SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_028319820.1 NCBI__GCF_000422285.1:WP_028319820.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

6msoA Crystal structure of mitochondrial fumarate hydratase from leishmania major in a complex with inhibitor thiomalate (see paper)
30% identity, 98% coverage: 1:274/279 of query aligns to 39:324/540 of 6msoA

query
sites
6msoA
M
 
M
R
 
L
H
 
R
I
 
V
E
 
D
A
 
P
Q
 
A
A
 
A
V
 
L
T
 
T
E
 
L
A
 
L
V
 
S
K
 
S
A
 
T
A
 
A
V
 
F
V
 
D
K
 
D
A
 
V
N
 
E
Y
 
H
E
 
L
L
 
L
G
 
R
E
 
S
D
 
S
V
 
H
I
 
L
Q
 
M
S
 
S
F
 
L
E
 
R
K
 
K
A
 
I
R
 
F
I
 
D
D
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
A
S
 
S
P
 
D
V
 
N
G
 
D
R
 
K
E
 
F
I
 
V
L
 
A
E
 
L
R
 
Q
L
 
L
I
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
A
R
 
N
I
 
I
A
 
S
R
 
S
T
 
A
E
 
R
R
 
L
I
 
L
P
 
P
I
 
G
C
|
C
Q
|
Q
D
|
D
T
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
G
D
 
Y
V
 
R
G
 
G
Q
 
D
E
 
Q
V
 
V
V
 
F
V
 
V
S
 
P
N
 
-
G
 
G
G
 
N
F
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
S
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
G
 
I
Y
 
F
E
 
Q
E
 
K
G
 
R
Y
 
N
L
 
F
R
|
R
K
 
Y
S
 
S
V
 
Q
C
 
N
H
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
S
-
 
M
F
 
Y
T
 
D
R
 
E
K
 
K
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
T
N
 
N
T
 
L
P
 
P
V
 
A
I
 
Q
I
 
I
H
 
D
F
 
L
N
 
Y
L
 
A
V
 
S
K
 
K
G
 
G
S
 
M
G
 
E
I
 
Y
R
 
S
M
 
F
W
 
M
V
 
F
V
 
V
P
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
 
S
E
 
A
N
 
N
M
 
K
S
 
S
R
 
F
L
 
L
F
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
S
M
 
V
L
 
L
P
 
N
P
 
P
S
 
K
A
 
S
G
 
L
W
 
R
T
 
N
G
 
F
V
 
L
K
 
K
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
A
L
 
M
T
 
F
V
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
T
N
 
S
P
x
A
C
|
C
P
 
P
P
 
P
T
 
Y
I
 
H
V
 
V
G
 
A
V
 
V
G
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
T
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
S
 
S
A
 
A
L
 
E
M
 
M
A
 
T
K
 
M
R
 
K
S
 
-
L
 
V
L
 
L
R
 
K
P
 
Y
L
 
A
G
 
S
E
 
C
P
 
H
N
 
Y
P
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
L
L
 
I
A
 
T
R
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
E
M
 
L
E
 
E
Q
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
K
A
 
V
I
 
C
N
 
Q
R
 
N
T
 
I
G
 
G
V
 
M
G
 
G
P
 
A
Q
 
Q
G
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
T
 
Y
S
 
A
L
 
H
A
 
D
V
 
V
H
 
R
I
 
V
L
 
I
M
 
R
M
 
M
P
 
P
C
 
R
H
 
H
I
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
C
P
 
P
L
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
G
I
 
V
Q
 
S
C
|
C
H
 
S
A
|
A
S
 
D
R
 
R
H
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q4QAU9 Fumarate hydratase 1, mitochondrial; Fumarase 1; LmFH-1; EC 4.2.1.2 from Leishmania major (see paper)
30% identity, 98% coverage: 1:274/279 of query aligns to 48:333/549 of Q4QAU9

query
sites
Q4QAU9
M
 
M
R
 
L
H
 
R
I
 
V
E
 
D
A
 
P
Q
 
A
A
 
A
V
 
L
T
 
T
E
 
L
A
 
L
V
 
S
K
 
S
A
 
T
A
 
A
V
 
F
V
 
D
K
 
D
A
 
V
N
 
E
Y
 
H
E
 
L
L
 
L
G
 
R
E
 
S
D
 
S
V
 
H
I
 
L
Q
 
M
S
 
S
F
 
L
E
 
R
K
 
K
A
 
I
R
 
F
I
 
D
D
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
A
S
 
S
P
 
D
V
 
N
G
 
D
R
 
K
E
 
F
I
 
V
L
 
A
E
 
L
R
 
Q
L
 
L
I
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
A
R
 
N
I
 
I
A
 
S
R
 
S
T
 
A
E
 
R
R
 
L
I
 
L
P
 
P
I
 
G
C
|
C
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
A
A
 
G
D
 
Y
V
 
R
G
 
G
Q
 
D
E
 
Q
V
 
V
V
 
F
V
 
V
S
 
P
N
 
-
G
 
G
G
 
N
F
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
S
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
G
 
I
Y
 
F
E
 
Q
E
 
K
G
 
R
Y
 
N
L
 
F
R
 
R
K
 
Y
S
 
S
V
 
Q
C
 
N
H
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
S
-
 
M
F
 
Y
T
 
D
R
 
E
K
 
K
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
T
N
 
N
T
 
L
P
 
P
V
 
A
I
 
Q
I
 
I
H
 
D
F
 
L
N
 
Y
L
 
A
V
 
S
K
 
K
G
 
G
S
 
M
G
 
E
I
 
Y
R
 
S
M
 
F
W
 
M
V
 
F
V
 
V
P
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
E
 
A
N
 
N
M
 
K
S
 
S
R
 
F
L
 
L
F
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
S
M
 
V
L
 
L
P
 
N
P
 
P
S
 
K
A
 
S
G
 
L
W
 
R
T
 
N
G
 
F
V
 
L
K
 
K
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
A
L
 
M
T
 
F
V
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
T
N
 
S
P
 
A
C
|
C
P
 
P
P
 
P
T
 
Y
I
 
H
V
 
V
G
 
A
V
 
V
G
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
T
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
S
 
S
A
 
A
L
 
E
M
 
M
A
 
T
K
 
M
R
 
K
S
 
-
L
 
V
L
 
L
R
 
K
P
 
Y
L
 
A
G
 
S
E
 
C
P
 
H
N
 
Y
P
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
L
L
 
I
A
 
T
R
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
E
M
 
L
E
 
E
Q
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
K
A
 
V
I
 
C
N
 
Q
R
 
N
T
 
I
G
 
G
V
 
M
G
 
G
P
 
A
Q
 
Q
G
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
T
 
Y
S
 
A
L
 
H
A
 
D
V
 
V
H
 
R
I
 
V
L
 
I
M
 
R
M
 
M
P
 
P
C
 
R
H
 
H
I
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
C
P
 
P
L
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
G
I
 
V
Q
 
S
C
|
C
H
 
S
A
 
A
S
 
D
R
 
R
H
 
Q

P14407 Fumarate hydratase class I, anaerobic; D-tartrate dehydratase; Fumarase B; EC 4.2.1.2; EC 4.2.1.81 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 86% coverage: 39:279/279 of query aligns to 78:328/548 of P14407

query
sites
P14407
E
 
E
E
 
A
S
 
S
P
 
E
V
 
N
G
 
D
R
 
K
E
 
Y
I
 
V
L
 
A
E
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
L
E
 
R
N
 
N
A
 
S
R
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
K
E
 
G
R
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
T
C
 
C
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
K
V
 
K
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
V
 
W
V
 
-
S
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
T
V
 
L
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
D
 
N
G
 
T
Y
 
Y
E
 
I
E
 
E
G
 
D
Y
 
N
L
 
L
R
 
R
K
 
Y
S
 
S
-
 
Q
-
 
N
-
 
A
V
 
A
C
 
L
H
 
D
P
 
M
F
 
Y
T
 
K
R
 
E
K
 
V
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
T
N
 
N
T
 
L
P
 
P
V
 
A
I
 
Q
I
 
I
H
 
D
F
 
L
N
 
Y
L
 
A
V
 
V
K
 
D
G
 
G
S
 
D
G
 
E
I
 
Y
R
 
K
M
 
F
W
 
L
V
 
C
V
 
V
P
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
E
 
A
N
 
N
M
x
K
S
 
T
R
 
Y
L
 
L
F
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
T
P
 
P
S
 
G
A
 
K
G
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
L
K
 
K
E
 
N
K
 
F
I
 
L
V
 
V
L
 
E
T
 
K
V
 
M
E
 
R
E
 
T
A
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
A
P
 
A
C
 
C
P
 
P
P
 
P
T
 
Y
I
 
H
V
 
I
G
 
A
V
 
F
G
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
T
F
 
S
E
 
A
Q
 
E
S
 
T
A
 
N
L
 
L
M
 
K
A
 
T
K
 
V
R
 
K
S
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
A
E
 
S
P
 
A
N
 
H
P
 
Y
D
 
Y
D
 
D
E
 
E
L
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
D
A
 
V
R
 
Q
M
 
L
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
E
I
 
A
N
 
Q
R
 
K
T
 
L
G
 
G
V
 
L
G
 
G
P
 
A
Q
 
Q
G
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
T
 
F
S
 
A
L
 
H
A
 
D
V
 
I
H
 
R
I
 
V
L
 
I
M
 
R
M
 
L
P
 
P
C
 
R
H
 
H
I
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
C
P
 
P
L
 
V
A
 
G
V
 
M
N
 
G
I
 
V
Q
 
S
C
 
C
H
 
S
A
 
A
S
 
D
R
 
R
H
 
N
L
 
I
E
 
K
V
 
A
T
 
K
L
 
I

6msnA Crystal structure of cytosolic fumarate hydratase from leishmania major in a complex with inhibitor thiomalate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 4:275/279 of query aligns to 43:325/532 of 6msnA

query
sites
6msnA
I
 
V
E
 
N
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
E
 
I
A
 
L
V
 
A
K
 
H
A
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
S
K
 
D
A
 
V
N
 
H
Y
 
H
E
 
F
L
 
F
G
 
R
E
 
K
D
 
D
V
 
H
I
 
L
Q
 
E
S
 
G
F
 
W
E
 
R
K
 
R
A
 
A
R
 
I
I
 
E
D
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
A
S
 
S
P
 
D
V
 
N
G
 
D
R
 
R
E
 
Y
I
 
V
L
 
A
E
 
T
R
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
A
R
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
G
E
 
R
R
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
S
C
|
C
Q
|
Q
D
|
D
T
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
G
D
 
K
V
 
R
G
 
G
Q
 
-
E
 
E
V
 
L
V
 
C
V
 
W
S
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
E
F
 
D
A
 
E
E
 
K
A
 
Y
V
 
L
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
W
D
 
N
G
 
A
Y
 
Y
E
 
R
E
 
Y
G
 
H
Y
 
N
L
 
L
R
|
R
K
 
Y
S
 
S
-
 
Q
-
 
T
-
 
A
V
 
A
C
 
L
H
 
D
P
 
M
F
 
F
T
 
K
R
 
E
K
 
C
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
D
N
 
N
T
 
L
P
 
P
V
 
A
I
 
Q
I
 
L
H
 
D
F
 
L
N
 
L
L
 
A
V
 
V
K
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
D
I
 
Y
R
 
E
M
 
F
W
 
L
V
 
F
V
 
I
P
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
 
S
E
 
A
N
 
N
M
 
K
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
F
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
N
P
 
P
S
 
K
A
 
S
G
 
L
W
 
R
T
 
A
G
 
F
V
 
I
K
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
K
E
 
T
A
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
A
P
x
A
C
|
C
P
 
P
P
 
P
T
 
Y
I
 
H
V
 
I
G
 
A
V
 
L
G
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
S
F
 
A
E
 
E
Q
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
K
M
 
T
A
 
V
K
 
K
R
 
L
S
 
A
L
 
S
L
 
C
R
 
R
P
 
Y
L
 
Y
G
 
D
E
 
S
-
 
L
P
 
P
N
 
T
P
 
T
D
 
G
D
 
D
E
 
K
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
E
M
 
W
E
 
E
Q
 
K
E
 
I
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
V
I
 
A
N
 
Q
R
 
K
T
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
P
 
A
Q
 
Q
G
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
T
 
F
S
 
A
L
 
H
A
 
Q
V
 
A
H
 
R
I
 
V
L
 
I
M
 
R
M
 
L
P
 
P
C
 
R
H
 
H
I
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
C
P
 
P
L
 
V
A
 
G
V
 
L
N
 
A
I
 
V
Q
 
S
C
|
C
H
 
S
A
|
A
S
 
D
R
 
R
H
 
Q
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6uoiA Crystal structure of cytosolic fumarate hydratase from leishmania major in a complex with malonate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 4:275/279 of query aligns to 45:327/535 of 6uoiA

query
sites
6uoiA
I
 
V
E
 
N
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
E
 
I
A
 
L
V
 
A
K
 
H
A
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
S
K
 
D
A
 
V
N
 
H
Y
 
H
E
 
F
L
 
F
G
 
R
E
 
K
D
 
D
V
 
H
I
 
L
Q
 
E
S
 
G
F
 
W
E
 
R
K
 
R
A
 
A
R
 
I
I
 
E
D
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
A
S
 
S
P
 
D
V
 
N
G
 
D
R
 
R
E
 
Y
I
 
V
L
 
A
E
 
T
R
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
A
R
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
G
E
 
R
R
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
S
C
|
C
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
G
D
 
K
V
 
R
G
 
G
Q
 
-
E
 
E
V
 
L
V
 
C
V
 
W
S
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
E
F
 
D
A
 
E
E
 
K
A
 
Y
V
 
L
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
W
D
 
N
G
 
A
Y
 
Y
E
 
R
E
 
Y
G
 
H
Y
 
N
L
 
L
R
 
R
K
 
Y
S
 
S
-
 
Q
-
 
T
-
 
A
V
 
A
C
 
L
H
 
D
P
 
M
F
 
F
T
 
K
R
 
E
K
 
C
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
D
N
 
N
T
 
L
P
 
P
V
 
A
I
 
Q
I
 
L
H
 
D
F
 
L
N
 
L
L
 
A
V
 
V
K
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
D
I
 
Y
R
 
E
M
 
F
W
 
L
V
 
F
V
 
I
P
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
E
 
A
N
|
N
M
 
K
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
F
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
N
P
 
P
S
 
K
A
 
S
G
 
L
W
 
R
T
 
A
G
 
F
V
 
I
K
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
K
E
 
T
A
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
A
P
x
A
C
|
C
P
 
P
P
 
P
T
 
Y
I
 
H
V
 
I
G
 
A
V
 
L
G
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
S
F
 
A
E
 
E
Q
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
K
M
 
T
A
 
V
K
 
K
R
 
L
S
 
A
L
 
S
L
 
C
R
 
R
P
 
Y
L
 
Y
G
 
D
E
 
S
-
 
L
P
 
P
N
 
T
P
 
T
D
 
G
D
 
D
E
 
K
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
E
M
 
W
E
 
E
Q
 
K
E
 
I
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
V
I
 
A
N
 
Q
R
 
K
T
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
P
 
A
Q
 
Q
G
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
T
 
F
S
 
A
L
 
H
A
 
Q
V
 
A
H
 
R
I
 
V
L
 
I
M
 
R
M
 
L
P
 
P
C
 
R
H
 
H
I
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
C
P
 
P
L
 
V
A
 
G
V
 
L
N
 
A
I
 
V
Q
 
S
C
|
C
H
 
S
A
|
A
S
 
D
R
 
R
H
 
Q
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6unzA Crystal structure of cytosolic fumarate hydratase from leishmania major (see paper)
27% identity, 97% coverage: 4:275/279 of query aligns to 50:332/539 of 6unzA

query
sites
6unzA
I
 
V
E
 
N
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
E
 
I
A
 
L
V
 
A
K
 
H
A
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
S
K
 
D
A
 
V
N
 
H
Y
 
H
E
 
F
L
 
F
G
 
R
E
 
K
D
 
D
V
 
H
I
 
L
Q
 
E
S
 
G
F
 
W
E
 
R
K
 
R
A
 
A
R
 
I
I
 
E
D
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
A
S
 
S
P
 
D
V
 
N
G
 
D
R
 
R
E
 
Y
I
 
V
L
 
A
E
 
T
R
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
A
R
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
G
E
 
R
R
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
S
C
|
C
Q
|
Q
D
|
D
T
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
G
D
 
K
V
 
R
G
 
G
Q
 
-
E
 
E
V
 
L
V
 
C
V
 
W
S
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
E
F
 
D
A
 
E
E
 
K
A
 
Y
V
 
L
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
W
D
 
N
G
 
A
Y
 
Y
E
 
R
E
 
Y
G
 
H
Y
 
N
L
 
L
R
 
R
K
 
Y
S
 
S
-
 
Q
-
 
T
-
 
A
V
 
A
C
 
L
H
 
D
P
 
M
F
 
F
T
 
K
R
 
E
K
 
C
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
D
N
 
N
T
 
L
P
 
P
V
 
A
I
 
Q
I
 
L
H
 
D
F
 
L
N
 
L
L
 
A
V
 
V
K
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
D
I
 
Y
R
 
E
M
 
F
W
 
L
V
 
F
V
 
I
P
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
E
 
A
N
 
N
M
 
K
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
F
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
N
P
 
P
S
 
K
A
 
S
G
 
L
W
 
R
T
 
A
G
 
F
V
 
I
K
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
K
E
 
T
A
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
A
P
x
A
C
|
C
P
 
P
P
 
P
T
 
Y
I
 
H
V
 
I
G
 
A
V
 
L
G
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
S
F
 
A
E
 
E
Q
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
K
M
 
T
A
 
V
K
 
K
R
 
L
S
 
A
L
 
S
L
 
C
R
 
R
P
 
Y
L
 
Y
G
 
D
E
 
S
-
 
L
P
 
P
N
 
T
P
 
T
D
 
G
D
 
D
E
 
K
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
E
M
 
W
E
 
E
Q
 
K
E
 
I
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
V
I
 
A
N
 
Q
R
 
K
T
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
P
 
A
Q
 
Q
G
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
T
 
F
S
 
A
L
 
H
A
 
Q
V
 
A
H
 
R
I
 
V
L
 
I
M
 
R
M
 
L
P
 
P
C
 
R
H
 
H
I
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
C
P
 
P
L
 
V
A
 
G
V
 
L
N
 
A
I
 
V
Q
 
S
C
|
C
H
 
S
A
|
A
S
 
D
R
 
R
H
 
Q
L
 
I

Sites not aligning to the query:

E9AE57 Fumarate hydratase 2; Fumarase 2; LmFH-2; EC 4.2.1.2 from Leishmania major (see paper)
27% identity, 97% coverage: 4:275/279 of query aligns to 70:352/568 of E9AE57

query
sites
E9AE57
I
 
V
E
 
N
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
E
 
I
A
 
L
V
 
A
K
 
H
A
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
S
K
 
D
A
 
V
N
 
H
Y
 
H
E
 
F
L
 
F
G
 
R
E
 
K
D
 
D
V
 
H
I
 
L
Q
 
E
S
 
G
F
 
W
E
 
R
K
 
R
A
 
A
R
 
I
I
 
E
D
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
A
S
 
S
P
 
D
V
 
N
G
 
D
R
 
R
E
 
Y
I
 
V
L
 
A
E
 
T
R
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
A
R
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
G
E
 
R
R
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
S
C
|
C
Q
|
Q
D
|
D
T
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
G
D
 
K
V
 
R
G
 
G
Q
 
-
E
 
E
V
 
L
V
 
C
V
 
W
S
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
E
F
 
D
A
 
E
E
 
K
A
 
Y
V
 
L
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
W
D
 
N
G
 
A
Y
 
Y
E
 
R
E
 
Y
G
 
H
Y
 
N
L
 
L
R
|
R
K
 
Y
S
 
S
-
 
Q
-
 
T
-
 
A
V
 
A
C
 
L
H
 
D
P
 
M
F
 
F
T
 
K
R
 
E
K
 
C
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
D
N
 
N
T
 
L
P
 
P
V
 
A
I
 
Q
I
 
L
H
 
D
F
 
L
N
 
L
L
 
A
V
 
V
K
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
D
I
 
Y
R
 
E
M
 
F
W
 
L
V
 
F
V
 
I
P
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
 
S
E
 
A
N
|
N
M
x
K
S
x
A
R
x
Y
L
|
L
F
x
Y
-
x
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
N
P
 
P
S
 
K
A
 
S
G
 
L
W
 
R
T
 
A
G
 
F
V
 
I
K
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
K
E
 
T
A
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
A
P
 
A
C
|
C
P
 
P
P
 
P
T
 
Y
I
 
H
V
 
I
G
 
A
V
 
L
G
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
S
F
 
A
E
 
E
Q
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
K
M
 
T
A
 
V
K
 
K
R
 
L
S
 
A
L
 
S
L
 
C
R
 
R
P
 
Y
L
 
Y
G
 
D
E
 
S
-
 
L
P
 
P
N
 
T
P
 
T
D
 
G
D
 
D
E
 
K
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
E
M
 
W
E
 
E
Q
 
K
E
 
I
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
V
I
 
A
N
 
Q
R
 
K
T
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
P
 
A
Q
 
Q
G
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
T
 
F
S
 
A
L
 
H
A
 
Q
V
 
A
H
 
R
I
 
V
L
 
I
M
 
R
M
 
L
P
 
P
C
 
R
H
 
H
I
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
C
P
 
P
L
 
V
A
 
G
V
 
L
N
 
A
I
 
V
Q
 
S
C
|
C
H
 
S
A
 
A
S
 
D
R
 
R
H
 
Q
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6uqnB Crystal structure of r173a variant of cytosolic fumarate hydratase from leishmania major in a complex with fumarate and s-malate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 4:275/279 of query aligns to 43:325/532 of 6uqnB

query
sites
6uqnB
I
 
V
E
 
N
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
E
 
I
A
 
L
V
 
A
K
 
H
A
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
S
K
 
D
A
 
V
N
 
H
Y
 
H
E
 
F
L
 
F
G
 
R
E
 
K
D
 
D
V
 
H
I
 
L
Q
 
E
S
 
G
F
 
W
E
 
R
K
 
R
A
 
A
R
 
I
I
 
E
D
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
A
S
 
S
P
 
D
V
 
N
G
 
D
R
 
R
E
 
Y
I
 
V
L
 
A
E
 
T
R
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
A
R
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
G
E
 
R
R
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
S
C
|
C
Q
|
Q
D
|
D
T
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
L
A
 
G
D
 
K
V
 
R
G
 
G
Q
 
-
E
 
E
V
 
L
V
 
C
V
 
W
S
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
E
F
 
D
A
 
E
E
 
K
A
 
Y
V
 
L
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
W
D
 
N
G
 
A
Y
 
Y
E
 
R
E
 
Y
-
 
H
-
 
N
-
 
L
G
 
A
Y
 
Y
L
 
S
R
 
Q
K
 
T
S
 
A
V
 
A
C
 
L
H
 
D
P
 
M
F
 
F
T
 
K
R
 
E
K
 
C
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
D
N
 
N
T
 
L
P
 
P
V
 
A
I
 
Q
I
 
L
H
 
D
F
 
L
N
 
L
L
 
A
V
 
V
K
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
D
I
 
Y
R
 
E
M
 
F
W
 
L
V
 
F
V
 
I
P
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
 
S
E
 
A
N
 
N
M
 
K
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
F
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
A
M
 
L
L
 
L
P
 
N
P
 
P
S
 
K
A
 
S
G
 
L
W
 
R
T
 
A
G
 
F
V
 
I
K
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
K
E
 
T
A
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
A
P
x
A
C
|
C
P
 
P
P
 
P
T
 
Y
I
 
H
V
 
I
G
 
A
V
 
L
G
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
S
F
 
A
E
 
E
Q
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
K
M
 
T
A
 
V
K
 
K
R
 
L
S
 
A
L
 
S
L
 
C
R
 
R
P
 
Y
L
 
Y
G
 
D
E
 
S
-
 
L
P
 
P
N
 
T
P
 
T
D
 
G
D
 
D
E
 
K
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
E
M
 
W
E
 
E
Q
 
K
E
 
I
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
V
I
 
A
N
 
Q
R
 
K
T
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
P
 
A
Q
 
Q
G
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
T
 
F
S
 
A
L
 
H
A
 
Q
V
 
A
H
 
R
I
 
V
L
 
I
M
 
R
M
 
L
P
 
P
C
 
R
H
 
H
I
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
C
P
 
P
L
 
V
A
 
G
V
 
L
N
 
A
I
 
V
Q
 
S
C
|
C
H
 
S
A
|
A
S
 
D
R
 
R
H
 
Q
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_028319820.1 NCBI__GCF_000422285.1:WP_028319820.1
MRHIEAQAVTEAVKAAVVKANYELGEDVIQSFEKARIDEESPVGREILERLIENARIART
ERIPICQDTGLVVVFADVGQEVVVSNGGFAEAVEQGVRDGYEEGYLRKSVCHPFTRKNTG
DNTPVIIHFNLVKGSGIRMWVVPKGGGSENMSRLFMLPPSAGWTGVKEKIVLTVEEAGPN
PCPPTIVGVGIGGNFEQSALMAKRSLLRPLGEPNPDDELARMEQEVLEAINRTGVGPQGL
GGRITSLAVHILMMPCHIASLPLAVNIQCHASRHLEVTL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory