SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_028990434.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_028990434.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3gegA Fingerprint and structural analysis of a scor enzyme with its bound cofactor from clostridium thermocellum (see paper)
41% identity, 96% coverage: 9:251/253 of query aligns to 5:230/241 of 3gegA

query
sites
3gegA
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
x
H
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
I
 
I
A
 
C
R
 
L
H
 
D
C
 
F
L
 
L
E
 
E
R
 
A
G
 
G
L
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
C
I
 
F
A
 
I
E
x
D
A
x
I
D
 
D
A
 
E
E
 
K
A
x
R
G
 
S
Q
 
A
E
 
D
T
 
F
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
R
A
 
P
A
 
N
L
 
L
G
 
F
D
 
Y
I
 
F
R
 
H
C
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
G
D
|
D
V
|
V
A
 
A
R
 
D
E
 
P
E
 
L
D
 
T
V
 
L
Q
 
K
R
 
K
T
 
F
V
 
V
R
 
E
E
 
Y
A
 
A
V
 
M
D
 
E
G
 
K
Y
 
L
G
 
Q
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
C
I
x
R
M
 
G
I
 
S
R
 
K
K
 
G
P
 
I
V
 
L
T
 
S
E
 
S
L
 
L
S
 
L
L
 
Y
A
 
E
E
 
E
W
 
F
R
 
D
R
 
Y
V
 
I
L
 
L
D
 
S
V
 
V
N
 
G
L
 
L
S
 
K
S
 
A
V
 
P
F
 
Y
L
 
E
G
 
L
A
 
S
K
 
R
H
 
L
A
 
C
A
 
R
P
 
D
F
 
E
L
 
L
R
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
S
|
S
T
 
T
R
 
R
G
 
A
L
 
F
M
 
Q
S
 
S
E
 
E
P
 
P
A
 
D
T
 
S
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
A
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
T
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
S
 
S
L
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
D
V
 
V
R
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
I
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
W
I
|
I
E
 
N
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
V
|
V
Q
 
T
L
 
F
R
 
T
E
 
Q
E
 
E
D
 
D
H
 
C
R
 
A
Q
 
A
H
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
K
D
 
D
V
 
I
A
 
S
S
 
N
L
 
M
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
Q
D
 
Q
E
 
D
A
 
-
G
 
-
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
T
F
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
S
R
 
K
K
 
R
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:248/253 of query aligns to 3:255/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
H
 
N
L
 
L
N
 
T
G
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
R
 
Q
H
 
A
C
 
F
L
 
L
E
 
G
R
 
Q
G
 
Q
L
 
A
K
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
E
x
D
A
x
I
D
 
D
A
 
-
E
 
E
A
 
A
G
 
Q
Q
 
G
E
 
E
T
 
A
A
 
M
A
 
V
E
 
R
L
 
K
A
 
E
A
 
N
L
 
N
G
 
D
D
 
R
I
 
L
R
 
H
C
 
F
V
 
V
A
 
Q
A
x
T
D
 
D
V
x
I
A
 
T
R
 
D
E
 
E
E
 
A
D
 
A
V
 
C
Q
 
Q
R
 
H
T
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
S
A
 
A
V
 
V
D
 
H
G
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
M
 
E
I
 
I
R
 
V
K
 
A
P
 
P
V
 
I
T
 
H
E
 
E
L
 
M
S
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
D
W
 
W
R
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
G
V
 
M
F
 
F
L
 
L
G
 
M
A
 
S
K
 
K
H
 
H
A
 
A
A
 
L
P
 
K
-
 
H
F
 
M
L
 
L
R
 
A
E
 
A
R
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
T
 
V
R
 
G
G
 
G
L
 
L
M
 
V
S
 
A
E
 
W
P
 
P
A
 
D
T
 
I
E
 
P
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
L
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
D
L
 
Y
G
 
A
P
 
K
-
 
H
A
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
S
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
I
I
|
I
E
 
D
A
 
T
G
 
P
D
 
L
W
 
N
K
 
E
K
 
K
R
 
S
S
 
F
L
 
L
R
 
E
H
 
N
P
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
V
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
K
E
 
K
E
 
E
D
 
K
H
 
A
R
 
K
Q
 
V
H
 
N
P
 
P
A
 
L
G
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
S
 
N
L
 
V
V
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
A
F
 
I
V
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
R
 
A
K
 
Q

8zaxA Crystal structure of a short-chain dehydrogenase from lactobacillus fermentum with NADPH
38% identity, 97% coverage: 2:246/253 of query aligns to 2:244/246 of 8zaxA

query
sites
8zaxA
H
 
Q
L
 
F
N
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
T
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
H
 
L
C
 
F
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
G
V
 
V
I
 
A
A
 
F
-
 
T
-
x
G
-
x
R
-
x
H
E
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
G
E
 
K
A
 
A
G
 
V
Q
 
Q
E
 
E
T
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
R
A
 
S
A
 
L
L
 
F
G
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
C
 
-
V
 
I
A
 
T
A
x
Q
D
|
D
V
|
V
A
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
D
 
D
V
 
W
Q
 
Q
R
 
N
T
 
A
V
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
V
D
 
E
G
 
K
Y
 
F
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
M
 
G
I
 
T
R
 
P
K
 
L
P
 
G
V
 
I
T
 
E
E
 
E
L
 
M
S
 
T
L
 
L
A
 
D
E
 
H
W
 
W
R
 
N
R
 
R
V
 
E
L
 
I
D
 
A
V
x
I
N
 
D
L
 
L
S
 
T
S
 
G
V
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
C
K
 
K
H
 
Y
A
 
G
A
 
V
P
 
K
F
 
A
L
 
M
R
 
K
E
 
E
R
 
H
R
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
M
M
 
I
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
V
E
 
P
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
R
A
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
V
A
 
A
V
 
L
S
 
E
L
 
C
-
 
A
-
 
E
-
 
K
G
 
G
P
 
Y
A
 
A
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
S
V
 
I
S
 
Y
P
|
P
G
 
G
W
 
V
I
|
I
E
 
A
A
 
T
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
P
S
 
L
L
 
I
R
 
D
H
 
H
P
 
L
V
 
D
Q
 
D
L
 
A
R
 
T
E
 
K
E
 
Q
D
 
F
H
 
Y
-
 
I
R
 
D
Q
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
V
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
G
A
 
A
G
 
S
F
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 3:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
N
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
H
H
 
S
C
 
Y
L
 
A
E
 
K
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
S
E
x
D
A
x
I
D
 
N
A
 
E
E
 
D
A
 
H
G
 
G
Q
 
N
E
 
K
T
 
A
A
 
V
A
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
-
 
G
D
 
E
I
 
A
R
 
S
C
 
F
V
 
V
A
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
A
 
S
R
 
N
E
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
Q
 
E
R
 
A
T
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
T
V
 
V
D
 
E
G
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
M
 
G
I
 
G
R
 
E
K
 
Q
P
 
A
V
 
L
T
 
A
-
 
G
E
 
D
L
 
Y
S
 
G
L
 
L
A
 
D
E
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
Y
G
 
G
A
 
C
K
 
K
H
 
Y
A
 
E
A
 
L
P
 
E
F
 
Q
L
 
M
R
 
E
E
 
K
R
 
N
R
 
G
G
 
G
A
 
G
-
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
T
 
I
R
 
H
G
 
G
L
 
I
M
 
V
S
 
A
E
 
A
P
 
P
A
 
L
T
 
S
E
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
N
L
 
I
A
 
G
V
 
A
S
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
Q
A
 
K
-
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
W
x
Y
I
|
I
E
 
E
A
 
T
G
 
P
D
x
L
W
 
L
K
 
E
K
 
S
R
 
L
S
 
T
L
 
K
R
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
E
L
 
M
R
 
K
E
 
E
E
 
A
D
 
L
H
 
I
R
 
S
Q
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
G
 
S
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
G
D
 
Y
F
 
Y
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

8y83A Crystal structure of a ketoreductase from sphingobacterium siyangense sy1 with co-enzyme (see paper)
39% identity, 95% coverage: 6:246/253 of query aligns to 7:247/249 of 8y83A

query
sites
8y83A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
L
H
 
A
C
 
Y
L
 
G
E
 
K
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
S
E
x
D
A
x
I
D
 
N
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
N
E
 
E
T
 
T
A
 
V
A
 
K
E
 
Q
L
 
I
A
 
E
A
 
S
L
 
L
G
 
G
-
 
G
D
 
E
I
 
A
R
 
V
C
 
F
V
 
F
A
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
S
A
 
S
R
 
S
E
 
P
E
 
A
D
 
D
V
 
N
Q
 
E
R
 
A
T
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
K
G
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
M
 
G
I
 
G
R
 
E
K
 
A
P
 
A
V
 
L
T
 
T
-
 
G
E
 
D
L
 
Y
S
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
G
W
 
W
R
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
I
N
 
N
L
 
F
S
 
N
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
Y
G
 
G
A
 
C
K
 
K
H
 
Y
A
 
Q
A
 
I
P
 
E
F
 
A
L
 
M
-
 
E
R
 
R
E
 
N
R
 
G
R
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
 
S
T
 
I
R
 
H
G
 
G
L
 
T
M
 
V
S
 
A
E
 
A
P
 
P
A
 
M
T
 
S
E
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
N
L
 
I
A
 
G
V
 
A
S
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
Q
A
 
K
-
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
S
 
G
P
|
P
G
|
G
W
x
Y
I
|
I
E
 
D
A
 
T
G
 
P
D
x
L
W
 
L
K
 
A
K
 
K
R
 
L
S
 
D
L
 
K
R
 
E
H
 
H
P
 
I
V
 
N
Q
 
A
L
 
L
R
 
I
E
 
S
E
 
-
D
 
-
H
 
-
R
 
-
Q
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
S
G
 
S
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
G
D
 
Y
F
 
Y
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

Q6WVP7 NADP-dependent (R)-specific alcohol dehydrogenase; (R)-specific ADH; Ketoreductase; KRED; EC 1.1.1.- from Lentilactobacillus kefiri (Lactobacillus kefiri) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 5:250/252 of Q6WVP7

query
sites
Q6WVP7
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
x
T
Q
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
K
C
 
F
L
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
T
E
 
G
A
x
R
D
x
H
A
 
A
E
 
D
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
G
L
 
T
G
 
D
D
 
V
I
 
I
R
 
R
C
 
F
V
 
V
A
 
Q
A
 
H
D
|
D
V
x
A
A
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
A
D
 
G
V
 
W
Q
 
T
R
 
K
T
 
L
V
 
F
R
 
D
E
 
T
A
 
T
V
 
E
D
 
E
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
T
Y
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
M
 
A
I
 
V
R
 
S
K
 
K
P
 
S
V
 
V
T
 
E
E
 
D
L
 
T
S
 
T
L
 
T
A
 
E
E
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
T
K
 
R
H
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
F
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
R
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
F
M
 
V
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
L
E
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
R
I
 
I
I
 
M
A
 
S
L
 
K
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
V
 
C
S
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
D
A
 
Y
-
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
 
G
W
 
Y
I
|
I
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
|
K
R
x
T
S
x
P
L
|
L
R
 
V
H
 
D
P
 
D
V
 
L
Q
 
E
L
 
G
R
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
M
H
 
M
R
 
S
Q
 
Q
H
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
W
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

1zk1A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 4:249/251 of 1zk1A

query
sites
1zk1A
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
T
Q
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
T
H
 
K
C
 
F
L
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
A
 
T
E
x
D
A
 
R
D
 
H
A
 
S
E
 
D
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
S
L
 
V
A
 
G
A
 
T
L
 
P
G
 
D
D
 
Q
I
 
I
R
 
Q
C
 
F
V
 
F
A
 
Q
A
x
H
D
|
D
V
x
S
A
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
D
D
 
G
V
 
W
Q
 
T
R
 
K
T
 
L
V
 
F
R
 
D
E
 
A
A
 
T
V
 
E
D
 
K
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
S
Y
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
M
x
A
I
 
V
R
x
N
K
 
K
P
 
S
V
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
T
S
 
T
L
 
T
A
 
A
E
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
T
K
 
R
H
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
F
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
R
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
F
M
 
V
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
L
E
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
R
I
 
I
I
 
M
A
 
S
L
 
K
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
V
 
C
S
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
D
A
 
Y
-
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
W
x
Y
I
|
I
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
K
R
 
T
S
 
P
L
|
L
R
 
V
H
 
D
P
 
D
V
 
L
Q
 
P
L
 
G
R
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
A
H
 
M
R
 
S
Q
 
Q
H
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
G
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

1zjzA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 4:249/251 of 1zjzA

query
sites
1zjzA
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
T
Q
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
T
H
 
K
C
 
F
L
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
A
 
T
E
x
D
A
 
R
D
 
H
A
 
S
E
 
D
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
S
L
 
V
A
 
G
A
 
T
L
 
P
G
 
D
D
 
Q
I
 
I
R
 
Q
C
 
F
V
 
F
A
 
Q
A
 
H
D
|
D
V
 
S
A
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
D
D
 
G
V
 
W
Q
 
T
R
 
K
T
 
L
V
 
F
R
 
D
E
 
A
A
 
T
V
 
E
D
 
K
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
S
Y
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
M
x
A
I
 
V
R
x
N
K
 
K
P
 
S
V
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
T
S
 
T
L
 
T
A
 
A
E
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
T
K
 
R
H
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
F
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
R
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
F
M
 
V
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
S
T
x
L
E
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
R
I
 
I
I
 
M
A
 
S
L
 
K
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
V
 
C
S
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
D
A
 
Y
-
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
W
 
Y
I
|
I
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
K
R
 
T
S
 
P
L
|
L
R
 
V
H
 
D
P
 
D
V
 
L
Q
 
P
L
 
G
R
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
A
H
 
M
R
 
S
Q
 
Q
H
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
G
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

1zjyA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and nadh (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 4:249/251 of 1zjyA

query
sites
1zjyA
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
T
Q
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
T
H
 
K
C
 
F
L
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
A
 
T
E
x
D
A
 
R
D
 
H
A
 
S
E
 
D
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
S
L
 
V
A
 
G
A
 
T
L
 
P
G
 
D
D
 
Q
I
 
I
R
 
Q
C
 
F
V
 
F
A
 
Q
A
 
H
D
|
D
V
 
S
A
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
D
D
 
G
V
 
W
Q
 
T
R
 
K
T
 
L
V
 
F
R
 
D
E
 
A
A
 
T
V
 
E
D
 
K
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
S
Y
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
M
x
A
I
 
V
R
x
N
K
 
K
P
 
S
V
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
T
S
 
T
L
 
T
A
 
A
E
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
T
K
 
R
H
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
F
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
R
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
F
M
 
V
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
S
T
x
L
E
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
R
I
 
I
I
 
M
A
 
S
L
 
K
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
V
 
C
S
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
D
A
 
Y
-
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
W
x
Y
I
|
I
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
K
R
 
T
S
 
P
L
|
L
R
 
V
H
 
D
P
 
D
V
 
L
Q
 
P
L
 
G
R
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
A
H
 
M
R
 
S
Q
 
Q
H
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
G
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

7ejiB Crystal structure of kred f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f variant and methyl methacrylate complex
38% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 4:249/251 of 7ejiB

query
sites
7ejiB
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
T
Q
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
K
C
 
F
L
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
T
E
 
G
A
x
R
D
x
H
A
 
A
E
 
D
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
G
L
 
T
G
 
D
D
 
V
I
 
I
R
 
R
C
 
F
V
 
V
A
 
Q
A
 
H
D
|
D
V
x
A
A
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
A
D
 
G
V
 
W
Q
 
T
R
 
K
T
 
L
V
 
F
R
 
D
E
 
T
A
 
T
V
 
E
D
 
E
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
T
Y
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
M
 
A
I
 
V
R
 
S
K
 
K
P
 
S
V
 
V
T
 
E
E
 
D
L
 
T
S
 
T
L
 
T
A
 
E
E
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
S
V
|
V
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
T
K
 
R
H
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
F
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
R
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
T
x
I
R
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
V
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
Q
E
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
R
A
 
I
L
 
M
T
 
S
H
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
L
S
 
D
L
 
C
G
 
A
P
 
L
A
 
K
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
x
P
I
|
I
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
K
R
x
T
S
x
P
L
|
L
R
 
V
H
 
D
P
 
D
V
 
A
Q
 
E
L
 
G
R
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
F
H
x
F
R
 
S
Q
 
Q
H
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
W
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

7ejhA Crystal structure of kred mutant-f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f and 2-hydroxyisoindoline-1,3-dione complex
38% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 6:251/253 of 7ejhA

query
sites
7ejhA
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
T
Q
 
L
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
K
C
 
F
L
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
T
E
 
G
A
x
R
D
x
H
A
 
A
E
 
D
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
G
L
 
T
G
 
D
D
 
V
I
 
I
R
 
R
C
 
F
V
 
V
A
 
Q
A
 
H
D
|
D
V
x
A
A
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
A
D
 
G
V
 
W
Q
 
T
R
 
K
T
 
L
V
 
F
R
 
D
E
 
T
A
 
T
V
 
E
D
 
E
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
T
Y
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
M
 
A
I
 
V
R
 
S
K
 
K
P
 
S
V
 
V
T
 
E
E
 
D
L
 
T
S
 
T
L
 
T
A
 
E
E
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
S
V
|
V
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
T
K
 
R
H
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
F
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
R
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
T
x
I
R
x
E
G
 
G
L
 
L
M
 
V
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
Q
E
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
R
A
 
I
L
 
M
T
 
S
H
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
L
S
 
D
L
 
C
G
 
A
P
 
L
A
 
K
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
H
P
|
P
G
|
G
W
x
P
I
|
I
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
K
R
x
T
S
x
P
L
|
L
R
x
V
H
 
D
P
 
D
V
 
A
Q
 
E
L
 
G
R
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
F
H
x
F
R
 
S
Q
 
Q
H
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
W
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

1zk4A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (wildtype) from lactobacillus brevis in complex with acetophenone and NADP (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 4:249/251 of 1zk4A

query
sites
1zk4A
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
T
Q
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
T
H
 
K
C
 
F
L
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
A
x
T
E
x
G
A
x
R
D
 
H
A
 
S
E
 
D
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
S
L
 
V
A
 
G
A
 
T
L
 
P
G
 
D
D
 
Q
I
 
I
R
 
Q
C
 
F
V
 
F
A
 
Q
A
x
H
D
|
D
V
 
S
A
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
D
D
 
G
V
 
W
Q
 
T
R
 
K
T
 
L
V
 
F
R
 
D
E
 
A
A
 
T
V
 
E
D
 
K
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
S
Y
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
M
x
A
I
 
V
R
 
N
K
 
K
P
 
S
V
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
T
S
 
T
L
 
T
A
 
A
E
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
T
K
 
R
H
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
F
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
R
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
F
M
 
V
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
L
E
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
R
I
 
I
I
 
M
A
 
S
L
 
K
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
V
 
C
S
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
D
A
 
Y
-
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
W
x
Y
I
|
I
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
K
R
x
T
S
 
P
L
|
L
R
 
V
H
 
D
P
 
D
V
 
L
Q
 
P
L
 
G
R
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
A
H
 
M
R
 
S
Q
 
Q
H
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
G
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

6y0sAAA R-specific alcohol dehydrogenase (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 4:249/251 of 6y0sAAA

query
sites
6y0sAAA
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
x
T
Q
 
L
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
T
H
 
K
C
 
F
L
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
A
 
T
E
x
G
A
 
R
D
x
H
A
 
S
E
 
D
A
x
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
S
L
 
V
A
 
G
A
 
T
L
 
P
G
 
D
D
 
Q
I
 
I
R
 
Q
C
 
F
V
 
F
A
 
Q
A
 
H
D
 
D
V
 
S
A
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
D
D
 
G
V
 
W
Q
 
T
R
 
K
T
 
L
V
 
F
R
 
D
E
 
A
A
 
T
V
 
E
D
 
K
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
S
Y
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
M
 
A
I
 
V
R
 
N
K
 
K
P
 
S
V
 
V
T
 
E
E
 
E
L
 
T
S
 
E
L
 
T
A
 
A
E
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
T
K
 
R
H
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
F
 
R
L
 
M
R
 
K
E
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
R
x
G
G
x
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
F
M
 
V
S
 
G
E
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
L
E
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
R
I
 
I
I
 
M
A
 
S
L
 
K
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
V
 
C
S
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
D
A
 
Y
-
x
D
V
 
V
R
|
R
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
 
G
W
 
Y
I
 
I
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
K
R
 
T
S
 
P
L
 
L
R
 
V
H
 
D
P
 
D
V
 
L
Q
 
P
L
 
G
R
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
A
H
 
M
R
 
S
Q
 
Q
H
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
T
P
 
P
A
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
Y
L
 
I
V
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
G
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
38% identity, 96% coverage: 3:246/253 of query aligns to 9:253/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
L
 
L
N
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
H
 
A
C
 
L
L
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
N
E
 
Y
A
|
A
D
x
S
A
x
S
E
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
E
 
D
-
 
A
-
 
V
T
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
I
L
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
G
G
 
G
D
 
R
I
 
A
R
 
V
C
 
A
V
 
V
A
 
G
A
x
G
D
|
D
V
|
V
A
 
S
R
 
K
E
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
A
Q
 
Q
R
 
R
T
 
I
V
 
V
R
 
D
E
 
T
A
 
A
V
 
I
D
 
E
G
 
T
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
V
M
x
Y
I
 
E
R
 
F
K
 
A
P
 
P
V
 
I
T
 
E
E
 
A
L
 
I
S
 
T
L
 
E
A
 
E
E
 
H
W
 
Y
R
 
R
R
 
R
V
 
Q
L
 
F
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
V
S
 
F
S
 
G
V
 
V
F
 
L
L
 
L
G
 
T
A
 
T
K
 
Q
H
 
A
A
 
A
A
 
V
P
 
K
F
 
H
L
 
L
R
 
G
E
 
E
R
 
-
R
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
V
R
 
V
G
 
T
L
 
S
M
 
I
S
 
T
E
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
S
E
 
A
A
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
G
S
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
D
A
 
A
L
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
L
S
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
-
 
R
A
 
K
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
I
S
 
N
P
|
P
G
|
G
W
x
M
I
|
I
E
 
V
A
x
T
G
 
E
D
x
G
W
x
T
K
 
H
K
 
S
R
 
A
S
 
G
L
x
I
R
 
I
H
 
G
P
 
S
V
 
-
Q
 
D
L
 
L
R
 
E
E
 
A
E
 
Q
D
 
V
H
 
L
R
 
G
Q
 
Q
H
 
T
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
R
F
 
W
V
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
H
F
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
L
T
 
N

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 96% coverage: 3:244/253 of query aligns to 4:236/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
L
 
L
N
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
K
 
A
A
 
S
I
 
H
A
 
V
R
 
R
H
 
A
C
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
F
A
 
G
E
x
D
A
 
I
D
x
L
A
 
D
E
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
K
E
 
A
T
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
A
G
 
-
D
 
-
I
 
A
R
 
R
C
 
Y
V
 
V
A
 
H
A
x
L
D
|
D
V
|
V
A
 
T
R
 
Q
E
 
P
E
 
A
D
 
Q
V
 
W
Q
 
K
R
 
A
T
 
A
V
 
V
R
 
D
E
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
T
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
H
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
M
x
L
I
 
N
R
 
I
K
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
E
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
I
K
 
R
H
 
A
A
 
V
A
 
V
P
 
K
F
 
P
L
 
M
R
 
K
E
 
E
R
 
A
-
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
x
E
G
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
G
E
 
T
P
 
V
A
 
A
T
x
C
E
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
I
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
T
A
 
A
V
 
L
S
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
S
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
S
V
 
I
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
 
L
I
x
V
E
 
K
A
x
T
-
x
P
-
x
M
G
x
T
D
 
D
W
 
W
K
x
V
K
 
P
R
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
E
D
 
D
H
x
I
R
x
F
Q
 
Q
H
 
T
P
 
A
A
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
V
D
 
E
V
 
V
A
 
S
S
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 96% coverage: 3:244/253 of query aligns to 4:236/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
L
 
L
N
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
G
G
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
K
 
A
A
 
S
I
 
H
A
 
V
R
 
R
H
 
A
C
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
F
A
 
G
E
x
D
A
x
I
D
x
L
A
 
D
E
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
K
E
 
A
T
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
A
G
 
-
D
 
-
I
 
A
R
 
R
C
 
Y
V
 
V
A
 
H
A
x
L
D
|
D
V
|
V
A
 
T
R
 
Q
E
 
P
E
 
A
D
 
Q
V
 
W
Q
 
K
R
 
A
T
 
A
V
 
V
R
 
D
E
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
T
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
H
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
M
 
L
I
 
N
R
 
I
K
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
E
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
I
K
 
R
H
 
A
A
 
V
A
 
V
P
 
K
F
 
P
L
 
M
R
 
K
E
 
E
R
 
A
-
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
G
E
 
T
P
 
V
A
 
A
T
 
C
E
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
I
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
T
A
 
A
V
 
L
S
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
S
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
S
V
 
I
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
 
L
I
x
V
E
 
K
A
x
T
-
x
P
-
x
M
G
x
T
D
 
D
W
 
W
K
 
V
K
 
P
R
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
E
D
 
D
H
 
I
R
 
F
Q
 
Q
H
 
T
P
 
A
A
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
V
D
 
E
V
 
V
A
 
S
S
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
41% identity, 96% coverage: 3:244/253 of query aligns to 5:237/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
L
 
L
N
x
I
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
A
Q
x
R
G
 
G
I
x
M
G
 
G
K
 
A
A
 
S
I
 
H
A
 
V
R
 
R
H
 
A
C
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
F
A
 
G
E
x
D
A
 
I
D
 
L
A
 
D
E
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
K
E
 
A
T
x
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
A
G
 
-
D
 
-
I
 
A
R
 
R
C
 
Y
V
 
V
A
 
H
A
 
L
D
|
D
V
|
V
A
 
T
R
 
Q
E
 
P
E
 
A
D
 
Q
V
 
W
Q
x
T
R
 
A
T
 
A
V
 
V
R
 
D
E
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
T
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
H
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
M
 
L
I
 
N
R
 
I
K
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
E
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
I
K
 
R
H
 
A
A
 
V
A
 
V
P
 
K
F
 
P
L
 
M
R
 
K
E
 
E
R
 
A
-
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
G
E
 
T
P
 
V
A
 
A
T
 
C
E
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
I
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
T
A
 
A
V
 
L
S
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
S
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
S
V
 
I
S
 
H
P
 
P
G
 
G
W
 
L
I
x
V
E
 
K
A
x
T
-
 
P
-
 
M
G
x
T
D
 
D
W
 
W
K
 
V
K
 
P
R
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
E
D
 
D
H
 
I
R
 
F
Q
 
Q
H
 
T
P
 
A
A
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
V
D
 
E
V
 
V
A
 
S
S
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
37% identity, 96% coverage: 1:244/253 of query aligns to 1:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
H
 
G
L
 
I
N
 
Q
G
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
Q
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
I
 
T
A
 
A
R
 
L
H
 
R
C
 
F
L
 
A
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
L
 
A
K
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
N
E
x
D
A
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
K
G
 
V
Q
 
R
E
 
A
T
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
R
G
 
G
D
 
H
-
 
R
I
 
V
R
 
L
C
 
G
V
 
A
A
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
A
 
G
R
 
N
E
 
K
E
 
A
D
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
G
T
 
M
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
M
 
E
I
 
R
R
 
A
K
 
G
P
 
A
V
 
L
T
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
R
 
D
R
 
V
V
 
T
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
K
S
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
C
A
 
T
K
 
Q
H
 
A
A
 
V
A
 
H
P
 
G
F
 
H
L
 
M
R
 
V
E
 
E
R
 
N
R
 
K
-
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
-
R
 
R
G
 
A
L
 
W
M
 
L
S
 
G
E
 
G
P
 
A
A
 
G
T
 
Q
E
 
T
A
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
H
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
A
 
A
-
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
L
I
 
I
E
 
H
A
 
T
G
 
P
D
 
M
W
 
W
K
 
D
K
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
E
 
E
E
 
K
D
 
D
H
 
Q
R
 
Q
-
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
S
Q
 
R
H
 
Q
P
 
P
A
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
N
L
 
T
V
 
L
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
D
 
V
F
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
37% identity, 96% coverage: 3:244/253 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
N
 
Q
G
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
I
 
T
A
 
A
R
 
L
H
 
R
C
 
F
L
 
A
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
L
 
A
K
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
N
E
x
D
A
x
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
K
G
 
V
Q
 
R
E
 
A
T
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
R
G
 
G
D
 
H
-
 
R
I
 
V
R
 
L
C
 
G
V
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
A
 
G
R
 
N
E
 
K
E
 
A
D
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
G
T
 
M
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
M
 
E
I
 
R
R
 
A
K
 
G
P
 
A
V
 
L
T
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
R
 
D
R
 
V
V
 
T
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
K
S
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
C
A
 
T
K
 
Q
H
 
A
A
 
V
A
 
H
P
 
G
F
 
H
L
 
M
R
 
V
E
 
E
R
 
N
R
 
K
-
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
T
 
-
R
 
R
G
 
A
L
 
W
M
 
L
S
 
G
E
 
G
P
 
A
A
 
G
T
 
Q
E
 
T
A
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
H
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
A
 
A
-
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
L
I
|
I
E
 
H
A
 
T
G
 
P
D
 
M
W
 
W
K
 
D
K
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
E
 
E
E
 
K
D
 
D
H
 
Q
R
 
Q
-
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
S
Q
 
R
H
 
Q
P
 
P
A
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
S
 
N
L
 
T
V
 
L
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
D
 
V
F
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
36% identity, 97% coverage: 1:246/253 of query aligns to 1:242/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
M
 
M
H
 
R
L
 
F
N
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
Q
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
R
C
 
F
L
 
S
E
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
E
x
D
A
 
W
D
 
A
A
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
V
Q
 
D
E
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
L
A
 
P
A
 
K
L
 
-
G
 
G
D
 
R
I
 
A
R
 
M
C
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
I
D
|
D
V
|
V
A
 
S
R
 
D
E
 
H
E
 
V
D
 
A
V
 
V
Q
 
E
R
 
K
T
 
M
V
 
M
R
 
N
E
 
E
A
 
V
V
 
A
D
 
E
G
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
M
 
H
I
 
V
R
 
A
K
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
L
E
 
E
L
 
T
S
 
S
L
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
R
 
R
R
 
R
V
 
I
L
 
A
D
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
I
S
 
D
S
 
G
V
 
V
F
 
V
L
 
F
G
 
C
A
 
S
K
 
K
H
 
F
A
 
A
A
 
L
P
 
P
F
 
H
L
 
L
R
 
L
E
 
K
R
 
T
R
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
T
x
V
R
x
S
G
 
G
L
 
L
M
 
G
S
 
G
E
 
D
P
 
W
A
 
G
T
 
A
E
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
H
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
L
S
 
D
L
 
H
-
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
S
 
C
P
 
P
G
 
S
W
 
L
I
x
V
E
 
K
A
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
x
T
K
 
N
R
 
M
S
 
T
L
 
N
R
 
G
H
 
W
P
 
P
V
 
Q
Q
 
E
L
 
I
R
|
R
E
x
D
E
x
K
D
 
F
H
 
N
R
 
E
Q
 
R
H
 
I
P
 
A
A
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
V
V
 
M
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
A
 
A
D
 
N
F
 
I
V
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_028990434.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_028990434.1
MHLNGKVAIVTGGGQGIGKAIARHCLERGLKVVIAEADAEAGQETAAELAALGDIRCVAA
DVAREEDVQRTVREAVDGYGRLDYLVNNAGIMIRKPVTELSLAEWRRVLDVNLSSVFLGA
KHAAPFLRERRGAIVNIASTRGLMSEPATEAYSASKGGIIALTHALAVSLGPAVRVNCVS
PGWIEAGDWKKRSLRHPVQLREEDHRQHPAGRVGRPEDVASLVLYLLSDEAGFVTGADFV
VDGGMTRKMIYVE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory