SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_028990208.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_028990208.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0DPQ8 Aromatic O-demethylase, reductase subunit; NADH--hemoprotein reductase; EC 1.6.2.- from Amycolatopsis sp. (strain ATCC 39116 / 75iv2) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 1:334/343 of query aligns to 1:334/334 of P0DPQ8

query
sites
P0DPQ8
M
 
M
T
 
T
Y
 
F
K
 
A
V
 
V
R
 
S
I
 
V
E
 
-
P
 
-
S
 
G
G
 
G
H
 
R
E
 
R
M
 
V
H
 
D
V
 
C
E
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
F
L
 
L
R
 
R
Q
 
G
G
 
G
F
 
V
N
 
W
F
 
M
P
 
P
Y
 
N
G
 
S
C
|
C
R
 
N
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
C
|
C
G
 
G
S
 
T
C
|
C
K
 
K
G
 
L
K
 
Q
I
 
V
V
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
G
 
G
Q
 
G
Y
 
A
Q
 
P
A
 
E
Y
 
D
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
A
E
 
E
E
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
S
G
 
G
M
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
A
C
|
C
A
 
Q
A
 
A
T
 
R
P
 
P
C
 
L
S
 
A
D
 
D
L
 
-
V
 
-
V
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
S
I
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
A
K
 
G
D
 
R
I
 
V
Q
 
T
-
 
H
-
 
P
V
 
L
K
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
T
A
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
L
R
 
E
I
 
V
E
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
A
P
 
R
D
 
D
V
 
T
R
 
R
A
 
R
V
 
V
Y
 
L
L
 
L
K
 
G
P
 
-
P
 
-
A
 
L
T
 
A
E
 
E
R
 
P
L
 
L
Q
 
A
F
 
F
L
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
D
 
E
I
 
L
L
 
V
L
 
V
K
 
P
-
 
G
N
 
S
G
 
G
K
 
A
R
 
R
R
|
R
G
x
Q
F
x
Y
S
|
S
L
 
L
A
 
A
G
 
N
S
 
T
P
 
A
L
 
D
N
 
E
D
 
D
E
 
K
F
 
V
L
 
L
E
 
E
L
 
L
H
|
H
I
x
V
K
x
R
R
 
R
V
 
V
K
 
P
G
 
G
G
 
G
E
x
V
F
x
A
T
|
T
E
 
D
H
 
G
-
 
W
V
 
L
F
 
F
T
 
D
T
 
G
L
 
L
K
 
A
E
 
A
K
 
G
D
 
D
I
 
R
W
 
V
R
 
E
F
 
A
E
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
D
F
 
F
Y
 
H
L
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
R
 
D
L
 
E
D
 
D
T
 
D
D
 
G
R
 
G
P
 
P
I
 
M
V
 
V
M
 
L
M
 
I
A
 
G
T
 
G
G
 
G
T
|
T
G
 
G
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
L
K
 
V
G
 
G
M
 
I
L
 
A
E
 
R
Y
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
R
G
 
H
L
 
P
N
 
S
R
 
R
P
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
Y
 
Y
W
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Y
 
G
E
 
A
H
 
A
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
R
 
D
L
 
L
E
 
G
L
 
R
I
 
F
K
 
A
E
 
E
W
 
I
Q
 
A
A
 
E
A
 
E
H
 
H
P
 
P
Q
 
G
F
 
F
T
 
R
F
 
F
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
S
 
S
-
 
D
R
 
E
P
 
P
S
 
D
E
 
P
T
 
A
W
 
Y
T
 
R
G
 
G
R
 
-
T
 
-
G
 
G
Y
 
F
V
 
P
T
 
T
E
 
D
A
 
A
A
 
F
M
 
V
Q
 
E
D
 
D
F
 
V
A
 
P
D
 
S
L
 
G
S
 
R
G
 
G
F
 
W
D
 
S
A
 
G
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
G
 
G
H
 
P
P
 
P
E
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
K
R
 
A
L
 
F
Q
 
K
E
 
R
K
 
R
G
 
R
L
 
M
P
 
S
G
 
P
E
 
R
R
 
R
I
 
I
F
 
H
S
 
R
D
 
E
A
 
K
F
|
F
T
 
T
F
 
P
A
 
A
S
|
S

5ogxA Crystal structure of amycolatopsis cytochrome p450 reductase gcob. (see paper)
39% identity, 97% coverage: 2:334/343 of query aligns to 1:333/333 of 5ogxA

query
sites
5ogxA
T
 
T
Y
 
F
K
 
A
V
 
V
R
 
S
I
 
V
E
 
-
P
 
-
S
 
G
G
 
G
H
 
R
E
 
R
M
 
V
H
 
D
V
 
C
E
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
F
L
 
L
R
 
R
Q
 
G
G
 
G
F
 
V
N
 
W
F
 
M
P
 
P
Y
 
N
G
 
S
C
|
C
R
x
N
N
 
Q
G
|
G
A
 
T
C
|
C
G
|
G
S
 
T
C
|
C
K
 
K
G
 
L
K
 
Q
I
 
V
V
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
G
 
G
Q
 
G
Y
 
A
Q
 
P
A
 
E
Y
 
D
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
A
E
 
E
E
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
S
G
 
G
M
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
A
C
|
C
A
 
Q
A
 
A
T
 
R
P
 
P
C
 
L
S
 
A
D
 
D
L
 
-
V
 
-
V
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
S
I
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
A
K
 
G
D
 
R
I
 
V
Q
 
T
-
 
H
-
 
P
V
 
L
K
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
T
A
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
L
R
 
E
I
 
V
E
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
A
P
 
R
D
 
D
V
 
T
R
 
R
A
 
R
V
 
V
Y
 
L
L
 
L
K
 
G
P
 
-
P
 
-
A
 
L
T
 
A
E
 
E
R
 
P
L
 
L
Q
 
A
F
 
F
L
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
I
 
V
D
 
E
I
 
L
L
 
V
L
 
V
K
 
P
-
 
G
N
 
S
G
 
G
K
 
A
R
 
R
R
|
R
G
x
Q
F
x
Y
S
|
S
L
 
L
A
 
A
G
 
N
S
 
T
P
 
A
L
 
D
N
 
E
D
 
D
E
 
K
F
 
V
L
 
L
E
 
E
L
 
L
H
|
H
I
x
V
K
 
R
R
 
R
V
|
V
K
 
P
G
 
G
G
|
G
E
x
V
F
x
A
T
|
T
E
 
D
H
 
G
-
 
W
V
 
L
F
 
F
T
 
D
T
 
G
L
 
L
K
 
A
E
 
A
K
 
G
D
 
D
I
 
R
W
 
V
R
 
E
F
 
A
E
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
D
F
 
F
Y
 
H
L
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
R
 
D
L
 
E
D
 
D
T
 
D
D
 
G
R
 
G
P
 
P
I
 
M
V
 
V
M
 
L
M
 
I
A
 
G
T
 
G
G
 
G
T
|
T
G
 
G
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
L
K
 
V
G
 
G
M
 
I
L
 
A
E
 
R
Y
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
R
G
 
H
L
 
P
N
 
S
R
 
R
P
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
Y
 
Y
W
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Y
 
G
E
 
A
H
 
A
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
R
 
D
L
 
L
E
 
G
L
 
R
I
 
F
K
 
A
E
 
E
W
 
I
Q
 
A
A
 
E
A
 
E
H
 
H
P
 
P
Q
 
G
F
 
F
T
 
R
F
 
F
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
S
 
S
-
 
D
R
 
E
P
 
P
S
 
D
E
 
P
T
 
A
W
 
Y
T
 
R
G
 
G
R
 
-
T
 
-
G
 
G
Y
 
F
V
 
P
T
 
T
E
 
D
A
 
A
A
 
F
M
 
V
Q
 
E
D
 
D
F
 
V
A
 
P
D
 
S
L
 
G
S
 
R
G
 
G
F
 
W
D
 
S
A
 
G
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
G
 
G
H
 
P
P
 
P
E
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
K
R
 
A
L
 
F
Q
 
K
E
 
R
K
 
R
G
 
R
L
 
M
P
 
S
G
 
P
E
 
R
R
 
R
I
 
I
F
 
H
S
 
R
D
 
E
A
 
K
F
|
F
T
 
T
F
x
P
A
 
A
S
|
S

1krhA X-ray structure of benzoate dioxygenase reductase (see paper)
32% identity, 92% coverage: 16:331/343 of query aligns to 19:335/337 of 1krhA

query
sites
1krhA
V
 
I
E
 
A
P
 
Q
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
S
E
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
G
 
Q
F
 
I
N
 
N
F
 
I
P
 
P
Y
x
M
G
x
D
C
|
C
R
|
R
N
 
E
G
|
G
A
 
E
C
|
C
G
|
G
S
 
T
C
|
C
K
 
R
G
 
A
K
 
F
I
 
C
V
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
N
V
 
Y
D
 
D
Y
 
M
-
 
P
-
 
E
G
 
D
Q
 
N
Y
 
Y
Q
 
I
A
 
E
Y
 
D
T
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
P
E
 
E
E
 
E
K
 
A
A
 
Q
L
 
Q
G
 
G
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
F
 
A
C
|
C
A
 
Q
A
 
C
T
 
R
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
F
E
 
Q
V
 
I
R
 
Q
E
 
A
I
 
S
G
 
S
A
 
E
A
 
V
K
 
C
D
 
K
I
 
T
Q
 
K
V
 
I
K
 
H
T
 
H
L
 
F
P
 
E
A
 
G
R
 
T
V
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
V
E
 
E
D
 
N
L
 
L
A
 
S
P
 
D
D
 
S
V
 
T
R
 
I
A
 
T
V
 
F
Y
 
D
L
 
I
K
 
Q
-
 
L
P
 
D
P
 
D
A
 
G
T
 
Q
E
 
P
R
 
D
L
 
I
Q
 
H
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
I
 
V
D
 
N
I
 
V
L
 
T
L
 
L
K
 
P
-
 
G
N
 
T
G
 
T
K
 
E
R
 
T
R
|
R
G
x
S
F
x
Y
S
|
S
L
 
F
A
 
S
G
 
S
S
 
Q
P
 
P
L
 
G
N
 
N
D
 
-
E
 
R
F
 
L
L
 
T
E
 
G
L
 
F
H
x
V
I
x
V
K
 
R
R
 
N
V
 
V
K
 
P
G
 
Q
G
|
G
E
x
K
F
x
M
T
x
S
E
 
E
H
 
Y
V
 
L
F
 
S
T
 
V
T
 
Q
L
 
A
K
 
K
E
 
A
K
 
G
D
 
D
I
 
K
W
 
M
R
 
S
F
 
F
E
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
F
G
 
G
S
 
S
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
L
 
-
D
 
D
T
 
V
D
 
K
R
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
L
M
 
M
M
 
L
A
 
A
T
 
G
G
 
G
T
|
T
G
 
G
F
 
I
A
 
A
P
 
P
I
 
F
K
 
L
G
 
S
M
 
M
L
 
L
E
 
Q
Y
 
V
G
 
L
F
 
E
A
 
Q
E
 
K
G
 
G
L
 
S
N
 
E
R
 
H
P
 
P
V
 
V
H
 
R
L
 
L
Y
 
V
W
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
T
Y
 
Q
E
 
D
H
 
C
D
 
D
F
 
L
Y
 
V
R
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
Q
I
 
L
K
 
D
E
 
A
W
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
K
H
 
L
P
 
P
Q
 
W
F
 
F
T
 
E
F
 
Y
V
 
R
P
 
T
V
 
V
V
 
V
S
 
A
R
 
H
P
 
-
S
 
A
E
 
E
T
 
S
W
 
Q
T
 
H
G
 
E
R
 
R
T
 
K
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
E
 
G
A
 
H
A
 
I
M
 
E
Q
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
D
 
N
L
 
G
S
 
G
G
 
E
F
 
V
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
C
|
C
G
 
G
H
 
P
P
 
V
E
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
E
E
 
A
G
 
V
A
 
R
R
 
S
R
 
W
L
 
L
Q
 
D
E
 
T
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
Q
G
 
P
E
 
A
R
 
N
I
 
F
F
 
L
S
 
F
D
x
E
A
 
K
F
|
F
T
x
S

Sites not aligning to the query:

4wqmA Structure of the toluene 4-monooxygenase nadh oxidoreductase t4mof, k270s k271s variant (see paper)
29% identity, 96% coverage: 2:330/343 of query aligns to 1:325/326 of 4wqmA

query
sites
4wqmA
T
 
S
Y
 
F
K
 
N
V
 
I
R
 
Q
I
 
S
E
 
D
P
 
D
S
 
L
G
 
L
H
 
H
E
 
H
M
 
F
H
 
E
V
 
A
E
 
D
P
 
S
G
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
A
G
 
E
F
 
L
N
 
V
F
 
F
P
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
|
C
R
x
N
N
x
S
G
|
G
A
 
G
C
|
C
G
|
G
S
 
A
C
|
C
K
 
K
G
 
I
K
 
E
I
 
L
V
 
L
S
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
N
G
 
L
Q
x
W
Y
 
P
Q
 
D
A
 
A
Y
 
P
T
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
A
E
 
R
E
 
E
K
 
L
A
 
R
L
 
K
G
 
N
M
 
R
A
 
F
L
 
L
F
 
A
C
|
C
A
 
Q
A
 
C
T
 
K
P
 
P
C
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
K
V
 
I
E
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
N
R
 
R
E
 
A
I
 
E
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
S
D
 
H
I
 
-
Q
 
P
V
 
P
K
 
K
T
 
R
L
 
F
P
 
S
A
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
V
R
 
S
I
 
K
E
 
R
D
 
F
L
 
L
A
 
S
P
 
D
D
 
E
V
 
M
R
 
F
A
 
E
V
 
L
Y
 
R
L
 
L
K
 
E
P
 
-
P
 
-
A
 
A
T
 
E
E
 
Q
R
 
K
L
 
V
Q
 
V
F
 
F
L
 
S
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
I
 
F
D
 
M
I
 
V
L
 
D
L
 
V
K
 
P
N
 
E
G
 
L
K
 
G
R
 
T
R
|
R
G
x
A
F
x
Y
S
|
S
L
 
-
A
 
A
G
 
A
S
 
N
P
 
P
L
 
V
N
 
D
D
 
G
E
 
N
F
 
T
L
 
L
E
 
T
L
 
L
H
x
I
I
x
V
K
 
K
R
 
A
V
 
V
K
 
P
G
 
N
G
|
G
E
x
K
F
x
V
T
x
S
E
 
C
H
 
A
V
 
L
F
 
A
T
 
N
T
 
E
L
 
T
K
 
I
E
 
E
K
 
T
D
 
-
I
 
-
W
 
L
R
 
Q
F
 
L
E
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
S
 
L
F
 
S
Y
 
V
L
 
L
R
 
K
L
 
T
D
 
A
T
 
D
D
 
E
R
 
T
P
 
Q
I
 
S
V
 
V
M
 
F
M
 
I
A
 
A
T
 
G
G
 
G
T
x
S
G
 
G
F
 
I
A
 
A
P
 
P
I
 
M
K
 
V
G
 
S
M
 
M
L
 
V
E
 
N
Y
 
T
G
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
L
 
Y
N
 
E
R
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
T
L
 
V
Y
 
F
W
 
Y
G
 
G
V
 
S
R
 
R
Y
 
L
E
 
E
H
 
A
D
 
E
F
 
L
Y
 
E
R
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
T
I
 
L
K
 
F
E
 
G
W
 
W
Q
 
K
A
 
E
A
 
N
H
 
L
P
 
K
Q
 
L
F
 
I
T
 
N
F
 
V
V
 
S
P
 
S
V
 
S
V
 
V
S
 
V
R
 
G
P
 
N
S
 
S
E
 
E
T
 
S
W
 
-
T
 
S
G
 
Y
R
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
T
 
H
E
 
E
A
 
I
A
 
I
M
 
P
Q
 
E
D
 
Y
F
 
M
A
 
E
D
 
G
L
 
L
S
 
L
G
 
G
F
 
A
D
 
E
A
 
F
Y
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
H
 
P
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
V
 
I
A
 
N
E
 
S
G
 
V
A
 
Q
R
 
K
R
 
L
L
 
L
Q
 
M
-
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
K
L
 
V
P
 
P
G
 
F
E
 
E
R
 
A
I
 
I
F
 
H
S
 
F
D
 
D
A
 
R
F
|
F

Q03304 Toluene-4-monooxygenase system, ferredoxin--NAD(+) reductase component; T4MO; Ferredoxin--NAD(+) reductase; Toluene-4-monooxygenase systme, electron transfer component; EC 1.18.1.3 from Ectopseudomonas mendocina (Pseudomonas mendocina) (see paper)
30% identity, 93% coverage: 12:330/343 of query aligns to 11:325/326 of Q03304

query
sites
Q03304
H
 
H
E
 
H
M
 
F
H
 
E
V
 
A
E
 
D
P
 
S
G
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
A
G
 
E
F
 
L
N
 
V
F
 
F
P
 
P
Y
 
Y
G
 
E
C
|
C
R
 
N
N
 
S
G
 
G
A
 
G
C
|
C
G
 
G
S
 
A
C
|
C
K
 
K
G
 
I
K
 
E
I
 
L
V
 
L
S
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
N
G
 
L
Q
 
W
Y
 
P
Q
 
D
A
 
A
Y
 
P
T
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
A
E
 
R
E
 
E
K
 
L
A
 
R
L
 
K
G
 
N
M
 
R
A
 
F
L
 
L
F
 
A
C
|
C
A
 
Q
A
 
C
T
 
K
P
 
P
C
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
K
V
 
I
E
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
N
R
 
R
E
 
A
I
 
E
G
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
S
D
 
H
I
 
-
Q
 
P
V
 
P
K
 
K
T
 
R
L
 
F
P
 
S
A
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
V
R
 
S
I
 
K
E
 
R
D
 
F
L
 
L
A
 
S
P
 
D
D
 
E
V
 
M
R
 
F
A
 
E
V
 
L
Y
 
R
L
 
L
K
 
E
P
 
-
P
 
-
A
 
A
T
 
E
E
 
Q
R
 
K
L
 
V
Q
 
V
F
 
F
L
 
S
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
F
D
 
M
I
 
V
L
 
D
L
 
V
K
 
P
N
 
E
G
 
L
K
 
G
R
 
T
R
|
R
G
x
A
F
x
Y
S
|
S
L
 
-
A
 
A
G
 
A
S
 
N
P
 
P
L
 
V
N
 
D
D
 
G
E
 
N
F
 
T
L
 
L
E
 
T
L
 
L
H
x
I
I
x
V
K
|
K
R
 
A
V
 
V
K
 
P
G
 
N
G
 
G
E
x
K
F
x
V
T
x
S
E
 
C
H
 
A
V
 
L
F
 
A
T
 
N
T
 
E
L
 
T
K
 
I
E
 
E
K
 
T
D
 
-
I
 
-
W
 
L
R
 
Q
F
 
L
E
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
S
 
L
F
 
S
Y
 
V
L
 
L
R
 
K
L
 
T
D
 
A
T
 
D
D
 
E
R
 
T
P
 
Q
I
 
S
V
 
V
M
 
F
M
 
I
A
 
A
T
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
F
 
I
A
 
A
P
 
P
I
 
M
K
 
V
G
 
S
M
 
M
L
 
V
E
 
N
Y
 
T
G
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
L
 
Y
N
 
E
R
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
T
L
 
V
Y
 
F
W
 
Y
G
 
G
V
 
S
R
 
R
Y
 
L
E
 
E
H
 
A
D
 
E
F
 
L
Y
 
E
R
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
T
I
 
L
K
 
F
E
 
G
W
 
W
Q
 
K
A
 
E
A
 
N
H
 
L
P
 
K
Q
 
L
F
 
I
T
 
N
F
 
V
V
 
S
P
 
S
V
 
S
V
 
V
S
 
V
R
 
G
P
 
N
S
 
S
E
 
E
T
 
K
W
 
-
T
 
K
G
 
Y
R
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
T
 
H
E
 
E
A
 
I
A
 
I
M
 
P
Q
 
E
D
 
Y
F
 
M
A
 
E
D
 
G
L
 
L
S
 
L
G
 
G
F
 
A
D
 
E
A
 
F
Y
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
H
 
P
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
V
 
I
A
 
N
E
 
S
G
 
V
A
 
Q
R
 
K
R
 
L
L
 
L
Q
 
M
-
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
K
L
 
V
P
 
P
G
 
F
E
 
E
R
 
A
I
 
I
F
 
H
S
 
F
D
 
D
A
 
R
F
 
F

7c3bC Ferredoxin reductase in carbazole 1,9a-dioxygenase (fad apo form) (see paper)
29% identity, 91% coverage: 20:330/343 of query aligns to 23:333/334 of 7c3bC

query
sites
7c3bC
E
 
K
T
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
A
Q
 
N
G
 
G
F
 
I
N
 
G
F
 
L
P
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
|
C
R
x
A
N
 
S
G
|
G
A
 
G
C
|
C
G
|
G
S
 
V
C
|
C
K
 
K
G
 
F
K
 
E
I
 
L
V
 
L
S
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
V
D
 
Q
Y
 
S
G
 
M
Q
 
W
Y
 
P
Q
 
D
A
 
A
Y
 
P
T
 
G
L
 
L
T
 
S
E
 
S
E
 
R
E
 
D
K
 
R
A
 
E
L
 
K
G
 
G
M
 
N
A
 
R
-
 
H
L
 
L
F
 
A
C
|
C
A
 
Q
A
 
C
T
 
I
P
 
A
C
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
R
V
 
I
E
 
K
V
 
V
R
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
A
A
 
V
K
 
Q
D
 
D
I
 
K
Q
 
Y
V
 
I
K
 
P
T
 
A
L
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
M
-
 
E
A
 
A
R
 
E
V
 
V
A
 
V
R
 
A
I
 
V
E
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
T
P
 
H
D
 
D
V
 
L
R
 
L
A
 
S
V
 
V
Y
 
K
L
 
L
K
 
R
P
 
T
P
 
D
A
 
V
T
 
P
E
 
A
R
 
-
L
 
-
Q
 
N
F
 
F
L
 
L
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
F
I
 
C
D
 
L
I
 
I
L
 
E
L
 
A
K
 
E
N
 
Q
-
 
L
-
 
P
G
 
G
K
 
V
R
 
V
R
 
R
G
 
A
F
 
Y
S
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
N
S
 
S
P
 
M
L
 
N
N
 
P
D
 
D
E
 
G
F
 
F
L
 
W
E
 
E
L
 
F
H
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
P
G
 
T
G
 
G
E
 
R
F
 
F
T
 
S
E
 
P
H
 
W
V
 
L
F
 
F
T
 
E
T
 
N
L
 
R
K
 
K
E
 
V
K
 
G
D
 
A
I
 
R
W
 
L
R
 
F
F
 
L
E
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
M
G
 
G
S
 
T
F
 
S
Y
 
F
L
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
R
P
 
K
I
 
S
V
 
L
M
 
C
M
 
I
A
 
G
T
 
G
G
 
G
T
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
S
P
 
Y
I
 
A
K
 
A
G
 
A
M
 
I
L
 
A
E
 
R
Y
 
A
G
 
S
F
 
I
A
 
R
E
 
E
G
 
-
L
 
T
N
 
D
R
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
K
L
 
L
Y
 
F
W
 
Y
G
 
G
V
 
S
R
 
R
Y
 
T
E
 
P
H
 
R
D
 
D
F
 
A
Y
 
V
R
 
R
L
 
W
E
 
I
L
 
D
I
 
I
K
 
-
E
 
-
W
 
-
Q
 
D
A
 
I
A
 
D
H
 
E
P
 
D
Q
 
K
F
 
L
T
 
E
F
 
V
V
 
V
P
 
Q
V
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
E
P
 
D
S
 
T
E
 
D
T
 
S
-
 
L
W
 
W
T
 
Q
G
 
G
R
 
P
T
 
I
G
 
G
Y
 
F
-
 
I
-
 
H
-
 
Q
V
 
V
T
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
-
D
 
-
F
 
L
A
 
E
D
 
T
L
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
Y
D
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
L
C
 
A
G
 
G
H
 
P
P
 
P
E
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
V
R
 
R
R
 
M
L
 
L
Q
 
L
E
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
 
R
E
 
D
R
 
Q
I
 
I
F
 
H
S
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
F

7c3aA Ferredoxin reductase in carbazole 1,9a-dioxygenase (see paper)
28% identity, 91% coverage: 20:330/343 of query aligns to 22:320/321 of 7c3aA

query
sites
7c3aA
E
 
K
T
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
A
Q
 
N
G
 
G
F
 
I
N
 
G
F
 
L
P
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
|
C
R
x
A
N
x
S
G
|
G
A
 
G
C
|
C
G
|
G
S
 
V
C
|
C
K
 
K
G
 
F
K
 
E
I
 
L
V
 
L
S
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
V
D
 
Q
Y
 
S
G
 
M
Q
x
W
Y
 
P
Q
 
D
A
 
A
Y
 
P
T
 
G
L
 
L
T
 
S
E
 
S
E
 
R
E
 
D
K
 
R
A
 
E
L
 
K
G
 
G
-
 
N
M
 
R
A
 
H
L
 
L
F
 
A
C
|
C
A
 
Q
A
 
C
T
 
I
P
 
A
C
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
R
V
 
I
E
 
K
V
 
V
R
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
A
A
 
V
K
 
Q
D
 
D
I
 
K
Q
 
Y
V
 
I
K
 
P
T
 
A
L
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
M
-
 
E
A
 
A
R
 
E
V
 
V
A
 
V
R
 
A
I
 
V
E
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
T
P
 
H
D
 
D
V
 
L
R
 
L
A
 
S
V
 
V
Y
 
K
L
 
L
K
 
R
P
 
T
P
 
D
A
 
V
T
 
P
E
 
A
R
 
-
L
 
-
Q
 
N
F
 
F
L
 
L
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
F
I
 
C
D
 
L
I
 
I
L
 
E
L
 
A
K
 
E
N
 
Q
-
 
L
-
 
P
G
 
G
K
 
V
R
 
V
R
|
R
G
x
A
F
x
Y
S
|
S
L
 
M
A
 
A
G
 
N
S
 
S
P
 
M
L
 
N
N
 
P
D
 
D
E
 
G
F
 
F
L
 
W
E
 
E
L
 
F
H
x
Y
I
|
I
K
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
P
G
 
T
G
|
G
E
x
R
F
|
F
T
x
S
E
 
P
H
 
W
V
 
L
F
 
F
T
 
E
T
 
N
L
 
R
K
 
K
E
 
V
K
 
G
D
 
A
I
 
R
W
 
L
R
 
F
F
 
L
E
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
M
G
 
G
S
 
T
F
 
S
Y
 
F
L
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
R
P
 
K
I
 
S
V
 
L
M
 
C
M
 
I
A
 
G
T
 
G
G
 
G
T
x
A
G
 
G
F
 
L
A
 
S
P
 
Y
I
 
A
K
 
A
G
 
A
M
 
I
L
 
A
E
 
R
Y
 
A
G
 
S
F
 
I
A
 
R
E
 
E
G
 
-
L
 
T
N
 
D
R
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
K
L
 
L
Y
 
F
W
 
Y
G
 
G
V
 
S
R
 
R
Y
 
T
E
 
P
H
 
R
D
 
D
F
 
A
Y
 
V
R
 
R
-
 
W
-
 
I
-
 
D
L
 
I
E
 
D
L
 
I
I
 
D
K
 
E
E
 
D
W
 
K
Q
 
L
A
 
E
A
 
V
H
 
V
P
 
Q
Q
 
A
F
 
V
T
 
T
F
 
F
V
 
I
P
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
H
Y
 
Q
V
 
V
T
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
-
D
 
-
F
 
L
A
 
E
D
 
T
L
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
Y
D
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
L
C
 
A
G
 
G
H
 
P
P
 
P
E
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
V
R
 
R
R
 
M
L
 
L
Q
 
L
E
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
 
R
E
 
D
R
 
Q
I
 
I
F
 
H
S
 
F
D
 
D
A
 
A
F
|
F

Sites not aligning to the query:

1tvcA Fad and nadh binding domain of methane monooxygenase reductase from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
27% identity, 59% coverage: 130:330/343 of query aligns to 42:244/250 of 1tvcA

query
sites
1tvcA
L
 
V
Q
 
K
F
 
F
L
 
E
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
x
F
I
 
M
D
 
D
I
 
L
L
 
T
L
 
I
K
 
P
N
 
G
G
 
T
K
 
D
-
 
V
R
 
S
R
|
R
G
x
S
F
x
Y
S
|
S
L
 
P
A
 
A
G
 
N
S
 
L
P
 
P
L
 
N
N
 
P
D
 
E
E
 
G
F
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
F
H
x
L
I
|
I
K
x
R
R
 
V
V
x
L
K
 
P
G
 
E
G
 
G
E
 
R
F
|
F
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
V
 
L
F
 
R
T
 
N
T
 
D
L
 
A
K
 
R
E
 
V
K
 
G
D
 
Q
I
 
V
W
 
L
R
 
S
F
 
V
E
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
V
F
 
F
Y
 
G
L
 
L
R
 
K
L
 
E
D
 
R
T
 
G
D
 
M
R
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
Y
M
 
F
M
 
V
A
 
A
T
 
G
G
 
G
T
 
T
G
|
G
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
V
K
 
V
G
 
S
M
 
M
L
 
V
E
 
R
Y
 
Q
G
 
M
F
 
Q
A
 
E
E
 
W
G
 
T
L
 
A
N
 
P
R
 
N
P
 
E
V
 
T
H
 
R
L
 
I
Y
 
Y
W
 
F
G
 
G
V
 
V
R
x
N
Y
 
T
E
 
E
H
 
P
D
x
E
F
 
L
Y
 
F
R
 
Y
L
 
I
E
 
D
L
 
E
I
 
L
K
 
K
E
 
S
W
 
L
Q
 
E
A
 
R
A
 
S
H
 
M
P
 
R
Q
 
N
F
 
L
T
 
T
F
 
V
V
 
K
P
 
A
V
 
C
V
 
V
S
 
W
R
 
H
P
 
P
S
|
S
E
x
G
T
 
D
W
 
W
T
 
E
G
 
G
R
 
E
T
 
Q
G
 
G
Y
 
S
V
 
P
T
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
L
M
 
R
Q
 
E
D
 
D
F
 
L
-
 
E
A
 
S
D
 
S
L
 
D
S
 
A
G
 
N
F
 
P
D
 
D
A
 
I
Y
 
Y
L
|
L
C
 
C
G
 
G
H
 
P
P
 
P
E
 
G
M
 
M
V
 
I
A
 
D
E
 
A
G
 
A
A
 
C
R
 
E
R
 
L
L
 
V
Q
 
R
E
 
S
K
 
R
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
I
 
V
F
 
F
S
 
F
D
x
E
A
 
K
F
|
F

Sites not aligning to the query:

7c3bB Ferredoxin reductase in carbazole 1,9a-dioxygenase (fad apo form) (see paper)
28% identity, 91% coverage: 20:330/343 of query aligns to 22:305/306 of 7c3bB

query
sites
7c3bB
E
 
K
T
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
A
Q
 
N
G
 
G
F
 
I
N
 
G
F
 
L
P
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
|
C
R
x
A
N
 
S
G
|
G
A
 
G
C
|
C
G
|
G
S
 
V
C
|
C
K
 
K
G
 
F
K
 
E
I
 
L
V
 
L
S
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
V
D
 
Q
Y
 
S
G
 
M
Q
 
W
Y
 
P
Q
 
D
A
 
A
Y
 
P
T
 
G
L
 
L
T
 
S
E
 
S
E
 
R
E
 
D
K
 
R
A
 
E
L
 
K
G
 
G
-
 
N
M
 
R
A
 
H
L
 
L
F
 
A
C
|
C
A
 
Q
A
 
C
T
 
I
P
 
A
C
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
R
V
 
I
E
 
K
V
 
V
R
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
A
A
 
V
K
 
Q
D
 
D
I
 
K
Q
 
Y
V
 
I
K
 
P
T
 
A
L
 
I
P
 
P
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
M
-
 
E
A
 
A
R
 
E
V
 
V
A
 
V
R
 
A
I
 
V
E
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
T
P
 
H
D
 
D
V
 
L
R
 
L
A
 
S
V
 
V
Y
 
K
L
 
L
K
 
R
P
 
T
P
 
D
A
 
V
T
 
P
E
 
A
R
 
-
L
 
-
Q
 
N
F
 
F
L
 
L
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
F
I
 
C
D
 
L
I
 
I
L
 
E
L
 
A
K
 
E
N
 
Q
-
 
L
-
 
P
G
 
G
K
 
V
R
 
V
R
 
R
G
 
A
F
 
Y
S
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
N
S
 
S
P
 
M
L
 
N
N
 
P
D
 
D
E
 
G
F
 
F
L
 
W
E
 
E
L
 
F
H
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
P
G
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
F
T
 
S
E
 
P
H
 
W
V
 
L
F
 
F
T
 
E
T
 
N
L
 
R
K
 
K
E
 
V
K
 
G
D
 
A
I
 
R
W
 
L
R
 
F
F
 
L
E
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
M
G
 
G
S
 
T
F
 
S
Y
 
F
L
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
R
P
 
K
I
 
S
V
 
L
M
 
C
M
 
I
A
 
G
T
 
G
G
 
G
T
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
S
P
 
Y
I
 
A
K
 
A
G
 
A
M
 
I
L
 
A
E
 
R
Y
 
A
G
 
S
F
 
I
A
 
R
E
 
E
G
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
T
P
 
D
V
 
V
H
 
K
L
 
L
Y
 
F
W
 
Y
G
 
G
V
 
S
R
 
R
Y
 
T
E
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
E
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
P
Q
 
W
F
 
I
T
 
D
F
 
I
V
 
D
P
 
E
V
 
V
V
 
V
S
 
Q
R
 
A
P
 
V
S
 
T
E
 
E
T
 
F
W
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
I
G
 
H
Y
 
Q
V
 
V
T
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
L
D
 
E
F
 
-
A
 
-
D
 
T
L
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
Y
D
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
L
C
 
A
G
 
G
H
 
P
P
 
P
E
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
D
E
 
A
G
 
T
A
 
V
R
 
R
R
 
M
L
 
L
Q
 
L
E
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
 
R
E
 
D
R
 
Q
I
 
I
F
 
H
S
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
F

P0A3C7 Ferredoxin-1; Ferredoxin I from Nostoc sp. (strain PCC 7120 / SAG 25.82 / UTEX 2576) (see paper)
39% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 3:94/99 of P0A3C7

query
sites
P0A3C7
T
 
T
Y
 
F
K
 
K
V
 
V
R
 
T
I
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
A
E
 
E
P
 
G
S
 
T
G
 
K
H
 
H
E
 
E
M
 
I
H
 
E
V
 
V
E
 
P
P
 
D
G
 
D
E
 
E
T
 
Y
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
Y
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
 
F
G
 
S
C
 
C
R
|
R
N
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
C
G
 
S
S
x
T
C
 
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
D
 
D
Y
 
-
G
 
-
Q
 
Q
Y
 
S
Q
 
D
A
 
Q
Y
 
S
T
x
F
L
 
L
T
 
D
E
x
D
E
x
D
E
 
Q
K
 
I
A
 
E
L
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
 
C
A
 
V
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
I
E
 
Q
V
 
T
R
 
H
E
 
K

Sites not aligning to the query:

1ewyC Anabaena pcc7119 ferredoxin:ferredoxin-NADP+-reductase complex (see paper)
39% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 2:93/98 of 1ewyC

query
sites
1ewyC
T
 
T
Y
 
F
K
 
K
V
 
V
R
 
T
I
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
A
E
 
E
P
 
G
S
 
T
G
 
K
H
 
H
E
 
E
M
 
I
H
 
E
V
 
V
E
 
P
P
 
D
G
 
D
E
 
E
T
 
Y
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
Y
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
x
F
G
x
S
C
|
C
R
|
R
N
 
A
G
|
G
A
|
A
C
|
C
G
 
S
S
 
T
C
|
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
D
 
D
Y
 
-
G
 
-
Q
 
Q
Y
 
S
Q
 
D
A
 
Q
Y
x
S
T
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
D
E
 
Q
K
 
I
A
 
E
L
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
V
L
|
L
F
 
T
C
|
C
A
 
V
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
I
E
 
Q
V
 
T
R
 
H
E
 
K

1czpA Anabaena pcc7119 [2fe-2s] ferredoxin in the reduced and oxixized state at 1.17 a (see paper)
39% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 2:93/98 of 1czpA

query
sites
1czpA
T
 
T
Y
 
F
K
 
K
V
 
V
R
 
T
I
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
A
E
 
E
P
 
G
S
 
T
G
 
K
H
 
H
E
 
E
M
 
I
H
 
E
V
 
V
E
 
P
P
 
D
G
 
D
E
 
E
T
 
Y
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
Y
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
x
F
G
 
S
C
|
C
R
|
R
N
 
A
G
|
G
A
 
A
C
|
C
G
 
S
S
 
T
C
|
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
D
 
D
Y
 
-
G
 
-
Q
 
Q
Y
 
S
Q
 
D
A
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
D
E
 
Q
K
 
I
A
 
E
L
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
|
C
A
 
V
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
I
E
 
Q
V
 
T
R
 
H
E
 
K

6xtfD Crystal structure a thioredoxin reductase from gloeobacter violaceus bound to its electron donor (see paper)
42% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 2:91/96 of 6xtfD

query
sites
6xtfD
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
R
 
T
-
 
L
I
 
V
E
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
K
-
 
K
E
 
E
M
 
I
H
 
D
V
 
C
E
 
P
P
 
S
G
 
D
E
 
E
T
 
Y
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
 
F
G
x
S
C
|
C
R
|
R
N
 
A
G
|
G
A
 
A
C
|
C
G
 
S
S
 
T
C
|
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
M
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
I
D
 
D
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
D
Y
 
-
Q
 
Q
A
 
S
Y
 
F
T
 
-
L
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
D
E
 
Q
K
 
I
A
 
A
L
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
|
C
A
 
V
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
N
L
 
C
V
 
S
V
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
H
E
 
K

4zhoA The crystal structure of arabidopsis ferredoxin 2 with 2fe-2s cluster (see paper)
44% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 2:91/97 of 4zhoA

query
sites
4zhoA
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
R
 
K
-
 
F
I
 
I
E
 
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
H
 
-
E
 
E
M
 
L
H
 
E
V
 
V
E
 
E
P
 
C
G
 
D
E
 
D
T
 
D
L
 
V
-
 
Y
-
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
|
Y
G
 
S
C
|
C
R
|
R
N
 
A
G
|
G
A
 
S
C
|
C
G
 
S
S
 
S
C
|
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
 
-
G
 
-
Q
 
Q
Y
 
S
Q
 
D
A
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
E
E
 
Q
K
 
I
A
 
G
L
 
E
G
 
G
M
 
F
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
|
C
A
 
A
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
T
V
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
H
E
 
K

O80429 Ferredoxin-2, chloroplastic; Ferredoxin II; Fd II from Zea mays (Maize) (see 2 papers)
41% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 46:135/140 of O80429

query
sites
O80429
T
 
T
Y
 
Y
K
 
N
V
 
V
R
 
K
-
 
L
I
 
I
E
 
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
H
 
E
-
 
V
E
 
E
M
 
L
H
 
Q
V
 
V
E
 
P
P
 
D
G
 
D
E
 
V
T
 
Y
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
F
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
E
G
 
G
F
 
I
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
 
F
G
 
S
C
 
C
R
 
R
N
 
A
G
 
G
A
 
S
C
 
C
G
 
S
S
 
S
C
 
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
 
-
G
 
-
Q
 
Q
Y
 
S
Q
 
D
A
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
T
x
N
E
 
D
E
 
N
E
 
Q
K
 
V
A
 
A
L
 
D
G
 
G
M
 
W
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
H
E
 
K

Sites not aligning to the query:

1gaqB Crystal structure of the complex between ferredoxin and ferredoxin- NADP+ reductase (see paper)
42% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 2:91/98 of 1gaqB

query
sites
1gaqB
T
 
T
Y
 
Y
K
 
N
V
 
V
R
 
K
-
 
L
I
 
I
E
 
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
H
 
E
-
 
V
E
 
E
M
 
L
H
 
Q
V
 
V
E
 
P
P
 
D
G
 
D
E
 
V
T
 
Y
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
D
G
 
G
F
 
I
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
C
|
C
R
|
R
N
 
A
G
|
G
A
 
S
C
|
C
G
 
S
S
 
S
C
|
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
 
Q
G
 
S
Q
 
D
Y
 
-
Q
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
T
 
-
L
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
G
E
 
Q
K
 
I
A
 
A
L
 
D
G
 
G
M
 
W
A
 
V
L
|
L
F
 
T
C
|
C
A
 
H
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
H
E
 
K

P27787 Ferredoxin-1, chloroplastic; Ferredoxin I; Fd I from Zea mays (Maize) (see 2 papers)
42% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 54:143/150 of P27787

query
sites
P27787
T
 
T
Y
 
Y
K
 
N
V
 
V
R
 
K
-
 
L
I
 
I
E
 
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
H
 
E
-
 
V
E
 
E
M
 
L
H
 
Q
V
 
V
E
 
P
P
 
D
G
 
D
E
 
V
T
 
Y
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
D
G
 
G
F
 
I
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
C
 
C
R
 
R
N
 
A
G
 
G
A
 
S
C
 
C
G
 
S
S
 
S
C
 
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
 
Q
G
 
S
Q
 
D
Y
 
-
Q
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
T
 
-
L
 
L
T
x
D
E
 
D
E
 
G
E
 
Q
K
 
I
A
 
A
L
 
D
G
 
G
M
 
W
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
 
C
A
 
H
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
H
E
 
K

Sites not aligning to the query:

1pfdA The solution structure of high plant parsley [2fe-2s] ferredoxin, nmr, 18 structures (see paper)
39% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 2:91/96 of 1pfdA

query
sites
1pfdA
T
 
T
Y
 
Y
K
 
N
V
 
V
R
 
K
-
 
L
I
 
I
E
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
G
H
 
E
-
 
V
E
 
E
M
 
F
H
 
K
V
 
C
E
 
D
P
 
D
G
 
D
E
 
V
T
 
Y
L
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
E
G
 
G
F
 
I
N
 
D
F
 
I
P
 
P
Y
 
Y
G
x
S
C
|
C
R
 
R
N
 
A
G
|
G
A
 
S
C
|
C
G
 
S
S
 
S
C
|
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
S
V
 
I
D
 
D
Y
 
-
G
 
-
Q
 
Q
Y
 
S
Q
 
D
A
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
E
E
 
Q
K
 
M
A
 
D
L
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
|
C
A
 
H
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
H
E
 
K

6yacN Plant psi-ferredoxin supercomplex (see paper)
39% identity, 26% coverage: 2:91/343 of query aligns to 2:91/97 of 6yacN

query
sites
6yacN
T
 
S
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
R
 
K
-
 
L
I
 
V
E
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
G
H
 
T
E
 
Q
M
 
E
H
 
F
V
 
E
E
 
C
P
 
P
G
 
S
E
 
D
T
 
V
-
 
Y
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
V
G
 
G
F
 
I
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
|
Y
G
x
S
C
|
C
R
|
R
N
 
A
G
 
G
A
 
S
C
|
C
G
 
S
S
|
S
C
|
C
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
D
 
D
Y
 
-
G
 
-
Q
 
Q
Y
 
S
Q
 
D
A
 
G
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
E
E
 
Q
K
 
I
A
 
E
L
 
A
G
 
G
M
 
F
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
|
C
A
 
V
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
C
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
H
E
 
K

1frrA Crystal structure of [2fe-2s] ferredoxin i from equisetum arvense at 1.8 angstroms resolution (see paper)
42% identity, 26% coverage: 3:90/343 of query aligns to 2:89/95 of 1frrA

query
sites
1frrA
Y
 
Y
K
 
K
V
 
T
R
 
V
I
 
L
E
 
K
-
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
E
-
 
F
E
 
T
M
 
L
H
 
D
V
 
V
E
 
P
P
 
E
G
 
G
E
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
E
R
 
E
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
N
 
D
F
 
L
P
 
P
Y
 
F
G
 
S
C
|
C
R
|
R
N
 
A
G
|
G
A
 
A
C
|
C
G
 
S
S
 
S
C
|
C
K
 
L
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
 
-
G
 
-
Q
 
E
Y
 
S
Q
 
E
A
 
G
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
G
E
 
Q
K
 
M
A
 
E
L
 
E
G
 
G
M
 
F
A
 
V
L
 
L
F
 
T
C
|
C
A
 
I
A
 
A
T
 
I
P
 
P
C
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
H

Query Sequence

>WP_028990208.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_028990208.1
MTYKVRIEPSGHEMHVEPGETLLEAALRQGFNFPYGCRNGACGSCKGKIVSGEVDYGQYQ
AYTLTEEEKALGMALFCAATPCSDLVVEVREIGAAKDIQVKTLPARVARIEDLAPDVRAV
YLKPPATERLQFLAGQYIDILLKNGKRRGFSLAGSPLNDEFLELHIKRVKGGEFTEHVFT
TLKEKDIWRFEGPLGSFYLRLDTDRPIVMMATGTGFAPIKGMLEYGFAEGLNRPVHLYWG
VRYEHDFYRLELIKEWQAAHPQFTFVPVVSRPSETWTGRTGYVTEAAMQDFADLSGFDAY
LCGHPEMVAEGARRLQEKGLPGERIFSDAFTFASQPKMVGGAE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory