SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_034211187.1 NCBI__GCF_000747155.1:WP_034211187.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 18 hits to proteins with known functional sites (download)

4fwsA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with ctp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 4fwsA

query
sites
4fwsA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
x
V
D
 
A
A
 
T
Q
x
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
G
x
N
G
|
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
|
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
x
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

4fwrA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with cmp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 4fwrA

query
sites
4fwrA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
G
x
N
G
 
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

4fwqA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gtp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 4fwqA

query
sites
4fwqA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
G
G
x
N
G
|
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
x
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

4fwpA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gdp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 4fwpA

query
sites
4fwpA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
|
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
G
G
x
N
G
 
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
x
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
x
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
x
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

4fwoA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gmp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 4fwoA

query
sites
4fwoA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
x
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
x
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
G
x
N
G
 
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
x
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

4fwnA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with adenosine tetraphosphate (ap4) (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 4fwnA

query
sites
4fwnA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
|
H
L
 
L
G
 
G
G
x
N
G
|
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

4fwmA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with atp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 4fwmA

query
sites
4fwmA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
|
H
L
 
L
G
 
G
G
x
N
G
|
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

4fwkA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with amp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 4fwkA

query
sites
4fwkA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
x
D
E
x
N
L
 
I
T
 
R
A
x
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
G
x
N
G
 
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

2e1zA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with diadenosine tetraphosphate (ap4a) obtained after co- crystallization with atp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 2e1zA

query
sites
2e1zA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
G
x
N
G
|
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
|
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

1x3nA Crystal structure of amppnp bound propionate kinase (tdcd) from salmonella typhimurium (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 1x3nA

query
sites
1x3nA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
G
x
N
G
|
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

1x3mA Crystal structure of adp bound propionate kinase (tdcd) from salmonella typhimurium (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:370/375 of query aligns to 4:387/394 of 1x3mA

query
sites
1x3mA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
V
Y
 
L
A
 
D
M
 
V
D
 
A
A
 
T
Q
 
C
G
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
G
K
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
L
 
N
P
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
A
H
 
F
D
 
L
A
 
S
R
 
I
S
 
N
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
W
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
K
R
 
R
A
 
D
G
 
L
Q
 
T
P
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
-
 
L
R
 
F
P
 
T
G
 
Q
P
 
S
A
 
V
R
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
T
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
Y
P
 
A
A
 
N
L
 
L
R
 
S
L
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
H
R
 
L
W
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
R
 
L
L
 
Y
P
 
G
V
 
L
P
 
P
-
 
W
A
 
E
S
 
Y
L
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
R
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
R
Q
 
R
-
 
A
L
 
Y
S
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
P
 
L
A
 
D
L
 
E
A
 
K
Q
 
D
A
 
S
R
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
G
x
N
G
 
G
S
 
A
S
 
S
L
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
M
M
 
M
A
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
R
 
T
H
 
G
M
 
Q
P
 
T
L
 
L
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
E
 
E
H
 
R
L
 
V
L
 
V
W
 
N
R
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
G
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
E
 
V
L
 
L
L
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
K
S
 
A
E
 
W
S
 
H
A
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
A
 
A
L
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
H
A
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
H
G
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
T
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
E
G
x
N
A
 
S
A
 
V
P
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
H
L
 
L
A
 
G
W
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
E
A
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
A
 
S
A
 
H
G
 
G
V
 
E
A
 
R
Q
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
P
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
S
 
I
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
T
D
 
N
E
|
E
E
 
E
Q
 
K
E
 
M
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
I

7fj9A Kpacka (pduw) with amppnp complex structure
37% identity, 96% coverage: 7:366/375 of query aligns to 4:385/395 of 7fj9A

query
sites
7fj9A
V
 
I
L
 
M
T
 
A
I
 
I
N
 
N
V
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
S
T
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
F
A
 
Q
Y
 
L
Y
 
L
A
 
N
M
 
M
D
 
-
A
 
P
Q
 
Q
G
 
G
V
 
A
L
 
L
I
 
L
T
 
C
S
 
Q
A
 
G
A
 
L
R
 
I
A
 
E
K
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
E
D
 
A
A
 
R
H
 
F
D
 
T
A
 
L
R
 
K
-
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
Q
R
 
K
W
 
W
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
A
L
 
V
S
 
T
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
E
Q
 
A
L
 
L
P
 
T
A
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
L
G
 
Q
Q
 
E
P
 
I
S
 
D
R
 
G
V
 
V
A
 
G
H
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
E
R
 
R
-
 
F
P
 
K
G
 
D
P
 
A
A
 
A
R
 
L
V
 
V
T
 
C
E
 
D
A
 
D
L
 
T
M
 
L
T
 
R
E
 
E
L
 
I
T
 
E
A
 
R
L
 
L
T
 
A
P
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
G
 
P
P
 
V
A
 
N
L
 
A
R
 
L
L
 
G
I
 
I
D
 
R
A
 
L
A
 
F
R
 
R
H
 
Q
R
 
L
W
 
L
P
 
P
G
 
A
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
A
W
 
F
H
 
H
A
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
E
A
 
A
R
 
W
R
 
L
L
 
Y
P
 
P
V
 
L
P
 
P
A
 
W
S
 
R
L
 
Y
H
 
Y
A
 
A
A
 
E
-
 
L
G
 
G
V
 
I
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
A
 
S
F
 
H
A
 
H
S
 
Y
A
 
V
V
 
S
R
 
S
Q
 
A
L
 
L
S
 
A
-
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
S
Q
 
A
A
 
L
R
 
R
L
 
V
V
 
V
L
 
S
V
 
C
H
 
H
L
 
L
G
|
G
G
x
N
G
|
G
S
 
C
S
 
S
L
 
V
C
 
C
A
 
A
V
 
I
A
 
K
N
 
G
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
N
T
 
T
T
 
S