SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_029621866.1 NCBI__GCF_000192475.1:WP_029621866.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 2 hits to proteins with known functional sites (download)

8oriD Crystal structure of rhizobium etli l-asparaginase reaiv (orthorhombic) (see paper)
40% identity, 89% coverage: 1:295/332 of query aligns to 5:303/341 of 8oriD

query
sites
8oriD
M
 
F
T
 
T
Q
 
M
A
 
T
V
 
N
P
 
P
M
 
V
T
 
T
-
 
V
E
 
E
L
 
V
W
 
T
R
 
R
G
 
G
S
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
R
H
 
H
L
 
R
G
 
G
H
 
A
A
 
V
V
 
A
I
 
V
C
 
V
D
 
D
D
 
G
R
 
D
G
 
G
Q
 
K
I
 
L
V
 
F
R
 
F
S
 
S
W
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
I
N
 
D
A
 
T
I
 
A
I
 
V
Y
 
F
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
A
A
 
C
K
 
K
M
 
A
I
 
M
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
V
T
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
A
Y
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
G
S
 
D
E
 
K
H
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
E
H
 
E
I
 
E
H
 
H
T
 
V
D
 
A
R
 
L
V
 
A
S
 
A
A
 
S
W
 
M
L
 
L
D
 
S
H
 
R
L
 
A
G
 
G
L
 
R
S
 
N
E
 
V
L
 
E
D
 
A
L
 
L
R
 
E
C
 
C
G
 
G
P
 
A
Q
 
H
E
 
W
P
 
S
A
 
M
D
 
N
M
 
Q
A
 
K
A
 
V
R
 
L
D
 
I
G
 
Q
L
 
Q
I
 
A
L
 
R
A
 
S
D
 
L
D
 
D
T
 
A
P
 
P
C
 
T
Q
 
A
I
 
L
H
 
H
N
 
N
N
 
N
C
|
C
S
 
S
G
 
G
K
|
K
H
 
H
S
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
I
T
 
C
L
 
A
A
 
C
Q
 
C
H
 
H
M
 
R
G
 
D
A
 
I
G
 
D
P
 
P
E
 
K
-
 
G
Y
 
Y
L
 
V
E
 
G
I
 
Y
D
 
E
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
V
A
 
E
C
 
I
L
 
R
S
 
A
A
 
V
I
 
M
E
 
E
E
 
R
T
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
V
-
 
L
-
 
G
S
 
A
P
 
E
T
 
S
Y
 
C
G
 
G
I
 
T
D
 
D
G
 
G
C
|
C
S
 
S
A
 
I
P
 
P
N
 
T
F
 
Y
A
 
A
T
 
M
S
 
P
L
 
L
V
 
R
G
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
H
S
 
G
M
 
F
A
 
A
W
 
R
F
 
M
A
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
T
D
 
G
R
 
L
S
 
E
D
 
P
R
 
L
S
 
R
S
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
S
V
 
R
Q
 
R
L
 
L
T
 
I
A
 
E
A
 
A
M
 
C
V
 
M
K
 
A
H
 
E
P
 
P
E
 
F
L
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
S
T
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
C
T
 
T
E
 
K
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
A
 
I
M
 
A
N
 
P
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
F
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
C
A
 
A
I
 
A
I
 
I
P
 
P
E
 
E
K
 
K
R
 
G
M
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
I
 
S
T
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
A
T
 
T
R
 
R
A
 
A
S
 
A
E
 
E
C
 
A
A
 
M
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
T
L
 
L
V
 
A
S
 
R
L
 
F

7os3AAA L-asparaginase II protein (see paper)
32% identity, 100% coverage: 1:331/332 of query aligns to 5:351/369 of 7os3AAA

query
sites
7os3AAA
M
 
M
T
 
T
Q
 
P
A
 
S
V
 
E
P
 
D
M
 
F
T
 
V
E
 
V
L
 
T
W
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
G
L
 
I
L
 
V
E
 
E
S
 
N
L
 
S
H
 
H
L
 
R
G
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
A
I
 
V
C
 
V
D
 
D
D
 
A
R
 
K
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
V
 
L
R
 
Y
S
 
A
W
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
P
N
 
T
A
 
R
I
 
M
I
 
T
Y
 
L
P
 
A
R
 
R
S
 
S
S
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
P
I
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
A
L
 
I
I
 
L
T
 
E
S
 
T
G
 
E
A
 
G
A
 
V
A
 
A
K
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
D
S
 
D
E
 
A
H
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
M
C
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
H
N
 
S
G
 
S
A
 
E
H
 
D
I
 
R
H
 
H
T
 
I
D
 
A
R
 
R
V
 
T
S
 
R
A
 
A
W
 
M
L
 
L
D
 
S
H
 
K
L
 
I
G
 
K
L
 
A
S
 
E
E
 
E
L
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
R
C
 
C
G
 
G
P
 
G
Q
 
H
E
 
P
P
 
S
A
 
L
D
 
S
M
 
E
A
 
M
A
 
V
R
 
N
D
 
R
G
 
S
L
 
W
I
 
I
L
 
K
A
 
Q
D
 
D
D
 
F
T
 
I
P
 
P
C
 
T
Q
 
A
I
 
V
H
 
C
N
 
S
N
 
N
C
|
C
S
 
S
G
 
G
K
|
K
H
 
H
S
 
V
G
 
G
F
 
M
L
 
L
T
 
A
L
 
G
A
 
A
Q
 
R
H
 
A
M
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
T
E
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
H
E
 
L
I
 
P
D
 
D
H
 
H
P
 
P
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
R
C
 
V
L
 
K
S
 
R
A
 
T
I
 
V
E
 
A
E
 
E
-
 
L
-
 
C
-
 
D
-
 
L
T
 
D
T
 
A
G
 
G
E
 
D
T
 
V
S
 
E
P
 
-
T
 
-
Y
 
W
G
 
G
I
 
T
D
 
D
G
 
G
C
|
C
S
 
N
A
 
L
P
 
P
N
 
T
F
 
P
A
 
A
T
 
F
S
 
P
L
 
L
V
 
D
G
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
R
S
 
I
M
 
Y
A
 
A
W
 
K
F
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
G
S
 
S
D
 
D
R
 
A
S
 
G
S
 
E
E
 
G
A
 
Q
A
 
S
V
 
T
Q
 
R
L
 
C
T
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
I
-
 
F
-
 
R
A
 
A
M
 
M
V
 
A
K
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
G
R
 
R
A
 
Y
C
 
C
T
 
T
E
 
M
L
 
L
M
 
M
R
 
R
A
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
G
R
 
A
V
 
L
A
 
V
I
 
G
K
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
S
F
 
Y
V
 
A
A
 
I
I
 
G
I
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
P
 
T
E
 
D
K
 
G
R
 
A
M
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
S
L
 
V
K
 
K
I
 
I
T
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
N
T
 
L
R
 
E
A
 
M
S
 
L
E
 
Y
C
 
A
A
 
V
I
 
V
A
 
T
A
 
E
I
 
L
L
 
L
V
 
E
S
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
G
H
 
S
P
 
P
A
 
D
T
 
V
R
 
R
K
 
S
F
 
Q
M
 
L
N
 
A
A
 
S
T
 
F
Q
 
H
Y
 
H
S
 
P
R
 
Q
R
 
R
G
 
V
L
 
N
E
 
T
C
 
M
G
 
G
V
 
V
I
 
T
K
 
T
P
 
G
A
 
G
P
 
V
D
 
S
F
 
F
P
 
P

Query Sequence

>WP_029621866.1 NCBI__GCF_000192475.1:WP_029621866.1
MTQAVPMTELWRGSLLESLHLGHAVICDDRGQIVRSWGDPNAIIYPRSSAKMIQALPLIT
SGAAAKYGLNSEHLALACASHNGAHIHTDRVSAWLDHLGLSELDLRCGPQEPADMAARDG
LILADDTPCQIHNNCSGKHSGFLTLAQHMGAGPEYLEIDHPVQQACLSAIEETTGETSPT
YGIDGCSAPNFATSLVGLARSMAWFASAADRSDRSSEAAVQLTAAMVKHPELVAGETRAC
TELMRAMNGRVAIKTGAEAVFVAIIPEKRMGVALKITDGTTRASECAIAAILVSLGVLAA
DHPATRKFMNATQYSRRGLECGVIKPAPDFPG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory