SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_027490509.1 NCBI__GCF_021560695.1:WP_027490509.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A959 Glutamate-pyruvate aminotransferase AlaA; EC 2.6.1.2 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
44% identity, 96% coverage: 1:400/415 of query aligns to 1:400/405 of P0A959

query
sites
P0A959
M
 
M
A
 
S
P
 
P
I
 
I
T
 
E
P
 
K
S
 
S
A
 
S
H
 
K
L
 
L
A
 
E
D
 
N
V
 
V
R
 
C
Y
 
Y
E
 
D
I
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
P
L
 
V
T
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
E
G
 
G
L
 
N
D
 
K
I
 
V
I
 
L
K
 
K
L
 
L
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
P
Y
 
F
G
 
G
F
 
F
A
 
D
T
 
A
P
 
P
A
 
D
H
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
V
A
 
D
I
 
V
A
 
I
G
 
R
H
 
N
L
 
L
H
 
P
D
 
T
S
 
A
E
 
Q
A
 
G
Y
 
Y
G
 
C
H
 
D
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
Y
P
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
M
A
 
Q
Q
 
H
Q
 
Y
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
M
Q
 
R
G
 
D
V
 
V
E
 
T
P
 
V
E
 
E
R
 
D
I
 
I
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
N
 
N
G
 
G
V
 
V
S
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
V
L
 
Q
S
 
A
L
 
M
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
D
 
S
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
M
L
 
L
L
 
V
P
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
W
 
W
S
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
V
I
 
S
L
 
L
N
 
S
G
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
A
R
 
V
Y
 
H
Y
 
Y
R
 
L
C
 
C
L
 
D
A
 
E
R
 
S
D
 
S
G
 
D
H
 
W
L
 
F
P
 
P
D
 
D
P
 
L
D
 
D
E
 
D
I
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
K
I
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
P
 
S
R
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
M
R
 
E
L
 
I
V
 
V
T
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
R
R
 
Q
H
 
H
R
 
N
L
 
L
L
 
I
L
 
I
L
 
F
S
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
E
F
 
H
Q
 
H
P
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
P
V
 
L
A
 
A
G
 
P
E
 
D
V
 
L
P
 
L
C
 
T
L
 
I
S
 
T
F
 
F
G
 
N
G
 
G
L
 
L
S
 
S
K
|
K
V
 
T
H
 
Y
R
 
R
A
 
V
C
 
A
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
V
 
Q
G
 
G
W
 
W
M
 
M
S
 
V
L
 
L
S
 
N
G
 
G
D
 
P
S
 
K
A
 
K
G
 
H
S
 
A
A
 
K
S
 
G
Y
 
Y
R
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
Q
 
E
L
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
R
L
 
L
C
 
C
A
 
A
N
 
N
V
 
V
T
 
P
A
 
A
Q
 
Q
W
 
H
A
 
A
V
 
I
L
 
Q
P
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
G
D
 
G
A
 
Y
P
 
Q
T
 
S
I
 
I
G
 
S
A
 
E
L
 
F
T
 
I
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
E
 
E
A
 
Q
R
 
R
R
 
N
I
 
R
V
 
A
L
 
W
E
 
E
G
 
L
V
 
I
A
 
N
A
 
D
S
 
I
D
 
P
Y
 
G
L
 
V
E
 
S
L
 
C
V
 
V
A
 
K
P
 
P
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
A
 
M
F
 
F
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
R
 
D
A
 
A
D
 
K
R
 
R
L
 
F
A
 
N
S
 
I
F
 
H
D
 
D
D
 
D
E
 
Q
A
 
K
F
 
M
A
 
V
L
 
L
R
 
D
L
 
F
L
 
L
E
 
L
E
 
Q
E
 
E
S
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
V
 
V
P
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
A
F
 
F
N
 
N
V
 
W
P
 
P
G
 
W
S
 
P
R
 
D
H
 
H
V
 
F
R
 
R
L
 
I
T
 
V
L
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
R
P
 
V
A
 
D
Q
 
D
L
 
I
R
 
E
E
 
L
V
 
S
F
 
L
V
 
S
R
 
K
I
 
F
E
 
A
R
 
R
V
 
F
L
 
L
S
 
S

4cvqA Crystal structure of an aminotransferase from escherichia coli at 2. 11 angstroem resolution (see paper)
44% identity, 96% coverage: 1:400/415 of query aligns to 1:400/404 of 4cvqA

query
sites
4cvqA
M
 
M
A
 
S
P
 
P
I
 
I
T
 
E
P
 
K
S
 
S
A
 
S
H
 
K
L
 
L
A
 
E
D
 
N
V
 
V
R
 
C
Y
 
Y
E
 
D
I
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
P
L
 
V
T
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
E
G
 
G
L
 
N
D
 
K
I
 
V
I
 
L
K
 
K
L
 
L
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
P
Y
 
F
G
 
G
F
 
F
A
 
D
T
 
A
P
 
P
A
 
D
H
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
V
A
 
D
I
 
V
A
 
I
G
 
R
H
 
N
L
 
L
H
 
P
D
 
T
S
 
A
E
 
Q
A
 
G
Y
 
Y
G
 
C
H
 
D
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
Y
P
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
M
A
 
Q
Q
 
H
Q
 
Y
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
M
Q
 
R
G
 
D
V
 
V
E
 
T
P
 
V
E
 
E
R
 
D
I
 
I
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
N
 
N
G
|
G
V
|
V
S
|
S
E
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
V
L
 
Q
S
 
A
L
 
M
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
D
 
S
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
M
L
 
L
L
 
V
P
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
L
 
L
W
 
W
S
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
V
I
 
S
L
 
L
N
 
S
G
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
A
R
 
V
Y
 
H
Y
 
Y
R
 
L
C
 
C
L
 
D
A
 
E
R
 
S
D
 
S
G
 
D
H
 
W
L
 
F
P
 
P
D
 
D
P
 
L
D
 
D
E
 
D
I
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
K
I
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
P
 
S
R
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
M
R
 
E
L
 
I
V
 
V
T
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
R
R
 
Q
H
 
H
R
 
N
L
 
L
L
 
I
L
 
I
L
 
F
S
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
Y
|
Y
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
E
F
 
H
Q
 
H
P
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
P
V
 
L
A
 
A
G
 
P
E
 
D
V
 
L
P
 
L
C
 
T
L
 
I
S
 
T
F
 
F
G
 
N
G
 
G
L
 
L
S
|
S
K
|
K
V
 
T
H
 
Y
R
 
R
A
 
V
C
 
A
G
 
G
Y
 
F
R
|
R
V
 
Q
G
 
G
W
 
W
M
 
M
S
 
V
L
 
L
S
 
N
G
 
G
D
 
P
S
 
K
A
 
K
G
 
H
S
 
A
A
 
K
S
 
G
Y
 
Y
R
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
Q
 
E
L
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
R
L
 
L
C
 
C
A
 
A
N
 
N
V
 
V
T
 
P
A
 
A
Q
 
Q
W
 
H
A
 
A
V
 
I
L
 
Q
P
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
G
D
 
G
A
 
Y
P
 
Q
T
 
S
I
 
I
G
 
S
A
 
E
L
 
F
T
 
I
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
E
 
E
A
 
Q
R
 
R
R
 
N
I
 
R
V
 
A
L
 
W
E
 
E
G
 
L
V
 
I
A
 
N
A
 
D
S
 
I
D
 
P
Y
 
G
L
 
V
E
 
S
L
 
C
V
 
V
A
 
K
P
 
P
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
A
 
M
F
 
F
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
R
 
D
A
 
A
D
 
K
R
 
R
L
 
F
A
 
N
S
 
I
F
 
H
D
 
D
D
 
D
E
 
Q
A
 
K
F
 
M
A
 
V
L
 
L
R
 
D
L
 
F
L
 
L
E
 
L
E
 
Q
E
 
E
S
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
V
 
V
P
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
A
F
 
F
N
 
N
V
 
W
P
 
P
G
 
W
S
 
P
R
 
D
H
 
H
V
 
F
R
 
R
L
 
I
T
 
V
L
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
R
P
 
V
A
 
D
Q
 
D
L
 
I
R
 
E
E
 
L
V
 
S
F
 
L
V
 
S
R
 
K
I
 
F
E
 
A
R
 
R
V
 
F
L
 
L
S
 
S

1xi9C Alanine aminotransferase from pyrococcus furiosus pfu-1397077-001
34% identity, 93% coverage: 13:400/415 of query aligns to 9:391/393 of 1xi9C

query
sites
1xi9C
V
 
V
R
 
E
Y
 
Y
E
 
A
I
 
I
R
 
R
G
 
D
A
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
P
R
 
-
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
K
G
 
G
L
 
I
D
 
K
I
 
V
I
 
I
K
 
R
L
 
L
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
D
P
 
P
G
 
V
R
 
K
Y
 
F
G
 
D
F
 
F
A
 
Q
T
 
P
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
M
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
Y
A
 
C
G
 
K
H
 
A
L
 
I
H
 
K
D
 
E
S
 
G
E
 
H
A
 
N
Y
 
Y
-
 
Y
G
 
G
H
 
D
E
 
S
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
P
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
E
Q
 
R
Q
 
E
R
 
K
A
 
R
R
 
K
G
 
N
A
 
G
Q
 
V
G
 
D
V
 
I
E
 
T
P
 
P
E
 
D
R
 
D
I
 
V
F
 
R
I
 
V
G
 
T
N
 
A
G
x
A
V
|
V
S
x
T
E
 
E
L
 
A
I
 
L
D
 
Q
L
 
L
S
 
I
L
 
F
R
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
D
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
V
P
 
P
S
 
G
P
 
P
D
 
S
Y
|
Y
P
 
P
L
 
P
W
 
Y
S
 
T
A
 
G
A
 
L
T
 
V
I
 
K
L
 
F
N
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
V
Y
 
E
Y
 
Y
R
 
R
C
 
T
L
 
I
A
 
E
R
 
E
D
 
E
G
 
D
H
 
W
L
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
I
D
 
D
E
 
D
I
 
I
E
 
R
A
 
K
L
 
K
I
 
I
T
 
T
P
 
D
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
L
Y
 
Y
P
 
D
R
 
K
A
 
K
L
 
T
L
 
L
Q
 
E
R
 
E
L
 
I
V
 
L
T
 
N
I
 
I
A
 
A
A
 
G
R
 
E
H
 
Y
R
 
E
L
 
I
L
 
P
L
 
V
L
 
I
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
|
I
Y
|
Y
D
 
D
E
 
L
I
 
M
L
 
T
Y
 
Y
D
 
E
D
 
G
A
 
E
V
 
H
F
 
I
Q
 
S
P
 
P
L
 
-
A
 
G
A
 
S
V
 
L
A
 
T
G
 
K
E
 
D
V
 
V
P
 
P
C
 
V
L
 
I
S
 
V
F
 
M
G
 
N
G
 
G
L
 
L
S
|
S
K
|
K
V
 
V
H
 
Y
R
 
F
A
 
A
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
|
R
V
 
L
G
 
G
W
 
Y
M
 
M
S
 
Y
L
 
F
S
 
V
G
 
D
D
 
P
S
 
E
A
 
N
G
 
K
S
 
L
A
 
S
S
 
E
Y
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
D
L
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
I
R
 
R
L
 
L
C
 
C
A
 
P
N
 
N
V
 
T
T
 
P
A
 
A
Q
 
Q
W
 
F
A
 
A
V
 
A
L
 
I
P
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
G
A
 
P
P
 
-
T
 
-
I
 
M
G
 
D
A
 
Y
L
 
L
T
 
K
T
 
E
P
 
Y
G
 
M
G
 
K
R
 
K
L
 
L
H
 
K
E
 
E
A
 
R
R
 
R
R
 
D
I
 
Y
V
 
I
L
 
Y
E
 
K
G
 
R
V
 
L
A
 
N
A
 
E
S
 
I
D
 
P
Y
 
G
L
 
I
E
 
S
L
 
T
V
 
T
A
 
K
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
A
 
I
F
 
F
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
R
 
E
A
 
V
D
 
G
R
 
P
L
 
W
A
 
K
S
 
-
F
 
-
D
 
N
D
 
D
E
 
K
A
 
E
F
 
F
A
 
V
L
 
L
R
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
H
E
 
N
E
 
A
S
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
F
V
 
V
P
 
H
G
 
G
S
 
S
S
 
G
F
 
F
N
 
G
V
 
E
P
 
Y
G
 
G
S
 
A
R
 
G
H
 
H
V
 
F
R
 
R
L
 
A
T
 
V
L
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
P
 
I
A
 
E
Q
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
E
V
 
A
F
 
M
V
 
D
R
 
R
I
 
F
E
 
E
R
 
K
V
 
F
L
 
M
S
 
K

1o4sB Crystal structure of aspartate aminotransferase (tm1255) from thermotoga maritima at 1.90 a resolution (see paper)
32% identity, 92% coverage: 21:400/415 of query aligns to 25:383/384 of 1o4sB

query
sites
1o4sB
L
 
L
T
 
D
R
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
I
A
 
K
A
 
K
G
 
G
L
 
E
D
 
D
I
 
V
I
 
I
K
 
N
L
 
L
N
 
T
I
 
A
G
 
G
N
 
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
P
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
P
L
 
V
R
 
V
E
 
E
A
 
E
I
 
A
A
 
V
G
 
R
H
 
F
L
 
L
H
 
Q
D
 
K
S
 
G
E
 
E
A
 
V
-
 
K
Y
 
Y
G
 
T
H
 
D
E
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
Y
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
G
I
 
I
A
 
A
A
 
K
Q
 
R
Q
 
I
R
 
G
A
 
E
R
 
R
G
 
Y
A
 
K
Q
 
K
G
 
D
V
 
I
E
 
S
P
 
P
E
 
D
R
 
Q
I
 
V
F
 
V
I
 
V
G
 
T
N
 
N
G
|
G
V
x
A
S
x
K
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
D
 
F
L
 
N
S
 
A
L
 
F
R
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
D
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
P
 
F
S
 
S
P
 
P
D
 
V
Y
x
W
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
I
A
 
P
A
 
Q
T
 
I
I
 
I
L
 
L
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
T
P
 
V
R
 
N
Y
 
V
Y
 
V
R
 
E
C
 
T
L
 
F
A
 
M
R
 
S
D
 
K
G
 
N
H
 
F
L
 
Q
P
 
P
D
 
S
P
 
L
D
 
E
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
L
T
 
V
P
 
G
R
 
K
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
N
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
R
R
 
R
A
 
E
L
 
F
L
 
L
Q
 
E
R
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
K
H
 
R
R
 
N
L
 
F
L
 
Y
L
 
I
L
 
I
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
x
V
Y
|
Y
D
 
D
E
 
S
I
 
L
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
D
 
D
A
 
E
V
 
F
F
 
T
Q
 
S
P
 
I
L
 
L
A
 
D
A
 
V
V
 
S
A
 
E
G
 
G
E
 
F
V
 
D
P
 
R
C
 
I
L
 
V
S
 
Y
F
 
I
G
 
N
G
 
G
L
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
S
H
 
H
R
 
S
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
|
R
V
 
V
G
 
G
W
 
Y
M
 
L
S
 
I
L
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
K
S
 
V
A
 
A
G
 
T
S
 
A
A
 
V
S
 
S
Y
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
K
L
 
I
L
 
Q
A
 
S
A
 
H
L
 
T
R
 
T
L
 
S
C
 
C
A
 
I
N
 
N
V
 
T
T
 
V
A
 
A
Q
 
Q
W
 
Y
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
D
 
V
A
 
D
P
 
N
T
 
S
I
 
Y
G
 
M
A
 
V
L
 
Q
T
 
T
T
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
F
H
 
K
E
 
E
A
 
R
R
 
K
R
 
N
I
 
F
V
 
V
L
 
V
E
 
E
G
 
R
V
 
L
A
 
K
A
 
K
S
 
M
D
 
G
Y
 
-
L
 
V
E
 
K
L
 
F
V
 
V
A
 
E
P
 
P
D
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
A
 
L
F
 
F
P
 
F
Q
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
G
D
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
D
D
 
D
E
 
V
A
 
K
F
 
F
A
 
C
L
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
E
 
K
S
 
K
V
 
V
L
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
A
F
 
F
N
 
L
V
 
K
P
 
P
G
 
G
S
 
-
R
 
-
H
 
F
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
S
L
 
F
L
 
A
P
 
T
P
 
S
P
 
I
A
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
T
E
 
E
V
 
A
F
 
L
V
 
D
R
 
R
I
 
I
E
 
E
R
 
D
V
 
F
L
 
L
S
 
N

1gdeA Crystal structure of pyrococcus protein a-1 e-form (see paper)
31% identity, 91% coverage: 23:400/415 of query aligns to 15:383/388 of 1gdeA

query
sites
1gdeA
R
 
R
R
 
K
A
 
L
R
 
F
E
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
G
G
 
M
L
 
K
D
 
D
I
 
V
I
 
I
K
 
S
L
 
L
N
 
G
I
 
I
G
 
G
N
 
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
H
 
H
L
 
I
R
 
K
E
 
E
A
 
Y
I
 
A
A
 
K
G
 
E
H
 
A
L
 
L
H
 
D
D
 
K
S
 
G
-
 
L
E
 
T
A
 
H
Y
 
Y
G
 
G
H
 
P
E
 
N
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
L
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
Q
 
L
R
 
K
A
 
K
R
 
Q
G
 
N
A
 
G
Q
 
I
G
 
E
V
 
A
E
 
D
P
 
P
E
 
K
-
 
T
R
 
E
I
 
I
F
 
M
I
 
V
G
 
L
N
 
L
G
|
G
V
x
A
S
x
N
E
 
Q
L
 
A
I
 
F
D
 
L
L
 
M
S
 
G
L
 
L
R
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
I
P
 
P
S
 
T
P
 
P
D
 
A
Y
x
F
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
A
A
 
P
A
 
A
T
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
V
Y
 
E
Y
 
V
R
 
P
C
 
T
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
D
 
D
G
 
E
H
 
F
L
 
R
P
 
L
D
 
N
P
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
L
E
 
K
A
 
K
L
 
Y
I
 
V
T
 
T
P
 
D
R
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
L
 
I
I
x
N
N
 
S
P
 
P
N
 
C
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
L
P
 
T
R
 
K
A
 
K
L
 
D
L
 
L
Q
 
E
R
 
E
L
 
I
V
 
A
T
 
D
I
 
F
A
 
V
A
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
 
V
Y
|
Y
D
 
E
E
 
H
I
 
F
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
R
F
 
H
Q
 
Y
P
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
M
V
 
F
P
 
E
-
 
R
C
 
T
L
 
I
S
 
T
F
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
T
H
 
F
R
 
A
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
|
R
V
 
L
G
 
G
W
 
F
M
 
V
S
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
A
A
 
A
G
 
P
S
 
S
A
 
W
S
 
I
Y
 
I
R
 
E
D
 
R
A
 
M
L
 
V
Q
 
K
L
 
F
L
 
Q
A
 
M
A
 
Y
L
 
N
R
 
A
L
 
T
C
 
C
A
 
P
N
 
V
V
 
T
T
 
F
A
 
I
Q
 
Q
W
 
Y
A
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
E
P
 
R
T
 
S
I
 
W
G
 
K
A
 
A
L
 
V
T
 
E
T
 
E
P
 
M
G
 
R
G
 
K
R
 
E
L
 
Y
H
 
D
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
K
I
 
L
V
 
V
L
 
W
E
 
K
G
 
R
V
 
L
A
 
N
A
 
E
S
 
M
D
 
G
Y
 
-
L
 
L
E
 
P
L
 
T
V
 
V
A
 
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
A
 
I
F
 
F
P
 
P
Q
 
R
V
 
I
R
 
R
A
 
D
D
 
T
R
 
G
L
 
L
A
 
T
S
 
S
F
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
S
L
 
E
R
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
K
E
 
E
E
 
A
S
 
R
V
 
V
L
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
A
F
 
F
N
 
G
V
 
K
P
 
A
G
 
G
S
 
E
R
 
G
H
 
Y
V
 
V
R
|
R
L
 
I
T
 
S
L
 
Y
L
 
A
P
 
T
P
 
A
P
 
Y
A
 
E
Q
 
K
L
 
L
R
 
E
E
 
E
V
 
A
F
 
M
V
 
D
R
 
R
I
 
M
E
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
K

1gd9A Crystall structure of pyrococcus protein-a1 (see paper)
31% identity, 91% coverage: 23:400/415 of query aligns to 15:383/388 of 1gd9A

query
sites
1gd9A
R
 
R
R
 
K
A
 
L
R
 
F
E
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
G
G
 
M
L
 
K
D
 
D
I
 
V
I
 
I
K
 
S
L
 
L
N
 
G
I
 
I
G
 
G
N
 
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
H
 
H
L
 
I
R
 
K
E
 
E
A
 
Y
I
 
A
A
 
K
G
 
E
H
 
A
L
 
L
H
 
D
D
 
K
S
 
G
-
 
L
E
 
T
A
 
H
Y
 
Y
G
 
G
H
 
P
E
 
N
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
L
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
Q
 
L
R
 
K
A
 
K
R
 
Q
G
 
N
A
 
G
Q
 
I
G
 
E
V
 
A
E
 
D
P
 
P
E
 
K
-
 
T
R
 
E
I
 
I
F
 
M
I
 
V
G
 
L
N
 
L
G
|
G
V
x
A
S
x
N
E
 
Q
L
 
A
I
 
F
D
 
L
L
 
M
S
 
G
L
 
L
R
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
I
P
 
P
S
 
T
P
 
P
D
 
A
Y
x
F
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
A
A
 
P
A
 
A
T
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
V
Y
 
E
Y
 
V
R
 
P
C
 
T
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
D
 
D
G
 
E
H
 
F
L
 
R
P
 
L
D
 
N
P
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
L
E
 
K
A
 
K
L
 
Y
I
 
V
T
 
T
P
 
D
R
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
L
 
I
I
 
N
N
 
S
P
 
P
N
 
C
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
L
P
 
T
R
 
K
A
 
K
L
 
D
L
 
L
Q
 
E
R
 
E
L
 
I
V
 
A
T
 
D
I
 
F
A
 
V
A
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
x
V
Y
|
Y
D
 
E
E
 
H
I
 
F
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
R
F
 
H
Q
 
Y
P
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
M
V
 
F
P
 
E
-
 
R
C
 
T
L
 
I
S
 
T
F
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
T
H
 
F
R
 
A
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
|
R
V
 
L
G
 
G
W
 
F
M
 
V
S
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
A
A
 
A
G
 
P
S
 
S
A
 
W
S
 
I
Y
 
I
R
 
E
D
 
R
A
 
M
L
 
V
Q
 
K
L
 
F
L
 
Q
A
 
M
A
 
Y
L
 
N
R
 
A
L
 
T
C
 
C
A
 
P
N
 
V
V
 
T
T
 
F
A
 
I
Q
 
Q
W
 
Y
A
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
E
P
 
R
T
 
S
I
 
W
G
 
K
A
 
A
L
 
V
T
 
E
T
 
E
P
 
M
G
 
R
G
 
K
R
 
E
L
 
Y
H
 
D
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
K
I
 
L
V
 
V
L
 
W
E
 
K
G
 
R
V
 
L
A
 
N
A
 
E
S
 
M
D
 
G
Y
 
-
L
 
L
E
 
P
L
 
T
V
 
V
A
 
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
A
 
I
F
 
F
P
 
P
Q
 
R
V
 
I
R
 
R
A
 
D
D
 
T
R
 
G
L
 
L
A
 
T
S
 
S
F
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
S
L
 
E
R
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
K
E
 
E
E
 
A
S
 
R
V
 
V
L
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
A
F
 
F
N
 
G
V
 
K
P
 
A
G
 
G
S
 
E
R
 
G
H
 
Y
V
 
V
R
 
R
L
 
I
T
 
S
L
 
Y
L
 
A
P
 
T
P
 
A
P
 
Y
A
 
E
Q
 
K
L
 
L
R
 
E
E
 
E
V
 
A
F
 
M
V
 
D
R
 
R
I
 
M
E
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
K

Q56232 Aspartate/prephenate aminotransferase; AspAT / PAT; Transaminase A; EC 2.6.1.1; EC 2.6.1.78 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see 3 papers)
34% identity, 92% coverage: 20:401/415 of query aligns to 18:384/385 of Q56232

query
sites
Q56232
A
 
A
L
 
V
T
 
N
R
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
L
I
 
V
K
 
A
L
 
L
N
 
T
I
 
A
G
 
G
N
 
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
R
G
 
R
H
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
Q
S
 
G
E
 
K
A
 
T
-
 
K
Y
 
Y
G
 
A
H
 
P
E
 
P
Q
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
P
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
Q
 
F
R
 
R
A
 
R
R
 
E
G
 
N
A
 
G
Q
 
L
G
 
S
V
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
E
R
 
E
I
 
T
F
 
I
I
 
V
G
 
T
N
 
V
G
 
G
V
 
G
S
 
K
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
D
 
F
L
 
N
S
 
L
L
 
F
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Q
 
D
D
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
Y
Y
 
W
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
P
A
 
E
A
 
M
T
 
V
I
 
R
L
 
F
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
P
 
V
R
 
V
Y
 
E
Y
 
V
R
 
E
C
 
T
L
 
L
A
 
P
R
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
R
I
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
I
 
N
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
D
L
 
F
L
 
Y
L
 
L
L
 
V
S
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
E
 
H
I
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
D
 
G
A
 
E
V
 
H
F
 
F
Q
 
S
P
 
P
L
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
P
E
 
E
V
 
-
P
 
H
C
 
T
L
 
L
S
 
T
F
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
A
S
 
A
K
|
K
V
 
A
H
 
F
R
 
A
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
 
R
V
 
I
G
 
G
W
 
Y
M
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
A
A
 
C
G
 
G
S
 
P
A
 
K
S
 
E
Y
 
V
R
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
A
L
 
S
L
 
V
A
 
S
A
 
S
L
 
Q
R
 
S
L
 
T
C
 
T
A
 
S
-
 
P
N
 
D
V
 
T
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
D
 
N
A
 
Q
P
 
E
T
 
A
I
 
S
G
 
R
A
 
A
L
 
F
T
 
V
T
 
E
P
 
M
G
 
A
G
 
R
R
 
E
L
 
A
H
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
-
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
T
A
 
A
S
 
L
D
 
G
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
L
 
A
V
 
V
A
 
R
P
 
P
D
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
A
 
-
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
R
 
L
A
 
M
D
 
D
R
 
T
L
 
S
A
 
P
S
 
I
F
 
A
D
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
R
A
 
A
L
 
A
R
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
T
S
 
D
F
 
F
N
 
A
V
 
A
P
 
F
G
 
G
S
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
S
L
 
Y
L
 
A
P
 
T
P
 
S
P
 
E
A
 
E
Q
 
N
L
 
L
R
 
R
E
 
K
V
 
A
F
 
L
V
 
E
R
 
R
I
 
F
E
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1b5oA Thermus thermophilus aspartate aminotransferase single mutant 1 (see paper)
34% identity, 92% coverage: 20:399/415 of query aligns to 18:382/382 of 1b5oA

query
sites
1b5oA
A
 
A
L
 
V
T
 
N
R
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
L
I
 
V
K
 
A
L
 
L
N
 
T
I
 
A
G
 
G
N
 
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
R
G
 
R
H
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
Q
S
 
G
E
 
K
A
 
T
-
 
K
Y
 
Y
G
 
A
H
 
P
E
 
P
Q
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
P
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
Q
 
F
R
 
R
A
 
R
R
 
E
G
 
N
A
 
G
Q
 
L
G
 
S
V
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
E
R
 
E
I
 
T
F
 
I
I
 
V
G
 
T
N
 
V
G
|
G
V
x
G
S
|
S
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
D
 
F
L
 
N
S
 
L
L
 
F
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Q
 
D
D
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
Y
Y
x
W
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
P
A
 
E
A
 
M
T
 
V
I
 
R
L
 
F
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
P
 
V
R
 
V
Y
 
E
Y
 
V
R
 
E
C
 
T
L
 
L
A
 
P
R
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
R
I
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
I
 
N
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
D
L
 
F
L
 
Y
L
 
L
L
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
|
I
Y
|
Y
D
 
E
E
 
H
I
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
D
 
G
A
 
E
V
 
H
F
 
F
Q
 
S
P
 
P
L
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
P
E
 
E
V
 
-
P
 
H
C
 
T
L
 
L
S
 
T
F
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
A
S
x
A
K
|
K
V
 
A
H
 
F
R
 
A
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
Y
M
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
A
A
 
C
G
 
G
S
 
P
A
 
K
S
 
E
Y
 
V
R
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
A
L
 
S
L
 
V
A
 
S
A
 
S
L
 
Q
R
 
S
L
 
T
C
 
T
A
 
S
-
 
P
N
 
D
V
 
T
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
D
 
N
A
 
Q
P
 
E
T
 
A
I
 
S
G
 
R
A
 
A
L
 
F
T
 
V
T
 
E
P
 
M
G
 
A
G
 
R
R
 
E
L
 
A
H
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
-
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
T
A
 
A
S
 
L
D
 
G
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
L
 
A
V
 
V
A
 
R
P
 
P
D
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
A
 
-
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
R
 
L
A
 
M
D
 
D
R
 
T
L
 
S
A
 
P
S
 
I
F
 
A
D
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
R
A
 
A
L
 
A
R
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
T
S
 
D
F
 
F
N
 
A
V
 
A
P
 
F
G
 
G
S
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
S
L
 
Y
L
 
A
P
 
T
P
 
S
P
 
E
A
 
E
Q
 
N
L
 
L
R
 
R
E
 
K
V
 
A
F
 
L
V
 
E
R
 
R
I
 
F
E
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L

1gc4A Thermus thermophilus aspartate aminotransferase tetra mutant 2 complexed with aspartate (see paper)
33% identity, 92% coverage: 20:399/415 of query aligns to 18:382/382 of 1gc4A

query
sites
1gc4A
A
 
A
L
 
V
T
 
N
R
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
L
I
 
V
K
 
A
L
 
L
N
 
T
I
 
A
G
 
G
N
 
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
R
G
 
R
H
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
Q
S
 
G
E
 
K
A
 
T
-
 
K
Y
|
Y
G
 
A
H
 
P
E
 
P
Q
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
P
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
Q
 
F
R
 
R
A
 
R
R
 
E
G
 
N
A
 
G
Q
 
L
G
 
S
V
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
E
R
 
E
I
 
T
F
 
I
I
 
V
G
 
T
N
 
V
G
|
G
V
x
G
S
|
S
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
D
 
F
L
 
N
S
 
L
L
 
F
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Q
 
D
D
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
Y
Y
x
W
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
P
A
 
E
A
 
M
T
 
V
I
 
R
L
 
F
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
P
 
V
R
 
V
Y
 
E
Y
 
V
R
 
E
C
 
T
L
 
L
A
 
P
R
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
R
I
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
I
 
N
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
D
L
 
F
L
 
Y
L
 
L
L
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
 
I
Y
|
Y
D
 
E
E
 
H
I
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
D
 
G
A
 
E
V
 
H
F
 
F
Q
 
S
P
 
P
L
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
P
E
 
E
V
 
-
P
 
H
C
 
T
L
 
L
S
 
T
F
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
A
S
 
A
K
 
K
V
 
A
H
 
F
R
 
A
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
Y
M
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
A
A
 
C
S
 
G
Y
 
P
R
 
K
D
 
E
A
 
V
L
 
I
Q
 
K
L
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
S
L
 
V
R
 
S
L
x
R
C
 
Q
A
 
S
N
 
T
V
 
T
T
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
T
-
 
I
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
D
 
N
A
 
Q
P
 
E
T
 
A
I
 
S
G
 
R
A
 
A
L
 
F
T
 
V
T
 
E
P
 
M
G
 
A
G
 
R
R
 
E
L
 
A
H
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
-
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
T
A
 
A
S
 
L
D
 
G
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
L
 
A
V
 
V
A
 
R
P
 
P
D
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
|
Y
A
 
-
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
R
 
L
A
 
M
D
 
D
R
 
T
L
 
S
A
 
P
S
 
I
F
 
A
D
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
R
A
 
A
L
 
A
R
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
T
S
 
D
F
 
F
N
 
A
V
 
A
P
 
F
G
 
G
S
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
V
R
|
R
L
 
L
T
 
S
L
 
Y
L
 
A
P
 
T
P
 
S
P
 
E
A
 
E
Q
 
N
L
 
L
R
 
R
E
 
K
V
 
A
F
 
L
V
 
E
R
 
R
I
 
F
E
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L

1gc3A Thermus thermophilus aspartate aminotransferase tetra mutant 2 complexed with tryptophan (see paper)
33% identity, 92% coverage: 20:399/415 of query aligns to 18:382/382 of 1gc3A

query
sites
1gc3A
A
 
A
L
 
V
T
x
N
R
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
L
I
 
V
K
 
A
L
 
L
N
x
T
I
x
A
G
|
G
N
x
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
R
G
 
R
H
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
Q
S
 
G
E
 
K
A
 
T
-
 
K
Y
 
Y
G
 
A
H
 
P
E
 
P
Q
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
P
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
Q
 
F
R
 
R
A
 
R
R
 
E
G
 
N
A
 
G
Q
 
L
G
 
S
V
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
E
R
 
E
I
 
T
F
 
I
I
 
V
G
 
T
N
 
V
G
 
G
V
x
G
S
|
S
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
D
 
F
L
 
N
S
 
L
L
 
F
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Q
 
D
D
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
Y
Y
x
W
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
P
A
 
E
A
 
M
T
 
V
I
 
R
L
 
F
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
P
 
V
R
 
V
Y
 
E
Y
 
V
R
 
E
C
 
T
L
 
L
A
 
P
R
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
R
I
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
I
 
N
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
D
L
 
F
L
 
Y
L
 
L
L
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
 
I
Y
|
Y
D
 
E
E
 
H
I
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
D
 
G
A
 
E
V
 
H
F
 
F
Q
 
S
P
 
P
L
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
P
E
 
E
V
 
-
P
 
H
C
 
T
L
 
L
S
 
T
F
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
A
S
 
A
K
|
K
V
 
A
H
 
F
R
 
A
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
Y
M
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
A
A
 
C
S
 
G
Y
 
P
R
 
K
D
 
E
A
 
V
L
 
I
Q
 
K
L
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
S
L
 
V
R
 
S
L
 
R
C
 
Q
A
 
S
N
 
T
V
 
T
T
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
T
-
 
I
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
D
 
N
A
 
Q
P
 
E
T
 
A
I
 
S
G
 
R
A
 
A
L
 
F
T
 
V
T
 
E
P
 
M
G
 
A
G
 
R
R
 
E
L
 
A
H
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
-
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
T
A
 
A
S
 
L
D
 
G
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
L
 
A
V
 
V
A
 
R
P
 
P
D
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
|
Y
A
 
-
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
R
 
L
A
 
M
D
 
D
R
 
T
L
 
S
A
 
P
S
 
I
F
 
A
D
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
R
A
 
A
L
 
A
R
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
T
S
 
D
F
 
F
N
 
A
V
 
A
P
 
F
G
 
G
S
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
V
R
|
R
L
 
L
T
 
S
L
 
Y
L
 
A
P
 
T
P
 
S
P
 
E
A
 
E
Q
 
N
L
 
L
R
 
R
E
 
K
V
 
A
F
 
L
V
 
E
R
 
R
I
 
F
E
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1bkgA Aspartate aminotransferase from thermus thermophilus with maleate (see paper)
34% identity, 92% coverage: 20:399/415 of query aligns to 18:382/382 of 1bkgA

query
sites
1bkgA
A
 
A
L
 
V
T
 
N
R
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
L
I
 
V
K
 
A
L
 
L
N
 
T
I
 
A
G
 
G
N
 
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
R
G
 
R
H
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
Q
S
 
G
E
 
K
A
 
T
-
 
K
Y
 
Y
G
 
A
H
 
P
E
 
P
Q
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
P
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
Q
 
F
R
 
R
A
 
R
R
 
E
G
 
N
A
 
G
Q
 
L
G
 
S
V
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
E
R
 
E
I
 
T
F
 
I
I
 
V
G
 
T
N
 
V
G
|
G
V
x
G
S
x
K
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
D
 
F
L
 
N
S
 
L
L
 
F
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Q
 
D
D
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
Y
Y
x
W
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
P
A
 
E
A
 
M
T
 
V
I
 
R
L
 
F
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
P
 
V
R
 
V
Y
 
E
Y
 
V
R
 
E
C
 
T
L
 
L
A
 
P
R
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
R
I
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
I
x
N
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
D
L
 
F
L
 
Y
L
 
L
L
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
|
I
Y
|
Y
D
 
E
E
 
H
I
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
D
 
G
A
 
E
V
 
H
F
 
F
Q
 
S
P
 
P
L
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
P
E
 
E
V
 
-
P
 
H
C
 
T
L
 
L
S
 
T
F
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
A
S
 
A
K
|
K
V
 
A
H
 
F
R
 
A
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
Y
M
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
A
A
 
C
G
 
G
S
 
P
A
 
K
S
 
E
Y
 
V
R
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
A
L
 
S
L
 
V
A
 
S
A
 
S
L
 
Q
R
 
S
L
 
T
C
 
T
A
 
S
-
 
P
N
 
D
V
 
T
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
D
 
N
A
 
Q
P
 
E
T
 
A
I
 
S
G
 
R
A
 
A
L
 
F
T
 
V
T
 
E
P
 
M
G
 
A
G
 
R
R
 
E
L
 
A
H
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
-
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
T
A
 
A
S
 
L
D
 
G
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
L
 
A
V
 
V
A
 
R
P
 
P
D
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
A
 
-
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
R
 
L
A
 
M
D
 
D
R
 
T
L
 
S
A
 
P
S
 
I
F
 
A
D
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
R
A
 
A
L
 
A
R
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
T
S
 
D
F
 
F
N
 
A
V
 
A
P
 
F
G
 
G
S
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
S
L
 
Y
L
 
A
P
 
T
P
 
S
P
 
E
A
 
E
Q
 
N
L
 
L
R
 
R
E
 
K
V
 
A
F
 
L
V
 
E
R
 
R
I
 
F
E
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L

1bjwA Aspartate aminotransferase from thermus thermophilus (see paper)
34% identity, 92% coverage: 20:399/415 of query aligns to 18:382/382 of 1bjwA

query
sites
1bjwA
A
 
A
L
 
V
T
 
N
R
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
L
I
 
V
K
 
A
L
 
L
N
 
T
I
 
A
G
|
G
N
 
E
P
 
P
G
 
D
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
R
G
 
R
H
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
Q
S
 
G
E
 
K
A
 
T
-
 
K
Y
 
Y
G
 
A
H
 
P
E
 
P
Q
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
P
P
 
E
A
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
Q
 
F
R
 
R
A
 
R
R
 
E
G
 
N
A
 
G
Q
 
L
G
 
S
V
 
V
E
 
T
P
 
P
E
 
E
R
 
E
I
 
T
F
 
I
I
 
V
G
 
T
N
 
V
G
 
G
V
 
G
S
 
K
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
D
 
F
L
 
N
S
 
L
L
 
F
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Q
 
D
D
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
Y
Y
x
W
P
 
V
L
 
S
W
 
Y
S
 
P
A
 
E
A
 
M
T
 
V
I
 
R
L
 
F
N
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
P
 
V
R
 
V
Y
 
E
Y
 
V
R
 
E
C
 
T
L
 
L
A
 
P
R
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
R
I
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
I
 
N
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
E
H
 
H
R
 
D
L
 
F
L
 
Y
L
 
L
L
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
I
|
I
Y
 
Y
D
 
E
E
 
H
I
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
D
 
G
A
 
E
V
 
H
F
 
F
Q
 
S
P
 
P
L
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
P
E
 
E
V
 
-
P
 
H
C
 
T
L
 
L
S
 
T
F
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
A
S
 
A
K
|
K
V
 
A
H
 
F
R
 
A
A
 
M
C
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
 
R
V
 
I
G
 
G
W
 
Y
M
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
A
A
 
C
G
 
G
S
 
P
A
 
K
S
 
E
Y
 
V
R
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
A
L
 
S
L
 
V
A
 
S
A
 
S
L
 
Q
R
 
S
L
 
T
C
 
T
A
 
S
-
 
P
N
 
D
V
 
T
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
D
 
N
A
 
Q
P
 
E
T
 
A
I
 
S
G
 
R
A
 
A
L
 
F
T
 
V
T
 
E
P
 
M
G
 
A
G
 
R
R
 
E
L
 
A
H
 
Y
E
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
-
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
T
A
 
A
S
 
L
D
 
G
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
L
 
A
V