SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_035219698.1 NCBI__GCF_000429905.1:WP_035219698.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4fw8A Crystal structure of fabg4 complexed with coenzyme nadh (see paper)
49% identity, 80% coverage: 95:479/479 of query aligns to 41:427/427 of 4fw8A

query
sites
4fw8A
L
 
L
A
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
M
 
K
D
 
D
A
 
Y
K
 
D
P
 
L
E
 
V
G
 
G
L
 
D
N
 
S
F
 
F
R
 
G
V
 
G
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
S
 
T
D
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
G
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
F
 
F
F
 
F
N
 
T
T
 
P
K
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
L
S
 
G
P
 
R
C
 
C
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
R
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
E
E
 
A
L
 
A
E
 
A
D
 
S
I
 
T
S
 
N
Q
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
T
K
 
R
S
 
S
A
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
-
K
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
T
S
 
T
Q
 
A
A
 
L
I
 
V
Y
 
Y
V
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
K
G
 
P
A
 
A
E
 
A
D
 
T
R
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
S
V
 
T
L
 
M
R
 
R
F
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
A
R
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
V
 
F
R
 
S
V
 
V
S
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
D
K
 
S
A
 
T
P
 
P
E
 
P
S
 
A
F
 
D
T
 
W
N
 
E
I
 
-
R
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
V
M
 
F
A
 
A
G
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
I
 
V
V
 
A
M
 
I
D
|
D
R
 
V
P
 
E
G
 
S
E
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
N
T
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
S
K
 
K
I
 
V
N
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
W
C
x
L
D
 
D
I
x
V
T
 
T
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
A
P
 
V
K
 
D
A
 
K
I
 
I
K
 
S
D
 
E
H
 
H
I
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
H
Y
 
H
G
 
G
K
 
G
K
 
K
G
 
A
L
 
-
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
K
M
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
M
 
M
D
 
D
A
 
D
D
 
A
R
 
R
W
 
W
N
 
D
M
 
A
V
 
V
M
 
L
N
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
P
I
 
L
A
 
R
S
 
L
T
 
T
K
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
V
K
 
G
-
 
N
-
 
G
I
 
S
M
 
I
P
 
G
D
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
I
C
 
G
L
|
L
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
R
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
I
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
T
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
F
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
L
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
V
 
I
T
 
A
F
 
Y
L
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
A
 
S
S
 
N
G
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
N
V
 
V
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
N
 
A
F
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A

3q6iA Crystal structure of fabg4 and coenzyme binary complex
49% identity, 80% coverage: 95:479/479 of query aligns to 41:427/427 of 3q6iA

query
sites
3q6iA
L
 
L
A
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
M
 
K
D
 
D
A
 
Y
K
 
D
P
 
L
E
 
V
G
 
G
L
 
D
N
 
S
F
 
F
R
 
G
V
 
G
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
S
 
T
D
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
G
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
F
 
F
F
 
F
N
 
T
T
 
P
K
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
L
S
 
G
P
 
R
C
 
C
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
R
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
E
E
 
A
L
 
A
E
 
A
D
 
S
I
 
T
S
 
N
Q
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
T
K
 
R
S
 
S
A
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
-
K
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
T
S
 
T
Q
 
A
A
 
L
I
 
V
Y
 
Y
V
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
K
G
 
P
A
 
A
E
 
A
D
 
T
R
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
S
V
 
T
L
 
M
R
 
R
F
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
A
R
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
V
 
F
R
 
S
V
 
V
S
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
D
K
 
S
A
 
T
P
 
P
E
 
P
S
 
A
F
 
D
T
 
W
N
 
E
I
 
-
R
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
V
M
 
F
A
 
A
G
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
I
 
V
V
 
A
M
 
I
D
|
D
R
 
V
P
 
E
G
 
S
E
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
N
T
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
S
K
 
K
I
 
V
N
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
W
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
A
P
 
V
K
 
D
A
 
K
I
 
I
K
 
S
D
 
E
H
 
H
I
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
H
Y
 
H
G
 
G
K
 
G
K
 
K
G
 
A
L
 
-
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
K
M
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
M
 
M
D
 
D
A
 
D
D
 
A
R
 
R
W
 
W
N
 
D
M
 
A
V
 
V
M
 
L
N
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
P
I
 
L
A
 
R
S
 
L
T
 
T
K
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
V
K
 
G
-
 
N
-
 
G
I
 
S
M
 
I
P
 
G
D
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
I
C
 
G
L
|
L
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
R
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
I
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
T
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
F
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
L
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
V
 
I
T
 
A
F
 
Y
L
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
A
 
S
S
 
N
G
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
N
V
 
V
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
N
 
A
F
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A

I6Y778 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]; Beta-ketoacyl CoA reductase; FASII-like 3-oxoacyl-thioester reductase; HMwFabG; EC 1.1.1.212 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
50% identity, 77% coverage: 109:479/479 of query aligns to 82:454/454 of I6Y778

query
sites
I6Y778
N
 
S
F
 
F
R
 
G
V
 
G
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
S
 
T
D
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
G
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
F
 
F
F
 
F
N
 
T
T
 
P
K
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
L
S
 
G
P
 
R
C
 
C
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
R
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
E
E
 
A
L
 
A
E
 
A
D
 
S
I
 
T
S
 
N
Q
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
T
K
x
R
S
 
S
A
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
-
K
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
T
S
 
T
Q
 
A
A
 
L
I
 
V
Y
 
Y
V
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
K
G
 
P
A
 
A
E
 
A
D
 
T
R
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
S
V
 
T
L
 
M
R
 
R
F
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
A
R
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
V
 
F
R
 
S
V
 
V
S
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
D
K
 
S
A
 
T
P
 
P
E
 
P
S
 
A
F
 
D
T
 
W
N
 
E
I
 
-
R
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
V
M
 
F
A
 
A
G
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
I
 
V
V
 
A
M
 
I
D
|
D
R
 
V
P
 
E
G
 
S
E
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
N
T
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
S
K
 
K
I
 
V
N
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
W
C
 
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
A
P
 
V
K
 
D
A
 
K
I
 
I
K
 
S
D
 
E
H
 
H
I
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
H
Y
 
H
G
 
G
K
 
G
K
 
K
G
 
A
L
 
-
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
|
K
M
x
L
L
|
L
A
|
A
N
|
N
M
 
M
D
 
D
A
 
D
D
 
A
R
 
R
W
 
W
N
 
D
M
 
A
V
 
V
M
 
L
N
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
P
I
 
L
A
 
R
S
 
L
T
 
T
K
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
V
K
 
G
-
 
N
-
 
G
I
 
S
M
 
I
P
 
G
D
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
I
C
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
V
 
R
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
I
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
T
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
F
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
L
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
V
 
I
T
 
A
F
 
Y
L
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
A
 
S
S
 
N
G
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
N
V
 
V
L
 
I
R
|
R
I
 
V
C
 
C
G
 
G
Q
|
Q
N
x
A
F
x
M
I
|
I
G
|
G
A
|
A

3v1uA Crystal structure of a beta-ketoacyl reductase fabg4 from mycobacterium tuberculosis h37rv complexed with NAD+ and hexanoyl-coa at 2.5 angstrom resolution (see paper)
49% identity, 77% coverage: 109:479/479 of query aligns to 47:416/416 of 3v1uA

query
sites
3v1uA
N
 
S
F
 
F
R
 
G
V
 
G
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
S
 
T
D
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
G
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
F
 
F
F
 
F
N
 
T
T
 
P
K
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
L
S
 
G
P
 
R
C
 
C
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
R
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
E
E
 
A
L
 
A
E
 
A
D
 
S
I
 
T
S
 
N
Q
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
T
K
 
R
S
 
S
A
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
-
K
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
T
S
 
T
Q
 
A
A
 
L
I
 
V
Y
 
Y
V
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
K
G
 
P
A
 
A
E
 
A
D
 
T
R
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
S
V
 
T
L
 
M
R
 
R
F
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
A
R
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
V
 
F
R
 
S
V
 
V
S
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
D
K
 
S
A
 
T
P
 
P
E
 
P
S
 
A
F
 
D
T
 
W
N
 
E
I
 
-
R
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
V
M
 
F
A
 
A
G
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
I
 
V
V
 
A
M
 
I
D
|
D
R
x
V
P
 
E
G
 
S
E
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
N
T
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
S
K
 
K
I
 
V
N
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
W
C
 
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
A
P
 
V
K
 
D
A
 
K
I
 
I
K
 
S
D
 
E
H
 
H
I
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
H
Y
 
H
G
 
G
K
 
G
K
 
K
G
 
A
L
 
-
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
|
K
M
x
L
L
 
L
A
 
A
N
|
N
M
 
M
D
 
D
A
 
D
D
 
A
R
 
R
W
 
W
N
 
D
M
 
A
V
 
V
M
 
L
N
 
A
I
x
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
P
I
 
L
A
 
R
S
 
L
T
 
T
K
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
V
K
 
G
-
 
N
-
 
G
I
 
S
M
 
I
P
 
G
D
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
I
C
 
G
L
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
V
 
R
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
I
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
T
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
Q
|
Q
M
 
M
T
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
I
P
 
P
F
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
L
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
V
 
I
T
 
A
F
 
Y
L
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
A
 
S
S
 
N
G
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
N
V
 
V
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
N
 
A
F
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A

5vp5A Crystal structure of a 3-oxoacyl-acyl-carrier protein reductase fabg4 from mycobacterium smegmatis bound to NAD
46% identity, 77% coverage: 109:479/479 of query aligns to 53:411/411 of 5vp5A

query
sites
5vp5A
N
 
S
F
 
F
R
 
G
V
 
G
L
 
V
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
S
 
T
D
 
E
P
 
A
A
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
E
M
 
L
Y
 
Y
E
 
T
F
 
F
F
 
F
N
 
T
T
 
P
K
 
L
I
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
L
S
 
A
P
 
P
C
 
C
G
 
A
R
 
R
L
 
V
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
R
 
T
P
 
T
A
 
P
D
 
A
E
 
E
L
 
A
E
 
G
D
 
S
I
 
V
S
 
H
Q
 
A
A
 
Q
A
 
V
A
 
V
S
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
T
K
 
R
S
 
S
A
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
-
K
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
T
S
 
V
Q
 
S
A
 
L
I
 
V
Y
 
Y
V
 
L
E
 
S
K
 
A
G
 
D
A
 
A
E
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
A
D
 
T
R
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
S
V
 
T
L
 
M
R
 
R
F
 
F
F
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
A
R
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
V
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
D
K
 
S
A
 
T
P
 
P
E
 
P
S
 
A
F
 
D
T
 
W
N
 
D
I
 
-
R
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
V
M
 
F
A
 
A
G
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
A
M
 
I
D
|
D
R
x
V
P
 
D
G
 
G
E
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
D
T
 
L
S
 
K
K
 
R
L
 
V
A
 
A
R
 
D
K
 
K
I
 
V
N
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
T
C
 
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
A
P
 
V
K
 
D
A
 
K
I
 
I
K
 
T
D
 
A
H
 
H
I
 
V
A
 
T
E
 
E
N
 
H
Y
 
H
G
 
G
K
 
G
K
 
K
G
 
-
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
K
M
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
M
 
M
D
 
D
A
 
E
D
 
K
R
 
R
W
 
W
N
 
D
M
 
A
V
 
V
M
 
I
N
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
P
I
 
Q
A
 
R
S
 
L
T
 
T
K
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
V
K
 
G
-
 
N
-
 
G
I
 
T
M
 
I
P
 
G
D
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
I
C
 
G
L
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
M
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
R
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
I
 
I
G
 
G
F
 
L
V
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
V
V
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
-
M
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
F
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
L
V
 
I
T
 
A
F
 
Y
L
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
A
 
S
S
 
N
G
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
N
V
 
T
L
 
I
R
 
R
I
 
V
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
N
 
A
F
 
M
I
 
L
G
 
G
A
 
A

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
43% identity, 50% coverage: 237:477/479 of query aligns to 6:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
D
 
E
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
L
M
 
L
A
 
A
G
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
Q
D
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
D
K
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
D
K
 
N
I
 
G
N
 
K
G
 
G
S
 
M
A
 
A
L
 
L
N
|
N
C
 
-
D
 
-
I
x
V
T
 
T
A
 
N
S
 
P
D
 
E
A
 
S
P
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
L
D
 
K
H
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
D
N
 
E
Y
 
F
G
 
G
K
 
-
K
 
-
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
E
D
 
E
R
 
E
W
 
W
N
 
S
M
 
D
V
 
I
M
 
M
N
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
T
A
 
S
L
 
I
I
 
F
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
R
I
 
G
M
 
M
-
 
M
-
 
K
P
 
K
D
 
R
N
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
Q
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
N
F
 
D
A
 
E
T
 
Q
R
 
R
E
 
T
A
 
A
G
 
-
R
 
-
R
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
L
 
V
S
 
P
Q
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
D
P
 
P
Q
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
V
 
A
V
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
41% identity, 50% coverage: 240:477/479 of query aligns to 6:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
V
G
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
Q
D
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
D
K
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
A
K
 
-
I
 
-
N
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
G
L
 
L
N
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
S
 
P
D
 
A
A
 
S
P
 
I
K
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
L
D
 
E
H
 
N
I
 
V
A
 
R
E
 
A
N
 
E
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
K
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
D
D
 
D
R
 
E
W
 
W
N
 
N
M
 
D
V
 
I
M
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
A
 
S
L
 
V
I
 
F
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
M
K
 
R
I
 
A
M
 
M
-
 
M
-
 
K
P
 
K
D
 
R
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
S
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
A
I
 
L
P
 
T
F
 
D
A
 
E
T
 
Q
R
 
R
E
 
A
A
 
G
G
 
-
R
 
-
R
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
S
 
P
Q
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
T
P
 
P
Q
 
N
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
V
 
A
V
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
42% identity, 50% coverage: 237:477/479 of query aligns to 6:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
D
 
E
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
L
M
 
L
A
 
A
G
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
Q
D
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
D
K
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
D
K
 
N
I
 
G
N
 
K
G
 
G
S
 
M
A
 
A
L
 
L
N
|
N
C
 
-
D
 
-
I
x
V
T
 
T
A
 
N
S
 
P
D
 
E
A
 
S
P
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
L
D
 
K
H
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
D
N
 
E
Y
 
F
G
 
G
K
 
-
K
 
-
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
E
D
 
E
R
 
E
W
 
W
N
 
S
M
 
D
V
 
I
M
 
M
N
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
L
 
T
A
 
S
L
 
I
I
 
F
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
R
I
 
G
M
 
M
-
 
M
-
 
K
P
 
K
D
 
R
N
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
 
V
S
x
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
N
A
 
D
A
 
E
I
 
Q
P
 
R
F
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
L
 
V
S
 
P
Q
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
D
P
 
P
Q
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
V
 
A
V
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 49% coverage: 237:473/479 of query aligns to 5:240/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
D
 
Q
V
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
Q
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
V
M
 
F
A
 
M
G
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
I
M
 
A
D
|
D
R
x
F
P
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
N
D
 
E
L
 
A
T
 
A
S
 
G
K
 
K
L
 
E
A
 
A
R
 
V
K
 
E
I
 
A
N
 
N
G
 
P
S
 
G
A
 
V
-
 
V
-
 
F
L
 
I
N
 
R
C
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
D
S
 
R
D
 
E
A
 
S
P
 
V
K
 
H
A
 
R
I
 
L
K
 
V
D
 
E
H
 
N
I
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
R
Y
 
F
G
 
G
K
 
K
K
 
-
G
 
-
L
 
I
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
I
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
|
D
K
 
S
M
 
M
L
 
L
A
 
S
N
x
K
M
 
M
D
 
T
A
 
V
D
 
D
R
 
Q
W
 
F
N
 
Q
M
 
Q
V
 
V
M
 
I
N
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
L
 
T
A
 
G
L
 
V
I
 
F
A
 
H
S
 
C
T
 
T
K
 
Q
E
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
P
I
 
Y
M
 
M
P
 
A
D
 
E
N
 
Q
G
 
G
R
 
K
-
 
G
-
 
K
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
T
A
 
Y
G
 
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
M
V
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
P
 
K
T
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
Q
 
A
M
|
M
T
 
V
A
 
A
A
 
E
I
 
V
P
 
P
F
 
E
A
 
K
T
 
V
R
 
I
E
 
E
A
x
K
G
 
M
R
 
K
R
 
A
L
 
Q
A
 
V
S
 
P
L
 
M
S
 
G
Q
 
R
G
 
L
G
 
G
L
 
K
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
Y
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
H
Q
 
E
A
 
S
S
 
D
G
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
G
 
H
V
 
V
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
D
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
42% identity, 50% coverage: 240:477/479 of query aligns to 6:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
V
G
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
 
T
D
 
S
R
 
E
P
 
N
G
 
G
E
 
A
E
 
K
D
 
N
L
 
I
T
 
S
S
 
D
K
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
A
K
 
-
I
 
-
N
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
G
L
 
L
N
 
M
C
 
L
D
 
N
I
 
V
T
 
T
A
 
D
S
 
P
D
 
A
A
 
S
P
 
I
K
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
L
D
 
E
H
 
N
I
 
I
A
 
R
E
 
A
N
 
E
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
K
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
D
D
 
D
R
 
E
W
 
W
N
 
N
M
 
D
V
 
I
M
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
A
 
S
L
 
V
I
 
F
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
M
K
 
R
I
 
A
M
|
M
P
 
M
D
 
K
N
 
K
-
 
R
-
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
S
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
A
I
 
L
P
 
S
F
 
D
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
E
 
A
A
 
G
G
 
-
R
 
-
R
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
L
 
V
S
 
P
Q
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
V
 
A
V
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
D
Q
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
43% identity, 51% coverage: 236:477/479 of query aligns to 9:253/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
P
 
S
L
 
L
D
 
Q
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
E
M
 
L
A
 
G
G
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
V
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
x
T
D
 
S
R
 
A
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
E
D
 
K
L
 
I
T
 
A
S
 
E
K
 
T
L
 
L
-
 
K
A
 
A
R
 
N
K
 
G
I
 
V
N
 
E
G
 
G
S
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
V
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
S
S
 
D
D
 
E
A
 
S
P
 
V
K
 
A
A
 
A
I
 
T
K
 
L
D
 
E
H
 
H
I
 
I
A
 
Q
E
 
Q
N
 
H
Y
 
L
G
 
G
K
 
Q
K
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
L
V
 
I
I
 
V
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
V
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
D
D
 
D
R
 
E
W
 
W
N
 
F
M
 
D
V
 
V
M
 
V
N
 
N
I
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
N
A
 
S
L
 
L
I
 
Y
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
R
I
 
G
M
 
M
P
 
T
D
 
K
N
 
A
-
 
R
-
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
x
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
T
E
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
Q
 
D
M
|
M
T
|
T
A
 
R
A
 
E
I
 
L
P
 
P
F
 
E
A
 
A
T
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
L
R
 
G
L
 
Q
A
 
I
S
 
P
L
 
L
S
 
G
Q
 
R
G
 
L
G
 
G
L
 
Q
P
 
A
Q
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
T
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
T
L
 
V
R
 
P
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
41% identity, 50% coverage: 240:477/479 of query aligns to 5:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
N
G
 
G
E
 
A
E
 
Q
D
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
D
K
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
-
K
 
-
I
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
G
L
 
L
N
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
S
 
P
D
 
A
A
 
S
P
 
I
K
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
L
D
 
E
H
 
K
I
 
I
A
 
R
E
 
A
N
 
E
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
K
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
D
D
 
E
R
x
E
W
 
W
N
 
N
M
 
D
V
 
I
M
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
A
 
S
L
 
V
I
 
F
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
M
K
 
R
I
 
A
M
 
M
-
 
M
-
 
K
P
 
K
D
 
R
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
S
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
A
I
 
L
P
 
S
F
 
D
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
E
 
A
A
 
G
G
 
-
R
 
-
R
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
L
 
V
S
 
P
Q
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
x
E
V
x
T
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
41% identity, 50% coverage: 240:477/479 of query aligns to 6:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
N
G
 
G
E
 
A
E
 
Q
D
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
D
K
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
-
K
 
-
I
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
G
L
 
L
N
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
S
 
P
D
 
A
A
 
S
P
 
I
K
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
L
D
 
E
H
 
K
I
 
I
A
 
R
E
 
A
N
 
E
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
K
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
D
D
 
E
R
 
E
W
 
W
N
 
N
M
 
D
V
 
I
M
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
A
 
S
L
 
V
I
 
F
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
M
K
 
R
I
 
A
M
 
M
-
 
M
-
 
K
P
 
K
D
 
R
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
S
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
A
I
 
L
P
 
S
F
 
D
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
E
 
A
A
 
G
G
 
-
R
 
-
R
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
L
 
V
S
 
P
Q
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
x
E
V
 
T
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
41% identity, 49% coverage: 240:473/479 of query aligns to 6:239/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
A
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
T
 
Q
M
 
L
A
 
I
G
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
Y
R
 
F
V
 
V
I
 
V
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
Q
D
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
D
K
 
S
L
 
F
A
 
G
R
 
E
K
 
Q
I
 
-
N
 
-
G
 
G
S
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
A
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
R
A
 
N
S
 
L
D
 
D
A
 
E
P
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
V
D
 
S
H
 
H
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
K
 
P
K
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
K
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
L
N
 
R
M
 
M
D
 
S
A
 
E
D
 
D
R
 
D
W
 
W
N
 
D
M
 
D
V
 
I
M
 
L
N
 
N
I
 
I
N
 
H
L
 
L
L
 
K
A
 
A
L
 
V
I
 
Y
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
R
L
 
V
L
 
L
K
 
K
I
 
G
M
 
M
P
 
T
D
 
K
N
 
A
-
 
R
-
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
A
I
 
H
A
 
F
G
 
A
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
E
G
 
A
F
 
F
V
 
S
E
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
K
T
 
E
V
 
M
A
 
G
D
 
S
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
A
T
 
T
Q
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
D
A
 
A
I
 
L
P
 
S
F
 
E
A
 
D
T
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
K
G
 
M
R
 
S
R
 
D
L
 
Q
A
 
V
S
 
A
L
 
L
S
 
N
Q
 
R
G
 
L
G
 
G
L
 
E
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
K
A
 
A
S
 
G
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
41% identity, 50% coverage: 240:477/479 of query aligns to 5:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
x
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
N
G
 
G
E
 
A
E
 
Q
D
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
D
K
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
-
K
 
-
I
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
G
L
 
L
N
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
S
 
P
D
 
A
A
 
S
P
 
I
K
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
L
D
 
E
H
 
K
I
 
I
A
 
R
E
 
A
N
 
E
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
K
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
D
D
 
E
R
 
E
W
 
W
N
 
N
M
 
D
V
 
I
M
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
A
 
S
L
 
V
I
 
F
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
M
K
 
R
I
 
A
M
 
M
-
 
M
-
 
K
P
 
K
D
 
R
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
S
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
A
I
 
L
P
 
S
F
 
D
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
E
 
A
A
 
G
G
 
-
R
 
-
R
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
L
 
V
S
 
P
Q
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
41% identity, 49% coverage: 240:473/479 of query aligns to 6:239/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
A
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
T
 
Q
M
 
L
A
 
I
G
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
Y
R
 
F
V
 
V
I
 
V
-
 
G
-
 
T
V
x
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
Q
D
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
D
K
 
S
L
 
F
A
 
G
R
 
E
K
 
Q
I
 
-
N
 
-
G
 
G
S
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
A
C
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
R
A
 
N
S
 
L
D
 
D
A
 
E
P
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
V
D
 
S
H
 
H
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
K
 
P
K
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
K
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
L
N
 
R
M
 
M
D
 
S
A
 
E
D
 
D
R
 
D
W
 
W
N
 
D
M
 
D
V
 
I
M
 
L
N
 
N
I
 
I
N
 
H
L
 
L
L
 
K
A
 
A
L
 
V
I
 
Y
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
R
L
 
V
L
 
L
K
 
K
I
 
G
M
 
M
P
 
T
D
 
K
N
 
A
-
 
R
-
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
x
I
S
|
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
A
I
 
H
A
 
F
G
 
A
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
E
G
 
A
F
 
F
V
 
S
E
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
K
T
 
E
V
 
M
A
 
G
D
 
S
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
 
T
Q
 
E
M
|
M
T
 
T
A
 
D
A
 
A
I
 
L
P
 
S
F
 
E
A
 
D
T
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
K
G
 
M
R
 
S
R
 
D
L
 
Q
A
 
V
S
 
A
L
 
L
S
 
N
Q
 
R
G
 
L
G
 
G
L
 
E
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
K
A
 
A
S
 
G
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
38% identity, 50% coverage: 240:477/479 of query aligns to 5:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
K
 
K
I
 
I
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
T
M
 
F
A
 
V
G
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
x
T
D
 
S
R
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
E
D
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
G
K
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
A
K
 
-
I
 
-
N
 
N
G
 
G
S
 
K
A
 
G
L
 
F
N
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
K
A
 
D
S
 
A
D
 
Q
A
 
S
P
 
I
K
 
D
A
 
S
I
 
V
K
 
L
D
 
A
H
 
S
I
 
I
A
 
R
E
 
A
N
 
E
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
K
 
-
G
 
-
L
 
I
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
D
D
 
D
R
 
E
W
 
W
N
 
E
M
 
D
V
 
I
M
 
L
N
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
T
A
 
S
L
 
V
I
 
F
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
M
K
 
C
I
 
A
M
 
M
P
 
M
D
 
K
N
 
K
-
 
R
-
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
S
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
A
I
 
L
P
 
T
F
 
D
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
E
 
A
A
 
G
G
 
I
R
 
L
R
 
S
L
 
S
A
 
V
S
 
P
L
 
A
S
 
N
Q
 
R
G
 
P
G
 
G
L
 
D
P
 
A
Q
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
V
 
A
V
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
E
A
 
A
S
 
G
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
H
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
42% identity, 51% coverage: 236:477/479 of query aligns to 15:254/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
P
 
S
L
 
L
D
 
Q
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
E
M
 
L
A
 
G
G
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
V
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
 
T
D
 
S
R
 
A
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
E
D
 
K
L
 
I
T
 
A
S
 
E
K
 
T
L
 
L
-
 
K
A
 
A
R
 
N
K
 
G
I
 
V
N
 
E
G
 
G
S
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
V
C
 
L
D
 
D
I
 
V
T
 
S
A
 
S
S
 
D
D
 
E
A
 
S
P
 
V
K
 
A
A
 
A
I
 
T
K
 
L
D
 
E
H
 
H
I
 
I
A
 
Q
E
 
Q
N
 
H
Y
 
L
G
 
G
K
 
Q
K
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
L
V
 
I
I
 
V
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
V
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
D
D
 
D
R
 
E
W
 
W
N
 
F
M
 
D
V
 
V
M
x
V
N
 
N
I
 
T
N
 
N
L
|
L
L
 
N
A
 
S
L
 
L
I
 
Y
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
R
I
 
G
M
 
M
P
 
T
D
 
K
N
 
A
-
 
R
-
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
V
 
L
I
 
E
G
|
G
F
|
F
V
 
T
E
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
E
I
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
A
T
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
L
R
 
G
L
 
Q
A
 
I
S
 
P
L
 
L
S
 
G
Q
 
R
G
 
L
G
 
G
L
 
Q
P
 
A
Q
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
T
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
T
L
 
V
R
 
P
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 49% coverage: 240:473/479 of query aligns to 6:243/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
Q
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
I
T
 
N
M
 
L
A
 
A
G
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
I
 
F
V
 
F
M
x
N
-
x
Y
-
x
N
D
x
G
R
x
S
P
 
P
G
 
E
E
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
E
T
 
T
S
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
V
R
 
A
K
 
E
-
 
H
-
 
G
I
 
V
N
 
E
G
 
V
S
 
E
A
 
A
L
 
M
N
 
K
C
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
A
 
I
S
 
A
D
 
E
A
 
D
P
 
V
K
 
D
A
 
A
I
 
F
K
 
F
D
 
K
H
 
Q
I
 
A
A
 
I
E
 
E
N
 
R
Y
 
F
G
 
G
K
 
R
K
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
M
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
E
D
 
D
R
 
E
W
 
W
N
 
D
M
 
D
V
 
V
M
 
I
N
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
L
 
K
A
 
G
L
 
T
I
 
F
A
 
L
S
 
C
T
 
T
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
S
K
 
R
I
 
T
M
 
M
P
 
M
D
 
K
N
 
Q
-
 
R
-
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
 
M
S
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
L
V
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
T
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
P
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
T
T
|
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
A
 
K
I
 
L
P
 
D
F
 
E
A
 
K
T
 
T
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
M
R
 
L
R
 
A
L
 
Q
A
 
I
S
 
P
L
 
L
S
 
G
Q
 
A
G
 
Y
G
 
G
L
 
T
P
 
T
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
A
A
 
S
S
 
K
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
Q
V
 
T
L
 
L
R
 
S
I
 
V
C
 
D
G
 
G

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
41% identity, 50% coverage: 237:477/479 of query aligns to 5:240/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
L
 
L
D
 
Q
V
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
E
M
 
L
A
 
G
G
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
V
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
V
 
A
M
 
T
D
 
S
R
 
A
P
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
E
D
 
K
L
 
I
T
 
A
S
 
E
K
 
T
L
 
L
-
 
K
A
 
A
R
 
N
K
 
G
I
 
V
N
 
E
G
 
G
S
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
V
C
 
L
D
 
D
I
 
V
T
 
S
A
 
S
S
 
D
D
 
E
A
 
S
P
 
V
K
 
A
A
 
A
I
 
T
K
 
L
D
 
E
H
 
H
I
 
I
A
 
Q
E
 
Q
N
 
H
Y
 
L
G
 
G
K
 
Q
K
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
L
V
 
I
I
 
V
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
R
T
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
M
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
D
R
 
E
W
 
W
N
x
F
M
 
D
V
 
V
M
x
V
N
 
N
I
 
T
N
 
N
L
|
L
L
 
N
A
 
S
L
 
L
I
 
Y
A
 
R
S
 
L
T
 
S
K
 
K
E
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
R
I
 
G
M
 
M
P
 
T
D
 
K
N
 
A
-
 
R
-
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
C
 
N
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
|
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
V
 
L
I
 
E
G
 
G
F
|
F
V
 
T
E
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
Q
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
E
I
 
L
P
 
P
F
 
E
A
 
A
T
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
L
R
 
G
L
 
Q
A
 
I
S
 
P
L
 
L
S
 
G
Q
 
R
G
 
L
G
 
G
L
 
Q
P
 
A
Q
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
T
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
T
L
 
V
R
 
P
I
 
V
C
 
N
G
 
G
Q
 
G
N
 
M
F
 
Y
I
 
M

Query Sequence

>WP_035219698.1 NCBI__GCF_000429905.1:WP_035219698.1
MGDILLELGKKDAARKVVKNLGLPLPLPQELSRPKGPWEEMPLLDVNAAVGHLPGSELAP
QIAQALGGMGAMVHAAADSKKFSHYQKQGTARGRLAKALDMDAKPEGLNFRVLIFDATGV
SDPAELEMMYEFFNTKIRSLSPCGRLIVLGRPADELEDISQAAASRALLGFVKSAGKEIG
KKGATSQAIYVEKGAEDRLEPVLRFFLSDRSAYVSGQMVRVSAKVKAPESFTNIRPLDVK
IALVTGAARGIGEQIARTMAGEGARVIVMDRPGEEDLTSKLARKINGSALNCDITASDAP
KAIKDHIAENYGKKGLDVIVHNAGVTRDKMLANMDADRWNMVMNINLLALIASTKELLKI
MPDNGRIVCLSSIAGIAGNVGQTNYAASKAGVIGFVEALAPTVADRGITVNAVAPGFIET
QMTAAIPFATREAGRRLASLSQGGLPQDVAQVVTFLASPQASGVTGGVLRICGQNFIGA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory