SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_029133026.1 NCBI__GCF_000428045.1:WP_029133026.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3qguA L,l-diaminopimelate aminotransferase from chlamydomonas reinhardtii (see paper)
43% identity, 99% coverage: 2:406/408 of query aligns to 5:403/406 of 3qguA

query
sites
3qguA
I
 
V
K
 
Q
I
 
R
N
 
N
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
Q
 
G
K
 
K
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
R
N
 
K
A
 
A
F
 
H
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
K
N
 
N
Q
 
P
D
 
D
K
 
A
K
 
K
L
 
I
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
x
E
A
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
Y
C
 
I
V
 
A
K
 
D
A
 
A
F
 
M
H
 
A
L
 
K
A
 
A
V
 
A
D
 
A
E
 
G
M
 
L
A
 
A
N
 
T
D
 
R
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
Q
D
 
G
F
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
S
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
G
A
 
H
R
 
A
G
 
G
A
 
R
Q
 
A
V
 
-
D
 
-
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
I
S
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
S
K
 
K
C
 
C
D
 
D
S
 
I
G
 
A
N
 
R
F
 
I
Q
 
Q
E
 
M
I
 
M
F
 
F
S
 
G
T
 
S
D
 
K
I
 
P
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
S
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
N
 
S
V
 
V
M
 
M
A
 
M
G
 
G
R
 
M
S
 
T
G
 
G
S
 
-
W
 
-
D
 
D
A
 
H
E
 
N
L
 
G
G
 
T
R
 
G
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
L
 
I
V
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
V
G
 
C
N
 
N
R
 
P
D
 
D
N
 
N
G
 
H
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
K
-
 
A
R
 
K
P
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
I
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
K
 
T
Q
 
E
W
 
L
V
 
V
D
 
N
Y
 
F
A
 
A
K
 
R
A
 
K
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
L
L
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
A
A
 
L
F
 
Y
V
 
I
Q
 
S
D
 
N
A
 
P
D
 
D
L
 
C
P
 
P
R
 
K
S
 
T
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
I
E
 
E
F
 
T
R
 
C
S
 
S
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
 
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
-
C
 
A
M
 
L
A
 
K
Y
 
Y
T
 
A
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
N
A
 
G
V
 
E
S
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
L
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
R
R
 
V
H
 
M
T
 
T
T
 
T
K
 
C
F
 
F
N
 
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
V
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
G
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
Q
A
 
P
E
 
E
G
 
G
Q
 
L
A
 
K
Q
 
E
I
 
M
K
 
N
E
 
A
L
 
M
I
 
I
A
 
K
Y
x
F
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
A
K
 
Q
Y
 
I
I
 
L
R
 
K
E
 
T
K
 
T
M
 
F
E
 
T
A
 
E
L
 
M
G
 
G
Y
 
F
E
 
S
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
D
N
 
D
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
W
 
W
I
 
V
D
 
G
-
 
F
S
 
P
K
 
G
C
 
K
D
 
P
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
A
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
R
A
 
C
A
 
N
V
 
I
V
 
V
C
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
K
 
P
C
 
A
G
 
G
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
R
 
R
I
 
A
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
G
S
 
S
Y
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
V
E
 
R
R
 
R
I
 
F
S
 
K
K
 
E

Sites not aligning to the query:

Q9ZQI7 Aminotransferase ALD1, chloroplastic; AGD2-like defense response protein 1; EC 2.6.1.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 5:404/408 of query aligns to 41:435/456 of Q9ZQI7

query
sites
Q9ZQI7
N
 
N
E
 
V
N
 
N
Y
 
L
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
Q
 
K
A
 
N
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
E
N
 
L
A
 
E
F
 
H
Q
 
I
Q
 
E
S
 
K
N
 
H
Q
 
P
D
 
N
K
 
V
K
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
T
G
 
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
Q
C
 
I
V
 
T
K
 
S
A
 
H
F
 
M
H
 
S
L
 
N
A
 
F
V
 
A
D
 
H
E
 
G
M
 
L
A
 
S
N
 
T
D
 
V
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
R
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
P
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
N
D
 
K
F
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
-
A
 
-
R
 
R
G
 
D
A
 
L
Q
 
H
V
 
V
D
 
K
A
 
S
D
 
N
E
 
E
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
D
G
 
G
A
|
A
K
x
Q
C
 
S
D
 
D
S
 
I
G
 
S
N
 
R
F
 
L
Q
 
Q
E
 
L
I
 
L
F
 
L
S
 
G
T
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
T
Y
 
F
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
T
 
S
N
 
S
V
 
V
M
 
I
A
 
I
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
H
W
 
F
D
 
H
A
 
E
E
 
K
L
 
T
G
 
K
R
 
K
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
N
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
D
 
P
G
 
C
N
 
G
R
 
P
D
 
N
N
 
N
G
 
S
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
A
D
 
M
R
 
T
P
 
P
-
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
V
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
Y
T
 
V
A
 
A
T
 
S
R
 
R
E
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
H
Q
 
Q
W
 
L
V
 
V
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
T
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
F
D
|
D
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
Q
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
S
L
 
-
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
I
E
 
E
F
 
V
R
 
S
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
 
K
T
 
F
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
|
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
S
V
 
I
V
 
I
P
 
P
K
 
D
E
 
E
C
 
L
M
 
L
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
Y
G
 
S
Q
 
N
A
 
G
V
 
F
S
 
P
V
 
I
H
 
I
S
 
N
L
 
D
W
 
F
N
 
H
R
 
R
R
 
I
H
 
V
T
 
T
T
 
T
K
 
S
F
 
F
N
|
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
A
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
G
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
S
A
 
S
E
 
G
G
 
G
Q
 
L
A
 
K
Q
 
E
I
 
I
K
 
R
E
 
S
L
 
V
I
 
N
A
 
N
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
R
K
 
K
Y
 
I
I
 
L
R
 
M
E
 
D
K
 
T
M
 
L
E
 
V
A
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
E
 
K
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
V
N
 
N
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
W
 
W
I
 
V
D
 
H
S
 
F
K
 
K
-
 
G
C
 
S
D
 
K
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
N
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
N
A
 
T
A
 
H
V
 
I
V
 
I
C
 
T
T
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
P
C
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
E
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
A
 
G
F
 
F
N
 
G
S
 
R
Y
 
R
E
 
D
N
 
H
V
 
I
T
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
L

4fl0B Crystal structure of ald1 from arabidopsis thaliana (see paper)
39% identity, 98% coverage: 5:404/408 of query aligns to 8:402/409 of 4fl0B

query
sites
4fl0B
N
 
N
E
 
V
N
 
N
Y
 
L
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
Q
 
K
A
 
N
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
E
N
 
L
A
 
E
F
 
H
Q
 
I
Q
 
E
S
 
K
N
 
H
Q
 
P
D
 
N
K
 
V
K
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
T
G
 
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
Q
C
 
I
V
 
T
K
 
S
A
 
H
F
 
M
H
 
S
L
 
N
A
 
F
V
 
A
D
 
H
E
 
G
M
 
L
A
 
S
N
 
T
D
 
V
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
P
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
N
D
 
K
F
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
-
A
 
-
R
 
R
G
 
D
A
 
L
Q
 
H
V
 
V
D
 
K
A
 
S
D
 
N
E
 
E
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
D
G
|
G
A
|
A
K
x
Q
C
 
S
D
 
D
S
 
I
G
 
S
N
 
R
F
 
L
Q
 
Q
E
 
L
I
 
L
F
 
L
S
 
G
T
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
T
Y
x
F
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
T
 
S
N
 
S
V
 
V
M
 
I
A
 
I
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
H
W
 
F
D
 
H
A
 
E
E
 
K
L
 
T
G
 
K
R
 
K
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
N
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
D
 
P
G
 
C
N
 
G
R
 
P
D
 
N
N
 
N
G
 
S
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
A
D
 
M
R
 
T
P
 
P
-
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
V
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
Y
T
 
V
A
 
A
T
 
S
R
 
R
E
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
H
Q
 
Q
W
 
L
V
 
V
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
T
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
F
D
|
D
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
Q
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
S
L
 
-
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
I
E
 
E
F
 
V
R
 
S
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
F
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
|
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
S
V
 
I
V
 
I
P
 
P
K
 
D
E
 
E
C
 
L
M
 
L
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
Y
G
 
S
Q
 
N
A
 
G
V
 
F
S
 
P
V
 
I
H
 
I
S
 
N
L
 
D
W
 
F
N
 
H
R
 
R
R
 
I
H
 
V
T
 
T
T
 
T
K
 
S
F
 
F
N
 
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
A
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
G
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
S
A
 
S
E
 
G
G
 
G
Q
 
L
A
 
K
Q
 
E
I
 
I
K
 
R
E
 
S
L
 
V
I
 
N
A
 
N
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
R
K
 
K
Y
 
I
I
 
L
R
 
M
E
 
D
K
 
T
M
 
L
E
 
V
A
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
E
 
K
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
V
N
 
N
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
W
 
W
I
 
V
D
 
H
S
 
F
K
 
K
-
 
G
C
 
S
D
 
K
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
N
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
N
A
 
T
A
 
H
V
 
I
V
 
I
C
 
T
T
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
P
C
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
E
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
A
 
G
F
 
F
N
 
G
S
 
R
Y
 
R
E
 
D
N
 
H
V
 
I
T
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
L

Q93ZN9 LL-diaminopimelate aminotransferase, chloroplastic; AtDAP-AT; DAP-AT; DAP-aminotransferase; LL-DAP-aminotransferase; Protein ABERRANT GROWTH AND DEATH 2; EC 2.6.1.83 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 3 papers)
42% identity, 99% coverage: 5:407/408 of query aligns to 62:459/461 of Q93ZN9

query
sites
Q93ZN9
N
 
N
E
 
S
N
 
N
Y
 
M
Q
 
S
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
R
N
 
S
A
 
A
F
 
H
Q
 
L
Q
 
L
S
 
K
N
 
Y
Q
 
P
D
 
D
K
 
A
K
 
Q
L
 
V
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
|
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
V
C
 
I
V
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
M
H
 
A
L
 
K
A
 
K
V
 
A
D
 
H
E
 
E
M
 
L
A
 
S
N
 
T
D
 
I
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
A
D
 
K
F
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
G
A
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
-
Q
 
-
V
 
I
D
 
G
A
 
D
D
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
D
G
 
G
A
|
A
K
|
K
C
 
C
D
 
D
S
 
I
G
 
S
N
 
R
F
 
L
Q
 
Q
E
 
V
I
 
M
F
 
F
S
 
G
T
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
S
Y
|
Y
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
S
N
 
S
V
 
V
M
 
I
A
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
Q
W
 
F
D
 
N
A
 
T
E
 
D
L
 
V
G
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
E
 
G
N
 
N
L
 
I
V
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
R
G
 
C
N
 
T
R
 
P
D
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
T
-
 
V
R
 
G
P
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
I
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
T
Q
 
Q
W
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
K
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
E
 
A
A
 
M
F
 
Y
V
 
M
Q
 
S
D
 
D
A
 
-
D
 
D
L
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
M
E
 
E
F
 
T
R
 
A
S
|
S
F
|
F
S
|
S
K
|
K
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
|
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
T
V
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
K
C
 
L
M
 
L
A
 
-
Y
 
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
G
V
 
F
S
 
P
V
 
V
H
 
A
S
 
K
L
 
D
W
 
F
N
 
N
R
 
R
R
 
I
H
 
I
T
 
C
T
 
T
K
 
C
F
 
F
N
|
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
S
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
G
 
G
Q
 
L
A
 
E
Q
 
A
I
 
M
K
 
H
E
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
T
K
 
N
Y
 
I
I
 
I
R
 
I
E
 
D
K
 
T
M
 
F
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
N
S
 
A
P
|
P
Y
 
Y
I
 
V
W
 
W
I
 
V
D
 
H
-
 
F
S
 
P
K
 
N
C
 
Q
D
 
S
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
A
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
K
A
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
V
C
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
P
C
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
R
|
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
G
S
 
H
Y
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
C
E
 
R
R
 
R
I
 
F
S
 
K
K
 
Q
I
 
L

3ei5A Crystal structure of ll-diaminopimelate aminotransferase from arabidopsis thaliana complexed with plp-glu: an external aldimine mimic (see paper)
42% identity, 99% coverage: 5:407/408 of query aligns to 9:406/408 of 3ei5A

query
sites
3ei5A
N
 
N
E
 
S
N
 
N
Y
 
M
Q
 
S
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
R
N
 
S
A
 
A
F
 
H
Q
 
L
Q
 
L
S
 
K
N
 
Y
Q
 
P
D
 
D
K
 
A
K
 
Q
L
 
V
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
|
I
G
|
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
V
C
 
I
V
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
M
H
 
A
L
 
K
A
 
K
V
 
A
D
 
H
E
 
E
M
 
L
A
 
S
N
 
T
D
 
I
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
A
D
 
K
F
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
G
A
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
-
Q
 
-
V
 
I
D
 
G
A
 
D
D
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
D
G
|
G
A
|
A
K
|
K
C
 
C
D
 
D
S
 
I
G
 
S
N
 
R
F
 
L
Q
 
Q
E
 
V
I
 
M
F
 
F
S
 
G
T
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
S
Y
|
Y
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
S
N
 
S
V
 
V
M
 
I
A
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
Q
W
 
F
D
 
N
A
 
T
E
 
D
L
 
V
G
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
E
 
G
N
 
N
L
 
I
V
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
R
G
 
C
N
 
T
R
 
P
D
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
T
-
 
V
R
 
G
P
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
I
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
T
Q
 
Q
W
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
K
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
V
F
 
Y
D
|
D
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
E
 
A
A
 
M
F
 
Y
V
 
M
Q
 
S
D
 
D
A
 
-
D
 
D
L
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
M
E
 
E
F
 
T
R
 
A
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
|
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
T
V
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
K
C
 
L
M
 
L
A
 
-
Y
 
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
G
V
 
F
S
 
P
V
 
V
H
 
A
S
 
K
L
 
D
W
 
F
N
 
N
R
 
R
R
 
I
H
 
I
T
 
C
T
 
T
K
 
C
F
 
F
N
|
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
S
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
G
 
G
Q
 
L
A
 
E
Q
 
A
I
 
M
K
 
H
E
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
T
K
 
N
Y
 
I
I
 
I
R
 
I
E
 
D
K
 
T
M
 
F
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
N
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
V
W
 
W
I
 
V
D
 
H
-
 
F
S
 
P
K
 
N
C
 
Q
D
 
S
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
A
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
K
A
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
V
C
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
P
C
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
R
|
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
G
S
 
H
Y
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
C
E
 
R
R
 
R
I
 
F
S
 
K
K
 
Q
I
 
L

2z1zA Crystal structure of ll-diaminopimelate aminotransferase from arabidopsis thaliana complexed with l-malate ion (see paper)
42% identity, 99% coverage: 5:407/408 of query aligns to 9:406/408 of 2z1zA

query
sites
2z1zA
N
 
N
E
 
S
N
 
N
Y
 
M
Q
 
S
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
R
N
 
S
A
 
A
F
 
H
Q
 
L
Q
 
L
S
 
K
N
 
Y
Q
 
P
D
 
D
K
 
A
K
 
Q
L
 
V
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
V
C
 
I
V
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
M
H
 
A
L
 
K
A
 
K
V
 
A
D
 
H
E
 
E
M
 
L
A
 
S
N
 
T
D
 
I
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
A
D
 
K
F
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
G
A
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
-
Q
 
-
V
 
I
D
 
G
A
 
D
D
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
D
G
|
G
A
|
A
K
|
K
C
 
C
D
 
D
S
 
I
G
 
S
N
 
R
F
 
L
Q
 
Q
E
 
V
I
 
M
F
 
F
S
 
G
T
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
S
Y
|
Y
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
S
N
 
S
V
 
V
M
 
I
A
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
Q
W
 
F
D
 
N
A
 
T
E
 
D
L
 
V
G
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
E
 
G
N
 
N
L
 
I
V
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
R
G
 
C
N
 
T
R
 
P
D
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
T
-
 
V
R
 
G
P
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
I
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
T
Q
 
Q
W
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
K
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
V
F
 
Y
D
|
D
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
E
 
A
A
 
M
F
 
Y
V
 
M
Q
 
S
D
 
D
A
 
-
D
 
D
L
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
M
E
 
E
F
 
T
R
 
A
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
|
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
T
V
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
K
C
 
L
M
 
L
A
 
-
Y
 
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
G
V
 
F
S
 
P
V
 
V
H
 
A
S
 
K
L
 
D
W
 
F
N
 
N
R
 
R
R
 
I
H
 
I
T
 
C
T
 
T
K
 
C
F
 
F
N
|
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
S
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
G
 
G
Q
 
L
A
 
E
Q
 
A
I
 
M
K
 
H
E
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
T
K
 
N
Y
 
I
I
 
I
R
 
I
E
 
D
K
 
T
M
 
F
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
N
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
V
W
 
W
I
 
V
D
 
H
-
 
F
S
 
P
K
 
N
C
 
Q
D
 
S
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
A
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
K
A
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
V
C
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
P
C
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
R
 
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
G
S
 
H
Y
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
C
E
 
R
R
 
R
I
 
F
S
 
K
K
 
Q
I
 
L

3ei6A Crystal structure of ll-diaminopimelate aminotransferase from arabidopsis thaliana complexed with plp-dap: an external aldimine mimic (see paper)
42% identity, 99% coverage: 5:407/408 of query aligns to 9:406/410 of 3ei6A

query
sites
3ei6A
N
 
N
E
 
S
N
 
N
Y
 
M
Q
 
S
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
R
N
 
S
A
 
A
F
 
H
Q
 
L
Q
 
L
S
 
K
N
 
Y
Q
 
P
D
 
D
K
 
A
K
 
Q
L
 
V
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
|
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
V
C
 
I
V
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
M
H
 
A
L
 
K
A
 
K
V
 
A
D
 
H
E
 
E
M
 
L
A
 
S
N
 
T
D
 
I
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
A
D
 
K
F
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
G
A
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
-
Q
 
-
V
 
I
D
 
G
A
 
D
D
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
D
G
|
G
A
|
A
K
|
K
C
 
C
D
 
D
S
 
I
G
 
S
N
 
R
F
 
L
Q
 
Q
E
 
V
I
 
M
F
 
F
S
 
G
T
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
S
Y
|
Y
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
S
N
 
S
V
 
V
M
 
I
A
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
Q
W
 
F
D
 
N
A
 
T
E
 
D
L
 
V
G
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
E
 
G
N
 
N
L
 
I
V
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
R
G
 
C
N
 
T
R
 
P
D
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
T
-
 
V
R
 
G
P
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
I
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
T
Q
 
Q
W
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
K
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
V
F
 
Y
D
|
D
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
E
 
A
A
 
M
F
 
Y
V
 
M
Q
 
S
D
 
D
A
 
-
D
 
D
L
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
M
E
 
E
F
 
T
R
 
A
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
|
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
T
V
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
K
C
 
L
M
 
L
A
 
-
Y
 
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
G
V
 
F
S
 
P
V
 
V
H
 
A
S
 
K
L
 
D
W
 
F
N
 
N
R
 
R
R
 
I
H
 
I
T
 
C
T
 
T
K
 
C
F
 
F
N
|
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
S
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
G
 
G
Q
 
L
A
 
E
Q
 
A
I
 
M
K
 
H
E
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
T
K
 
N
Y
 
I
I
 
I
R
 
I
E
 
D
K
 
T
M
 
F
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
N
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
V
W
 
W
I
 
V
D
 
H
-
 
F
S
 
P
K
 
N
C
 
Q
D
 
S
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
A
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
K
A
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
V
C
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
P
C
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
R
|
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
G
S
 
H
Y
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
C
E
 
R
R
 
R
I
 
F
S
 
K
K
 
Q
I
 
L

3ei8A Crystal structure of k270n variant of ll-diaminopimelate aminotransferase from arabidopsis thaliana complexed with ll-dap: external aldimine form (see paper)
42% identity, 99% coverage: 5:407/408 of query aligns to 9:406/411 of 3ei8A

query
sites
3ei8A
N
 
N
E
 
S
N
 
N
Y
 
M
Q
 
S
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
R
N
 
S
A
 
A
F
 
H
Q
 
L
Q
 
L
S
 
K
N
 
Y
Q
 
P
D
 
D
K
 
A
K
 
Q
L
 
V
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
V
C
 
I
V
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
M
H
 
A
L
 
K
A
 
K
V
 
A
D
 
H
E
 
E
M
 
L
A
 
S
N
 
T
D
 
I
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
A
D
 
K
F
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
G
A
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
-
Q
 
-
V
 
I
D
 
G
A
 
D
D
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
D
G
|
G
A
|
A
K
|
K
C
 
C
D
 
D
S
 
I
G
 
S
N
 
R
F
 
L
Q
 
Q
E
 
V
I
 
M
F
 
F
S
 
G
T
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
S
Y
|
Y
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
S
N
 
S
V
 
V
M
 
I
A
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
Q
W
 
F
D
 
N
A
 
T
E
 
D
L
 
V
G
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
E
 
G
N
 
N
L
 
I
V
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
R
G
 
C
N
 
T
R
 
P
D
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
T
-
 
V
R
 
G
P
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
I
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
T
Q
 
Q
W
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
K
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
V
F
 
Y
D
|
D
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
E
 
A
A
 
M
F
 
Y
V
 
M
Q
 
S
D
 
D
A
 
-
D
 
D
L
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
M
E
 
E
F
 
T
R
 
A
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
 
N
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
|
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
T
V
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
K
C
 
L
M
 
L
A
 
-
Y
 
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
G
V
 
F
S
 
P
V
 
V
H
 
A
S
 
K
L
 
D
W
 
F
N
 
N
R
 
R
R
 
I
H
 
I
T
 
C
T
 
T
K
 
C
F
 
F
N
|
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
S
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
G
 
G
Q
 
L
A
 
E
Q
 
A
I
 
M
K
 
H
E
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
T
K
 
N
Y
 
I
I
 
I
R
 
I
E
 
D
K
 
T
M
 
F
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
N
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
V
W
 
W
I
 
V
D
 
H
-
 
F
S
 
P
K
 
N
C
 
Q
D
 
S
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
A
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
K
A
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
V
C
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
P
C
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
R
 
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
G
S
 
H
Y
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
C
E
 
R
R
 
R
I
 
F
S
 
K
K
 
Q
I
 
L

3ei9A Crystal structure of k270n variant of ll-diaminopimelate aminotransferase from arabidopsis thaliana complexed with l-glu: external aldimine form (see paper)
42% identity, 99% coverage: 5:407/408 of query aligns to 9:406/412 of 3ei9A

query
sites
3ei9A
N
 
N
E
 
S
N
 
N
Y
 
M
Q
 
S
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
S
 
P
N
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
R
N
 
S
A
 
A
F
 
H
Q
 
L
Q
 
L
S
 
K
N
 
Y
Q
 
P
D
 
D
K
 
A
K
 
Q
L
 
V
I
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
I
|
I
G
|
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
V
C
 
I
V
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
M
H
 
A
L
 
K
A
 
K
V
 
A
D
 
H
E
 
E
M
 
L
A
 
S
N
 
T
D
 
I
A
 
E
T
 
G
F
 
Y
H
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
A
D
 
K
F
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
T
D
 
F
F
 
Y
Q
 
G
A
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
-
Q
 
-
V
 
I
D
 
G
A
 
D
D
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
D
G
|
G
A
|
A
K
|
K
C
 
C
D
 
D
S
 
I
G
 
S
N
 
R
F
 
L
Q
 
Q
E
 
V
I
 
M
F
 
F
S
 
G
T
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
S
Y
|
Y
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
S
N
 
S
V
 
V
M
 
I
A
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
Q
W
 
F
D
 
N
A
 
T
E
 
D
L
 
V
G
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
E
 
G
N
 
N
L
 
I
V
 
E
Y
 
Y
L
 
M
D
 
R
G
 
C
N
 
T
R
 
P
D
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
T
-
 
V
R
 
G
P
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
I
I
 
I
Y
 
F
L
 
F
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
T
Q
 
Q
W
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
K
N
 
N
K
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
V
F
 
Y
D
|
D
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
E
 
A
A
 
M
F
 
Y
V
 
M
Q
 
S
D
 
D
A
 
-
D
 
D
L
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
M
E
 
E
F
 
T
R
 
A
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
 
N
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
R
|
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
T
V
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
K
C
 
L
M
 
L
A
 
-
Y
 
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
G
V
 
F
S
 
P
V
 
V
H
 
A
S
 
K
L
 
D
W
 
F
N
 
N
R
 
R
R
 
I
H
 
I
T
 
C
T
 
T
K
 
C
F
 
F
N
|
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
N
P
 
I
V
 
S
Q
 
Q
R
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
C
Y
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
G
 
G
Q
 
L
A
 
E
Q
 
A
I
 
M
K
 
H
E
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
L
 
K
N
 
E
N
 
N
A
 
T
K
 
N
Y
 
I
I
 
I
R
 
I
E
 
D
K
 
T
M
 
F
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
N
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
V
W
 
W
I
 
V
D
 
H
-
 
F
S
 
P
K
 
N
C
 
Q
D
 
S
S
 
S
W
 
W
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
A
R
 
E
L
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
K
A
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
V
C
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
P
C
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
R
|
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
G
S
 
H
Y
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
C
E
 
R
R
 
R
I
 
F
S
 
K
K
 
Q
I
 
L

O84395 LL-diaminopimelate aminotransferase; DAP-AT; DAP-aminotransferase; LL-DAP-aminotransferase; EC 2.6.1.83 from Chlamydia trachomatis serovar D (strain ATCC VR-885 / DSM 19411 / UW-3/Cx) (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:404/408 of query aligns to 1:386/394 of O84395

query
sites
O84395
I
 
M
K
 
K
I
 
R
N
 
N
E
 
P
N
 
H
Y
 
F
Q
 
V
K
 
S
L
 
L
Q
 
T
A
 
K
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
S
 
A
N
 
D
I
 
L
A
 
Q
K
 
K
R
 
R
V
 
V
N
 
A
A
 
Q
F
 
F
Q
 
R
Q
 
L
S
 
E
N
 
N
Q
 
P
D
 
Q
K
 
H
K
 
T
L
 
V
I
 
I
K
 
N
L
 
L
G
 
S
I
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
T
T
 
T
R
 
Q
A
 
P
L
 
L
P
 
N
D
 
A
A
 
S
C
 
V
V
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
F
H
 
A
L
 
S
A
 
S
V
 
I
D
 
A
E
 
R
M
 
L
A
 
S
N
 
S
D
 
P
A
 
T
T
 
T
F
 
C
H
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
E
 
D
Q
 
F
G
 
G
Y
 
L
D
 
P
F
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
A
 
K
I
 
L
A
 
S
K
 
E
N
 
D
D
 
F
F
 
Y
Q
 
-
A
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
F
Q
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
K
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
I
S
 
S
D
 
D
G
 
G
A
|
A
K
|
K
C
 
V
D
 
D
S
 
L
G
 
F
N
 
R
F
 
L
Q
 
L
E
 
S
I
 
F
F
 
F
S
 
G
T
 
P
D
 
N
I
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
P
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
S
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
L
D
 
D
T
 
I
N
 
A
V
 
R
M
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
A
S
 
-
G
 
-
S
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
K
N
 
E
L
 
I
V
 
I
Y
 
A
L
 
L
D
 
P
G
 
C
N
 
L
R
 
Q
D
 
E
N
 
N
G
 
A
F
 
F
I
 
F
P
 
P
D
 
E
L
 
F
P
 
P
-
 
E
D
 
D
R
 
T
P
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
I
I
 
L
Y
 
C
L
 
L
C
 
C
F
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
T
T
 
V
A
 
L
T
 
N
R
 
K
E
 
D
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
Q
 
A
W
 
I
V
 
V
D
 
H
Y
 
Y
A
 
A
K
 
I
A
 
E
N
 
H
K
 
E
S
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
F
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
E
 
S
A
 
T
F
 
F
V
 
I
Q
 
S
D
 
D
A
 
P
D
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
K
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
F
V
 
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
F
 
I
R
 
N
S
|
S
F
|
F
S
|
S
K
|
K
T
 
P
A
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
A
G
 
G
T
 
I
R
 
R
C
 
L
A
 
G
Y
 
W
T
 
T
V
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
C
 
-
M
 
L
A
 
T
Y
 
Y
T
 
A
E
 
D
A
 
G
G
 
H
Q
 
F
A
 
V
V
 
I
S
 
Q
V
 
D
H
 
-
S
 
-
L
 
-
W
 
W
N
 
E
R
 
R
R
 
F
H
 
L
T
 
S
T
 
T
K
 
T
F
 
F
N
 
N
S
 
G
V
 
A
S
 
S
Y
 
I
P
 
P
V
 
A
Q
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
V
A
 
A
V
 
G
Y
 
L
S
 
S
A
 
I
E
 
L
G
 
P
Q
 
Q
A
 
L
Q
 
-
I
 
-
K
 
-
E
 
E
L
 
A
I
 
I
A
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
R
N
 
E
N
 
N
A
 
S
K
 
D
Y
 
L
I
 
L
R
 
R
E
 
K
K
 
A
M
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
G
Y
 
F
E
 
E
C
 
V
I
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
E
N
 
H
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
W
 
W
I
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
T
D
 
Q
S
 
A
K
 
N
C
 
I
D
 
S
S
 
D
W
 
R
E
 
D
F
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
F
L
 
F
L
 
L
N
 
R
E
 
E
A
 
Y
A
 
H
V
 
I
V
 
A
C
 
I
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
R
C
 
S
G
 
G
E
 
S
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
R
 
R
I
 
F
S
 
S
A
 
S
F
 
L
N
 
G
S
 
K
Y
 
R
E
 
E
N
 
D
V
 
I
T
 
L
E
 
A
A
 
A
M
 
C
E
 
E
R
 
R
I
 
L

6l1oB Product bound bacf structure from bacillus subtillis (see paper)
30% identity, 96% coverage: 17:407/408 of query aligns to 17:387/392 of 6l1oB

query
sites
6l1oB
F
|
F
S
 
S
N
 
L
I
 
V
A
 
F
K
 
Q
R
 
K
V
 
V
N
 
K
A
 
E
F
 
M
Q
 
E
Q
 
K
S
 
T
N
 
G
Q
 
-
D
 
-
K
 
A
K
 
H
L
 
I
I
 
I
K
 
N
L
 
L
G
 
G
I
x
Q
G
|
G
D
 
N
V
 
P
T
 
D
R
 
L
A
 
P
L
 
T
P
 
P
D
 
P
A
 
H
C
 
I
V
 
V
K
 
E
A
 
A
F
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
L
D
 
R
E
 
E
M
 
A
A
 
S
N
 
L
D
 
N
A
 
P
T
 
S
F
 
F
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
E
 
F
Q
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
A
N
 
F
D
 
Y
F
 
K
Q
 
R
A
 
E
R
 
Y
G
 
G
A
 
V
Q
 
T
V
 
I
D
 
N
A
 
P
D
 
E
-
 
T
E
 
E
V
 
V
F
 
A
V
 
L
S
 
F
D
 
G
G
 
G
A
x
G
K
|
K
C
 
A
D
 
G
S
 
L
G
 
Y
N
 
V
F
 
L
Q
 
T
E
 
Q
I
 
C
F
 
L
S
 
L
T
 
N
D
 
P
I
 
G
T
 
D
V
 
I
A
 
A
-
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
N
P
 
P
V
 
G
Y
|
Y
P
 
P
V
x
E
Y
 
Y
V
 
L
D
 
S
T
 
G
N
 
I
V
 
T
M
 
M
A
 
A
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
W
 
-
D
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
-
R
 
-
Y
 
Y
E
 
E
N
 
M
L
 
P
V
 
L
Y
 
Y
L
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
E
D
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
F
P
 
E
D
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
R
 
E
P
 
K
V
 
A
D
 
K
L
 
L
I
 
M
Y
 
F
L
 
L
C
x
N
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
A
 
A
T
 
D
R
 
A
E
 
A
Q
 
F
L
 
Y
K
 
A
Q
 
K
W
 
A
V
 
A
D
 
A
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
E
N
 
H
K
 
N
S
 
I
L
 
H
I
 
L
L
 
I
F
 
H
D
|
D
A
 
F
A
 
A
Y
|
Y
E
 
G
A
 
A
F
 
F
V
 
E
Q
 
F
D
 
D
A
 
Q
D
 
K
L
 
-
P
 
P
R
 
A
S
 
S
I
 
F
Y
 
L
E
 
E
V
 
A
E
 
E
G
 
D
A
 
A
R
 
K
E
 
T
V
 
V
A
 
G
V
 
A
E
 
E
F
 
L
R
 
Y
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
T
A
 
F
G
 
N
F
 
M
T
 
A
G
 
G
T
 
W
R
|
R
C
 
M
A
 
A
Y
 
F
T
 
A
V
 
V
V
 
G
P
 
N
K
 
E
E
 
K
C
 
I
M
 
I
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
S
 
-
V
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
W
 
-
N
 
N
R
 
E
R
 
F
H
 
Q
T
 
D
T
 
H
K
 
V
F
 
F
N
 
V
S
 
G
V
 
M
S
 
F
Y
 
G
P
 
G
V
 
L
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
A
V
 
A
Y
 
L
S
 
S
A
 
G
-
 
D
-
 
P
E
 
E
G
 
H
Q
 
T
A
 
E
Q
 
S
I
 
L
K
 
K
E
 
R
L
 
I
I
 
Y
A
 
K
Y
 
E
Y
 
R
L
 
I
N
 
D
N
 
F
A
 
F
K
 
T
Y
 
A
I
 
L
R
 
C
E
 
E
K
 
K
M
 
-
E
 
-
A
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
E
 
K
C
 
M
I
 
E
G
 
K
G
 
P
V
 
K
N
 
G
S
 
T
P
 
F
Y
|
Y
I
 
V
W
 
W
I
 
A
D
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
N
S
 
T
K
 
F
C
 
E
D
 
T
S
 
S
W
 
H
E
 
Q
F
 
F
F
 
S
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
N
 
E
E
 
H
A
 
A
A
 
H
V
 
V
V
 
V
C
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
E
G
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
S
C
 
N
G
 
G
E
 
K
G
 
R
Y
 
H
I
 
V
R
|
R
I
 
I
S
 
S
A
 
M
F
 
V
N
 
S
S
 
K
Y
 
Q
E
 
E
N
 
D
V
 
L
T
 
R
E
 
E
A
 
F
M
 
V
E
 
T
R
 
R
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
I
 
L

6l1lB Apo-bacf structure from bacillus subtillis (see paper)
30% identity, 96% coverage: 17:407/408 of query aligns to 17:387/393 of 6l1lB

query
sites
6l1lB
F
 
F
S
 
S
N
 
L
I
 
V
A
 
F
K
 
Q
R
 
K
V
 
V
N
 
K
A
 
E
F
 
M
Q
 
E
Q
 
K
S
 
T
N
 
G
Q
 
-
D
 
-
K
 
A
K
 
H
L
 
I
I
 
I
K
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
Q
G
 
G
D
 
N
V
 
P
T
 
D
R
 
L
A
 
P
L
 
T
P
 
P
D
 
P
A
 
H
C
 
I
V
 
V
K
 
E
A
 
A
F
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
L
D
 
R
E
 
E
M
 
A
A
 
S
N
 
L
D
 
N
A
 
P
T
 
S
F
 
F
H