SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_028988713.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_028988713.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4cpdA Alcohol dehydrogenase tadh from thermus sp. Atn1
40% identity, 95% coverage: 1:376/394 of query aligns to 1:337/346 of 4cpdA

query
sites
4cpdA
M
 
M
F
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
V
Y
 
F
Q
 
E
G
 
N
P
 
K
F
 
E
D
 
R
V
 
V
R
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
E
V
 
V
P
 
N
D
 
A
P
 
P
A
 
R
I
 
L
Q
 
Q
E
 
H
P
 
P
D
 
L
D
 
D
V
 
A
I
 
L
L
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
H
A
 
L
T
 
A
A
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
L
H
|
H
L
 
L
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
K
 
K
M
 
I
P
 
P
A
 
V
M
 
L
E
 
P
H
 
-
G
 
G
D
 
S
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
M
 
V
G
 
G
V
 
Q
V
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
V
G
 
G
P
 
E
A
 
G
V
 
I
T
 
Q
K
 
D
V
 
L
R
 
Q
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
V
I
 
V
V
 
G
P
 
P
F
 
F
V
 
H
I
 
I
A
 
A
C
|
C
G
 
G
E
 
T
C
|
C
F
 
P
F
 
Y
C
|
C
H
 
R
R
 
R
E
 
H
L
 
Q
Y
 
Y
S
 
N
A
 
L
C
|
C
E
 
E
T
 
-
T
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
R
G
 
G
A
x
G
L
 
V
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
H
 
P
L
 
M
Y
 
F
G
 
G
G
 
N
I
 
L
P
 
Q
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
I
V
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
K
 
F
A
 
S
N
 
N
V
 
V
G
 
N
P
 
L
F
 
R
K
 
K
V
 
L
P
 
P
G
 
P
S
 
N
L
 
L
A
 
S
D
 
P
E
 
E
R
 
R
V
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
A
T
 
G
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
S
T
|
T
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
G
A
 
G
A
 
L
L
 
I
N
 
Q
A
 
G
G
 
Q
I
 
L
T
 
R
R
 
P
G
 
G
S
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
V
F
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
T
 
A
A
 
I
A
 
E
C
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
K
V
 
I
F
 
L
M
 
A
V
 
I
D
|
D
R
|
R
H
 
I
P
 
P
Y
 
E
R
|
R
L
 
L
E
 
E
F
 
R
A
 
A
Q
 
-
A
 
A
T
 
S
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
I
N
 
N
I
 
A
E
 
E
K
 
Q
Q
 
E
D
 
N
P
 
P
A
 
V
E
 
R
E
 
R
I
 
V
I
 
R
K
 
S
A
 
E
T
 
T
G
 
N
R
 
D
R
 
E
G
 
G
V
 
P
D
 
D
A
 
L
V
 
V
V
 
L
D
 
E
A
|
A
V
|
V
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
G
S
 
A
E
 
A
A
 
T
M
 
L
R
 
S
Q
 
L
C
 
A
I
 
L
A
 
E
A
 
M
V
 
V
R
 
R
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
V
S
 
S
V
 
A
P
x
V
G
 
G
V
|
V
Y
 
D
A
 
N
G
 
A
P
 
P
L
 
S
H
 
F
A
 
P
F
 
F
P
 
P
W
 
L
G
 
A
D
 
S
A
 
G
F
 
L
E
 
V
K
 
K
G
 
D
L
 
L
S
 
T
F
 
F
A
 
R
G
 
I
G
 
G
Q
x
L
T
x
A
H
 
N
V
 
V
Q
 
H
K
 
L
Y
 
Y
L
 
I
P
 
D
D
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
A
H
 
L
I
 
L
G
 
A
E
 
S
G
 
G
E
 
R
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
D
 
E
V
 
R
I
 
I
I
 
V
S
 
S
H
 
H
H
 
Y
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
P
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
I
 
L
F
|
F
S
 
D
K
 
R
K
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5ylnA Zinc dependent alcohol dehydrogenase 2 from streptococcus pneumonia - apo form
32% identity, 97% coverage: 1:384/394 of query aligns to 5:341/348 of 5ylnA

query
sites
5ylnA
M
 
M
F
 
K
A
 
A
L
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
K
P
 
P
F
 
G
D
 
L
V
 
A
R
 
S
V
 
F
E
 
V
R
 
D
V
 
V
P
 
D
D
 
K
P
 
P
A
 
V
I
 
I
Q
 
R
E
 
K
P
 
P
D
 
T
D
 
-
V
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
R
V
 
I
T
 
V
A
 
K
T
 
T
A
 
T
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
L
 
I
Y
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
D
M
 
V
P
 
P
A
 
T
M
 
C
E
 
Q
H
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
G
M
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
G
P
 
E
A
 
G
V
 
V
T
 
S
K
 
N
V
 
F
R
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
L
V
 
I
P
 
S
F
 
C
V
 
V
I
 
C
A
 
A
C
|
C
G
 
G
E
 
K
C
|
C
F
 
Y
F
 
Y
C
|
C
H
 
K
R
 
K
E
 
G
L
 
I
Y
 
Y
S
 
A
A
 
H
C
|
C
E
 
E
T
 
-
T
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
D
R
 
E
G
 
G
A
 
G
L
 
W
V
 
I
H
 
F
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
D
G
 
G
G
 
M
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
K
 
H
A
 
A
N
 
D
V
 
N
G
 
T
P
 
L
F
 
Y
K
 
H
V
 
T
P
 
P
G
 
E
S
 
D
L
 
L
A
 
S
D
 
D
E
 
E
R
 
A
V
 
L
L
 
V
F
 
M
L
 
L
T
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
-
 
I
A
 
G
A
 
V
L
 
L
N
 
K
A
 
G
G
 
K
I
 
V
T
 
E
R
 
P
G
 
G
S
 
C
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
F
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
A
T
 
A
A
 
L
A
 
L
C
 
T
A
 
A
R
 
Q
L
 
F
L
 
Y
G
 
S
A
 
P
D
 
A
T
 
K
V
 
L
F
 
I
M
 
M
V
 
V
D
 
D
R
 
L
H
 
D
P
 
D
Y
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
E
F
 
T
A
 
A
Q
 
-
A
 
L
T
 
S
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
I
 
T
P
 
H
L
 
-
N
 
K
I
 
V
E
 
N
K
 
S
Q
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
I
E
 
K
E
 
E
I
 
I
I
 
Y
K
 
D
A
 
L
T
 
T
G
 
D
R
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
I
E
 
P
A
 
A
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
T
M
 
F
R
 
D
Q
 
F
C
 
C
I
 
Q
A
 
K
A
 
I
V
 
I
R
 
G
R
 
V
G
 
D
G
 
G
R
 
T
V
 
V
S
 
A
V
 
N
P
 
C
G
 
G
V
 
V
Y
 
H
A
 
G
G
 
K
P
 
P
L
 
V
H
 
E
A
 
-
F
 
F
P
 
D
W
 
L
G
 
D
D
 
K
A
 
L
F
 
W
E
 
I
K
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
V
A
 
T
G
 
T
G
 
G
Q
 
L
T
 
V
H
 
S
V
 
T
Q
 
N
K
 
T
Y
 
-
L
 
T
P
 
P
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
K
H
 
A
I
 
L
G
 
E
E
 
S
G
 
H
E
 
K
L
 
I
Q
 
E
P
 
P
D
 
E
V
 
K
I
 
L
I
 
V
S
 
T
H
 
H
H
 
Y
L
 
F
P
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
E
A
 
I
A
 
E
R
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
E
I
 
V
F
 
F
S
 
S
K
 
K
K
 
A
E
 
A
D
 
D
N
 
H
C
 
H
R
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
I

4jlwA Crystal structure of formaldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
39% identity, 94% coverage: 4:373/394 of query aligns to 5:379/395 of 4jlwA

query
sites
4jlwA
L
 
V
T
 
V
Y
 
Y
Q
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
G
D
 
K
V
 
V
R
 
E
V
 
V
E
 
Q
R
 
N
V
 
I
P
 
P
D
 
Y
P
 
P
A
 
K
I
 
M
Q
 
Q
E
 
D
P
 
P
D
 
Q
D
 
G
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
H
-
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
R
V
 
V
T
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
Q
H
|
H
L
 
M
Y
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
R
M
 
T
P
 
T
A
 
A
M
 
P
E
 
E
H
 
-
G
 
G
D
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
I
M
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
A
 
I
G
 
G
P
 
R
A
 
G
V
 
V
T
 
E
K
 
T
V
 
M
R
 
K
K
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
L
V
 
V
I
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
N
I
 
V
A
 
A
C
|
C
G
 
G
E
 
H
C
|
C
F
 
R
F
 
T
C
|
C
H
 
K
R
 
E
E
 
Q
L
 
H
Y
 
T
S
 
G
A
 
V
C
|
C
E
 
L
T
 
T
T
 
V
N
 
N
P
 
P
D
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
A
F
 
Y
F
 
-
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
H
 
D
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
G
 
G
I
 
W
P
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
V
 
V
P
 
P
K
 
Y
A
 
A
N
 
D
V
 
F
G
 
N
P
 
L
F
 
L
K
 
K
V
 
L
P
 
P
G
 
N
-
 
R
S
 
E
L
 
A
A
 
A
D
 
M
E
 
E
R
 
K
V
 
I
L
 
R
F
 
D
L
 
L
T
 
T
-
 
C
-
 
L
-
 
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
G
R
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
C
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
T
 
V
V
 
V
F
 
I
M
 
V
V
 
G
D
|
D
R
 
V
H
 
N
P
 
P
Y
 
T
R
|
R
L
 
L
E
 
A
F
 
H
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
T
 
Q
Y
 
G
G
 
F
A
 
E
I
 
I
P
 
A
L
 
-
N
 
D
I
 
L
E
 
S
K
 
K
Q
 
D
D
 
T
P
 
P
A
 
L
E
 
H
E
 
E
I
 
Q
I
 
I
K
 
A
A
 
A
-
 
L
T
 
L
G
 
G
R
 
E
R
 
P
G
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
K
x
R
G
 
G
S
x
H
P
 
G
V
 
H
E
 
S
T
 
G
A
 
S
M
 
Q
A
 
Q
W
 
E
A
 
A
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
P
S
 
A
E
 
T
A
x
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
S
C
 
L
I
 
M
A
 
G
A
 
I
V
 
T
R
 
R
R
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
S
 
G
V
 
I
P
|
P
G
 
G
V
x
L
Y
 
Y
-
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
D
A
 
A
G
 
A
P
 
A
L
 
K
H
 
H
-
 
G
-
 
A
-
 
L
A
 
S
F
 
I
P
 
R
W
 
F
G
 
G
D
 
L
A
 
G
F
 
W
E
 
A
K
 
K
G
 
S
L
 
H
S
 
S
F
 
F
A
 
H
G
 
T
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
H
 
P
V
 
V
Q
 
M
K
 
K
Y
 
Y
L
 
N
P
 
R
D
 
Q
L
 
L
L
 
M
R
 
Q
H
 
A
I
 
I
G
 
M
E
 
W
G
 
D
E
 
R
L
 
I
Q
 
K
-
 
I
P
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
I
 
G
S
 
V
H
 
E
H
 
V
L
 
I
P
 
T
L
 
L
A
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
P
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
E
 
G
I
 
E
F
 
F
S
 
D

1kolA Crystal structure of formaldehyde dehydrogenase (see paper)
38% identity, 94% coverage: 4:373/394 of query aligns to 5:379/396 of 1kolA

query
sites
1kolA
L
 
V
T
 
V
Y
 
Y
Q
 
L
G
 
G
P
 
S
F
 
G
D
 
K
V
 
V
R
 
E
V
 
V
E
 
Q
R
 
K
V
 
I
P
 
D
D
 
Y
P
 
P
A
 
K
I
 
M
Q
 
Q
E
 
D
P
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
E
D
 
H
D
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
K
V
 
V
T
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
Q
H
|
H
L
 
M
Y
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
R
M
 
T
P
 
T
A
 
A
M
 
-
E
 
Q
H
 
V
G
 
G
D
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
I
M
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
I
E
 
E
A
 
K
G
 
G
P
 
R
A
 
D
V
 
V
T
 
E
K
 
N
V
 
L
R
 
Q
K
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
L
V
 
V
I
 
S
V
 
V
P
 
P
F
|
F
V
 
N
I
 
V
A
 
A
C
|
C
G
 
G
E
 
R
C
|
C
F
 
R
F
 
S
C
|
C
H
 
K
R
 
E
E
 
M
L
 
H
Y
 
T
S
 
G
A
 
V
C
|
C
E
 
L
T
 
T
T
 
V
N
|
N
P
 
P
D
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
A
F
 
Y
F
 
-
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
H
 
D
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
G
 
D
I
 
W
P
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
V
 
V
P
 
P
K
 
Y
A
 
A
N
 
D
V
 
F
G
 
N
P
 
L
F
 
L
K
 
K
V
 
L
P
 
P
G
 
D
-
 
R
S
 
D
L
 
K
A
 
A
D
 
M
E
 
E
R
 
K
V
 
I
L
 
R
F
 
D
L
 
L
T
 
T
-
 
C
-
 
L
-
 
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
G
R
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
I
 
V
F
 
A
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
C
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
T
 
V
V
 
V
F
 
I
M
 
V
V
 
G
D
|
D
R
x
L
H
 
N
P
 
P
Y
 
A
R
|
R
L
 
L
E
 
A
F
 
H
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
Q
Y
 
G
G
 
F
A
 
E
I
 
I
P
 
A
L
 
-
N
 
D
I
 
L
E
 
S
K
 
L
Q
 
D
D
 
T
P
 
P
A
 
L
E
 
H
E
 
E
I
 
Q
I
 
I
K
 
A
A
 
A
-
 
L
T
 
L
G
 
G
R
 
E
R
 
P
G
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
A
V
 
V
D
 
D
A
|
A
V
|
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
K
x
R
G
 
G
S
x
H
P
 
G
V
 
H
E
 
E
T
 
G
A
 
A
M
 
K
A
 
H
W
 
E
A
 
A
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
P
S
 
A
E
 
T
A
x
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
S
C
 
L
I
 
M
A
 
Q
A
 
V
V
 
T
R
 
R
R
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
S
 
G
V
 
I
P
|
P
G
 
G
V
x
L
Y
 
Y
A
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
I
G
 
G
P
 
S
L
 
L
H
 
-
A
 
S
F
 
I
P
 
R
W
 
F
G
 
G
D
 
L
A
 
G
F
 
W
E
 
A
K
 
K
G
 
S
L
 
H
S
 
S
F
 
F
A
 
H
G
 
T
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
H
 
P
V
 
V
Q
 
M
K
 
K
Y
 
Y
L
 
N
P
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
M
R
 
Q
H
 
A
I
 
I
G
 
M
E
 
W
G
 
D
E
 
R
L
 
I
Q
 
N
-
 
I
P
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
V
I
 
G
S
 
V
H
 
Q
H
 
V
L
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
P
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
E
 
G
I
 
E
F
 
F
S
 
D

Sites not aligning to the query:

P46154 Glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase; FALDH; FDH; Formaldehyde dismutase; EC 1.2.1.46; EC 1.2.98.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
37% identity, 94% coverage: 4:373/394 of query aligns to 7:381/399 of P46154

query
sites
P46154
L
 
V
T
 
V
Y
 
Y
Q
 
L
G
 
G
P
 
S
F
 
G
D
 
K
V
 
V
R
 
E
V
 
V
E
 
Q
R
 
K
V
 
I
P
 
D
D
 
Y
P
 
P
A
 
K
I
 
M
Q
 
Q
E
 
D
P
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
E
D
 
H
D
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
K
V
 
V
T
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
Q
H
|
H
L
 
M
Y
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
R
M
 
T
P
 
T
A
 
A
M
 
-
E
 
Q
H
 
V
G
 
G
D
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
I
M
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
I
E
 
E
A
 
K
G
 
G
P
 
R
A
 
D
V
 
V
T
 
E
K
 
N
V
 
L
R
 
Q
K
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
L
V
 
V
I
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
N
I
 
V
A
 
A
C
|
C
G
 
G
E
 
R
C
|
C
F
 
R
F
 
S
C
|
C
H
 
K
R
 
E
E
 
M
L
 
H
Y
 
T
S
 
G
A
 
V
C
|
C
E
 
L
T
 
T
T
 
V
N
 
N
P
 
P
D
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
A
F
 
Y
F
 
-
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
H
 
D
L
 
M
Y
 
-
G
 
G
G
 
D
I
 
W
P
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
L
R
 
L
V
 
V
P
 
P
K
 
Y
A
 
A
N
 
D
V
 
F
G
 
N
P
 
L
F
 
L
K
 
K
V
 
L
P
 
P
G
 
D
-
 
R
S
 
D
L
 
K
A
 
A
D
 
M
E
 
E
R
 
K
V
 
I
L
 
R
F
 
D
L
 
L
T
 
T
-
 
C
-
 
L
-
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
G
R
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
I
 
V
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
C
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
T
 
V
V
 
V
F
 
I
M
 
V
V
 
G
D
|
D
R
 
L
H
 
N
P
 
P
Y
 
A
R
|
R
L
 
L
E
 
A
F
 
H
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
Q
Y
 
G
G
 
F
A
 
E
I
 
I
P
 
A
L
 
-
N
 
D
I
 
L
E
 
S
K
 
L
Q
 
D
D
 
T
P
 
P
A
 
L
E
 
H
E
 
E
I
 
Q
I
 
I
K
 
A
A
 
A
-
 
L
T
 
L
G
 
G
R
 
E
R
 
P
G
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
K
x
R
G
 
G
S
x
H
P
 
G
V
 
H
E
 
E
T
 
G
A
 
A
M
 
K
A
 
H
W
 
E
A
 
A
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
P
S
 
A
E
 
T
A
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
S
C
 
L
I
 
M
A
 
Q
A
 
V
V
 
T
R
 
R
R
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
S
 
G
V
 
I
P
|
P
G
 
G
V
x
L
Y
 
Y
A
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
I
G
 
G
P
 
S
L
 
L
H
 
-
A
 
S
F
 
I
P
 
R
W
 
F
G
 
G
D
 
L
A
 
G
F
 
W
E
 
A
K
 
K
G
 
S
L
 
H
S
 
S
F
 
F
A
 
H
G
 
T
G
|
G
Q
 
Q
T
|
T
H
 
P
V
 
V
Q
 
M
K
 
K
Y
 
Y
L
 
N
P
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
M
R
 
Q
H
 
A
I
 
I
G
 
M
E
 
W
G
 
D
E
 
R
L
 
I
Q
 
N
-
 
I
P
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
V
I
 
G
S
 
V
H
 
Q
H
 
V
L
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
P
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
E
 
G
I
 
E
F
 
F
S
 
D

2dphA Crystal structure of formaldehyde dismutase
35% identity, 94% coverage: 3:374/394 of query aligns to 5:381/398 of 2dphA

query
sites
2dphA
A
 
S
L
 
V
T
 
V
Y
 
Y
Q
 
H
G
 
G
P
 
T
F
 
R
D
 
D
V
 
L
R
 
R
V
 
V
E
 
E
R
 
T
V
 
V
P
 
P
D
 
Y
P
 
P
A
 
K
I
 
L
Q
 
E
E
 
H
P
 
N
D
 
N
D
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
H
-
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
K
V
 
V
T
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
Q
H
|
H
L
 
I
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
K
 
R
M
 
F
P
 
-
A
 
I
M
 
V
E
 
P
H
 
K
G
 
G
D
 
H
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
I
M
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
A
 
K
G
 
G
P
 
S
A
 
D
V
 
V
T
 
E
K
 
L
V
 
M
R
 
D
K
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
L
V
 
V
I
 
S
V
 
V
P
 
P
F
|
F
V
 
N
I
 
V
A
 
A
C
|
C
G
 
G
E
 
R
C
|
C
F
 
R
F
 
N
C
|
C
H
 
K
R
 
E
E
 
A
L
 
R
Y
 
S
S
 
D
A
 
V
C
|
C
E
 
E
T
 
N
T
 
N
-
x
L
-
 
V
N
 
N
P
 
P
D
 
D
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
A
G
 
D
A
 
L
A
 
G
F
 
A
F
 
F
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
-
L
 
-
Y
 
L
G
 
K
G
 
G
I
 
W
P
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
V
 
V
P
 
P
K
 
Y
A
 
A
N
 
D
V
 
Y
G
 
M
P
 
L
F
 
L
K
 
K
V
 
F
-
 
G
P
 
D
G
 
K
S
 
E
L
 
Q
A
 
A
D
 
M
E
 
E
R
 
K
V
 
I
L
 
K
F
 
D
L
 
L
T
 
T
-
 
L
-
 
I
-
x
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
|
P
T
|
T
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
A
 
G
A
 
C
L
 
V
N
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
K
R
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
H
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
F
x
A
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
R
M
 
C
T
 
A
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
T
 
C
V
 
V
F
 
I
M
 
V
V
x
G
D
|
D
R
x
Q
H
 
N
P
 
P
Y
 
E
R
|
R
L
 
L
E
 
K
F
 
L
A
 
L
Q
 
-
A
 
S
T
 
D
Y
 
A
G
 
G
A
 
F
I
 
E
P
 
T
L
 
I
N
 
D
I
x
L
E
 
R
K
 
N
Q
 
S
D
 
A
P
 
P
A
 
L
-
 
R
E
 
D
E
 
Q
I
 
I
I
 
D
K
 
Q
A
 
I
T
 
L
G
 
G
R
 
K
R
 
P
G
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
C
V
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
K
x
H
G
 
G
S
 
L
P
 
G
V
 
D
E
 
E
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
A
W
 
N
A
 
T
K
 
E
L
 
T
E
 
P
G
 
N
G
 
G
S
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
A
M
 
L
R
 
N
Q
 
S
C
 
L
I
 
F
A
 
D
A
 
V
V
 
V
R
 
R
R
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
I
S
 
G
V
 
I
P
|
P
G
|
G
V
x
I
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
P
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
G
-
 
R
L
 
L
H
 
H
A
 
-
F
 
L
P
 
D
W
 
F
G
 
G
D
 
K
A
 
M
F
 
W
E
 
T
K
 
K
G
 
S
L
 
I
S
 
R
F
 
I
A
 
M
G
 
T
G
 
G
Q
 
M
T
x
A
H
 
P
V
 
V
Q
 
T
K
 
N
Y
 
Y
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
G
 
T
E
 
E
G
 
A
E
 
I
L
 
L
Q
 
W
P
 
D
D
 
Q
-
 
M
-
 
P
-
 
Y
-
 
L
-
 
S
-
 
K
V
 
V
I
 
M
I
 
N
S
 
I
H
 
E
H
 
V
L
 
I
P
 
T
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
A
 
A
A
 
P
R
 
D
G
 
G
Y
 
Y
E
 
A
I
 
K
F
 
F
S
 
D
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Q52078 Formaldehyde dismutase; EC 1.2.98.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
35% identity, 94% coverage: 3:374/394 of query aligns to 6:382/399 of Q52078

query
sites
Q52078
A
x
S
L
x
V
T
x
V
Y
|
Y
Q
x
H
G
|
G
P
x
T
F
x
R
D
|
D
V
x
L
R
|
R
V
|
V
E
|
E
R
x
T
V
|
V
P
|
P
D
x
Y
P
|
P
A
x
K
I
x
L
Q
x
E
E
x
H
P
x
N
D
x
N
D
x
R
-
x
K
-
x
L
-
x
E
-
x
H
-
x
A
V
|
V
I
|
I
L
|
L
R
x
K
V
|
V
T
x
V
A
x
S
T
|
T
A
x
N
I
|
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
|
D
L
x
Q
H
|
H
L
x
I
Y
|
Y
R
|
R
G
|
G
K
x
R
M
x
F
P
 
-
A
x
I
M
x
V
E
x
P
H
x
K
G
|
G
D
x
H
I
x
V
L
|
L
G
|
G
H
|
H
E
|
E
F
x
I
M
x
T
G
|
G
V
x
E
V
|
V
E
x
V
E
|
E
A
x
K
G
|
G
P
x
S
A
x
D
V
|
V
T
x
E
K
x
L
V
x
M
R
x
D
K
x
I
G
|
G
D
|
D
R
x
L
V
|
V
I
x
S
V
|
V
P
|
P
F
|
F
V
x
N
I
x
V
A
|
A
C
|
C
G
|
G
E
x
R
C
|
C
F
x
R
F
x
N
C
|
C
H
x
K
R
x
E
E
x
A
L
x
R
Y
x
S
S
x
D
A
x
V
C
|
C
E
|
E
T
x
N
T
x
N
-
x
L
-
x
V
N
|
N
P
|
P
D
|
D
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
x
A
G
x
D
A
x
L
A
x
G
F
x
A
F
|
F
G
|
G
Y
x
F
S
x
D
H
 
-
L
 
-
Y
x
L
G
x
K
G
|
G
I
x
W
P
x
S
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
A
|
A
E
|
E
Y
|
Y
V
|
V
R
x
L
V
|
V
P
|
P
K
x
Y
A
|
A
N
x
D
V
x
Y
G
x
M
P
x
L
F
x
L
K
|
K
V
x
F
-
x
G
P
x
D
G
x
K
S
x
E
L
x
Q
A
|
A
D
x
M
E
|
E
R
x
K
V
x
I
L
x
K
F
x
D
L
|
L
T
|
T
-
x
L
-
x
I
-
x
S
D
|
D
I
|
I
L
|
L
P
|
P
T
|
T
G
|
G
Y
x
F
Q
x
H
A
x
G
A
x
C
L
x
V
N
x
S
A
|
A
G
|
G
I
x
V
T
x
K
R
x
P
G
|
G
S
|
S
S
x
H
V
|
V
A
x
Y
I
|
I
F
x
A
G
|
G
A
|
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
|
G
L
x
R
M
x
C
T
x
A
A
|
A
A
|
A
C
x
G
A
|
A
R
|
R
L
|
L
L
|
L
G
|
G
A
|
A
D
x
A
T
x
C
V
|
V
F
x
I
M
x
V
V
x
G
D
|
D
R
x
Q
H
x
N
P
|
P
Y
x
E
R
|
R
L
|
L
E
x
K
F
x
L
A
x
L
Q
 
-
A
x
S
T
x
D
Y
x
A
G
|
G
A
x
F
I
x
E
P
x
T
L
x
I
N
x
D
I
x
L
E
x
R
K
x
N
Q
x
S
D
x
A
P
|
P
A
x
L
-
x
R
E
x
D
E
x
Q
I
|
I
I
x
D
K
x
Q
A
x
I
T
x
L
G
|
G
R
x
K
R
x
P
G
x
E
V
|
V
D
|
D
A
x
C
V
x
G
V
|
V
D
|
D
A
|
A
V
|
V
G
|
G
F
|
F
E
|
E
A
|
A
K
x
H
G
|
G
S
x
L
P
x
G
V
x
D
E
|
E
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
|
A
W
x
N
A
x
T
K
x
E
L
x
T
E
x
P
G
x
N
G
|
G
S
 
-
S
 
-
E
 
-
A
|
A
M
x
L
R
x
N
Q
x
S
C
x
L
I
x
F
A
x
D
A
x
V
V
|
V
R
|
R
R
x
A
G
|
G
G
|
G
R
x
A
V
x
I
S
x
G
V
x
I
P
|
P
G
|
G
V
x
I
Y
|
Y
A
x
V
G
|
G
P
x
S
-
x
D
-
x
P
-
x
D
-
x
P
-
x
V
-
x
N
-
x
K
-
x
D
-
x
A
-
x
G
-
x
S
-
x
G
-
x
R
L
|
L
H
|
H
A
 
-
F
x
L
P
x
D
W
x
F
G
|
G
D
x
K
A
x
M
F
x
W
E
x
T
K
|
K
G
x
S
L
x
I
S
x
R
F
x
I
A
x
M
G
x
T
G
|
G
Q
x
M
T
x
A
H
x
P
V
|
V
Q
x
T
K
x
N
Y
|
Y
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
L
x
N
R
|
R
H
|
H
I
x
L
G
x
T
E
|
E
G
x
A
E
x
I
L
|
L
Q
x
W
P
x
D
D
x
Q
-
x
M
-
x
P
-
x
Y
-
x
L
-
x
S
-
x
K
V
|
V
I
x
M
I
x
N
S
x
I
H
x
E
H
x
V
L
x
I
P
x
T
L
|
L
A
x
D
E
x
Q
A
|
A
A
x
P
R
x
D
G
|
G
Y
|
Y
E
x
A
I
x
K
F
|
F
S
x
D
K
|
K

Sites not aligning to the query:

O58389 L-threonine 3-dehydrogenase; L-ThrDH; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see 2 papers)
31% identity, 87% coverage: 17:358/394 of query aligns to 24:320/348 of O58389

query
sites
O58389
V
 
V
P
 
P
D
 
K
P
 
P
A
 
G
I
 
-
Q
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
T
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
L
 
I
Y
 
Y
R
 
E
G
 
W
K
 
N
M
 
E
P
 
W
A
 
A
-
 
Q
-
 
S
-
 
R
M
 
I
E
 
K
H
 
P
G
 
P
D
 
Q
I
 
I
L
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
M
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
A
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
G
V
 
V
T
 
E
K
 
G
V
 
I
R
 
E
K
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
I
 
S
V
 
V
P
 
E
F
 
T
V
 
H
I
 
I
A
 
V
C
|
C
G
 
G
E
 
K
C
|
C
F
 
Y
F
 
A
C
|
C
H
 
R
R
 
R
E
 
G
L
 
Q
Y
 
Y
S
 
H
A
 
V
C
|
C
E
 
Q
T
 
N
T
 
T
N
 
K
P
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
I
K
 
F
G
 
G
I
 
V
R
 
D
S
 
T
G
 
D
A
 
G
A
 
V
F
 
F
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
R
 
V
V
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
Q
N
 
N
V
 
I
G
 
-
P
 
-
F
 
W
K
 
K
V
 
N
P
 
P
G
 
K
S
 
S
L
 
I
A
 
P
D
 
P
E
 
E
R
 
Y
V
 
A
L
 
T
F
 
-
L
 
L
T
 
Q
D
x
E
I
 
P
L
 
L
P
 
G
T
 
N
G
 
A
Y
 
V
Q
 
D
A
 
T
A
 
V
L
 
L
N
 
-
A
 
A
G
 
G
I
 
P
T
 
I
R
 
S
G
 
G
S
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
L
I
 
I
F
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
x
L
G
 
G
L
 
L
M
 
L
T
 
G
A
 
I
A
 
A
C
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
Y
T
 
P
V
 
V
F
 
I
M
 
V
V
 
S
D
x
E
R
 
P
H
 
S
P
 
D
Y
 
F
R
|
R
L
 
R
E
 
E
F
 
L
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
T
 
V
Y
 
G
G
 
A
A
 
D
I
 
Y
P
 
V
L
 
I
N
 
N
I
 
P
E
 
F
K
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
V
A
 
V
E
 
K
E
 
E
I
 
V
I
 
M
K
 
D
A
 
I
T
 
T
G
 
D
R
 
G
R
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
F
F
 
L
E
 
E
A
 
F
K
 
S
G
 
G
S
 
A
P
 
P
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
E
Q
 
Q
C
 
G
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
T
R
 
P
G
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
S
 
S
V
 
L
P
x
L
G
|
G
V
x
L
Y
 
Y
A
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
V
H
 
T
A
 
I
F
 
D
P
 
F
W
 
N
G
 
N
D
 
L
A
 
I
F
 
I
E
 
F
K
 
K
G
 
A
L
 
L
S
 
T
F
 
I
A
 
Y
G
 
G
-
x
I
G
x
T
Q
 
G
T
x
R
H
 
H
V
 
L
Q
 
W
K
 
E
Y
 
T
L
 
W
P
 
Y
D
 
T
L
 
V
L
 
S
R
 
R
H
 
L
I
 
L
G
 
Q
E
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
L
Q
 
N
P
 
L
D
 
D
V
 
P
I
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H

2dfvA Hyperthermophilic threonine dehydrogenase from pyrococcus horikoshii (see paper)
31% identity, 87% coverage: 17:358/394 of query aligns to 22:318/346 of 2dfvA

query
sites
2dfvA
V
 
V
P
 
P
D
 
K
P
 
P
A
 
G
I
 
-
Q
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
T
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
L
 
I
Y
 
Y
R
 
E
G
 
W
K
 
N
M
 
E
P
 
W
A
 
A
-
 
Q
-
 
S
-
 
R
M
 
I
E
 
K
H
 
P
G
 
P
D
 
Q
I
 
I
L
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
M
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
A
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
G
V
 
V
T
 
E
K
 
G
V
 
I
R
 
E
K
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
I
 
S
V
 
V
P
 
E
F
 
T
V
 
H
I
 
I
A
 
V
C
|
C
G
 
G
E
 
K
C
|
C
F
 
Y
F
 
A
C
|
C
H
 
R
R
 
R
E
 
G
L
 
Q
Y
 
Y
S
 
H
A
 
V
C
|
C
E
 
Q
T
 
N
T
 
T
N
x
K
P
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
I
K
 
F
G
 
G
I
 
V
R
 
D
S
 
T
G
 
D
A
 
G
A
 
V
F
 
F
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
R
 
V
V
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
Q
N
 
N
V
 
I
G
 
-
P
 
-
F
 
W
K
 
K
V
 
N
P
 
P
G
 
K
S
 
S
L
 
I
A
 
P
D
 
P
E
 
E
R
 
Y
V
 
A
L
 
T
F
 
-
L
 
L
T
 
Q
D
 
E
I
x
P
L
 
L
P
 
G
T
 
N
G
x
A
Y
 
V
Q
 
D
A
 
T
A
 
V
L
 
L
N
 
-
A
 
A
G
 
G
I
 
P
T
 
I
R
 
S
G
 
G
S
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
L
I
 
I
F
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
x
L
G
 
G
L
 
L
M
 
L
T
 
G
A
 
I
A
 
A
C
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
Y
T
 
P
V
 
V
F
 
I
M
 
V
V
 
S
D
x
E
R
x
P
H
 
S
P
 
D
Y
 
F
R
|
R
L
 
R
E
 
E
F
 
L
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
T
 
V
Y
 
G
G
 
A
A
 
D
I
 
Y
P
 
V
L
 
I
N
 
N
I
 
P
E
 
F
K
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
V
A
 
V
E
 
K
E
 
E
I
 
V
I
 
M
K
 
D
A
 
I
T
 
T
G
 
D
R
 
G
R
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
F
F
 
L
E
 
E
A
x
F
K
x
S
G
 
G
S
x
A
P
 
P
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
E
Q
 
Q
C
 
G
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
T
R
 
P
G
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
S
 
S
V
 
L
P
x
L
G
|
G
V
x
L
Y
 
Y
A
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
V
H
 
T
A
 
I
F
 
D
P
 
F
W
 
N
G
 
N
D
 
L
A
 
I
F
 
I
E
 
F
K
 
K
G
 
A
L
 
L
S
 
T
F
 
I
A
 
Y
G
 
G
-
x
I
G
x
T
Q
 
G
T
 
R
H
 
H
V
 
L
Q
 
W
K
 
E
Y
 
T
L
 
W
P
 
Y
D
 
T
L
 
V
L
 
S
R
 
R
H
 
L
I
 
L
G
 
Q
E
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
L
Q
 
N
P
 
L
D
 
D
V
 
P
I
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H

Sites not aligning to the query:

2ejvA Crystal structure of threonine 3-dehydrogenase complexed with NAD+
29% identity, 94% coverage: 17:386/394 of query aligns to 20:341/343 of 2ejvA

query
sites
2ejvA
V
 
V
P
 
P
D
 
E
P
 
P
A
 
G
I
 
-
Q
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
L
 
I
Y
 
W
R
 
-
G
 
-
K
 
K
M
 
W
P
 
D
A
 
A
M
 
W
E
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
R
I
 
I
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
V
L
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
M
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
G
V
 
V
T
 
R
K
 
R
V
 
P
R
 
Q
K
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
I
 
S
V
 
L
P
 
E
F
 
S
V
 
H
I
 
I
A
 
V
C
|
C
G
 
H
E
 
A
C
|
C
F
 
P
F
 
A
C
|
C
H
 
R
R
 
T
E
 
G
L
 
N
Y
 
Y
S
 
H
A
 
V
C
|
C
E
 
L
T
 
N
T
 
T
N
x
Q
P
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
V
S
 
D
H
 
R
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
V
V
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
A
G
 
-
P
 
-
F
 
W
K
 
V
V
 
N
P
 
P
G
 
K
S
 
D
L
 
L
A
 
P
D
 
F
E
 
E
R
 
V
V
 
A
L
 
A
F
 
I
L
 
L
T
 
E
D
x
P
I
 
F
L
 
G
P
 
N
T
x
A
G
 
V
Y
 
H
Q
 
T
A
 
V
A
 
Y
L
 
A
N
 
G
A
 
S
G
 
G
I
 
V
T
 
S
R
 
-
G
 
G
S
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
L
I
 
I
F
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
x
I
G
 
G
L
 
L
M
 
M
T
 
A
A
 
A
A
 
M
C
 
V
A
 
V
R
 
R
L
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
G
T
 
P
V
 
I
F
 
L
M
 
V
V
x
S
D
|
D
R
x
P
H
 
N
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
L
 
L
E
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
R
A
 
-
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
P
L
 
Y
N
 
A
I
 
D
E
 
R
K
 
L
Q
 
V
D
 
N
P
 
P
A
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
D
I
 
L
K
 
L
A
 
E
T
 
V
G
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
V
K
 
T
G
 
G
S
 
S
P
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
A
 
L
M
 
L
A
 
E
W
x
F
A
x
S
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
S
x
N
S
 
E
E
 
A
A
|
A
M
 
I
R
 
H
Q
 
Q
C
 
G
I
 
L
A
 
M
A
 
A
V
 
L
R
 
I
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
A
S
 
R
V
 
I
P
x
L
G
|
G
V
x
I
Y
 
P
A
 
S
G
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
R
A
 
F
F
 
D
P
 
L
W
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
L
F
 
V
E
 
M
K
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
T
F
 
A
A
 
F
G
 
G
-
 
I
-
 
A
G
 
G
Q
 
R
T
 
R
H
 
L
V
 
W
Q
 
Q
K
 
T
Y
 
W
L
 
M
P
 
Q
-
 
G
D
 
T
L
 
A
L
 
L
R
 
V
H
 
Y
I
 
S
G
 
G
E
 
R
G
 
V
E
 
D
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
D
 
-
V
 
-
I
 
L
I
 
L
S
 
T
H
 
H
H
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
R
A
 
Y
A
 
R
R
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
G
I
 
L
F
 
L
S
 
A
K
 
S
K
 
G
E
 
Q
D
 
-
N
 
-
C
 
A
R
 
V
K
|
K
V
 
V
V
 
I
L
 
L
T
 
D
P
 
P

2dq4A Crystal structure of threonine 3-dehydrogenase
29% identity, 94% coverage: 17:386/394 of query aligns to 20:341/343 of 2dq4A

query
sites
2dq4A
V
 
V
P
 
P
D
 
E
P
 
P
A
 
G
I
 
-
Q
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
L
 
I
Y
 
W
R
 
-
G
 
-
K
 
K
M
 
W
P
 
D
A
 
A
M
 
W
E
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
R
I
 
I
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
V
L
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
M
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
G
V
 
V
T
 
R
K
 
R
V
 
P
R
 
Q
K
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
I
 
S
V
 
L
P
 
E
F
 
S
V
 
H
I
 
I
A
 
V
C
|
C
G
 
H
E
 
A
C
|
C
F
 
P
F
 
A
C
|
C
H
 
R
R
 
T
E
 
G
L
 
N
Y
 
Y
S
 
H
A
 
V
C
|
C
E
 
L
T
 
N
T
 
T
N
x
Q
P
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
V
S
 
D
H
 
R
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
V
V
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
A
G
 
-
P
 
-
F
 
W
K
 
V
V
 
N
P
 
P
G
 
K
S
 
D
L
 
L
A
 
P
D
 
F
E
 
E
R
 
V
V
 
A
L
 
A
F
 
I
L
 
L
T
 
E
D
x
P
I
 
F
L
 
G
P
 
N
T
x
A
G
 
V
Y
 
H
Q
 
T
A
 
V
A
 
Y
L
 
A
N
 
G
A
 
S
G
 
G
I
 
V
T
 
S
R
 
-
G
 
G
S
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
L
I
 
I
F
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
M
T
 
A
A
 
A
A
 
M
C
 
V
A
 
V
R
 
R
L
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
G
T
 
P
V
 
I
F
 
L
M
 
V
V
 
S
D
 
D
R
 
P
H
 
N
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
E
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
R
A
 
-
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
P
L
 
Y
N
 
A
I
 
D
E
 
R
K
 
L
Q
 
V
D
 
N
P
 
P
A
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
D
I
 
L
K
 
L
A
 
E
T
 
V
G
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
V
K
 
T
G
 
G
S
 
S
P
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
A
 
L
M
 
L
A
 
E
W
 
F
A
 
S
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
N
S
 
E
E
 
A
A
 
A
M
 
I
R
 
H
Q
 
Q
C
 
G
I
 
L
A
 
M
A
 
A
V
 
L
R
 
I
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
A
S
 
R
V
 
I
P
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
P
A
 
S
G
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
R
A
 
F
F
 
D
P
 
L
W
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
L
F
 
V
E
 
M
K
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
T
F
 
A
A
 
F
G
 
G
-
 
I
-
 
A
G
 
G
Q
 
R
T
 
R
H
 
L
V
 
W
Q
 
Q
K
 
T
Y
 
W
L
 
M
P
 
Q
-
 
G
D
 
T
L
 
A
L
 
L
R
 
V
H
 
Y
I
 
S
G
 
G
E
 
R
G
 
V
E
 
D
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
D
 
-
V
 
-
I
 
L
I
 
L
S
 
T
H
 
H
H
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
R
A
 
Y
A
 
R
R
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
G
I
 
L
F
 
L
S
 
A
K
 
S
K
 
G
E
 
Q
D
 
-
N
 
-
C
 
A
R
 
V
K
|
K
V
 
V
V
 
I
L
 
L
T
 
D
P
 
P

Q5SKS4 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; EC 1.1.1.103 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
29% identity, 94% coverage: 17:386/394 of query aligns to 20:341/343 of Q5SKS4

query
sites
Q5SKS4
V
 
V
P
 
P
D
 
E
P
 
P
A
 
G
I
 
-
Q
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
L
L
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
L
 
I
Y
 
W
R
 
-
G
 
-
K
 
K
M
 
W
P
 
D
A
 
A
M
 
W
E
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
R
I
 
I
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
V
L
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
M
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
G
V
 
V
T
 
R
K
 
R
V
 
P
R
 
Q
K
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
I
 
S
V
 
L
P
 
E
F
 
S
V
 
H
I
 
I
A
 
V
C
|
C
G
 
H
E
 
A
C
|
C
F
 
P
F
 
A
C
|
C
H
 
R
R
 
T
E
 
G
L
 
N
Y
 
Y
S
 
H
A
 
V
C
|
C
E
 
L
T
 
N
T
 
T
N
 
Q
P
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
V
S
 
D
H
 
R
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
V
V
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
A
G
 
-
P
 
-
F
 
W
K
 
V
V
 
N
P
 
P
G
 
K
S
 
D
L
 
L
A
 
P
D
 
F
E
 
E
R
 
V
V
 
A
L
 
A
F
 
I
L
 
L
T
 
E
D
 
P
I
 
F
L
 
G
P
 
N
T
 
A
G
 
V
Y
 
H
Q
 
T
A
 
V
A
 
Y
L
 
A
N
 
G
A
 
S
G
 
G
I
 
V
T
 
S
R
 
-
G
 
G
S
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
L
I
 
I
F
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
x
I
G
 
G
L
 
L
M
 
M
T
 
A
A
 
A
A
 
M
C
 
V
A
 
V
R
 
R
L
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
G
T
 
P
V
 
I
F
 
L
M
 
V
V
 
S
D
|
D
R
 
P
H
 
N
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
L
 
L
E
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
R
A
 
-
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
P
L
 
Y
N
 
A
I
 
D
E
 
R
K
 
L
Q
 
V
D
 
N
P
 
P
A
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
D
I
 
L
K
 
L
A
 
E
T
 
V
G
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
V
K
 
T
G
 
G
S
 
S
P
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
A
 
L
M
 
L
A
 
E
W
 
F
A
 
S
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
N
S
 
E
E
 
A
A
 
A
M
 
I
R
 
H
Q
 
Q
C
 
G
I
 
L
A
 
M
A
 
A
V
 
L
R
 
I
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
A
S
 
R
V
 
I
P
x
L
G
|
G
V
x
I
Y
 
P
A
 
S
G
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
R
A
 
F
F
 
D
P
 
L
W
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
L
F
 
V
E
 
M
K
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
T
F
 
A
A
 
F
G
 
G
-
x
I
-
x
A
G
|
G
Q
 
R
T
 
R
H
 
L
V
 
W
Q
 
Q
K
 
T
Y
 
W
L
 
M
P
 
Q
-
 
G
D
 
T
L
 
A
L
 
L
R
 
V
H
 
Y
I
 
S
G
 
G
E
 
R
G
 
V
E
 
D
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
D
 
-
V
 
-
I
 
L
I
 
L
S
 
T
H
 
H
H
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
R
A
 
Y
A
 
R
R
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
G
I
 
L
F
 
L
S
 
A
K
 
S
K
 
G
E
 
Q
D
 
-
N
 
-
C
 
A
R
 
V
K
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
L
T
 
D
P
 
P

7aauC Crystal structure of nitrosoglutathione reductase from chlamydomonas reinhardtii in complex with NAD+ (see paper)
28% identity, 97% coverage: 2:385/394 of query aligns to 15:377/378 of 7aauC

query
sites
7aauC
F
 
I
A
 
A
L
 
W
T
 
E
Y
 
A
Q
 
K
G
 
K
P
 
P
F
 
L
D
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
T
E
 
V
R
 
T
V
 
V
P
 
A
D
 
P
P
 
P
A
 
G
I
 
-
Q
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
R
L
 
V
R
 
Q
V
 
I
T
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
L
C
|
C
G
 
Q
S
x
T
D
 
D
L
 
A
H
x
Y
L
 
T
Y
 
L
R
 
G
G
 
G
K
 
L
M
 
D
P
 
P
A
 
E
M
 
G
E
 
R
H
 
F
G
 
P
D
 
C
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
A
M
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
S
A
 
V
G
 
G
P
 
E
A
 
G
V
 
V
T
 
T
K
 
S
V
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
I
 
I
V
 
P
P
 
C
F
 
Y
V
 
Q
I
 
A
A
 
Y
C
|
C
G
 
G
E
 
E
C
|
C
F
 
K
F
 
F
C
|
C
H
 
K
R
 
H
E
 
P
L
 
E
Y
 
S
S
 
N
A
 
L
C
|
C
E
 
V
T
 
S
T
 
V
N
 
R
P
 
A
D
 
F
R
 
T
G
 
G
A
 
K
L
 
G
V
 
V
H
 
M
A
 
K
K
 
S
G
 
D
I
 
G
R
 
K
S
 
P
G
 
R
A
 
F
A
 
T
F
 
V
F
 
D
G
 
G
Y
 
K
S
 
P
H
 
I
L
 
Y
Y
 
H
G
 
F
G
 
M
I
 
G
P
 
T
G
 
S
G
 
T
Q
 
F
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
V
 
T
R
 
V
V
 
V
P
 
H
K
 
E
A
 
Q
N
 
S
V
 
V
G
 
A
P
 
K
F
 
I
K
 
D
V
 
V
P
 
N
G
 
A
S
 
P
L
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
C
F
 
L
L
 
L
T
 
G
D
x
C
I
 
G
L
 
V
P
 
S
T
|
T
G
 
G
Y
 
W
Q
 
G
A
 
A
A
 
V
L
 
F
N
 
N
-
 
T
A
 
A
G
 
K
I
 
V
T
 
T
R
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
F
 
F
G
|
G
A
 
L
G
|
G
P
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
A
T
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
R
V
 
I
F
 
I
M
 
A
V
 
V
D
|
D
R
x
I
H
 
D
P
 
P
Y
 
T
R
 
K
L
 
F
E
 
P
F
 
T
A
 
A
Q
 
K
-
 
E
-
 
F
-
 
G
A
 
A
T
 
T
Y
 
D
G
 
C
A
 
I
I
 
N
P
 
P
L
 
K
N
 
D
I
 
H
E
 
E
K
 
K
Q
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
I
E
 
Q
E
 
Q
I
 
V
I
 
I
K
 
V
A
 
E
T
 
M
G
 
T
R
 
E
R
 
W
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
Y
V
 
T
V
 
F
D
 
E
A
x
C
V
x
I
G
 
G
F
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
N
T
 
T
A
 
A
M
 
V
A
 
M
W
 
R
A
 
A
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
C
G
 
A
S
 
H
S
 
R
E
 
G
A
 
W
M
 
G
R
 
T
Q
 
S
C
 
V
I
 
I
A
x
V
A
x
G
V
|
V
R
 
A
R
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
E
V
 
I
Y
 
S
A
 
T
G
 
R
P
 
P
L
 
F
H
 
Q
A
 
L
F
 
V
P
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
R
W
 
W
G
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
K
 
M
G
 
G
L
 
T
S
x
A
F
|
F
A
 
G
G
 
G
G
 
Y
Q
 
K
T
 
S
H
 
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
-
Y
 
-
L
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
L
L
 
V
R
 
T
H
 
D
I
 
Y
G
 
M
E
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
T
Q
 
L
P
 
L
D
 
D
V
 
K
I
 
Y
I
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
N
L
 
M
P
 
K
L
 
F
A
 
D
E
 
Q
A
 
I
A
 
N
R
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
I
 
L
F
 
L
S
 
H
K
 
A
K
 
G
E
 
E
D
 
-
N
 
-
C
 
C
R
 
L
K
x
R
V
 
C
V
 
V
L
 
L
T
 
T

3fpcA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-294 of t. Brockii adh by e. Histolytica adh (see paper)
34% identity, 61% coverage: 25:264/394 of query aligns to 24:244/352 of 3fpcA

query
sites
3fpcA
P
 
P
D
 
F
D
 
D
V
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
R
V
 
P
T
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
H
|
H
L
 
T
Y
 
V
R
 
F
G
 
E
K
 
G
M
 
A
P
 
I
A
 
G
M
 
E
E
 
R
H
 
H
G
 
N
D
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
M
 
V
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
A
 
V
G
 
G
P
 
S
A
 
E
V
 
V
T
 
K
K
 
D
V
 
F
R
 
K
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
F
 
-
F
 
-
C
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
A
L
 
I
Y
 
T
S
 
P
A
x
D
C
 
W
E
 
R
T
|
T
T
 
S
N
 
E
P
x
V
D
 
Q
R
 
R
G
 
G
A
 
Y
L
 
H
V
 
Q
H
 
H
A
x
S
K
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
W
A
 
K
F
 
F
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
S
H
 
N
L
 
V
Y
 
K
G
 
D
G
 
G
I
 
V
P
 
F
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
Y
 
F
V
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
K
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
M
G
 
N
P
 
L
F
 
A
K
 
H
V
 
L
P
 
P
G
 
K
S
 
E
L
 
I
A
 
P
D
 
L
E
 
E
R
 
A
V
 
A
L
 
V
F
 
M
L
 
I
T
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
P
 
T
T
|
T
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
L
 
E
N
 
L
A
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
K
R
 
L
G
 
G
S
 
D
S
 
T
V
 
V
A
 
C
I
 
V
F
 
I
G
 
G
A
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
T
 
S
A
 
V
A
 
A
C
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
G
T
 
R
V
 
I
F
 
F
M
 
A
V
 
V
D
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
K
Y
 
H
R
 
C
L
 
C
E
 
D
F
 
I
A
 
A
Q
 
-
A
 
L
T
 
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
I
 
T
P
 
D
-
 
I
L
 
I
N
 
N
I
 
Y
E
 
K
K
 
N
Q
 
G
D
 
D
P
 
I
A
 
V
E
 
E
E
 
Q
I
 
I
I
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
D
R
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
I
A
 
A
V
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3fsrA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of t. Brockii adh by c. Beijerinckii adh (see paper)
31% identity, 71% coverage: 25:303/394 of query aligns to 24:263/352 of 3fsrA

query
sites
3fsrA
P
 
P
D
 
F
D
 
D
V
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
R
V
 
P
T
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
H
|
H
L
 
T
Y
 
V
R
 
F
G
 
E
K
 
G
M
 
A
P
 
I
A
 
G
M
 
E
E
 
R
H
 
H
G
 
N
D
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
M
 
V
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
A
 
V
G
 
G
P
 
S
A
 
E
V
 
V
T
 
K
K
 
D
V
 
F
R
 
K
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
F
 
-
F
 
-
C
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
A
L
 
I
Y
 
T
S
 
P
A
x
D
C
 
W
E
 
R
T
|
T
T
 
S
N
 
E
P
x
V
D
 
Q
R
 
R
G
 
G
A
 
Y
L
 
H
V
 
Q
H
 
H
A
x
S
K
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
W
A
 
K
F
 
F
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
S
H
 
N
L
 
V
Y
 
K
G
 
D
G
 
G
I
 
V
P
 
F
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
Y
 
F
V
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
K
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
M
G
 
N
P
 
L
F
 
A
K
 
H
V
 
L
P
 
P
G
 
K
S
 
E
L
 
I
A
 
P
D
 
L
E
 
E
R
 
A
V
 
A
L
 
V
F
 
M
L
 
I
T
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
P
 
T
T
|
T
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
L
 
E
N
 
L
A
 
A
G
 
D
I
 
I
T
 
Q
R
 
M
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
A
 
I
G
 
G
P
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
T
 
G
A
 
I
A
 
A
C
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
G
T
 
R
V
 
I
F
 
I
M
 
G
V
 
V
D
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
P
Y
 
I
R
 
C
L
 
V
E
 
E
F
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
-
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
I
 
T
P
 
D
-
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
Y
E
 
K
K
 
N
Q
 
G
D
 
H
P
 
I
A
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
I
 
M
K
 
K
A
 
L
T
 
T
G
 
N
R
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
R
V
 
V
V
 
I
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
M
E
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
G
S
 
S
E
 
E
A
 
T
M
 
L
R
 
S
Q
 
Q
C
 
A
I
 
V
A
 
S
A
 
M
V
 
V
R
 
K
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
I
V
 
I
S
 
S

Sites not aligning to the query:

6schC Nadh-dependent variant of cbadh (see paper)
32% identity, 70% coverage: 27:303/394 of query aligns to 26:263/355 of 6schC

query
sites
6schC
D
 
D
V
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
R
V
 
P
T
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
S
I
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
H
|
H
-
 
T
L
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
K
 
A
M
 
L
P
 
G
A
 
D
M
 
R
E
 
K
H
 
N
G
 
M
D
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
A
M
 
V
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
A
 
V
G
 
G
P
 
S
A
 
E
V
 
V
T
 
K
K
 
D
V
 
F
R
 
K
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
F
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
F
 
-
F
 
-
C
 
C
H
 
T
R
 
T
E
 
P
L
 
D
Y
 
W
S
 
R
A
 
S
C
 
L
E
 
E
T
 
V
T
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
Q
R
 
A
G
 
G
A
 
F
L
 
Q
V
 
Q
H
 
H
A
 
S
K
 
N
G
 
G
I
 
M
R
 
L
S
 
A
G
 
G
A
x
W
A
 
K
F
 
F
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
S
H
 
N
L
 
F
Y
 
K
G
 
D
G
 
G
I
 
V
P
 
F
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
Y
 
Y
V
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
K
 
D
A
 
A
N
 
D
V
 
M
G
 
N
P
 
L
F
 
A
K
 
I
V
 
L
P
 
P
G
 
K
S
 
D
L
 
M
A
 
P
D
 
L
E
 
E
R
 
N
V
 
A
L
 
V
F
 
M
L
 
I
T
 
T
D
|
D
I
 
M
L
 
M
P
 
T
T
|
T
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
L
 
E
N
 
L
A
 
A
G
 
D
I
 
I
T
 
Q
R
 
M
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
|
G
A
 
I
G
 
G
P
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
T
 
G
A
 
I
A
 
A
C
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
G
T
 
R
V
 
I
F
 
I
M
 
G
V
 
V
D
|
D
R
x
Y
H
x
R
P
 
P
Y
 
I
R
 
C
L
 
V
E
 
E
F
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
-
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
I
 
T
P
 
D
-
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
P
E
 
K
K
 
N
Q
 
G
D
 
H
P
 
I
A
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
I
 
M
K
 
K
A
 
L
T
 
T
G
 
N
R
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
R
V
 
V
V
 
I
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
M
E
x
A
G
|
G
G
|
G
S
 
G
S
 
S
E
 
E
A
 
T
M
 
L
R
 
S
Q
 
Q
C
 
A
I
 
V
A
 
S
A
 
M
V
 
V
R
 
K
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
I
V
 
I
S
 
S

Sites not aligning to the query:

4rquB Alcohol dehydrogenase crystal structure in complex with NAD (see paper)
28% identity, 89% coverage: 27:376/394 of query aligns to 32:365/375 of 4rquB

query
sites
4rquB
D
 
E
V
 
V
I
 
R
L
 
I
R
 
K
V
 
I
T
 
L
A
 
F
T
 
T
A
 
S
I
 
L
C
|
C
G
x
H
S
x
T
D
 
D
L
 
V
H
x
Y
L
 
F
Y
 
W
R
 
E
G
 
A
K
 
K
M
 
G
P
 
Q
A
 
T
M
 
P
E
 
L
H
 
F
G
 
P
D
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
M
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
S
A
 
V
G
 
G
P
 
E
A
 
G
V
 
V
T
 
T
K
 
D
V
 
L
R
 
Q
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
P
P
 
I
F
|
F
V
 
T
I
 
G
A
 
E
C
|
C
G
 
G
E
 
E
C
|
C
F
 
R
F
 
H
C
|
C
H
 
H
R
 
S
E
 
E
L
 
E
Y
 
S
S
 
N
A
 
M
C
|
C
E
 
D
T
 
L
-
 
L
-
x
R
T
 
I
N
 
N
P
 
T
D
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
H
A
 
D
K
 
G
G
 
E
I
 
S
R
 
R
S
 
F
G
 
S
A
 
I
A
 
N
F
 
G
F
 
K
G
 
P
Y
 
I
S
 
Y
H
 
H
L
 
F
Y
 
L
G
 
G
G
 
-
I
 
-
P
 
T
G
 
S
G
 
T
Q
 
F
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
V
 
T
R
 
V
V
 
V
P
 
H
K
 
S
A
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
A
P
 
K
F
 
I
K
 
N
V
 
P
P
 
D
G
 
A
S
 
P
L
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
C
F
 
I
L
 
V
T
 
S
D
x
C
I
 
G
L
 
L
P
 
S
T
|
T
G
 
G
Y
 
L
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
L
 
L
N
 
N
-
 
V
A
 
A
G
 
K
I
 
P
T
 
K
R
 
K
G
 
G
S
 
Q
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
L
G
|
G
P
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
E
C
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
I
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
R
V
 
I
F
 
I
M
 
G
V
 
V
D
|
D
R
x
F
H
 
N
P
 
S
Y
 
K
R
|
R
L
 
F
E
 
D
F
 
Q
A
 
A
Q
 
K
A
 
E
T
 
F
Y
 
G
G
 
V
A
 
T
I
 
E
P
 
C
L
 
V
N
 
N
I
 
P
E
 
K
K
 
D
Q
 
H
D
 
D
-
 
K
P
 
P
A
 
I
E
 
Q
E
 
Q
I
 
V
I
 
I
K
 
A
A
 
E
T
 
M
G
 
T
R
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
R
V
 
S
V
 
V
D
 
E
A
x
C
V
x
T
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
S
S
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
I
Q
 
Q
C
 
A
I
 
F
A
 
E
A
 
C
V
 
V
R
 
H
R
 
D
G
 
G
G
 
W
R
 
G
V
 
V
S
 
A
V
 
V
P
 
L
G
x
V
V
 
G
Y
 
V
A
 
P
G
 
S
P
 
K
L
 
D
H
 
D
A
 
A
F
 
F
P
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
F
W
 
L
G
 
N
D
 
E
A
 
R
F
 
T
E
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
T
S
 
F
F
|
F
A
 
-
G
 
-
G
 
G
Q
 
N
T
 
Y
H
 
K
V
 
P
Q
 
K
K
 
T
Y
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
G
L
 
V
L
 
V
R
 
E
H
 
K
I
 
Y
G
 
M
E
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
E
P
 
L
D
 
E
V
 
K
I
 
F
I
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
T
L
 
V
P
 
P
L
 
F
A
 
S
E
 
E
A
 
I
A
 
N
R
 
K
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
I
 
Y
F
 
M
S
 
L
K
 
K
K
 
G
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8conA Crystal structure of alcohol dehydrogenase from arabidopsis thaliana in complex with nadh (see paper)
28% identity, 89% coverage: 27:376/394 of query aligns to 36:369/379 of 8conA

query
sites
8conA
D
 
E
V
 
V
I
 
R
L
 
I
R
 
K
V
 
I
T
 
L
A
 
F
T
 
T
A
 
S
I
 
L
C
|
C
G
x
H
S
 
T
D
 
D
L
 
V
H
 
Y
L
 
F
Y
 
W
R
 
E
G
 
A
K
 
K
M
 
G
P
 
Q
A
 
T
M
 
P
E
 
L
H
 
F
G
 
P
D
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
M
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
S
A
 
V
G
 
G
P
 
E
A
 
G
V
 
V
T
 
T
K
 
D
V
 
L
R
 
Q
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
P
P
 
I
F
 
F
V
 
T
I
 
G
A
 
E
C
|
C
G
 
G
E
 
E
C
|
C
F
 
R
F
 
H
C
|
C
H
 
H
R
 
S
E
 
E
L
 
E
Y
 
S
S
 
N
A
 
M
C
|
C
E
 
D
T
 
L
-
 
L
-
 
R
T
 
I
N
 
N
P
 
T
D
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
H
A
 
D
K
 
G
G
 
E
I
 
S
R
 
R
S
 
F
G
 
S
A
 
I
A
 
N
F
 
G
F
 
K
G
 
P
Y
 
I
S
 
Y
H
 
H
L
 
F
Y
 
L
G
 
G
G
 
-
I
 
-
P
 
T
G
 
S
G
 
T
Q
 
F
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
V
 
T
R
 
V
V
 
V
P
 
H
K
 
S
A
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
A
P
 
K
F
 
I
K
 
N
V
 
P
P
 
D
G
 
A
S
 
P
L
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
C
F
 
I
L
 
V
T
 
S
D
x
C
I
 
G
L
 
L
P
 
S
T
|
T
G
 
G
Y
 
L
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
L
 
L
N
 
N
-
 
V
A
 
A
G
 
K
I
 
P
T
 
K
R
 
K
G
 
G
S
 
Q
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
|
G
A
 
L
G
|
G
P
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
E
C
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
I
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
R
V
 
I
F
 
I
M
 
G
V
 
V
D
|
D
R
x
F
H
 
N
P
 
S
Y
 
K
R
 
R
L
 
F
E
 
D
F
 
Q
A
 
A
Q
 
K
A
 
E
T
 
F
Y
 
G
G
 
V
A
 
T
I
 
E
P
 
C
L
 
V
N
 
N
I
 
P
E
 
K
K
 
D
Q
 
H
D
 
D
-
 
K
P
 
P
A
 
I
E
 
Q
E
 
Q
I
 
V
I
 
I
K
 
A
A
 
E
T
 
M
G
 
T
R
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
R
V
 
S
V
 
V
D
 
E
A
x
C
V
x
T
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
S
S
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
I
Q
 
Q
C
 
A
I
 
F
A
 
E
A
 
C
V
 
V
R
 
H
R
 
D
G
 
G
G
 
W
R
 
G
V
 
V
S
 
A
V
 
V
P
 
L
G
x
V
V
x
G
Y
x
V
A
 
P
G
 
S
P
 
K
L
 
D
H
 
D
A
 
A
F
 
F
P
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
F
W
 
L
G
 
N
D
 
E
A
 
R
F
 
T
E
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
T
S
x
F
F
|
F
A
 
-
G
 
-
G
 
G
Q
 
N
T
 
Y
H
 
K
V
 
P
Q
 
K
K
 
T
Y
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
G
L
 
V
L
 
V
R
 
E
H
 
K
I
 
Y
G
 
M
E
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
E
P
 
L
D
 
E
V
 
K
I
 
F
I
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
T
L
 
V
P
 
P
L
 
F
A
 
S
E
 
E
A
 
I
A
 
N
R
 
K
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
I
 
Y
F
 
M
S
 
L
K
 
K
K
 
G
E
 
E

P06525 Alcohol dehydrogenase class-P; AtADH; EC 1.1.1.1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 4 papers)
28% identity, 89% coverage: 27:376/394 of query aligns to 36:369/379 of P06525

query
sites
P06525
D
 
E
V
 
V
I
 
R
L
 
I
R
 
K
V
 
I
T
 
L
A
 
F
T
 
T
A
 
S
I
 
L
C
|
C
G
 
H
S
x
T
D
|
D
L
 
V
H
 
Y
L
 
F
Y
 
W
R
 
E
G
 
A
K
 
K
M
 
G
P
 
Q
A
 
T
M
 
P
E
 
L
H
 
F
G
 
P
D
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
M
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
S
A
 
V
G
 
G
P
 
E
A
 
G
V
 
V
T
 
T
K
 
D
V
 
L
R
 
Q
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
P
P
 
I
F
 
F
V
 
T
I
 
G
A
 
E
C
|
C
G
 
G
E
 
E
C
|
C
F
 
R
F
 
H
C
|
C
H
 
H
R
 
S
E
 
E
L
 
E
Y
 
S
S
 
N
A
 
M
C
|
C
E
 
D
T
 
L
-
 
L
-
 
R
T
 
I
N
 
N
P
 
T
D
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
H
A
 
D
K
 
G
G
 
E
I
 
S
R
 
R
S
 
F
G
 
S
A
 
I
A
 
N
F
 
G
F
 
K
G
 
P
Y
 
I
S
 
Y
H
 
H
L
 
F
Y
 
L
G
 
G
G
 
-
I
 
-
P
 
T
G
 
S
G
 
T
Q
 
F
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
V
 
T
R
 
V
V
 
V
P
 
H
K
 
S
A
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
A
P
 
K
F
 
I
K
 
N
V
 
P
P
 
D
G
 
A
S
 
P
L
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
C
F
 
I
L
 
V
T
 
S
D
x
C
I
 
G
L
 
L
P
 
S
T
 
T
G
 
G
Y
 
L
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
L
 
L
N
 
N
-
 
V
A
 
A
G
 
K
I
 
P
T
 
K
R
 
K
G
 
G
S
 
Q
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
L
G
 
G
P
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
L
M
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
E
C
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
I
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
R
V
 
I
F
 
I
M
 
G
V
 
V
D
|
D
R
 
F
H
 
N
P
 
S
Y
 
K
R
|
R
L
 
F
E
 
D
F
 
Q
A
 
A
Q
 
K
A
 
E
T
 
F
Y
 
G
G
 
V
A
 
T
I
 
E
P
 
C
L
 
V
N
 
N
I
 
P
E
 
K
K
 
D
Q
 
H
D
 
D
-
 
K
P
 
P
A
 
I
E
 
Q
E
 
Q
I
 
V
I
 
I
K
 
A
A
 
E
T
 
M
G
 
T
R
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
R
V
 
S
V
 
V
D
 
E
A
 
C
V
x
T
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
S
S
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
I
Q
 
Q
C
 
A
I
 
F
A
 
E
A
 
C
V
 
V
R
 
H
R
 
D
G
 
G
G
 
W
R
 
G
V
 
V
S
 
A
V
 
V
P
 
L
G
x
V
V
 
G
Y
x
V
A
 
P
G
 
S
P
 
K
L
 
D
H
 
D
A
 
A
F
 
F
P
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
F
W
 
L
G
 
N
D
 
E
A
 
R
F
 
T
E
 
L
K
 
K
G
 
G
L
x
T
S
 
F
F
|
F
A
 
-
G
 
-
G
 
G
Q
 
N
T
 
Y
H
 
K
V
 
P
Q
 
K
K
 
T
Y
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
G
L
 
V
L
 
V
R
 
E
H
 
K
I
 
Y
G
 
M
E
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
E
P
 
L
D
 
E
V
 
K
I
 
F
I
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
T
L
 
V
P
 
P
L
 
F
A
 
S
E
 
E
A
 
I
A
 
N
R
 
K
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
I
 
Y
F
 
M
S
 
L
K
 
K
K
 
G
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P80360 Alcohol dehydrogenase class-3; Alcohol dehydrogenase class-III; Glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase; FALDH; FDH; GSH-FDH; S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase; EC 1.1.1.1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.284 from Myxine glutinosa (Atlantic hagfish) (see 2 papers)
28% identity, 88% coverage: 27:372/394 of query aligns to 36:364/376 of P80360

query
sites
P80360
D
 
E
V
 
V
I
 
R
L
 
M
R
 
K
V
 
V
T
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
V
C
 
C
G
 
H
S
 
T
D
 
D
L
 
A
H
 
Y
L
 
T
Y
 
L
R
 
S
G
 
G
K
 
V
M
 
D
P
 
P
A
 
E
M
 
G
E
 
S
H
 
F
G
 
P
D
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
G
M
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
S
A
 
V
G
 
G
P
 
E
A
 
G
V
 
V
T
 
T
K
 
K
V
 
F
R
 
K
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
S
V
 
V
I
 
I
V
 
P
P
 
L
F
 
Y
V
 
I
I
 
P
A
 
Q
C
 
C
G
 
G
E
 
E
C
 
C
F
 
K
F
 
F
C
 
C
H
 
L
R
 
N
E
 
P
L
 
K
Y
 
T
S
 
N
A
 
L
C
 
C
E
 
Q
T
 
K
T
 
I
N
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
M
-
 
M
P
 
P
D
 
D
R
 
G
G
 
T
A
 
S
L
 
R
V
 
L
H
 
T
A
 
C
K
 
R
G
 
G
I
 
-
R
 
K
S
 
S
G
 
L
A
 
Y
A
 
H
F
 
F
F
 
M
G
 
G
Y
 
A
S
 
S
H
 
T
L
 
F
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
R
 
V
V
 
V
P
 
-
K
 
-
A
 
A
N
 
D
V
 
I
G
 
S
P
 
L
F
 
C
K
 
R
V
 
V
P
 
A
G
 
P
S
 
E
L
 
A
A
 
P
D
 
P
E
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
C
F
 
L
L
 
L
T
 
G
D
 
C
I
 
G
L
 
V
P
 
S
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
G
A
 
A
A
 
P
L
 
L
N
 
N
-
 
T
A
 
A
G
 
K
I
 
V
T
 
E
R
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
T
V
 
C
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
L
G
 
G
P
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
A
T
 
A
A
 
I
A
 
M
C
 
G
A
 
C
R
 
R
L
 
V
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
R
V
 
I
F
 
I
M
 
A
V
 
I
D
 
D
R
 
R
H
 
N
P
 
P
Y
 
D
R
 
K
L
 
F
E
 
E
F
 
K
A
 
A
Q
 
R
-
 
I
-
 
F
-
 
G
A
 
A
T
 
T
Y
 
D
G
 
C
A
 
V
I
 
V
P
 
P
L
 
D
N
 
A
I
 
S
E
 
D
K
 
K
Q
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
I
E
 
S
E
 
Q
I
 
V
I
 
L
K
 
G
A
 
E
T
 
M
G
 
T
R
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
Y
V
 
T
V
 
F
D
 
E
A
 
C
V
 
V
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
N
S
 
V
E
 
G
A
 
I
M
 
M
R
 
R
Q
 
A
C
 
A
I
 
L
A
 
E
A
 
S
V
 
C
R
 
H
R
 
K
G
 
G
G
 
W
R
 
G
V
 
V
S
 
S
V
 
V
P
 
I
-
 
L
G
 
G
V
 
V
Y
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
P
 
E
L
 
I
H
 
S
A
 
T
F
 
R
P
 
P
W
 
F
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
T
G
 
G
D
 
R
A
 
T
F
 
W
E
 
-
K
 
K
G
 
G
L
 
A
S
 
A
F
 
F
A
 
G
G
 
G
G
 
W
Q
 
K
T
 
S
H
 
-
V
 
-
Q
 
V
K
 
E
Y
 
S
L
 
V
P
 
P
D
 
K
L
 
L
L
 
V
R
 
D
H
 
D
I
 
Y
G
 
M
E
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
I
Q
 
M
P
 
V
D
 
D
V
 
E
I
 
F
I
 
V
S
 
S
H
 
H
H
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
A
 
D
E
 
S
A
 
I
A
 
N
R
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
I
 
L
F
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_028988713.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_028988713.1
MFALTYQGPFDVRVERVPDPAIQEPDDVILRVTATAICGSDLHLYRGKMPAMEHGDILGH
EFMGVVEEAGPAVTKVRKGDRVIVPFVIACGECFFCHRELYSACETTNPDRGALVHAKGI
RSGAAFFGYSHLYGGIPGGQAEYVRVPKANVGPFKVPGSLADERVLFLTDILPTGYQAAL
NAGITRGSSVAIFGAGPVGLMTAACARLLGADTVFMVDRHPYRLEFAQATYGAIPLNIEK
QDPAEEIIKATGRRGVDAVVDAVGFEAKGSPVETAMAWAKLEGGSSEAMRQCIAAVRRGG
RVSVPGVYAGPLHAFPWGDAFEKGLSFAGGQTHVQKYLPDLLRHIGEGELQPDVIISHHL
PLAEAARGYEIFSKKEDNCRKVVLTPAGPGAATH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory