SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_025329670.1 NCBI__GCF_000600005.1:WP_025329670.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
35% identity, 82% coverage: 54:309/312 of query aligns to 56:313/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
R
 
R
I
 
I
N
 
D
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
E
N
 
N
S
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
V
 
N
P
x
Y
A
|
A
T
x
V
G
|
G
L
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
R
 
V
Q
 
E
T
 
E
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
H
 
R
N
 
G
V
 
I
G
 
Y
I
 
V
R
 
T
N
 
N
V
 
T
R
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
N
 
T
D
 
N
T
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
M
 
F
M
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
T
M
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
P
 
V
A
 
K
Y
 
G
Q
 
D
R
 
K
D
 
F
V
 
V
A
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
E
W
 
W
E
 
K
N
 
R
S
 
K
P
 
G
F
 
I
F
 
A
C
 
W
H
 
H
F
 
P
G
 
K
A
 
W
P
 
F
I
 
L
-
 
G
H
 
Y
D
 
E
L
 
L
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
V
G
 
G
K
x
F
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
H
 
R
V
 
I
L
 
L
W
 
Y
G
 
Y
E
x
S
H
x
R
K
 
T
N
 
R
A
 
K
S
 
S
S
 
Q
C
 
A
R
 
E
D
 
K
G
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
E
Y
 
Y
T
 
R
P
 
P
F
 
L
T
 
E
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
E
 
K
Q
 
E
T
|
T
R
 
M
N
 
Y
M
 
M
I
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
K
 
K
M
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
Q
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
x
I
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
T
Q
 
K
P
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
-
P
 
P
V
 
Y
H
 
Y
G
 
N
N
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
R
 
-
A
 
-
H
 
S
L
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
W
 
S
G
 
A
S
 
T
E
 
F
E
 
E
A
 
A
I
 
R
Q
 
E
R
 
A
I
 
M
C
 
A
S
 
E
M
 
L
L
 
V
E
 
A
D
 
R
N
 
N
I
 
L
N
 
I
T
 
A
F
 
F
M
 
K
Q
 
R

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
34% identity, 81% coverage: 54:307/312 of query aligns to 55:310/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
R
 
K
I
 
I
N
 
D
A
 
R
E
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
D
N
 
A
S
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
V
 
N
P
 
Y
A
 
A
T
x
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
R
 
I
Q
 
E
T
 
E
A
 
A
Q
 
T
Q
 
K
H
 
R
N
 
G
V
 
I
G
 
Y
I
 
V
R
 
T
N
 
N
V
 
T
R
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
N
 
T
D
 
D
T
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
W
M
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
M
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
P
 
V
A
 
K
Y
 
G
Q
 
D
R
 
K
D
 
F
V
 
V
A
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
E
W
 
W
E
 
K
N
 
R
S
 
R
P
 
G
F
 
I
F
 
A
C
 
W
H
 
H
F
 
P
G
 
K
A
 
M
P
 
F
I
 
L
-
 
G
H
 
Y
D
 
D
L
 
V
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
V
G
|
G
K
x
F
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
R
V
 
I
L
 
L
W
 
Y
G
 
T
E
x
A
H
x
R
K
x
S
N
 
R
A
x
K
S
 
P
S
 
E
C
 
A
R
 
E
D
 
K
G
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
E
Y
 
F
T
 
K
P
 
P
F
 
L
T
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
V
L
 
L
H
 
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
E
 
K
Q
x
E
T
|
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
M
I
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
K
 
R
M
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
T
Q
 
K
P
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
-
P
 
P
V
 
Y
H
 
Y
G
 
D
N
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
R
 
-
A
 
-
H
 
A
L
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
W
 
S
G
 
A
S
 
T
E
 
F
E
 
G
A
 
A
I
 
R
Q
 
E
R
 
G
I
 
M
C
 
A
S
 
E
M
 
L
L
 
V
E
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
N
 
I
T
 
A
F
 
F

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
34% identity, 84% coverage: 35:295/312 of query aligns to 30:289/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
P
 
P
D
 
D
E
 
E
V
 
-
A
 
-
D
 
D
R
 
R
I
 
L
A
 
V
Q
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
D
-
 
V
A
 
E
N
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
S
 
R
N
 
S
K
 
K
V
 
P
R
 
K
I
 
V
N
 
T
A
 
R
E
 
R
A
 
V
I
 
I
R
 
E
N
 
S
S
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
Q
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
R
P
 
A
A
 
G
T
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
R
 
V
Q
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
E
H
 
K
N
 
G
V
 
I
G
 
E
I
 
V
R
 
V
N
 
N
V
 
A
R
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
x
S
N
 
S
D
 
R
T
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
A
M
 
V
M
 
G
L
 
L
I
 
M
L
 
F
A
 
S
L
 
V
M
 
A
R
 
R
Q
 
K
L
 
I
P
 
A
A
 
F
Y
 
A
Q
 
D
R
 
R
D
 
K
V
 
M
A
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
V
W
 
W
E
 
A
N
 
K
S
 
K
P
 
E
F
 
A
F
 
M
C
 
G
H
 
I
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
E
L
 
L
N
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
|
G
K
x
F
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Y
A
 
Q
L
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
I
A
 
A
Q
 
N
A
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
H
 
N
V
 
I
L
 
L
-
 
L
-
x
Y
-
x
D
-
x
P
W
 
Y
G
 
P
E
 
N
H
 
E
K
 
E
N
 
R
A
 
A
S
 
K
S
 
E
C
 
V
R
 
N
D
 
G
G
 
K
Y
 
F
T
 
V
P
 
D
F
 
L
T
 
E
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
C
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
V
E
 
E
Q
 
S
T
|
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
L
I
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
K
 
K
M
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
Q
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
T
G
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
L
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
T
Q
 
N
P
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
L
V
 
P
H
 
K
G
 
D
N
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
T
R
 
K
A
 
-
H
 
-
L
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
W
 
A
G
 
S
S
 
T
E
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
Q
Q
 
E
R
 
R

3kb6B Crystal structure of d-lactate dehydrogenase from aquifex aeolicus complexed with NAD and lactic acid (see paper)
31% identity, 78% coverage: 54:296/312 of query aligns to 53:306/334 of 3kb6B

query
sites
3kb6B
R
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
E
E
 
E
A
 
L
I
 
L
R
 
S
N
 
K
S
 
M
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
H
V
 
T
P
 
R
A
x
S
T
x
V
G
|
G
L
 
F
D
 
D
H
 
H
I
 
I
D
 
D
R
 
L
Q
 
D
T
 
Y
A
 
C
Q
 
K
Q
 
K
H
 
K
N
 
G
V
 
I
G
 
L
I
 
V
R
 
T
N
 
H
V
 
I
R
 
P
G
 
A
Y
|
Y
G
x
S
N
 
P
D
 
E
T
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
A
 
T
M
 
F
M
 
A
L
 
M
I
 
I
L
 
L
A
 
T
L
 
L
M
 
V
R
 
K
Q
 
R
L
 
L
P
 
K
A
 
R
Y
 
I
Q
 
E
R
 
D
D
 
R
V
 
V
A
 
K
A
 
K
-
 
L
G
 
N
L
 
F
W
 
S
E
 
Q
N
 
D
S
 
S
P
 
E
F
 
I
F
 
L
C
 
A
H
 
R
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
R
K
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
V
F
 
I
G
 
G
K
 
T
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
S
A
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
M
R
 
Y
A
 
G
Q
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
V
L
 
L
W
 
C
G
 
Y
E
x
D
H
x
V
K
 
V
N
 
K
A
 
R
S
 
E
S
 
D
C
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
K
-
 
G
-
 
C
-
 
V
Y
 
Y
T
 
T
P
 
S
F
 
L
T
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
V
P
|
P
L
 
Y
N
 
T
E
 
K
Q
 
E
T
 
T
R
 
H
N
 
H
M
 
M
I
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
I
K
 
S
M
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
D
Q
 
G
A
 
V
V
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
T
Q
 
D
P
 
A
L
 
L
V
 
Y
A
 
R
A
 
A
L
 
Y
K
 
Q
Y
 
R
G
 
G
Q
 
K
L
 
F
G
 
S
G
 
G
A
 
L
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
E
 
D
E
|
E
P
 
E
P
 
I
V
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
K
H
 
N
G
 
L
N
 
K
P
 
I
L
 
L
L
 
E
R
 
L
A
 
A
H
 
C
L
 
K
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
|
A
W
x
Y
G
 
Y
S
 
T
E
 
D
E
 
K
A
 
S
I
 
L
Q
 
E
R
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5z20F The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with nadh and oxamate (see paper)
38% identity, 76% coverage: 67:304/312 of query aligns to 77:322/336 of 5z20F

query
sites
5z20F
Q
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
A
V
 
L
P
 
R
A
 
S
T
 
A
G
 
G
L
 
Y
D
 
N
H
 
H
I
 
V
D
 
D
R
 
L
Q
 
A
T
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
H
 
L
N
 
G
V
 
L
G
 
P
I
 
V
R
 
V
N
 
H
V
 
V
R
 
P
G
 
A
Y
|
Y
G
x
S
N
 
P
D
 
H
T
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
A
 
A
M
 
V
M
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
T
L
 
L
M
 
N
R
 
R
Q
 
R
L
 
L
-
 
H
P
 
R
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
N
R
 
R
D
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
T
E
 
R
N
 
E
S
 
G
P
 
D
F
 
F
F
 
S
C
 
L
H
 
H
F
 
-
G
 
G
A
 
L
P
 
T
I
 
G
H
 
F
D
 
D
L
 
L
N
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
V
F
 
I
G
 
G
K
 
T
G
|
G
G
x
Q
I
|
I
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
R
R
 
I
A
 
M
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
C
H
 
E
V
 
L
L
 
L
-
 
A
W
x
Y
G
x
D
E
x
P
H
 
Y
K
 
P
N
 
N
A
 
P
S
 
R
S
 
I
C
 
Q
R
 
A
D
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
R
Y
 
Y
T
 
L
P
 
A
F
 
L
T
 
D
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
|
P
L
 
L
N
 
T
E
 
A
Q
 
D
T
|
T
R
 
R
N
 
H
M
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
A
A
 
Q
E
 
R
L
 
L
K
 
A
M
 
T
M
 
M
K
 
K
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
V
 
M
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
T
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
N
E
 
A
Q
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
Y
S
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
Q
P
 
P
V
 
L
H
 
Q
G
 
D
N
 
D
P
 
V
L
 
L
L
 
A
R
 
R
-
 
L
A
 
L
H
 
S
L
 
F
P
 
P
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
A
H
|
H
I
 
Q
A
|
A
W
 
F
G
 
L
S
 
T
E
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
Q
 
A
R
 
A
I
 
I
C
 
A
S
 
D
M
 
T
L
 
T
E
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
32% identity, 80% coverage: 56:305/312 of query aligns to 58:300/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
N
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
L
I
 
I
R
 
D
N
 
A
S
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
Q
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
S
V
 
S
P
 
F
A
 
S
T
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
K
I
 
V
D
 
D
R
 
L
Q
 
I
T
 
K
A
 
C
Q
 
E
Q
 
E
H
 
K
N
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
V
R
 
T
N
 
N
V
 
T
R
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
 
L
N
 
T
D
 
D
T
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
I
M
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
V
M
 
L
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
P
 
C
A
 
E
Y
 
C
Q
 
D
R
 
K
D
 
Y
V
 
V
A
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
A
W
 
W
E
 
K
N
 
F
S
 
G
P
 
D
F
 
F
F
 
-
C
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
K
P
 
L
I
 
T
H
 
T
D
 
K
L
 
F
N
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
 
G
K
x
L
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
H
 
P
V
 
I
-
 
S
L
 
Y
W
 
F
G
x
S
E
x
R
H
x
S
K
 
K
N
 
K
A
 
P
S
 
N
S
 
T
C
 
N
R
 
Y
D
 
T
G
 
Y
Y
 
Y
T
 
G
P
 
S
F
 
V
T
 
V
Q
 
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
S
Q
 
N
A
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
L
S
 
V
L
 
V
H
 
A
C
 
C
P
 
P
L
 
L
N
 
T
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
R
 
T
N
 
H
M
 
I
I
 
I
D
 
N
E
 
R
A
 
E
E
 
V
L
 
I
K
 
D
M
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
P
L
 
H
V
 
V
A
 
D
E
 
E
Q
 
P
P
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
K
 
V
Y
 
E
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
E
 
R
E
 
E
P
 
P
P
 
E
V
 
V
H
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
P
L
 
E
L
 
K
R
 
L
A
 
F
H
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
V
A
 
G
W
 
S
G
 
G
S
 
T
E
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
R
Q
 
K
R
 
V
I
 
M
C
 
A
S
 
D
M
 
L
L
 
V
E
 
V
D
 
G
N
 
N
I
 
L
N
 
E

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
32% identity, 80% coverage: 56:305/312 of query aligns to 56:298/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
N
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
L
I
 
I
R
 
D
N
 
A
S
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
Q
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
S
V
 
S
P
 
F
A
 
S
T
x
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
K
I
 
V
D
 
D
R
 
L
Q
 
I
T
 
K
A
 
C
Q
 
E
Q
 
E
H
 
K
N
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
V
R
 
T
N
 
N
V
 
T
R
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
N
 
T
D
 
D
T
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
I
M
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
V
M
 
L
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
P
 
C
A
 
E
Y
 
C
Q
 
D
R
 
K
D
 
Y
V
 
V
A
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
A
W
 
W
E
 
K
N
 
F
S
 
G
P
 
D
F
 
F
F
 
-
C
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
K
P
 
L
I
 
T
H
 
T
D
 
K
L
 
F
N
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
|
G
K
x
L
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
H
 
P
V
 
I
-
 
S
L
 
Y
W
 
F
G
x
S
E
x
R
H
x
S
K
 
K
N
 
K
A
 
P
S
 
N
S
 
T
C
 
N
R
 
Y
D
 
T
G
 
Y
Y
 
Y
T
 
G
P
 
S
F
 
V
T
 
V
Q
 
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
S
Q
 
N
A
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
L
S
 
V
L
 
V
H
 
A
C
|
C
P
|
P
L
 
L
N
 
T
E
 
P
Q
 
E
T
|
T
R
 
T
N
 
H
M
 
I
I
 
I
D
 
N
E
 
R
A
 
E
E
 
V
L
 
I
K
 
D
M
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
P
L
 
H
V
 
V
A
 
D
E
 
E
Q
 
P
P
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
K
 
V
Y
 
E
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
E
 
R
E
|
E
P
 
P
P
 
E
V
 
V
H
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
P
L
 
E
L
 
K
R
 
L
A
 
F
H
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
A
x
G
W
 
S
G
 
G
S
 
T
E
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
R
Q
 
K
R
 
V
I
 
M
C
 
A
S
 
D
M
 
L
L
 
V
E
 
V
D
 
G
N
 
N
I
 
L
N
 
E

6p2iA Acyclic imino acid reductase (bsp5) in complex with NADPH and d-arg (see paper)
31% identity, 98% coverage: 5:310/312 of query aligns to 2:300/307 of 6p2iA

query
sites
6p2iA
E
 
K
I
 
I
V
 
T
F
 
Y
L
 
I
D
 
D
R
 
K
A
 
P
T
 
T
-
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
 
S
Y
 
W
P
 
V
F
 
I
N
 
N
F
 
K
-
 
I
-
 
N
K
 
E
F
 
Y
P
 
G
H
 
D
H
 
F
I
 
E
T
 
V
S
 
F
Y
 
Y
S
 
D
H
 
F
T
 
P
S
 
N
P
 
E
D
 
E
E
 
E
V
 
A
A
 
I
D
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
S
Q
 
S
A
 
T
N
 
D
I
 
I
V
 
A
I
 
I
S
 
V
N
x
E
K
 
W
V
 
T
R
 
S
I
 
I
N
 
T
A
 
K
E
 
E
A
 
M
I
 
I
R
 
E
N
 
K
S
 
I
P
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
L
 
Y
I
 
L
A
 
I
V
 
T
P
 
I
A
x
T
T
|
T
G
x
S
L
 
Y
D
 
D
H
 
Y
I
 
I
D
 
D
R
 
V
Q
 
N
T
 
S
A
 
L
Q
 
K
Q
 
D
H
 
N
N
 
E
V
 
I
G
 
M
I
 
V
R
 
S
N
 
N
V
 
C
R
 
P
G
 
Q
Y
|
Y
G
x
S
N
 
K
D
 
Q
T
 
A
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
A
 
V
M
 
F
M
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
F
A
 
A
L
 
V
M
 
N
R
 
R
Q
 
K
L
 
I
P
 
L
A
 
Q
Y
 
A
Q
 
D
R
 
E
D
 
T
V
 
C
A
 
R
A
 
K
G
 
G
L
 
L
W
 
S
E
 
H
-
 
I
N
 
Y
S
 
P
P
 
P
F
 
F
F
 
L
C
 
C
H
 
S
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
E
L
 
I
N
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
L
F
 
I
G
|
G
K
x
I
G
|
G
G
x
Q
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
I
A
 
A
Q
 
N
A
 
A
F
 
F
G
 
Q
M
 
M
H
 
K
V
 
V
L
 
I
W
 
-
G
 
G
E
 
L
H
x
N
K
|
K
N
x
S
A
 
K
S
x
R
S
 
N
C
 
V
R
 
K
D
 
G
-
 
I
G
 
Q
Y
 
Q
T
 
V
P
 
D
F
 
I
T
 
T
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
Q
 
K
Q
 
K
A
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
I
S
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
I
P
|
P
L
 
R
N
 
N
E
 
A
Q
 
D
T
|
T
R
 
E
N
 
I
M
 
I
I
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
K
E
 
L
L
 
L
K
 
S
M
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
T
G
x
C
R
 
R
G
 
G
G
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
D
E
 
E
Q
 
Q
P
 
A
L
 
L
V
 
Y
A
 
S
A
 
V
L
 
L
K
 
K
Y
 
Q
G
 
N
Q
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
D
L
 
L
S
 
T
E
 
Y
E
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
Y
H
 
K
G
 
D
N
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
I
R
 
-
A
 
-
H
 
G
L
 
L
P
 
N
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
G
I
 
S
A
 
A
W
|
W
G
 
Y
S
 
S
E
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
R
Q
 
E
R
 
K
I
 
N
C
 
M
S
 
Y
M
 
E
L
 
L
E
 
I
D
 
E
N
 
N
I
 
I
N
 
E
T
 
S
F
 
Y
M
 
L
Q
 
A
E
 
Q

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
35% identity, 82% coverage: 54:309/312 of query aligns to 56:313/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
R
 
R
I
 
I
N
 
D
A
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
E
N
 
N
S
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
Q
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
V
 
N
P
 
Y
A
 
A
T
x
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
R
 
I
Q
 
E
T
 
E
A
 
A
Q
 
T
Q
 
K
H
 
R
N
 
G
V
 
I
G
 
Y
I
 
V
R
 
T
N
 
N
V
 
T
R
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
N
 
T
D
 
D
T
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
F
M
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
T
M
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
P
 
V
A
 
K
Y
 
G
Q
 
D
R
 
R
D
 
F
V
 
V
A
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
E
W
 
W
E
 
K
N
 
K
S
 
R
P
 
G
F
 
V
F
 
A
C
 
W
H
 
H
F
 
P
G
 
K
A
 
W
P
 
F
I
 
L
-
 
G
H
 
Y
D
 
D
L
 
V
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
 
G
K
x
L
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
H
 
R
V
 
I
L
 
L
W
 
Y
G
 
Y
E
x
S
H
x
R
K
x
T
N
 
R
A
 
K
S
 
E
S
 
E
C
 
V
R
 
E
D
 
R
G
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
E
Y
 
F
T
 
K
P
 
P
F
 
L
T
 
E
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
V
L
 
L
H
x
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
E
 
R
Q
 
E
T
|
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
L
I
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
K
 
K
M
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
Q
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
T
Q
 
N
P
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
-
P
 
P
V
 
Y
H
 
Y
G
 
N
N
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
R
 
K
A
 
-
H
 
-
L
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
W
 
S
G
 
A
S
 
S
E
 
F
E
 
G
A
 
A
I
 
R
Q
 
E
R
 
G
I
 
M
C
 
A
S
 
E
M
 
L
L
 
V
E
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
N
 
I
T
 
A
F
 
F
M
 
K
Q
 
R

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
35% identity, 82% coverage: 54:309/312 of query aligns to 56:313/334 of O58320

query
sites
O58320
R
 
R
I
 
I
N
 
D
A
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
E
N
 
N
S
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
Q
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
V
 
N
P
 
Y
A
 
A
T
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
R
 
I
Q
 
E
T
 
E
A
 
A
Q
 
T
Q
 
K
H
 
R
N
 
G
V
 
I
G
 
Y
I
 
V
R
 
T
N
 
N
V
 
T
R
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
 
L
N
 
T
D
 
D
T
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
F
M
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
T
M
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
P
 
V
A
 
K
Y
 
G
Q
 
D
R
 
R
D
 
F
V
 
V
A
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
E
W
 
W
E
 
K
N
 
K
S
 
R
P
 
G
F
 
V
F
 
A
C
 
W
H
 
H
F
 
P
G
 
K
A
 
W
P
 
F
I
 
L
-
 
G
H
 
Y
D
 
D
L
 
V
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
 
G
K
x
L
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
H
 
R
V
 
I
L
 
L
W
 
Y
G
 
Y
E
x
S
H
x
R
K
x
T
N
 
R
A
 
K
S
 
E
S
 
E
C
 
V
R
 
E
D
 
R
G
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
E
Y
 
F
T
 
K
P
 
P
F
 
L
T
 
E
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
V
L
 
L
H
 
A
C
 
V
P
 
P
L
 
L
N
 
T
E
 
R
Q
 
E
T
 
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
L
I
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
K
 
K
M
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
Q
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
T
Q
 
N
P
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
E
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
V
 
Y
H
 
Y
G
 
N
N
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
R
 
K
A
 
-
H
 
-
L
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
|
I
A
x
G
W
 
S
G
 
A
S
 
S
E
 
F
E
 
G
A
 
A
I
 
R
Q
 
E
R
 
G
I
 
M
C
 
A
S
 
E
M
 
L
L
 
V
E
 
A
D
 
K
N
 
N
I
 
L
N
 
I
T
 
A
F
 
F
M
 
K
Q
 
R

6ttbA Crystal structure of NAD-dependent formate dehydrogenase from staphylococcus aureus in complex with NAD
32% identity, 80% coverage: 58:308/312 of query aligns to 71:316/331 of 6ttbA

query
sites
6ttbA
E
 
E
A
 
R
I
 
I
R
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
R
 
N
L
 
L
Q
 
K
L
 
L
I
 
A
A
 
I
V
 
T
P
 
A
A
 
G
T
x
V
G
 
G
L
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
V
D
 
D
R
 
L
Q
 
A
T
 
A
A
 
A
Q
 
S
Q
 
E
H
 
H
N
 
N
V
 
I
G
 
G
I
 
V
R
 
V
N
 
E
V
 
V
R
 
T
G
 
G
Y
 
S
G
x
N
N
 
T
D
 
V
T
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
A
 
A
M
 
V
M
 
M
L
 
D
I
 
L
L
 
L
A
 
I
L
 
L
M
 
L
R
 
R
Q
 
N
L
 
Y
P
 
E
A
 
E
Y
 
G
Q
 
H
R
 
R
D
 
Q
V
 
S
A
 
V
A
 
E
G
 
G
L
 
E
W
 
W
E
 
N
N
 
-
S
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
L
C
 
S
H
 
Q
F
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
H
I
 
A
H
 
H
D
 
E
L
 
L
N
 
Q
G
 
H
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
|
F
G
 
G
K
 
F
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
R
A
 
L
Q
 
A
A
 
P
F
 
F
G
 
N
M
 
V
H
 
T
V
 
L
L
 
-
W
 
-
G
 
-
E
 
Q
H
 
H
K
x
Y
N
x
D
A
x
P
S
 
I
S
 
N
C
 
Q
R
 
Q
D
 
D
-
 
H
-
 
K
-
 
L
-
 
S
G
 
K
Y
 
F
T
 
V
P
 
S
F
 
F
T
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
Q
 
S
Q
 
S
A
 
S
D
 
D
V
 
A
V
 
I
S
 
T
L
 
I
H
|
H
C
x
A
P
|
P
L
 
L
N
 
T
E
 
P
Q
 
E
T
|
T
R
 
D
N
 
N
M
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
K
A
 
D
E
 
V
L
 
L
K
 
S
M
 
R
M
 
M
K
 
K
P
 
K
Q
 
H
A
 
S
V
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
N
E
 
R
Q
 
D
P
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
Y
 
S
G
 
E
Q
 
H
L
 
L
G
 
Q
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
V
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
W
S
 
Y
E
 
P
E
 
Q
P
 
P
P
 
A
V
 
P
H
 
A
G
 
D
N
 
H
P
 
P
L
 
W
L
 
R
R
 
T
A
 
-
H
 
-
L
 
M
P
 
P
N
 
R
L
 
N
I
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
V
H
|
H
I
 
Y
A
x
S
W
x
G
G
 
M
S
 
T
E
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
Q
Q
 
K
R
 
R
I
 
I
C
 
E
S
 
D
M
 
G
L
 
V
E
 
K
D
 
D
N
 
I
I
 
L
N
 
E
T
 
R
F
 
F
M
 
F

4zgsA Identification of the pyruvate reductase of chlamydomonas reinhardtii (see paper)
33% identity, 82% coverage: 54:308/312 of query aligns to 65:335/346 of 4zgsA

query
sites
4zgsA
R
 
R
I
 
A
N
 
D
A
 
A
E
 
S
A
 
V
I
 
I
R
 
K
N
 
E
S
 
L
P
 
A
R
 
K
-
 
A
-
 
G
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
L
P
 
R
A
 
C
T
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
D
H
 
R
I
 
V
D
 
D
R
 
L
Q
 
H
T
 
A
A
 
C
Q
 
A
Q
 
E
H
 
H
N
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
V
R
 
V
N
 
R
V
 
V
R
 
P
G
 
T
Y
|
Y
G
x
S
N
 
P
D
 
E
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
A
 
A
M
 
V
M
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
L
M
 
N
R
 
R
Q
 
H
L
 
L
P
 
T
-
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
I
R
 
R
D
 
-
V
 
V
A
 
R
A
 
M
G
 
G
L
 
N
W
 
Y
E
 
S
N
 
L
S
 
S
P
 
-
F
 
-
F
 
-
C
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
G
A
 
L
P
 
V
I
 
G
H
 
V
D
 
E
L
 
M
N
 
R
G
 
H
K
 
K
T
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
V
F
 
V
G
 
G
K
 
T
G
|
G
G
x
A
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
I
A
 
L
Q
 
K
A
 
G
F
 
I
G
 
G
M
 
C
H
 
K
V
 
V
L
 
F
W
 
A
G
 
Y
E
x
D
H
 
I
K
 
K
-
 
P
N
 
N
A
 
P
S
 
A
S
 
V
C
 
E
R
 
A
D
 
M
G
 
G
-
 
I
-
 
P
Y
 
Y
T
 
V
P
 
S
F
 
L
T
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
Q
 
M
A
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
V
S
 
T
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
|
P
L
 
L
N
x
L
E
 
P
Q
x
S
T
|
T
R
 
R
N
 
Q
M
 
L
I
 
I
D
 
N
E
 
K
A
 
E
E
 
S
L
 
I
K
 
Q
M
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
K
Q
 
G
A
 
V
V
 
M
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
 
V
G
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
D
E
 
S
Q
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
E
Y
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
Y
S
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
G
P
 
G
V
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
H
-
 
T
H
 
K
G
 
F
N
 
D
P
 
P
L
 
S
L
 
V
R
 
R
A
 
M
H
 
Q
-
 
K
-
 
W
-
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
L
-
 
S
L
 
Y
P
 
P
N
 
Q
L
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
T
A
 
A
W
x
F
G
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
L
Q
 
N
R
 
N
I
 
I
C
 
C
S
 
T
M
 
T
L
 
T
E
 
I
D
 
Q
N
 
N
I
 
I
N
 
A
T
 
D
F
 
Y
M
 
V

7arzA Ternary complex of NAD-dependent formate dehydrogenase from physcomitrium patens
28% identity, 92% coverage: 26:312/312 of query aligns to 52:343/361 of 7arzA

query
sites
7arzA
H
 
Y
I
 
V
T
 
V
S
 
T
Y
 
S
S
 
D
H
 
K
T
 
D
S
 
G
P
 
P
D
 
D
E
 
S
V
 
E
A
 
L
D
 
D
R
 
K
-
 
E
I
 
L
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
N
 
H
I
 
I
V
 
L
I
 
I
S
x
T
N
 
T
K
x
P
V
x
F
R
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
I
 
M
N
 
T
A
 
K
E
 
E
A
 
R
I
 
L
R
 
A
N
 
K
S
 
A
P
 
K
R
 
N
L
 
L
Q
 
E
L
 
L
I
x
L
A
x
V
V
x
T
P
 
A
A
x
G
T
x
V
G
 
G
L
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
I
D
 
D
R
 
L
Q
 
H
T
 
A
A
 
A
Q
 
A
Q
 
E
H
 
K
N
 
G
V
 
L
G
 
T
I
 
V
R
 
S
N
 
E
V
 
V
R
 
T
G
 
G
Y
 
S
G
x
N
N
 
V
D
 
T
T
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
D
A
 
E
M
 
V
M
 
L
L
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
V
L
 
L
M
 
V
R
 
R
Q
 
N
L
 
F
P
 
A
A
 
P
Y
 
G
Q
 
W
R
 
K
D
 
Q
V
 
V
A
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
G
W
 
W
E
 
N
N
 
V
S
 
A
P
 
A
F
 
V
F
 
V
C
 
H
H
 
H
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
A
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
N
 
I
G
 
D
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
T
F
 
V
G
 
G
K
 
G
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
M
A
 
K
R
 
R
A
 
L
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
L
-
 
Y
-
 
Y
-
x
D
-
x
R
H
 
N
V
 
S
L
 
L
W
 
G
G
 
A
E
 
E
H
 
R
K
 
E
N
 
K
A
 
E
S
 
L
S
 
G
C
 
C
R
 
K
D
 
R
G
 
-
Y
 
E
T
 
T
P
 
D
F
 
L
T
 
D
Q
 
T
L
 
M
L
 
L
Q
 
S
Q
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
V
L
 
V
H
 
N
C
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
T
E
 
D
Q
|
Q
T
 
T
R
 
R
N
 
G
M
 
L
I
 
F
D
 
N
E
 
K
A
 
E
E
 
R
L
 
I
K
 
A
M
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
K
Q
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
x
N
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
A
A
 
D
E
 
T
Q
 
E
P
 
A
L
 
V
V
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
C
K
 
E
Y
 
S
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
V
 
G
D
|
D
V
 
V
L
 
W
S
 
N
E
 
A
E
 
Q
P
 
P
P
 
A
V
 
G
H
 
K
G
 
D
N
 
H
P
 
P
L
 
W
L
 
-
R
 
-
A
 
R
H
 
Y
L
 
M
P
 
P
N
 
N
L
 
H
I
 
A
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
S
W
x
G
G
 
T
S
 
T
E
 
L
E
 
D
A
 
A
I
 
Q
Q
 
K
R
 
R
I
 
F
C
 
A
S
 
A
M
 
G
L
 
T
E
 
K
D
 
D
N
 
M
I
 
I
N
 
D
T
 
R
F
 
W
M
 
L
Q
 
K
E
 
H
N
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
30% identity, 89% coverage: 34:310/312 of query aligns to 87:370/466 of P87228

query
sites
P87228
S
|
S
P
 
E
D
 
D
E
 
D
V
 
L
A
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
I
A
 
K
Q
 
G
A
 
V
N
 
H
I
 
A
V
 
I
-
 
G
I
 
I
S
 
R
N
 
S
K
 
K
V
 
T
R
 
R
I
 
L
N
 
T
A
 
R
E
 
R
A
 
V
I
 
L
R
 
E
N
 
A
S
 
A
P
 
D
R
 
S
L
 
L
Q
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
G
V
 
C
P
 
F
A
 
C
T
 
I
G
 
G
L
 
T
D
 
N
H
 
Q
I
 
V
D
 
D
R
 
L
Q
 
D
T
 
F
A
 
A
Q
 
A
Q
 
E
H
 
R
N
 
G
V
 
I
G
 
A
I
 
V
R
 
F
N
 
N
V
 
S
R
 
P
G
 
Y
Y
 
A
G
 
N
N
 
S
D
 
R
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
V
M
 
I
M
 
G
L
 
Y
I
 
I
L
 
I
A
 
S
L
 
L
M
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
V
P
 
G
A
 
D
Y
 
R
Q
 
S
R
 
L
D
 
E
V
 
L
A
 
H
A
 
R
G
 
G
L
 
E
W
 
W
E
 
N
N
 
K
S
 
V
P
 
S
F
 
S
F
 
G
C
 
C
H
 
W
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
E
L
 
I
N
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
 
G
K
 
Y
G
 
G
G
 
H
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
A
 
Q
L
 
L
A
 
S
A
 
V
R
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
F
 
M
G
 
G
M
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
V
W
 
Y
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
M
-
 
P
-
 
L
G
 
G
E
 
S
H
 
A
K
 
K
N
 
Q
A
 
L
S
 
S
S
 
S
C
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
L
T
 
P
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
H
Q
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
V
P
 
P
L
 
A
N
x
S
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
I
 
I
D
 
S
E
 
S
A
 
K
E
 
E
L
 
F
K
 
A
M
 
A
M
 
M
K
 
K
P
 
E
Q
 
G
A
 
S
V
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
 
A
G
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
I
Q
 
P
P
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
S
K
 
K
Y
 
S
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
S
 
P
E
 
S
E
 
E
P
 
P
P
 
A
V
 
G
H
 
N
G
 
G
N
 
K
P
 
D
L
 
K
L
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
S
-
 
E
R
 
L
A
 
T
H
 
H
L
 
C
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
I
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
I
A
 
G
W
 
G
G
 
S
S
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
Q
Q
 
Y
R
 
N
I
 
I
C
 
G
S
 
I
M
 
E
L
 
V
E
 
S
D
 
E
N
 
A
I
 
L
N
 
T
T
 
R
F
 
Y
M
 
I
Q
 
N
E
 
E

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
29% identity, 80% coverage: 47:295/312 of query aligns to 46:289/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
I
 
L
V
 
I
I
 
V
S
 
R
N
 
S
K
 
A
V
 
T
R
 
K
I
 
V
N
 
T
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
R
 
N
N
 
A
S
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
V
 
R
P
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
R
 
L
Q
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
H
 
K
N
 
G
V
 
I
G
 
L
I
 
V
R
 
M
N
 
N
V
 
T
R
 
P
G
 
N
Y
 
G
G
 
N
N
 
S
D
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
M
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
Y
 
A
Q
 
T
R
 
A
D
 
S
V
 
M
A
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
K
W
 
W
E
 
E
N
 
R
S
 
K
P
 
K
F
 
F
F
 
M
C
 
G
H
 
T
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
x
L
G
|
G
K
x
L
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
|
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
L
 
I
W
 
G
G
 
Y
E
x
D
H
 
P
K
 
I
N
 
I
A
 
S
S
 
P
S
 
E
C
 
V
R
 
S
D
 
A
G
 
S
Y
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
Q
T
 
L
P
 
P
F
 
L
T
 
E
Q
 
E
L
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
I
 
L
D
 
N
E
 
D
A
 
N
E
 
T
L
 
F
K
 
A
M
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
Q
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
C
G
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
A
 
D
E
 
E
Q
 
G
P
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
Y
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
S
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
V
 
R
H
 
-
G
 
-
N
 
D
P
 
R
L
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
D
H
 
H
L
 
-
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
W
 
A
G
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
Q
Q
 
S
R
 
R

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
29% identity, 80% coverage: 47:295/312 of query aligns to 46:289/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
I
 
L
V
 
I
I
 
V
S
 
R
N
 
S
K
 
A
V
 
T
R
 
K
I
 
V
N
 
T
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
R
 
N
N
 
A
S
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
V
 
R
P
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
R
 
L
Q
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
H
 
K
N
 
G
V
 
I
G
 
L
I
 
V
R
 
M
N
 
N
V
 
T
R
 
P
G
 
N
Y
 
G
G
 
N
N
 
S
D
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
M
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
Y
 
A
Q
 
T
R
 
A
D
 
S
V
 
M
A
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
K
W
 
W
E
 
E
N
 
R
S
 
K
P
 
K
F
 
F
F
 
M
C
 
G
H
 
T
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
 
G
K
 
L
G
|
G
G
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
L
 
I
W
 
G
G
x
Y
E
x
D
H
x
P
K
x
I
N
x
I
A
 
S
S
 
P
S
 
E
C
 
V
R
 
S
D
 
A
G
 
S