SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_035218082.1 NCBI__GCF_000429905.1:WP_035218082.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
42% identity, 97% coverage: 7:257/258 of query aligns to 1:251/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
L
T
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
S
x
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
V
 
F
A
 
G
F
 
I
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
N
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
S
R
|
R
R
 
N
T
 
L
D
 
E
R
 
E
L
 
A
K
 
S
D
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
Q
N
 
K
L
 
L
-
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
Y
G
 
G
V
 
V
G
 
E
A
 
T
E
 
M
P
 
A
V
 
F
T
 
R
C
|
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
L
 
N
E
 
Y
N
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
K
N
 
K
M
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
A
T
 
V
T
 
K
D
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
N
I
 
R
P
 
R
H
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
E
T
 
E
E
 
F
P
 
P
Y
 
L
E
 
D
S
 
E
F
 
F
K
 
R
M
 
Q
V
 
V
M
 
I
D
 
E
I
x
V
N
 
N
V
 
L
N
 
F
A
 
G
Q
 
T
F
 
Y
L
 
Y
C
 
V
S
 
C
Q
 
R
R
 
E
C
 
A
G
 
F
R
 
S
I
 
L
M
 
L
L
 
R
E
 
E
A
 
S
R
 
D
S
 
N
G
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
M
 
L
L
 
T
G
 
-
L
 
-
V
 
V
G
 
E
L
 
E
G
 
V
S
 
T
I
 
M
P
 
P
Q
 
N
A
x
I
S
 
S
-
 
A
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
A
N
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
W
 
W
S
 
G
K
 
R
R
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
W
F
x
Y
P
 
R
S
x
T
E
 
K
M
|
M
T
|
T
T
 
E
D
 
A
M
 
V
F
 
F
G
 
S
D
 
D
E
 
P
R
 
E
S
 
K
E
 
L
A
 
D
F
 
Y
M
 
M
E
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
I
L
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
G
 
T
G
 
G
R
 
V
T
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
E
G
 
A
S
 
K
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
I
 
I
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
T
A
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
40% identity, 95% coverage: 10:254/258 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
S
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
R
A
 
D
F
 
I
A
 
A
Q
 
I
G
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
F
L
 
F
A
x
N
A
x
Y
R
x
N
R
x
G
T
x
S
D
 
P
R
 
E
L
 
A
K
 
A
D
 
E
L
 
E
A
 
T
A
 
A
N
 
K
L
 
L
-
 
V
E
 
A
K
 
E
T
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
E
A
 
V
E
 
E
P
 
A
V
 
M
T
 
K
C
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
L
 
I
E
 
A
N
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
N
 
A
M
 
F
V
 
F
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
T
 
I
D
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
A
 
T
I
 
R
P
 
D
H
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
T
 
R
E
 
M
P
 
K
Y
 
E
E
 
D
S
 
E
F
 
W
K
 
D
M
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
I
|
I
N
 
N
V
 
L
N
 
K
A
 
G
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
T
Q
 
K
R
 
A
C
 
V
G
 
S
R
 
R
I
 
T
M
 
M
L
 
M
E
 
K
A
 
Q
R
 
R
S
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
M
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
-
G
 
-
S
 
N
I
 
A
P
 
G
Q
|
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
N
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
W
 
L
S
 
A
K
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
F
F
x
I
P
 
T
S
x
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
T
 
D
D
 
K
M
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
D
E
 
E
R
 
K
S
 
T
E
 
K
A
 
E
F
 
A
M
 
M
E
 
L
K
 
A
R
 
Q
S
 
I
L
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
G
 
Y
G
 
G
R
 
T
T
 
T
E
 
E
E
 
D
L
 
I
I
 
A
G
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
S
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
41% identity, 97% coverage: 8:257/258 of query aligns to 3:248/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
F
 
F
D
 
S
L
 
L
T
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
H
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
H
V
 
V
V
 
-
L
 
L
A
 
A
A
 
W
R
 
G
R
|
R
T
 
T
D
 
D
R
 
G
L
 
V
K
 
K
D
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
D
N
 
E
L
 
I
E
 
A
K
 
D
T
 
G
G
 
G
V
 
G
G
 
S
A
 
A
E
 
E
P
 
A
V
 
V
T
 
V
C
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
A
-
 
D
L
 
L
E
 
E
N
 
G
D
 
A
V
 
A
D
 
N
N
 
V
M
 
A
V
 
E
K
 
E
A
 
L
T
 
A
T
 
A
D
 
T
R
 
R
F
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
A
 
I
I
 
A
P
 
R
H
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
E
T
 
E
E
 
V
P
 
S
Y
 
L
E
 
G
S
 
R
F
 
W
K
 
R
M
 
E
V
 
V
M
 
L
D
 
T
I
 
V
N
 
N
V
 
L
N
 
D
A
 
A
Q
 
A
F
 
W
L
 
V
C
 
L
S
 
S
Q
 
R
R
 
S
C
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
A
A
 
H
R
 
G
S
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
T
I
|
I
A
|
A
S
|
S
M
 
M
L
 
L
G
 
S
L
 
F
V
 
Q
G
 
G
L
 
G
G
 
R
S
 
N
I
x
V
P
 
-
Q
 
-
A
 
A
S
 
A
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
M
 
V
I
 
V
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
G
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
F
x
V
P
 
V
S
x
T
E
 
A
M
x
N
T
|
T
T
 
A
D
 
A
M
 
L
F
 
R
G
 
A
D
 
D
E
 
D
R
 
E
S
 
R
E
 
A
A
 
A
F
 
E
M
 
I
E
 
T
K
 
A
R
 
R
S
 
I
L
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
G
 
W
G
 
A
R
 
T
T
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
M
I
 
V
G
 
G
A
 
P
L
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
H
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
L
A
 
A

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
38% identity, 95% coverage: 10:254/258 of query aligns to 4:243/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
T
 
T
G
 
A
K
 
Q
T
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
T
A
 
A
Q
 
L
G
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
M
N
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
N
A
 
Y
R
 
A
R
 
Q
T
 
S
D
 
S
R
 
T
L
 
A
K
 
A
D
 
D
-
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
I
E
 
I
K
 
A
T
 
N
G
 
G
V
 
G
G
 
E
A
 
A
E
 
I
P
 
A
V
 
V
T
 
Q
C
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
N
E
 
A
N
 
D
D
 
E
V
 
V
D
 
D
N
 
Q
M
 
L
V
 
I
K
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
L
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
I
 
R
P
 
D
H
 
T
P
 
L
A
 
L
E
 
L
T
 
R
E
 
M
P
 
K
Y
 
L
E
 
E
S
 
D
F
 
W
K
 
Q
M
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
D
I
 
L
N
 
N
V
 
L
N
 
T
A
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
T
Q
 
K
R
 
A
C
 
V
G
 
S
R
 
K
I
 
L
M
 
M
L
 
L
E
 
K
A
 
Q
R
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
A
G
 
G
L
 
M
V
 
-
G
 
-
L
 
M
G
 
G
S
 
N
I
x
P
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
S
 
N
Y
 
Y
N
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
K
E
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
W
 
L
S
 
A
K
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
W
x
F
F
 
I
P
 
A
S
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
T
 
E
D
 
N
M
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
R
x
N
S
 
A
E
 
E
A
 
P
F
 
I
M
 
L
E
 
Q
K
 
F
R
 
I
S
 
P
L
 
L
L
 
A
R
 
R
R
 
Y
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
T
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
V
I
 
A
G
 
G
A
 
T
L
 
I
L
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
E
 
D
-
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
F
V
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
39% identity, 97% coverage: 8:257/258 of query aligns to 6:246/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
F
 
F
D
 
D
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
S
x
D
S
 
T
G
 
G
L
|
L
G
 
G
V
 
Q
A
 
G
F
 
M
A
 
A
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
C
N
 
D
V
 
I
V
 
V
L
 
-
A
 
-
A
 
G
R
 
V
R
 
N
T
x
I
D
 
V
R
 
E
L
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
T
A
 
I
A
 
E
N
 
K
L
 
V
E
 
T
K
 
A
T
 
L
G
 
G
V
 
R
G
 
R
A
 
F
E
 
L
P
 
S
V
 
L
T
 
T
C
 
A
D
|
D
V
x
M
T
 
S
L
 
N
E
 
V
N
 
S
D
 
G
V
 
H
D
 
A
N
 
E
M
 
L
V
 
V
K
 
E
A
 
K
T
 
A
T
 
V
D
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
H
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
A
 
I
I
 
R
P
 
R
H
 
E
P
 
D
A
 
A
E
 
I
T
 
E
E
 
F
P
 
S
Y
 
E
E
 
K
S
 
N
F
 
W
K
 
D
M
 
D
V
 
V
M
 
M
D
 
N
I
x
L
N
 
N
V
 
I
N
 
K
A
 
S
Q
 
V
F
 
F
L
 
F
C
 
M
S
 
S
Q
 
Q
R
 
T
C
 
V
G
 
A
R
 
R
I
 
Q
M
 
F
L
 
I
-
 
K
E
 
Q
A
 
G
R
 
K
S
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
M
 
M
L
 
L
G
 
S
L
 
F
V
 
Q
G
 
G
L
 
G
G
 
I
S
 
R
I
 
V
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
S
 
S
Y
|
Y
N
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
S
A
 
A
M
 
V
I
 
M
N
 
G
M
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
N
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
W
 
Y
F
x
M
P
 
A
S
x
T
E
 
N
M
x
N
T
 
T
T
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
Q
E
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
K
A
 
E
F
 
I
M
 
L
E
 
D
K
 
-
R
 
R
S
 
I
L
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
G
 
W
G
 
G
R
 
L
T
 
P
E
 
Q
E
 
D
L
 
L
I
 
M
G
 
G
A
 
P
L
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
S
A
 
A
G
 
S
S
 
D
Y
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Y
T
 
T
I
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
L
A
 
A

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
33% identity, 100% coverage: 1:257/258 of query aligns to 5:259/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
M
 
M
K
 
T
S
 
H
P
 
A
A
 
L
E
 
D
L
 
R
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
R
T
 
R
A
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
 
G
S
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
L
A
 
T
F
 
L
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
A
 
N
A
 
D
R
|
R
R
 
N
T
 
E
D
 
E
R
 
K
L
 
A
K
 
A
D
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
R
N
 
R
L
 
F
E
 
R
K
 
D
T
 
E
G
 
G
V
 
F
G
 
A
A
 
A
E
 
D
P
 
H
V
 
A
T
 
V
C
 
F
D
|
D
V
|
V
T
 
A
L
 
E
E
 
H
N
 
A
D
 
Q
V
 
V
D
 
R
N
 
A
M
 
A
V
 
I
K
 
D
A
 
E
T
 
F
T
 
E
D
 
A
R
 
R
F
 
V
G
 
G
R
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
Q
I
 
R
P
 
R
H
 
A
P
 
P
A
 
L
E
 
D
T
 
A
E
 
F
P
 
E
Y
 
P
E
 
D
S
 
D
F
 
W
K
 
H
M
 
A
V
 
L
M
 
M
D
 
R
I
 
V
N
 
N
V
 
L
N
 
D
A
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
V
S
 
A
Q
 
Q
R
 
A
C
 
V
G
 
A
R
 
R
I
 
H
M
 
M
L
 
I
E
 
A
A
 
R
R
 
G
S
 
H
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
C
S
|
S
M
 
V
L
 
Q
G
 
S
L
 
E
V
 
L
G
 
A
L
 
R
G
 
P
S
 
T
I
 
I
P
 
-
Q
 
-
A
 
A
S
 
P
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
M
 
V
I
 
R
N
 
M
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
G
L
 
M
A
 
C
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
S
 
A
K
 
R
R
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
Y
F
|
F
P
 
E
S
x
T
E
 
E
M
x
L
T
x
N
T
 
R
D
 
A
M
 
L
F
 
V
G
 
D
D
 
D
E
 
A
R
 
A
S
 
F
E
 
S
A
 
D
F
 
W
M
 
L
E
 
C
K
 
K
R
 
R
S
 
T
L
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
G
 
W
G
 
G
R
 
Q
T
 
V
E
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
A
L
 
I
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
A
A
 
A
G
 
S
S
 
D
Y
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
L
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
L
T
 
T
A
 
S

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
38% identity, 93% coverage: 16:254/258 of query aligns to 5:241/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
C
N
 
K
V
 
V
V
 
L
L
 
V
-
x
N
A
x
Y
A
|
A
R
|
R
R
x
S
T
 
A
D
 
K
R
 
A
L
 
A
K
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
S
A
 
K
N
 
Q
L
 
I
E
 
E
K
 
A
T
 
Y
G
 
G
V
 
G
G
 
Q
A
 
A
E
 
I
P
 
T
V
 
F
T
 
G
C
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
S
L
 
K
E
 
E
N
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
E
N
 
A
M
 
M
V
 
M
K
 
K
A
 
T
T
 
A
T
 
I
D
 
D
R
 
A
F
 
W
G
 
G
R
 
T
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
I
 
R
P
 
D
H
 
T
P
 
L
A
 
L
E
 
I
T
 
R
E
 
M
P
 
K
Y
 
K
E
 
S
S
 
Q
F
 
W
K
 
D
M
 
E
V
 
V
M
 
I
D
 
D
I
 
L
N
 
N
V
 
L
N
 
T
A
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
T
Q
 
Q
R
 
A
C
 
A
G
 
T
R
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
M
E
 
K
A
 
K
R
 
R
S
 
K
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
M
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
-
L
 
-
G
 
G
S
 
N
I
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
F
T
 
S
R
 
K
E
 
T
L
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
W
 
G
S
 
A
K
 
S
R
 
R
G
 
N
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
F
F
x
I
P
 
A
S
|
S
E
 
D
M
|
M
T
 
T
T
 
A
D
 
K
M
 
L
F
 
G
G
 
E
D
 
D
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
M
 
M
E
 
E
K
 
K
R
 
K
S
 
I
L
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
G
 
T
G
 
G
R
 
Q
T
 
P
E
 
E
E
 
N
L
 
V
I
 
A
G
 
G
A
 
L
L
 
V
L
 
E
L
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
L
S
 
S
E
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
I
 
F
V
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7vyqA Short chain dehydrogenase (scr) cryoem structure with NADP and ethyl 4-chloroacetoacetate (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:257/258 of query aligns to 25:279/280 of 7vyqA

query
sites
7vyqA
K
 
K
S
 
N
P
 
V
A
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
S
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
|
S
S
x
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
W
A
 
A
F
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
V
V
 
A
L
 
I
A
 
W
A
 
-
R
 
Y
R
x
N
T
 
S
D
x
H
R
 
P
L
 
A
K
 
D
D
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
E
N
 
H
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
T
 
T
-
 
Y
G
 
G
V
 
V
G
 
H
A
 
S
E
 
K
P
 
A
V
 
Y
T
 
K
C
 
C
D
 
N
V
x
I
T
 
S
L
 
D
E
 
P
N
 
K
D
 
S
V
 
V
D
 
E
N
 
E
M
 
T
V
 
I
K
 
S
A
 
Q
T
 
Q
T
 
E
D
 
K
R
 
D
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
F
V
 
V
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
V
A
x
T
I
 
W
P
 
T
H
 
Q
P
 
G
A
 
P
E
 
E
-
 
I
-
 
D
T
 
V
E
 
D
P
 
N
Y
 
Y
E
 
D
S
 
S
F
 
W
K
 
N
M
 
K
V
 
I
M
 
I
D
 
S
I
x
V
N
 
D
V
 
L
N
 
N
A
 
G
Q
 
V
F
 
Y
L
 
Y
C
 
C
S
 
S
Q
 
H
R
 
N
C
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
I
M
 
F
L
 
K
E
 
K
A
 
N
R
 
G
S
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
L
I
 
I
N
 
I
I
 
T
A
 
S
S
|
S
M
 
I
L
 
S
G
 
G
L
 
K
V
 
I
G
 
V
L
 
-
G
 
-
S
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
|
Q
-
 
L
-
 
Q
A
 
A
S
 
P
Y
|
Y
N
 
N
A
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
M
 
C
I
 
T
N
 
H
M
 
L
T
 
A
R
 
K
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
P
R
 
F
G
 
A
V
 
-
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
S
P
|
P
G
|
G
W
x
Y
F
x
I
P
 
D
S
x
T
E
 
D
M
x
I
T
|
T
T
 
D
D
 
-
M
 
-
F
|
F
G
 
A
D
 
S
E
 
K
R
 
D
S
 
M
E
 
K
A
 
A
F
 
K
M
x
W
E
 
W
K
 
Q
R
 
L
S
 
T
L
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
G
 
E
G
 
G
R
 
L
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
N
A
 
A
G
 
S
S
 
T
Y
 
F
I
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
T
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T
A
 
C

7dlmA Short chain dehydrogenase (scr) crystal structure with NADPH (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:257/258 of query aligns to 25:279/280 of 7dlmA

query
sites
7dlmA
K
 
K
S
 
N
P
 
V
A
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
S
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
|
S
S
x
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
W
A
 
A
F
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
V
V
 
A
L
 
I
A
 
W
A
 
-
R
x
Y
R
x
N
T
x
S
D
x
H
R
 
P
L
 
A
K
 
D
D
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
E
N
 
H
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
T
 
T
-
 
Y
G
 
G
V
 
V
G
 
H
A
 
S
E
 
K
P
 
A
V
 
Y
T
 
K
C
|
C
D
x
N
V
x
I
T
 
S
L
 
D
E
 
P
N
 
K
D
 
S
V
 
V
D
 
E
N
 
E
M
 
T
V
 
I
K
 
S
A
 
Q
T
 
Q
T
 
E
D
 
K
R
 
D
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
F
V
 
V
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
|
V
A
 
T
I
 
W
P
 
T
H
 
Q
P
 
G
A
 
P
E
 
E
-
 
I
-
 
D
T
 
V
E
 
D
P
 
N
Y
 
Y
E
 
D
S
 
S
F
 
W
K
 
N
M
 
K
V
 
I
M
 
I
D
 
S
I
 
V
N
 
D
V
 
L
N
 
N
A
 
G
Q
 
V
F
 
Y
L
 
Y
C
 
C
S
 
S
Q
 
H
R
 
N
C
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
I
M
 
F
L
 
K
E
 
K
A
 
N
R
 
G
S
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
L
I
 
I
N
 
I
I
x
T
A
 
S
S
|
S
M
 
I
L
 
S
G
 
G
L
 
K
V
 
I
G
 
V
L
 
-
G
 
-
S
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
-
 
L
-
 
Q
A
 
A
S
 
P
Y
|
Y
N
 
N
A
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
M
 
C
I
 
T
N
 
H
M
 
L
T
 
A
R
 
K
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
P
R
 
F
G
 
A
V
 
-
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
S
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
F
x
I
P
 
D
S
x
T
E
 
D
M
x
I
T
 
T
T
 
D
D
 
-
M
 
-
F
 
F
G
 
A
D
 
S
E
 
K
R
 
D
S
 
M
E
 
K
A
 
A
F
 
K
M
 
W
E
 
W
K
 
Q
R
 
L
S
 
T
L
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
G
 
E
G
 
G
R
 
L
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
N
A
 
A
G
 
S
S
 
T
Y
 
F
I
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
T
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T
A
 
C

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 94% coverage: 13:254/258 of query aligns to 5:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
T
 
S
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
V
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
V
 
V
-
 
A
V
 
V
L
 
N
A
 
Y
A
 
A
R
 
G
R
 
S
T
 
K
D
 
E
R
 
K
L
 
A
K
 
E
D
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
E
N
 
E
L
 
I
E
 
K
K
 
A
T
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
D
A
 
S
E
 
F
P
 
A
V
 
I
T
 
Q
C
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
D
E
 
A
N
 
D
D
 
E
V
 
V
D
 
K
N
 
A
M
 
M
V
 
I
K
 
K
A
 
E
T
 
V
T
 
V
D
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
I
 
R
P
 
D
H
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
T
 
R
E
 
M
P
 
K
Y
 
E
E
 
Q
S
 
E
F
 
W
K
 
D
M
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
N
 
K
A
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
S
 
I
Q
 
Q
R
 
K
C
 
A
G
 
T
R
 
P
I
 
Q
M
 
M
L
 
L
E
 
R
A
 
Q
R
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
M
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
-
G
 
-
S
 
N
I
 
P
P
 
G
Q
|
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
N
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
W
 
L
S
 
A
K
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
F
 
I
P
 
V
S
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
-
T
 
T
D
 
D
M
 
A
F
 
L
G
 
S
D
 
D
E
 
E
R
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
Q
F
 
M
M
 
L
E
 
T
K
 
Q
R
 
I
S
 
P
L
 
L
L
 
A
R
 
R
R
 
F
G
 
G
G
 
Q
R
 
D
T
 
T
E
 
-
E
 
D
L
 
I
I
 
A
G
 
N
A
 
T
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
K
G
 
A
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
39% identity, 95% coverage: 10:254/258 of query aligns to 3:236/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
L
 
L
T
 
T
G
 
D
K
 
R
T
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
-
 
N
A
 
Y
A
|
A
R
x
S
R
x
S
T
 
A
D
 
G
R
 
A
L
 
A
K
 
D
D
 
E
L
 
V
A
 
V
A
 
A
N
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
G
G
 
E
A
 
A
E
 
F
P
 
A
V
 
V
T
 
K
C
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
L
 
Q
E
 
E
N
 
S
D
 
E
V
 
V
D
 
E
N
 
A
M
 
L
V
 
F
K
 
A
A
 
A
T
 
V
T
 
I
D
 
E
R
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
I
 
R
P
 
D
H
 
T
P
 
L
A
 
L
E
 
L
T
 
R
E
 
M
P
 
K
Y
 
R
E
 
D
S
 
D
F
 
W
K
 
Q
M
 
S
V
 
V
M
 
L
D
 
D
I
x
L
N
 
N
V
 
L
N
 
G
A
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
Q
 
R
R
 
A
C
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
E
 
K
A
 
Q
R
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
M
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
-
V
 
-
G
 
E
L
 
M
G
 
G
S
 
N
I
 
P
P
 
G
Q
|
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
N
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
W
 
L
S
 
A
K
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
F
x
I
P
 
A
S
x
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
T
 
S
D
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
L
M
 
L
E
 
E
K
 
V
R
 
I
S
 
P
L
 
L
L
 
G
R
 
R
R
 
Y
G
 
-
G
 
G
R
 
E
T
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
V
I
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
V
L
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
D
-
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
I
 
I
V
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9BY49 Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase; TERP; 2,4-dienoyl-CoA reductase-related protein; DCR-RP; HPDHase; Short chain dehydrogenase/reductase family 29C member 1; pVI-ARL; EC 1.3.1.38 from Homo sapiens (Human) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 10:254/258 of query aligns to 16:264/303 of Q9BY49

query
sites
Q9BY49
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
Q
T
 
V
A
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
V
Q
 
K
G
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
S
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
K
T
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
L
E
 
P
K
 
P
T
 
T
G
 
K
V
 
Q
G
 
A
-
 
R
A
 
V
E
 
I
P
 
P
V
 
I
T
 
Q
C
 
C
D
 
N
V
 
I
T
 
R
L
 
N
E
 
E
N
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
N
N
 
N
M
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
S
T
 
T
T
 
L
D
 
D
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
N
I
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
G
G
 
G
V
 
G
A
 
Q
I
 
F
P
 
L
H
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
T
 
H
E
 
I
P
 
S
Y
 
S
E
 
K
S
 
G
F
 
W
K
 
H
M
 
A
V
 
V
M
 
L
D
 
E
I
 
T
N
 
N
V
 
L
N
 
T
A
 
G
Q
 
T
F
 
F
L
 
Y
C
 
M
S
 
C
Q
 
K
R
 
A
C
 
V
G
 
Y
R
 
S
I
 
S
M
 
W
L
 
M
E
 
K
A
 
E
R
 
H
S
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
I
S
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
V
V
 
P
G
 
T
L
 
K
G
 
A
S
 
G
I
 
F
P
 
P
Q
 
L
A
 
A
S
 
V
Y
 
H
N
 
S
-
 
G
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
G
M
 
V
I
 
Y
N
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
C
R
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
V
F
 
I
P
 
Y
S
 
S
E
 
Q
M
 
T
T
 
A
T
 
V
D
 
E
M
 
N
F
 
Y
G
 
G
D
 
S
E
 
-
R
 
W
S
 
G
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
M
 
F
E
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
F
K
 
Q
R
 
K
S
 
I
L
 
P
L
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
I
G
 
G
R
 
V
T
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
V
I
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
V
L
 
C
L
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
E
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
I
 
V
V
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
38% identity, 96% coverage: 10:257/258 of query aligns to 8:252/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
L
 
L
T
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
x
A
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
L
A
 
A
F
 
T
A
 
G
Q
 
R
G
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
G
A
x
D
R
x
I
R
 
D
T
 
P
D
 
T
R
 
T
L
 
G
K
 
K
D
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
N
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
G
T
 
L
G
 
F
V
 
V
G
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
P
V
|
V
T
 
-
C
 
-
D
|
D
V
|
V
T
 
S
L
 
E
E
 
Q
N
 
E
D
 
A
V
 
V
D
 
D
N
 
N
M
 
L
V
 
F
K
 
D
A
 
T
T
 
A
T
 
A
D
 
S
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
S
I
 
P
P
 
P
H
 
E
P
 
D
-
 
D
-
 
L
A
 
I
E
 
E
T
 
N
E
 
T
P
 
D
Y
 
L
E
 
P
S
 
A
F
 
W
K
 
Q
M
 
R
V
 
V
M
 
Q
D
 
D
I
 
I
N
 
N
V
 
L
N
 
K
A
 
S
Q
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
S
S
 
C
Q
 
R
R
 
A
C
 
A
G
 
L
R
 
R
I
 
H
M
 
M
L
 
V
E
 
P
A
 
A
R
 
G
S
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
M
 
F
L
 
V
G
 
A
L
 
V
V
 
M
G
 
G
L
 
-
G
 
S
S
 
A
I
 
T
P
 
S
Q
|
Q
A
 
I
S
 
S
Y
|
Y
N
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
L
N
 
A
M
 
M
T
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
V
Q
 
Q
W
 
Y
S
 
A
K
 
R
R
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
C
P
|
P
G
 
G
W
x
P
F
x
V
P
 
N
S
 
T
E
 
P
M
 
L
T
 
L
T
 
Q
D
 
E
M
 
L
F
 
F
G
 
A
D
 
K
E
 
D
R
 
P
S
 
E
E
 
R
A
 
A
F
 
A
M
 
R
E
 
R
K
 
L
R
 
V
S
 
H
L
 
I
-
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
G
 
F
G
 
A
R
 
E
T
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
D
G
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
T
 
T
I
 
F
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
I
T
 
S
A
 
S

4hp8B Crystal structure of a putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens (target efi-506435) with bound NADP
39% identity, 99% coverage: 2:257/258 of query aligns to 1:245/246 of 4hp8B

query
sites
4hp8B
K
 
K
S
 
N
P
 
P
A
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
F
D
 
S
L
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
N
S
x
T
G
|
G
L
|
L
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
C
A
 
A
A
 
A
R
|
R
R
|
R
T
 
A
-
 
P
D
 
D
R
 
E
L
 
T
K
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
I
A
 
A
N
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
K
T
 
D
G
 
G
V
 
G
G
 
N
A
 
A
E
 
S
P
 
A
V
 
L
T
 
L
C
 
I
D
|
D
V
x
F
T
 
A
L
 
-
E
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
D
N
 
P
M
 
L
V
 
A
K
 
A
A
 
K
T
 
D
T
 
S
D
 
F
R
 
T
F
 
D
G
 
A
R
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
A
 
-
I
 
I
P
 
R
H
 
R
P
 
A
A
 
D
E
 
S
T
 
V
E
 
E
P
 
F
Y
 
S
E
 
E
-
 
L
S
 
D
F
 
W
K
 
D
M
 
E
V
 
V
M
 
M
D
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
L
N
 
K
A
 
A
Q
 
L
F
 
F
L
 
F
C
 
T
S
 
T
Q
 
Q
R
 
A
C
 
F
G
 
A
R
 
K
I
 
E
M
 
L
L
 
L
-
 
A
E
 
K
A
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
V
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
M
 
L
L
 
L
G
 
S
L
 
F
V
 
Q
G
 
G
L
 
G
G
 
I
S
 
R
I
x
V
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
S
 
S
Y
|
Y
N
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
M
 
V
I
 
A
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
N
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
A
R
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
F
x
I
P
 
E
S
x
T
E
 
N
M
x
N
T
|
T
T
 
E
D
 
A
M
 
L
F
 
R
G
 
A
D
 
D
-
 
A
E
 
A
R
 
R
S
 
N
E
 
K
A
 
A
F
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
-
R
 
R
S
 
I
L
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
G
 
W
G
 
G
R
 
H
T
 
S
E
 
E
E
 
D
L
 
I
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
E
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
H
G
 
G
Q
 
A
T
 
I
I
 
L
V
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
L
A
 
A

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 97% coverage: 7:257/258 of query aligns to 2:254/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
I
F
 
M
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
F
 
A
A
 
V
Q
 
Q
G
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
-
R
 
-
R
x
D
T
x
I
D
 
D
R
 
E
L
 
A
K
 
Q
D
 
G
L
 
E
A
 
A
A
 
M
N
 
V
L
 
R
E
 
K
K
 
E
T
 
N
G
 
N
V
 
D
G
 
R
A
 
L
E
 
H
P
 
F
V
 
V
T
 
Q
C
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
L
 
D
E
 
E
N
 
A
D
 
A
V
 
C
D
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
S
T
 
A
T
 
V
D
 
H
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
A
 
E
I
 
I
P
 
V
H
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
H
T
 
E
E
 
M
P
 
E
Y
 
L
E
 
S
S
 
D
F
 
W
K
 
N
M
 
K
V
 
V
M
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
V
 
L
N
 
T
A
 
G
Q
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
M
S
 
S
Q
 
K
R
 
H
C
 
A
G
 
L
R
 
K
I
 
H
M
 
M
L
 
L
E
 
A
A
 
A
R
 
G
S
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
M
 
V
L
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
L
 
W
G
 
P
S
 
D
I
 
I
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
S
 
A
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
L
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
M
A
 
A
A
 
V
Q
 
D
W
 
Y
S
 
A
K
 
K
R
 
H
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
I
F
x
I
P
 
D
S
 
T
E
 
P
M
 
L
T
 
N
T
 
E
D
 
K
M
 
S
F
 
F
G
 
L
D
 
-
E
 
E
R
 
N
S
 
N
E
 
E
A
 
G
F
 
T
M
 
L
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
A
K
 
K
R
 
V
S
 
N
L
 
P
L
 
L
R
 
L
R
 
R
G
 
L
G
 
G
R
 
K
T
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
I
I
 
A
G
 
N
A
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
L
G
 
S
S
 
S
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
T
 
A
I
 
I
V
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T
A
 
A

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
37% identity, 94% coverage: 13:254/258 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
T
 
S
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
V
 
V
-
 
A
V
 
V
L
x
N
A
x
Y
A
|
A
R
x
G
R
x
S
T
 
K
D
 
E
R
 
K
L
 
A
K
 
E
D
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
E
N
 
E
L
 
I
E
 
K
K
 
A
T
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
D
A
 
S
E
 
F
P
 
A
V
 
I
T
 
Q
C
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
L
 
D
E
 
A
N
 
D
D
 
E
V
 
V
D
 
K
N
 
A
M
 
M
V
 
I
K
 
K
A
 
E
T
 
V
T
 
V
D
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
I
 
R
P
 
D
H
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
T
 
R
E
 
M
P
 
K
Y
 
E
E
 
Q
S
 
E
F
 
W
K
 
D
M
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
D
I
x
T
N
 
N
V
 
L
N
 
K
A
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
S
 
I
Q
 
Q
R
 
K
C
 
A
G
 
T
R
 
P
I
 
Q
M
 
M
L
 
L
E
 
R
A
 
Q
R
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
M
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
-
G
 
-
S
 
N
I
 
P
P
 
G
Q
|
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
N
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
W
 
L
S
 
A
K
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
F
 
I
P
 
V
S
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
T
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
D
E
 
E
R
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
Q
F
 
M
M
 
L
E
 
T
K
 
Q
R
 
I
S
 
P
L
 
L
L
 
A
R
 
R
R
 
F
G
 
G
G
 
Q
R
 
D
T
 
T
E
 
-
E
 
D
L
 
I
I
 
A
G
 
N
A
 
T
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
K
G
 
A
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
39% identity, 97% coverage: 7:256/258 of query aligns to 6:252/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
L
 
V
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
L
A
 
E
F
 
I
A
 
C
Q
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
R
 
E
T
 
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
K
 
-
D
 
D
L
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
L
 
E
E
 
L
K
 
G
T
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
E
 
R
P
 
-
V
 
I
T
 
V
C
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
L
 
-
E
 
D
N
 
A
D
 
E
V
 
A
D
 
M
N
 
T
M
 
A
V
 
A
K
 
A
A
 
A
T
 
E
T
 
A
D
 
E
R
 
A
F
 
V
G
 
A
R
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
I
 
R
P
 
L
H
 
H
P
 
D
A
 
A
E
 
L
T
 
E
E
 
T
P
 
D
Y
 
D
E
 
A
S
 
T
F
 
W
K
 
R
M
 
Q
V
 
V
M
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
G
Q
 
M
F
 
F
L
 
W
C
 
A
S
 
S
Q
 
R
R
 
A
C
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
A
M
 
M
L
 
V
E
 
A
A
 
R
R
 
G
S
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
M
 
M
L
 
S
G
 
G
L
 
T
V
 
I
G
 
V
L
 
-
G
 
-
S
x
N
I
 
R
P
 
P
Q
 
Q
-
 
F
-
 
A
A
 
S
S
 
S
Y
|
Y
N
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
M
 
V
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
Y
F
x
V
P
 
A
S
x
T
E
 
E
M
|
M
T
|
T
T
 
L
D
 
K
M
|
M
F
 
-
G
 
-
D
 
R
E
 
E
R
 
R
S
 
P
E
 
E
A
 
L
F
 
F
M
 
E
E
 
T
K
 
W
R
 
L
S
 
D
L
 
M
-
 
T
-
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
G
 
C
G
 
G
R
 
E
T
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
I
I
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
T
 
I
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T

2wsbA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD (see paper)
39% identity, 97% coverage: 7:256/258 of query aligns to 6:252/254 of 2wsbA

query
sites
2wsbA
L
 
V
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
L
A
 
E
F
 
I
A
 
C
Q
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
R
 
E
T
 
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
K
 
-
D
 
D
L
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
L
 
E
E
 
L
K
 
G
T
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
E
 
R
P
 
-
V
 
I
T
 
V
C
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
L
 
-
E
 
D
N
 
A
D
 
E
V
 
A
D
 
M
N
 
T
M
 
A
V
 
A
K
 
A
A
 
A
T
 
E
T
 
A
D
 
E
R
 
A
F
 
V
G
 
A
R
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
I
 
R
P
 
L
H
 
H
P
 
D
A
 
A
E
 
L
T
 
E
E
 
T
P
 
D
Y
 
D
E
 
A
S
 
T
F
 
W
K
 
R
M
 
Q
V
 
V
M
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
G
Q
 
M
F
 
F
L
 
W
C
 
A
S
 
S
Q
 
R
R
 
A
C
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
A
M
 
M
L
 
V
E
 
A
A
 
R
R
 
G
S
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
M
|
M
L
 
S
G
 
G
L
 
T
V
 
I
G
 
V
L
 
-
G
 
-
S
x
N
I
 
R
P
 
P
Q
 
Q
-
 
F
-
 
A
A
 
S
S
 
S
Y
|
Y
N
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
M
 
V
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
Y
F
x
V
P
 
A
S
x
T
E
 
E
M
|
M
T
|
T
T
 
L
D
 
K
M
 
M
F
 
-
G
 
-
D
 
R
E
 
E
R
 
R
S
 
P
E
 
E
A
 
L
F
 
F
M
 
E
E
 
T
K
 
W
R
 
L
S
 
D
L
 
M
-
 
T
-
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
G
 
C
G
 
G
R
 
E
T
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
I
I
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
T
 
I
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T

2wdzA Crystal structure of the short chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD+ and 1,2-pentandiol (see paper)
39% identity, 97% coverage: 7:256/258 of query aligns to 6:252/254 of 2wdzA

query
sites
2wdzA
L
 
V
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
L
A
 
E
F
 
I
A
 
C
Q
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
R
 
E
T
x
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
K
 
-
D
|
D
L
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
L
 
E
E
 
L
K
 
G
T
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
E
x
R
P
 
-
V
 
I
T
 
V
C
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
L
 
-
E
 
D
N
 
A
D
 
E
V
 
A
D
 
M
N
 
T
M
 
A
V
 
A
K
 
A
A
 
A
T
 
E
T
 
A
D
 
E
R
 
A
F
 
V
G
 
A
R
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
I
 
R
P
 
L
H
 
H
P
 
D
A
 
A
E
 
L
T
 
E
E
 
T
P
 
D
Y
 
D
E
 
A
S
 
T
F
 
W
K
 
R
M
 
Q
V
 
V
M
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
G
Q
 
M
F
 
F
L
 
W
C
 
A
S
 
S
Q
 
R
R
 
A
C
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
A
M
 
M
L
 
V
E
 
A
A
 
R
R
 
G
S
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
M
 
M
L
x
S
G
 
G
L
 
T
V
 
I
G
 
V
L
 
-
G
 
-
S
 
N
I
 
R
P
 
P
Q
 
Q
-
 
F
-
 
A
A
 
S
S
 
S
Y
|
Y
N
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
M
 
V
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
Y
F
x
V
P
 
A
S
x
T
E
 
E
M
|
M
T
|
T
T
 
L
D
 
K
M
 
M
F
 
-
G
 
-
D
 
R
E
 
E
R
 
R
S
 
P
E
 
E
A
 
L
F
 
F
M
 
E
E
 
T
K
 
W
R
 
L
S
 
D
L
 
M
-
 
T
-
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
G
 
C
G
 
G
R
 
E
T
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
I
I
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
T
 
I
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T

C0KTJ6 Galactitol 2-dehydrogenase (L-tagatose-forming); Galactitol dehydrogenase; GDH; GatDH; Galactitol:NAD(+) 5-oxidoreductase; EC 1.1.1.406 from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 7:256/258 of query aligns to 6:252/254 of C0KTJ6

query
sites
C0KTJ6
L
 
V
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
V
 
L
A
 
E
F
 
I
A
 
C
Q
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
I
A
x
D
R
 
R
R
 
E
T
 
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
K
 
-
D
 
D
L
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
L
 
E
E
 
L
K
 
G
T
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
E
 
R
P
 
-
V
 
I
T
 
V
C
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
L
 
-
E
 
D
N
 
A
D
 
E
V
 
A
D
 
M
N
 
T
M
 
A
V
 
A
K
 
A
A
 
A
T
 
E
T
 
A
D
 
E
R
 
A
F
 
V
G
 
A
R
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
I
 
R
P
 
L
H
 
H
P
 
D
A
 
A
E
 
L
T
 
E
E
 
T
P
 
D
Y
 
D
E
 
A
S
 
T
F
 
W
K
 
R
M
 
Q
V
 
V
M
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
G
Q
 
M
F
 
F
L
 
W
C
 
A
S
 
S
Q
 
R
R
 
A
C
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
A
M
 
M
L
 
V
E
 
A
A
 
R
R
 
G
S
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
L
A
 
G
S
 
S
M
 
M
L
 
S
G
 
G
L
 
T
V
 
I
G
 
V
L
 
-
G
 
-
S
 
N
I
 
R
P
 
P
Q
 
Q
-
 
F
-
 
A
A
 
S
S
 
S
Y
|
Y
N
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
M
 
V
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
K
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
Y
F
x
V
P
x
A
S
x
T
E
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
L
D
 
K
M
 
M
F
 
-
G
 
-
D
 
R
E
 
E
R
 
R
S
 
P
E
 
E
A
 
L
F
 
F
M
 
E
E
 
T
K
 
W
R
 
L
S
 
D
L
 
M
-
 
T
-
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
G
 
C
G
 
G
R
 
E
T
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
I
I
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
T
 
I
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_035218082.1 NCBI__GCF_000429905.1:WP_035218082.1
MKSPAELFDLTGKTAVITGASSGLGVAFAQGLAAAGANVVLAARRTDRLKDLAANLEKTG
VGAEPVTCDVTLENDVDNMVKATTDRFGRLDILVNNAGVAIPHPAETEPYESFKMVMDIN
VNAQFLCSQRCGRIMLEARSGSIINIASMLGLVGLGSIPQASYNASKAAMINMTRELAAQ
WSKRGVRVNAIAPGWFPSEMTTDMFGDERSEAFMEKRSLLRRGGRTEELIGALLLLASEA
GSYITGQTIVVDGGWTAI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory