
E
S
 
S
V
 
I
N
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
K
Q
 
A
I
 
I
E
 
T
A
 
D
D
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
V
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
F
 
W
E
 
S
N
 
D
V
 
I
L
 
M
N
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
I
W
 
F
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
L
S
 
R
K
 
G
M
 
M
L
 
M
R
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
T
R
 
K
S
 
S
I
 
M
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
E
 
E
T
|
T
D
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
K
E
 
A
L
 
L
S
 
N
D
 
D
D
 
E
Q
 
Q
R
 
R
K
 
T
A
 
A
Y
 
T
L
 
L
D
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
A
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:232/234 of query aligns to 1:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
S
 
T
R
 
K
T
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
Q
F
 
L
E
 
A
K
 
E
N
 
E
G
 
G
D
 
Y
R
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
x
N
H
x
Y
R
x
A
G
|
G
S
|
S
G
 
K
A
 
E
P
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
V
-
 
D
-
 
S
Y
 
F
G
 
A
V
 
I
Q
 
Q
C
x
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
D
S
 
A
D
 
D
S
 
E
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
M
F
 
I
E
 
K
Q
 
E
I
 
V
E
 
V
A
 
S
D
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
E
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
Q
Q
 
E
F
 
W
E
 
D
N
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
N
C
 
C
A
 
I
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
P
K
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
K
 
R
F
 
S
G
 
G
R
 
A
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
A
L
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
T
R
 
K
S
 
S
I
 
A
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
 
I
E
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
-
D
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
K
K
 
E
A
 
Q
Y
 
M
L
 
L
D
 
T
T
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
K
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
T
 
T
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
K
A
 
A
G
 
K
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
T
I
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
41% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 9:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
R
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
L
F
 
L
E
 
A
K
 
E
N
 
R
G
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
T
 
T
H
 
A
R
x
T
G
 
S
S
 
E
G
 
S
A
 
G
P
 
A
E
 
Q
G
 
A
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
G
Y
 
K
G
 
G
V
 
M
Q
 
A
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
S
 
P
D
 
E
S
 
S
V
 
I
N
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
K
Q
 
A
I
 
I
E
 
T
A
 
D
D
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
V
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
F
 
W
E
 
S
N
 
D
V
 
I
L
 
M
N
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
I
W
 
F
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
L
S
 
R
K
 
G
M
 
M
L
 
M
R
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
 
V
S
x
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
T
R
 
K
S
 
S
I
 
M
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
D
 
D
M
 
M
T
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
N
D
 
D
D
 
E
Q
 
Q
R
 
R
K
 
T
A
 
A
Y
 
T
L
 
L
D
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
A
A
 
V
T
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
45% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 19:254/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
R
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
F
 
L
E
 
G
K
 
R
N
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
D
 
E
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
E
T
 
T
H
 
L
R
 
K
G
 
A
S
 
N
G
 
G
A
 
V
P
 
-
E
 
E
G
 
G
L
 
-
Y
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
V
C
 
L
D
 
D
I
 
V
T
 
S
D
 
S
S
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
V
N
 
A
A
 
A
A
 
T
F
 
L
E
 
E
Q
 
H
I
 
I
E
 
Q
A
 
Q
D
 
H
L
 
L
G
 
G
P
 
Q
V
 
P
E
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
D
 
R
D
 
D
T
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
V
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
F
 
W
E
 
F
N
 
D
V
 
V
L
x
V
N
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
T
 
N
G
 
S
A
 
L
W
 
Y
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
L
S
 
R
K
 
G
M
 
M
L
 
T
R
 
K
A
 
A
K
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
-
L
 
-
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
V
 
E
G
|
G
L
x
F
A
 
T
R
 
R
S
 
A
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
R
 
R
N
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
A
Q
 
Q
R
 
R
K
 
E
A
 
A
Y
 
L
L
 
L
D
 
G
T
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
V
A
 
V
T
 
G
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
T
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
44% identity, 98% coverage: 3:232/234 of query aligns to 8:240/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
R
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
F
 
L
E
 
G
K
 
R
N
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
D
 
E
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
E
T
 
T
H
 
L
R
 
K
G
 
A
S
 
N
G
 
G
A
 
V
P
 
-
E
 
E
G
 
G
L
 
-
Y
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
V
C
 
L
D
 
D
I
 
V
T
 
S
D
 
S
S
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
V
N
 
A
A
 
A
A
 
T
F
 
L
E
 
E
Q
 
H
I
 
I
E
 
Q
A
 
Q
D
 
H
L
 
L
G
 
G
P
 
Q
V
 
P
E
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
F
 
W
E
x
F
N
 
D
V
 
V
L
x
V
N
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
T
 
N
G
 
S
A
 
L
W
 
Y
R
 
R
C
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
V
S
 
L
S
 
R
K
 
G
M
 
M
L
 
T
R
 
K
A
 
A
K
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
M
 
I
I
 
I
F
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
A
L
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
|
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
V
 
E
G
 
G
L
x
F
A
 
T
R
 
R
S
 
A
I
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
R
 
R
N
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
P
D
 
E
D
 
A
Q
 
Q
R
 
R
K
 
E
A
 
A
Y
 
L
L
 
L
D
 
G
T
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
V
A
 
V
T
 
G
W
 
F
L
 
L
S
 
A
G
 
S
N
 
D
D
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
T
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
G
 
Y
M
 
M

Query Sequence

>WP_025274425.1 NCBI__GCF_000527155.1:WP_025274425.1
MSRTVLVTGGNRGIGLAIARAFEKNGDRVAVTHRGSGAPEGLYGVQCDITDSDSVNAAFE
QIEADLGPVEVLVANAGVTDDTLLLRMSEEQFENVLNTNLTGAWRCAKRASSKMLRAKFG
RMIFISSVVGMLGNAGQTNYAASKAGLVGLARSITRELGSRNITANVIAPGFVETDMTAE
LSDDQRKAYLDTIPAKRLAQPEEIAATATWLSGNDAGYINGAIIPVDGGLGMGH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory