SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_028312930.1 NCBI__GCF_000482785.1:WP_028312930.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 3 hits to proteins with known functional sites (download)

1l7nA Transition state analogue of phosphoserine phosphatase (aluminum fluoride complex) (see paper)
20% identity, 90% coverage: 2:202/224 of query aligns to 2:181/209 of 1l7nA

query
sites
1l7nA
K
 
K
R
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
I
L
 
L
F
 
F
D
|
D
L
x
F
D
|
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
V
S
 
N
Y
 
N
D
 
E
S
 
T
G
 
I
A
 
D
D
 
E
L
 
I
L
 
A
R
 
R
F
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
V
V
 
E
D
 
E
R
 
E
Y
 
V
T
 
K
E
 
K
H
 
I
C
 
T
I
 
K
E
 
E
Y
 
A
V
 
M
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
N
L
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
S
N
 
L
R
 
R
E
 
K
Y
 
R
Y
 
V
A
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
K
R
 
D
Y
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
V
T
 
-
A
 
-
W
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
K
S
 
A
G
 
I
K
 
K
H
 
R
V
 
I
S
 
T
A
 
P
-
 
T
-
 
E
A
 
G
A
 
A
M
 
E
R
 
E
L
 
T
V
 
I
H
 
K
S
 
E
H
 
L
H
 
K
A
 
N
S
 
R
G
 
G
D
 
Y
L
 
V
C
 
V
C
 
A
L
 
V
V
 
V
T
x
S
A
x
G
T
 
G
S
 
F
E
 
D
F
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
N
A
 
K
Y
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
D
H
 
Y
M
 
A
V
 
F
A
 
A
T
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
I
M
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
P
 
K
Q
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
E
L
 
V
N
 
-
Y
 
L
R
 
K
E
 
E
G
 
-
K
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
N
V
 
A
R
x
K
D
 
G
W
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
-
 
I
-
 
A
G
 
K
L
 
I
D
 
E
W
 
G
S
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
E
E
 
D
S
 
T
V
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
F
 
A
N
|
N
D
|
D
L
 
I
P
 
S
L
 
M
L
 
F
E
 
K
Y
 
K
V
 
A
S
 
G
H
 
L
P
 
K
V
 
I
A
 
A

1f5sA Crystal structure of phosphoserine phosphatase from methanococcus jannaschii (see paper)
20% identity, 90% coverage: 2:202/224 of query aligns to 3:182/210 of 1f5sA

query
sites
1f5sA
K
 
K
R
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
I
L
 
L
F
 
F
D
|
D
L
x
F
D
|
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
V
S
 
N
Y
 
N
D
 
E
S
 
T
G
 
I
A
 
D
D
 
E
L
 
I
L
 
A
R
 
R
F
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
V
V
 
E
D
 
E
R
 
E
Y
 
V
T
 
K
E
 
K
H
 
I
C
 
T
I
 
K
E
 
E
Y
 
A
V
 
M
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
N
L
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
S
N
 
L
R
 
R
E
 
K
Y
 
R
Y
 
V
A
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
K
R
 
D
Y
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
V
T
 
-
A
 
-
W
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
K
S
 
A
G
 
I
K
 
K
H
 
R
V
 
I
S
 
T
A
 
P
-
 
T
-
 
E
A
 
G
A
 
A
M
 
E
R
 
E
L
 
T
V
 
I
H
 
K
S
 
E
H
 
L
H
 
K
A
 
N
S
 
R
G
 
G
D
 
Y
L
 
V
C
 
V
C
 
A
L
 
V
V
 
V
T
x
S
A
x
G
T
 
G
S
 
F
E
 
D
F
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
N
A
 
K
Y
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
D
H
 
Y
M
 
A
V
 
F
A
 
A
T
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
I
M
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
P
 
K
Q
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
E
L
 
V
N
 
-
Y
 
L
R
 
K
E
 
E
G
 
-
K
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
N
V
 
A
R
x
K
D
 
G
W
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
-
 
I
-
 
A
G
 
K
L
 
I
D
 
E
W
 
G
S
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
E
E
 
D
S
 
T
V
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
F
 
A
N
 
N
D
|
D
L
 
I
P
 
S
L
 
M
L
 
F
E
 
K
Y
 
K
V
 
A
S
 
G
H
 
L
P
 
K
V
 
I
A
 
A

Q58989 Phosphoserine phosphatase; PSP; PSPase; O-phosphoserine phosphohydrolase; EC 3.1.3.3 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see 3 papers)
20% identity, 90% coverage: 2:202/224 of query aligns to 4:183/211 of Q58989

query
sites
Q58989
K
 
K
R
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
I
L
 
L
F
 
F
D
|
D
L
 
F
D
|
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
V
S
 
N
Y
 
N
D
x
E
S
 
T
G
 
I
A
 
D
D
 
E
L
 
I
L
 
A
R
 
R
F
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
V
V
 
E
D
 
E
R
 
E
Y
 
V
T
 
K
E
 
K
H
 
I
C
 
T
I
 
K
E
 
E
Y
 
A
V
 
M
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
N
L
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
S
N
 
L
R
 
R
E
 
K
Y
x
R
Y
 
V
A
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
K
R
 
D
Y
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
V
T
 
-
A
 
-
W
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
K
S
 
A
G
 
I
K
 
K
H
 
R
V
 
I
S
 
T
A
 
P
-
 
T
-
 
E
A
 
G
A
 
A
M
 
E
R
 
E
L
 
T
V
 
I
H
 
K
S
 
E
H
 
L
H
 
K
A
 
N
S
 
R
G
 
G
D
 
Y
L
 
V
C
 
V
C
 
A
L
 
V
V
 
V
T
x
S
A
x
G
T
 
G
S
 
F
E
 
D
F
 
I
I
 
A
A
 
V
S
 
N
A
 
K
Y
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
D
H
 
Y
M
 
A
V
 
F
A
 
A
T
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
I
M
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
P
 
K
Q
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
E
L
 
V
N
 
-
Y
 
L
R
 
K
E
 
E
G
 
-
K
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
N
V
 
A
R
x
K
D
 
G
W
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
-
 
I
-
 
A
G
 
K
L
 
I
D
 
E
W
 
G
S
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
E
E
 
D
S
 
T
V
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
F
 
A
N
|
N
D
 
D
L
 
I
P
 
S
L
 
M
L
 
F
E
 
K
Y
 
K
V
 
A
S
 
G
H
 
L
P
 
K
V
 
I
A
 
A

Query Sequence

>WP_028312930.1 NCBI__GCF_000482785.1:WP_028312930.1
MKRRLALFDLDHTLISYDSGADLLRFLVARELVDAGFVDRYTEHCIEYVAGRVDLRQLNR
EYYALLMRYPVESLTAWRNEWREESGKHVSAAAMRLVHSHHASGDLCCLVTATSEFIASA
YREIFGFEHMVATRIAMAEGPQGSFISGEVEGLLNYREGKIANVRDWLLAQGLDWSSFDE
SVFYSDSFNDLPLLEYVSHPVAVTPDARLRAVAIERGWRILDLA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory