SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_028989441.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_028989441.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

7wxiA Gpr domain of drosophila p5cs filament with glutamate and atpgammas (see paper)
38% identity, 98% coverage: 6:419/422 of query aligns to 1:409/430 of 7wxiA

query
sites
7wxiA
P
 
P
V
 
V
E
 
E
T
 
V
Q
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
N
A
 
A
R
 
R
A
 
T
A
 
G
A
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
M
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
L
D
 
T
T
 
P
R
 
A
A
 
Q
K
 
R
N
 
A
E
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
N
G
 
T
M
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
S
D
 
R
S
 
E
E
 
K
E
 
F
I
 
I
Q
 
L
K
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
A
N
 
E
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
P
S
 
L
L
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
S
L
 
L
S
 
N
E
 
P
P
 
A
R
 
K
L
 
L
Q
 
K
A
 
N
M
 
L
A
 
S
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
D
P
 
S
D
 
H
P
 
K
-
 
N
V
 
V
G
 
G
E
 
R
I
 
V
A
 
L
D
 
R
L
 
R
K
 
T
F
 
R
R
 
L
P
 
A
S
 
D
G
 
Q
I
 
L
Q
 
E
V
 
L
G
 
K
K
 
Q
M
 
V
R
 
T
M
 
V
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
L
M
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
A
 
P
D
 
Q
A
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L
C
 
A
L
 
M
K
 
A
S
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
A
H
 
H
S
 
S
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
L
L
 
V
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
T
A
 
V
R
 
G
L
 
A
P
 
E
L
 
-
D
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
S
T
 
T
P
 
-
D
 
-
R
 
R
A
 
E
A
 
E
V
 
I
G
 
S
A
 
D
M
 
L
I
 
L
R
 
S
M
 
M
R
 
E
G
 
N
L
 
H
I
 
I
D
 
D
I
 
L
I
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
S
K
 
S
S
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
S
I
 
I
S
 
Q
A
 
Q
E
 
Q
A
 
S
T
 
L
-
 
H
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
K
 
G
H
 
H
L
 
A
H
 
E
G
 
G
N
 
V
C
 
C
H
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
E
 
R
F
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
A
V
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
V
 
C
Q
 
D
R
 
Y
L
 
P
G
 
A
T
 
A
C
 
C
N
 
N
T
 
A
A
 
M
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
Q
 
E
-
 
D
A
 
L
V
 
M
A
 
S
G
 
G
D
 
A
M
 
I
L
 
F
P
 
G
P
 
D
I
 
V
A
 
C
A
 
N
A
 
M
L
 
L
R
 
K
E
 
R
K
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
K
L
 
I
R
 
Y
G
 
A
C
 
G
P
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
N
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
K
 
T
L
 
F
L
 
G
P
 
P
D
 
P
L
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
S
T
 
L
E
 
K
E
 
H
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
A
I
 
L
-
 
E
I
 
C
S
 
C
V
 
I
K
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
P
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
A
M
 
I
D
 
N
H
 
H
I
 
I
A
 
H
Q
 
T
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
S
H
 
H
S
 
T
E
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
N
Y
 
D
S
 
A
H
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
F
 
F
L
 
L
R
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
A
S
 
C
V
 
V
M
 
F
V
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
S
R
|
R
F
 
F
A
 
A
D
|
D
G
 
G
F
 
F
E
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
S
T
 
T
D
 
A
K
 
R
L
 
I
H
 
H
V
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
T
Q
 
T
K
 
K
W
 
W
I
 
I
V
 
L
L
 
E
G
 
G
D
 
Q
G
 
D
H
 
H

7wxgA Gpr domain closed form of drosophila p5cs filament with glutamate, atp, and NADPH (see paper)
38% identity, 98% coverage: 6:419/422 of query aligns to 1:409/430 of 7wxgA

query
sites
7wxgA
P
 
P
V
 
V
E
 
E
T
 
V
Q
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
N
A
 
A
R
 
R
A
 
T
A
 
G
A
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
M
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
L
D
 
T
T
 
P
R
 
A
A
 
Q
K
 
R
N
 
A
E
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
N
G
 
T
M
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
S
D
 
R
S
 
E
E
 
K
E
 
F
I
 
I
Q
 
L
K
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
A
N
 
E
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
P
S
 
L
L
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
S
L
 
L
S
 
N
E
 
P
P
 
A
R
 
K
L
 
L
Q
 
K
A
 
N
M
 
L
A
 
S
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
D
P
 
S
D
 
H
P
 
K
-
 
N
V
 
V
G
 
G
E
 
R
I
 
V
A
 
L
D
 
R
L
 
R
K
 
T
F
 
R
R
 
L
P
 
A
S
 
D
G
 
Q
I
 
L
Q
 
E
V
 
L
G
 
K
K
 
Q
M
 
V
R
 
T
M
 
V
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
L
M
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
|
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
A
 
P
D
 
Q
A
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L
C
 
A
L
 
M
K
 
A
S
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
A
H
 
H
S
 
S
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
L
L
 
V
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
T
A
 
V
R
 
G
L
 
A
P
 
E
L
 
-
D
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
S
T
 
T
P
 
-
D
 
-
R
|
R
A
 
E
A
 
E
V
 
I
G
 
S
A
 
D
M
 
L
I
 
L
R
 
S
M
 
M
R
 
E
G
 
N
L
 
H
I
 
I
D
 
D
I
 
L
I
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
|
G
G
x
S
K
x
S
S
 
D
L
|
L
I
 
V
E
 
R
R
 
S
I
 
I
S
 
Q
A
 
Q
E
 
Q
A
 
S
T
 
L
-
 
H
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
K
 
G
H
 
H
L
 
A
H
 
E
G
|
G
N
 
V
C
 
C
H
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
E
 
R
F
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
A
V
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
V
 
C
Q
 
D
R
 
Y
L
 
P
G
 
A
T
 
A
C
 
C
N
 
N
T
 
A
A
 
M
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
Q
 
E
-
 
D
A
 
L
V
 
M
A
 
S
G
 
G
D
 
A
M
 
I
L
 
F
P
 
G
P
 
D
I
 
V
A
 
C
A
 
N
A
 
M
L
 
L
R
 
K
E
 
R
K
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
K
L
 
I
R
 
Y
G
 
A
C
 
G
P
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
N
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
K
 
T
L
 
F
L
 
G
P
 
P
D
 
P
L
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
S
T
 
L
E
 
K
E
 
H
D
x
E
Y
 
Y
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
A
I
 
L
-
 
E
I
 
C
S
 
C
V
 
I
K
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
P
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
A
M
 
I
D
 
N
H
 
H
I
 
I
A
 
H
Q
 
T
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
S
H
 
H
S
 
T
E
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
N
Y
 
D
S
 
A
H
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
F
 
F
L
 
L
R
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
A
S
 
C
V
 
V
M
 
F
V
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
S
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
S
T
 
T
D
 
A
K
 
R
L
 
I
H
 
H
V
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
T
Q
 
T
K
 
K
W
 
W
I
 
I
V
 
L
L
 
E
G
 
G
D
 
Q
G
 
D
H
 
H

4jbeB 1.95 angstrom crystal structure of gamma-glutamyl phosphate reductase from saccharomonospora viridis.
35% identity, 97% coverage: 7:415/422 of query aligns to 4:408/412 of 4jbeB

query
sites
4jbeB
V
 
V
E
 
A
T
 
K
Q
 
A
V
 
V
R
 
E
G
 
E
L
 
C
A
 
A
E
 
R
R
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
P
V
 
S
L
 
L
Q
 
S
Q
 
G
A
 
A
D
 
P
T
 
D
R
 
T
A
 
A
K
 
I
N
 
D
E
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
S
M
 
M
A
 
A
E
 
D
F
 
R
I
 
L
V
 
L
R
 
A
D
 
H
S
 
R
E
 
D
E
 
A
I
 
V
Q
 
L
K
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
A
K
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
A
N
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
L
 
M
D
 
S
A
 
A
A
 
G
S
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
T
L
 
I
S
 
T
E
 
E
P
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
T
A
 
D
M
 
M
A
 
A
E
 
D
G
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
A
P
 
P
D
 
H
P
 
P
V
 
Q
G
 
R
E
 
T
I
 
V
A
 
-
D
 
E
L
 
L
K
 
S
F
 
T
R
 
L
P
 
D
S
 
G
G
 
G
I
 
L
Q
 
R
V
 
L
G
 
V
K
 
E
M
 
R
R
 
R
M
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
A
I
 
N
Y
 
Y
E
 
E
S
 
A
R
 
R
P
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
A
G
 
S
L
 
Q
C
 
L
L
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
G
I
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
A
 
A
F
 
L
H
 
K
S
 
S
N
 
A
Q
 
Q
A
 
R
I
 
L
A
 
L
E
 
E
-
 
V
R
 
V
L
 
I
R
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
T
R
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
I
P
 
D
L
 
A
D
 
N
A
 
V
I
 
V
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
D
 
P
T
 
R
P
 
P
D
 
E
R
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
I
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
P
G
 
D
L
 
L
I
 
V
D
 
P
I
 
L
I
 
V
I
 
I
P
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
S
K
 
G
S
 
E
L
 
S
I
 
T
E
 
R
R
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
T
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
G
V
 
V
P
 
R
V
 
T
I
 
L
K
 
A
H
 
H
L
 
A
H
 
D
G
 
G
N
 
G
C
 
G
H
 
V
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
F
 
K
A
 
A
N
x
D
L
 
R
D
|
D
K
 
T
A
 
V
V
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
S
K
 
-
V
 
L
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
V
C
 
C
N
 
N
T
 
R
A
 
L
E
 
N
S
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
Q
 
D
A
|
A
V
 
V
A
 
Y
G
 
E
D
x
E
M
 
F
L
 
W
P
 
P
P
 
V
I
 
V
A
 
S
A
x
E
A
 
A
L
 
L
R
 
A
E
|
E
K
 
R
G
 
G
I
 
V
E
 
S
L
 
P
R
 
S
G
 
L
C
 
P
P
 
P
E
 
Y
T
 
D
L
 
H
K
 
P
L
 
I
L
 
G
P
 
Y
D
 
E
L
 
W
A
 
A
V
 
L
A
 
D
T
 
S
E
 
E
E
 
R
D
 
E
Y
 
A
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
I
 
T
I
 
V
S
 
T
V
 
V
K
 
A
V
 
R
V
 
V
D
 
D
S
 
G
L
 
V
D
 
A
A
 
E
A
 
A
M
 
V
D
 
R
H
 
I
I
 
A
A
 
N
Q
 
E
Y
 
E
G
 
T
S
 
S
G
 
G
H
 
L
S
 
A
E
 
A
A
 
G
I
 
I
V
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Y
 
A
S
 
R
H
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
E
F
 
F
L
 
F
R
 
D
E
 
G
V
 
Y
D
 
Q
S
 
G
S
 
T
S
 
G
V
 
V
M
 
F
V
 
W
N
 
N
A
 
A
S
 
P
T
 
T
R
 
R
F
 
L
A
 
L
D
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
K
Y
 
L
G
 
L
L
 
G
G
 
V
A
 
P
E
 
E
I
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
N
T
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
V
H
 
P
-
 
G
V
 
P
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
T
L
 
Y
E
 
P
G
 
D
L
 
L
T
 
Y
T
 
V
Q
 
R
K
 
Q
W
 
Y
I
 
A
V
 
V
L
 
L

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
24% identity, 72% coverage: 89:391/422 of query aligns to 72:413/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
L
 
L
R
 
K
E
 
N
I
 
L
A
 
F
A
 
A
L
 
A
P
 
N
D
 
D
P
 
V
V
 
Y
G
 
N
E
 
S
I
 
I
A
 
K
D
 
D
L
 
V
K
 
K
F
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
R
R
 
R
P
 
D
S
 
E
G
 
E
I
 
N
Q
 
R
V
 
V
G
 
W
K
 
E
M
 
I
R
 
A
M
 
Q
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
-
 
A
G
 
G
M
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
A
 
V
D
 
I
A
 
F
A
 
K
G
 
A
L
 
L
-
 
I
C
 
A
L
 
V
K
 
K
S
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
S
x
P
E
 
S
A
 
A
F
 
A
H
 
K
S
 
C
N
 
T
Q
 
A
A
 
E
I
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
I
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
A
G
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
G
L
 
A
P
 
P
L
 
K
D
 
G
A
 
L
I
 
I
Q
 
S
V
 
C
L
 
I
D
 
T
T
 
Q
P
 
P
D
 
T
R
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
T
G
 
N
A
 
E
M
 
L
I
 
M
R
 
K
M
 
H
R
 
K
G
 
-
L
 
L
I
 
T
D
 
D
I
 
V
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
P
S
 
G
L
|
L
I
 
V
E
 
-
R
 
K
I
 
A
S
 
A
A
 
Y
E
 
S
A
 
S
T
 
G
V
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
K
 
G
H
 
V
L
 
G
H
 
P
G
 
G
N
 
N
C
 
V
H
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
F
 
S
A
 
A
N
 
N
L
 
I
D
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
I
V
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
V
 
T
Q
 
F
R
 
D
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
-
 
I
C
 
C
N
 
A
T
 
S
A
 
E
E
 
Q
S
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
I
A
 
K
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
E
P
 
K
I
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
K
 
Q
G
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
I
-
 
M
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
I
 
A
E
 
E
L
 
M
R
 
A
G
 
G
-
 
I
-
 
E
C
 
I
P
 
P
E
 
S
T
 
D
L
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
-
 
V
-
 
A
P
 
E
D
 
E
L
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
G
T
 
K
E
 
E
E
 
Y
D
 
P
Y
 
F
Y
 
S
T
 
I
E
 
E
Y
 
K
L
 
L
G
 
S
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
A
V
 
F
K
 
Y
V
 
I
V
 
V
D
 
K
S
 
G
L
 
M
D
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
-
D
 
S
H
 
E
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
G
G
 
G
S
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
T
E
 
V
A
 
G
I
 
I
V
 
H
T
 
A
E
 
E
D
 
D
Y
 
E
S
 
K
H
 
V
A
 
I
R
 
E
R
 
A
F
 
Y
L
 
T
R
 
I
E
 
D
V
 
K
D
 
P
S
 
A
S
 
G
S
 
R
V
 
I
M
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
G
T
 
T
R
 
T
F
 
F
A
 
G
D
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
T
I
 
V
G
 
N
I
 
V

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
24% identity, 72% coverage: 89:391/422 of query aligns to 73:414/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
L
 
L
R
 
K
E
 
N
I
 
L
A
 
F
A
 
A
L
 
A
P
 
N
D
 
D
P
 
V
V
 
Y
G
 
N
E
 
S
I
 
I
A
 
K
D
 
D
L
 
V
K
 
K
F
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
R
R
 
R
P
 
D
S
 
E
G
 
E
I
 
N
Q
 
R
V
 
V
G
 
W
K
 
E
M
 
I
R
 
A
M
 
Q
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
-
 
A
G
 
G
M
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
A
 
V
D
 
I
A
 
F
A
 
K
G
 
A
L
 
L
-
 
I
C
 
A
L
 
V
K
 
K
S
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
S
 
P
E
 
S
A
 
A
F
 
A
H
 
K
S
 
C
N
 
T
Q
 
A
A
 
E
I
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
I
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
A
G
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
G
L
 
A
P
 
P
L
 
K
D
 
G
A
 
L
I
 
I
Q
 
S
V
 
C
L
 
I
D
 
T
T
 
Q
P
 
P
D
 
T
R
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
T
G
 
N
A
 
E
M
 
L
I
 
M
R
 
K
M
 
H
R
 
K
G
 
-
L
 
L
I
 
T
D
 
D
I
 
V
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
P
S
 
G
L
|
L
I
 
V
E
 
-
R
 
K
I
 
A
S
 
A
A
 
Y
E
 
S
A
 
S
T
 
G
V
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
K
 
G
H
 
V
L
 
G
H
 
P
G
 
G
N
 
N
C
 
V
H
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
F
 
S
A
 
A
N
 
N
L
 
I
D
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
I
V
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
V
 
T
Q
 
F
R
 
D
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
-
 
I
C
 
C
N
 
A
T
 
S
A
 
E
E
 
Q
S
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
I
A
 
K
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
E
P
 
K
I
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
K
 
Q
G
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
I
-
 
M
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
x
A
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
I
 
A
E
 
E
L
 
M
R
 
A
G
 
G
-
 
I
-
 
E
C
 
I
P
 
P
E
 
S
T
 
D
L
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
-
 
V
-
 
A
P
 
E
D
 
E
L
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
G
T
 
K
E
 
E
E
 
Y
D
 
P
Y
 
F
Y
 
S
T
 
I
E
 
E
Y
 
K
L
 
L
G
 
S
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
A
V
 
F
K
 
Y
V
 
I
V
 
V
D
 
K
S
 
G
L
 
M
D
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
-
D
 
S
H
 
E
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
G
G
 
G
S
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
T
E
 
V
A
 
G
I
 
I
V
 
H
T
 
A
E
 
E
D
 
D
Y
 
E
S
 
K
H
 
V
A
 
I
R
 
E
R
 
A
F
 
Y
L
 
T
R
 
I
E
 
D
V
 
K
D
 
P
S
 
A
S
 
G
S
 
R
V
 
I
M
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
G
T
 
T
R
 
T
F
 
F
A
 
G
D
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
T
I
 
V
G
 
N
I
 
V

4yweA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
29% identity, 66% coverage: 110:389/422 of query aligns to 126:410/476 of 4yweA

query
sites
4yweA
S
 
A
G
 
G
I
 
Y
Q
 
T
V
 
V
G
 
L
K
 
T
M
 
V
R
 
R
M
 
E
P
 
P
I
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
T
G
 
G
M
 
H
I
 
I
-
 
V
-
 
P
Y
 
W
E
x
N
S
 
Y
R
 
P
P
 
M
N
 
Q
V
 
I
T
 
F
A
 
G
D
 
R
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
A
C
 
A
L
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
C
I
 
V
L
 
V
R
x
K
G
 
P
G
 
A
S
 
E
E
x
D
A
 
A
F
 
C
H
 
L
S
 
S
N
 
V
Q
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
-
L
 
L
R
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
A
G
 
G
R
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
A
D
 
G
A
 
A
I
 
L
Q
 
N
V
 
I
L
 
V
D
 
T
T
 
G
P
 
Y
D
 
G
R
 
H
A
 
E
A
 
A
V
 
G
G
 
A
A
 
A
M
 
L
I
 
A
R
 
R
M
 
H
R
 
P
G
 
G
L
 
I
I
 
D
D
 
H
I
 
I
I
 
S
I
 
F
-
 
T
-
 
G
-
 
S
P
 
P
R
 
A
G
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
-
L
 
L
I
 
V
E
 
T
R
 
Q
I
 
M
S
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
N
T
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
T
K
 
L
H
x
E
L
 
L
H
 
G
G
 
G
N
 
K
C
 
S
H
 
P
V
 
Q
Y
 
I
V
 
V
D
 
F
E
 
A
F
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
L
D
 
D
K
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
P
I
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
S
A
 
A
K
 
I
V
 
V
Q
 
Q
R
 
N
L
 
G
G
 
G
-
 
Q
T
 
T
C
|
C
N
 
S
T
 
A
A
 
G
E
 
S
S
 
R
L
 
V
L
 
L
V
 
I
H
 
E
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
Y
G
 
E
D
 
P
M
 
L
L
 
V
P
 
E
P
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
F
R
 
N
E
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
V
C
 
G
P
 
P
E
 
S
T
 
R
L
 
A
K
 
D
L
 
L
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
Y
 
D
L
 
C
G
 
G
P
 
P
I
 
L
I
 
I
S
 
N
V
 
A
K
 
K
-
 
Q
-
 
Q
-
 
Q
-
 
R
V
 
V
V
 
W
D
 
D
S
 
F
L
 
L
-
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
M
 
H
D
 
D
H
 
G
I
 
I
A
 
P
Q
 
M
Y
 
A
G
 
A
S
 
H
G
 
G
H
 
Q
S
 
V
E
 
V
A
 
A
I
 
D
V
 
A
T
 
P
E
 
E
D
 
S
-
 
G
Y
 
F
S
 
Y
H
 
Q
A
 
A
R
 
P
R
 
A
F
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
D
V
 
V
D
 
P
S
 
P
S
 
S
S
 
H
V
 
R
M
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
E
-
x
E
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
P
V
 
V
N
 
L
A
 
A
S
 
A
T
 
M
R
 
R
F
 
F
A
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
N
G
 
G
F
 
T
E
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
G
 
V
A
 
A
E
 
G
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8uhwB The structure of the clostridium thermocellum adhe spirosome
22% identity, 62% coverage: 114:375/422 of query aligns to 95:396/859 of 8uhwB

query
sites
8uhwB
V
 
I
G
 
K
K
 
K
M
 
I
R
 
A
M
 
E
P
 
P
I
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
A
-
 
A
M
 
V
I
 
I
Y
 
P
E
 
T
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
I
A
 
F
A
 
K
G
 
T
L
 
L
-
 
I
C
 
A
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
I
L
 
I
R
 
S
G
 
P
G
 
H
S
 
P
E
 
R
A
 
A
F
 
K
H
 
N
S
 
S
N
 
T
Q
 
I
A
 
E
I
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
I
L
 
V
R
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
A
G
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
G
L
 
A
P
 
P
L
 
E
D
 
G
A
 
I
I
 
I
Q
 
G
V
 
W
L
 
I
D
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
S
R
 
L
A
 
E
A
 
L
V
 
T
G
 
N
A
 
L
M
 
V
I
 
M
R
 
R
M
 
E
R
 
A
G
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
D
I
 
V
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
P
S
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
-
R
 
K
I
 
A
S
 
A
A
 
Y
E
 
S
A
 
S
T
 
G
V
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
 
V
L
 
G
H
 
A
G
 
G
N
 
N
C
 
T
H
 
P
V
 
A
Y
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
D
F
 
S
A
 
A
N
 
D
L
 
I
D
 
V
K
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
N
I
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
H
A
 
S
K
 
K
V
 
T
Q
 
F
R
 
D
L
 
N
G
 
G
T
 
M
-
 
I
C
 
C
N
 
A
T
 
S
A
 
E
E
 
Q
S
 
S
L
 
V
L
 
I
V
 
V
H
 
L
Q
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
Y
G
 
K
D
 
E
M
 
V
L
 
-
P
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
K
K
 
K
G
 
E
I
 
F
E
 
E
L
 
K
R
 
R
G
 
G
C
 
C
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
I
-
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
T
-
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
V
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
T
K
 
K
L
 
I
L
 
L
P
 
I
D
 
G
-
 
E
-
 
V
L
 
T
A
 
S
V
 
V
A
 
D
T
 
I
E
 
S
E
 
E
D
 
E
Y
 
F
Y
 
A
T
 
H
E
 
E
Y
 
K
L
 
L
G
 
C
P
 
P
I
 
V
I
 
L
S
 
A
V
 
M
K
 
Y
V
 
R
V
 
A
D
 
K
S
 
D
L
 
F
D
 
D
A
 
D
A
 
A
M
 
L
D
 
D
H
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
L
I
 
V
A
 
A
Q
 
D
Y
 
G
G
 
G
S
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
T
E
 
S
A
 
S
I
 
L
V
 
Y
T
 
I
E
 
D
D
 
T
Y
 
V
S
 
T
H
 
Q
A
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
L
R
 
Q
R
 
K
F
 
F
L
 
S
R
 
E
E
 
R
V
 
M
D
 
K
S
 
T
S
 
C
S
 
R
V
 
I
M
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
T
S
 
P
T
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_028989441.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_028989441.1
MEKHTPVETQVRGLAERARAAARVLQQADTRAKNEALLGMAEFIVRDSEEIQKANRKDLR
NAEAAGLDAASLDRLTLSEPRLQAMAEGLREIAALPDPVGEIADLKFRPSGIQVGKMRMP
IGVIGMIYESRPNVTADAAGLCLKSGNAVILRGGSEAFHSNQAIAERLRAALGRARLPLD
AIQVLDTPDRAAVGAMIRMRGLIDIIIPRGGKSLIERISAEATVPVIKHLHGNCHVYVDE
FANLDKAVRIVVNAKVQRLGTCNTAESLLVHQAVAGDMLPPIAAALREKGIELRGCPETL
KLLPDLAVATEEDYYTEYLGPIISVKVVDSLDAAMDHIAQYGSGHSEAIVTEDYSHARRF
LREVDSSSVMVNASTRFADGFEYGLGAEIGISTDKLHVRGPVGLEGLTTQKWIVLGDGHV
RQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory