SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_027490520.1 NCBI__GCF_021560695.1:WP_027490520.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1p9lA Structure of m. Tuberculosis dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pdc (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:266/266 of query aligns to 1:244/245 of 1p9lA

query
sites
1p9lA
L
 
M
R
 
R
I
 
V
C
 
G
L
 
V
A
 
L
G
|
G
A
 
A
T
 
K
G
|
G
W
x
K
A
x
V
G
 
G
S
 
T
E
 
T
L
 
M
A
 
V
R
 
R
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
T
L
 
L
V
 
S
S
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
E
R
 
L
H
x
D
A
|
A
G
 
G
Q
 
D
K
 
P
L
 
L
G
 
S
D
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
L
E
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
N
C
 
T
D
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
x
V
A
 
V
K
 
M
A
 
G
N
 
N
I
 
L
L
 
E
A
 
F
A
 
L
L
 
I
E
 
D
H
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
A
A
 
E
D
 
R
Y
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
A
 
S
-
 
W
L
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
K
R
 
P
R
 
N
R
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
I
C
 
A
G
x
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
I
 
M
K
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
F
I
 
F
P
 
D
Q
 
S
W
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Y
 
L
A
x
H
S
x
H
A
 
P
G
 
H
K
|
K
P
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
V
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
T
A
 
A
T
 
K
R
 
L
M
 
I
G
 
A
K
 
E
V
 
A
R
 
R
Q
 
K
P
 
G
Q
 
L
L
 
P
E
 
P
V
 
N
P
 
P
L
 
D
E
 
A
Q
 
T
T
 
S
V
 
T
G
 
S
L
 
L
R
 
P
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
D
L
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
I
x
A
G
 
H
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
T
P
 
E
D
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
S
G
 
L
S
 
D
S
 
R
A
 
T
K
 
S
P
 
-
Y
x
F
V
 
V
D
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
R
V
 
I
S
 
A
M
 
E
L
 
R
T
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
T
R
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L

1c3vA Dihydrodipicolinate reductase from mycobacterium tuberculosis complexed with NADPH and pdc (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:266/266 of query aligns to 1:244/245 of 1c3vA

query
sites
1c3vA
L
 
M
R
 
R
I
 
V
C
 
G
L
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
T
x
K
G
|
G
W
x
K
A
x
V
G
 
G
S
 
T
E
 
T
L
 
M
A
 
V
R
 
R
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
T
L
 
L
V
 
S
S
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
E
R
 
L
H
x
D
A
|
A
G
 
G
Q
 
D
K
 
P
L
 
L
G
 
S
D
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
L
E
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
N
C
 
T
D
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
x
V
A
 
V
K
 
M
A
 
G
N
 
N
I
 
L
L
 
E
A
 
F
A
 
L
L
 
I
E
 
D
H
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
A
A
 
E
D
 
R
Y
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
A
 
S
-
 
W
L
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
K
R
 
P
R
 
N
R
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
I
C
 
A
G
x
P
N
|
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
I
 
M
K
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
F
I
 
F
P
 
D
Q
 
S
W
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Y
 
L
A
x
H
S
 
H
A
 
P
G
 
H
K
|
K
P
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
V
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
T
A
 
A
T
 
K
R
 
L
M
 
I
G
 
A
K
 
E
V
 
A
R
 
R
Q
 
K
P
 
G
Q
 
L
L
 
P
E
 
P
V
 
N
P
 
P
L
 
D
E
 
A
Q
 
T
T
 
S
V
 
T
G
 
S
L
 
L
R
 
P
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
D
L
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
I
x
A
G
 
H
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
T
P
 
E
D
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
S
G
 
L
S
 
D
S
 
R
A
 
T
K
 
S
P
 
-
Y
x
F
V
 
V
D
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
R
V
 
I
S
 
A
M
 
E
L
 
R
T
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
T
R
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L

5ugvA Dapb from mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:266/266 of query aligns to 2:245/245 of 5ugvA

query
sites
5ugvA
L
 
M
R
 
R
I
 
V
C
 
G
L
 
V
A
 
L
G
|
G
A
 
A
T
 
K
G
|
G
W
x
K
A
x
V
G
 
G
S
 
A
E
 
T
L
 
M
A
 
V
R
 
R
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
T
L
 
L
V
 
S
S
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
E
R
 
L
H
x
D
A
|
A
G
 
G
Q
 
D
K
 
P
L
 
L
G
 
S
D
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
L
E
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
N
C
 
T
D
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
x
V
A
 
V
K
 
M
A
 
G
N
 
N
I
 
L
L
 
E
A
 
F
A
 
L
L
 
I
E
 
D
H
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
A
A
 
E
D
 
R
Y
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
A
 
S
-
 
W
L
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
K
R
 
P
R
 
N
R
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
I
C
 
A
G
 
P
N
 
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
I
 
M
K
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
F
I
 
F
P
 
D
Q
 
S
W
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Y
 
L
A
 
H
S
 
H
A
 
P
G
 
H
K
 
K
P
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
T
A
 
A
T
 
K
R
 
L
M
 
I
G
 
A
K
 
E
V
 
A
R
 
R
Q
 
K
P
 
G
Q
 
L
L
 
P
E
 
P
V
 
N
P
 
P
L
 
D
E
 
A
Q
 
T
T
 
S
V
 
T
G
 
S
L
 
L
R
 
P
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
D
L
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
I
 
A
G
 
H
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
T
P
 
E
D
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
S
G
 
L
S
 
D
S
 
R
A
 
T
K
 
S
P
 
-
Y
 
F
V
 
V
D
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
R
V
 
I
S
 
A
M
 
E
L
 
R
T
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
T
R
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L

5tjzA Structure of 4-hydroxytetrahydrodipicolinate reductase from mycobacterium tuberculosis with NADPH and 2,6 pyridine dicarboxylic acid (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:266/266 of query aligns to 2:245/245 of 5tjzA

query
sites
5tjzA
L
 
M
R
 
R
I
 
V
C
 
G
L
 
V
A
 
L
G
|
G
A
 
A
T
 
K
G
|
G
W
x
K
A
x
V
G
 
G
S
 
A
E
 
T
L
 
M
A
 
V
R
 
R
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
T
L
 
L
V
 
S
S
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
E
R
 
L
H
x
D
A
|
A
G
 
G
Q
 
D
K
 
P
L
 
L
G
 
S
D
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
L
E
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
N
C
 
T
D
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
V
A
 
V
K
 
M
A
 
G
N
 
N
I
 
L
L
 
E
A
 
F
A
 
L
L
 
I
E
 
D
H
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
A
A
 
E
D
 
R
Y
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
A
 
S
-
 
W
L
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
K
R
 
P
R
 
N
R
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
I
C
 
A
G
x
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
I
 
M
K
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
F
I
 
F
P
 
D
Q
 
S
W
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Y
 
L
A
x
H
S
x
H
A
 
P
G
 
H
K
|
K
P
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
V
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
T
A
 
A
T
 
K
R
 
L
M
 
I
G
 
A
K
 
E
V
 
A
R
 
R
Q
 
K
P
 
G
Q
 
L
L
 
P
E
 
P
V
 
N
P
 
P
L
 
D
E
 
A
Q
 
T
T
 
S
V
 
T
G
 
S
L
 
L
R
 
P
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
D
L
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
I
x
A
G
 
H
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
T
P
 
E
D
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
S
G
 
L
S
 
D
S
 
R
A
 
T
K
 
S
P
 
-
Y
x
F
V
 
V
D
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
R
V
 
I
S
 
A
M
 
E
L
 
R
T
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
T
R
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L

P9WP23 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
34% identity, 99% coverage: 3:266/266 of query aligns to 1:244/245 of P9WP23

query
sites
P9WP23
L
 
M
R
 
R
I
 
V
C
 
G
L
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
T
x
K
G
 
G
W
x
K
A
x
V
G
 
G
S
 
A
E
 
T
L
 
M
A
 
V
R
 
R
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
T
L
 
L
V
 
S
S
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
E
R
 
L
H
x
D
A
 
A
G
 
G
Q
 
D
K
 
P
L
 
L
G
 
S
D
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
L
E
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
N
C
 
T
D
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
I
E
 
D
Y
 
F
T
 
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
V
A
 
V
K
 
M
A
 
G
N
 
N
I
 
L
L
 
E
A
 
F
A
 
L
L
 
I
E
 
D
H
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
A
A
 
E
D
 
R
Y
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
A
 
S
-
 
W
L
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
K
R
 
P
R
 
N
R
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
I
C
x
A
G
x
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
I
 
M
K
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
F
I
 
F
P
 
D
Q
 
S
W
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Y
 
L
A
 
H
S
 
H
A
 
P
G
 
H
K
|
K
P
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
T
A
 
A
T
 
K
R
 
L
M
 
I
G
 
A
K
 
E
V
 
A
R
 
R
Q
 
K
P
 
G
Q
 
L
L
 
P
E
 
P
V
 
N
P
 
P
L
 
D
E
 
A
Q
 
T
T
 
S
V
 
T
G
 
S
L
 
L
R
 
P
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
D
L
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
I
 
A
G
 
H
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
T
P
 
E
D
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
S
G
 
L
S
 
D
S
 
R
A
 
T
K
 
S
P
 
-
Y
 
F
V
 
V
D
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
R
V
 
I
S
 
A
M
 
E
L
 
R
T
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
T
R
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L

1yl5A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis dihydrodipicolinate reductase (rv2773c) (crystal form a) (see paper)
34% identity, 99% coverage: 4:266/266 of query aligns to 4:246/247 of 1yl5A

query
sites
1yl5A
R
 
R
I
 
V
C
 
G
L
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
G
W
 
K
A
 
V
G
 
G
S
 
A
E
 
T
L
 
M
A
 
V
R
 
R
G
 
A
I
x
V
A
|
A
A
 
A
A
|
A
D
 
D
D
 
D
L
|
L
V
 
T
L
 
L
V
 
S
S
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
E
R
 
L
H
 
D
A
 
A
G
 
G
Q
 
D
K
 
P
L
 
L
G
 
S
D
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
L
E
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
N
C
 
T
D
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
I
E
 
D
Y
 
F
T
 
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
V
A
 
V
K
 
M
A
 
G
N
 
N
I
 
L
L
 
E
A
 
F
A
 
L
L
 
I
E
 
D
H
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
A
A
 
E
D
 
R
Y
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
A
 
S
-
 
W
L
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
K
R
 
P
R
 
N
R
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
I
C
 
A
G
 
P
N
 
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
I
 
M
K
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
F
I
 
F
P
 
D
Q
 
S
W
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Y
 
L
A
x
H
S
 
H
A
 
P
G
 
H
K
|
K
P
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
T
A
 
A
T
 
K
R
 
L
M
 
I
G
 
A
K
 
E
V
 
A
R
 
R
Q
 
K
P
 
G
Q
 
L
L
 
P
E
 
P
V
 
N
P
 
P
L
 
D
E
 
A
Q
 
T
T
 
S
V
 
T
G
 
S
L
 
L
R
 
P
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
D
L
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
I
 
A
G
 
H
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
T
P
 
E
D
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
S
G
 
L
S
 
D
S
 
R
A
 
T
K
 
S
P
 
-
Y
 
F
V
 
V
D
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
R
V
 
I
S
 
A
M
 
E
L
 
R
T
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
T
R
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L

5z2fA NADPH/pda bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
28% identity, 99% coverage: 1:264/266 of query aligns to 1:265/265 of 5z2fA

query
sites
5z2fA
M
 
M
S
 
M
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
A
L
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
P
T
x
R
G
|
G
W
x
K
A
x
M
G
 
G
S
 
Q
E
 
E
L
 
A
A
 
V
R
 
H
G
 
T
I
 
V
A
 
M
A
 
N
A
 
N
D
 
E
D
 
N
L
 
M
V
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
A
 
V
V
 
L
A
x
D
R
x
H
R
x
K
H
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
D
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
D
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
A
G
 
S
L
 
Y
D
 
E
A
 
V
T
 
P
I
 
V
F
 
F
G
 
L
S
 
N
A
 
L
A
 
E
E
 
S
A
 
L
L
 
I
-
 
V
T
 
T
Q
 
I
A
 
K
C
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
L
E
 
D
Y
x
L
T
|
T
H
 
T
P
 
P
D
 
H
S
 
Q
A
 
V
K
 
F
A
 
E
N
 
H
I
 
T
L
 
M
A
 
L
A
 
C
L
 
L
E
 
Q
H
 
N
G
 
N
A
 
V
H
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
Y
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
D
 
T
A
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
V
R
 
N
R
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
C
L
 
I
A
 
V
C
 
A
G
x
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
M
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
A
L
 
Y
I
 
F
P
 
P
Q
 
D
W
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
E
Y
 
M
A
x
H
S
x
H
A
 
D
G
 
Q
K
|
K
P
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
V
 
A
R
 
Y
E
 
K
L
 
T
A
 
A
T
 
Q
R
 
M
M
 
I
G
 
A
K
 
E
V
 
V
R
 
R
Q
 
P
P
 
S
Q
 
H
L
 
K
E
 
Q
V
 
G
P
 
H
L
 
P
E
 
N
Q
 
E
T
 
K
V
 
E
G
 
T
L
 
L
R
 
E
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
S
L
 
Y
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
 
I
I
x
A
G
 
H
A
 
Q
E
 
Q
A
 
I
I
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
G
P
 
E
D
 
G
Q
 
Q
T
 
L
L
 
F
T
 
T
I
 
L
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
S
G
 
-
S
 
Y
S
 
N
A
 
R
K
 
Q
P
 
S
Y
 
F
V
 
M
D
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
T
L
 
F
A
 
S
I
 
I
R
 
N
K
 
Q
V
 
V
S
 
M
M
 
E
L
 
I
T
 
K
G
 
E
L
 
L
H
 
V
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
N
V
 
I
L
 
L

5z2eA Dipicolinate bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
28% identity, 99% coverage: 1:264/266 of query aligns to 1:265/265 of 5z2eA

query
sites
5z2eA
M
 
M
S
 
M
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
A
L
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
P
T
 
R
G
 
G
W
 
K
A
 
M
G
 
G
S
 
Q
E
 
E
L
 
A
A
 
V
R
 
H
G
 
T
I
 
V
A
 
M
A
 
N
A
 
N
D
 
E
D
 
N
L
 
M
V
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
A
 
V
V
 
L
A
 
D
R
 
H
R
 
K
H
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
D
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
D
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
A
G
 
S
L
 
Y
D
 
E
A
 
V
T
 
P
I
 
V
F
 
F
G
 
L
S
 
N
A
 
L
A
 
E
E
 
S
A
 
L
L
 
I
-
 
V
T
 
T
Q
 
I
A
 
K
C
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
L
E
 
D
Y
 
L
T
 
T
H
 
T
P
 
P
D
 
H
S
 
Q
A
 
V
K
 
F
A
 
E
N
 
H
I
 
T
L
 
M
A
 
L
A
 
C
L
 
L
E
 
Q
H
 
N
G
 
N
A
 
V
H
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
Y
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
D
 
T
A
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
V
R
 
N
R
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
C
L
 
I
A
 
V
C
 
A
G
 
P
N
 
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
M
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
A
L
 
Y
I
 
F
P
 
P
Q
 
D
W
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
E
Y
 
M
A
x
H
S
x
H
A
 
D
G
 
Q
K
|
K
P
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
V
 
A
R
 
Y
E
 
K
L
 
T
A
 
A
T
 
Q
R
 
M
M
 
I
G
 
A
K
 
E
V
 
V
R
 
R
Q
 
P
P
 
S
Q
 
H
L
 
K
E
 
Q
V
 
G
P
 
H
L
 
P
E
 
N
Q
 
E
T
 
K
V
 
E
G
 
T
L
 
L
R
 
E
E
 
G
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
S
L
 
Y
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
 
I
I
 
A
G
 
H
A
 
Q
E
 
Q
A
 
I
I
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
G
P
 
E
D
 
G
Q
 
Q
T
 
L
L
 
F
T
 
T
I
 
L
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
S
G
 
-
S
 
Y
S
 
N
A
 
R
K
 
Q
P
 
S
Y
 
F
V
 
M
D
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
T
L
 
F
A
 
S
I
 
I
R
 
N
K
 
Q
V
 
V
S
 
M
M
 
E
L
 
I
T
 
K
G
 
E
L
 
L
H
 
V
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
N
V
 
I
L
 
L

5wolA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase dapb from coxiella burnetii
32% identity, 99% coverage: 2:264/266 of query aligns to 1:230/230 of 5wolA

query
sites
5wolA
S
 
A
L
 
I
R
 
N
I
 
V
C
 
I
L
 
I
A
x
N
G
 
G
A
 
I
T
 
N
G
|
G
W
x
K
A
x
M
G
 
G
S
 
R
E
 
V
L
 
V
A
 
K
R
 
E
G
 
N
I
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
Q
D
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
G
V
 
T
A
x
G
R
|
R
R
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
Q
D
 
D
G
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
K
T
 
T
I
 
I
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
Q
T
 
T
Q
 
T
A
 
H
C
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
x
T
P
 
P
D
 
Q
S
|
S
A
 
V
K
 
F
A
 
H
N
 
N
I
 
A
L
 
E
A
 
I
A
 
I
L
 
I
E
 
Q
H
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
L
A
 
E
D
 
Q
Y
 
I
A
 
A
Q
 
L
I
 
L
D
 
D
A
 
K
L
 
Q
A
 
C
R
 
R
E
 
N
R
 
K
R
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
I
A
 
V
C
 
A
G
x
P
N
|
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
M
K
 
K
F
 
Y
A
 
A
E
 
K
M
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
H
L
 
Y
I
 
F
P
 
P
Q
 
D
W
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
E
Y
 
M
A
x
H
S
 
H
A
 
S
G
 
Q
K
|
K
P
 
I
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
|
T
V
 
A
R
 
I
E
x
K
L
 
T
A
 
A
T
 
Q
R
 
M
M
 
I
G
 
G
K
 
E
V
 
M
R
 
R
Q
 
S
P
 
S
Q
 
R
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
E
T
 
I
L
 
K
A
 
N
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
S
L
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
 
F
I
 
S
G
 
H
A
 
Q
E
 
S
A
 
V
I
 
I
F
 
F
G
 
G
M
 
S
P
 
N
D
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
N
 
D
A
 
-
G
 
G
S
 
M
S
 
D
A
 
R
K
 
N
P
 
C
Y
 
T
V
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
I
L
 
F
L
 
M
A
 
A
I
 
C
R
 
R
K
 
K
V
 
V
S
 
M
M
 
E
L
 
L
T
 
D
G
 
Y
L
 
L
H
 
V
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
N
V
 
L
L
 
L

5eesA Crystal structure of dapb in complex with NADP+ from corynebacterium glutamicum (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:266/266 of query aligns to 2:247/247 of 5eesA

query
sites
5eesA
L
 
I
R
 
K
I
 
V
C
 
G
L
 
V
A
 
L
G
|
G
A
 
A
T
 
K
G
|
G
W
x
R
A
x
V
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
L
 
I
A
 
V
R
 
A
G
 
A
I
 
V
A
 
N
A
 
E
A
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
A
 
E
V
 
I
A
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
-
G
|
G
L
x
V
D
 
D
A
 
D
T
 
D
I
 
L
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
S
E
 
L
A
 
L
L
 
V
T
 
D
Q
 
N
A
 
G
C
 
A
D
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
V
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
 
T
P
 
P
D
 
N
S
 
A
A
 
V
K
 
M
A
 
G
N
 
N
I
 
L
L
 
E
A
 
F
A
 
C
L
 
I
E
 
N
H
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
S
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
R
Y
 
L
A
 
E
Q
 
Q
I
 
V
-
 
R
D
 
D
A
 
W
L
 
L
A
 
E
R
 
G
E
 
K
R
 
D
R
 
N
R
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
C
 
A
G
x
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
T
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
T
I
 
M
K
 
V
F
 
F
A
 
S
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
F
I
 
F
P
 
E
Q
 
S
W
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Y
 
L
A
x
H
S
x
H
A
 
P
G
 
N
K
|
K
P
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
V
 
A
R
 
I
E
 
H
L
 
T
A
 
A
T
 
Q
R
 
G
M
 
I
G
 
A
K
 
A
V
 
A
R
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
M
-
 
D
-
 
A
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
D
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
A
L
 
T
E
 
E
Q
 
Q
T
 
A
V
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
E
E
 
G
T
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
S
L
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
M
P
 
S
G
 
G
F
 
M
V
 
V
I
 
A
G
 
H
A
 
E
E
 
Q
A
 
V
I
 
I
F
 
F
G
 
G
M
 
T
P
 
Q
D
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
Q
N
 
D
A
 
S
G
 
-
S
 
Y
S
 
D
A
 
R
K
 
N
P
 
S
Y
x
F
V
 
A
D
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
G
I
 
V
R
 
R
K
 
N
V
 
I
S
 
A
M
 
Q
L
 
H
T
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
V
R
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
H
V
 
Y
L
 
L
E
 
G
L
 
L

5eerA Crystal structure of dapb from corynebacterium glutamicum (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:266/266 of query aligns to 2:247/247 of 5eerA

query
sites
5eerA
L
 
I
R
 
K
I
 
V
C
 
G
L
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
G
W
 
R
A
 
V
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
L
 
I
A
 
V
R
 
A
G
 
A
I
 
V
A
 
N
A
 
E
A
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
A
 
E
V
 
I
A
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
G
L
 
V
D
 
D
A
 
D
T
 
D
I
 
L
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
S
E
 
L
A
 
L
L
 
V
T
 
D
Q
 
N
A
 
G
C
 
A
D
 
E
V
 
V
F
 
V
V
 
V
E
 
D
Y
 
F
T
 
T
H
 
T
P
 
P
D
 
N
S
 
A
A
 
V
K
 
M
A
 
G
N
 
N
I
 
L
L
 
E
A
 
F
A
 
C
L
 
I
E
 
N
H
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
S
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
R
Y
 
L
A
 
E
Q
 
Q
I
 
V
-
 
R
D
 
D
A
 
W
L
 
L
A
 
E
R
 
G
E
 
K
R
 
D
R
 
N
R
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
C
 
A
G
 
P
N
 
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
T
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
T
I
 
M
K
 
V
F
 
F
A
 
S
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
F
I
 
F
P
 
E
Q
 
S
W
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Y
 
L
A
x
H
S
x
H
A
 
P
G
 
N
K
|
K
P
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
V
 
A
R
 
I
E
 
H
L
 
T
A
 
A
T
 
Q
R
 
G
M
 
I
G
 
A
K
 
A
V
 
A
R
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
M
-
 
D
-
 
A
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
D
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
A
L
 
T
E
 
E
Q
 
Q
T
 
A
V
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
E
E
 
G
T
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
S
L
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
I
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
M
P
 
S
G
 
G
F
 
M
V
 
V
I
 
A
G
 
H
A
 
E
E
 
Q
A
 
V
I
 
I
F
 
F
G
 
G
M
 
T
P
 
Q
D
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
Q
N
 
D
A
 
S
G
 
-
S
 
Y
S
 
D
A
 
R
K
 
N
P
 
S
Y
 
F
V
 
A
D
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
G
I
 
V
R
 
R
K
 
N
V
 
I
S
 
A
M
 
Q
L
 
H
T
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
V
R
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
H
V
 
Y
L
 
L
E
 
G
L
 
L

5tejB Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
31% identity, 61% coverage: 3:164/266 of query aligns to 2:166/269 of 5tejB

query
sites
5tejB
L
 
V
R
 
R
I
 
I
C
 
A
L
 
V
A
 
A
G
|
G
A
 
A
T
 
A
G
|
G
W
x
R
A
x
M
G
 
G
S
 
R
E
 
N
L
 
L
A
 
V
R
 
K
G
 
A
I
 
-
A
 
A
A
 
H
A
 
H
D
 
N
D
 
P
L
 
V
V
 
A
L
 
K
V
 
V
S
 
A
A
 
A
V
 
G
A
 
S
R
x
E
R
|
R
H
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
S
-
 
L
A
 
V
G
 
G
Q
 
V
K
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
E
V
 
L
L
 
C
S
 
G
E
 
E
D
 
G
G
 
K
L
 
F
D
 
D
A
 
V
T
 
V
I
 
V
F
 
C
G
 
D
S
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
Q
L
 
I
T
 
D
Q
 
Q
A
 
-
C
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
I
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
 
A
P
 
P
D
 
A
S
|
S
A
 
T
K
 
L
A
 
N
N
 
N
I
 
L
L
 
A
A
 
L
A
 
C
L
 
Q
E
 
Q
H
 
Y
G
 
G
A
 
K
H
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
E
A
 
E
D
 
Q
Y
 
R
A
 
E
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
R
 
V
R
 
P
R
 
-
G
 
-
V
 
V
L
 
V
A
 
M
C
 
A
G
x
P
N
|
N
F
x
Y
A
 
S
L
 
V
T
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
V
I
 
F
K
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
M
P
 
G
Q
 
D
W
 
Y
-
 
C
-
 
D
-
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
V
D
 
E
Y
 
A
A
x
H
S
x
H
A
 
R
G
 
H
K
|
K
P
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T

Sites not aligning to the query:

5tejA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
31% identity, 61% coverage: 3:164/266 of query aligns to 2:166/269 of 5tejA

query
sites
5tejA
L
 
V
R
 
R
I
 
I
C
 
A
L
 
V
A
 
A
G
|
G
A
 
A
T
 
A
G
|
G
W
x
R
A
x
M
G
 
G
S
 
R
E
 
N
L
 
L
A
 
V
R
 
K
G
 
A
I
 
-
A
 
A
A
 
H
A
 
H
D
 
N
D
 
P
L
 
V
V
 
A
L
 
K
V
 
V
S
 
A
A
 
A
V
 
G
A
 
S
R
x
E
R
|
R
H
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
S
-
 
L
A
 
V
G
 
G
Q
 
V
K
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
E
V
 
L
L
 
C
S
 
G
E
 
E
D
 
G
G
 
K
L
 
F
D
 
D
A
 
V
T
 
V
I
 
V
F
 
C
G
 
D
S
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
Q
L
 
I
T
 
D
Q
 
Q
A
 
-
C
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
I
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
 
A
P
 
P
D
 
A
S
|
S
A
 
T
K
 
L
A
 
N
N
 
N
I
 
L
L
 
A
A
 
L
A
 
C
L
 
Q
E
 
Q
H
 
Y
G
 
G
A
 
K
H
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
E
A
 
E
D
 
Q
Y
 
R
A
 
E
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
R
 
V
R
 
P
R
 
-
G
 
-
V
 
V
L
 
V
A
 
M
C
 
A
G
x
P
N
 
N
F
 
Y
A
 
S
L
 
V
T
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
V
I
 
F
K
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
M
P
 
G
Q
 
D
W
 
Y
-
 
C
-
 
D
-
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
V
D
 
E
Y
 
A
A
x
H
S
 
H
A
 
R
G
 
H
K
|
K
P
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T

5temA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,6 pyridine dicarboxylic and nadh (see paper)
31% identity, 61% coverage: 3:164/266 of query aligns to 2:166/266 of 5temA

query
sites
5temA
L
 
V
R
 
R
I
 
I
C
 
A
L
 
V
A
 
A
G
|
G
A
 
A
T
 
A
G
|
G
W
x
R
A
x
M
G
 
G
S
 
R
E
 
N
L
 
L
A
 
V
R
 
K
G
 
A
I
 
-
A
 
A
A
 
H
A
 
H
D
 
N
D
 
P
L
 
V
V
 
A
L
 
K
V
 
V
S
 
A
A
 
A
V
 
G
A
 
S
R
x
E
R
|
R
H
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
S
-
 
L
A
 
V
G
 
G
Q
 
V
K
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
E
V
 
L
L
 
C
S
 
G
E
 
E
D
 
G
G
 
K
L
 
F
D
 
D
A
 
V
T
 
V
I
 
V
F
 
C
G
 
D
S
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
Q
L
 
I
T
 
D
Q
 
Q
A
 
-
C
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
I
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
 
A
P
 
P
D
 
A
S
|
S
A
 
T
K
 
L
A
 
N
N
 
N
I
 
L
L
 
A
A
 
L
A
 
C
L
 
Q
E
 
Q
H
 
Y
G
 
G
A
 
K
H
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
D
 
E
A
 
E
D
 
Q
Y
 
R
A
 
E
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
R
 
V
R
 
P
R
 
-
G
 
-
V
 
V
L
 
V
A
 
M
C
 
A
G
x
P
N
|
N
F
x
Y
A
 
S
L
 
V
T
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
V
I
 
F
K
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
M
P
 
G
Q
 
D
W
 
Y
-
 
C
-
 
D
-
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
V
D
 
E
Y
 
A
A
x
H
S
x
H
A
 
R
G
 
H
K
|
K
P
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T

Sites not aligning to the query:

1drvA Escherichia coli dhpr/acnadh complex (see paper)
28% identity, 97% coverage: 2:260/266 of query aligns to 2:258/270 of 1drvA

query
sites
1drvA
S
 
N
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
A
L
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
T
 
G
G
|
G
W
x
R
A
x
M
G
 
G
S
 
R
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
R
 
Q
G
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
E
D
 
G
L
 
V
V
 
Q
L
 
L
V
 
G
S
 
A
A
 
A
V
 
L
A
x
E
R
 
R
R
 
E
H
 
G
A
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
L
G
 
G
Q
 
S
K
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
-
L
 
L
S
 
A
E
 
G
D
 
A
G
 
G
L
 
K
D
 
T
A
 
G
T
 
V
I
 
T
F
 
V
G
 
Q
S
 
S
A
 
S
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
K
Q
 
D
A
 
D
C
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
x
R
P
 
P
D
 
E
S
x
G
A
 
T
K
 
L
A
 
N
N
 
H
I
 
L
L
 
A
A
 
F
A
 
C
L
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
K
H
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
D
 
E
A
 
A
D
 
G
Y
 
-
A
 
K
Q
 
Q
I
 
A
D
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
A
R
 
D
R
 
I
R
 
A
G
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
C
x
A
G
 
-
N
 
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
T
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
I
 
L
K
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
M
P
 
G
Q
 
D
W
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
E
Y
 
A
A
x
H
S
 
H
A
 
R
G
 
H
K
|
K
P
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
K
 
E
V
 
A
R
 
I
Q
 
A
P
 
H
Q
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
K
P
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
T
 
C
-
 
A
V
 
V
G
 
Y
L
 
S
R
 
R
E
 
E
T
 
G
R
 
H
G
 
T
G
 
G
T
 
E
-
 
R
L
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
Q
 
I
V
 
G
H
 
F
A
 
A
L
 
T
R
 
V
L
 
R
P
 
A
G
 
G
F
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
E
E
 
H
-
 
T
A
 
A
I
 
M
F
 
F
G
 
A
M
 
D
P
 
I
D
 
G
Q
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
N
 
K
A
 
A
G
 
-
S
 
S
S
 
S
A
x
R
K
 
M
P
 
T
Y
 
F
V
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
S
V
 
A
S
 
L
M
 
W
L
 
L
T
 
S
G
 
G
L
 
K
H
 
E
R
 
S
G
 
G
L
 
L

1druA Escherichia coli dhpr/nadh complex (see paper)
28% identity, 97% coverage: 2:260/266 of query aligns to 2:258/270 of 1druA

query
sites
1druA
S
 
N
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
A
L
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
T
 
G
G
|
G
W
x
R
A
x
M
G
 
G
S
 
R
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
R
 
Q
G
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
E
D
 
G
L
 
V
V
 
Q
L
 
L
V
 
G
S
 
A
A
 
A
V
 
L
A
x
E
R
|
R
R
 
E
H
 
G
A
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
L
G
 
G
Q
 
S
K
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
-
L
 
L
S
 
A
E
 
G
D
 
A
G
 
G
L
 
K
D
 
T
A
 
G
T
 
V
I
 
T
F
 
V
G
 
Q
S
 
S
A
 
S
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
K
Q
 
D
A
 
D
C
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
I
E
 
D
Y
x
F
T
|
T
H
x
R
P
 
P
D
 
E
S
x
G
A
 
T
K
 
L
A
 
N
N
 
H
I
 
L
L
 
A
A
 
F
A
 
C
L
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
K
H
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
D
 
E
A
 
A
D
 
G
Y
 
-
A
 
K
Q
 
Q
I
 
A
D
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
A
R
 
D
R
 
I
R
 
A
G
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
C
x
A
G
 
-
N
|
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
T
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
I
 
L
K
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
M
P
 
G
Q
 
D
W
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
E
Y
 
A
A
x
H
S
 
H
A
 
R
G
 
H
K
|
K
P
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
K
 
E
V
 
A
R
 
I
Q
 
A
P
 
H
Q
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
K
P
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
T
 
C
-
 
A
V
 
V
G
 
Y
L
 
S
R
 
R
E
 
E
T
 
G
R
 
H
G
 
T
G
 
G
T
 
E
-
 
R
L
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
Q
 
I
V
 
G
H
 
F
A
 
A
L
 
T
R
 
V
L
 
R
P
 
A
G
 
G
F
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
E
E
 
H
-
 
T
A
 
A
I
 
M
F
 
F
G
 
A
M
 
D
P
 
I
D
 
G
Q
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
N
 
K
A
 
A
G
 
-
S
 
S
S
 
S
A
 
R
K
 
M
P
 
T
Y
x
F
V
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
S
V
 
A
S
 
L
M
 
W
L
 
L
T
 
S
G
 
G
L
 
K
H
 
E
R
 
S
G
 
G
L
 
L

1arzA Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
28% identity, 97% coverage: 2:260/266 of query aligns to 2:258/270 of 1arzA

query
sites
1arzA
S
 
N
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
A
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
G
G
 
G
W
 
R
A
 
M
G
 
G
S
 
R
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
R
 
Q
G
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
E
D
 
G
L
 
V
V
 
Q
L
 
L
V
 
G
S
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
E
R
 
R
R
 
E
H
 
G
A
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
L
G
 
G
Q
 
S
K
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
-
L
 
L
S
 
A
E
 
G
D
 
A
G
 
G
L
 
K
D
 
T
A
 
G
T
 
V
I
 
T
F
 
V
G
 
Q
S
 
S
A
 
S
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
K
Q
 
D
A
 
D
C
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
I
E
 
D
Y
 
F
T
 
T
H
 
R
P
 
P
D
 
E
S
 
G
A
 
T
K
 
L
A
 
N
N
 
H
I
 
L
L
 
A
A
 
F
A
 
C
L
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
K
H
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
D
 
E
A
 
A
D
 
G
Y
 
-
A
 
K
Q
 
Q
I
 
A
D
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
A
R
 
D
R
 
I
R
 
A
G
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
C
 
A
G
 
-
N
 
N
F
 
F
A
 
S
L
 
V
T
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
I
 
L
K
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
V
I
 
M
P
 
G
Q
 
D
W
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
E
Y
 
A
A
x
H
S
x
H
A
 
R
G
 
H
K
|
K
P
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
K
 
E
V
 
A
R
 
I
Q
 
A
P
 
H
Q
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
K
P
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
T
 
C
-
 
A
V
 
V
G
 
Y
L
 
S
R
 
R
E
 
E
T
 
G
R
 
H
G
 
T
G
 
G
T
 
E
-
 
R
L
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
Q
 
I
V
 
G
H
 
F
A
 
A
L
 
T
R
 
V
L
 
R
P
 
A
G
 
G
F
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
E
E
 
H
-
 
T
A
 
A
I
 
M
F
 
F
G
 
A
M
 
D
P
 
I
D
 
G
Q
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
N
 
K
A
 
A
G
 
-
S
 
S
S
 
S
A
 
R
K
 
M
P
 
T
Y
 
F
V
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
S
V
 
A
S
 
L
M
 
W
L
 
L
T
 
S
G
 
G