SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_028996415.1 NCBI__GCF_000430725.1:WP_028996415.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3r7lA Crystal structure of pala-bound aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
42% identity, 93% coverage: 17:312/320 of query aligns to 3:285/290 of 3r7lA

query
sites
3r7lA
H
 
H
L
 
L
L
 
T
S
 
T
T
 
M
E
 
S
G
 
E
L
 
L
P
 
S
R
 
T
A
 
E
V
 
E
L
 
I
T
 
K
Q
 
D
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
A
 
A
S
 
Q
T
 
E
F
 
-
L
 
L
A
 
K
V
 
S
G
 
G
E
 
K
R
 
T
E
 
D
I
 
N
K
 
Q
K
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
F
V
 
A
F
 
A
N
 
N
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
F
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
K
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
M
D
 
N
V
 
V
I
 
L
N
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
G
A
 
T
R
 
S
S
 
T
S
|
S
T
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
S
M
 
I
Q
 
G
A
 
V
D
 
D
M
 
V
F
 
C
V
 
V
V
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
S
E
 
E
S
 
D
G
 
E
-
 
Y
A
 
Y
P
 
E
Y
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
S
Q
 
Q
H
 
V
C
 
N
A
 
I
P
 
P
H
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
C
H
 
G
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
R
 
Y
H
 
E
F
 
E
K
 
F
K
 
N
D
 
T
F
 
F
T
 
K
N
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
A
H
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
-
P
 
A
E
 
R
I
 
V
R
 
L
A
 
F
V
 
S
G
 
G
P
 
P
T
 
S
T
 
E
L
 
W
V
 
-
P
 
Q
D
 
D
N
 
E
L
 
E
R
 
N
E
 
T
M
 
F
G
 
G
V
 
T
R
 
Y
V
 
V
C
 
S
R
 
M
D
 
D
M
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
A
I
 
V
R
 
E
D
 
S
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
M
M
 
L
L
|
L
R
|
R
L
 
I
Q
|
Q
N
 
N
E
 
E
R
 
R
M
 
H
G
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
-
P
 
-
S
 
S
A
 
Q
G
 
E
E
 
G
F
 
Y
F
 
L
K
 
N
H
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
V
E
 
E
K
 
R
L
 
A
A
 
E
L
 
R
A
 
M
K
 
K
P
 
R
D
 
H
A
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
A
P
 
P
I
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
S
 
D
A
 
S
V
 
L
A
 
V
D
 
E
G
 
S
R
 
E
H
 
K
S
 
S
V
 
R
I
 
I
L
 
F
P
 
K
Q
 
Q
V
 
M
T
 
K
F
 
N
G
|
G
I
 
V
A
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
I

3r7fA Crystal structure of cp-bound aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
42% identity, 93% coverage: 17:312/320 of query aligns to 3:285/291 of 3r7fA

query
sites
3r7fA
H
 
H
L
 
L
L
 
T
S
 
T
T
 
M
E
 
S
G
 
E
L
 
L
P
x
S
R
x
T
A
 
E
V
 
E
L
 
I
T
 
K
Q
 
D
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
A
 
A
S
x
Q
T
 
E
F
 
-
L
 
L
A
x
K
V
 
S
G
 
G
E
 
K
R
 
T
E
 
D
I
 
N
K
 
Q
K
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
F
V
 
A
F
 
A
N
 
N
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
F
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
K
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
M
D
 
N
V
 
V
I
 
L
N
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
G
A
 
T
R
 
S
S
 
T
S
 
S
T
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
S
M
 
I
Q
 
G
A
 
V
D
 
D
M
 
V
F
 
C
V
 
V
V
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
S
E
 
E
S
 
D
G
 
E
-
 
Y
A
 
Y
P
 
E
Y
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
S
Q
 
Q
H
 
V
C
 
N
A
 
I
P
 
P
H
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
C
H
 
G
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
R
 
Y
H
x
E
F
 
E
K
 
F
K
 
N
D
 
T
F
 
F
T
 
K
N
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
A
H
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
T
T
x
R
L
 
L
G
 
G
V
 
-
P
 
A
E
 
R
I
 
V
R
 
L
A
 
F
V
 
S
G
 
G
P
 
P
T
 
S
T
 
E
L
 
W
V
 
-
P
 
Q
D
 
D
N
 
E
L
 
E
R
 
N
E
 
T
M
 
F
G
 
G
V
 
T
R
 
Y
V
 
V
C
 
S
R
 
M
D
 
D
M
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
A
I
 
V
R
 
E
D
 
S
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
M
M
 
L
L
|
L
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
R
 
R
M
 
H
G
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
-
P
 
-
S
 
S
A
 
Q
G
 
E
E
 
G
F
 
Y
F
 
L
K
 
N
H
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
V
E
 
E
K
 
R
L
 
A
A
 
E
L
 
R
A
 
M
K
|
K
P
 
R
D
x
H
A
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
A
P
 
P
I
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
S
 
D
A
 
S
V
 
L
A
 
V
D
 
E
G
 
S
R
 
E
H
 
K
S
 
S
V
 
R
I
 
I
L
 
F
P
x
K
Q
 
Q
V
 
M
T
x
K
F
 
N
G
|
G
I
 
V
A
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
I

3r7dA Crystal structure of unliganded aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
42% identity, 93% coverage: 17:312/320 of query aligns to 3:285/291 of 3r7dA

query
sites
3r7dA
H
 
H
L
 
L
L
 
T
S
 
T
T
 
M
E
 
S
G
 
E
L
 
L
P
x
S
R
x
T
A
 
E
V
 
E
L
 
I
T
 
K
Q
 
D
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
A
 
A
S
 
Q
T
 
E
F
 
-
L
 
L
A
 
K
V
 
S
G
 
G
E
 
K
R
 
T
E
 
D
I
 
N
K
 
Q
K
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
F
V
 
A
F
 
A
N
 
N
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
F
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
K
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
M
D
 
N
V
 
V
I
 
L
N
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
G
A
 
T
R
 
S
S
x
T
S
|
S
T
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
S
M
 
I
Q
 
G
A
 
V
D
 
D
M
 
V
F
 
C
V
 
V
V
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
S
E
 
E
S
 
D
G
 
E
-
 
Y
A
 
Y
P
 
E
Y
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
S
Q
 
Q
H
 
V
C
 
N
A
 
I
P
 
P
H
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
C
H
 
G
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
R
 
Y
H
 
E
F
 
E
K
 
F
K
 
N
D
 
T
F
 
F
T
 
K
N
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
A
H
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
T
T
x
R
L
 
L
G
 
G
V
 
-
P
 
A
E
 
R
I
 
V
R
 
L
A
 
F
V
 
S
G
 
G
P
 
P
T
 
S
T
 
E
L
 
W
V
 
-
P
 
Q
D
 
D
N
 
E
L
 
E
R
 
N
E
 
T
M
 
F
G
 
G
V
 
T
R
 
Y
V
 
V
C
 
S
R
 
M
D
 
D
M
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
A
I
 
V
R
 
E
D
 
S
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
M
M
 
L
L
|
L
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
R
 
R
M
 
H
G
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
-
P
 
-
S
 
S
A
 
Q
G
 
E
E
 
G
F
 
Y
F
 
L
K
 
N
H
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
V
E
 
E
K
 
R
L
 
A
A
 
E
L
 
R
A
 
M
K
 
K
P
 
R
D
 
H
A
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
A
P
 
P
I
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
S
 
D
A
 
S
V
 
L
A
 
V
D
 
E
G
 
S
R
 
E
H
 
K
S
 
S
V
 
R
I
 
I
L
 
F
P
 
K
Q
 
Q
V
 
M
T
 
K
F
 
N
G
|
G
I
 
V
A
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
I

P05654 Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
42% identity, 93% coverage: 17:312/320 of query aligns to 3:285/304 of P05654

query
sites
P05654
H
 
H
L
 
L
L
 
T
S
 
T
T
 
M
E
 
S
G
 
E
L
 
L
P
 
S
R
 
T
A
 
E
V
 
E
L
 
I
T
 
K
Q
 
D
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
A
 
A
S
 
Q
T
 
E
F
 
-
L
 
L
A
 
K
V
 
S
G
 
G
E
 
K
R
 
T
E
 
D
I
 
N
K
 
Q
K
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
F
V
 
A
F
 
A
N
 
N
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
T
 
F
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
K
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
M
D
 
N
V
 
V
I
 
L
N
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
G
A
 
T
R
 
S
S
 
T
S
 
S
T
 
V
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
S
M
 
I
Q
 
G
A
 
V
D
 
D
M
 
V
F
 
C
V
 
V
V
 
I
R
 
R
H
 
H
S
 
S
E
 
E
S
 
D
G
 
E
-
 
Y
A
 
Y
P
 
E
Y
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
S
Q
 
Q
H
 
V
C
 
N
A
 
I
P
 
P
H
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
C
H
 
G
A
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
G
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
R
 
Y
H
 
E
F
 
E
K
 
F
K
 
N
D
 
T
F
 
F
T
 
K
N
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
A
H
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
-
P
 
A
E
 
R
I
 
V
R
 
L
A
 
F
V
 
S
G
 
G
P
 
P
T
 
S
T
 
E
L
 
W
V
 
-
P
 
Q
D
 
D
N
 
E
L
 
E
R
 
N
E
 
T
M
 
F
G
 
G
V
 
T
R
 
Y
V
 
V
C
 
S
R
 
M
D
 
D
M
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
A
I
 
V
R
 
E
D
 
S
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
M
M
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
R
 
R
M
 
H
G
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
-
P
 
-
S
 
S
A
 
Q
G
 
E
E
 
G
F
 
Y
F
 
L
K
 
N
H
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
V
E
 
E
K
 
R
L
 
A
A
 
E
L
 
R
A
 
M
K
 
K
P
 
R
D
 
H
A
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
A
P
 
P
I
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
S
 
D
A
 
S
V
 
L
A
 
V
D
 
E
G
 
S
R
 
E
H
 
K
S
 
S
V
 
R
I
 
I
L
 
F
P
 
K
Q
 
Q
V
 
M
T
 
K
F
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
I

Sites not aligning to the query:

6pnzA The structure of the aspartate transcarbamoylase trimer from staphylococcus aureus complexed with pala at 2.27 resolution.
39% identity, 93% coverage: 17:312/320 of query aligns to 3:288/293 of 6pnzA

query
sites
6pnzA
H
 
H
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
H
L
 
L
P
 
S
R
 
T
A
 
D
V
 
Q
L
 
I
T
 
Y
Q
 
K
I
 
L
L
 
I
D
 
Q
T
 
K
A
 
A
S
 
S
T
 
Q
F
 
F
L
 
K
A
 
S
V
 
-
G
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
Q
I
 
L
K
 
-
K
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
N
L
 
F
R
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
Y
V
 
V
F
 
A
N
 
N
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
N
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
K
T
 
C
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
M
A
 
A
A
 
E
K
 
L
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
L
D
 
K
V
 
T
I
 
I
N
 
S
L
 
F
D
 
E
I
 
T
A
 
S
R
 
T
S
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
S
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
I
 
C
A
 
K
N
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
S
M
 
I
Q
 
G
A
 
C
D
 
D
M
 
L
F
 
L
V
 
V
V
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
P
E
 
F
S
 
N
G
 
N
A
 
Y
P
 
Y
Y
 
E
L
 
K
I
 
L
A
 
A
Q
 
N
H
 
I
C
 
N
A
 
I
P
 
P
H
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
I
V
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
H
 
G
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
G
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
R
 
Y
H
 
E
F
 
E
K
 
Y
K
 
G
D
 
Y
F
 
F
T
 
E
N
 
G
L
 
L
T
 
N
V
 
V
A
 
L
I
 
I
V
 
C
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
K
H
 
N
S
 
S
R
|
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
Y
H
 
H
A
 
S
L
 
L
T
 
K
T
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
N
I
 
V
R
 
M
A
 
F
V
 
N
G
 
S
P
 
P
T
 
N
T
 
A
L
 
W
V
 
I
P
 
D
D
 
D
N
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
A
M
 
P
G
 
Y
V
 
V
R
 
N
V
 
I
C
 
-
R
 
D
D
 
D
M
 
V
A
 
I
E
 
E
G
 
T
I
 
V
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
I
I
 
V
I
 
M
M
 
L
L
 
L
R
|
R
L
 
I
Q
|
Q
N
 
H
E
 
E
R
 
R
M
 
H
G
 
G
S
 
L
A
 
A
L
 
E
L
 
E
P
 
T
-
 
R
-
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
D
E
 
D
F
 
Y
F
 
H
K
 
Q
H
 
K
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
E
E
 
V
K
 
R
L
 
Y
A
 
N
L
 
K
A
 
L
K
 
Q
P
 
E
D
 
H
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
x
A
P
 
P
I
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
Q
S
 
S
A
 
D
V
 
L
A
 
V
D
 
E
G
 
A
R
 
S
H
 
K
S
 
S
V
 
R
I
 
I
L
 
F
P
 
K
Q
 
Q
V
 
M
T
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
Y
V
 
L
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
I

4bjhB Crystal structure of the aquifex reactor complex formed by dihydroorotase (h180a, h232a) with dihydroorotate and aspartate transcarbamoylase with n-(phosphonacetyl)-l-aspartate (pala) (see paper)
39% identity, 93% coverage: 18:315/320 of query aligns to 4:289/291 of 4bjhB

query
sites
4bjhB
L
 
L
L
 
I
S
 
S
T
 
S
E
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
E
V
 
E
L
 
V
T
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
K
T
 
Y
A
 
A
S
 
K
T
 
E
F
 
F
L
 
K
A
 
E
V
 
G
G
 
K
E
 
E
R
 
E
E
 
T
I
 
I
K
 
K
K
 
A
V
 
S
P
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
F
F
 
F
F
 
S
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
R
R
 
E
L
 
L
S
 
G
A
 
I
D
 
E
V
 
T
I
 
Y
N
 
L
L
 
V
D
 
S
I
 
G
A
 
S
R
 
E
S
 
S
S
 
S
T
 
T
A
 
V
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
F
D
 
D
T
 
T
I
 
L
A
 
K
N
 
T
L
 
F
S
 
E
A
 
G
M
 
L
Q
 
G
A
 
F
D
 
D
M
 
Y
F
 
V
V
 
V
V
 
F
R
|
R
H
 
V
S
 
P
E
 
F
S
 
V
G
 
F
A
 
F
P
 
P
Y
 
Y
L
 
K
-
 
E
I
 
I
A
 
V
Q
 
K
H
 
S
C
 
L
A
 
-
P
 
-
H
 
N
V
 
L
H
 
R
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
T
H
 
H
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
M
 
F
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
E
F
 
H
K
 
F
K
 
G
D
 
E
F
 
V
T
 
K
N
 
D
L
 
L
T
 
R
V
 
V
A
 
L
I
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
|
V
A
 
F
R
 
R
S
 
S
D
 
G
I
 
A
H
 
P
A
 
L
L
 
L
T
 
N
T
 
M
L
 
F
G
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
K
I
 
I
R
 
G
A
 
V
V
 
C
G
 
G
P
 
P
T
 
K
T
 
T
L
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
R
N
 
D
L
 
V
R
 
E
E
 
V
M
 
F
G
 
K
V
 
V
R
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
D
D
 
D
M
 
V
A
 
D
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
D
D
 
W
A
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
I
M
 
W
L
 
L
R
|
R
L
 
L
Q
|
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
S
 
E
A
 
N
L
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
S
A
 
E
G
 
S
E
 
S
F
 
Y
F
 
F
K
 
K
H
 
Q
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
K
E
 
E
K
 
R
L
 
F
A
 
E
L
 
K
A
 
V
K
 
K
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
L
V
 
Y
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
|
G
P
 
P
I
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
N
V
 
V
E
 
D
I
 
I
D
 
D
S
 
H
A
 
E
V
 
L
A
 
V
D
 
Y
G
 
T
R
 
E
H
 
K
S
 
S
V
 
L
I
 
I
L
 
Q
P
 
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
K
F
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
K
A
 
A
V
 
I
M
 
Y
S
 
K
I
 
F
I
 
L

3d6nB Crystal structure of aquifex dihydroorotase activated by aspartate transcarbamoylase (see paper)
39% identity, 93% coverage: 18:315/320 of query aligns to 4:289/291 of 3d6nB

query
sites
3d6nB
L
 
L
L
 
I
S
 
S
T
 
S
E
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
E
V
 
E
L
 
V
T
 
E
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
K
T
 
Y
A
 
A
S
 
K
T
 
E
F
 
F
L
 
K
A
 
E
V
 
G
G
 
K
E
 
E
R
 
E
E
 
T
I
 
I
K
 
K
K
 
A
V
 
S
P
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
F
F
 
F
F
 
S
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
R
R
 
E
L
 
L
S
 
G
A
 
I
D
 
E
V
 
T
I
 
Y
N
 
L
L
 
V
D
 
S
I
 
G
A
 
S
R
 
E
S
 
S
S
 
S
T
 
T
A
 
V
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
F
D
 
D
T
 
T
I
 
L
A
 
K
N
 
T
L
 
F
S
 
E
A
 
G
M
 
L
Q
 
G
A
 
F
D
 
D
M
 
Y
F
 
V
V
 
V
V
 
F
R
|
R
H
 
V
S
 
P
E
 
F
S
 
V
G
 
F
A
 
F
P
 
P
Y
 
Y
L
 
K
-
 
E
I
 
I
A
 
V
Q
 
K
H
 
S
C
 
L
A
 
-
P
 
-
H
 
N
V
 
L
H
 
R
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
T
H
 
H
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
M
 
F
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
E
F
 
H
K
 
F
K
 
G
D
 
E
F
 
V
T
 
K
N
 
D
L
 
L
T
 
R
V
 
V
A
 
L
I
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
|
V
A
 
F
R
 
R
S
 
S
D
 
G
I
 
A
H
 
P
A
 
L
L
 
L
T
 
N
T
 
M
L
 
F
G
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
K
I
 
I
R
 
G
A
 
V
V
 
C
G
 
G
P
 
P
T
 
K
T
 
T
L
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
R
N
 
D
L
 
V
R
 
E
E
 
V
M
 
F
G
 
K
V
 
V
R
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
D
D
 
D
M
 
V
A
 
D
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
D
D
 
W
A
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
I
M
 
W
L
 
L
R
|
R
L
 
L
Q
 
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
S
 
E
A
 
N
L
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
S
A
 
E
G
 
S
E
 
S
F
 
Y
F
 
F
K
 
K
H
 
Q
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
K
E
 
E
K
 
R
L
 
F
A
 
E
L
 
K
A
 
V
K
 
K
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
L
V
 
Y
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
|
G
P
 
P
I
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
N
V
 
V
E
 
D
I
 
I
D
 
D
S
 
H
A
 
E
V
 
L
A
 
V
D
 
Y
G
 
T
R
 
E
H
 
K
S
 
S
V
 
L
I
 
I
L
 
Q
P
 
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
K
F
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
K
A
 
A
V
 
I
M
 
Y
S
 
K
I
 
F
I
 
L

5g1nE Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to pala (see paper)
35% identity, 94% coverage: 17:317/320 of query aligns to 7:305/307 of 5g1nE

query
sites
5g1nE
H
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
T
 
V
E
 
Q
G
 
Q
L
 
F
P
 
T
R
 
K
A
 
D
V
 
Q
L
 
M
T
 
S
Q
 
H
I
 
L
L
 
F
D
 
N
T
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
T
F
 
L
L
 
R
A
 
M
V
 
M
G
 
V
E
 
Q
R
 
K
E
 
E
I
 
-
K
 
R
K
 
S
V
 
L
P
 
D
L
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
M
F
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
T
 
S
T
 
S
F
 
F
E
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
M
K
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
A
V
 
V
I
 
L
N
 
S
L
 
F
D
 
S
I
 
E
A
 
A
R
 
T
S
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
A
D
 
D
T
 
S
I
 
V
A
 
Q
N
 
T
L
 
M
S
 
S
A
 
C
M
 
Y
Q
 
-
A
 
A
D
 
D
M
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
L
R
|
R
H
 
H
S
 
P
E
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
P
 
V
Y
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
C
 
C
A
 
-
P
 
-
H
 
R
V
 
R
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
V
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
E
F
 
E
K
 
L
K
 
G
D
 
T
F
 
V
T
 
N
N
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
I
A
 
T
I
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
K
H
 
H
S
 
G
R
|
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
C
A
 
L
L
 
L
T
 
T
T
 
Q
L
 
Y
G
 
R
V
 
V
P
 
-
E
 
S
I
 
L
R
 
R
A
 
Y
V
 
V
G
 
A
P
 
P
T
 
P
T
 
S
L
 
L
-
 
R
V
 
M
P
 
P
D
 
P
N
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
A
M
 
F
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
R
G
 
G
V
 
T
R
 
K
V
 
Q
-
 
E
-
 
E
C
 
F
R
 
E
D
 
S
M
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
A
I
 
L
R
 
P
D
 
D
A
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
Y
M
 
M
L
x
T
R
|
R
L
 
I
Q
|
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
F
G
 
G
S
 
S
A
 
T
L
 
Q
L
 
E
P
 
Y
S
 
E
A
 
A
G
 
C
E
 
-
F
 
-
F
 
F
K
 
G
H
 
Q
Y
 
F
G
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
H
K
 
I
L
 
M
A
 
T
L
 
R
A
 
A
K
 
K
P
 
K
D
 
K
A
 
M
I
 
V
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
M
P
 
P
-
 
R
I
 
V
N
 
N
R
 
E
-
 
I
G
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
P
R
 
R
H
 
-
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
A
T
 
E
F
 
N
G
|
G
I
 
M
A
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
T
I
 
V
A
 
L
G
 
G

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
35% identity, 94% coverage: 17:317/320 of query aligns to 1925:2223/2225 of P27708

query
sites
P27708
H
|
H
L
x
I
L
|
L
S
|
S
T
x
V
E
x
Q
G
x
Q
L
x
F
P
x
T
R
x
K
A
x
D
V
x
Q
L
x
M
T
x
S
Q
x
H
I
x
L
L
x
F
D
x
N
T
x
V
A
|
A
S
x
H
T
|
T
F
x
L
L
x
R
A
x
M
V
x
M
G
x
V
E
x
Q
R
x
K
E
|
E
I
 
-
K
x
R
K
x
S
V
x
L
P
x
D
L
x
I
L
|
L
R
x
K
G
|
G
K
|
K
S
x
V
V
x
M
F
x
A
N
x
S
L
x
M
F
|
F
F
x
Y
E
|
E
N
x
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
x
S
T
x
S
T
x
S
F
|
F
E
x
A
I
x
A
A
|
A
A
x
M
K
x
A
R
|
R
L
|
L
S
x
G
A
x
G
D
x
A
V
|
V
I
x
L
N
x
S
L
x
F
D
x
S
I
x
E
A
|
A
R
x
T
S
|
S
S
|
S
T
x
V
A
x
Q
K
|
K
G
|
G
E
|
E
S
|
S
L
|
L
L
x
A
D
|
D
T
x
S
I
x
V
A
x
Q
N
x
T
L
x
M
S
|
S
A
x
C
M
x
Y
Q
 
-
A
|
A
D
|
D
M
x
V
F
x
V
V
|
V
V
x
L
R
|
R
H
|
H
S
x
P
E
x
Q
S
x
P
G
|
G
A
|
A
P
x
V
Y
x
E
L
|
L
I
x
A
A
|
A
Q
x
K
H
|
H
C
|
C
A
 
-
P
 
-
H
x
R
V
x
R
H
x
P
V
|
V
V
x
I
N
|
N
A
|
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
R
x
V
H
x
G
A
x
E
H
|
H
P
|
P
T
|
T
Q
|
Q
G
x
A
L
|
L
L
|
L
D
|
D
M
x
I
Y
x
F
T
|
T
I
|
I
R
|
R
H
x
E
F
x
E
K
x
L
K
x
G
D
x
T
F
x
V
T
x
N
N
x
G
L
x
M
T
|
T
V
x
I
A
x
T
I
x
M
V
|
V
G
|
G
D
|
D
I
x
L
V
x
K
H
|
H
S
x
G
R
|
R
V
x
T
A
x
V
R
x
H
S
|
S
D
x
L
I
x
A
H
x
C
A
x
L
L
|
L
T
|
T
T
x
Q
L
x
Y
G
x
R
V
|
V
P
 
-
E
x
S
I
x
L
R
|
R
A
x
Y
V
|
V
G
x
A
P
|
P
T
x
P
T
x
S
L
|
L
-
x
R
V
x
M
P
|
P
D
x
P
N
x
T
L
x
V
R
|
R
E
x
A
M
x
F
-
x
V
-
x
A
-
x
S
-
x
R
G
|
G
V
x
T
R
x
K
V
x
Q
-
x
E
-
x
E
C
x
F
R
x
E
D
x
S
M
x
I
A
x
E
E
|
E
G
x
A
I
x
L
R
x
P
D
|
D
A
x
T
D
|
D
V
|
V
I
x
L
I
x
Y
M
|
M
L
x
T
R
|
R
L
x
I
Q
|
Q
N
x
K
E
|
E
R
|
R
M
x
F
G
|
G
S
|
S
A
x
T
L
x
Q
L
x
E
P
x
Y
S
x
E
A
|
A
G
 
-
E
 
-
F
x
C
F
|
F
K
x
G
H
x
Q
Y
x
F
G
x
I
L
|
L
T
|
T
P
|
P
E
x
H
K
x
I
L
x
M
A
x
T
L
x
R
A
|
A
K
|
K
P
x
K
D
x
K
A
x
M
I
x
V
V
|
V
M
|
M
H
|
H
P
|
P
G
x
M
P
|
P
-
x
R
I
x
V
N
|
N
R
x
E
-
x
I
G
x
S
V
|
V
E
|
E
I
x
V
D
|
D
S
|
S
A
 
-
V
 
-
A
 
-
D
|
D
G
x
P
R
|
R
H
 
-
S
x
A
V
x
A
I
x
Y
L
x
F
P
x
R
Q
|
Q
V
x
A
T
x
E
F
x
N
G
|
G
I
x
M
A
x
Y
V
x
I
R
|
R
M
|
M
A
|
A
V
x
L
M
x
L
S
x
A
I
x
T
I
x
V
A
x
L
G
|
G

Sites not aligning to the query:

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
35% identity, 94% coverage: 17:317/320 of query aligns to 1925:2223/2225 of P08955

query
sites
P08955
H
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
T
 
V
E
 
K
G
 
Q
L
 
F
P
 
T
R
 
K
A
 
D
V
 
Q
L
 
M
T
 
S
Q
 
H
I
 
L
L
 
F
D
 
N
T
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
T
F
 
L
L
 
R
A
 
M
V
 
M
G
 
V
E
 
Q
R
 
K
E
 
E
I
 
-
K
 
R
K
 
S
V
 
L
P
 
D
L
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
M
F
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
T
 
S
T
 
S
F
 
F
E
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
M
K
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
A
V
 
V
I
 
L
N
 
S
L
 
F
D
 
S
I
 
E
A
 
A
R
 
T
S
 
S
S
 
S
T
 
V
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
A
D
 
D
T
 
S
I
 
V
A
 
Q
N
 
T
L
 
M
S
 
S
A
 
C
M
 
Y
Q
 
-
A
 
A
D
 
D
M
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
L
R
 
R
H
 
H
S
 
P
E
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
P
 
V
Y
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
C
 
C
A
 
-
P
 
-
H
 
R
V
 
R
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
V
H
 
G
A
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
E
F
 
E
K
 
L
K
 
G
D
 
T
F
 
V
T
 
N
N
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
I
A
 
T
I
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
K
H
 
H
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
C
A
 
L
L
 
L
T
 
T
T
 
Q
L
 
Y
G
 
R
V
 
V
P
 
-
E
 
S
I
 
L
R
 
R
A
 
Y
V
 
V
G
 
A
P
 
P
T
 
P
T
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
M
-
 
P
-
 
P
-
 
S
V
 
V
P
 
W
D
 
D
N
 
F
L
 
V
R
 
A
E
 
S
M
 
R
G
 
G
V
 
T
R
 
K
V
 
Q
-
 
E
-
 
E
C
 
F
R
 
E
D
 
S
M
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
A
I
 
L
R
 
P
D
 
D
A
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
Y
M
 
M
L
 
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
F
G
 
G
S
 
S
A
 
T
L
 
Q
L
 
E
P
 
Y
S
 
E
A
 
A
G
 
-
E
 
-
F
 
C
F
 
F
K
 
G
H
 
Q
Y
 
F
G
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
H
K
 
I
L
 
M
A
 
T
L
 
R
A
 
A
K
 
K
P
 
K
D
 
K
A
 
M
I
 
V
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
M
P
 
P
-
 
R
I
 
V
N
 
N
R
 
E
-
 
I
G
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
P
R
 
R
H
 
-
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
A
T
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
M
A
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
T
I
 
V
A
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5g1pA Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to carbamoyl phosphate (see paper)
34% identity, 94% coverage: 17:317/320 of query aligns to 4:290/292 of 5g1pA

query
sites
5g1pA
H
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
T
 
V
E
 
Q
G
 
Q
L
 
F
P
 
T
R
 
K
A
 
D
V
 
Q
L
 
M
T
 
S
Q
 
H
I
 
L
L
 
F
D
 
N
T
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
T
F
 
L
L
 
R
A
 
M
V
 
M
G
 
V
E
 
Q
R
 
K
E
 
E
I
 
-
K
 
R
K
 
S
V
 
L
P
 
D
L
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
M
F
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
T
 
S
T
 
S
F
 
F
E
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
M
K
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
A
V
 
V
I
 
L
N
 
S
L
 
F
D
 
S
I
 
E
A
 
A
R
 
T
S
 
S
S
 
S
T
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
A
D
 
D
T
 
S
I
 
V
A
 
Q
N
 
T
L
 
M
S
 
S
A
 
C
M
 
Y
Q
 
-
A
 
A
D
 
D
M
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
L
R
|
R
H
 
H
S
 
P
E
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
P
 
V
Y
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
C
 
C
A
 
-
P
 
-
H
 
R
V
 
R
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
V
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
E
F
 
E
K
 
L
K
 
G
D
 
T
F
 
V
T
 
N
N
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
I
A
 
T
I
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
K
H
 
H
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
C
A
 
L
L
 
L
T
 
T
T
 
Q
L
 
Y
G
 
R
V
 
V
P
 
-
E
 
S
I
 
L
R
 
R
A
 
Y
V
 
V
G
 
A
P
 
P
T
 
P
T
 
S
L
 
L
-
 
R
V
 
M
P
 
P
D
 
P
N
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
A
M
 
F
G
 
V
V
 
A
R
 
S
V
 
G
C
 
T
R
 
K
D
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
E
-
 
S
M
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
A
I
 
L
R
 
P
D
 
D
A
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
Y
M
 
M
L
x
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
H
 
Q
Y
 
F
G
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
H
K
 
I
L
 
M
A
 
T
L
 
R
A
 
A
K
 
K
P
 
K
D
 
K
A
 
M
I
 
V
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
M
P
 
P
-
 
R
I
 
V
N
 
N
R
 
E
-
 
I
G
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
P
R
 
R
H
 
-
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
A
T
 
E
F
 
N
G
|
G
I
 
M
A
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
T
I
 
V
A
 
L
G
 
G

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
36% identity, 86% coverage: 44:317/320 of query aligns to 29:305/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
K
 
Q
V
 
L
P
 
E
L
 
Y
L
 
A
R
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
I
V
 
L
F
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
S
A
 
A
A
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
G
L
 
F
-
 
A
D
 
E
I
 
A
A
 
S
R
 
T
S
 
S
S
 
S
T
 
V
A
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
R
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
K
N
 
T
L
 
V
S
 
E
A
 
Q
M
 
Y
Q
 
-
A
 
C
D
 
D
M
 
V
F
 
I
V
 
V
V
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
P
E
 
K
S
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
A
Y
 
R
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Q
 
E
H
 
-
C
 
-
A
 
V
P
 
A
H
 
E
V
 
V
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
H
 
N
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
K
F
 
E
K
 
F
K
 
G
D
 
R
F
 
I
T
 
D
N
 
G
L
 
L
T
 
K
V
 
I
A
 
G
I
 
L
V
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
K
H
 
Y
S
 
G
R
|
R
V
x
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
F
L
 
Y
G
 
D
V
 
V
P
 
-
E
 
E
I
 
L
R
 
Y
A
 
L
V
 
I
G
 
S
P
 
P
T
 
E
T
 
L
L
 
L
-
 
R
-
 
M
-
 
P
-
 
R
-
 
H
V
 
I
P
 
V
D
 
E
N
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
M
R
 
K
V
 
V
C
 
V
R
 
E
-
 
T
-
 
T
D
 
T
M
 
L
A
 
E
E
 
D
G
 
V
I
 
I
R
 
G
D
 
K
A
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
Y
M
 
V
L
x
T
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
F
P
 
P
S
 
D
A
 
E
G
 
Q
E
 
E
F
 
Y
F
 
L
K
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
H
 
S
Y
 
Y
G
 
Q
L
 
V
T
 
N
P
 
L
E
 
K
K
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
K
A
 
A
K
 
K
P
 
D
D
 
E
A
 
L
I
 
R
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
L
P
 
P
I
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
D
E
 
E
I
 
I
D
 
H
S
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
D
D
 
N
G
 
T
R
 
K
H
 
H
S
 
A
V
 
I
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
T
 
F
F
 
N
G
|
G
I
 
V
A
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
L
I
 
V
A
 
L
G
 
G

4eknB Structure of the catalytic chain of methanococcus jannaschii aspartate transcarbamoylase in a hexagonal crystal form (see paper)
34% identity, 95% coverage: 17:319/320 of query aligns to 3:304/304 of 4eknB

query
sites
4eknB
H
 
H
L
 
L
L
 
I
S
 
S
T
 
M
E
 
K
G
 
D
L
 
I
P
 
G
R
 
K
A
 
E
V
 
E
L
 
I
T
 
L
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
E
A
 
A
S
 
R
T
 
K
F
 
M
-
 
E
-
 
E
L
 
L
A
 
L
V
 
N
G
 
T
E
 
K
R
 
R
E
 
P
I
 
L
K
 
K
K
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
L
R
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
I
V
 
L
F
 
A
N
 
T
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
T
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
T
A
 
A
A
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
I
N
 
T
L
 
M
-
 
T
D
 
D
I
 
L
A
 
K
R
 
S
S
 
S
S
 
S
T
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
G
M
 
Y
Q
 
-
A
 
A
D
 
D
M
 
I
F
 
I
V
 
V
V
 
L
R
 
R
H
 
H
S
 
P
E
 
S
S
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
A
Y
 
R
L
 
L
I
 
A
A
 
S
Q
 
E
H
 
Y
C
 
S
A
 
-
P
 
-
H
 
Q
V
 
V
H
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
H
 
N
A
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
G
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
R
 
M
H
 
R
F
 
E
K
 
I
K
 
G
D
 
R
F
 
I
T
 
D
N
 
G
L
 
I
T
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
K
H
 
Y
S
x
G
R
|
R
V
x
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
V
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
S
T
 
L
L
 
F
G
 
E
V
 
N
P
 
V
E
 
E
I
 
M
R
 
Y
A
 
F
V
 
V
G
 
S
P
 
P
T
 
K
T
 
E
L
 
L
V
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
R
V
 
L
C
 
P
R
 
K
D
 
D
M
 
I
A
 
I
E
 
E
G
 
D
I
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
K
D
 
N
V
 
I
-
 
K
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
V
I
 
L
I
 
Y
M
 
V
L
x
T
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
F
P
 
P
S
 
D
A
 
P
G
 
N
E
 
E
F
 
Y
F
 
E
K
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
H
 
S
Y
 
Y
G
 
K
L
 
I
T
 
K
P
 
R
E
 
E
K
 
Y
L
 
V
A
 
E
L
 
G
A
 
K
K
 
K
P
 
-
D
 
-
A
 
F
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
L
P
 
P
I
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
D
E
 
E
I
 
I
D
 
D
S
 
Y
A
 
D
V
 
V
A
 
D
D
 
D
G
 
L
R
 
P
H
 
Q
S
 
A
V
 
K
I
 
Y
L
 
F
P
 
K
Q
 
Q
V
 
S
T
 
F
F
 
Y
G
|
G
I
 
I
A
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
I
M
 
L
-
 
K
S
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
E
G
 
D
N
 
N
D
 
E

P05990 Multifunctional protein r; Protein rudimentary; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
34% identity, 94% coverage: 17:317/320 of query aligns to 1919:2218/2224 of P05990

query
sites
P05990
H
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
A
T
 
V
E
 
D
G
 
M
L
 
F
P
 
N
R
 
K
A
 
D
V
 
H
L
 
L
T
 
N
Q
 
D
I
 
I
L
 
F
D
 
N
T
 
L
A
 
A
S
 
Q
T
 
L
F
 
L
L
 
K
A
 
L
V
 
R
G
 
G
E
 
T
R
 
K
E
 
D
I
 
R
K
 
P
K
 
V
V
 
D
P
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
P
G
 
G
K
 
K
S
 
I
V
 
M
F
 
A
N
 
S
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
T
 
C
T
 
S
F
 
F
E
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
M
K
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
S
L
 
M
D
 
D
I
 
N
A
 
I
R
 
T
S
 
S
S
 
S
T
 
V
A
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
E
D
 
D
T
 
S
I
 
I
A
 
K
N
 
V
L
 
V
S
 
S
A
 
S
M
 
Y
Q
 
-
A
 
A
D
 
D
M
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
L
R
 
R
H
 
H
S
 
P
E
 
S
S
 
P
G
 
G
A
 
A
P
 
V
Y
 
A
L
 
R
I
 
A
A
 
A
Q
 
T
H
 
F
C
 
S
A
 
-
P
 
-
H
 
R
V
 
K
H
 
P
V
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
V
H
 
G
A
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
E
F
 
E
K
 
F
K
 
G
D
 
T
F
 
V
T
 
N
N
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
I
A
 
T
I
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
K
H
 
N
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
R
A
 
L
L
 
L
T
 
T
T
 
L
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
P
 
-
E
 
N
I
 
L
R
 
Q
A
 
Y
V
 
V
G
 
A
P
 
P
T
 
N
T
 
S
L
 
L
-
 
Q
V
 
M
P
 
P
D
 
D
N
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
Q
-
 
F
L
 
V
R
 
H
E
 
Q
M
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
K
-
 
Q
-
 
L
V
 
F
C
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
L
A
 
K
E
 
N
G
 
V
I
 
L
R
 
P
D
 
D
A
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
Y
M
 
M
L
 
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
E
 
E
R
 
R
M
 
F
G
 
D
S
 
N
A
 
-
L
 
-
L
 
V
P
 
E
S
 
D
A
 
Y
G
 
E
E
 
K
F
 
C
F
 
C
K
 
G
H
 
H
Y
 
L
G
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
E
K
 
H
L
 
M
A
 
M
L
 
R
A
 
A
K
 
K
P
 
K
D
 
R
A
 
S
I
 
I
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
I
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
N
E
 
E
I
 
I
D
 
S
S
 
R
A
 
E
V
 
I
A
 
D
D
 
S
G
 
D
R
 
P
H
 
R
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
A
T
 
E
F
 
Y
G
 
G
I
 
M
A
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
M
I
 
V
A
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P49077 Aspartate carbamoyltransferase, chloroplastic; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
34% identity, 94% coverage: 14:315/320 of query aligns to 83:386/390 of P49077

query
sites
P49077
E
 
E
L
 
L
I
 
S
H
 
D
L
 
V
L
 
I
S
 
E
T
 
G
E
 
K
G
 
Q
L
 
F
P
 
D
R
 
R
A
 
E
V
 
M
L
 
L
T
 
S
Q
 
A
I
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
S
 
R
T
 
E
F
 
M
L
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
-
E
 
E
R
 
K
E
 
S
I
 
S
K
 
S
K
 
Q
V
 
S
P
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
Y
S
 
L
V
 
M
F
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
S
A
 
A
A
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
L
N
 
T
L
 
T
D
 
E
I
 
N
A
 
A
R
 
R
-
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
T
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
E
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
T
L
 
V
S
 
E
A
 
G
M
 
Y
Q
 
-
A
 
S
D
 
D
M
 
I
F
 
I
V
 
V
V
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
-
Y
 
-
L
 
A
I
 
R
A
 
K
Q
 
A
H
 
A
C
 
A
A
 
T
P
 
A
H
 
N
V
 
I
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
P
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
H
 
S
F
 
E
K
 
I
K
 
G
D
 
K
F
 
L
T
 
D
N
 
G
L
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
A
H
 
N
S
 
G
R
|
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
Y
A
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
K
L
 
F
G
 
K
V
 
D
P
 
V
E
 
K
I
 
I
R
 
Y
A
 
F
V
 
V
G
 
S
P
 
P
T
 
E
T
 
I
L
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
V
 
I
P
 
K
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
R
 
T
E
 
S
M
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
W
-
 
E
-
 
E
C
 
S
R
 
S
D
 
D
M
 
L
A
 
M
E
 
E
G
 
V
I
 
A
R
 
S
D
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
Y
M
 
Q
L
 
T
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
E
 
E
R
 
R
M
 
F
G
 
G
S
 
E
A
 
R
L
 
L
-
 
D
L
 
L
P
 
Y
S
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
R
F
 
-
F
 
-
K
 
G
H
 
K
Y
 
Y
G
 
I
L
 
V
T
 
D
P
 
K
E
 
D
K
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
V
A
 
M
K
 
Q
P
 
K
D
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
I
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
D
E
 
E
I
 
I
D
 
T
S
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
D
D
 
A
G
 
D
R
 
P
H
 
R
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
A
T
 
K
F
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
K
I
 
L
I
 
L

6ys6B Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with pala (see paper)
33% identity, 94% coverage: 14:315/320 of query aligns to 5:308/312 of 6ys6B

query
sites
6ys6B
E
 
E
L
 
L
I
 
S
H
 
D
L
 
V
L
 
I
S
 
E
T
 
G
E
 
K
G
 
Q
L
 
F
P
 
D
R
 
R
A
 
E
V
 
M
L
 
L
T
 
S
Q
 
A
I
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
S
 
R
T
 
E
F
 
M
L
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
-
E
 
E
R
 
K
E
 
S
I
 
S
K
 
S
K
 
Q
V
 
S
P
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
Y
S
 
L
V
 
M
F
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
T
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
S
A
 
A
A
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
L
N
 
T
L
 
T
D
 
E
I
 
N
A
 
A
R
 
R
-
 
E
-
 
F
S
 
S
S
|
S
T
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
E
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
T
L
 
V
S
 
E
A
 
G
M
 
Y
Q
 
-
A
 
S
D
 
D
M
 
I
F
 
I
V
 
V
V
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
-
Y
 
-
L
 
A
I
 
R
A
 
K
Q
 
A
H
 
A
C
 
A
A
 
T
P
 
A
H
 
N
V
 
I
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
P
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
H
 
S
F
 
E
K
 
I
K
 
G
D
 
K
F
 
L
T
 
D
N
 
G
L
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
A
H
 
N
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
Y
A
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
K
L
 
F
G
 
K
V
 
D
P
 
V
E
 
K
I
 
I
R
 
Y
A
 
F
V
 
V
G
 
S
P
 
P
T
 
E
T
 
I
L
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
V
 
I
P
 
K
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
R
 
T
E
 
S
M
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
W
-
 
E
-
 
E
C
 
S
R
 
S
D
 
D
M
 
L
A
 
M
E
 
E
G
 
V
I
 
A
R
 
S
D
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
Y
M
 
Q
L
x
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
E
 
E
R
 
R
M
 
F
G
 
G
S
 
E
A
 
R
L
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
Y
L
 
E
P
 
A
S
 
A
A
 
R
G
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
I
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
V
T
 
D
P
 
K
E
 
D
K
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
V
A
 
M
K
 
Q
P
 
K
D
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
L
P
 
P
I
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
D
E
 
E
I
 
I
D
 
T
S
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
D
D
 
A
G
 
D
R
 
P
H
 
R
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
A
T
 
K
F
 
N
G
|
G
I
 
L
A
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
K
I
 
L
I
 
L

6ypoA Arabidopsis aspartate transcarbamoylase bound to ump (see paper)
33% identity, 94% coverage: 14:315/320 of query aligns to 5:308/312 of 6ypoA

query
sites
6ypoA
E
 
E
L
 
L
I
 
S
H
 
D
L
 
V
L
 
I
S
 
E
T
 
G
E
 
K
G
 
Q
L
 
F
P
 
D
R
 
R
A
 
E
V
 
M
L
 
L
T
 
S
Q
 
A
I
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
S
 
R
T
 
E
F
 
M
L
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
-
E
 
E
R
 
K
E
 
S
I
 
S
K
 
S
K
 
Q
V
 
S
P
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
Y
S
 
L
V
 
M
F
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
S
A
 
A
A
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
L
N
 
T
L
 
T
D
 
E
I
 
N
A
 
A
R
 
R
-
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
T
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
E
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
T
L
 
V
S
 
E
A
 
G
M
 
Y
Q
 
-
A
 
S
D
 
D
M
 
I
F
 
I
V
 
V
V
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
-
Y
 
-
L
 
A
I
 
R
A
 
K
Q
 
A
H
 
A
C
 
A
A
 
T
P
 
A
H
 
N
V
 
I
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
P
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
H
 
S
F
 
E
K
 
I
K
 
G
D
 
K
F
 
L
T
 
D
N
 
G
L
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
A
H
 
N
S
 
G
R
|
R
V
x
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
Y
A
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
K
L
 
F
G
 
K
V
 
D
P
 
V
E
 
K
I
 
I
R
 
Y
A
 
F
V
 
V
G
 
S
P
 
P
T
 
E
T
 
I
L
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
V
 
I
P
 
K
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
R
 
T
E
 
S
M
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
W
-
 
E
-
 
E
C
 
S
R
 
S
D
 
D
M
 
L
A
 
M
E
 
E
G
 
V
I
 
A
R
 
S
D
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
Y
M
 
Q
L
x
T
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
E
 
E
R
 
R
M
 
F
G
 
G
S
 
E
A
 
R
L
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
Y
L
 
E
P
 
A
S
 
A
A
 
R
G
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
I
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
V
T
 
D
P
 
K
E
 
D
K
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
V
A
 
M
K
 
Q
P
 
K
D
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
|
H
P
|
P
G
x
L
P
 
P
I
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
D
E
 
E
I
 
I
D
 
T
S
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
D
D
 
A
G
 
D
R
 
P
H
 
R
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
A
T
 
K
F
 
N
G
|
G
I
 
L
A
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
K
I
 
L
I
 
L

6yvbC Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with carbamoyl phosphate (see paper)
33% identity, 94% coverage: 14:315/320 of query aligns to 17:320/324 of 6yvbC

query
sites
6yvbC
E
 
E
L
 
L
I
 
S
H
 
D
L
 
V
L
 
I
S
 
E
T
 
G
E
 
K
G
 
Q
L
 
F
P
 
D
R
 
R
A
 
E
V
 
M
L
 
L
T
 
S
Q
 
A
I
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
S
 
R
T
 
E
F
 
M
L
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
-
E
 
E
R
 
K
E
 
S
I
 
S
K
 
S
K
 
Q
V
 
S
P
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
Y
S
 
L
V
 
M
F
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
S
A
 
A
A
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
L
N
 
T
L
 
T
D
 
E
I
 
N
A
 
A
R
 
R
-
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
T
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
E
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
R
N
 
T
L
 
V
S
 
E
A
 
G
M
 
Y
Q
 
-
A
 
S
D
 
D
M
 
I
F
 
I
V
 
V
V
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
-
Y
 
-
L
 
A
I
 
R
A
 
K
Q
 
A
H
 
A
C
 
A
A
 
T
P
 
A
H
 
N
V
 
I
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
P
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
H
 
S
F
 
E
K
 
I
K
 
G
D
 
K
F
 
L
T
 
D
N
 
G
L
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
A
H
 
N
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
D
 
L
I
 
A
H
 
Y
A
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
K
L
 
F
G
 
K
V
 
D
P
 
V
E
 
K
I
 
I
R
 
Y
A
 
F
V
 
V
G
 
S
P
 
P
T
 
E
T
 
I
L
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
V
 
I
P
 
K
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
R
 
T
E
 
S
M
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
W
-
 
E
-
 
E
C
 
S
R
 
S
D
 
D
M
 
L
A
 
M
E
 
E
G
 
V
I
 
A
R
 
S
D
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
I
 
Y
M
 
Q
L
x
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
E
 
E
R
 
R
M
 
F
G
 
G
S
 
E
A
 
R
L
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
Y
L
 
E
P
 
A
S
 
A
A
 
R
G
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
I
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
V
T
 
D
P
 
K
E
 
D
K
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
V
A
 
M
K
 
Q
P
 
K
D
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
L
P
 
P
I
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
D
E
 
E
I
 
I
D
 
T
S
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
D
D
 
A
G
 
D
R
 
P
H
 
R
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
A
T
 
K
F
 
N
G
|
G
I
 
L
A
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
K
I
 
L
I
 
L

8bplA Aspartate transcarbamoylase mutant (n2045c, r2238c) from chaetomium thermophilum cad-like bound to carbamoyl phosphate (see paper)
32% identity, 93% coverage: 17:315/320 of query aligns to 17:314/316 of 8bplA

query
sites
8bplA
H
 
H
L
 
V
L
 
L
S
 
S
T
 
V
E
 
T
G
 
Q
L
 
F
P
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
D
L
 
L
T
 
H
Q
 
L
I
 
L
L
 
F
D
 
Q
T
 
I
A
 
A
S
 
Q
T
 
E
F
 
-
L
 
M
A
 
R
V
 
L
G
 
G
E
 
V
R
 
Q
E
 
R
I
 
E
K
 
G
K
 
V
V
 
L
P
 
D
L
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
L
F
 
C
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
T
 
A
T
 
S
F
 
F
E
 
D
I
 
A
A
 
A
A
 
M
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
R
V
 
T
I
 
I
N
 
P
L
 
I
D
 
Q
I
 
T
A
 
S
R
 
T
S
 
S
S
 
S
T
 
V
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
Q
D
 
D
T
 
T
I
 
L
A
 
R
N
 
T
L
 
L
S
 
-
A
 
A
M
 
C
Q
 
Y
A
 
S
D
 
D
M
 
A
F
 
I
V
 
V
V
 
L
R
|
R
H
 
H
S
 
P
E
 
D
S
 
E
G
 
K
A
 
C
P
 
V
Y
 
D
L
 
V
I
 
A
A
 
K
Q
 
K
H
 
Y
C
 
C
A
 
P
P
 
-
H
 
-
V
 
V
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
R
 
S
H
 
K
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
E
F
 
E
K
 
L
K
 
G
D
 
T
F
 
M
T
 
Q
N
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
I
A
 
T
I
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
L
H
 
Y
S
 
G
R
 
R
V
 
P
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
V
H
 
Y
A
 
L
L
 
L
T
 
R
T
 
H
L
 
Y
G
 
Q
V
 
V
P
 
-
E
 
K
I
 
V
R
 
Q
A
 
L
V
 
V
G
 
S
P
 
P
T
 
K
T
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
A
V
 
V
P
 
R
D
 
Q
N
 
Q
L
 
L
R
 
V
E
 
D
M
 
A
G
 
G
V
 
Q
R
 
L
V
 
L
C
 
C
R
 
E
D
 
S
M
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
P
E
 
E
G
 
I
I
 
L
R
 
G
D
 
R
A
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
Y
M
 
C
L
 
T
R
 
R
L
 
V
Q
 
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
F
P
 
P
S
 
S
A
 
L
G
 
A
E
 
E
F
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
V
F
 
K
K
 
D
H
 
S
Y
 
Y
G
 
R
L
 
I
T
 
D
P
 
Y
E
 
S
K
 
T
L
 
L
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
D
 
T
A
 
T
I
 
V
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
x
L
P
 
P
I
 
R
N
 
N
R
 
E
G
 
-
V
 
-
E
 
E
I
 
V
D
 
A
S
 
E
A
 
E
V
 
V
A
 
D
D
 
F
G
 
D
R
 
Q
H
 
R
S
 
A
V
 
A
I
 
Y
L
 
F
P
 
R
Q
 
Q
V
 
M
T
 
C
F
 
Y
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
V
 
C
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
L
I
 
V

2hseA Structure of d236a e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of phosphonoacetamide and l-aspartate at 2.60 a resolution
35% identity, 95% coverage: 17:319/320 of query aligns to 8:307/310 of 2hseA

query
sites
2hseA
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
T
 
I
E
 
N
G
 
D
L
 
L
P
 
S
R
 
R
A
 
D
V
 
D
L
 
L
T
 
N
Q
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
A
T
 
K
F
 
L
L
 
K
A
 
A
V
 
N
G
 
P
E
 
Q
R
 
P
E
 
E
I
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
S
 
V
V
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
T
x
S
F
 
F
E
 
E
I
 
T
A
 
S
A
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
A
D
 
S
V
 
V
I
 
V
N
 
G
L
 
F
-
 
S
D
 
D
I
 
S
A
 
A
R
 
N
S
 
T
S
 
S
T
 
L
A
 
G
K
 
K
-
x
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
S
N
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
M
 
Y
Q
 
-
A
 
V
D
 
D
M
 
A
F
 
I
V
 
V
V
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
P
E
 
Q
S
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
A
Y
 
R
L
 
L
I
 
-
A
 
A
Q
 
T
H
 
E
C
 
F
A
 
S
P
 
G
H
 
N
V
 
V
H
 
P
V
 
V
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
H
 
N
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
G
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
H
 
E
F
 
T
K
 
Q
K
 
G
D
 
R
F
 
L
T
 
D
N
 
N
L
 
L
T
 
H
V
 
V
A
 
A
I
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
K
H
 
Y
S
 
G
R
|
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
T
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
A
T
 
K
L
 
F
G
 
D
V
 
G
P
 
N
E
 
R
I
 
F
R
 
Y
A
 
F
V
 
I
G
 
A
P
 
P
T
 
D
T
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
M
-
 
P
-
 
Q
-
 
Y
V
 
I
P
 
L
D
 
D
N
 
M
L
 
L
R
 
D
E
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
A
V
 
W
C
 
S
-
 
L
-
 
H
R
 
S
D
 
S
M
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
V
I
 
M
R
 
A
D
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
I
 
Y
M
 
M
L
x
T
R
|
R
L
 
V
Q
|
Q
N
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
L
G
 
A
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
S
A
 
E
G
 
Y
E
 
A
F
 
N
F
 
V
K
 
K
-
 
A
H
 
Q
Y
 
F
G
 
V
L
 
L
T
 
R
P
 
A
E
 
S
K
 
D
L
 
L
A
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
P
 
A
D
 
N
A
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
G
x
L
P
|
P
I
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
D
E
 
E
I
 
I
D
 
A
S
 
T
A
 
D
V
 
V
A
 
D
D
 
K
G
 
T
R
 
P
H
 
H
S
 
A
V
 
W
I
 
Y
L
 
F
P
 
Q
Q
 
Q
V
x
A
T
 
G
F
 
N
G
|
G
I
 
I
A
 
F
V
 
A
R
|
R
M
 
Q
A
 
A
V
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
L
I
 
V
A
 
L
G
 
N
N
 
R
D
 
D

Query Sequence

>WP_028996415.1 NCBI__GCF_000430725.1:WP_028996415.1
MLSRRNPQLNSHGELIHLLSTEGLPRAVLTQILDTASTFLAVGEREIKKVPLLRGKSVFN
LFFENSTRTRTTFEIAAKRLSADVINLDIARSSTAKGESLLDTIANLSAMQADMFVVRHS
ESGAPYLIAQHCAPHVHVVNAGDGRHAHPTQGLLDMYTIRHFKKDFTNLTVAIVGDIVHS
RVARSDIHALTTLGVPEIRAVGPTTLVPDNLREMGVRVCRDMAEGIRDADVIIMLRLQNE
RMGSALLPSAGEFFKHYGLTPEKLALAKPDAIVMHPGPINRGVEIDSAVADGRHSVILPQ
VTFGIAVRMAVMSIIAGNDA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory