SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_034412295.1 NCBI__GCF_000482785.1:WP_034412295.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
67% identity, 98% coverage: 6:265/265 of query aligns to 1:255/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
S
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
Q
C
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
|
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
A
K
 
K
E
 
D
T
 
A
A
 
V
E
 
A
K
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
V
 
K
R
 
T
V
 
P
E
 
G
Y
 
Y
S
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
x
L
S
 
S
K
 
D
P
 
E
A
 
A
E
 
Q
V
 
I
A
 
A
A
 
D
M
 
M
V
 
M
K
 
R
F
 
Y
A
 
A
Q
 
E
D
 
S
T
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
V
A
 
S
P
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
T
F
 
F
P
 
P
D
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
S
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
T
I
 
T
K
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
K
 
R
A
 
A
K
 
R
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
|
A
S
 
S
A
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
K
Q
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
G
 
E
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
W
V
|
V
L
 
L
T
|
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
K
R
 
R
A
 
I
A
 
A
N
 
-
E
 
E
G
 
G
K
 
A
T
 
E
I
 
P
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
R
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
R
E
 
E
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
W
N
 
N
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
68% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 2:260/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
T
C
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
V
R
 
R
K
 
A
E
 
G
T
 
L
A
 
A
E
 
A
K
 
Q
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
L
Y
 
Y
S
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
x
L
S
 
S
K
 
K
P
 
G
A
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
G
M
 
L
V
 
V
K
 
D
F
 
N
A
 
A
Q
 
V
D
 
R
T
 
Q
L
 
M
G
 
G
S
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
H
V
 
T
A
 
A
P
 
L
V
 
I
E
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
D
 
T
E
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
L
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
S
 
A
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
Q
N
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
|
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
Q
 
G
T
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
 
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
D
 
S
A
 
A
R
x
L
A
 
A
A
 
E
N
 
K
E
 
N
G
 
G
K
 
V
T
 
D
I
 
Q
E
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
Y
 
V
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
V
 
T
A
 
A
Q
 
R

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
68% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 2:260/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
T
C
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
V
R
 
R
K
 
A
E
 
G
T
 
L
A
 
A
E
 
A
K
 
Q
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
L
Y
 
Y
S
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
S
 
S
K
 
K
P
 
G
A
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
G
M
 
L
V
 
V
K
 
D
F
 
N
A
 
A
Q
 
V
D
 
R
T
 
Q
L
 
M
G
 
G
S
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
T
A
 
A
P
 
L
V
 
I
E
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
D
 
T
E
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
S
 
A
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
Q
N
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
Q
 
G
T
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
L
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
D
 
S
A
 
A
R
x
L
A
 
A
A
 
E
N
 
K
E
 
N
G
 
G
K
 
V
T
 
D
I
 
Q
E
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
Y
 
V
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
V
 
T
A
 
A
Q
 
R

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
66% identity, 98% coverage: 6:265/265 of query aligns to 1:255/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
S
 
T
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
Q
C
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
L
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
P
I
 
A
E
 
L
A
 
A
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
E
T
 
I
A
 
A
E
 
-
K
 
R
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
E
 
V
Y
 
H
S
 
H
G
 
P
A
 
A
D
|
D
I
x
L
S
 
S
K
 
D
P
 
V
A
 
A
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
F
K
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
D
 
R
T
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
F
 
F
P
 
P
D
 
L
E
 
E
K
 
S
W
 
W
D
 
D
A
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
A
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
K
 
R
A
 
A
K
 
R
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
A
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
G
S
 
S
A
 
T
Q
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
Q
 
T
T
 
S
G
 
N
I
 
V
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
L
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
D
R
|
R
A
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
G
G
 
G
K
 
D
T
 
P
I
 
L
E
 
-
Q
 
Q
A
 
A
K
 
Q
R
 
H
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
S
Q
 
Q
I
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
A
A
 
A
Y
 
W
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
64% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 2:260/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
H
 
T
C
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
A
 
P
A
 
E
A
 
D
I
 
I
E
 
E
A
 
R
L
 
E
R
 
R
K
 
S
E
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
S
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
E
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
I
x
L
S
 
S
K
 
D
P
 
A
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
R
A
 
D
M
 
F
V
 
I
K
 
A
F
 
K
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
H
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
S
 
A
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
A
 
K
K
 
Q
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
V
Q
 
N
K
|
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
G
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
D
 
E
A
 
A
R
x
I
A
 
S
A
 
Q
N
 
Q
E
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
K
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
I
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
Y
 
L
N
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
V
 
T
A
 
A
Q
 
R

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
64% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 2:260/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
H
 
T
C
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
A
 
P
A
 
E
A
 
D
I
 
I
E
 
E
A
 
R
L
 
E
R
 
R
K
 
S
E
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
S
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
E
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
G
 
N
A
|
A
D
|
D
I
x
L
S
 
S
K
 
D
P
 
A
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
R
A
 
D
M
 
F
V
 
I
K
 
A
F
 
K
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
H
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
S
 
A
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
A
 
K
K
 
Q
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
V
Q
 
N
K
|
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
G
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
D
 
E
A
 
A
R
x
I
A
 
S
A
 
Q
N
 
Q
E
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
K
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
I
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
Y
 
L
N
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
V
 
T
A
 
A
Q
 
R

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
64% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 2:260/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
H
 
T
C
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
A
 
P
A
 
E
A
 
D
I
 
I
E
 
E
A
 
R
L
 
E
R
 
R
K
 
S
E
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
S
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
E
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
I
x
L
S
 
S
K
 
D
P
 
A
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
R
A
 
D
M
 
F
V
 
I
K
 
A
F
 
K
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
H
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
S
 
A
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
A
 
K
K
 
Q
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
V
Q
 
N
K
|
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
G
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
D
 
E
A
 
A
R
x
I
A
 
S
A
 
Q
N
 
Q
E
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
K
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
I
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
Y
 
L
N
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
V
 
T
A
 
A
Q
 
R

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
64% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 2:260/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
H
 
T
C
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
A
 
P
A
 
E
A
 
D
I
 
I
E
 
E
A
 
R
L
 
E
R
 
R
K
 
S
E
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
S
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
E
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
I
x
L
S
 
S
K
 
D
P
 
A
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
R
A
 
D
M
 
F
V
 
I
K
 
A
F
 
K
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
H
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
S
 
A
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
A
 
K
K
 
Q
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
V
Q
 
N
K
|
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
G
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
D
 
E
A
 
A
R
x
I
A
 
S
A
 
Q
N
 
Q
E
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
K
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
I
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
Y
 
L
N
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
V
 
T
A
 
A
Q
 
R

1x1tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas fragi complexed with NAD+ (see paper)
64% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 2:236/236 of 1x1tA

query
sites
1x1tA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
T
C
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
|
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
L
 
V
R
 
R
K
 
A
E
 
G
T
 
L
A
 
A
E
 
A
K
 
Q
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
L
Y
 
Y
S
 
D
G
 
G
A
 
A
D
|
D
I
x
L
S
 
S
K
 
K
P
 
G
A
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
G
M
 
L
V
 
V
K
 
D
F
 
N
A
 
A
Q
 
V
D
 
R
T
 
Q
L
 
M
G
 
G
S
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
T
A
 
A
P
 
L
V
 
I
E
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
D
 
T
E
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
L
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
S
 
A
N
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
Q
N
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
Q
 
G
T
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
V
|
V
L
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
Q
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
R
D
x
T
L
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
Y
 
V
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
V
 
T
A
 
A
Q
 
R

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
42% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 5:261/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
L
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
K
C
 
K
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
I
E
 
S
A
x
D
L
x
M
R
 
N
K
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
C
E
 
Q
K
 
E
Y
 
T
G
 
A
V
 
N
R
 
S
V
 
L
E
 
K
Y
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
F
D
 
D
-
 
A
I
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
P
A
 
C
E
x
D
V
|
V
A
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
Y
-
 
K
A
 
Q
M
 
A
V
 
I
K
 
E
F
 
L
A
 
T
Q
 
Q
D
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
T
E
 
A
K
 
V
W
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
S
 
T
S
 
G
N
 
A
F
 
F
H
 
I
A
 
G
I
 
I
K
 
K
A
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
N
 
K
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
A
 
I
H
x
N
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
F
A
 
A
Q
 
G
K
|
K
S
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
N
T
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
C
A
 
A
Q
 
R
T
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
V
|
V
L
 
D
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
 
V
Q
 
R
K
 
G
Q
|
Q
I
 
I
D
 
A
A
 
D
R
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
T
E
 
R
G
 
N
K
 
V
T
 
S
I
 
L
E
 
D
Q
 
S
A
 
A
K
 
L
R
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
I
G
 
L
E
 
A
K
 
M
Q
 
V
P
 
P
S
 
Q
L
 
K
E
 
R
F
 
L
V
 
L
T
 
S
P
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
G
 
A
G
 
D
L
 
Y
A
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
Q
 
G
I
 
V
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
Y
 
V
N
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
V
 
T
A
 
A
Q
 
Q

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
42% identity, 98% coverage: 7:265/265 of query aligns to 4:260/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
L
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
K
C
 
K
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
I
E
 
S
A
x
D
L
x
M
R
 
N
K
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
C
E
 
Q
K
 
E
Y
 
T
G
 
A
V
 
N
R
 
S
V
 
L
E
 
K
Y
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
F
D
 
D
-
 
A
I
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
P
A
 
C
E
x
D
V
|
V
A
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
Y
-
 
K
A
 
Q
M
 
A
V
 
I
K
 
E
F
 
L
A
 
T
Q
 
Q
D
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
T
E
 
A
K
 
V
W
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
S
 
T
S
 
G
N
 
A
F
 
F
H
 
I
A
 
G
I
 
I
K
 
K
A
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
N
 
K
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
A
 
I
H
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
F
A
 
A
Q
 
G
K
|
K
S
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
N
T
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
C
A
 
A
Q
 
R
T
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
x
Y
V
|
V
L
 
D
T
|
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
K
 
G
Q
|
Q
I
 
I
D
 
A
A
 
D
R
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
T
E
 
R
G
 
N
K
 
V
T
 
S
I
 
L
E
 
D
Q
 
S
A
 
A
K
 
L
R
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
I
G
 
L
E
 
A
K
 
M
Q
 
V
P
 
P
S
 
Q
L
 
K
E
 
R
F
 
L
V
 
L
T
 
S
P
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
G
 
A
G
 
D
L
 
Y
A
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
Q
 
G
I
 
V
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
Y
 
V
N
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
V
 
T
A
 
A
Q
 
Q

9febA Short-chain dehydrogenase/reductase (sdr) from thermus caliditerrae in complex with NADP
41% identity, 97% coverage: 6:261/265 of query aligns to 5:256/261 of 9febA

query
sites
9febA
S
 
S
L
 
L
K
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
H
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
E
C
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
R
L
 
L
V
 
T
L
 
L
N
 
V
G
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
A
x
R
A
x
K
I
 
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
R
 
-
K
 
E
E
 
E
T
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
R
Y
 
L
G
 
R
V
 
A
R
 
W
V
 
T
E
 
E
Y
 
V
S
 
Q
G
 
G
-
 
E
-
 
V
A
 
G
D
|
D
I
 
V
S
 
A
K
 
D
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
M
A
 
E
A
 
S
M
 
L
V
 
V
K
 
H
F
 
R
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
T
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
P
L
 
V
D
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
 
F
Q
x
V
Y
 
L
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
F
E
 
L
E
 
E
F
 
I
P
 
N
D
 
E
E
 
E
K
 
L
W
 
W
D
 
Q
A
 
R
I
 
H
I
 
I
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
G
S
 
A
N
 
A
F
 
Y
H
 
R
A
 
L
I
 
I
K
 
R
A
 
L
A
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
K
 
L
A
 
E
K
 
M
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
 
S
A
 
T
H
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
G
S
 
Y
A
 
P
Q
 
Y
K
 
A
S
 
V
A
 
P
Y
 
Y
V
 
C
T
 
A
A
 
A
K
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
R
V
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
T
L
 
D
T
 
T
P
 
D
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
S
I
 
V
D
 
-
A
 
L
R
 
R
A
 
V
A
 
A
N
 
Q
E
 
R
G
 
T
K
 
A
T
 
R
I
 
A
E
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
V
R
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
F
G
 
A
E
 
R
K
 
R
Q
 
N
P
 
P
S
 
Q
L
 
G
E
 
R
F
 
L
V
 
V
T
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
G
 
W
L
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
W
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
I
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
Y
 
I
N
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
G
G
 
G

9fe6B Short-chain dehydrogenase/reductase (sdr) from thermus caliditerrae
41% identity, 97% coverage: 6:261/265 of query aligns to 5:256/261 of 9fe6B

query
sites
9fe6B
S
 
S
L
 
L
K
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
H
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
E
C
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
R
L
 
L
V
 
T
L
 
L
N
 
V
G
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
A
 
R
A
 
K
I
x
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
R
 
-
K
 
E
E
 
E
T
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
R
Y
 
L
G
x
R
V
 
A
R
 
W
V
 
T
E
 
E
Y
x
V
S
 
Q
G
|
G
-
 
E
-
 
V
A
 
G
D
 
D
I
 
V
S
 
A
K
 
D
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
M
A
 
E
A
 
S
M
 
L
V
 
V
K
 
H
F
 
R
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
T
x
R
L
 
F
G
 
G
S
 
P
L
 
V
D
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
F
Q
 
V
Y
 
L
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
F
E
 
L
E
 
E
F
 
I
P
 
N
D
 
E
E
 
E
K
 
L
W
 
W
D
 
Q
A
 
R
I
 
H
I
 
I
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
G
S
 
A
N
 
A
F
 
Y
H
 
R
A
 
L
I
 
I
K
 
R
A
 
L
A
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
K
 
L
A
 
E
K
 
M
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
 
S
A
 
T
H
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
G
S
 
Y
A
 
P
Q
 
Y
K
 
A
S
 
V
A
 
P
Y
 
Y
V
 
C
T
 
A
A
 
A
K
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
R
V
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
T
L
 
D
T
 
T
P
 
D
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
S
I
 
V
D
 
-
A
 
L
R
 
R
A
 
V
A
 
A
N
 
Q
E
 
R
G
 
T
K
 
A
T
 
R
I
 
A
E
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
V
R
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
F
G
 
A
E
 
R
K
 
R
Q
 
N
P
 
P
S
 
Q
L
 
G
E
 
R
F
 
L
V
 
V
T
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
G
 
W
L
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
W
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
I
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
Y
 
I
N
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:264/265 of query aligns to 3:247/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
K
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
H
C
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
V
V
 
I
L
 
V
N
 
S
G
x
D
F
x
I
G
 
N
D
 
E
A
 
D
A
 
H
A
 
G
I
 
N
E
 
K
A
 
A
L
 
V
R
 
E
K
 
D
E
 
I
T
 
K
A
 
A
E
 
Q
K
 
-
Y
 
-
G
 
G
V
 
G
R
 
E
V
 
A
E
 
S
Y
 
F
S
 
V
G
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
T
S
 
S
K
 
N
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
V
K
 
K
F
 
R
A
 
T
Q
 
V
D
 
E
T
 
I
L
 
Y
G
 
G
S
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
Y
 
A
V
 
L
A
 
A
P
 
G
V
 
-
E
 
-
E
 
D
F
 
Y
P
 
G
D
 
L
E
 
D
K
 
S
W
 
W
D
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
L
A
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
D
S
 
G
N
 
V
F
 
F
H
 
Y
A
 
G
I
 
C
K
 
K
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
Q
M
 
M
K
 
E
A
 
K
K
 
N
N
 
G
W
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
A
 
I
H
 
H
G
 
G
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
P
Q
 
L
K
 
S
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
T
T
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
N
V
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
N
 
Y
A
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
W
x
Y
V
x
I
L
 
E
T
 
T
P
 
P
L
|
L
V
 
L
Q
 
E
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
S
I
 
L
E
 
T
Q
 
K
A
 
E
K
 
M
R
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
I
E
 
S
K
 
K
Q
 
H
P
 
P
S
 
M
L
 
G
E
 
R
F
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
G
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
S
A
 
S
Q
 
F
I
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
G
A
 
Y
Y
 
Y
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
V
 
T
A
 
A

8y83A Crystal structure of a ketoreductase from sphingobacterium siyangense sy1 with co-enzyme
38% identity, 97% coverage: 7:264/265 of query aligns to 4:248/249 of 8y83A

query
sites
8y83A
L
 
L
K
 
A
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
L
C
 
A
L
 
Y
A
 
G
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
S
G
x
D
F
x
I
G
 
N
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
G
I
 
N
E
 
E
A
 
T
L
 
V
R
 
K
K
 
Q
E
 
-
T
 
-
A
 
I
E
 
E
K
 
S
Y
 
L
G
 
G
V
 
G
R
 
E
V
 
A
E
 
V
Y
 
F
S
 
F
G
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
S
S
 
S
K
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
D
V
 
N
A
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
V
K
 
G
F
 
Y
A
 
A
Q
 
V
D
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
G
Y
 
G
V
 
E
A
 
A
P
 
A
V
 
L
E
 
T
-
 
G
E
 
D
F
 
Y
P
 
S
D
 
L
E
 
D
K
 
G
W
 
W
D
 
K
A
 
K
I
 
V
I
 
I
A
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
F
S
 
N
S
 
G
N
 
V
F
 
F
H
 
Y
A
 
G
I
 
C
K
 
K
A
 
Y
A
 
Q
L
 
I
P
 
E
A
 
A
M
 
M
K
 
E
A
 
R
K
 
N
N
 
G
W
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
 
S
A
 
I
H
 
H
G
 
G
L
 
T
V
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
P
Q
 
M
K
 
S
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
T
T
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
N
V
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
N
 
Y
A
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
|
G
W
x
Y
V
x
I
L
 
D
T
 
T
P
 
P
L
|
L
V
 
L
Q
 
A
K
 
K
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
I
 
L
E
 
D
Q
 
K
A
 
E
K
 
H
R
 
I
D
 
N
L
 
A
L
 
L
G
 
I
E
 
S
K
 
K
Q
 
H
P
 
P
S
 
I
L
 
G
E
 
R
F
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
G
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
D
A
 
K
A
 
S
A
 
S
Q
 
F
I
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
G
A
 
Y
Y
 
Y
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
V
 
T
A
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
38% identity, 97% coverage: 6:263/265 of query aligns to 2:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
S
 
T
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
I
C
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
L
 
I
V
 
F
L
 
F
N
|
N
G
x
Y
F
x
N
G
|
G
D
x
S
A
 
P
A
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
T
R
 
A
K
 
K
E
 
L
T
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
-
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
V
E
 
E
Y
 
A
S
 
M
G
 
K
A
 
A
D
x
N
I
x
V
S
 
A
K
 
I
P
 
A
A
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
D
A
 
A
M
 
F
V
 
F
K
 
K
F
 
Q
A
 
A
Q
 
I
D
 
E
T
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
Q
 
T
Y
 
R
V
 
D
A
 
N
P
 
L
V
 
L
E
 
M
E
 
R
F
 
M
P
 
K
D
 
E
E
 
D
K
 
E
W
 
W
D
 
D
A
 
D
I
 
V
I
 
I
A
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
S
 
K
S
 
G
N
 
T
F
 
F
H
 
L
A
 
C
I
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
S
P
 
R
A
 
T
M
 
M
K
 
M
A
 
K
K
 
Q
N
 
R
W
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
A
 
V
H
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
N
A
 
A
Q
 
G
K
x
Q
S
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
T
V
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
L
A
 
A
Q
 
P
T
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
F
V
x
I
L
 
T
T
|
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
Q
 
D
K
 
K
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
I
 
L
E
 
D
Q
 
E
A
 
K
K
 
T
R
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
M
G
 
L
E
 
A
K
 
Q
Q
 
I
P
 
P
S
 
L
L
 
G
E
 
A
F
 
Y
V
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
G
 
A
G
 
N
L
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
S
A
 
K
Q
 
Y
I
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
Y
 
L
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
V
 
V

6zzpA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:262/265 of query aligns to 4:262/265 of 6zzpA

query
sites
6zzpA
L
 
L
N
 
Q
T
 
Q
S
 
D
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
E
C
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
A
 
V
A
 
G
I
 
I
E
 
A
A
x
D
L
x
I
R
 
N
K
 
L
E
 
E
T
 
A
A
 
A
E
 
Q
K
 
K
Y
 
T
G
 
V
V
 
D
R
 
A
V
 
I
E
 
E
Y
 
A
S
 
A
G
 
G
A
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
x
M
D
|
D
I
x
V
S
 
T
K
 
S
P
 
E
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
N
A
 
D
M
 
G
V
 
V
K
 
Q
F
 
R
A
 
L
Q
 
V
D
 
D
T
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
I
V
 
I
A
 
D
P
 
P
V
 
I
E
 
H
E
 
K
F
 
M
P
 
A
D
 
F
E
 
E
K
 
D
W
 
W
D
 
K
A
 
K
I
 
M
I
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
H
L
 
L
S
 
D
S
 
G
N
 
A
F
 
F
H
 
L
A
 
T
I
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
A
 
H
M
 
M
-
 
Y
K
 
K
A
 
D
K
 
D
N
 
K
W
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
Y
I
x
M
A
 
G
S
|
S
A
 
V
H
|
H
G
 
S
L
 
H
V
 
E
A
 
A
S
 
S
A
 
L
Q
 
F
K
|
K
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
C
K
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
G
A
 
A
Q
 
V
T
 
H
G
 
N
I
 
V
T
 
R
C
 
S
N
 
H
A
 
V
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
x
F
V
|
V
L
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
D
 
P
A
 
Q
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
N
 
E
E
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
S
I
 
E
E
 
E
Q
 
S
A
 
V
K
 
V
R
 
N
D
 
D
L
 
I
L
 
M
G
 
L
E
 
V
K
 
N
Q
 
T
P
 
V
S
 
D
L
 
K
E
 
E
F
 
F
V
 
T
T
 
T
P
 
V
E
 
D
Q
 
D
L
 
I
G
 
A
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
A
D
 
F
A
 
P
A
 
T
A
 
N
Q
 
V
I
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
S
Y
 
I
N
 
V
V
 
A
D
 
S
G
 
H
G
 
G
W
 
W

6zzoC Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:262/265 of query aligns to 4:262/265 of 6zzoC

query
sites
6zzoC
L
 
L
N
 
Q
T
 
Q
S
 
D
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
E
C
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
A
 
V
A
 
G
I
 
I
E
 
A
A
x
D
L
x
I
R
 
N
K
 
L
E
 
E
T
 
A
A
 
A
E
 
Q
K
 
K
Y
 
T
G
 
V
V
 
D
R
 
A
V
 
I
E
 
E
Y
 
A
S
 
A
G
 
G
A
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
x
M
D
|
D
I
x
V
S
 
T
K
 
S
P
 
E
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
N
A
 
D
M
 
G
V
 
V
K
 
Q
F
 
R
A
 
L
Q
 
V
D
 
D
T
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
I
V
 
I
A
 
D
P
 
P
V
 
I
E
 
H
E
 
K
F
 
M
P
 
A
D
 
F
E
 
E
K
 
D
W
 
W
D
 
K
A
 
K
I
 
M
I
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
H
L
 
L
S
 
D
S
 
G
N
 
A
F
 
F
H
 
L
A
 
T
I
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
A
 
H
M
 
M
-
 
Y
K
 
K
A
 
D
K
 
D
N
 
K
W
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
Y
I
x
M
A
 
G
S
 
S
A
 
V
H
|
H
G
 
S
L
 
H
V
 
E
A
 
A
S
 
S
A
 
L
Q
 
F
K
|
K
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
C
K
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
G
A
 
A
Q
 
V
T
 
H
G
 
N
I
 
V
T
 
R
C
 
S
N
 
H
A
 
V
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
x
F
V
|
V
L
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
D
 
P
A
 
Q
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
N
 
E
E
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
S
I
 
E
E
 
E
Q
 
S
A
 
V
K
 
V
R
 
N
D
 
D
L
 
I
L
 
M
G
 
L
E
 
V
K
 
N
Q
 
T
P
 
V
S
 
D
L
 
K
E
 
E
F
 
F
V
 
T
T
 
T
P
 
V
E
 
D
Q
 
D
L
 
I
G
 
A
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
A
D
 
F
A
 
P
A
 
T
A
 
N
Q
 
V
I
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
S
Y
 
I
N
 
V
V
 
A
D
 
S
G
 
H
G
 
G
W
 
W

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
36% identity, 98% coverage: 6:265/265 of query aligns to 4:255/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
S
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
G
 
A
I
 
A
A
 
V
H
 
Q
C
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
D
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
V
N
 
A
G
x
D
F
x
I
G
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
A
 
G
I
 
E
E
 
A
A
 
M
L
 
V
R
 
R
K
 
K
E
 
E
T
 
N
A
 
N
E
 
D
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
R
V
 
L
E
 
H
Y
 
F
S
 
V
G
 
Q
A
x
T
D
 
D
I
|
I
S
 
T
K
 
D
P
 
E
A
 
A
E
 
A
V
 
C
A
 
Q
A
 
H
M
 
A
V
 
V
K
 
E
F
 
S
A
 
A
Q
 
V
D
 
H
T
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
E
Y
 
I
V
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
H
E
 
E
F
 
M
P
 
E
D
 
L
E
 
S
K
 
D
W
 
W
D
 
N
A
 
K
I
 
V
I
 
L
A
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
G
N
 
M
F
 
F
H
 
L
A
 
M
I
 
S
K
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
K
A
 
H
M
 
M
K
 
L
A
 
A
K
 
A
N
 
G
W
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
A
 
V
H
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
W
A
 
P
Q
 
D
K
 
I
S
 
P
A
 
A
Y
|
Y
V
 
N
T
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
S
V
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
N
 
Y
A
 
A
Q
 
K
T
 
H
G
 
Q
I
 
I
T
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
I
V
x
I
L
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
N
Q
 
E
K
 
K
Q
 
S
I
 
F
D
 
-
A
 
-
R
 
L
A
 
E
A
 
N
N
 
N
E
 
E
G
 
G
K
 
-
T
 
T
I
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
E
L
 
-
L
 
K
G
 
A
E
 
K
K
 
V
Q
 
N
P
 
P
S
 
L
L
 
L
E
 
R
F
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
G
 
A
G
 
N
L
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
A
 
S
A
 
S
Q
 
Y
I
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
A
Y
 
I
N
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
V
 
T
A
 
A
Q
 
Q

3sjuA Hedamycin polyketide ketoreductase bound to NADPH (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:261/265 of query aligns to 1:251/255 of 3sjuA

query
sites
3sjuA
K
 
Q
V
 
T
A
 
A
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
V
T
 
S
S
|
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
R
C
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
I
D
 
-
L
 
A
V
 
V
L
 
Y
N
 
G
G
 
C
F
x
A
G
x
R
D
|
D
A
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
S
A
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
D
A
 
G
L
 
L
R
 
R
K
 
A
E
 
A
T
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
Y
 
-
G
 
G
V
 
H
R
 
D
V
 
V
E
 
D
Y
 
G
S
 
S
G
 
S
A
x
C
D
|
D
I
x
V
S
 
T
K
 
S
P
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
H
A
 
A
M
 
A
V
 
V
K
 
A
F
 
A
A
 
A
Q
 
V
D
 
E
T
 
R
L
 
F
G
 
G
S
 
P
L
 
I
D
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
|
G
I
 
R
Q
 
N
Y
 
G
V
 
G
A
 
G
P
 
E
V
 
T
E
 
A
E
 
D
F
 
L
P
 
D
D
 
D
E
 
A
K
 
L
W
 
W
D
 
A
A
 
D
I
 
V
I
 
L
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
G
N
 
V
F
 
F
H
 
R
A
 
V
I
 
T
K
 
R
A
 
E
A
 
V
L
 
L
P
 
R
A
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
M
K
 
R
A
 
E
K
 
A
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
A
 
T
H
 
G
G
 
G
L
 
K
V
 
Q
A
 
G
S
 
V
A
 
M
Q
 
Y
K
 
A
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
T
T
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
F
E
 
E
N
 
L
A
 
A
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
Y
V
|
V
L
 
E
T
|
T
P
 
P
L
x
M
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
Q
 
V
I
 
R
D
 
E
A
 
G
R
x
Y
A
 
A
A
 
R
N
 
H
E
 
W
G
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
-
E
 
E
Q
 
Q
A
 
E
K
 
V
R
 
H
D
 
E
L
 
R
L
 
F
G
 
N
E
 
A
K
 
K
Q
 
I
P
 
P
S
 
L
L
 
G
E
 
R
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
V
V
 
G
F
 
Y
L
 
L
C
 
V
S
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
I
 
I
R
 
T
G
 
A
V
 
Q
A
 
A
Y
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_034412295.1 NCBI__GCF_000482785.1:WP_034412295.1
MALNTSLKGKVALVTGSTSGIGLGIAHCLAAEGADLVLNGFGDAAAIEALRKETAEKYGV
RVEYSGADISKPAEVAAMVKFAQDTLGSLDILVNNAGIQYVAPVEEFPDEKWDAIIAINL
SSNFHAIKAALPAMKAKNWGRIINIASAHGLVASAQKSAYVTAKHGVVGLTKVVALENAQ
TGITCNAICPGWVLTPLVQKQIDARAANEGKTIEQAKRDLLGEKQPSLEFVTPEQLGGLA
VFLCSDAAAQIRGVAYNVDGGWVAQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory