SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_027490460.1 NCBI__GCF_021560695.1:WP_027490460.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ahxA Aspartate aminotransferase hexamutant (see paper)
50% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 1ahxA

query
sites
1ahxA
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
I
 
L
Y
 
Y
V
 
Y
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
L
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

1ahgA Aspartate aminotransferase hexamutant (see paper)
50% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 1ahgA

query
sites
1ahgA
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
|
D
P
 
P
I
|
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
V
 
Y
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
L
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
 
G
G
|
G
S
|
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

1ahfA Aspartate aminotransferase hexamutant (see paper)
50% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 1ahfA

query
sites
1ahfA
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
x
I
G
|
G
I
 
L
Y
 
Y
V
 
Y
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
L
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

5vwrA E.Coli aspartate aminotransferase-(1r,3s,4s)-3-amino-4- fluorocyclopentane-1-carboxylic acid (fcp)-alpha-ketoglutarate (see paper)
49% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 5vwrA

query
sites
5vwrA
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
|
G
G
|
G
S
x
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
N
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

5t4lA Plp and gaba trigger gabr-mediated transcription regulation in bacillus subsidies via external aldimine formation (see paper)
49% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 5t4lA

query
sites
5t4lA
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
|
G
G
|
G
S
x
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
N
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

3qpgA Crystal structures of escherichia coli aspartate aminotransferase reconstituted with 1-deaza-pyridoxal 5'-phosphate: internal aldimine and stable l-aspartate external aldimine (see paper)
49% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 3qpgA

query
sites
3qpgA
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
|
G
G
|
G
S
x
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
N
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

3pa9A Mechanism of inactivation of e. Coli aspartate aminotransferase by (s)-4-amino-4,5-dihydro-2-furancarboxylic acid (s-adfa) ph 7.5 (see paper)
49% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 3pa9A

query
sites
3pa9A
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
N
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
|
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

1x2aA Crystal structure of e.Coli aspat complexed with n-phosphopyridoxyl-d- glutamic acid (see paper)
49% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 1x2aA

query
sites
1x2aA
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
x
I
G
|
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
N
Y
|
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
|
G
G
|
G
S
x
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
|
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
N
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
|
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

1x29A Crystal structure of e.Coli aspat complexed with n-phosphopyridoxyl-2- methyl-l-glutamic acid (see paper)
49% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 1x29A

query
sites
1x29A
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
N
Y
|
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
|
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
N
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
|
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

1x28A Crystal structure of e.Coli aspat complexed with n-phosphopyridoxyl-l- glutamic acid (see paper)
49% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 1x28A

query
sites
1x28A
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
N
Y
|
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
|
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
N
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
|
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V

1cq8A Aspartate aminotransferase (E.C. 2.6.1.1) complexed with c6-pyridoxal- 5p-phosphate (see paper)
49% identity, 99% coverage: 4:398/400 of query aligns to 2:395/396 of 1cq8A

query
sites
1cq8A
F
 
F
A
 
E
S
 
N
L
 
I
E
 
T
M
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
D
T
 
L
Y
 
F
V
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
x
I
G
|
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
S
V
 
V
H
 
K
E
 
K
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
E
K
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
N
 
G
R
 
R
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
G
S
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
L
K
 
A
Q
 
K
V
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
V
G
 
-
A
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
W
I
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
W
|
W
G
 
P
N
 
N
H
 
H
H
 
K
V
 
S
V
 
V
F
 
F
R
 
N
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
N
H
 
H
G
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
A
M
 
L
L
 
I
E
 
N
D
 
S
L
 
L
G
 
N
K
 
E
L
 
A
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
L
 
S
K
 
V
E
 
E
R
 
K
R
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
F
 
L
V
 
F
D
|
D
M
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
M
G
 
H
I
 
K
E
 
E
A
 
-
F
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
S
S
|
S
Y
 
Y
S
|
S
K
|
K
S
 
N
F
 
F
S
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
S
 
T
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
G
 
E
E
 
T
A
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
F
S
 
S
K
 
Q
I
 
M
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
S
 
N
P
 
P
S
 
P
T
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
N
S
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
I
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
H
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
G
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
-
 
R
D
 
D
F
 
F
G
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
I
K
 
K
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
I
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
P
A
 
D
N
 
N
L
 
M
D
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
A
V
 
V