SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_034410867.1 NCBI__GCF_000482785.1:WP_034410867.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
49% identity, 95% coverage: 12:243/243 of query aligns to 7:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
L
 
L
V
 
E
V
 
V
S
 
Q
G
 
S
L
 
L
T
 
H
A
 
V
A
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
K
 
A
A
 
I
D
 
H
V
 
A
L
 
I
T
 
K
D
 
G
V
 
I
S
 
D
I
 
L
E
 
K
V
 
V
E
 
P
P
 
R
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
V
C
 
T
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
L
R
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
V
P
 
R
P
 
A
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
I
S
 
I
F
 
F
G
 
N
G
 
G
R
 
Q
D
 
D
I
 
I
T
 
T
G
 
N
L
 
K
A
 
P
T
 
A
H
 
H
L
 
V
V
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
A
C
 
L
I
 
V
P
 
P
E
|
E
G
 
G
R
 
R
K
 
R
V
 
I
F
 
F
G
 
P
R
 
E
M
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
M
I
 
M
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
G
 
N
I
 
R
A
 
K
D
 
D
R
 
K
A
 
E
E
 
G
V
 
I
A
 
K
R
 
R
R
 
D
M
 
L
D
 
E
E
 
W
V
 
I
F
 
F
A
 
S
I
 
L
F
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
R
R
 
L
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Q
M
 
M
L
 
L
S
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
S
A
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
M
I
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
L
V
 
V
A
 
S
E
 
E
T
 
V
F
 
F
A
 
E
V
 
V
V
 
I
K
 
Q
R
 
K
I
 
I
N
 
N
E
 
Q
M
 
E
G
 
G
I
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
N
 
N
V
 
A
H
 
L
Q
 
G
T
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
V
A
 
L
R
 
E
G
 
G
S
 
K
T
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
L
K
 
L
E
 
D
D
 
N
P
 
E
E
 
M
V
 
V
K
 
R
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
F
 
L
G
 
G

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
34% identity, 95% coverage: 12:243/243 of query aligns to 3:235/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
V
 
T
V
 
A
S
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
K
 
G
A
 
R
D
 
R
V
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
E
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
A
 
M
I
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
R
R
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
N
V
 
I
S
 
I
F
 
I
G
 
D
G
 
D
R
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
S
G
 
L
L
 
L
A
 
P
T
 
L
H
 
H
L
 
A
V
 
R
N
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
K
 
S
V
 
I
F
 
F
G
x
R
R
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
I
 
M
G
 
A
A
 
V
F
 
L
G
 
Q
I
 
I
A
 
R
D
 
D
R
 
D
A
 
L
E
 
S
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
E
D
 
D
E
 
R
V
 
A
F
 
N
A
 
E
I
 
L
F
 
M
P
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
L
 
I
A
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
S
L
x
M
G
|
G
G
x
Q
T
 
S
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
A
 
R
M
 
R
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
F
 
K
A
 
R
V
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
R
E
 
D
M
 
S
G
 
G
I
 
L
T
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
H
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
S
 
T
T
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
I
K
 
L
E
 
Q
D
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
K
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
G
 
G

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
34% identity, 95% coverage: 12:243/243 of query aligns to 3:235/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
V
 
T
V
 
A
S
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
A
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
K
 
G
A
x
R
D
 
R
V
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
E
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
A
 
M
I
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
R
R
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
N
V
 
I
S
 
I
F
 
I
G
 
D
G
 
D
R
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
S
G
 
L
L
 
L
A
 
P
T
 
L
H
 
H
L
 
A
V
 
R
N
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
I
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
K
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
R
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
I
 
M
G
 
A
A
 
V
F
 
L
G
 
Q
I
 
I
A
 
R
D
 
D
R
 
D
A
 
L
E
 
S
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
E
D
 
D
E
 
R
V
 
A
F
 
N
A
 
E
I
 
L
F
 
M
P
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
L
 
I
A
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
Q
T
x
S
M
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
Q
 
R
A
 
R
M
 
R
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
F
 
K
A
 
R
V
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
R
E
 
D
M
 
S
G
 
G
I
 
L
T
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
H
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
S
 
T
T
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
I
K
 
L
E
 
Q
D
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
K
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
G
 
G

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
34% identity, 95% coverage: 12:243/243 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
V
 
T
V
 
A
S
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
A
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
K
 
G
A
 
R
D
 
R
V
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
E
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
A
 
M
I
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
R
R
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
N
V
 
I
S
 
I
F
 
I
G
 
D
G
 
D
R
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
S
G
 
L
L
 
L
A
 
P
T
 
L
H
 
H
L
 
A
V
 
R
N
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
I
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
K
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
R
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
I
 
M
G
 
A
A
 
V
F
 
L
G
 
Q
I
 
I
A
 
R
D
 
D
R
 
D
A
 
L
E
 
S
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
E
D
 
D
E
 
R
V
 
A
F
 
N
A
 
E
I
 
L
F
 
M
P
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
L
 
I
A
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
Q
T
x
S
M
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
R
A
 
R
M
 
R
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
|
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
F
 
K
A
 
R
V
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
R
E
 
D
M
 
S
G
 
G
I
 
L
T
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
x
H
N
 
N
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
H
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
S
 
T
T
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
I
K
 
L
E
 
Q
D
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
K
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
G
 
G

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
34% identity, 97% coverage: 9:243/243 of query aligns to 1:236/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
S
 
S
S
 
A
R
 
T
L
 
L
V
 
T
V
 
A
S
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
A
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
K
 
G
A
x
R
D
 
R
V
|
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
E
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
A
 
M
I
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
R
R
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
N
V
 
I
S
 
I
F
 
I
G
 
D
G
 
D
R
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
S
G
 
L
L
 
L
A
 
P
T
 
L
H
 
H
L
 
A
V
 
R
N
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
K
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
R
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
I
 
M
G
 
A
A
 
V
F
 
L
G
 
Q
I
 
I
A
 
R
D
 
D
R
 
D
A
 
L
E
 
S
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
E
D
 
D
E
 
R
V
 
A
F
 
N
A
 
E
I
 
L
F
 
M
P
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
L
 
I
A
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
Q
T
 
S
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
A
 
R
M
 
R
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
F
 
K
A
 
R
V
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
R
E
 
D
M
 
S
G
 
G
I
 
L
T
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
x
H
N
 
N
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
H
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
S
 
T
T
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
I
K
 
L
E
 
Q
D
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
K
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
34% identity, 95% coverage: 12:242/243 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
V
 
T
V
 
A
S
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
A
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
K
 
G
A
x
R
D
 
R
V
|
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
E
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
A
 
M
I
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
R
R
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
N
V
 
I
S
 
I
F
 
I
G
 
D
G
 
D
R
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
S
G
 
L
L
 
L
A
 
P
T
x
L
H
|
H
L
 
A
V
 
R
N
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
I
 
L
P
|
P
E
x
Q
G
 
E
R
x
A
K
x
S
V
 
I
F
|
F
G
x
R
R
|
R
M
x
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
I
 
M
G
 
A
A
x
V
F
 
L
G
 
Q
I
 
I
A
 
R
D
 
D
R
 
D
A
 
L
E
 
S
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
E
D
 
D
E
 
R
V
 
A
F
 
N
A
 
E
I
 
L
F
 
M
P
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
L
 
I
A
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
S
L
 
M
G
 
G
G
x
Q
T
 
S
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
A
 
R
M
 
R
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
A
R
|
R
G
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
F
 
K
A
 
R
V
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
R
E
 
D
M
 
S
G
 
G
I
 
L
T
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
H
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
S
 
T
T
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
I
K
 
L
E
 
Q
D
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
K
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
34% identity, 95% coverage: 12:242/243 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
V
 
T
V
 
A
S
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
A
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
K
 
G
A
x
R
D
 
R
V
|
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
E
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
A
 
M
I
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
R
R
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
N
V
 
I
S
 
I
F
 
I
G
 
D
G
 
D
R
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
S
G
 
L
L
 
L
A
 
P
T
 
L
H
 
H
L
 
A
V
 
R
N
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
I
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
K
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
R
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
I
 
M
G
 
A
A
 
V
F
 
L
G
 
Q
I
 
I
A
 
R
D
 
D
R
 
D
A
 
L
E
 
S
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
E
D
 
D
E
 
R
V
 
A
F
 
N
A
 
E
I
 
L
F
 
M
P
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
L
 
I
A
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
Q
T
 
S
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
A
 
R
M
 
R
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
F
 
K
A
 
R
V
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
R
E
 
D
M
 
S
G
 
G
I
 
L
T
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
H
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
S
 
T
T
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
I
K
 
L
E
 
Q
D
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
K
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
34% identity, 95% coverage: 12:241/243 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
V
 
T
V
 
A
S
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
A
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
K
 
G
A
x
R
D
 
R
V
|
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
E
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
A
 
M
I
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
R
R
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
N
V
 
I
S
 
I
F
 
I
G
 
D
G
 
D
R
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
S
G
 
L
L
 
L
A
 
P
T
 
L
H
 
H
L
 
A
V
 
R
N
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
K
 
S
V
 
I
F
|
F
G
x
R
R
|
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
I
 
M
G
 
A
A
 
V
F
 
L
G
 
Q
I
 
I
A
 
R
D
 
D
R
 
D
A
 
L
E
 
S
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
E
D
 
D
E
 
R
V
 
A
F
 
N
A
 
E
I
 
L
F
 
M
P
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
L
 
I
A
 
E
E
 
H
R
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
Q
T
 
S
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
A
 
R
M
 
R
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
F
 
K
A
 
R
V
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
R
E
 
D
M
 
S
G
 
G
I
 
L
T
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
H
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
G
S
 
T
T
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
I
K
 
L
E
 
Q
D
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
K
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 95% coverage: 12:243/243 of query aligns to 3:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
L
 
L
V
 
K
V
 
A
S
 
Q
G
 
H
L
 
L
T
 
A
A
 
K
A
 
S
Y
 
Y
G
 
K
K
 
K
A
 
R
D
 
K
V
 
V
L
 
V
T
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
Q
V
 
V
E
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
S
I
 
F
R
 
Y
A
 
M
I
 
I
L
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
V
P
 
A
P
 
R
R
 
D
A
 
E
G
 
G
K
 
T
V
 
I
S
 
T
F
 
I
G
 
D
G
 
D
R
 
N
D
 
D
I
 
I
T
 
S
G
 
I
L
 
L
A
 
P
T
 
M
H
 
H
L
 
S
V
 
R
N
 
S
R
 
R
A
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
K
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
R
 
K
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
L
 
I
R
 
-
I
 
M
G
 
A
A
 
V
F
 
L
G
 
Q
I
 
T
A
 
R
D
 
E
R
 
E
A
 
L
E
 
T
V
 
H
A
x
E
R
 
E
R
 
R
M
 
Q
D
|
D
E
 
K
V
 
L
F
 
E
A
 
D
I
 
L
F
 
L
P
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
L
 
I
A
 
Q
E
 
H
R
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
S
L
 
A
G
 
G
G
 
M
T
 
A
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
A
 
R
M
 
R
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
F
 
K
A
 
K
V
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
R
E
 
D
M
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
D
V
 
V
A
 
C
H
 
E
R
 
K
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
G
S
 
T
T
 
P
A
 
Q
E
 
D
L
 
V
K
 
L
E
 
N
D
 
N
P
 
E
E
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
G
 
G

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 95% coverage: 12:243/243 of query aligns to 5:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
L
 
L
V
 
R
V
 
T
S
 
E
G
 
N
L
 
I
T
 
V
A
 
K
A
 
Y
Y
x
F
G
 
G
K
 
E
A
x
F
D
 
K
V
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
I
 
I
E
 
S
V
 
V
E
 
N
P
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
T
 
T
C
 
L
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
R
 
N
A
 
V
I
 
I
L
 
T
S
 
G
L
 
F
T
 
L
P
 
K
P
 
A
R
 
D
A
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
V
S
 
Y
F
 
F
G
 
E
G
 
N
R
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
T
G
 
N
L
 
K
A
 
E
T
 
P
H
 
A
L
 
E
V
 
L
N
 
Y
R
 
H
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
C
 
R
I
 
T
P
 
F
E
 
Q
G
 
T
R
 
P
K
 
Q
V
 
P
F
 
L
G
 
K
R
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
F
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
K
G
 
W
I
 
I
A
 
P
D
 
K
R
 
E
A
 
E
E
 
E
V
 
M
A
 
V
R
 
E
R
 
K
M
 
A
D
 
F
E
 
K
V
 
I
F
 
L
A
 
E
I
 
-
F
 
F
P
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
H
R
 
L
R
 
Y
A
 
D
Q
 
R
L
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
M
A
 
K
M
 
L
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
T
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
I
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
G
F
 
L
V
 
A
A
 
H
E
 
D
T
 
I
F
 
F
A
 
N
V
 
H
V
 
V
K
 
L
R
 
E
I
 
L
N
 
K
E
 
A
M
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
H
N
 
R
V
 
L
H
 
D
Q
 
I
T
 
V
L
 
L
A
 
N
V
 
Y
A
 
I
H
 
D
R
 
H
G
 
L
Y
 
Y
V
 
V
L
 
M
A
 
F
Q
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
G
-
 
R
S
 
G
T
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
I
K
 
K
E
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
F
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 95% coverage: 12:243/243 of query aligns to 5:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
L
 
L
V
 
R
V
 
T
S
 
E
G
 
N
L
 
I
T
 
V
A
 
K
A
 
Y
Y
x
F
G
 
G
K
 
E
A
x
F
D
 
K
V
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
I
 
I
E
 
S
V
 
V
E
 
C
P
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
T
 
T
C
 
L
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
R
 
N
A
 
V
I
 
I
L
 
T
S
 
G
L
 
F
T
 
L
P
 
K
P
 
A
R
 
D
A
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
V
S
 
Y
F
 
F
G
 
E
G
 
N
R
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
T
G
 
N
L
 
K
A
 
E
T
 
P
H
 
A
L
 
E
V
 
L
N
 
Y
R
 
H
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
C
 
R
I
 
T
P
 
F
E
 
Q
G
 
T
R
 
P
K
 
Q
V
 
P
F
 
L
G
 
K
R
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
F
 
I
G
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
K
-
 
W
I
 
I
A
 
P
D
 
K
R
 
E
A
 
E
E
 
E
V
 
M
A
 
V
R
 
E
R
 
K
M
 
A
D
 
F
E
 
K
V
 
I
F
 
L
A
 
E
I
 
-
F
 
F
P
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
H
R
 
L
R
 
Y
A
 
D
Q
 
R
L
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
E
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
M
A
 
K
M
 
L
L
 
V
S
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
T
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
I
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
G
F
 
L
V
 
A
A
 
H
E
 
D
T
 
I
F
 
F
A
 
N
V
 
H
V
 
V
K
 
L
R
 
E
I
 
L
N
 
K
E
 
A
M
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
H
N
 
R
V
 
L
H
 
D
Q
 
I
T
 
V
L
 
L
A
 
N
V
 
Y
A
 
I
H
 
D
R
 
H
G
 
L
Y
 
Y
V
 
V
L
 
M
A
 
F
Q
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
G
-
 
R
S
 
G
T
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
I
K
 
K
E
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
F
 
I
G
 
G

P55339 ABC-type transporter ATP-binding protein EcsA from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 10:240/243 of query aligns to 2:230/247 of P55339

query
sites
P55339
S
 
S
R
 
L
L
 
L
V
 
S
V
 
V
S
 
K
G
 
D
L
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
G
Y
 
Y
G
 
T
K
 
R
A
 
N
D
 
P
V
 
V
L
 
L
T
 
K
D
 
N
V
 
V
S
 
S
I
 
F
E
 
T
V
 
L
E
 
E
P
 
P
G
 
N
E
 
Q
I
 
I
T
 
V
C
 
G
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
L
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
M
P
 
D
P
 
P
R
 
H
A
 
K
G
 
G
K
 
S
V
 
I
S
 
E
F
 
L
G
 
N
G
 
G
R
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
E
D
 
D
I
 
P
T
 
E
G
 
G
L
 
Y
A
 
-
T
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
-
N
 
-
R
 
R
A
 
S
G
 
Q
I
 
F
A
 
T
C
 
Y
I
 
I
P
 
P
E
 
E
G
 
T
R
 
P
K
 
V
V
 
L
F
 
Y
G
 
E
R
 
E
M
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
M
E
 
E
N
 
H
L
 
L
R
 
E
I
 
L
G
 
T
-
 
A
-
 
M
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
I
 
L
A
 
S
D
 
-
R
 
K
A
 
E
E
 
T
V
 
M
A
 
E
R
 
K
R
 
R
M
 
L
D
 
P
E
 
P
V
 
L
F
 
L
A
 
K
I
 
E
F
 
F
P
 
-
R
 
R
L
 
M
A
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
L
A
 
K
Q
 
W
L
 
F
G
 
P
G
 
A
T
 
H
M
 
F
S
 
S
G
 
K
G
 
G
E
 
M
Q
 
K
A
 
Q
M
 
K
L
 
V
S
 
M
I
 
I
G
 
M
R
 
C
G
 
A
L
 
F
M
 
L
A
 
A
A
 
E
P
 
P
K
 
A
L
 
L
L
 
Y
L
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
L
G
|
G
L
 
L
S
 
D
P
 
P
L
 
L
F
 
A
V
 
I
A
 
N
E
 
-
T
 
-
F
 
-
A
 
A
V
 
L
V
 
L
K
 
E
R
 
R
I
 
M
N
 
N
E
 
E
M
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
G
G
 
G
I
 
A
T
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
M
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
N
 
S
V
 
T
H
 
H
Q
 
-
T
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
T
A
 
A
H
 
E
R
 
R
G
 
Y
-
 
C
-
 
D
-
 
S
-
 
F
Y
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
H
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
V
 
R
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
T
T
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
L
K
 
R
E
 
E
D
 
Q
P
 
F
E
 
G
V
 
M
K
 
K
A
 
D
A
 
A

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
31% identity, 86% coverage: 27:234/243 of query aligns to 20:229/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
L
 
L
T
 
R
D
 
G
V
 
V
S
 
S
I
 
V
E
 
S
V
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
T
 
A
C
 
Y
I
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
S
I
 
L
L
 
Y
S
 
R
L
 
E
T
 
V
P
 
K
P
 
I
R
 
D
A
 
K
G
 
G
K
 
S
V
 
L
S
 
S
F
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
F
D
 
N
I
 
L
T
 
V
G
 
K
L
 
I
A
 
K
T
 
K
H
 
K
L
 
D
V
 
V
N
 
P
-
 
L
-
 
L
R
 
R
A
 
R
G
 
S
I
 
V
A
 
G
C
 
V
I
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
D
R
 
Y
K
 
K
V
 
L
F
 
L
G
 
P
R
 
K
M
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
A
I
 
Y
G
 
A
A
 
M
F
 
E
G
 
V
I
 
I
A
 
G
-
 
E
D
 
N
R
 
R
A
 
R
E
 
N
V
 
I
A
 
K
R
 
R
R
 
R
M
 
V
D
 
M
E
 
E
V
 
V
F
 
L
A
 
D
I
 
L
F
 
V
P
 
G
R
 
-
L
 
L
A
 
K
E
 
H
R
 
K
R
 
V
A
 
R
Q
 
S
L
 
F
G
 
P
G
 
N
T
 
E
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Q
M
 
R
L
 
I
S
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
I
M
 
V
A
 
N
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
P
L
 
D
F
 
N
V
 
S
A
 
W
E
 
E
T
 
I
F
 
M
A
 
N
V
 
L
V
 
L
K
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
L
M
 
Q
G
 
G
I
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
L
L
 
M
V
 
A
E
 
T
Q
 
H
N
 
N
V
 
S
H
 
Q
Q
 
I
T
 
V
L
 
N
A
 
T
V
 
L
A
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
V
Y
 
I
V
 
A
L
 
I
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
R
R
 
D
G
 
E
S
 
S
T
 
K
A
 
G
E
 
E
L
 
Y
K
 
G
E
 
Y
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
31% identity, 86% coverage: 27:234/243 of query aligns to 20:229/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
L
 
L
T
 
R
D
 
G
V
 
V
S
 
S
I
 
V
E
 
S
V
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
T
 
A
C
 
Y
I
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
S
I
 
L
L
 
Y
S
 
R
L
 
E
T
 
V
P
 
K
P
 
I
R
 
D
A
 
K
G
 
G
K
 
S
V
 
L
S
 
S
F
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
F
D
 
N
I
 
L
T
 
V
G
 
K
L
 
I
A
 
K
T
 
K
H
 
K
L
 
D
V
 
V
N
 
P
-
 
L
-
 
L
R
 
R
A
 
R
G
 
S
I
 
V
A
 
G
C
 
V
I
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
D
R
 
Y
K
 
K
V
 
L
F
 
L
G
 
P
R
 
K
M
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
A
I
 
Y
G
 
A
A
 
M
F
 
E
G
 
V
I
 
I
A
 
G
-
 
E
D
 
N
R
 
R
A
 
R
E
 
N
V
 
I
A
 
K
R
 
R
R
 
R
M
 
V
D
 
M
E
 
E
V
 
V
F
 
L
A
 
D
I
 
L
F
 
V
P
 
G
R
 
-
L
 
L
A
 
K
E
 
H
R
 
K
R
 
V
A
 
R
Q
 
S
L
 
F
G
 
P
G
 
N
T
 
E
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Q
M
 
R
L
 
I
S
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
I
M
 
V
A
 
N
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
P
L
 
D
F
 
N
V
 
S
A
 
W
E
 
E
T
 
I
F
 
M
A
 
N
V
 
L
V
 
L
K
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
L
M
 
Q
G
 
G
I
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
L
L
 
M
V
 
A
E
 
T
Q
 
H
N
 
N
V
 
S
H
 
Q
Q
 
I
T
 
V
L
 
N
A
 
T
V
 
L
A
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
V
Y
 
I
V
 
A
L
 
I
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
R
R
 
D
G
 
E
S
 
S
T
 
K
A
 
G
E
 
E
L
 
Y
K
 
G
E
 
Y
D
 
D

Sites not aligning to the query:

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
31% identity, 86% coverage: 27:234/243 of query aligns to 20:229/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
L
 
L
T
 
R
D
 
G
V
 
V
S
 
S
I
 
V
E
 
S
V
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
T
 
A
C
 
Y
I
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
S
I
 
L
L
 
Y
S
 
R
L
 
E
T
 
V
P
 
K
P
 
I
R
 
D
A
 
K
G
 
G
K
 
S
V
 
L
S
 
S
F
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
F
D
 
N
I
 
L
T
 
V
G
 
K
L
 
I
A
 
K
T
 
K
H
 
K
L
 
D
V
 
V
N
 
P
-
 
L
-
 
L
R
 
R
A
 
R
G
 
S
I
 
V
A
 
G
C
 
V
I
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
D
R
 
Y
K
 
K
V
 
L
F
 
L
G
 
P
R
 
K
M
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
A
I
 
Y
G
 
A
A
 
M
F
 
E
G
 
V
I
 
I
A
 
G
-
 
E
D
 
N
R
 
R
A
 
R
E
 
N
V
 
I
A
 
K
R
 
R
R
 
R
M
 
V
D
 
M
E
 
E
V
 
V
F
 
L
A
 
D
I
 
L
F
 
V
P
 
G
R
 
-
L
 
L
A
 
K
E
 
H
R
 
K
R
 
V
A
 
R
Q
 
S
L
 
F
G
 
P
G
 
N
T
 
E
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Q
M
 
R
L
 
I
S
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
I
M
 
V
A
 
N
A
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
A
D
|
D
E
|
E
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
P
L
 
D
F
 
N
V
 
S
A
 
W
E
 
E
T
 
I
F
 
M
A
 
N
V
 
L
V
 
L
K
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
L
M
 
Q
G
 
G
I
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
L
L
 
M
V
 
A
E
 
T
Q
 
H
N
 
N
V
 
S
H
 
Q
Q
 
I
T
 
V
L
 
N
A
 
T
V
 
L
A
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
V
Y
 
I
V
 
A
L
 
I
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
R
R
 
D
G
 
E
S
 
S
T
 
K
A
 
G
E
 
E
L
 
Y
K
 
G
E
 
Y
D
 
D

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
32% identity, 81% coverage: 27:224/243 of query aligns to 18:217/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
L
 
L
T
 
H
D
 
E
V
 
V
S
 
S
I
 
F
E
 
R
V
 
V
E
 
H
P
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
L
C
 
F
I
 
V
L
 
T
G
 
G
A
 
H
N
x
S
G
 
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
L
I
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
M
T
 
E
P
 
R
P
 
P
R
 
T
A
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
L
S
 
L
F
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
D
 
D
I
 
L
T
 
G
G
 
R
L
 
I
A
 
T
T
 
T
H
 
A
L
 
Q
V
 
I
N
 
P
-
 
F
-
 
L
R
 
R
A
 
R
G
 
Q
I
 
I
A
 
G
C
 
V
I
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
N
R
 
H
K
 
Q
V
 
L
F
 
L
G
 
T
R
 
D
M
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
A
E
 
D
N
 
N
-
 
I
-
 
A
L
 
L
R
 
P
I
 
L
G
 
Q
A
 
I
F
 
L
G
 
G
I
 
M
A
 
P
D
 
-
R
 
K
A
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
M
 
V
D
 
A
E
 
S
V
 
A
F
 
L
A
 
E
I
 
R
F
 
V
P
 
-
R
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
K
R
 
G
A
 
E
Q
 
A
L
 
L
G
 
P
G
 
S
T
x
D
M
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
A
 
Q
M
 
R
L
 
V
S
 
G
I
 
I
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
I
M
 
V
A
 
H
A
 
Q
P
 
P
K
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
P
L
 
R
F
 
L
V
 
A
A
 
S
E
 
E
T
 
I
F
 
M
A
 
G
V
 
V
V
 
F
K
 
E
R
 
D
I
 
I
N
 
N
E
 
R
M
 
L
G
 
G
I
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
S
Q
 
H
N
 
D
V
 
L
H
 
A
Q
 
L
T
 
I
L
 
A
A
 
R
V
 
M
A
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
M
Y
 
L
V
 
T
L
 
L
A
 
Q
Q
 
R
G
 
G
R
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 93% coverage: 11:235/243 of query aligns to 3:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
R
 
R
L
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
K
G
 
N
L
 
V
T
 
S
A
 
K
A
 
V
Y
x
F
G
 
K
K
 
K
A
 
G
D
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
I
 
I
E
 
N
V
 
I
E
 
E
P
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
T
 
F
C
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
R
 
R
A
 
I
I
 
I
L
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
P
 
V
P
 
P
R
 
S
A
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
L
S
 
Y
F
 
F
G
 
D
G
 
D
R
 
R
D
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
L
 
L
V
 
V
N
 
A
R
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
K
A
 
L
C
 
I
I
 
V
-
 
P
P
 
P
E
 
E
G
 
D
R
 
R
K
 
K
V
 
I
-
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
F
-
x
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
A
-
 
L
F
 
Y
G
 
P
R
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
F
G
 
P
I
 
L
A
 
T
D
 
N
-
 
M
-
 
K
-
 
M
-
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
R
R
 
K
R
 
R
M
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
A
A
 
K
I
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
H
-
 
V
-
 
L
-
 
N
-
 
H
F
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
E
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
Q
M
 
R
L
 
V
S
 
A
I
 
L
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
V
A
 
K
A
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
F
L
 
S
G
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
A
L
 
R
F
 
M
V
 
R
A
 
D
E
 
S
T
 
A
F
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
E
I
 
V
-
 
Q
N
 
S
E
 
R
M
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
H
N
 
D
V
 
P
H
 
A
Q
 
D
T
 
I
L
 
F
A
 
A
V
 
I
A
 
A
H
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
R
 
K
V
 
L
V
 
V
A
 
Q
R
 
V
G
 
G
S
 
K
T
 
P
A
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
Y
E
 
D
D
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 93% coverage: 11:235/243 of query aligns to 3:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
R
 
R
L
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
K
G
 
N
L
 
V
T
 
S
A
 
K
A
 
V
Y
x
F
G
 
K
K
 
K
A
 
G
D
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
I
 
I
E
 
N
V
 
I
E
 
E
P
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
T
 
F
C
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
R
 
R
A
 
I
I
 
I
L
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
P
 
V
P
 
P
R
 
S
A
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
L
S
 
Y
F
 
F
G
 
D
G
 
D
R
 
R
D
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
L
 
L
V
 
V
N
 
A
R
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
K
A
 
L
C
 
I
I
 
V
-
 
P
P
 
P
E
 
E
G
 
D
R
 
R
K
 
K
V
 
I
-
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
A
-
 
L
F
 
Y
G
 
P
R
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
F
G
 
P
I
 
L
A
 
T
D
 
N
-
 
M
-
 
K
-
 
M
-
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
R
R
 
K
R
 
R
M
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
A
A
 
K
I
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
H
-
 
V
-
 
L
-
 
N
-
 
H
F
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
E
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
Q
M
 
R
L
 
V
S
 
A
I
 
L
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
V
A
 
K
A
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
F
L
 
S
G
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
A
L
 
R
F
 
M
V
 
R
A
 
D
E
 
S
T
 
A
F
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
E
I
 
V
-
 
Q
N
 
S
E
 
R
M
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
H
N
 
D
V
 
P
H
 
A
Q
 
D
T
 
I
L
 
F
A
 
A
V
 
I
A
 
A
H
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
R
 
K
V
 
L
V
 
V
A
 
Q
R
 
V
G
 
G
S
 
K
T
 
P
A
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
Y
E
 
D
D
 
N
P
 
P

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 93% coverage: 11:235/243 of query aligns to 3:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
R
 
R
L
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
K
G
 
N
L
 
V
T
 
S
A
 
K
A
 
V
Y
x
F
G
 
K
K
 
K
A
 
G
D
 
K
V
 
V
-
 
V
-
x
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
I
 
I
E
 
N
V
 
I
E
 
E
P
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
T
 
F
C
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
R
 
R
A
 
I
I
 
I
L
 
A
S
 
G
L
 
L
T
 
D
P
 
V
P
 
P
R
 
S
A
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
L
S
 
Y
F
 
F
G
 
D
G
 
D
R
 
R
D
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
L
 
L
V
 
V
N
 
A
R
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
K
A
 
L
C
 
I
I
 
V
-
 
P
P
 
P
E
 
E
G
 
D
R
 
R
K
 
K
V
 
I
-
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
A
-
 
L
F
 
Y
G
 
P
R
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
F
G
 
P
I
 
L
A
 
T
D
 
N
-
 
M
-
 
K
-
 
M
-
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
R
R
 
K
R
 
R
M
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
A
A
 
K
I
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
H
-
 
V
-
 
L
-
 
N
-
 
H
F
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
E
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
Q
M
 
R
L
 
V
S
 
A
I
 
L
G
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
V
A
 
K
A
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
S
G
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
A
L
 
R
F
 
M
V
 
R
A
 
D
E
 
S
T
 
A
F
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
E
I
 
V
-
 
Q
N
 
S
E
 
R
M
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
H
N
 
D
V
 
P
H
 
A
Q
 
D
T
 
I
L
 
F
A
 
A
V
 
I
A
 
A
H
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
R
 
K
V
 
L
V
 
V
A
 
Q
R
 
V
G
 
G
S
 
K
T
 
P
A
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
Y
E
 
D
D
 
N
P
 
P

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
30% identity, 93% coverage: 11:235/243 of query aligns to 3:232/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
R
 
R
L
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
K
G
 
N
L
 
V
T
 
S
A
 
K
A
 
V
Y
 
F
G
 
K
K
 
K
A
 
G
D
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
I
 
I
E
 
N
V
 
I
E
 
E
P
 
N