SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_035236781.1 NCBI__GCF_000745975.1:WP_035236781.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
53% identity, 95% coverage: 1:236/248 of query aligns to 6:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
M
 
V
L
 
L
K
 
E
I
 
V
K
 
Q
N
 
S
L
 
L
K
 
H
C
 
V
C
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
N
 
A
I
 
I
A
 
H
V
 
A
V
 
I
H
 
K
T
 
G
V
 
I
S
 
D
L
 
L
S
 
K
V
 
V
R
 
P
Q
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
I
 
V
S
 
T
I
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
G
 
S
A
 
A
V
 
I
C
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
V
K
 
R
N
 
A
W
 
Q
S
 
K
G
 
G
E
 
K
I
 
I
E
 
I
F
 
F
K
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
K
 
T
G
 
N
M
 
K
S
 
P
A
 
A
P
 
H
A
 
V
I
 
I
V
 
N
S
 
R
Q
 
M
G
 
G
I
 
I
S
 
A
M
 
L
V
 
V
P
 
P
E
|
E
G
 
G
R
 
R
Q
 
R
I
 
I
F
 
F
S
 
P
P
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
V
M
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
N
R
 
R
F
 
K
R
 
D
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
I
A
 
K
Q
 
R
D
 
D
L
 
L
D
 
E
R
 
W
V
 
I
V
 
F
Q
 
S
M
 
L
F
 
F
P
 
P
I
 
R
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
S
 
L
D
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
S
R
 
R
P
 
P
A
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
S
M
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
I
I
 
L
V
 
V
G
 
S
M
 
E
I
 
V
F
 
F
E
 
E
T
 
V
I
 
I
Q
 
Q
T
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
T
 
E
G
 
G
V
 
T
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
D
 
H
R
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
Q
M
 
I
V
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
A
D
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
D
D
 
N
D
 
E
D
 
M
V
 
V
K
 
R
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
36% identity, 96% coverage: 2:239/248 of query aligns to 3:238/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
K
 
T
I
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
A
C
 
K
C
 
A
Y
 
Y
G
 
K
N
 
G
I
 
R
A
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
E
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
V
 
V
C
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
K
 
P
N
 
R
W
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
D
S
 
D
L
 
I
K
 
S
G
 
L
M
 
L
S
 
P
A
 
L
P
 
H
A
 
A
I
 
R
V
 
A
S
 
R
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
M
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
Q
 
S
I
 
I
F
 
F
S
x
R
P
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
K
 
M
M
 
-
G
 
-
A
 
A
Y
 
V
T
 
L
R
 
Q
F
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
G
 
L
K
 
S
T
 
A
R
 
E
V
 
Q
A
 
R
Q
 
E
D
 
D
-
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
E
V
 
L
V
 
M
Q
 
E
M
 
E
F
 
F
P
 
H
I
 
I
L
 
E
R
 
H
E
 
L
R
 
R
S
 
-
D
 
D
Q
 
S
L
x
M
A
x
G
G
x
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
K
 
I
I
 
S
V
 
V
G
 
I
M
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
H
M
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
E
D
 
H
V
 
V
K
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
E
D
 
D
Y
 
F

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
36% identity, 96% coverage: 2:239/248 of query aligns to 3:238/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
K
 
T
I
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
A
C
 
K
C
 
A
Y
|
Y
G
 
K
N
 
G
I
x
R
A
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
E
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
V
 
V
C
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
K
 
P
N
 
R
W
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
D
S
 
D
L
 
I
K
 
S
G
 
L
M
 
L
S
 
P
A
 
L
P
 
H
A
 
A
I
 
R
V
 
A
S
 
R
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
M
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
Q
 
S
I
 
I
F
 
F
S
 
R
P
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
K
 
M
M
 
-
G
 
-
A
 
A
Y
 
V
T
 
L
R
 
Q
F
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
G
 
L
K
 
S
T
 
A
R
 
E
V
 
Q
A
 
R
Q
 
E
D
 
D
-
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
E
V
 
L
V
 
M
Q
 
E
M
 
E
F
 
F
P
 
H
I
 
I
L
 
E
R
 
H
E
 
L
R
 
R
S
 
-
D
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
T
x
S
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
K
 
I
I
 
S
V
 
V
G
 
I
M
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
H
M
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
E
D
 
H
V
 
V
K
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
E
D
 
D
Y
 
F

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
35% identity, 96% coverage: 2:239/248 of query aligns to 4:239/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
K
 
T
I
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
A
C
 
K
C
 
A
Y
|
Y
G
 
K
N
 
G
I
x
R
A
 
R
V
|
V
V
 
V
H
 
E
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
V
 
V
C
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
K
 
P
N
 
R
W
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
D
S
 
D
L
 
I
K
 
S
G
 
L
M
 
L
S
 
P
A
 
L
P
 
H
A
 
A
I
 
R
V
 
A
S
 
R
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
M
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
Q
 
S
I
 
I
F
 
F
S
 
R
P
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
K
 
M
M
 
-
G
 
-
A
 
A
Y
 
V
T
 
L
R
 
Q
F
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
G
 
L
K
 
S
T
 
A
R
 
E
V
 
Q
A
 
R
Q
 
E
D
 
D
-
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
E
V
 
L
V
 
M
Q
 
E
M
 
E
F
 
F
P
 
H
I
 
I
L
 
E
R
 
H
E
 
L
R
 
R
S
 
-
D
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
K
 
I
I
 
S
V
 
V
G
 
I
M
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
x
H
N
 
N
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
H
M
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
E
D
 
H
V
 
V
K
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
E
D
 
D
Y
 
F

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:236/248 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
K
 
T
I
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
A
C
 
K
C
 
A
Y
|
Y
G
 
K
N
 
G
I
 
R
A
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
E
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
V
 
V
C
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
K
 
P
N
 
R
W
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
D
S
 
D
L
 
I
K
 
S
G
 
L
M
 
L
S
 
P
A
 
L
P
 
H
A
 
A
I
 
R
V
 
A
S
 
R
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
M
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
Q
 
S
I
 
I
F
 
F
S
 
R
P
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
K
 
M
M
 
-
G
 
-
A
 
A
Y
 
V
T
 
L
R
 
Q
F
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
G
 
L
K
 
S
T
 
A
R
 
E
V
 
Q
A
 
R
Q
 
E
D
 
D
-
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
E
V
 
L
V
 
M
Q
 
E
M
 
E
F
 
F
P
 
H
I
 
I
L
 
E
R
 
H
E
 
L
R
 
R
S
 
-
D
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
T
x
S
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
F
M
 
A
G
|
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
K
 
I
I
 
S
V
 
V
G
 
I
M
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
x
H
N
 
N
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
H
M
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
E
D
 
H
V
 
V
K
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
35% identity, 94% coverage: 2:235/248 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
K
 
T
I
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
A
C
 
K
C
 
A
Y
|
Y
G
 
K
N
 
G
I
x
R
A
 
R
V
|
V
V
 
V
H
 
E
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
V
 
V
C
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
K
 
P
N
 
R
W
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
D
S
 
D
L
 
I
K
 
S
G
 
L
M
 
L
S
 
P
A
x
L
P
x
H
A
 
A
I
 
R
V
 
A
S
 
R
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
M
 
Y
V
 
L
P
|
P
E
x
Q
G
 
E
R
x
A
Q
x
S
I
 
I
F
|
F
S
x
R
P
x
R
L
|
L
S
 
S
V
 
V
M
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
K
 
M
M
 
-
G
 
-
A
 
A
Y
x
V
T
 
L
R
 
Q
F
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
G
 
L
K
 
S
T
 
A
R
 
E
V
 
Q
A
 
R
Q
 
E
D
 
D
-
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
E
V
 
L
V
 
M
Q
 
E
M
 
E
F
 
F
P
 
H
I
 
I
L
 
E
R
 
H
E
 
L
R
 
R
S
 
-
D
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
x
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
K
 
I
I
 
S
V
 
V
G
 
I
M
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
H
M
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
E
D
 
H
V
 
V
K
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
35% identity, 94% coverage: 2:235/248 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
K
 
T
I
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
A
C
 
K
C
 
A
Y
|
Y
G
 
K
N
 
G
I
x
R
A
 
R
V
|
V
V
 
V
H
 
E
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
V
 
V
C
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
K
 
P
N
 
R
W
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
D
S
 
D
L
 
I
K
 
S
G
 
L
M
 
L
S
 
P
A
 
L
P
 
H
A
 
A
I
 
R
V
 
A
S
 
R
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
M
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
Q
 
S
I
 
I
F
 
F
S
 
R
P
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
K
 
M
M
 
-
G
 
-
A
 
A
Y
 
V
T
 
L
R
 
Q
F
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
G
 
L
K
 
S
T
 
A
R
 
E
V
 
Q
A
 
R
Q
 
E
D
 
D
-
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
E
V
 
L
V
 
M
Q
 
E
M
 
E
F
 
F
P
 
H
I
 
I
L
 
E
R
 
H
E
 
L
R
 
R
S
 
-
D
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
K
 
I
I
 
S
V
 
V
G
 
I
M
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
H
M
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
E
D
 
H
V
 
V
K
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
35% identity, 94% coverage: 2:234/248 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
K
 
T
I
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
A
C
 
K
C
 
A
Y
|
Y
G
 
K
N
 
G
I
x
R
A
 
R
V
|
V
V
 
V
H
 
E
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
V
 
V
C
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
K
 
P
N
 
R
W
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
D
S
 
D
L
 
I
K
 
S
G
 
L
M
 
L
S
 
P
A
 
L
P
 
H
A
 
A
I
 
R
V
 
A
S
 
R
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
M
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
Q
 
S
I
 
I
F
|
F
S
x
R
P
x
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
K
 
M
M
 
-
G
 
-
A
 
A
Y
 
V
T
 
L
R
 
Q
F
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
G
 
L
K
 
S
T
 
A
R
 
E
V
 
Q
A
 
R
Q
 
E
D
 
D
-
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
E
V
 
L
V
 
M
Q
 
E
M
 
E
F
 
F
P
 
H
I
 
I
L
 
E
R
 
H
E
 
L
R
 
R
S
 
-
D
 
D
Q
 
S
L
 
M
A
 
G
G
 
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
K
 
I
I
 
S
V
 
V
G
 
I
M
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
H
M
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
E
D
 
H
V
 
V
K
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
33% identity, 96% coverage: 1:239/248 of query aligns to 2:238/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
M
 
I
L
 
L
K
 
K
I
 
A
K
 
Q
N
 
H
L
 
L
K
 
A
C
 
K
C
 
S
Y
 
Y
G
 
K
N
 
K
I
 
R
A
 
K
V
 
V
V
 
V
H
 
S
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
I
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
S
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
V
 
I
C
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
V
K
 
A
N
 
R
W
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
T
I
 
I
E
 
T
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
N
S
 
D
L
 
I
K
 
S
G
 
I
M
 
L
S
 
P
A
 
M
P
 
H
A
 
S
I
 
R
V
 
S
S
 
R
Q
 
M
G
 
G
I
 
I
S
 
G
M
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
Q
 
S
I
 
I
F
 
F
S
 
R
P
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
E
D
 
D
N
 
N
L
 
I
K
 
M
M
 
-
G
 
-
A
 
A
Y
 
V
T
 
L
R
 
Q
F
 
T
R
 
R
K
 
E
E
 
E
G
 
L
K
 
T
T
 
H
R
x
E
V
 
E
A
 
R
Q
 
Q
D
|
D
-
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
D
V
 
L
V
 
L
Q
 
E
M
 
E
F
 
F
P
 
H
I
 
I
L
 
Q
R
 
H
E
 
I
R
 
R
S
 
K
D
 
S
Q
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
G
-
 
M
T
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
N
P
 
P
A
 
Q
L
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
P
K
 
I
I
 
S
V
 
V
G
 
I
M
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
K
T
 
I
I
 
I
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
R
G
 
G
V
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
D
I
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
K
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
M
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
Q
E
 
D
L
 
V
L
 
L
V
 
N
D
 
N
D
 
E
D
 
Q
V
 
V
K
 
K
R
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
E
D
 
Q
Y
 
F

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
29% identity, 96% coverage: 1:237/248 of query aligns to 4:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
M
 
I
L
 
L
K
 
R
I
 
T
K
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
V
C
 
K
C
 
Y
Y
x
F
G
 
G
N
 
E
I
x
F
A
 
K
V
 
A
V
 
L
H
 
D
T
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
R
 
N
Q
 
K
G
 
G
E
 
D
L
 
V
I
 
T
S
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
V
V
 
I
C
 
T
G
 
G
L
 
F
L
 
L
K
 
K
N
 
A
W
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
V
E
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
R
 
K
S
 
D
L
 
I
K
 
T
G
 
N
M
 
K
S
 
E
A
 
P
P
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
Y
S
 
H
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
V
M
 
R
V
 
T
P
 
F
E
 
Q
G
 
T
R
 
P
Q
 
Q
I
 
P
F
 
L
S
 
K
P
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
L
M
 
I
G
 
G
A
 
E
Y
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
T
 
S
R
 
L
F
 
F
R
 
Y
K
 
K
E
 
K
G
 
W
K
 
I
T
 
P
R
 
K
V
 
E
A
 
E
Q
 
E
D
 
M
L
 
V
D
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
 
K
M
 
I
F
 
L
P
 
E
I
 
F
L
 
L
R
 
K
-
 
L
-
 
S
E
 
H
R
 
L
S
 
Y
D
 
D
Q
 
R
L
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
T
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
M
L
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
L
V
 
A
G
 
H
M
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
N
T
 
H
I
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
A
T
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
H
N
 
R
A
 
L
R
 
D
A
 
I
A
 
V
L
 
L
K
 
N
I
 
Y
A
 
I
D
 
D
R
 
H
G
 
L
Y
 
Y
V
 
V
L
 
M
E
 
F
T
 
N
G
 
G
K
 
Q
M
 
I
V
 
I
L
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
R
A
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
L
 
V
L
 
L
V
 
S
D
 
D
D
 
P
D
 
K
V
 
V
K
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
K
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
29% identity, 95% coverage: 1:236/248 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
M
 
I
L
 
L
K
 
R
I
 
T
K
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
V
C
 
K
C
 
Y
Y
x
F
G
 
G
N
 
E
I
x
F
A
 
K
V
 
A
V
 
L
H
 
D
T
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
R
 
C
Q
 
K
G
 
G
E
 
D
L
 
V
I
 
T
S
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
V
V
 
I
C
 
T
G
 
G
L
 
F
L
 
L
K
 
K
N
 
A
W
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
V
E
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
R
 
K
S
 
D
L
 
I
K
 
T
G
 
N
M
 
K
S
 
E
A
 
P
P
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
Y
S
 
H
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
V
M
 
R
V
 
T
P
 
F
E
 
Q
G
 
T
R
 
P
Q
 
Q
I
 
P
F
 
L
S
 
K
P
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
L
M
 
I
G
 
G
A
 
E
Y
 
I
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
T
 
S
R
 
L
F
 
F
R
 
Y
K
 
K
E
 
K
G
 
W
K
 
I
T
 
P
R
 
K
V
 
E
A
 
E
Q
 
E
D
 
M
L
 
V
D
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
 
K
M
 
I
F
 
L
P
 
E
I
 
F
L
 
L
R
 
K
-
 
L
-
 
S
E
 
H
R
 
L
S
 
Y
D
 
D
Q
 
R
L
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
L
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
T
R
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
M
L
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
L
V
 
A
G
 
H
M
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
N
T
 
H
I
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
A
T
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
H
N
 
R
A
 
L
R
 
D
A
 
I
A
 
V
L
 
L
K
 
N
I
 
Y
A
 
I
D
 
D
R
 
H
G
 
L
Y
 
Y
V
 
V
L
 
M
E
 
F
T
 
N
G
 
G
K
 
Q
M
 
I
V
 
I
L
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
R
A
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
L
 
V
L
 
L
V
 
S
D
 
D
D
 
P
D
 
K
V
 
V
K
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
28% identity, 96% coverage: 1:237/248 of query aligns to 2:238/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
M
 
I
L
 
I
K
 
R
I
 
I
K
 
R
N
 
N
L
 
L
K
 
H
C
 
K
C
 
W
Y
x
F
G
 
G
N
 
P
I
 
L
A
 
H
V
|
V
V
 
L
H
 
K
T
 
G
V
 
I
S
 
H
L
 
L
S
 
E
V
 
V
R
 
A
Q
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
K
I
 
L
S
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
G
 
R
A
 
T
V
 
I
C
 
N
G
 
R
L
 
L
L
 
E
K
 
D
N
 
F
W
 
Q
S
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
E
 
V
F
 
V
K
 
D
G
 
G
R
 
L
S
 
S
L
 
V
K
 
K
G
 
D
M
 
D
S
 
R
A
 
A
P
 
L
A
 
R
I
 
E
V
 
I
S
 
R
Q
 
R
G
 
E
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
Q
R
 
F
Q
 
N
I
 
L
F
 
F
S
 
P
P
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
T
M
 
L
G
 
-
A
 
A
Y
 
P
T
 
M
R
 
R
F
 
V
R
 
R
K
 
R
E
 
W
G
 
P
K
 
R
T
 
E
R
 
K
V
 
A
A
 
E
Q
 
K
D
 
K
L
 
A
D
 
L
R
 
E
V
 
L
V
 
L
Q
 
E
M
 
R
F
 
V
P
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
-
E
 
D
R
 
Q
S
 
A
D
 
R
Q
 
K
L
 
Y
A
 
P
G
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
M
R
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
V
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
M
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
M
V
 
V
G
 
G
M
 
E
I
 
V
F
 
L
E
 
D
T
 
V
I
 
M
Q
 
R
T
 
D
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
T
 
G
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
R
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
V
V
 
F
L
 
M
E
 
D
T
 
G
G
 
G
K
 
Q
M
 
I
V
 
V
L
 
E
Q
 
E
G
 
G
S
 
R
A
 
P
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
F
V
 
T
-
 
R
-
 
P
D
 
K
D
 
E
D
 
E
V
 
R
K
 
T
R
 
R
A
 
S
Y
 
F
L
 
L
G
 
Q
K
 
R

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
27% identity, 96% coverage: 1:239/248 of query aligns to 3:242/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
M
L
 
I
K
 
D
I
 
V
K
 
H
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
C
 
K
C
 
S
Y
x
F
G
 
G
N
 
S
I
 
L
A
 
E
V
|
V
V
 
L
H
 
K
T
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
C
V
 
L
C
 
-
G
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
E
N
 
D
W
 
F
-
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
G
R
 
I
S
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
A
M
 
K
S
 
D
A
 
T
P
 
N
-
 
L
A
 
N
I
 
K
V
 
V
S
 
R
Q
 
E
G
 
E
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
R
R
 
F
Q
 
N
I
 
L
F
 
F
S
 
P
P
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
A
K
 
P
M
 
M
G
 
K
A
 
V
Y
 
R
T
 
K
R
 
W
F
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
G
 
A
K
 
E
T
 
A
R
 
K
V
 
A
A
 
M
Q
 
E
D
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
G
Q
 
-
M
 
-
F
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
R
 
K
E
 
D
R
 
K
S
 
A
D
 
H
Q
 
A
L
 
Y
A
 
P
G
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
M
R
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
V
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
M
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
M
V
 
V
G
 
G
M
 
E
I
 
V
F
 
L
E
 
S
T
 
V
I
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
T
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
R
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
T
 
G
G
 
G
K
 
Y
M
 
I
V
 
I
L
 
E
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
P
D
 
E
E
 
D
L
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
R
V
 
P
D
 
Q
D
 
H
D
 
E
V
 
R
K
 
T
R
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
V
Y
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
27% identity, 96% coverage: 1:239/248 of query aligns to 3:242/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
M
L
 
I
K
 
D
I
 
V
K
 
H
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
C
 
K
C
 
S
Y
x
F
G
 
G
N
 
S
I
 
L
A
 
E
V
|
V
V
 
L
H
 
K
T
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
C
V
 
L
C
 
-
G
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
E
N
 
D
W
 
F
-
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
G
R
 
I
S
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
A
M
 
K
S
 
D
A
 
T
P
 
N
-
 
L
A
 
N
I
 
K
V
 
V
S
 
R
Q
 
E
G
 
E
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
R
R
 
F
Q
 
N
I
 
L
F
 
F
S
 
P
P
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
A
K
 
P
M
 
M
G
 
K
A
 
V
Y
 
R
T
 
K
R
 
W
F
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
G
 
A
K
 
E
T
 
A
R
 
K
V
 
A
A
 
M
Q
 
E
D
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
G
Q
 
-
M
 
-
F
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
R
 
K
E
 
D
R
 
K
S
 
A
D
 
H
Q
 
A
L
 
Y
A
 
P
G
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
M
R
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
V
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
M
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
M
V
 
V
G
 
G
M
 
E
I
 
V
F
 
L
E
 
S
T
 
V
I
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
T
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
R
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
T
 
G
G
 
G
K
 
Y
M
 
I
V
 
I
L
 
E
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
P
D
 
E
E
 
D
L
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
R
V
 
P
D
 
Q
D
 
H
D
 
E
V
 
R
K
 
T
R
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
V
Y
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
27% identity, 96% coverage: 1:239/248 of query aligns to 3:242/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
M
L
 
I
K
 
D
I
 
V
K
 
H
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
C
 
K
C
 
S
Y
x
F
G
 
G
N
 
S
I
 
L
A
 
E
V
|
V
V
 
L
H
 
K
T
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
C
V
 
L
C
 
-
G
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
E
N
 
D
W
 
F
-
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
G
R
 
I
S
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
A
M
 
K
S
 
D
A
 
T
P
 
N
-
 
L
A
 
N
I
 
K
V
 
V
S
 
R
Q
 
E
G
 
E
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
R
R
 
F
Q
 
N
I
 
L
F
 
F
S
 
P
P
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
A
K
 
P
M
 
M
G
 
K
A
 
V
Y
 
R
T
 
K
R
 
W
F
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
G
 
A
K
 
E
T
 
A
R
 
K
V
 
A
A
 
M
Q
 
E
D
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
G
Q
 
-
M
 
-
F
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
R
 
K
E
 
D
R
 
K
S
 
A
D
 
H
Q
 
A
L
 
Y
A
 
P
G
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
M
R
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
V
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
M
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
M
V
 
V
G
 
G
M
 
E
I
 
V
F
 
L
E
 
S
T
 
V
I
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
T
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
R
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
T
 
G
G
 
G
K
 
Y
M
 
I
V
 
I
L
 
E
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
P
D
 
E
E
 
D
L
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
R
V
 
P
D
 
Q
D
 
H
D
 
E
V
 
R
K
 
T
R
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
V
Y
 
F

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
27% identity, 96% coverage: 1:239/248 of query aligns to 3:242/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
M
L
 
I
K
 
D
I
 
V
K
 
H
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
C
 
K
C
 
S
Y
x
F
G
 
G
N
 
S
I
 
L
A
 
E
V
|
V
V
 
L
H
 
K
T
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
C
V
 
L
C
 
-
G
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
E
N
 
D
W
 
F
-
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
G
R
 
I
S
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
A
M
 
K
S
 
D
A
 
T
P
 
N
-
 
L
A
 
N
I
 
K
V
 
V
S
 
R
Q
 
E
G
 
E
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
R
R
 
F
Q
 
N
I
 
L
F
 
F
S
 
P
P
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
A
K
 
P
M
 
M
G
 
K
A
 
V
Y
 
R
T
 
K
R
 
W
F
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
G
 
A
K
 
E
T
 
A
R
 
K
V
 
A
A
 
M
Q
 
E
D
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
G
Q
 
-
M
 
-
F
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
R
 
K
E
 
D
R
 
K
S
 
A
D
 
H
Q
 
A
L
 
Y
A
 
P
G
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
M
R
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
V
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
M
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
M
V
 
V
G
 
G
M
 
E
I
 
V
F
 
L
E
 
S
T
 
V
I
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
T
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
R
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
T
 
G
G
 
G
K
 
Y
M
 
I
V
 
I
L
 
E
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
P
D
 
E
E
 
D
L
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
R
V
 
P
D
 
Q
D
 
H
D
 
E
V
 
R
K
 
T
R
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
V
Y
 
F

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
29% identity, 96% coverage: 1:237/248 of query aligns to 1:238/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
L
 
I
K
 
F
I
 
V
K
 
N
N
 
D
L
 
V
K
 
Y
C
 
K
C
 
N
Y
x
F
G
 
G
N
 
S
I
 
L
A
 
E
V
|
V
V
 
L
H
 
K
T
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
L
S
 
K
V
 
V
R
 
N
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
C
V
 
I
C
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
K
 
E
N
 
P
W
 
T
S
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
E
 
F
F
 
I
K
 
D
G
 
G
R
 
V
S
 
K
L
 
I
K
 
N
-
 
N
G
 
G
M
 
K
S
 
V
A
 
N
P
 
I
A
 
N
I
 
K
V
 
V
S
 
R
Q
 
Q
G
 
K
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
H
R
 
F
Q
 
N
I
 
L
F
 
F
S
 
P
P
 
H
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
T
M
 
L
G
 
A
A
 
P
Y
 
V
T
 
K
-
 
V
-
 
K
R
 
K
F
 
M
R
 
N
K
 
K
E
 
K
G
 
E
K
 
A
T
 
E
R
 
E
V
 
L
A
 
A
Q
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
L
R
 
A
V
 
K
V
 
V
Q
 
G
M
 
L
F
 
L
P
 
-
I
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
D
R
 
K
S
 
K
D
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
P
G
 
I
T
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
M
R
 
Q
P
 
P
A
 
E
L
 
V
L
 
M
V
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
T
M
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
M
V
 
V
G
 
K
M
 
E
I
 
V
F
 
L
E
 
N
T
 
V
I
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
T
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
x
H
N
 
E
A
 
M
R
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
G
 
V
Y
 
I
V
 
F
L
 
M
E
 
D
T
 
D
G
 
G
K
 
V
M
 
I
V
 
V
L
 
E
Q
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
P
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
F
-
 
Y
-
 
R
V
 
A
D
 
K
D
 
N
D
 
E
V
 
R
K
 
T
R
 
R
A
 
E
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 86% coverage: 2:215/248 of query aligns to 258:473/501 of P04983

query
sites
P04983
L
 
L
K
 
K
I
 
V
K
 
D
N
 
N
L
 
L
K
 
-
C
 
C
C
 
G
Y
 
P
G
 
G
N
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
H
 
N
T
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
F
S
 
T
V
 
L
R
 
R
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
L
S
 
G
I
 
V
I
 
S
G
 
G
A
 
L
N
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
R
S
 
T
T
 
E
L
 
L
L
 
M
G
 
K
A
 
V
V
 
L
C
 
Y
G
 
G
L
 
A
L
 
L
K
 
P
N
 
R
W
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
Y
I
 
V
E
 
T
F
 
L
K
 
D
G
 
G
R
 
H
S
 
E
L
 
V
K
 
V
G
 
T
M
 
R
S
 
S
A
 
P
P
 
Q
A
 
D
I
 
G
V
 
L
S
 
A
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
S
 
V
M
 
Y
V
 
I
P
 
S
E
 
E
G
 
D
R
 
R
Q
 
K
-
 
R
-
 
D
-
 
G
I
 
L
F
 
V
S
 
L
P
 
G
L
 
M
S
 
S
V
 
V
M
 
K
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
M
 
L
G
 
T
A
 
A
Y
 
L
T
 
R
R
 
Y
F
 
F
R
 
S
K
 
R
E
 
A
G
 
G
K
 
G
T
 
S
R
 
L
V
 
K
A
 
H
Q
 
A
D
 
D
L
 
E
D
 
Q
R
 
Q
V
 
A
V
 
V
-
 
S
-
 
D
-
 
F
-
 
I
Q
 
R
M
 
L
F
 
F
P
 
N
I
 
V
L
 
K
R
 
T
E
 
P
R
 
S
S
 
M
D
 
E
Q
 
Q
L
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
K
L
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
T
R
 
R
P
 
P
A
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
M
 
R
G
 
G
L
 
V
A
 
D
P
 
V
K
 
G
I
 
A
V
 
K
G
 
K
M
 
E
I
 
I
F
 
Y
E
 
Q
T
 
L
I
 
I
Q
 
N
T
 
Q
L
 
F
R
 
K
D
 
A
T
 
D
G
 
G
V
 
L
T
 
S
I
 
I
L
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
S
Q
 
S
N
 
E
A
 
M
R
 
P
A
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
G
I
 
M
A
 
S
D
 
D
R
 
R
G
 
I
Y
 
I
V
 
V
L
 
M
E
 
H
T
 
E
G
 
G
K
 
H
M
 
L

Sites not aligning to the query:

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
30% identity, 90% coverage: 2:224/248 of query aligns to 1:218/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
L
 
V
K
 
Q
I
 
L
K
 
Q
N
 
N
L
 
V
K
 
T
C
 
K
C
 
A
Y
x
W
G
 
G
N
 
E
I
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
S
H
 
K
T
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
V
 
I
R
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
F
I
 
V
S
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
M
V
 
I
C
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
K
 
T
N
 
I
W
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
L
E
 
-
F
 
F
K
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
K
L
 
R
K
 
M
G
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
-
V
 
-
S
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
S
R
 
Y
Q
 
A
I
 
L
F
 
Y
S
 
P
P
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
M
 
F
G
 
G
-
 
L
A
 
K
Y
 
L
T
 
A
R
 
G
F
 
A
R
 
K
K
 
K
E
 
E
G
 
V
K
 
I
T
 
N
R
 
Q
V
 
R
A
 
V
Q
 
N
D
 
Q
L
 
V
D
 
A
R
 
E
V
 
V
V
 
L
Q
 
Q
M
 
L
F
 
A
P
 
H
I
 
L
L
 
L
R
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
D
Q
x
R
L
 
K
A
 
P
G
 
K
T
x
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
M
 
V
A
 
A
R
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
V
L
 
F
V
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
L
M
 
S
G
 
N
L
 
L
A
 
D
P
 
A
K
 
A
I
 
L
-
 
R
V
 
V
G
 
Q
M
 
M
I
 
R
F
 
I
E
 
E
T
 
I
I
 
S
Q
 
R
T
 
L
L
 
H
R
 
K
D
 
R
T
 
L
G
 
G
V
 
R
T
 
T
I
 
M
L
 
I
L
 
Y
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
D
A
 
Q
R
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
I
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
K
G
 
I
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
A
G
 
G
K
 
R
M
 
V
V
 
A
L
 
Q
Q
 
V
G
 
G
S
 
K
A
 
P
D
 
L
E
 
E
L
 
L

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
29% identity, 98% coverage: 2:243/248 of query aligns to 4:242/371 of P68187

query
sites
P68187
L
 
V
K
 
Q
I
 
L
K
 
Q
N
 
N
L
 
V
K
 
T
C
 
K
C
 
A
Y
 
W
G
 
G
N
 
E
I
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
S
H
 
K
T
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
V
 
I
R
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
F
I
 
V
S
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
M
V
 
I
C
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
K
 
T
N
 
I
W
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
L
E
 
-
F
 
F
K
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
K
L
 
R
K
 
M
G
 
N
M
 
D
S
 
T
A
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
-
V
 
-
S
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
S
R
 
Y
Q
x
A
I
 
L
F
 
Y
S
 
P
P
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
M
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
M
 
F
G
 
G
-
 
L
A
 
K
Y
 
L
T
 
A
R
 
G
F
 
A
R
x
K
K
 
K
E
 
E
G
 
V
K
 
I
T
 
N
R
 
Q
V
 
R
A
x
V
Q
 
N
D
 
Q
L
x
V
D
 
A
R
x
E
V
 
V
V
 
L
Q
 
Q
M
 
L
F
x
A
P
 
H
I
 
L
L
 
L
R
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
D
Q
 
R
L
 
K
A
 
P
G
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
|
G
E
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
M
 
V
A
 
A
R
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
V
L
 
F
V
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
S
 
L
M
 
S
G
 
N
L
 
L
A
 
D
P
 
A
K
 
A
I
 
L
-
 
R
V
 
V
G
 
Q
M
 
M
I
 
R
F
 
I
E
 
E
T
 
I
I
 
S
Q
 
R
T
 
L
L
 
H
R
 
K
D
 
R
T
 
L
G
 
G
V
 
R
T
 
T
I
 
M
L
 
I
L
 
Y
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
D
A
 
Q
R
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
I
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
K
G
 
I
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
A
G
 
G
K
 
R
M
 
V
V
 
A
L
 
Q
Q
 
V
G
 
G
S
 
K
A
 
P
D
 
L
E
 
E
L
 
L
-
 
Y
-
 
H
L
 
Y
V
 
P
D
 
A
D
 
D
D
x
R
V
 
F
K
 
V
R
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
K
 
S
D
 
P
Y
 
K
G
 
M
D
 
N
F
|
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_035236781.1 NCBI__GCF_000745975.1:WP_035236781.1
MLKIKNLKCCYGNIAVVHTVSLSVRQGELISIIGANGAGKSTLLGAVCGLLKNWSGEIEF
KGRSLKGMSAPAIVSQGISMVPEGRQIFSPLSVMDNLKMGAYTRFRKEGKTRVAQDLDRV
VQMFPILRERSDQLAGTLSGGEQQMLAIGRALMARPALLVLDEPSMGLAPKIVGMIFETI
QTLRDTGVTILLVEQNARAALKIADRGYVLETGKMVLQGSADELLVDDDVKRAYLGKDYG
DFLDGRNQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory