SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_029000246.1 NCBI__GCF_000430725.1:WP_029000246.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
41% identity, 86% coverage: 37:315/323 of query aligns to 36:317/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
R
 
R
Q
 
E
R
 
K
F
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
V
P
 
K
Q
 
D
A
 
V
Q
 
D
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
T
S
x
M
-
x
L
S
 
S
F
 
E
A
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
Q
 
E
T
 
V
L
 
F
D
 
E
R
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
I
I
 
V
S
 
A
S
 
N
I
x
Y
S
x
A
V
|
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
E
Y
 
E
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
L
 
V
C
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
N
T
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
H
L
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
C
 
A
A
 
T
S
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
V
V
 
V
E
 
K
L
 
G
S
 
D
N
 
K
L
 
F
V
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
T
 
K
R
 
R
N
 
K
-
 
G
I
 
I
G
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
E
 
K
D
 
W
L
 
F
F
 
L
G
 
G
W
 
Y
D
 
E
V
 
L
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
P
 
R
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
D
x
S
P
x
R
F
 
T
E
 
R
V
 
K
R
 
S
V
 
Q
P
 
A
E
 
E
L
 
K
S
 
E
G
 
L
L
 
G
V
 
A
T
 
E
R
 
Y
L
 
R
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
R
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
A
 
I
L
 
L
T
x
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
E
 
K
A
 
E
T
|
T
R
 
M
G
 
Y
L
 
M
M
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
E
 
R
F
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
P
G
 
T
A
 
A
I
 
I
F
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
E
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
E
G
 
G
P
 
W
L
 
I
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
T
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
Q
 
N
A
 
-
S
 
E
P
 
E
L
 
L
R
 
F
T
 
S
H
 
L
P
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
V
P
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
T
 
A
E
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
I
A
 
A
V
 
F
L
 
K
D
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
I
P
 
P

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 5:315/323 of query aligns to 3:316/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
N
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
I
F
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
I
P
 
P
P
 
E
D
 
N
L
 
G
L
 
I
A
 
E
R
 
L
I
 
L
T
 
R
E
 
E
R
 
H
H
 
F
D
 
E
V
 
V
V
 
E
V
 
V
A
 
W
D
 
E
P
 
H
R
 
E
R
 
H
T
 
E
E
 
I
E
 
P
R
 
R
Q
 
E
R
 
V
F
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
V
P
 
K
Q
 
D
A
 
V
Q
 
D
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
T
S
 
M
-
 
L
S
 
S
F
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
D
A
 
R
Q
 
E
T
 
V
L
 
F
D
 
D
R
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
I
I
 
V
S
 
A
S
 
N
I
 
Y
S
 
A
V
|
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
E
 
D
L
 
I
P
 
E
Y
 
E
L
 
A
E
 
T
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
L
 
V
C
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
T
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
A
F
 
W
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
C
 
A
A
 
A
S
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
V
V
 
V
E
 
K
L
 
G
S
 
D
N
 
K
L
 
F
V
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
T
 
K
R
 
R
N
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
I
 
H
G
 
P
E
 
K
D
 
M
L
 
F
F
 
L
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
R
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
H
 
T
D
x
A
P
 
-
F
 
-
E
x
R
V
x
S
R
 
R
V
x
K
P
 
P
E
 
E
L
 
A
S
 
E
G
 
K
L
 
E
V
 
L
-
 
G
-
 
A
T
 
E
R
 
F
L
 
K
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
A
 
V
L
 
L
T
 
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
E
 
K
A
x
E
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
M
M
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
E
 
R
F
 
L
A
 
R
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
P
G
 
T
A
 
A
I
 
V
F
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
E
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
E
G
 
G
P
 
W
L
 
I
R
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
T
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
Q
 
D
A
 
E
S
 
E
P
 
-
L
 
L
R
 
F
T
 
A
H
 
L
P
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
V
P
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
T
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
L
 
I
A
 
A
V
 
F
L
 
K
D
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
V
P
 
P

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
42% identity, 80% coverage: 57:314/323 of query aligns to 63:321/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
L
 
V
D
 
D
A
 
K
Q
 
R
T
 
I
L
 
L
D
 
D
R
 
A
A
 
A
P
 
G
A
 
A
-
 
N
L
 
L
E
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
S
S
 
T
I
 
M
S
 
S
V
|
V
G
|
G
V
 
I
D
 
D
N
 
H
Y
 
L
E
 
A
L
 
L
P
 
D
Y
 
E
L
 
I
E
 
K
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
R
L
 
V
C
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
T
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
A
F
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
L
L
 
L
C
 
T
A
 
T
S
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
P
E
 
E
L
 
A
S
 
I
N
 
E
L
 
E
V
 
V
R
 
K
E
 
N
G
 
G
R
 
G
W
 
W
T
 
T
R
 
S
N
 
W
I
 
K
G
 
P
E
 
L
D
 
W
L
 
L
F
 
C
G
 
G
W
 
Y
D
 
G
V
 
L
H
 
T
G
 
Q
K
 
S
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
K
L
 
-
G
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
P
 
Q
V
 
R
L
 
F
Y
 
L
H
 
Y
D
 
T
P
 
G
F
x
R
E
x
Q
V
x
P
R
|
R
V
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
A
S
 
A
G
 
E
L
 
F
V
 
Q
T
 
A
R
 
E
-
 
F
L
 
V
P
 
S
M
 
T
D
 
P
E
 
E
V
 
L
L
 
A
Q
 
A
R
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
V
L
 
V
T
 
A
L
 
C
P
x
S
L
 
L
S
 
T
E
 
P
A
 
A
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
C
G
 
N
A
 
K
R
 
D
E
 
F
F
 
F
A
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
E
G
 
T
A
 
A
I
 
V
F
 
F
V
 
I
N
 
N
G
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
G
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
N
E
 
Q
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
A
N
 
S
G
 
G
P
 
K
L
 
I
R
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
A
 
S
T
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
T
A
 
N
S
 
H
P
 
P
L
 
L
R
 
L
T
 
T
H
 
L
P
 
K
R
 
N
V
 
C
T
 
V
P
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
|
S
A
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
R
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
E
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
G
L
 
L
D
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
P

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
42% identity, 80% coverage: 57:314/323 of query aligns to 59:317/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
L
 
V
D
 
D
A
 
K
Q
 
R
T
 
I
L
 
L
D
 
D
R
 
A
A
 
A
P
 
G
A
 
A
-
 
N
L
 
L
E
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
S
S
 
T
I
 
M
S
|
S
V
|
V
G
|
G
V
 
I
D
 
D
N
 
H
Y
 
L
E
 
A
L
 
L
P
 
D
Y
 
E
L
 
I
E
 
K
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
R
L
 
V
C
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
T
 
T
T
|
T
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
A
F
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
L
L
 
L
C
 
T
A
 
T
S
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
P
E
 
E
L
 
A
S
 
I
N
 
E
L
 
E
V
 
V
R
 
K
E
 
N
G
 
G
R
 
G
W
 
W
T
 
T
R
 
S
N
 
W
I
 
K
G
 
P
E
 
L
D
 
W
L
 
L
F
 
C
G
 
G
W
 
Y
D
 
G
V
 
L
H
 
T
G
 
Q
K
 
S
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
F
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
K
L
 
-
G
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
P
 
Q
V
 
R
L
 
F
Y
 
L
H
 
Y
D
 
T
P
x
G
F
x
R
E
 
Q
V
 
P
R
|
R
V
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
A
S
 
A
G
 
E
L
 
F
V
 
Q
T
 
A
R
 
E
-
 
F
L
 
V
P
 
S
M
 
T
D
 
P
E
 
E
V
 
L
L
 
A
Q
 
A
R
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
V
L
 
V
T
 
A
L
x
C
P
x
S
L
 
L
S
 
T
E
 
P
A
 
A
T
|
T
R
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
C
G
 
N
A
 
K
R
 
D
E
 
F
F
 
F
A
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
E
G
 
T
A
 
A
I
 
V
F
 
F
V
 
I
N
 
N
G
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
G
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
N
E
 
Q
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
A
N
 
S
G
 
G
P
 
K
L
 
I
R
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
A
 
S
T
 
P
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
T
A
 
N
S
 
H
P
 
P
L
 
L
R
 
L
T
 
T
H
 
L
P
 
K
R
 
N
V
 
C
T
 
V
P
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
R
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
E
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
G
L
 
L
D
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
34% identity, 94% coverage: 2:304/323 of query aligns to 1:298/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
N
 
N
R
 
L
K
 
R
N
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
I
F
 
S
R
 
D
A
 
S
L
 
L
P
 
D
P
 
P
D
 
-
L
x
C
L
 
C
A
 
R
R
x
K
I
|
I
T
 
L
E
 
Q
R
 
D
H
 
G
D
 
G
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
A
 
V
D
 
E
P
 
-
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
x
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
x
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
x
I
R
 
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
x
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
34% identity, 94% coverage: 2:304/323 of query aligns to 1:298/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
N
 
N
R
 
L
K
 
R
N
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
I
F
 
S
R
 
D
A
 
S
L
 
L
P
 
D
P
 
P
D
 
-
L
 
C
L
 
C
A
 
R
R
 
K
I
 
I
T
 
L
E
 
Q
R
 
D
H
 
G
D
 
G
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
A
 
V
D
 
E
P
 
-
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
 
I
R
 
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
x
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
35% identity, 85% coverage: 32:304/323 of query aligns to 28:297/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
x
I
R
x
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
x
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
S
x
L
E
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
35% identity, 85% coverage: 32:304/323 of query aligns to 27:296/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
x
I
R
x
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
35% identity, 85% coverage: 32:304/323 of query aligns to 27:296/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
x
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
x
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
x
I
R
 
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
35% identity, 85% coverage: 32:304/323 of query aligns to 25:294/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
x
I
R
x
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
x
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
35% identity, 85% coverage: 32:304/323 of query aligns to 28:297/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
 
I
R
x
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
35% identity, 85% coverage: 32:304/323 of query aligns to 28:297/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
|
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
 
-
E
 
-
V
 
I
R
 
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
35% identity, 85% coverage: 32:304/323 of query aligns to 28:297/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
x
I
R
x
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
 
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
37% identity, 83% coverage: 36:304/323 of query aligns to 26:288/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
N
F
 
L
L
 
L
D
 
I
A
 
A
-
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
V
S
 
R
S
 
S
F
 
A
A
 
A
L
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
 
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
-
E
 
-
V
 
I
R
x
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
x
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
 
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
x
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
34% identity, 94% coverage: 2:304/323 of query aligns to 5:302/533 of O43175

query
sites
O43175
N
 
N
R
 
L
K
 
R
N
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
I
F
 
S
R
 
D
A
 
S
L
 
L
P
 
D
P
 
P
D
 
-
L
 
C
L
 
C
A
 
R
R
 
K
I
 
I
T
 
L
E
 
Q
R
 
D
H
 
G
D
 
G
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
A
 
V
D
 
E
P
 
-
R
 
K
R
 
Q
T
 
N
E
 
L
E
 
S
R
 
K
Q
 
E
R
 
E
F
 
L
L
 
I
D
 
A
A
 
E
L
 
L
P
 
Q
Q
 
D
A
 
C
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
-
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
x
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
E
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
V
C
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
L
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
C
 
C
A
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
T
 
E
R
|
R
N
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
K
L
 
F
F
 
M
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
L
H
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
L
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
Y
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
 
-
E
 
-
V
 
I
R
 
I
V
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
S
-
 
F
-
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
T
L
 
V
T
 
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
G
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
Q
 
R
A
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
I
P
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
I
x
L
G
|
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
-
 
S
R
 
R
A
 
C
M
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 95% coverage: 6:313/323 of query aligns to 5:305/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
V
 
V
V
 
L
V
 
I
F
 
A
R
 
D
A
 
K
L
 
L
P
 
A
P
 
P
D
 
S
L
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
A
I
 
L
T
 
G
E
 
D
R
 
Q
H
 
V
D
 
E
V
 
V
V
 
R
V
 
W
A
 
V
D
 
D
P
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
G
E
 
P
E
 
D
R
 
R
Q
 
D
R
 
K
F
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
Q
 
D
G
 
A
L
 
L
-
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
D
 
A
R
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
I
I
 
V
S
 
A
S
x
R
I
 
A
S
 
G
V
|
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
V
P
 
D
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
L
L
 
V
C
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
T
V
 
S
L
x
N
T
 
I
E
 
H
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
H
L
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
C
 
A
A
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
A
L
 
A
S
 
D
N
 
A
L
 
S
V
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
H
R
 
T
W
 
W
T
 
K
R
 
R
N
 
S
I
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
S
L
 
F
F
 
S
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
I
H
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
I
A
 
A
L
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
P
 
Y
V
 
V
L
 
V
Y
 
A
H
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
-
 
V
-
 
S
E
 
P
V
 
A
R
 
R
V
 
A
P
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
-
L
 
-
V
 
I
T
 
E
R
 
L
L
 
L
P
 
S
M
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
S
L
 
V
T
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
K
S
 
T
E
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
I
G
 
D
A
 
K
R
 
E
E
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
S
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
F
 
I
V
 
V
N
 
N
G
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
Q
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
T
N
 
G
G
 
G
P
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
P
 
T
Q
 
D
A
 
-
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
F
T
 
E
H
 
L
P
 
A
R
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
V
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
H
 
A
E
 
E
T
 
A
R
x
Q
R
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
E
 
T
L
 
D
A
 
V
T
 
A
E
 
E
N
 
S
L
 
V
L
 
R
A
 
L
V
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 95% coverage: 6:313/323 of query aligns to 4:304/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
V
 
V
V
 
L
V
 
I
F
 
A
R
 
D
A
 
K
L
 
L
P
 
A
P
 
P
D
 
S
L
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
A
I
 
L
T
 
G
E
 
D
R
 
Q
H
 
V
D
 
E
V
 
V
V
 
R
V
 
W
A
 
V
D
 
D
P
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
G
E
 
P
E
 
D
R
 
R
Q
 
D
R
 
K
F
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
Q
 
D
G
 
A
L
 
L
-
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
S
S
 
A
F
 
T
A
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
D
 
A
R
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
I
I
 
V
S
 
A
S
 
R
I
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
V
P
 
D
Y
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
L
L
 
V
C
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
T
V
 
S
L
x
N
T
 
I
E
 
H
T
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
H
L
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
C
 
A
A
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
V
 
P
E
 
A
L
 
A
S
 
D
N
 
A
L
 
S
V
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
H
R
 
T
W
 
W
T
 
K
R
 
R
N
 
S
I
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
S
L
 
F
F
 
S
G
 
G
W
 
T
D
 
E
V
 
I
H
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
I
A
 
A
L
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
P
 
Y
V
 
V
L
 
V
Y
 
A
H
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
-
 
V
-
 
S
E
 
P
V
 
A
R
 
R
V
 
A
P
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
-
L
 
-
V
 
I
T
 
E
R
 
L
L
 
L
P
 
S
M
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
A
 
S
L
 
V
T
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
K
S
 
T
E
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
I
G
 
D
A
 
K
R
 
E
E
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
S
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
F
 
I
V
 
V
N
 
N
G
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
Q
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
T
N
 
G
G
 
G
P
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
P
 
T
Q
 
D
A
 
-
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
F
T
 
E
H
 
L
P
 
A
R
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
V
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
A
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
R
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
E
 
T
L
 
D
A
 
V
T
 
A
E
 
E
N
 
S
L
 
V
L
 
R
A
 
L
V
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
36% identity, 96% coverage: 5:315/323 of query aligns to 4:317/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
N
 
K
V
 
V
V
 
F
V
 
I
F
 
T
R
 
R
A
 
E
L
 
I
P
 
P
P
 
E
D
 
V
L
 
G
L
 
I
A
 
K
R
 
M
I
 
L
T
 
E
E
 
D
R
 
E
H
 
F
D
 
E
V
 
V
V
 
E
V
 
V
A
 
W
D
 
G
P
 
D
R
 
E
R
 
K
T
 
E
E
 
I
E
 
P
R
 
R
Q
 
E
R
 
I
F
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
K
L
 
V
P
 
K
Q
 
E
A
 
V
Q
 
D
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
T
S
 
M
-
 
L
S
 
S
F
 
E
A
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
K
Q
 
E
T
 
V
L
 
F
D
 
E
R
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
E
 
R
V
 
I
I
 
V
S
 
A
S
 
N
I
 
Y
S
 
A
V
|
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
E
 
D
L
 
I
P
 
E
Y
 
E
L
 
A
E
 
T
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
L
 
V
C
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
T
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
C
 
A
A
 
T
S
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
V
V
 
V
E
 
K
L
 
G
S
 
D
N
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
-
 
K
T
 
K
R
 
R
N
 
G
I
 
V
G
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
E
 
K
D
 
W
L
 
F
F
 
L
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
P
 
R
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
D
x
S
P
x
R
F
x
T
E
 
R
V
 
K
R
 
E
V
 
E
P
 
V
E
 
E
L
 
R
S
 
E
G
 
L
L
 
N
V
 
A
T
 
E
R
 
F
L
 
K
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
A
 
V
L
 
L
T
x
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
E
 
R
A
 
E
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
E
 
R
F
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
K
G
 
T
A
 
A
I
 
I
F
 
L
V
 
I
N
 
N
G
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
E
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
E
G
 
G
P
 
W
L
 
I
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
T
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
Q
 
N
A
 
E
S
 
E
P
 
L
L
 
F
R
 
K
T
 
L
H
 
D
P
 
-
R
 
N
V
 
V
T
 
V
P
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
T
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
L
 
I
A
 
A
V
 
F
L
 
K
D
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
I
P
 
P

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
36% identity, 96% coverage: 5:315/323 of query aligns to 4:317/334 of O58320

query
sites
O58320
N
 
K
V
 
V
V
 
F
V
 
I
F
 
T
R
 
R
A
 
E
L
 
I
P
 
P
P
 
E
D
 
V
L
 
G
L
 
I
A
 
K
R
 
M
I
 
L
T
 
E
E
 
D
R
 
E
H
 
F
D
 
E
V
 
V
V
 
E
V
 
V
A
 
W
D
 
G
P
 
D
R
 
E
R
 
K
T
 
E
E
 
I
E
 
P
R
 
R
Q
 
E
R
 
I
F
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
K
L
 
V
P
 
K
Q
 
E
A
 
V
Q
 
D
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
T
S
 
M
-
 
L
S
 
S
F
 
E
A
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
K
Q
 
E
T
 
V
L
 
F
D
 
E
R
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
E
 
R
V
 
I
I
 
V
S
 
A
S
 
N
I
 
Y
S
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
E
 
D
L
 
I
P
 
E
Y
 
E
L
 
A
E
 
T
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
L
 
V
C
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
T
 
A
T
 
T
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
C
 
A
A
 
T
S
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
V
V
 
V
E
 
K
L
 
G
S
 
D
N
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
-
 
K
T
 
K
R
 
R
N
 
G
I
 
V
G
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
E
 
K
D
 
W
L
 
F
F
 
L
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
P
 
R
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
D
x
S
P
x
R
F
x
T
E
 
R
V
 
K
R
 
E
V
 
E
P
 
V
E
 
E
L
 
R
S
 
E
G
 
L
L
 
N
V
 
A
T
 
E
R
 
F
L
 
K
P
 
P
M
 
L
D
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
A
 
V
L
 
L
T
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
R
A
 
E
T
 
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
E
 
R
F
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
K
G
 
T
A
 
A
I
 
I
F
 
L
V
 
I
N
 
N
G
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
E
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
E
G
 
G
P
 
W
L
 
I
R
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
T
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
Q
 
N
A
 
E
S
 
E
P
 
L
L
 
F
R
 
K
T
 
L
H
 
D
P
 
-
R
 
N
V
 
V
T
 
V
P
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
T
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
L
 
I
A
 
A
V
 
F
L
 
K
D
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
I
P
 
P

8atiA Human ctbp2(31-364) in complex with rai2 peptide(315-322)
35% identity, 90% coverage: 26:315/323 of query aligns to 25:318/330 of 8atiA

query
sites
8atiA
V
|
V
V
x
A
V
x
F
A
x
C
D
 
D
P
 
A
R
 
Q
R
 
S
T
 
T
E
 
Q
E
|
E
R
 
I
Q
x
H
R
 
E
F
 
-
L
 
-
D
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
N
Q
 
E
A
 
A
Q
 
V
G
 
G
-
 
A
L
 
M
I
 
M
G
 
Y
S
 
H
S
 
T
F
 
I
A
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
Q
 
E
T
 
D
L
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
F
P
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
R
V
 
V
I
 
I
S
 
V
S
 
R
I
 
I
S
 
G
V
x
S
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
K
Y
 
A
L
 
A
E
 
G
R
 
E
R
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
L
 
V
C
 
C
N
 
N
T
 
I
P
 
P
G
 
S
V
 
A
L
 
A
T
 
V
E
 
E
T
 
E
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
S
L
 
T
F
 
I
A
 
C
L
 
H
I
 
I
L
 
L
C
 
N
A
 
L
S
 
Y
R
 
R
R
 
R
L
 
N
V
 
T
E
 
W
L
 
L
S
 
Y
N
 
Q
L
 
A
V
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
V
R
 
Q
W
 
S
T
 
V
R
 
E
N
 
Q
I
 
I
G
 
R
E
 
E
D
 
V
L
 
A
F
 
S
G
 
G
W
 
A
D
 
A
-
 
R
V
 
I
H
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
L
L
 
I
G
|
G
F
 
F
G
|
G
R
|
R
I
x
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
K
L
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
P
 
S
V
 
V
L
 
I
Y
 
F
H
 
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
Y
E
 
L
V
 
Q
R
 
D
V
 
G
P
 
I
E
 
E
L
 
R
S
 
S
G
 
L
L
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
R
L
 
V
-
 
Y
P
 
T
M
 
L
D
 
Q
E
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
Y
R
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
C
V
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
H
L
x
C
P
x
N
L
 
L
S
 
N
E
 
E
A
 
H
T
 
N
R
 
H
G
 
H
L
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
F
 
I
A
 
K
L
 
Q
M
 
M
K
 
R
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
I
 
F
F
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
E
G
 
G
P
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
H
A
 
E
T
 
S
E
 
E
P
 
P
L
 
F
P
 
S
Q
 
F
A
 
A
S
 
Q
-
 
G
P
 
P
L
 
L
R
 
K
T
 
D
H
 
A
P
 
P
R
 
N
V
 
L
T
 
I
P
 
C
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
T
G
x
A
S
x
W
A
 
Y
T
 
S
H
 
E
E
 
Q
T
 
A
R
 
S
R
 
L
A
 
E
M
 
M
A
 
R
E
 
E
L
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
T
N
 
E
L
 
I
L
 
R
A
 
R
V
 
A
L
 
I
D
 
T
G
 
G
E
 
R
P
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_029000246.1 NCBI__GCF_000430725.1:WP_029000246.1
MNRKNVVVFRALPPDLLARITERHDVVVADPRRTEERQRFLDALPQAQGLIGSSFALDAQ
TLDRAPALEVISSISVGVDNYELPYLERRGITLCNTPGVLTETTADTLFALILCASRRLV
ELSNLVREGRWTRNIGEDLFGWDVHGKTLGILGFGRIGQALARRAALGFGMPVLYHDPFE
VRVPELSGLVTRLPMDEVLQRADIVALTLPLSEATRGLMGAREFALMKSGAIFVNGARGG
LVQEDALLQALDNGPLRAAALDVFATEPLPQASPLRTHPRVTPLPHIGSATHETRRAMAE
LATENLLAVLDGEPPHCAVLLRR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory