SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_027722988.1 NCBI__GCF_000425265.1:WP_027722988.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
27% identity, 95% coverage: 5:282/294 of query aligns to 2:284/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
L
 
L
W
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
I
A
 
S
D
 
V
S
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
K
E
 
H
I
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
A
Y
 
V
H
 
G
A
 
V
G
 
S
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
K
A
 
S
F
 
S
A
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
R
 
E
R
 
Y
A
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
S
T
 
K
R
 
E
G
 
N
L
 
V
N
 
D
L
 
T
E
 
R
S
 
G
V
 
I
S
 
V
V
 
K
D
 
D
K
 
E
D
 
K
H
 
K
A
 
H
T
 
T
G
 
G
F
 
I
V
 
V
E
 
F
A
 
V
K
 
Q
V
 
L
D
 
K
S
 
G
Q
 
A
G
 
S
V
 
P
A
 
S
H
 
F
Y
 
L
I
 
L
F
 
Y
P
 
-
D
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
W
 
Y
D
 
F
H
 
N
L
 
M
T
 
T
L
 
L
N
 
N
E
 
D
R
 
I
A
 
N
L
 
W
E
 
D
L
 
I
A
 
V
P
 
E
K
 
E
V
 
A
D
 
K
A
 
I
V
 
V
C
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
S
L
 
V
A
 
I
Q
 
L
R
 
A
S
 
R
E
 
N
K
 
P
S
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
T
I
 
V
S
 
M
I
 
K
F
 
V
L
 
I
D
 
K
N
 
K
A
 
I
P
 
K
Q
 
G
A
 
S
M
 
S
K
 
L
I
 
I
-
 
A
Y
 
F
D
 
D
M
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
Q
 
L
N
 
D
F
 
L
Y
 
W
N
 
R
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
M
I
 
I
N
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
E
R
 
E
S
 
S
L
 
I
Q
 
K
K
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
V
K
 
K
L
 
A
N
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
I
 
V
L
 
L
K
 
Y
V
 
L
L
 
E
H
 
N
E
 
Q
K
 
G
F
 
V
T
 
E
L
 
V
K
 
K
C
 
G
S
 
S
V
 
M
L
 
L
T
 
T
-
 
A
-
 
I
R
x
T
G
 
L
G
|
G
S
 
P
G
 
K
S
 
G
L
 
F
M
 
R
L
 
L
G
 
I
Q
 
K
N
 
N
K
 
E
E
 
T
I
 
V
E
 
V
N
 
D
S
 
V
G
 
P
I
 
S
Y
 
Y
V
 
N
D
x
V
K
 
N
I
 
P
T
 
L
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
T
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
I
-
 
L
-
 
K
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
C
 
L
T
 
D
L
 
L
E
 
L
S
 
K
I
 
L
S
 
G
K
 
K
H
 
F
A
 
A
N
 
N
E
 
L
L
 
V
A
|
A
A
 
A
Y
 
L
V
 
S
C
 
T
S
 
Q
C
 
K
K
 
R
G
 
G
A
 
A

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
27% identity, 95% coverage: 5:282/294 of query aligns to 1:283/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
L
 
L
W
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
I
A
 
S
D
 
V
S
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
K
E
 
H
I
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
A
Y
 
V
H
 
G
A
 
V
G
 
S
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
K
A
 
S
F
 
S
A
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
R
 
E
R
 
Y
A
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
S
T
 
K
R
 
E
G
 
N
L
 
V
N
 
D
L
 
T
E
 
R
S
 
G
V
 
I
S
 
V
V
 
K
D
 
D
K
 
E
D
 
K
H
 
K
A
 
H
T
 
T
G
 
G
F
 
I
V
 
V
E
 
F
A
 
V
K
 
Q
V
 
L
D
 
K
S
 
G
Q
 
A
G
 
S
V
 
P
A
 
S
H
 
F
Y
 
L
I
 
L
F
 
Y
P
 
-
D
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
W
 
Y
D
 
F
H
 
N
L
 
M
T
 
T
L
 
L
N
 
N
E
 
D
R
 
I
A
 
N
L
 
W
E
 
D
L
 
I
A
 
V
P
 
E
K
 
E
V
 
A
D
 
K
A
 
I
V
 
V
C
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
S
L
 
V
A
 
I
Q
 
L
R
 
A
S
 
R
E
 
N
K
 
P
S
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
T
I
 
V
S
 
M
I
 
K
F
 
V
L
 
I
D
 
K
N
 
K
A
 
I
P
 
K
Q
 
G
A
 
S
M
 
S
K
 
L
I
 
I
-
 
A
Y
 
F
D
 
D
M
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
Q
 
L
N
 
D
F
 
L
Y
 
W
N
 
R
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
M
I
 
I
N
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
E
R
 
E
S
 
S
L
 
I
Q
 
K
K
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
V
K
|
K
L
 
A
N
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
I
 
V
L
 
L
K
 
Y
V
 
L
L
 
E
H
 
N
E
 
Q
K
 
G
F
 
V
T
 
E
L
 
V
K
 
K
C
 
G
S
 
S
V
 
M
L
 
L
T
 
T
-
 
A
-
 
I
R
x
T
G
 
L
G
|
G
S
 
P
G
 
K
S
 
G
L
 
F
M
 
R
L
 
L
G
 
I
Q
 
K
N
 
N
K
 
E
E
 
T
I
 
V
E
 
V
N
 
D
S
 
V
G
 
P
I
 
S
Y
 
Y
V
 
N
D
x
V
K
 
N
I
x
P
T
 
L
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
T
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
I
-
 
L
-
 
K
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
C
 
L
T
 
D
L
 
L
E
 
L
S
 
K
I
 
L
S
 
G
K
 
K
H
 
F
A
 
A
N
 
N
E
 
L
L
 
V
A
|
A
A
 
A
Y
 
L
V
 
S
C
 
T
S
 
Q
C
 
K
K
 
R
G
 
G
A
 
A

6ilsB Structure of arabidopsis thaliana ribokinase complexed with ribose and atp (see paper)
26% identity, 92% coverage: 24:294/294 of query aligns to 39:307/313 of 6ilsB

query
sites
6ilsB
G
 
G
G
|
G
A
x
K
P
 
G
V
 
A
N
|
N
F
 
Q
A
 
A
Y
 
A
H
 
C
A
 
G
G
 
A
A
 
K
L
 
L
G
 
M
A
 
Y
E
 
P
A
 
T
F
 
Y
A
 
F
I
 
V
S
 
G
T
 
R
I
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
A
R
 
H
G
 
G
R
 
K
R
 
L
A
 
-
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
C
G
 
G
L
 
V
N
 
H
L
 
L
E
 
D
S
 
Y
V
 
V
S
 
R
V
 
S
D
 
V
K
 
N
D
 
N
H
 
E
A
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
H
V
 
A
E
 
V
A
 
V
K
 
M
V
 
L
D
 
Q
S
 
S
Q
 
D
G
 
G
V
 
Q
A
 
N
H
 
S
Y
 
I
I
 
I
F
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
G
P
 
A
D
 
N
D
 
M
I
 
K
A
 
A
W
 
W
D
 
P
H
 
E
L
 
I
T
 
-
L
 
M
N
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
V
P
 
R
K
 
N
V
 
A
D
 
G
A
 
I
V
 
V
C
 
L
F
 
L
G
 
Q
T
 
R
L
x
E
A
 
I
Q
 
P
R
 
D
S
 
S
E
 
I
K
 
N
S
 
I
R
 
Q
A
 
V
A
 
A
I
 
K
S
 
A
I
 
V
F
 
K
L
 
K
D
 
A
N
 
G
A
 
V
P
 
P
Q
 
V
A
 
I
M
 
L
K
 
D
I
 
V
Y
 
G
D
 
G
M
 
M
N
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
-
Y
 
-
N
 
-
E
 
T
E
 
P
I
 
I
I
 
P
N
 
N
R
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
D
K
 
S
A
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
K
 
S
L
 
P
N
|
N
D
 
E
D
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
S
V
 
R
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
M
F
 
P
G
 
T
L
 
E
N
 
T
G
 
F
D
 
E
E
 
Q
K
 
I
S
 
S
I
 
Q
L
 
A
K
 
V
V
 
A
L
 
K
H
 
C
E
 
H
K
 
K
F
 
L
T
 
G
L
 
V
K
 
K
C
 
Q
S
 
V
V
 
L
L
 
V
T
x
K
R
 
L
G
|
G
G
 
S
S
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
A
M
 
L
L
 
F
G
 
I
Q
 
Q
N
 
G
-
 
E
K
 
K
E
 
P
I
 
I
E
 
Q
N
 
Q
S
 
S
G
 
I
I
|
I
Y
 
P
V
x
A
D
 
A
K
 
Q
I
 
V
T
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
|
F
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
M
L
 
V
Q
 
E
G
 
G
C
 
K
T
 
S
L
 
H
E
 
E
S
 
E
I
 
C
S
 
L
K
 
R
H
 
F
A
 
A
N
 
A
E
 
A
L
 
A
A
|
A
A
x
S
Y
 
L
V
 
C
C
 
V
S
 
Q
C
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
I
P
 
P
P
 
S
V
 
M
P
 
P
D
 
D
R
 
R
Y
 
K
T
 
S
L
 
V
I
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
25% identity, 96% coverage: 10:292/294 of query aligns to 8:301/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
G
 
G
E
x
D
I
 
A
L
 
V
W
 
V
D
|
D
V
 
L
L
 
I
A
 
P
D
 
D
S
 
G
E
 
Q
E
 
Q
-
 
H
-
 
Y
-
 
L
-
 
K
-
 
C
I
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
P
V
 
A
N
|
N
F
 
V
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
I
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
G
E
 
R
A
 
S
F
 
A
A
 
F
I
 
F
S
 
G
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
R
 
R
R
 
F
A
 
M
I
 
Q
A
 
Q
E
 
T
L
 
L
L
 
T
T
 
D
R
 
E
G
 
Q
L
 
V
N
 
D
L
 
C
E
 
Q
S
 
H
V
 
L
S
 
H
V
 
F
D
 
D
K
 
P
D
 
V
H
 
H
A
 
R
T
 
T
G
 
S
F
 
T
V
 
V
E
 
V
A
 
V
K
 
D
V
 
L
D
 
D
S
 
E
Q
x
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
H
 
S
Y
x
F
I
 
T
F
|
F
P
 
M
D
 
V
D
 
K
I
 
P
A
 
S
W
 
A
D
 
D
H
 
Q
-
 
F
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
N
 
S
E
 
D
R
 
I
A
 
P
L
 
S
E
 
F
L
 
Q
A
 
K
P
 
G
K
 
E
V
 
W
D
 
L
A
 
H
V
 
V
C
 
C
F
 
S
G
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
R
 
Q
S
 
P
E
 
S
K
 
R
S
 
S
R
 
S
A
 
T
A
 
F
I
 
A
S
 
A
I
 
I
F
 
A
L
 
Q
D
 
M
N
 
K
A
 
E
P
 
V
Q
 
G
A
 
G
M
 
Y
K
 
V
I
 
S
Y
 
F
D
 
D
M
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
Q
 
E
N
 
E
F
 
V
Y
 
W
N
 
S
E
 
E
E
 
P
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
I
 
T
I
 
V
N
 
M
R
 
R
S
 
A
L
 
V
Q
 
G
K
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
V
K
 
K
L
 
F
N
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
V
 
F
V
 
L
A
 
T
S
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
G
L
 
T
N
 
Q
G
 
S
D
 
I
E
 
E
K
 
E
S
 
G
I
 
L
L
 
Q
K
 
A
V
 
I
L
 
-
H
 
-
E
 
A
K
 
D
F
 
F
T
 
Q
L
 
I
K
 
P
C
 
L
S
 
V
V
 
V
L
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
x
A
S
 
K
G
 
G
S
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
A
G
 
T
Q
 
P
N
 
N
K
 
S
E
 
Q
I
 
Q
E
 
I
N
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
K
Y
x
A
V
|
V
D
 
K
K
 
P
I
 
I
T
 
-
D
 
D
T
|
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
T
 
V
A
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
Q
G
 
D
L
 
W
L
 
H
Q
 
N
G
 
Q
C
 
A
T
 
T
L
 
I
E
 
L
S
 
D
I
 
A
S
 
V
K
 
K
H
 
W
A
 
A
N
|
N
E
 
G
L
 
C
A
x
G
A
|
A
Y
 
L
V
 
A
C
 
T
S
 
T
C
 
Q
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
M
P
 
T
P
 
A
V
 
L
P
 
P
D
 
N
R
 
Q
Y
 
A
T
 
A
L
 
L

A1A6H3 Ribokinase; AtRBSK; RK; EC 2.7.1.15 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
26% identity, 92% coverage: 24:294/294 of query aligns to 105:373/379 of A1A6H3

query
sites
A1A6H3
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
V
 
A
N
 
N
F
 
Q
A
 
A
Y
 
A
H
 
C
A
 
G
G
 
A
A
 
K
L
 
L
G
 
M
A
 
Y
E
 
P
A
 
T
F
 
Y
A
 
F
I
 
V
S
 
G
T
 
R
I
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
A
R
 
H
G
 
G
R
 
K
R
 
-
A
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
C
G
 
G
L
 
V
N
 
H
L
 
L
E
 
D
S
 
Y
V
 
V
S
 
R
V
 
S
D
 
V
K
 
N
D
 
N
H
 
E
A
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
H
V
 
A
E
 
V
A
 
V
K
 
M
V
 
L
D
 
Q
S
 
S
Q
 
D
G
 
G
V
 
Q
A
 
N
H
 
S
Y
 
I
I
 
I
F
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
G
P
 
A
D
 
N
D
 
M
I
 
K
A
 
A
W
 
W
D
 
P
H
 
E
L
 
I
T
 
-
L
 
M
N
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
V
P
 
R
K
 
N
V
 
A
D
 
G
A
 
I
V
 
V
C
 
L
F
 
L
G
 
Q
T
 
R
L
 
E
A
 
I
Q
 
P
R
 
D
S
 
S
E
 
I
K
 
N
S
 
I
R
 
Q
A
 
V
A
 
A
I
 
K
S
 
A
I
 
V
F
 
K
L
 
K
D
 
A
N
 
G
A
 
V
P
 
P
Q
 
V
A
 
I
M
 
L
K
 
D
I
 
V
Y
 
G
D
 
G
M
 
M
N
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
-
Y
 
-
N
 
-
E
 
T
E
 
P
I
 
I
I
 
P
N
 
N
R
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
D
K
 
S
A
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
K
 
S
L
 
P
N
 
N
D
 
E
D
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
S
V
 
R
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
M
F
 
P
G
 
T
L
 
E
N
 
T
G
 
F
D
 
E
E
 
Q
K
 
I
S
 
S
I
 
Q
L
 
A
K
 
V
V
 
A
L
 
K
H
 
C
E
 
H
K
 
K
F
 
L
T
 
G
L
 
V
K
 
K
C
 
Q
S
 
V
V
 
L
L
 
V
T
 
K
R
 
L
G
 
G
G
 
S
S
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
A
M
 
L
L
 
F
G
 
I
Q
 
Q
-
 
G
N
 
E
K
 
K
E
 
P
I
 
I
E
 
Q
N
 
Q
S
 
S
G
 
I
I
 
I
Y
 
P
V
 
A
D
 
A
K
 
Q
I
 
V
T
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
T
F
 
F
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
M
L
 
V
Q
 
E
G
 
G
C
 
K
T
 
S
L
 
H
E
 
E
S
 
E
I
 
C
S
 
L
K
 
R
H
 
F
A
 
A
N
 
A
E
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
S
Y
 
L
V
 
C
C
 
V
S
 
Q
C
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
I
P
 
P
P
 
S
V
 
M
P
 
P
D
 
D
R
 
R
Y
 
K
T
 
S
L
 
V
I
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
25% identity, 96% coverage: 10:292/294 of query aligns to 12:305/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
G
 
G
E
x
D
I
 
A
L
 
V
W
 
V
D
|
D
V
 
L
L
 
I
A
 
P
D
 
D
S
 
G
E
 
Q
E
 
Q
-
 
H
-
 
Y
-
 
L
-
 
K
-
 
C
I
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
P
V
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
I
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
G
E
 
R
A
 
S
F
 
A
A
 
F
I
 
F
S
 
G
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
R
 
R
R
 
F
A
 
M
I
 
Q
A
 
Q
E
 
T
L
 
L
L
 
T
T
 
D
R
 
E
G
 
Q
L
 
V
N
 
D
L
 
C
E
 
Q
S
 
H
V
 
L
S
 
H
V
 
F
D
 
D
K
 
P
D
 
V
H
 
H
A
 
R
T
 
T
G
 
S
F
 
T
V
 
V
E
 
V
A
 
V
K
 
D
V
 
L
D
 
D
S
 
E
Q
 
C
G
 
G
V
 
E
A
 
R
H
 
S
Y
x
F
I
 
T
F
|
F
P
 
M
D
 
V
D
 
K
I
 
P
A
 
S
W
 
A
D
 
D
H
 
Q
-
 
F
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
N
 
S
E
 
D
R
 
I
A
 
P
L
 
S
E
 
F
L
 
Q
A
 
K
P
 
G
K
 
E
V
 
W
D
 
L
A
 
H
V
 
V
C
 
C
F
 
S
G
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
R
 
Q
S
 
P
E
 
S
K
 
R
S
 
S
R
 
S
A
 
T
A
 
F
I
 
A
S
 
A
I
 
I
F
 
A
L
 
Q
D
 
M
N
 
K
A
 
E
P
 
V
Q
 
G
A
 
G
M
 
Y
K
 
V
I
 
S
Y
 
F
D
 
D
M
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
Q
 
E
N
 
E
F
 
V
Y
 
W
N
 
S
E
 
E
E
 
P
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
I
 
T
I
 
V
N
 
M
R
 
R
S
 
A
L
 
V
Q
 
G
K
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
V
K
|
K
L
 
F
N
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
L
S
 
Q
V
 
F
V
 
L
A
 
T
S
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
G
L
 
T
N
 
Q
G
 
S
D
 
I
E
 
E
K
 
E
S
 
G
I
 
L
L
 
Q
K
 
A
V
 
I
L
 
-
H
 
-
E
 
A
K
 
D
F
 
F
T
 
Q
L
 
I
K
 
P
C
 
L
S
 
V
V
 
V
L
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
 
A
S
 
K
G
 
G
S
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
A
G
 
T
Q
 
P
N
 
N
K
 
S
E
 
Q
I
 
Q
E
 
I
N
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
K
Y
x
A
V
|
V
D
 
K
K
 
P
I
 
I
T
 
-
D
 
D
T
 
C
I
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
T
 
V
A
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
Q
G
 
D
L
 
W
L
 
H
Q
 
N
G
 
Q
C
 
A
T
 
T
L
 
I
E
 
L
S
 
D
I
 
A
S
 
V
K
 
K
H
 
W
A
 
A
N
|
N
E
 
G
L
 
C
A
x
G
A
|
A
Y
 
L
V
 
A
C
 
T
S
 
T
C
 
Q
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
M
P
 
T
P
 
A
V
 
L
P
 
P
D
 
N
R
 
Q
Y
 
A
T
 
A
L
 
L

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
26% identity, 92% coverage: 23:292/294 of query aligns to 32:297/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
I
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
E
V
 
V
N
|
N
F
 
V
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
L
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
K
A
 
V
F
 
G
A
 
F
I
 
V
S
 
G
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
M
A
 
V
I
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
L
 
R
T
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
T
S
 
H
V
 
F
S
 
R
V
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
R
A
 
A
T
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
T
-
 
G
-
 
L
-
x
Y
-
 
L
-
 
R
E
 
E
A
 
Y
K
 
L
V
 
P
D
 
L
S
 
G
Q
 
Q
G
 
G
V
 
R
A
 
V
H
 
F
Y
 
Y
-
 
Y
-
x
R
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
A
I
 
L
F
 
A
P
 
P
D
 
G
D
 
A
I
 
F
A
 
D
W
 
P
D
 
D
H
 
Y
L
 
L
T
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
F
L
 
L
N
 
H
E
 
L
R
 
S
A
 
G
L
 
I
E
 
T
L
 
P
A
 
A
P
 
L
K
 
S
V
 
P
D
 
E
A
 
A
V
 
R
C
 
A
F
 
F
G
 
-
T
 
S
L
 
L
A
 
W
Q
 
A
R
 
M
S
 
E
E
 
E
K
 
A
S
 
K
R
 
R
A
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
R
I
 
V
F
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
-
I
 
-
Y
 
-
D
 
-
M
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
|
R
Q
 
Q
N
 
T
F
 
L
Y
 
W
N
 
S
E
 
P
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
G
I
 
F
I
 
L
N
 
E
R
 
R
S
 
A
L
 
L
Q
 
P
K
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
L
K
 
F
L
 
L
N
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
L
V
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
L
N
 
F
G
 
G
D
 
R
E
 
V
K
 
E
S
 
E
I
 
A
L
 
L
K
 
R
V
 
A
L
 
L
H
 
-
E
 
-
K
 
-
F
 
-
T
 
S
L
 
A
K
 
P
C
 
E
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
G
x
A
S
 
K
G
 
G
S
 
A
L
 
W
M
 
A
L
 
F
G
 
V
Q
 
D
N
 
G
K
 
R
E
 
R
I
 
V
E
 
E
N
 
G
S
 
S
G
 
A
I
 
F
Y
 
A
V
 
V
D
 
E
K
 
A
I
 
V
T
 
-
D
 
D
T
 
P
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
Y
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
V
Q
 
W
G
 
G
C
 
L
T
 
P
L
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
R
S
 
L
K
 
R
H
 
L
A
 
A
N
|
N
E
 
L
L
 
L
A
 
G
A
|
A
Y
 
S
V
 
V
C
 
A
S
 
A
C
 
S
K
 
R
G
 
G
A
x
D
M
 
H
P
 
E
P
 
G
V
 
A
P
 
P
D
 
Y
R
 
R
Y
 
E
T
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
26% identity, 92% coverage: 23:292/294 of query aligns to 32:297/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
E
V
 
V
N
 
N
F
 
V
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
L
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
K
A
 
V
F
 
G
A
 
F
I
 
V
S
 
G
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
M
A
 
V
I
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
L
 
R
T
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
T
S
 
H
V
 
F
S
 
R
V
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
R
A
 
A
T
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
L
-
 
R
E
 
E
A
 
Y
K
 
L
V
 
P
D
 
L
S
 
G
Q
 
Q
G
 
G
V
 
R
A
 
V
H
 
F
Y
 
Y
-
 
Y
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
A
I
 
L
F
 
A
P
 
P
D
 
G
D
 
A
I
 
F
A
 
D
W
 
P
D
 
D
H
 
Y
L
 
L
T
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
F
L
 
L
N
 
H
E
 
L
R
 
S
A
 
G
L
 
I
E
 
T
L
 
P
A
 
A
P
 
L
K
 
S
V
 
P
D
 
E
A
 
A
V
 
R
C
 
A
F
 
F
G
 
-
T
 
S
L
 
L
A
 
W
Q
 
A
R
 
M
S
 
E
E
 
E
K
 
A
S
 
K
R
 
R
A
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
R
I
 
V
F
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
-
I
 
-
Y
 
-
D
 
-
M
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
N
 
T
F
 
L
Y
 
W
N
 
S
E
 
P
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
G
I
 
F
I
 
L
N
 
E
R
 
R
S
 
A
L
 
L
Q
 
P
K
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
L
K
 
F
L
 
L
N
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
L
V
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
L
N
 
F
G
 
G
D
 
R
E
 
V
K
 
E
S
 
E
I
 
A
L
 
L
K
 
R
V
 
A
L
 
L
H
 
-
E
 
-
K
 
-
F
 
-
T
 
S
L
 
A
K
 
P
C
 
E
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
G
 
A
S
 
K
G
 
G
S
 
A
L
 
W
M
 
A
L
 
F
G
 
V
Q
 
D
N
 
G
K
 
R
E
 
R
I
 
V
E
 
E
N
 
G
S
 
S
G
x
A
I
x
F
Y
 
A
V
|
V
D
 
E
K
 
A
I
 
V
T
 
-
D
 
D
T
 
P
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
Y
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
V
Q
 
W
G
 
G
C
 
L
T
 
P
L
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
R
S
 
L
K
 
R
H
 
L
A
 
A
N
|
N
E
 
L
L
 
L
A
 
G
A
|
A
Y
 
S
V
 
V
C
 
A
S
 
A
C
 
S
K
 
R
G
 
G
A
 
D
M
 
H
P
 
E
P
 
G
V
 
A
P
 
P
D
 
Y
R
 
R
Y
 
E
T
 
D
L
 
L

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
26% identity, 92% coverage: 23:292/294 of query aligns to 32:297/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
I
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
x
E
V
|
V
N
|
N
F
 
V
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
L
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
K
A
 
V
F
 
G
A
 
F
I
 
V
S
 
G
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
M
A
 
V
I
 
E
A
 
E
E
 
R
L
 
L
L
 
R
T
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
T
S
 
H
V
 
F
S
 
R
V
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
R
A
 
A
T
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
L
-
 
R
E
 
E
A
 
Y
K
 
L
V
 
P
D
 
L
S
 
G
Q
 
Q
G
 
G
V
 
R
A
 
V
H
 
F
Y
|
Y
-
x
Y
-
x
R
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
A
I
 
L
F
 
A
P
 
P
D
 
G
D
 
A
I
 
F
A
 
D
W
 
P
D
 
D
H
 
Y
L
 
L
T
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
F
L
 
L
N
 
H
E
 
L
R
 
S
A
 
G
L
 
I
E
 
T
L
 
P
A
 
A
P
 
L
K
 
S
V
 
P
D
 
E
A
 
A
V
 
R
C
 
A
F
 
F
G
 
-
T
 
S
L
 
L
A
 
W
Q
 
A
R
 
M
S
 
E
E
 
E
K
 
A
S
 
K
R
 
R
A
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
R
I
 
V
F
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
-
I
 
-
Y
 
-
D
 
-
M
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
|
R
Q
 
Q
N
 
T
F
 
L
Y
 
W
N
 
S
E
 
P
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
G
I
 
F
I
 
L
N
 
E
R
 
R
S
 
A
L
 
L
Q
 
P
K
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
L
K
 
F
L
 
L
N
x
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
L
V
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
L
N
 
F
G
 
G
D
 
R
E
 
V
K
 
E
S
 
E
I
 
A
L
 
L
K
 
R
V
 
A
L
 
L
H
 
-
E
 
-
K
 
-
F
 
-
T
 
S
L
 
A
K
 
P
C
 
E
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
x
K
R
|
R
G
|
G
G
x
A
S
x
K
G
|
G
S
x
A
L
 
W
M
 
A
L
 
F
G
 
V
Q
 
D
N
 
G
K
 
R
E
 
R
I
 
V
E
 
E
N
 
G
S
 
S
G
 
A
I
 
F
Y
 
A
V
 
V
D
 
E
K
 
A
I
 
V
T
 
-
D
 
D
T
 
P
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
Y
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
V
Q
 
W
G
 
G
C
 
L
T
 
P
L
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
R
S
 
L
K
 
R
H
 
L
A
 
A
N
|
N
E
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Y
 
S
V
 
V
C
 
A
S
 
A
C
 
S
K
 
R
G
 
G
A
x
D
M
 
H
P
 
E
P
 
G
V
 
A
P
 
P
D
 
Y
R
 
R
Y
 
E
T
 
D
L
 
L

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
24% identity, 90% coverage: 24:289/294 of query aligns to 30:302/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
G
 
G
G
|
G
A
 
A
P
 
S
V
 
A
N
 
N
F
 
V
A
 
G
Y
 
V
H
 
C
A
 
V
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
E
A
 
C
F
 
G
A
 
F
I
 
I
S
 
G
T
 
C
I
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
D
R
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
F
A
 
L
I
 
R
A
 
Q
E
 
V
L
 
F
L
 
Q
T
 
D
R
 
N
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
V
E
 
T
S
 
F
V
 
L
S
 
R
V
 
L
D
 
D
K
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
T
T
 
S
G
 
A
F
 
V
V
 
L
E
 
I
A
 
V
K
 
N
V
 
L
D
 
T
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
F
-
 
T
-
x
Y
V
 
L
A
 
V
H
 
H
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
T
Y
 
Y
I
 
V
F
 
S
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
P
-
 
P
-
 
F
-
 
R
-
 
Q
W
 
Y
D
 
E
H
 
W
L
 
F
T
 
Y
L
 
F
N
 
S
E
 
S
R
 
I
A
 
G
L
 
L
E
 
T
L
 
D
A
 
R
P
 
P
K
 
A
V
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
C
C
 
L
F
 
E
G
 
G
T
 
-
L
 
-
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
S
 
M
E
 
R
K
 
E
S
 
A
R
 
G
A
 
G
A
 
Y
I
 
V
S
 
-
I
 
-
F
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
-
I
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
Q
 
S
N
 
K
F
 
M
Y
 
W
N
 
G
E
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
P
E
 
E
I
 
L
I
 
I
N
 
A
R
 
R
S
 
S
L
x
A
Q
x
A
K
 
L
A
|
A
D
 
S
V
 
I
L
 
C
K
 
K
L
 
V
N
 
S
D
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
L
S
 
C
V
 
Q
V
 
L
A
 
S
S
 
G
M
 
A
F
 
S
G
 
H
L
 
W
N
 
Q
G
 
-
D
 
D
E
 
A
K
 
R
S
 
Y
I
 
Y
L
 
L
K
 
R
V
 
D
L
 
L
H
x
G
E
 
C
K
 
D
F
 
T
T
 
T
L
 
-
K
 
-
C
 
-
S
 
-
V
 
I
L
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
D
G
 
G
S
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
I
G
 
T
Q
 
A
N
 
E
K
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
H
N
 
F
S
 
P
G
 
A
I
 
P
Y
 
R
V
 
V
D
 
D
K
 
-
I
 
V
T
 
V
D
|
D
T
 
T
I
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
T
 
V
A
 
G
A
 
G
V
 
L
A
 
L
I
 
F
G
 
T
L
 
L
L
 
S
Q
 
R
G
 
A
C
 
N
T
 
C
L
 
W
-
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
-
H
 
N
A
 
A
N
 
N
E
 
A
L
 
C
A
 
G
A
 
A
Y
 
M
V
x
A
C
 
V
S
 
T
C
x
A
K
 
K
G
|
G
A
 
A
M
 
M
P
 
T
-
 
A
-
 
L
P
 
P
V
 
F
P
 
P
D
 
D
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
27% identity, 89% coverage: 24:285/294 of query aligns to 35:307/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
G
 
G
G
 
G
A
 
S
P
 
V
V
 
F
N
 
N
F
 
T
A
 
A
Y
 
I
H
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
P
A
 
T
F
 
G
A
 
F
I
 
F
S
 
S
T
 
G
I
 
I
G
 
S
D
 
S
D
 
D
E
 
F
R
 
F
G
 
G
R
 
D
R
 
V
A
 
L
I
 
R
A
 
D
E
 
T
L
 
L
L
 
A
T
 
R
R
 
S
G
 
N
L
 
V
N
 
D
L
 
Y
E
 
S
S
 
F
V
 
A
S
 
A
V
 
I
D
 
S
K
 
N
D
 
R
H
 
P
A
 
T
T
 
T
G
 
L
F
 
A
V
 
F
E
 
V
A
 
R
K
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
-
A
 
A
H
 
R
Y
 
Y
I
 
A
F
 
F
P
 
Y
D
 
D
D
 
E
-
 
N
I
 
T
A
 
A
W
 
G
D
 
R
H
 
M
L
 
L
T
 
S
L
 
R
N
 
N
E
 
D
R
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
M
P
 
P
K
 
Y
V
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
S
A
 
A
V
 
M
C
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
C
L
 
I
A
 
S
Q
 
L
R
 
I
S
 
S
E
 
E
K
 
P
S
 
C
R
 
G
A
 
S
A
 
V
I
 
Y
S
 
E
I
 
T
F
 
L
L
 
L
-
 
A
D
 
R
N
 
E
A
 
A
P
 
P
Q
 
N
A
 
R
M
 
V
K
 
M
I
 
F
Y
 
L
D
 
D
M
 
P
N
 
N
L
 
I
R
 
R
Q
 
A
N
 
N
F
 
L
Y
 
I
N
 
T
E
 
V
E
 
R
I
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
L
-
 
T
-
 
R
I
 
M
N
 
K
R
 
R
S
 
M
L
 
I
Q
 
A
K
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
V
K
 
K
L
 
L
N
 
S
D
 
D
D
 
E
E
 
D
I
 
L
S
 
D
V
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
W
F
 
F
G
 
G
L
 
E
N
 
K
G
 
G
D
 
S
E
 
H
K
 
D
S
 
E
I
 
I
L
 
-
K
 
A
V
 
A
L
 
E
H
 
W
E
 
L
K
 
K
F
 
L
T
 
G
L
 
P
K
 
K
C
 
L
S
 
V
V
 
V
L
 
I
T
|
T
R
 
K
G
|
G
G
x
A
S
 
H
G
|
G
S
 
A
L
 
V
M
 
A
L
 
Y
G
 
T
Q
 
N
N
 
H
K
 
A
E
 
T
I
 
V
E
 
P
N
 
V
S
 
P
G
 
G
I
 
V
Y
 
K
V
 
V
D
 
D
K
 
-
I
 
V
T
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
x
V
T
 
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
H
A
 
S
I
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
G
 
K
C
 
D
T
 
A
L
 
L
E
 
A
S
 
N
I
 
L
S
 
S
K
 
E
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
H
 
H
A
 
S
N
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
V
E
 
R
L
 
A
A
|
A
A
 
A
Y
 
V
V
 
T
C
 
V
S
 
S
C
 
R
K
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
N
P
 
P
P
 
P

1rk2A E. Coli ribokinase complexed with ribose and adp, solved in space group p212121 (see paper)
27% identity, 90% coverage: 24:289/294 of query aligns to 38:295/305 of 1rk2A

query
sites
1rk2A
G
|
G
G
|
G
A
x
K
P
 
G
V
 
A
N
|
N
F
 
Q
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
R
L
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
A
 
I
F
 
A
A
 
F
I
 
I
S
 
A
T
 
C
I
 
T
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
S
R
 
I
G
 
G
R
 
E
R
 
S
A
 
V
I
 
R
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
T
 
T
R
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
D
L
 
I
E
 
T
S
 
P
V
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
I
K
 
K
D
 
G
H
 
E
A
 
S
T
 
T
G
 
G
F
 
V
V
 
A
E
 
L
A
 
I
K
 
F
V
 
V
D
 
N
S
 
G
Q
 
E
G
 
G
V
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
I
 
-
F
 
-
P
 
-
D
 
E
D
 
N
I
 
V
A
 
I
W
 
G
D
 
I
H
 
H
L
 
A
T
 
G
L
 
A
N
 
N
E
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
K
 
A
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
C
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
V
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
E
E
 
R
K
 
I
S
 
A
R
 
N
A
 
A
A
 
S
I
 
A
S
 
L
I
 
L
F
 
M
L
 
Q
D
 
L
N
x
E
A
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
M
Q
 
A
A
 
A
M
 
A
K
 
K
I
 
I
Y
 
A
D
 
H
M
 
Q
N
 
N
L
 
K
R
 
T
Q
 
I
N
 
V
F
 
A
Y
 
L
N
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
A
E
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
P
N
 
D
R
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
A
K
 
L
A
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
I
K
 
T
L
 
P
N
 
N
D
 
E
D
 
T
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
K
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
I
F
 
R
G
 
V
L
 
E
N
 
N
G
 
D
-
 
E
D
 
D
E
 
A
K
 
A
S
 
K
I
 
A
L
 
A
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
H
 
H
E
 
E
K
 
K
F
 
-
T
x
G
L
 
I
K
x
R
C
 
T
S
 
V
V
 
L
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
x
S
S
 
R
G
 
G
S
 
-
L
 
V
M
 
W
L
 
A
G
 
S
Q
 
V
N
 
N
K
 
G
E
 
E
I
 
G
E
 
Q
N
 
R
S
 
V
G
 
P
I
 
G
Y
 
F
V
 
R
D
 
V
K
 
Q
I
 
A
T
 
V
D
|
D
T
 
T
I
 
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
 
F
T
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
I
I
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
G
 
E
C
 
K
T
 
P
L
 
L
E
 
P
S
 
E
I
 
A
S
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
N
x
H
E
 
A
L
 
A
A
|
A
A
 
A
Y
 
I
V
x
A
C
 
V
S
 
T
C
x
R
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
P
 
P
P
x
S
V
 
V
P
 
P
D
 
W
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4xckA Vibrio cholerae o395 ribokinase complexed with adp, ribose and cesium ion. (see paper)
25% identity, 90% coverage: 24:289/294 of query aligns to 38:295/306 of 4xckA

query
sites
4xckA
G
 
G
G
|
G
A
x
K
P
 
G
V
 
A
N
|
N
F
 
Q
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
R
L
 
M
G
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
V
F
 
G
A
 
F
I
 
I
S
 
A
T
 
C
I
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
S
R
 
F
G
 
G
R
 
I
R
 
N
A
 
I
I
 
R
A
 
E
E
 
S
L
 
F
L
 
K
T
 
L
R
 
D
G
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
T
E
 
A
S
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
D
 
Q
K
 
P
D
 
N
H
 
C
A
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
-
x
A
-
 
M
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
S
-
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
x
I
-
 
C
V
x
I
E
 
S
A
 
A
K
 
E
V
 
A
D
 
N
S
 
A
Q
 
K
G
 
L
V
 
T
A
 
A
H
 
A
Y
 
A
I
 
I
F
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
H
 
-
L
 
L
T
 
A
L
 
A
N
 
I
E
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
R
E
 
Y
L
 
L
A
 
L
P
 
M
K
 
Q
V
 
L
D
x
E
A
 
T
V
 
P
C
 
L
F
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
K
Q
 
A
R
 
A
S
 
Q
E
 
E
K
 
A
S
 
K
R
 
T
A
 
A
A
 
K
I
 
T
S
 
N
I
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
N
N
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
A
A
 
-
M
 
-
K
 
-
I
 
-
Y
 
-
D
 
-
M
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
-
Y
 
-
N
 
-
E
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
P
N
 
D
R
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
K
K
 
C
A
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
T
L
 
P
N
 
N
D
 
E
D
 
T
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
I
F
 
T
G
 
V
L
 
Y
N
 
D
-
 
D
G
 
S
D
 
S
E
 
A
K
 
Q
S
 
Q
I
 
A
L
 
A
K
 
D
V
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
C
K
 
K
F
 
-
T
 
G
L
 
I
K
 
E
C
 
I
S
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
x
S
S
 
K
G
 
G
S
 
-
L
 
V
M
 
W
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
N
 
N
K
 
G
E
 
R
I
 
G
E
 
Q
N
 
R
S
 
I
G
 
P
I
 
G
Y
 
F
V
 
V
D
x
V
K
 
K
I
 
A
T
 
T
D
 
D
T
|
T
I
x
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
|
F
T
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
V
I
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
G
 
E
C
 
M
T
 
P
L
 
L
E
 
E
S
 
S
I
 
A
S
 
I
K
 
K
H
 
F
A
 
A
N
x
H
E
 
A
L
 
A
A
|
A
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
C
x
V
S
 
T
C
 
R
K
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
P
 
T
P
 
S
V
 
I
P
 
P
D
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P0A9J6 Ribokinase; RK; EC 2.7.1.15 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
27% identity, 90% coverage: 24:289/294 of query aligns to 41:298/309 of P0A9J6

query
sites
P0A9J6
G
 
G
G
|
G
A
x
K
P
x
G
V
x
A
N
|
N
F
 
Q
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
R
L
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
A
 
I
F
 
A
A
 
F
I
 
I
S
 
A
T
 
C
I
 
T
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
S
R
 
I
G
 
G
R
 
E
R
 
S
A
 
V
I
 
R
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
T
 
T
R
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
D
L
 
I
E
 
T
S
 
P
V
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
I
K
 
K
D
 
G
H
 
E
A
 
S
T
 
T
G
 
G
F
 
V
V
 
A
E
 
L
A
 
I
K
 
F
V
 
V
D
 
N
S
 
G
Q
 
E
G
 
G
V
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
I
 
-
F
 
-
P
 
-
D
 
E
D
 
N
I
 
V
A
 
I
W
 
G
D
 
I
H
 
H
L
 
A
T
 
G
L
 
A
N
 
N
E
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
K
 
A
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
C
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
V
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
E
E
 
R
K
 
I
S
 
A
R
 
N
A
 
A
A
 
S
I
 
A
S
 
L
I
 
L
F
 
M
L
 
Q
D
 
L
N
x
E
A
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
M
Q
 
A
A
 
A
M
 
A
K
 
K
I
 
I
Y
 
A
D
 
H
M
 
Q
N
 
N
L
 
K
R
 
T
Q
 
I
N
 
V
F
 
A
Y
 
L
N
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
A
E
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
P
N
 
D
R
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
A
K
 
L
A
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
I
K
 
T
L
 
P
N
|
N
D
 
E
D
 
T
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
K
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
I
F
 
R
G
 
V
L
 
E
N
 
N
G
 
D
-
 
E
D
 
D
E
 
A
K
 
A
S
 
K
I
 
A
L
 
A
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
H
 
H
E
 
E
K
 
K
F
 
-
T
 
G
L
 
I
K
 
R
C
 
T
S
 
V
V
 
L
L
 
I
T
|
T
R
x
L
G
|
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
S
 
-
L
 
V
M
 
W
L
 
A
G
 
S
Q
 
V
N
 
N
K
 
G
E
 
E
I
 
G
E
 
Q
N
 
R
S
 
V
G
 
P
I
 
G
Y
 
F
V
 
R
D
 
V
K
 
Q
I
 
A
T
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
 
F
T
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
I
I
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
G
 
E
C
 
K
T
 
P
L
 
L
E
 
P
S
 
E
I
 
A
S
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
N
x
H
E
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
V
 
A
C
 
V
S
 
T
C
 
R
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
P
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
P
D
 
W
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1gqtB Activation of ribokinase by monovalent cations (see paper)
27% identity, 90% coverage: 24:289/294 of query aligns to 40:297/307 of 1gqtB

query
sites
1gqtB
G
 
G
G
|
G
A
 
K
P
 
G
V
 
A
N
|
N
F
 
Q
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
R
L
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
A
 
I
F
 
A
A
 
F
I
 
I
S
 
A
T
 
C
I
 
T
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
S
R
 
I
G
 
G
R
 
E
R
 
S
A
 
V
I
 
R
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
T
 
T
R
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
D
L
 
I
E
 
T
S
 
P
V
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
I
K
 
K
D
 
G
H
 
E
A
 
S
T
 
T
G
 
G
F
 
V
V
 
A
E
 
L
A
 
I
K
 
F
V
 
V
D
 
N
S
 
G
Q
 
E
G
 
G
V
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
I
 
-
F
 
-
P
 
-
D
 
E
D
 
N
I
 
V
A
 
I
W
 
G
D
 
I
H
 
H
L
 
A
T
 
G
L
 
A
N
 
N
E
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
K
 
A
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
C
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
V
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
E
E
 
R
K
 
I
S
 
A
R
 
N
A
 
A
A
 
S
I
 
A
S
 
L
I
 
L
F
 
M
L
 
Q
D
 
L
N
x
E
A
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
M
Q
 
A
A
 
A
M
 
A
K
 
K
I
 
I
Y
 
A
D
 
H
M
 
Q
N
 
N
L
 
K
R
 
T
Q
 
I
N
 
V
F
 
A
Y
 
L
N
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
A
E
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
P
N
 
D
R
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
A
K
 
L
A
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
I
K
 
T
L
 
P
N
|
N
D
 
E
D
 
T
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
K
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
I
F
 
R
G
 
V
L
 
E
N
 
N
G
 
D
-
 
E
D
 
D
E
 
A
K
 
A
S
 
K
I
 
A
L
 
A
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
H
 
H
E
 
E
K
 
K
F
 
-
T
 
G
L
 
I
K
 
R
C
 
T
S
 
V
V
 
L
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
x
S
S
 
R
G
 
G
S
 
-
L
 
V
M
 
W
L
 
A
G
 
S
Q
 
V
N
 
N
K
 
G
E
 
E
I
 
G
E
 
Q
N
 
R
S
 
V
G
 
P
I
 
G
Y
 
F
V
 
R
D
 
V
K
 
Q
I
 
A
T
 
V
D
|
D
T
 
T
I
|
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
 
F
T
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
I
I
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
G
 
E
C
 
K
T
 
P
L
 
L
E
 
P
S
 
E
I
 
A
S
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
N
x
H
E
 
A
L
 
A
A
|
A
A
 
A
Y
 
I
V
x
A
C
 
V
S
 
T
C
x
R
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
P
 
P
P
x
S
V
 
V
P
 
P
D
 
W
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
24% identity, 82% coverage: 9:250/294 of query aligns to 7:234/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
L
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
W
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
V
A
 
D
-
 
G
-
 
P
-
 
D
D
 
P
S
 
A
E
 
E
E
 
Y
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
P
 
P
V
 
L
N
 
N
F
 
V
A
 
A
Y
 
V
H
 
G
A
 
L
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
R
E
 
D
A
 
V
F
 
D
A
 
L
I
 
L
S
 
T
T
 
H
I
 
I
G
 
G
D
x
R
D
 
D
E
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
R
A
 
I
I
 
A
A
 
E
E
 
Y
L
 
I
L
 
E
T
 
S
R
 
S
G
 
G
L
 
V
N
 
Q
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
x
G
S
 
S
V
 
Q
D
 
T
K
 
A
D
 
D
H
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
R
V
 
T
D
 
P
S
 
T
Q
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
R
H
 
T
Y
 
Y
I
 
A
F
 
F
P
 
-
D
 
-
D
 
D
I
 
L
A
 
E
W
 
W
D
 
Q
H
 
I
L
 
P
T
 
D
L
 
T
N
 
P
E
 
P
R
 
V
A
 
A
L
 
P
E
 
P
L
 
L
A
 
L
P
 
-
K
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
V
C
 
H
F
 
T
G
 
G
T
 
S
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
R
 
A
S
 
R
E
 
E
K
 
P
S
 
G
R
 
C
A
 
L
A
 
A
I
 
V
S
 
A
I
 
A
F
 
L
L
 
L
D
 
D
N
 
A
A
 
Y
P
 
R
Q
 
A
A
 
A
M
 
A
K
 
T
I
 
V
-
 
S
Y
 
F
D
 
D
M
 
P
N
 
N
L
 
V
R
 
R
Q
 
P
N
 
S
F
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
D
Y
 
L
N
 
T
E
 
R
E
 
R
I
 
R
I
 
I
N
 
Q
R
 
R
S
 
L
L
 
V
Q
 
E
K
 
R
A
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
I
K
 
K
L
 
-
N
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
A
S
 
S
M
 
A
F
 
E
G
 
D
L
 
L
N
 
H
G
 
W
D
 
I
E
 
D
K
 
P
S
 
T
I
 
Q
L
 
P
K
 
P
V
 
E
L
 
Q
H
 
T
E
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
W
L
 
L
K
 
A
C
 
C
S
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
I
-
 
V
V
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
L
G
 
G
G
 
D
S
 
Q
G
 
G
S
 
A
L
 
V
M
 
A
L
 
F
G
 
C
Q
 
A
N
 
A
K
 
G
E
 
P
I
 
-
E
 
-
N
 
-
S
 
A
G
 
S
I
 
V
Y
 
P
V
 
A
D
 
Q
K
 
P
I
 
V
T
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
F
 
F
T
 
M
A
 
A

Q9H477 Ribokinase; RK; EC 2.7.1.15 from Homo sapiens (Human)
26% identity, 92% coverage: 23:292/294 of query aligns to 51:317/322 of Q9H477

query
sites
Q9H477
I
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
V
 
A
N
 
N
F
 
Q
A
 
C
Y
 
V
H
 
Q
A
 
A
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
M
A
 
T
F
 
S
A
 
M
I
 
V
S
 
C
T
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
K
D
 
D
E
 
S
R
 
F
G
 
G
R
 
N
R
 
D
A
 
Y
I
 
I
A
 
E
E
 
N
L
 
L
L
 
K
T
 
Q
R
 
N
G
 
D
L
 
I
N
 
S
L
 
T
E
 
E
S
 
F
V
 
T
S
 
Y
V
 
Q
D
 
T
K
 
K
D
 
D
H
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
T
V
 
A
E
 
S
A
 
I
K
 
I
V
 
V
D
 
N
S
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
Q
A
 
N
H
 
I
Y
 
I
I
 
V
F
 
I
P
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
V
A
 
A
W
 
G
D
 
A
H
 
N
L
 
L
T
 
L
L
 
L
N
 
N
E
 
T
R
 
E
A
 
D
L
 
L
E
 
R
L
 
A
A
 
A
P
 
A
K
 
N
V
 
V
D
 
I
A
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
M
V
 
V
C
 
C
-
 
Q
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
P
F
 
A
G
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
E
Q
 
A
R
 
L
S
 
T
E
 
M
K
 
A
S
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
G
I
 
V
S
 
K
I
 
T
F
 
L
L
 
F
D
 
N
N
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
A
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
M
 
L
N
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
P
N
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
N
 
T
E
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
L
A
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
F
K
 
C
L
 
C
N
|
N
D
 
E
D
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
I
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
L
-
 
T
F
 
V
G
 
G
L
 
S
N
 
A
G
 
A
D
 
D
E
 
A
K
 
G
S
 
E
I
 
A
L
 
A
K
 
L
V
 
V
L
 
L
H
 
L
E
 
K
K
 
R
F
 
-
T
 
G
L
 
C
K
 
Q
C
 
V
S
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
R
x
L
G
|
G
G
x
A
S
x
E
G
|
G
S
 
C
L
 
V
M
 
V
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
N
 
T
K
 
-
E
 
E
I
 
P
E
 
E
N
 
P
S
 
K
G
 
H
I
 
I
Y
 
P
V
x
T
D
 
E
K
 
K
I
 
V
-
 
K
-
 
A
T
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
F
T
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
F
G
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
L
 
Y
Q
 
P
G
 
N
C
 
L
T
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
M
S
 
L
K
 
N
H
 
R
A
 
S
N
|
N
E
 
F
L
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
V
V
 
S
C
 
V
S
 
Q
C
 
A
K
 
A
G
 
G
A
 
T
M
 
Q
P
 
S
P
 
S
V
 
Y
P
 
P
D
 
Y
R
 
K
Y
 
K
T
 
D
L
 
L

5byfA Crystal structure of human ribokinase in complex with amp
26% identity, 92% coverage: 23:292/294 of query aligns to 39:305/313 of 5byfA

query
sites
5byfA
I
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
V
 
A
N
 
N
F
 
Q
A
 
C
Y
 
V
H
 
Q
A
 
A
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
M
A
 
T
F
 
S
A
 
M
I
 
V
S
 
C
T
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
K
D
 
D
E
 
S
R
 
F
G
 
G
R
 
N
R
 
D
A
 
Y
I
 
I
A
 
E
E
 
N
L
 
L
L
 
K
T
 
Q
R
 
N
G
 
D
L
 
I
N
 
S
L
 
T
E
 
E
S
 
F
V
 
T
S
 
Y
V
 
Q
D
 
T
K
 
K
D
 
D
H
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
T
V
 
A
E
 
S
A
 
I
K
 
I
V
 
V
D
 
N
S
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
Q
A
 
N
H
 
I
Y
 
I
I
 
V
F
 
I
P
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
V
A
 
A
W
 
G
D
 
A
H
 
N
L
 
L
T
 
L
L
 
L
N
 
N
E
 
T
R
 
E
A
 
D
L
 
L
E
 
R
L
 
A
A
 
A
P
 
A
K
 
N
V
 
V
D
 
I
A
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
M
V
 
V
C
 
C
-
 
Q
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
P
F
 
A
G
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
E
Q
 
A
R
 
L
S
 
T
E
 
M
K
 
A
S
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
G
I
 
V
S
 
K
I
 
T
F
 
L
L
 
F
D
 
N
N
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
A
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
M
 
L
N
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
P
N
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
N
 
T
E
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
L
A
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
F
K
 
C
L
 
C
N
 
N
D
 
E
D
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
I
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
L
-
 
T
F
 
V
G
 
G
L
 
S
N
 
A
G
 
A
D
 
D
E
 
A
K
 
G
S
 
E
I
 
A
L
 
A
K
 
L
V
 
V
L
 
L
H
 
L
E
 
K
K
 
R
F
 
-
T
 
G
L
 
C
K
 
Q
C
 
V
S
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
x
A
S
 
E
G
|
G
S
 
C
L
 
V
M
 
V
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
N
 
T
K
 
-
E
 
E
I
 
P
E
 
E
N
 
P
S
 
K
G
 
H
I
 
I
Y
 
P
V
 
T
D
 
E
K
 
K
I
 
V
-
 
K
-
 
A
T
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
F
T
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
F
G
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
L
 
Y
Q
 
P
G
 
N
C
 
L
T
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
M
S
 
L
K
 
N
H
 
R
A
 
S
N
|
N
E
 
F
L
 
I
A
|
A
A
 
A
Y
 
V
V
 
S
C
 
V
S
 
Q
C
 
A
K
 
A
G
 
G
A
 
T
M
 
Q
P
 
S
P
 
S
V
 
Y
P
 
P
D
 
Y
R
 
K
Y
 
K
T
 
D
L
 
L

P0DX97 Deoxyribokinase; dRK; ATP:2-deoxy-D-ribose 5-phosphotransferase; EC 2.7.1.229 from Salmonella typhi (see paper)
24% identity, 90% coverage: 24:287/294 of query aligns to 37:293/306 of P0DX97

query
sites
P0DX97
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
V
 
A
N
 
N
F
 
Q
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
L
G
 
N
A
 
S
E
 
K
A
 
V
F
 
L
A
 
M
I
 
L
S
 
T
T
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
I
R
 
F
G
 
A
R
 
D
R
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
R
E
 
N
L
 
L
L
 
E
T
 
S
R
 
W
G
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
T
E
 
T
S
 
Y
V
 
V
S
 
E
V
 
K
D
 
V
K
 
P
D
 
C
H
 
T
A
 
S
T
 
S
G
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
I
F
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
A
K
 
N
V
 
S
D
 
S
S
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
L
-
 
I
-
 
I
Q
 
K
G
 
G
V
 
A
A
 
N
H
 
K
Y
 
F
I
 
L
F
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
D
I
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
A
A
 
A
W
 
E
D
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
C
H
 
Q
L
 
L
T
 
I
L
 
V
N
 
L
E
 
Q
R
 
L
A
 
E
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
E
P
 
T
K
 
V
V
 
Y
D
 
H
A
 
A
V
 
I
C
 
E
F
 
F
G
 
G
T
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
K
R
 
K
A
 
H
A
 
G
I
 
I
S
 
E
I
 
V
F
 
L
L
 
L
D
 
N
N
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
-
A
 
A
M
 
L
K
 
R
I
 
E
Y
 
L
D
 
D
M
 
M
N
 
S
L
 
Y
R
 
A
Q
 
C
N
 
-
F
 
-
Y
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
F
K
 
V
L
 
P
N
 
N
D
 
E
D
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
E
V
 
I
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
M
F
 
P
G
 
V
L
 
D
N
 
T
G
 
Y
D
 
D
E
 
H
-
 
I
K
 
R
S
 
A
I
 
A
L
 
A
K
 
R
V
 
S
L
 
L
H
 
V
E
 
D
K
 
K
F
 
-
T
 
G
L
 
L
K
 
N
C
 
N
S
 
I
V
 
I
L
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
E
S
 
K
G
 
G
S
 
A
L
 
L
M
 
W
L
 
M
G
 
T
Q
 
R
N
 
D
K
 
Q
E
 
E
I
 
V
E
 
H
N
 
V
S
 
P
G
 
A
I
 
F
Y
 
R
V
 
V
D
 
N
K
 
A
I
 
V
T
 
-
D
 
D
T
 
T
I
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
F
 
F
T
 
I
A
 
G
A
 
C
V
 
F
A
 
A
I
 
H
G
 
Y
L
 
Y
L
 
V
Q
 
Q
G
 
S
C
 
G
T
 
D
L
 
V
E
 
E
S
 
A
I
 
A
S
 
M
K
 
K
H
 
K
A
 
A
N
 
V
E
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
V
 
S
C
 
V
S
 
T
C
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
T
M
 
Q
P
 
S
P
 
S
V
 
Y
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5c3yA Structure of human ribokinase crystallized with amppnp
26% identity, 91% coverage: 24:292/294 of query aligns to 38:303/306 of 5c3yA

query
sites
5c3yA
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
V
 
A
N
 
N
F
 
Q
A
 
C
Y
 
V
H
 
Q
A
 
A
G
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
M
A
 
T
F
 
S
A
 
M
I
 
V
S
 
C
T
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
K
D
 
D
E
 
S
R
 
F
G
 
G
R
 
N
R
 
D
A
 
Y
I
 
I
A
 
E
E
 
N
L
 
L
L
 
K
T
 
Q
R
 
N
G
 
D
L
 
I
N
 
S
L
 
T
E
 
E
S
 
F
V
 
T
S
 
Y
V
 
Q
D
 
T
K
 
K
D
 
D
H
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
T
V
 
A
E
 
S
A
 
I
K
 
I
V
 
V
D
 
N
S
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
Q
A
 
N
H
 
I
Y
 
I
I
 
V
F
 
I
P
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
V
A
 
A
W
 
G
D
 
A
H
 
N
L
 
L
T
 
L
L
 
L
N
 
N
E
 
T
R
 
E
A
 
D
L
 
L
E
 
R
L
 
A
A
 
A
P
 
A
K
 
N
V
 
V
D
 
I
A
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
M
V
 
V
C
 
C
-
 
Q
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
P
F
 
A
G
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
E
Q
 
A
R
 
L
S
 
T
E
 
M
K
 
A
S
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
G
I
 
V
S
 
K
I
 
T
F
 
L
L
 
F
D
 
N
N
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
A
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
M
 
L
N
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
P
N
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
N
 
T
E
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
L
A
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
F
K
 
C
L
 
C
N
 
N
D
 
E
D
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
E
V
 
I
V
 
L
A
 
T
S
 
G
M
 
L
-
 
T
F
 
V
G
 
G
L
 
S
N
 
A
G
 
A
D
 
D
E
 
A
K
 
G
S
 
E
I
 
A
L
 
A
K
 
L
V
 
V
L
 
L
H
 
L
E
 
K
K
 
R
F
 
-
T
 
G
L
 
C
K
 
Q
C
 
V
S
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
 
A
S
 
E
G
 
G
S
 
C
L
 
V
M
 
V
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
N
 
T
K
 
-
E
 
E
I
 
P
E
 
E
N
 
P
S
 
K
G
 
H
I
 
I
Y
 
P
V
 
T
D
 
E
K
 
K
I
x
V
-
 
K
-
 
A
T
 
V
D
 
D
T
|
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
F
T
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
F
G
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
L
 
Y
Q
 
P
G
 
N
C
 
L
T
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
M
S
 
L
K
 
N
H
 
R
A
 
S
N
|
N
E
 
F
L
 
I
A
|
A
A
|
A
Y
 
V
V
 
S
C
 
V
S
 
Q
C
 
A
K
 
A
G
 
G
A
 
T
M
 
Q
P
 
S
P
 
S
V
 
Y
P
 
P
D
 
Y
R
 
K
Y
 
K
T
 
D
L
 
L

Query Sequence

>WP_027722988.1 NCBI__GCF_000425265.1:WP_027722988.1
MADFLIAGLGEILWDVLADSEEIGGAPVNFAYHAGALGAEAFAISTIGDDERGRRAIAEL
LTRGLNLESVSVDKDHATGFVEAKVDSQGVAHYIFPDDIAWDHLTLNERALELAPKVDAV
CFGTLAQRSEKSRAAISIFLDNAPQAMKIYDMNLRQNFYNEEIINRSLQKADVLKLNDDE
ISVVASMFGLNGDEKSILKVLHEKFTLKCSVLTRGGSGSLMLGQNKEIENSGIYVDKITD
TIGAGDSFTAAVAIGLLQGCTLESISKHANELAAYVCSCKGAMPPVPDRYTLIR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory