SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_028487001.1 NCBI__GCF_000483485.1:WP_028487001.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
45% identity, 60% coverage: 5:168/272 of query aligns to 81:244/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
L
 
L
R
 
R
S
 
V
D
 
D
I
 
I
N
 
Q
C
 
A
V
 
V
F
 
Y
E
 
D
R
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
Y
R
 
S
N
 
R
T
 
F
F
 
M
E
 
D
V
 
P
L
 
V
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
W
 
T
Y
 
H
R
 
R
V
 
L
A
 
A
H
 
H
W
 
W
F
 
L
W
 
Y
G
 
K
K
 
Q
G
 
G
L
 
R
K
 
K
W
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
Y
F
 
Y
I
 
L
S
 
Q
S
 
S
L
 
R
S
 
S
R
 
S
W
 
S
F
 
I
T
 
F
G
 
Q
I
 
T
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
R
I
 
L
G
 
G
E
 
S
R
 
G
F
 
L
F
 
F
I
 
L
D
 
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
D
D
 
N
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
S
K
 
S
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
Q
R
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
S
 
Q
D
 
C
A
 
S
R
 
K
I
 
I
G
x
A
S
x
A
N
 
G
A
x
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
H
G
 
N
R
 
V
T
|
T
V
 
V
V
x
A
G
|
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
x
I

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
45% identity, 61% coverage: 8:173/272 of query aligns to 80:245/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
D
 
D
I
 
I
N
 
Q
C
 
A
V
 
V
F
 
R
E
 
H
R
 
R
D
|
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
R
 
E
N
 
L
T
 
W
F
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
W
 
S
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
T
H
 
H
W
 
Y
F
 
L
W
 
W
G
 
N
K
 
Q
G
 
N
L
 
R
K
 
K
W
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
F
 
Y
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
Q
S
 
I
R
 
S
W
 
V
F
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
H
R
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
F
D
|
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
V
G
 
R
D
 
E
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
K
D
 
Y
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
N
A
 
P
V
 
V
P
 
P
N
 
E
G
 
Y
R
 
A
T
 
T
V
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
S
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
S
 
A

8i04A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with serine (see paper)
44% identity, 64% coverage: 1:174/272 of query aligns to 73:246/258 of 8i04A

query
sites
8i04A
M
 
M
F
 
I
K
 
A
R
 
S
L
 
A
R
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
I
N
 
Q
C
 
A
V
 
V
F
 
R
E
 
T
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
R
 
D
N
 
K
T
 
Y
F
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
L
L
 
Q
W
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
F
 
L
W
 
W
G
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
R
K
 
R
W
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
F
 
F
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
Q
S
 
V
R
 
S
W
 
V
F
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
R
R
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
T
K
 
S
G
 
G
Q
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
R
D
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
Q
A
 
P
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
H
R
 
T
T
 
T
V
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
G
Q
 
K
D
 
P
K
 
G
S
 
S
E
 
D

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
46% identity, 61% coverage: 8:174/272 of query aligns to 80:246/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
D
 
D
I
 
I
N
 
C
C
 
A
V
 
T
F
 
V
E
 
N
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
R
 
S
N
 
M
T
 
Y
F
 
S
E
 
M
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
Y
H
 
H
A
 
A
I
 
L
L
 
Q
W
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
N
W
 
W
F
 
L
W
 
W
G
 
R
K
 
Q
G
 
G
L
 
R
K
 
K
W
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
F
x
Y
I
 
F
S
 
Q
S
 
N
L
x
Q
S
 
I
R
 
S
W
 
V
F
 
A
T
 
C
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
R
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
Q
G
 
D
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
E
K
 
C
G
 
G
Q
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
E
D
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
H
R
 
T
T
 
T
V
 
V
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
G
Q
 
R
D
 
P
K
 
Q
S
 
S
E
 
D

Sites not aligning to the query:

8i06A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with coa (see paper)
45% identity, 62% coverage: 1:168/272 of query aligns to 77:244/244 of 8i06A

query
sites
8i06A
M
 
M
F
 
I
K
 
A
R
 
S
L
 
A
R
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
I
N
 
Q
C
 
A
V
 
V
F
 
R
E
 
T
R
 
R
D
 
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
R
 
D
N
 
K
T
 
Y
F
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
L
L
 
Q
W
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
F
 
L
W
 
W
G
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
R
K
 
R
W
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
F
 
F
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
Q
S
 
V
R
 
S
W
 
V
F
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
R
R
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
 
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
x
L
H
x
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
T
K
 
S
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
R
D
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
|
G
S
x
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
Q
A
 
P
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
H
R
 
T
T
|
T
V
 
A
V
x
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V

8i09A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with butyl gallate (see paper)
45% identity, 62% coverage: 1:168/272 of query aligns to 76:243/246 of 8i09A

query
sites
8i09A
M
 
M
F
 
I
K
 
A
R
 
S
L
 
A
R
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
I
N
 
Q
C
 
A
V
 
V
F
 
R
E
 
T
R
 
R
D
|
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
R
 
D
N
 
K
T
 
Y
F
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
L
L
 
Q
W
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
F
 
L
W
 
W
G
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
R
K
 
R
W
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
F
 
F
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
Q
S
 
V
R
 
S
W
 
V
F
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
R
R
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
|
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
T
K
 
S
G
 
G
Q
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
|
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
R
D
 
G
A
 
A
R
x
K
I
|
I
G
|
G
S
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
|
L
K
 
Q
A
 
P
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
H
R
 
T
T
 
T
V
 
A
V
x
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
42% identity, 62% coverage: 3:170/272 of query aligns to 80:247/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
K
 
K
R
 
C
L
 
V
R
 
E
S
 
A
D
 
D
I
 
L
N
 
K
C
 
A
V
 
I
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
C
R
 
D
N
 
E
T
 
Y
F
 
S
E
 
L
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
W
 
A
Y
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
N
H
 
H
W
 
R
F
 
L
W
 
Y
G
 
L
K
 
D
G
 
G
L
 
R
K
 
K
W
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
F
 
F
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
R
S
 
M
R
 
S
W
 
E
F
 
V
T
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
R
I
 
L
G
 
G
E
 
Y
R
 
G
F
 
L
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
N
D
 
N
C
 
I
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
S
T
 
G
W
 
K
Q
 
E
K
 
G
G
 
G
Q
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
N
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
K
 
S
A
 
D
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
S
R
 
I
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
K
I
 
P
V
 
V
E
 
A
Q
 
R

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
43% identity, 64% coverage: 1:174/272 of query aligns to 77:250/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
M
 
M
F
 
I
K
 
A
R
 
S
L
 
A
R
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
I
N
 
Q
C
 
A
V
 
V
F
 
R
E
 
T
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
R
 
D
N
 
K
T
 
Y
F
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
L
L
 
Q
W
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
F
 
L
W
 
W
G
 
N
K
 
Q
G
 
G
L
 
R
K
 
R
W
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
F
 
F
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
Q
S
 
V
R
 
S
W
 
V
F
 
T
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
R
R
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
 
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
S
K
 
G
G
 
G
Q
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
R
D
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
Q
A
 
P
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
H
R
 
T
T
 
T
V
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
G
Q
 
K
D
 
P
K
 
D
S
 
S
E
 
D

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
43% identity, 61% coverage: 3:168/272 of query aligns to 78:243/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
K
 
K
R
 
C
L
 
V
R
 
E
S
 
A
D
 
D
I
 
L
N
 
K
C
 
A
V
 
I
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
C
R
 
D
N
 
E
T
 
Y
F
 
S
E
 
L
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
W
 
A
Y
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
N
H
 
H
W
 
R
F
 
L
W
 
Y
G
 
L
K
 
D
G
 
G
L
 
R
K
 
K
W
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
F
 
F
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
R
S
 
M
R
 
S
W
 
E
F
 
V
T
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
R
I
 
L
G
 
G
E
 
Y
R
 
G
F
 
L
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
N
D
 
N
C
 
I
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
S
T
 
G
W
 
K
Q
 
E
K
 
G
G
 
G
Q
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
N
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
K
 
S
A
 
D
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
S
R
 
I
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
K
I
 
P
V
 
V

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
46% identity, 57% coverage: 5:160/272 of query aligns to 103:258/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
L
 
V
R
 
K
S
 
Q
D
 
D
I
 
I
N
 
I
C
 
A
V
 
A
F
 
Y
E
 
T
R
 
G
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
A
R
 
S
N
 
S
T
 
L
F
 
A
E
 
M
V
 
I
L
 
I
T
 
R
T
 
S
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
V
I
 
M
L
 
M
W
 
I
Y
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
W
 
I
F
 
L
W
 
Y
G
 
M
K
 
N
G
 
G
L
 
D
K
 
I
W
 
E
L
 
Y
A
 
S
R
 
R
F
 
E
I
 
L
S
 
M
S
 
E
L
 
N
S
 
I
R
 
H
W
 
S
F
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
G
C
 
T
K
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
N
R
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
|
D
H
|
H
G
 
G
M
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
W
C
 
C
T
 
R
L
 
V
Y
 
Y
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
x
A
T
 
M
T
 
S
W
 
F
Q
 
K
K
 
G
G
 
N
Q
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
N
A
 
V
R
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
T
K
 
Q
A
 
N
V
 
I
P
 
D
N
 
Q
G
 
D
R
 
Q
T
 
I
V
 
V

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
42% identity, 64% coverage: 1:174/272 of query aligns to 80:253/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
M
 
M
F
 
I
K
 
V
R
 
S
L
 
A
R
 
A
S
 
R
D
 
D
I
 
I
N
 
L
C
 
A
V
 
V
F
 
R
E
 
L
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
R
 
D
N
 
K
T
 
Y
F
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
L
L
 
Q
W
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
F
 
L
W
 
W
G
 
A
K
 
Q
G
 
D
L
 
R
K
 
K
W
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
F
 
Y
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
Q
S
 
V
R
 
S
W
 
V
F
 
A
T
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
C
R
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
 
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
N
D
 
D
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
G
|
G
T
 
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
T
K
 
S
G
 
G
Q
 
D
R
|
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
R
D
 
E
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
R
D
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
A
G
 
H
R
 
T
T
 
T
V
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
G
Q
 
K
D
 
P
K
 
E
S
 
S
E
 
D

3p47A Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-cysteine (see paper)
42% identity, 58% coverage: 3:160/272 of query aligns to 103:268/270 of 3p47A

query
sites
3p47A
K
 
R
R
 
T
L
 
L
R
 
K
S
 
T
D
 
D
I
 
L
N
 
I
C
 
A
V
 
A
F
 
Y
E
 
A
R
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
P
N
 
G
T
 
L
F
 
S
E
 
L
V
 
I
L
 
I
T
 
R
T
 
C
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
H
 
Q
A
 
A
I
 
V
L
 
I
W
 
V
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
V
F
 
L
W
 
Y
G
 
E
K
 
C
G
 
G
L
 
E
K
 
R
W
 
Y
L
 
Y
A
 
C
R
 
R
F
 
E
I
 
M
S
 
M
S
 
E
L
 
S
S
 
V
R
 
H
W
 
S
F
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
G
C
 
A
K
 
S
I
 
I
G
 
K
E
 
G
R
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
M
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
W
C
 
C
T
 
R
L
 
I
Y
 
Y
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
x
A
T
 
M
T
x
H
W
 
F
Q
 
Q
K
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
G
G
 
T
Q
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
V
 
T
V
 
I
G
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
I
I
 
V
G
 
G
S
 
S
D
 
H
A
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
D
K
 
R
A
 
D
V
 
V
P
 
D
N
 
S
G
 
N
R
 
Q
T
 
T
V
 
V

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
45% identity, 60% coverage: 7:168/272 of query aligns to 82:243/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
S
 
A
D
 
D
I
 
L
N
 
R
C
 
A
V
 
A
F
 
R
E
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
C
R
 
V
N
 
S
T
 
Y
F
 
S
E
 
H
V
 
C
L
 
L
T
 
L
T
 
N
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
L
A
 
A
I
 
C
L
 
Q
W
 
A
Y
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
W
 
L
F
 
L
W
 
W
G
 
R
K
 
Q
G
 
S
L
 
R
K
 
R
W
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
L
F
 
A
I
 
L
S
 
H
S
 
S
L
 
R
S
 
I
R
 
A
W
 
N
F
 
V
T
 
F
G
 
A
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
K
R
 
G
F
 
I
F
 
L
I
 
F
D
 
D
H
 
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
 
L
H
 
H
G
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
T
 
G
W
 
K
Q
 
V
K
 
G
G
 
G
Q
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
E
D
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
S
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
I
A
 
D
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
R
R
 
T
T
 
T
V
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
L
V
 
V

3q1xA Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-serine (see paper)
42% identity, 58% coverage: 3:160/272 of query aligns to 101:266/267 of 3q1xA

query
sites
3q1xA
K
 
R
R
 
T
L
 
L
R
 
K
S
 
T
D
 
D
I
 
L
N
 
I
C
 
A
V
 
A
F
 
Y
E
 
A
R
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
P
N
 
G
T
 
L
F
 
S
E
 
L
V
 
I
L
 
I
T
 
R
T
 
C
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
H
 
Q
A
 
A
I
 
V
L
 
I
W
 
V
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
V
F
 
L
W
 
Y
G
 
E
K
 
C
G
 
G
L
 
E
K
 
R
W
 
Y
L
 
Y
A
 
C
R
 
R
F
 
E
I
 
M
S
 
M
S
 
E
L
 
S
S
 
V
R
 
H
W
 
S
F
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
G
C
 
A
K
 
S
I
 
I
G
 
K
E
 
G
R
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
M
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
W
C
 
C
T
 
R
L
 
I
Y
 
Y
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
M
T
x
H
W
 
F
Q
 
Q
K
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
G
G
 
T
Q
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
V
 
T
V
 
I
G
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
I
I
 
V
G
 
G
S
 
S
D
 
H
A
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
D
K
 
R
A
 
D
V
 
V
P
 
D
N
 
S
G
 
N
R
 
Q
T
 
T
V
 
V

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
43% identity, 59% coverage: 8:168/272 of query aligns to 80:233/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
D
 
D
I
 
I
N
 
Q
C
 
A
V
 
V
F
 
R
E
 
H
R
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
R
 
E
N
 
L
T
 
W
F
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
T
 
L
T
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
W
 
S
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
T
H
 
H
W
 
Y
F
 
L
W
 
W
G
 
N
K
 
Q
G
 
N
L
 
R
K
 
K
W
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
F
 
Y
I
 
L
S
 
Q
S
 
N
L
 
Q
S
 
I
R
 
S
W
 
V
F
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
H
R
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
x
L
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
 
-
W
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
V
G
 
R
D
 
E
R
 
G
V
 
V
V
 
M
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
|
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
K
D
 
Y
A
 
A
R
x
K
I
 
I
G
|
G
S
x
A
N
 
N
A
 
S
V
|
V
V
 
V
L
|
L
K
 
N
A
 
P
V
 
V
P
 
P
N
 
E
G
 
Y
R
 
A
T
|
T
V
 
A
V
x
A
G
 
G
I
x
V
P
|
P
G
 
A
R
 
R
I
 
I
V
|
V

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
44% identity, 60% coverage: 7:168/272 of query aligns to 78:233/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
S
 
A
D
 
D
I
 
L
N
 
R
C
 
A
V
 
A
F
 
R
E
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
V
A
 
S
A
 
Y
R
 
S
N
 
H
T
 
C
F
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
L
T
 
N
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
L
 
F
H
 
L
A
 
A
I
 
C
L
 
Q
W
 
A
Y
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
W
 
L
F
 
L
W
 
W
G
 
R
K
 
Q
G
 
S
L
 
R
K
 
R
W
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
L
F
 
A
I
 
L
S
 
H
S
 
S
L
 
R
S
 
I
R
 
A
W
 
N
F
 
V
T
 
F
G
 
A
I
 
V
E
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
C
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
K
R
 
G
F
 
I
F
 
L
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
C
 
V
T
 
S
L
 
I
Y
x
L
H
 
H
G
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
T
 
-
W
 
-
Q
 
-
K
 
G
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
K
 
K
I
 
I
G
 
G
S
 
E
D
 
G
A
 
A
R
x
K
I
 
V
G
|
G
S
x
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
|
L
K
 
I
A
 
D
V
 
V
P
 
P
N
 
P
G
 
R
R
 
T
T
 
T
V
 
A
V
|
V
G
 
G
I
 
N
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
L
V
 
V

4eaaA X-ray crystal structure of the h141n mutant of perosamine n- acetyltransferase from caulobacter crescentus in complex with coa and gdp-perosamine (see paper)
26% identity, 37% coverage: 68:167/272 of query aligns to 100:207/210 of 4eaaA

query
sites
4eaaA
I
 
V
H
 
S
P
 
P
A
 
S
C
 
V
K
 
R
I
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
G
F
 
V
F
 
A
I
 
V
D
 
M
H
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
V
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
S
-
 
W
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
N
E
 
T
T
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
N
D
 
D
C
 
C
T
 
R
L
 
L
Y
 
G
H
 
A
G
 
A
V
 
C
T
 
H
L
 
L
G
 
G
G
x
P
T
 
A
T
 
S
W
 
A
Q
 
L
K
 
A
G
 
G
Q
 
G
R
 
V
H
 
-
P
 
-
T
 
S
L
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
R
V
 
A
V
x
F
V
 
L
G
 
G
A
x
V
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
I
G
 
P
P
 
G
I
 
V
K
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
A
D
 
D
A
 
T
R
 
I
I
 
V
G
 
G
S
x
A
N
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
V
K
 
R
A
 
D
V
 
L
P
 
P
N
 
D
G
 
S
R
 
V
T
 
L
V
 
A
V
x
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
K
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4ea9A X-ray structure of gdp-perosamine n-acetyltransferase in complex with transition state analog at 0.9 angstrom resolution (see paper)
26% identity, 37% coverage: 68:167/272 of query aligns to 98:205/207 of 4ea9A

query
sites
4ea9A
I
 
V
H
 
S
P
 
P
A
 
S
C
 
V
K
 
R
I
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
G
F
 
V
F
 
A
I
 
V
D
 
M
H
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
V
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
S
-
 
W
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
N
E
 
T
T
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
H
D
 
D
C
 
C
T
 
R
L
 
L
Y
 
G
H
 
A
G
 
A
V
 
C
T
x
H
L
 
L
G
 
G
G
x
P
T
 
A
T
 
S
W
 
A
Q
 
L
K
 
A
G
 
G
Q
 
G
R
 
V
H
 
-
P
 
-
T
 
S
L
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
R
V
 
A
V
x
F
V
 
L
G
|
G
A
x
V
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
I
G
 
P
P
 
G
I
 
V
K
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
A
D
 
D
A
 
T
R
 
I
I
 
V
G
 
G
S
x
A
N
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
V
K
 
R
A
 
D
V
 
L
P
 
P
N
 
D
G
 
S
R
 
V
T
 
L
V
 
A
V
x
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
K
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4ea8A X-ray crystal structure of perb from caulobacter crescentus in complex with coenzyme a and gdp-n-acetylperosamine at 1 angstrom resolution (see paper)
26% identity, 37% coverage: 68:167/272 of query aligns to 98:205/207 of 4ea8A

query
sites
4ea8A
I
 
V
H
 
S
P
 
P
A
 
S
C
 
V
K
 
R
I
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
G
F
 
V
F
 
A
I
 
V
D
 
M
H
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
V
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
S
-
 
W
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
N
E
 
T
T
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
H
D
 
D
C
 
C
T
 
R
L
 
L
Y
 
G
H
 
A
G
 
A
V
 
C
T
x
H
L
 
L
G
 
G
G
 
P
T
 
A
T
 
S
W
 
A
Q
 
L
K
 
A
G
 
G
Q
 
G
R
 
V
H
 
-
P
 
-
T
 
S
L
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
R
V
 
A
V
x
F
V
 
L
G
|
G
A
x
V
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
I
G
 
P
P
 
G
I
 
V
K
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
A
D
 
D
A
 
T
R
 
I
I
 
V
G
 
G
S
x
A
N
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
V
K
 
R
A
 
D
V
 
L
P
 
P
N
 
D
G
 
S
R
 
V
T
 
L
V
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
K
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6sc4B Gamma-carbonic anhydrase from the haloarchaeon halobacterium sp. (see paper)
32% identity, 34% coverage: 94:185/272 of query aligns to 82:162/178 of 6sc4B

query
sites
6sc4B
I
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
N
T
 
I
L
 
I
Y
 
G
H
|
H
G
 
R
V
 
A
T
 
L
L
 
I
G
x
H
G
 
G
T
 
A
T
 
K
W
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
I
G
 
N
D
 
D
R
 
E
V
 
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
S
K
 
I
V
 
V
L
 
F
G
 
N
P
 
K
I
 
A
K
 
E
I
 
V
G
 
K
S
 
T
D
 
N
A
 
S
R
 
M
I
 
V
G
 
G
S
 
M
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
-
 
E
-
 
K
K
 
Q
A
 
E
V
 
V
P
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
I
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
I
P
 
P
G
 
A
R
 
R
I
 
V
V
 
L
E
 
-
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
S
 
R
E
 
E
A
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
I
K
 
K
M
 
Q
A
 
I
Q
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_028487001.1 NCBI__GCF_000483485.1:WP_028487001.1
MFKRLRSDINCVFERDPAARNTFEVLTTYPGLHAILWYRVAHWFWGKGLKWLARFISSLS
RWFTGIEIHPACKIGERFFIDHGMGVVIGETAVIGDDCTLYHGVTLGGTTWQKGQRHPTL
GDRVVVGAGAKVLGPIKIGSDARIGSNAVVLKAVPNGRTVVGIPGRIVEQDKSEAQQRRA
KMAQKIGFDAYGMKQDAADPVEKAIYSLLDHIQVQDEKLEKMALELQKLGGESIDMHMPK
LDDAVLEPDDPEQAAHLKSGLNPENDGNNKSG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory