SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_025274439.1 NCBI__GCF_000527155.1:WP_025274439.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

3vayA Crystal structure of 2-haloacid dehalogenase from pseudomonas syringae pv. Tomato dc3000 (see paper)
35% identity, 97% coverage: 7:228/229 of query aligns to 2:227/230 of 3vayA

query
sites
3vayA
I
 
I
K
 
K
A
 
L
V
 
V
S
 
T
F
 
F
D
|
D
G
 
L
D
|
D
E
 
D
T
 
T
L
 
L
W
 
W
N
 
D
F
 
T
Q
 
A
T
 
P
A
 
A
M
 
I
R
 
V
E
 
G
A
 
A
L
 
E
Q
 
A
K
 
A
A
 
L
V
 
R
D
 
D
T
 
W
M
 
L
R
 
A
S
 
E
E
 
Q
G
 
A
L
 
P
R
 
K
R
 
L
P
 
-
D
 
-
G
 
G
D
 
P
V
 
V
S
 
P
V
 
V
E
 
E
W
 
H
L
 
L
I
 
W
E
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
E
P
 
D
K
 
P
Y
 
S
G
 
F
R
 
K
T
 
H
T
 
R
M
 
I
E
 
S
G
 
A
I
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
R
A
 
V
F
 
L
R
 
F
E
 
H
A
 
A
V
 
L
A
 
E
Q
 
D
C
 
A
G
 
G
G
 
Y
D
 
D
I
 
S
E
 
D
S
 
E
A
 
A
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
C
 
A
D
 
D
R
 
E
Y
 
S
F
 
F
D
 
E
D
 
V
R
 
F
L
 
L
S
 
H
G
 
G
Q
 
R
-
 
H
-
 
Q
-
 
V
R
 
Q
L
 
I
Y
 
F
D
 
P
R
 
E
T
 
V
I
 
Q
E
 
P
T
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
I
L
 
L
A
 
A
H
 
K
N
 
T
Y
 
F
S
 
T
L
 
L
A
 
G
L
 
V
V
 
I
T
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
T
 
A
R
 
D
P
 
V
E
 
R
S
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
Y
F
 
F
D
 
A
V
 
F
V
 
A
V
 
L
T
 
C
A
 
A
A
 
E
E
 
D
S
 
L
G
 
G
F
 
I
V
 
G
K
 
K
P
 
P
D
 
D
S
 
P
R
 
A
I
 
P
F
 
F
G
 
L
V
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
A
D
 
K
V
 
V
A
 
D
P
 
A
E
 
S
N
 
A
C
 
A
V
 
V
H
 
H
I
 
V
G
 
G
D
|
D
H
 
H
P
 
P
V
 
S
E
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
M
R
 
R
T
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
Y
N
 
N
R
 
P
S
 
Q
G
 
G
G
 
K
E
 
A
S
 
W
D
 
D
V
 
A
N
 
D
I
 
R
K
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
-
 
H
-
 
N
-
 
L
G
 
S
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
A

8bp1A Crystal structure of bhmehis1.0, an engineered enzyme for the morita- baylis-hillman reaction (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:229/229 of query aligns to 2:225/231 of 8bp1A

query
sites
8bp1A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
S
 
F
F
 
F
D
|
D
G
 
S
D
x
L
E
 
G
T
 
T
L
 
L
W
 
I
N
 
S
F
 
V
Q
 
E
T
 
G
A
 
A
M
 
Y
R
 
K
E
 
V
A
 
H
L
 
L
Q
 
K
K
 
I
A
 
M
V
 
E
D
 
E
T
 
V
M
 
L
R
 
G
S
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
G
 
Y
D
 
P
V
 
L
S
 
N
V
 
P
E
 
K
W
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
D
V
 
E
R
 
Y
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
R
-
 
E
A
 
A
L
 
F
P
 
S
K
 
N
Y
 
Y
G
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
L
R
 
R
T
 
D
T
 
I
M
 
L
E
 
E
G
 
E
I
 
V
-
 
M
R
 
R
R
 
K
A
 
L
A
 
A
F
 
E
R
 
K
E
 
Y
A
 
G
V
 
F
A
 
K
Q
 
Y
C
 
P
G
 
E
G
 
N
D
 
L
I
 
W
E
 
E
S
 
I
A
 
S
D
 
L
R
 
R
L
 
M
C
 
A
D
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
F
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
G
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
P
R
 
E
T
 
V
I
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
K
H
 
G
N
 
K
Y
 
Y
S
 
H
L
 
V
A
 
G
L
 
V
V
 
I
T
x
L
N
|
N
G
x
R
N
 
D
T
 
T
R
 
E
P
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
F
-
 
L
E
 
D
S
 
A
M
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
K
E
 
D
R
 
L
F
 
F
D
 
D
V
 
S
V
 
I
V
 
T
T
 
T
A
 
S
A
 
E
E
 
E
S
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
F
K
 
K
P
 
P
D
 
H
S
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
E
V
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
K
R
 
K
L
 
A
D
 
G
V
 
V
A
 
K
P
 
G
E
 
E
N
 
K
C
 
A
V
 
V
H
 
Y
I
 
V
G
 
G
D
|
D
H
 
N
P
 
P
V
 
V
E
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
G
A
 
G
A
 
S
Q
 
K
N
 
N
A
 
L
G
 
G
L
 
M
R
 
T
T
 
S
I
 
I
W
 
L
L
 
L
N
 
D
R
 
R
S
 
K
G
 
G
G
 
E
E
 
K
S
 
R
D
 
E
V
 
F
N
 
W
I
 
D
K
 
K
P
 
A
D
 
D
A
 
F
E
 
I
I
 
V
G
 
S
R
 
D
L
 
L
P
 
R
D
 
E
L
 
V
L
 
I
S
 
K
L
 
I

6q7oA Crystal structure of oe1 (see paper)
35% identity, 43% coverage: 110:207/229 of query aligns to 101:203/230 of 6q7oA

query
sites
6q7oA
L
 
L
Y
 
Y
D
 
P
R
 
E
T
 
V
I
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
K
H
 
G
N
 
K
Y
 
Y
S
 
H
L
 
V
A
 
G
L
 
M
V
 
I
T
 
T
N
 
D
G
 
S
N
 
D
T
 
T
R
 
E
P
 
Q
-
 
A
-
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
L
E
 
D
S
 
A
M
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
K
E
 
D
R
 
L
F
 
F
D
 
D
V
 
S
V
 
I
V
 
T
T
 
T
A
 
S
A
 
E
E
 
E
S
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
F
K
 
K
P
 
P
D
 
H
S
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
E
V
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
K
R
 
K
L
 
A
D
 
G
V
 
V
A
 
K
P
 
G
E
 
E
N
 
E
C
 
A
V
 
V
H
 
Y
I
 
V
G
 
G
D
|
D
H
 
N
P
 
P
V
 
V
E
 
K
D
 
D
V
 
C
A
 
G
A
 
G
A
 
S
Q
 
K
N
 
N
A
 
L
G
 
G
L
 
M
R
 
T
T
 
S
I
 
I
W
 
L
L
 
L
N
 
D
R
 
R
S
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6q7nA Crystal structure of bh32 alkylated with the mechanistic inhibitor 2- bromoacetophenone (see paper)
35% identity, 43% coverage: 110:207/229 of query aligns to 101:203/230 of 6q7nA

query
sites
6q7nA
L
 
L
Y
 
Y
D
 
P
R
 
E
T
 
V
I
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
K
H
 
G
N
 
K
Y
 
Y
S
 
H
L
 
V
A
 
G
L
 
M
V
 
I
T
 
T
N
 
D
G
 
S
N
 
D
T
 
T
R
 
E
P
 
Q
-
 
A
-
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
L
E
 
D
S
 
A
M
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
K
E
 
D
R
 
L
F
 
F
D
 
D
V
 
S
V
 
I
V
 
T
T
 
T
A
 
S
A
 
E
E
 
E
S
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
F
K
 
K
P
 
P
D
 
H
S
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
E
V
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
K
R
 
K
L
 
A
D
 
G
V
 
V
A
 
K
P
 
G
E
 
E
N
 
E
C
 
A
V
 
V
H
 
Y
I
 
V
G
 
G
D
 
D
H
 
N
P
 
P
V
 
V
E
 
K
D
 
D
V
 
C
A
 
G
A
 
G
A
 
S
Q
 
K
N
 
N
A
 
L
G
 
G
L
 
M
R
 
T
T
 
S
I
 
I
W
 
L
L
 
L
N
 
D
R
 
R
S
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4ygrA Crystal structure of had phosphatase from thermococcus onnurineus (see paper)
38% identity, 43% coverage: 109:207/229 of query aligns to 86:189/215 of 4ygrA

query
sites
4ygrA
R
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
D
 
P
R
 
D
T
 
T
I
 
I
E
 
P
T
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
W
L
 
L
A
 
R
H
 
D
N
 
T
-
 
G
Y
 
Y
S
 
K
L
 
L
A
 
G
L
 
I
V
 
V
T
|
T
N
x
S
G
|
G
-
 
P
-
 
K
-
 
Y
-
 
Q
N
 
R
T
 
L
R
 
K
P
 
L
E
 
K
S
 
L
M
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
L
E
 
D
R
 
Y
F
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
A
 
R
A
 
D
E
 
D
S
 
V
G
 
N
F
 
A
V
 
I
K
|
K
P
 
P
D
 
E
S
 
P
R
 
K
I
 
I
F
 
F
G
 
L
V
 
Y
A
 
T
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
A
 
E
P
 
P
E
 
G
N
 
E
C
 
A
V
 
V
H
 
M
I
 
V
G
|
G
D
|
D
H
 
S
P
x
L
V
 
S
E
x
Q
D
|
D
V
 
V
A
 
Y
A
 
G
A
 
A
Q
 
K
N
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
M
R
 
T
T
 
A
I
 
V
W
 
W
L
 
I
N
 
N
R
 
R
S
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4knvA The crystal structure of apo human hdhd4 from se-mad (see paper)
26% identity, 88% coverage: 7:207/229 of query aligns to 1:208/241 of 4knvA

query
sites
4knvA
I
 
M
K
 
R
A
 
A
V
 
V
S
 
F
F
 
F
D
|
D
G
x
L
D
|
D
E
 
N
T
 
T
L
 
L
W
 
I
N
 
D
F
 
T
Q
 
A
T
 
G
A
 
A
M
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
G
L
 
M
Q
 
L
K
 
E
A
 
V
V
 
I
D
 
K
T
 
L
M
 
L
R
 
Q
S
 
S
E
 
K
G
 
Y
L
 
H
R
 
Y
R
 
K
P
 
E
D
 
E
G
 
A
D
 
E
V
 
I
S
 
I
V
 
C
E
 
D
W
 
K
L
 
-
I
 
V
E
 
Q
V
 
V
R
 
K
E
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
E
A
 
C
L
 
F
P
 
H
K
 
P
Y
 
Y
G
 
N
R
 
-
T
 
T
T
 
C
M
 
I
E
 
T
G
 
D
I
 
L
R
 
R
R
 
T
A
 
S
A
 
H
F
 
W
R
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
Q
 
E
C
 
T
G
 
K
G
 
G
D
 
G
I
 
A
E
 
A
S
 
N
A
 
R
D
 
K
R
 
L
L
 
A
C
 
E
D
 
E
R
 
C
Y
 
Y
F
 
F
-
 
L
-
 
W
-
 
K
D
 
S
D
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
G
 
H
Q
 
M
R
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
E
R
 
D
T
 
V
I
 
K
E
 
A
T
 
M
L
 
L
E
 
T
S
 
E
L
 
L
A
 
R
H
 
K
N
 
E
Y
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
L
L
 
L
V
 
L
T
|
T
N
|
N
G
 
G
N
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
Q
-
 
R
T
 
E
R
 
K
P
 
I
E
 
E
S
 
A
M
 
C
G
 
A
L
 
C
G
 
Q
E
 
S
R
 
Y
F
 
F
D
 
D
V
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
G
A
 
G
E
 
E
S
 
Q
G
 
R
F
 
E
V
 
E
K
|
K
P
 
P
D
 
A
S
 
P
R
 
S
I
 
I
F
 
F
G
 
Y
V
 
Y
A
 
C
I
 
C
E
 
N
R
 
L
L
 
L
D
 
G
V
 
V
A
 
Q
P
 
P
E
 
G
N
 
D
C
 
C
V
 
V
H
 
M
I
 
V
G
 
G
D
|
D
H
 
T
P
 
L
V
 
E
E
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
Q
A
 
G
A
 
G
Q
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
K
-
 
A
T
 
T
I
 
V
W
 
W
L
 
I
N
 
N
R
 
K
S
 
N
G
 
G

3i76B The crystal structure of the orthorhombic form of the putative had- hydrolase yfnb from bacillus subtilis bound to magnesium reveals interdomain movement
27% identity, 71% coverage: 67:229/229 of query aligns to 58:225/229 of 3i76B

query
sites
3i76B
G
 
G
R
 
K
T
 
M
T
 
T
M
 
R
E
 
D
G
 
E
I
 
V
R
 
V
R
 
N
A
 
T
A
 
R
F
 
F
R
 
S
E
 
A
A
 
L
V
 
L
A
 
K
Q
 
E
C
 
Y
G
 
G
G
 
Y
D
 
E
I
 
A
E
 
D
S
 
G
A
 
A
D
 
-
R
 
L
L
 
L
C
 
E
D
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
F
 
R
D
 
R
D
 
F
R
 
L
L
 
E
S
 
E
G
 
G
Q
 
H
R
 
Q
L
 
L
Y
 
I
D
 
D
R
 
G
T
 
A
I
 
F
E
 
D
T
 
L
L
 
I
E
 
S
S
 
N
L
 
L
A
 
Q
H
 
Q
N
 
Q
Y
 
F
S
 
D
L
 
L
A
 
Y
L
 
I
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
V
T
 
S
-
 
H
-
 
T
-
 
Q
-
 
Y
-
 
K
R
 
R
P
 
L
E
 
R
S
 
D
M
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
F
E
 
P
R
 
F
F
 
F
D
 
K
V
 
D
V
 
I
V
 
F
T
 
V
A
 
S
A
 
E
E
 
D
S
 
T
G
 
G
F
 
F
V
 
Q
K
 
K
P
 
P
D
 
M
S
 
K
R
 
E
I
 
Y
F
 
F
G
 
N
V
 
Y
A
 
V
I
 
F
E
 
E
R
 
R
L
 
I
-
 
P
D
 
Q
V
 
F
A
 
S
P
 
A
E
 
E
N
 
H
C
 
T
V
 
L
H
 
I
I
 
I
G
 
G
D
|
D
H
 
S
P
 
L
V
 
T
E
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
K
A
 
G
A
 
G
Q
 
Q
N
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
T
 
T
I
 
C
W
 
W
L
 
M
N
 
N
R
 
P
S
 
D
G
 
M
G
 
K
E
 
P
S
 
N
D
 
V
V
 
P
N
 
E
I
 
I
K
 
I
P
 
P
D
 
T
A
 
Y
E
 
E
I
 
I
G
 
R
R
 
K
L
 
L
P
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
Y
S
 
H
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3qnmA Haloalkane dehalogenase family member from bacteroides thetaiotaomicron of unknown function
23% identity, 97% coverage: 8:229/229 of query aligns to 4:229/231 of 3qnmA

query
sites
3qnmA
K
 
K
A
 
N
V
 
L
S
 
F
F
 
F
D
|
D
G
 
L
D
|
D
E
 
D
T
 
T
L
 
I
W
 
W
N
 
A
F
 
F
Q
 
S
T
 
R
A
 
N
M
 
A
R
 
R
E
 
D
A
 
T
L
 
F
Q
 
E
K
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
E
T
 
V
M
 
Y
R
 
Q
S
 
K
E
 
Y
G
 
S
L
 
F
R
 
D
R
 
R
P
 
Y
D
 
F
G
 
D
D
 
S
V
 
F
S
 
D
V
 
H
E
 
Y
W
 
Y
L
 
T
I
 
L
E
 
Y
V
 
Q
R
 
R
E
 
R
R
 
N
L
 
T
A
 
E
A
 
L
L
 
W
P
 
L
K
 
E
Y
 
Y
G
 
G
-
 
E
-
 
G
R
 
K
T
 
V
T
 
T
M
 
K
E
 
E
G
 
E
I
 
L
R
 
N
R
 
R
A
 
Q
A
 
R
F
 
F
R
 
F
E
 
Y
A
 
P
V
 
L
A
 
Q
Q
 
A
C
 
V
G
 
G
G
 
V
D
 
E
I
 
D
E
 
E
S
 
A
-
 
L
A
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
F
C
 
S
D
 
E
R
 
D
Y
 
F
F
 
F
D
 
A
D
 
I
R
 
I
L
 
P
S
 
T
G
 
K
Q
 
S
R
 
G
L
 
L
Y
 
M
D
 
P
R
 
H
T
 
A
I
 
K
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
E
S
 
Y
L
 
L
A
 
A
H
 
P
N
 
Q
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
A
 
Y
L
 
I
V
 
L
T
 
S
N
 
N
G
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
Q
N
 
S
T
 
R
R
 
K
P
 
M
E
 
R
S
 
S
M
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
Y
F
 
F
D
 
K
V
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
L
A
 
S
A
 
E
E
 
D
S
 
L
G
 
G
F
 
V
V
 
L
K
 
K
P
 
P
D
 
R
S
 
P
R
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
H
V
 
F
A
 
A
I
 
L
E
 
S
R
 
A
L
 
T
D
 
Q
V
 
S
A
 
E
P
 
L
E
 
R
N
 
E
C
 
S
V
 
L
H
 
M
I
 
I
G
 
G
D
|
D
H
 
S
P
 
W
V
 
E
E
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
T
A
 
G
A
 
A
Q
 
H
N
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
M
R
 
H
T
 
Q
I
 
A
W
 
F
L
 
Y
N
 
N
R
 
V
S
 
T
G
 
-
G
 
E
E
 
R
S
 
T
D
 
V
V
 
F
N
 
P
I
 
F
K
 
Q
P
 
P
D
 
T
A
 
Y
E
 
H
I
 
I
G
 
H
R
 
S
L
 
L
P
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
M
S
 
N
L
 
L

8ywoA Crystal structure of l-azetidine-2-carboxylate hydrolase soaked in (s)-azetidine-2-carboxylic acid
25% identity, 89% coverage: 7:209/229 of query aligns to 6:205/240 of 8ywoA

query
sites
8ywoA
I
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
L
S
 
T
F
 
F
D
 
D
G
 
C
D
x
Y
E
 
G
T
 
T
L
 
L
W
 
I
N
 
D
F
x
W
Q
 
E
T
 
T
A
 
G
M
 
I
R
 
V
E
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
P
A
 
L
V
 
A
D
 
-
T
 
-
M
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
K
R
 
R
P
 
T
D
 
G
G
 
K
D
 
T
V
 
F
S
 
T
V
 
S
E
 
D
W
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
E
V
 
V
R
 
F
E
 
G
R
 
R
L
 
N
A
 
E
A
 
S
L
 
-
P
 
P
K
 
Q
Y
 
Q
G
 
T
R
 
E
T
 
T
T
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
L
M
 
Y
E
 
Q
G
 
D
I
 
I
R
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
V
F
 
Y
R
 
D
E
 
R
A
 
I
V
 
A
A
 
K
Q
 
E
C
 
W
G
 
G
G
 
L
D
 
E
I
 
P
E
 
D
S
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
-
C
 
-
D
 
-
R
 
E
Y
 
E
F
 
F
D
 
G
D
 
T
R
 
S
L
 
V
S
 
K
G
 
N
Q
 
W
R
 
P
L
 
A
Y
 
F
D
 
P
R
 
D
T
 
T
I
 
V
E
 
E
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
Y
L
 
L
A
 
K
H
 
K
N
 
H
Y
 
Y
S
 
K
L
 
L
A
 
V
L
 
I
V
 
L
T
 
S
N
|
N
-
 
I
-
 
D
-
 
R
G
 
N
N
 
E
T
 
F
R
 
K
P
 
L
E
 
S
S
 
N
M
 
A
G
 
K
L
 
L
G
 
G
E
 
V
R
 
E
F
 
F
D
 
D
V
 
H
V
 
I
V
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
S
 
V
G
 
G
F
 
S
V
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
N
S
 
P
R
 
N
I
 
N
F
 
F
G
 
T
V
 
Y
A
 
M
I
 
I
E
 
D
R
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
A
D
 
G
V
 
I
A
 
E
P
 
K
E
 
K
N
 
D
C
 
I
V
 
L
H
 
H
I
 
T
G
 
A
D
 
E
H
 
S
P
 
L
V
 
Y
E
x
H
D
 
D
V
 
H
A
 
I
A
 
P
A
 
A
Q
 
N
N
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
V
T
 
S
I
 
A
W
 
W
L
 
I
N
 
Y
R
 
R
S
 
R
G
 
H
G
 
G
E
 
K

B2Z3V8 L-azetidine-2-carboxylate hydrolase; A2CH; AC hydrolase; EC 3.5.-.- from Pseudomonas sp. (strain A2C) (see paper)
25% identity, 89% coverage: 7:209/229 of query aligns to 6:205/240 of B2Z3V8

query
sites
B2Z3V8
I
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
L
S
 
T
F
 
F
D
|
D
G
 
C
D
 
Y
E
 
G
T
 
T
L
 
L
W
 
I
N
 
D
F
 
W
Q
 
E
T
 
T
A
 
G
M
 
I
R
 
V
E
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
P
A
 
L
V
 
A
D
 
-
T
 
-
M
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
K
R
 
R
P
 
T
D
 
G
G
 
K
D
 
T
V
 
F
S
 
T
V
 
S
E
 
D
W
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
E
V
 
V
R
 
F
E
 
G
R
 
R
L
 
N
A
 
E
A
 
S
L
 
-
P
 
P
K
 
Q
Y
 
Q
G
 
T
R
 
E
T
 
T
T
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
L
M
 
Y
E
 
Q
G
 
D
I
 
I
R
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
V
F
 
Y
R
 
D
E
 
R
A
 
I
V
 
A
A
 
K
Q
 
E
C
 
W
G
 
G
G
 
L
D
 
E
I
 
P
E
 
D
S
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
-
C
 
-
D
 
-
R
 
E
Y
 
E
F
 
F
D
 
G
D
 
T
R
 
S
L
 
V
S
 
K
G
 
N
Q
 
W
R
 
P
L
 
A
Y
 
F
D
 
P
R
 
D
T
 
T
I
 
V
E
 
E
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
Y
L
 
L
A
 
K
H
 
K
N
 
H
Y
 
Y
S
 
K
L
 
L
A
 
V
L
 
I
V
 
L
T
 
S
N
 
N
-
 
I
-
 
D
-
 
R
G
 
N
N
 
E
T
 
F
R
 
K
P
 
L
E
 
S
S
 
N
M
 
A
G
 
K
L
 
L
G
 
G
E
 
V
R
 
E
F
 
F
D
 
D
V
 
H
V
 
I
V
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
S
 
V
G
 
G
F
 
S
V
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
N
S
 
P
R
 
N
I
 
N
F
 
F
G
 
T
V
 
Y
A
 
M
I
 
I
E
 
D
R
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
A
D
 
G
V
 
I
A
 
E
P
 
K
E
 
K
N
 
D
C
 
I
V
 
L
H
 
H
I
 
T
G
 
A
D
 
E
H
 
S
P
 
L
V
 
Y
E
 
H
D
 
D
V
 
H
A
 
I
A
 
P
A
 
A
Q
 
N
N
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
V
T
 
S
I
 
A
W
 
W
L
 
I
N
 
Y
R
 
R
S
 
R
G
 
H
G
 
G
E
 
K

Q51645 (S)-2-haloacid dehalogenase 4A; 2-haloalkanoic acid dehalogenase IVA; Halocarboxylic acid halidohydrolase IVA; L-2-haloacid dehalogenase IVA; EC 3.8.1.2 from Burkholderia cepacia (Pseudomonas cepacia) (see 2 papers)
28% identity, 52% coverage: 111:229/229 of query aligns to 98:222/231 of Q51645

query
sites
Q51645
Y
 
Y
D
 
P
R
 
D
T
 
A
I
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
K
L
 
L
-
 
K
A
 
S
H
 
A
N
 
G
Y
 
Y
S
 
I
L
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
L
T
x
S
N
|
N
G
 
G
N
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
M
-
 
L
-
 
Q
T
 
A
R
 
A
P
 
L
E
 
K
S
 
A
M
 
S
G
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
R
R
 
V
F
 
L
D
 
D
V
 
S
V
 
C
V
 
L
T
 
S
A
 
A
A
 
D
E
 
D
S
 
L
G
 
K
F
 
I
V
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
D
S
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
Y
G
 
Q
V
 
F
A
 
A
I
 
C
E
 
D
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
A
 
N
P
 
P
E
 
N
N
 
E
C
 
V
V
 
C
H
 
F
I
 
V
G
 
S
D
 
S
H
 
N
P
 
-
V
 
A
E
 
W
D
 
D
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
Q
 
G
N
 
K
A
 
F
G
 
G
L
 
F
R
 
N
T
 
T
I
 
V
W
 
R
L
 
I
N
 
N
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
G
 
N
E
 
P
S
 
P
D
 
E
V
 
Y
N
 
E
I
 
F
K
 
A
P
 
P
-
 
L
D
 
K
A
 
H
E
 
Q
I
 
V
G
 
N
R
 
S
L
 
L
P
 
S
D
 
E
L
 
L
L
 
W
S
 
P
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2no5B Crystal structure analysis of a dehalogenase with intermediate complex (see paper)
28% identity, 52% coverage: 111:229/229 of query aligns to 98:222/226 of 2no5B

query
sites
2no5B
Y
 
Y
D
 
P
R
 
D
T
 
A
I
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
K
L
 
L
-
 
K
A
 
S
H
 
A
N
 
G
Y
 
Y
S
 
I
L
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
L
T
x
S
N
|
N
G
 
G
N
 
N
T
 
D
R
 
E
P
 
M
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
L
E
 
K
S
 
A
M
 
S
G
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
R
R
 
V
F
 
L
D
 
D
V
 
S
V
 
C
V
 
L
T
 
S
A
 
A
A
 
D
E
 
D
S
 
L
G
 
K
F
 
I
V
 
Y
K
|
K
P
 
P
D
 
D
S
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
Y
G
 
Q
V
 
F
A
 
A
I
 
C
E
 
D
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
A
 
N
P
 
P
E
 
N
N
 
E
C
 
V
V
 
C
H
 
F
I
 
V
G
x
S
D
 
S
H
x
N
P
 
-
V
x
A
E
x
W
D
|
D
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
Q
 
G
N
 
K
A
 
F
G
 
G
L
 
F
R
 
N
T
 
T
I
 
V
W
 
R
L
 
I
N
 
N
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
G
 
N
E
 
P
S
 
P
D
 
E
V
 
Y
N
 
E
I
 
F
K
 
A
P
 
P
-
 
L
D
 
K
A
 
H
E
 
Q
I
 
V
G
 
N
R
 
S
L
 
L
P
 
S
D
 
E
L
 
L
L
 
W
S
 
P
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_025274439.1 NCBI__GCF_000527155.1:WP_025274439.1
MFDWSTIKAVSFDGDETLWNFQTAMREALQKAVDTMRSEGLRRPDGDVSVEWLIEVRERL
AALPKYGRTTMEGIRRAAFREAVAQCGGDIESADRLCDRYFDDRLSGQRLYDRTIETLES
LAHNYSLALVTNGNTRPESMGLGERFDVVVTAAESGFVKPDSRIFGVAIERLDVAPENCV
HIGDHPVEDVAAAQNAGLRTIWLNRSGGESDVNIKPDAEIGRLPDLLSL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory