SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_035239519.1 NCBI__GCF_000745975.1:WP_035239519.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7qh2C Cryo-em structure of ldh-etfab complex from acetobacterium woodii (see paper)
38% identity, 94% coverage: 15:456/469 of query aligns to 30:463/467 of 7qh2C

query
sites
7qh2C
G
 
G
S
 
E
E
 
D
F
 
F
V
 
-
S
 
S
S
 
H
D
 
D
K
 
E
A
 
L
N
 
G
R
 
S
I
 
I
L
 
-
H
 
H
S
 
S
Y
 
Y
D
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
K
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
E
I
 
V
V
 
L
V
 
I
H
 
K
P
 
V
A
 
T
D
 
S
A
 
T
R
 
E
A
 
E
V
 
V
S
 
S
R
 
K
I
 
I
M
 
M
T
 
K
L
 
Y
A
 
A
H
 
Y
H
 
E
H
 
H
R
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
V
P
x
V
R
 
R
G
|
G
S
|
S
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
x
L
T
 
V
G
 
G
G
x
A
A
x
C
L
 
V
P
 
P
V
 
L
C
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
M
M
 
L
G
 
E
M
 
T
S
 
T
R
 
L
M
 
M
N
 
N
R
 
N
I
 
I
L
 
L
D
 
E
I
 
L
D
 
D
Q
 
T
E
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
T
A
 
V
V
 
T
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
L
T
 
L
G
 
M
D
 
E
F
 
L
Q
 
S
K
 
K
A
 
F
V
 
V
E
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
D
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
E
L
 
-
K
 
K
V
 
S
S
x
A
S
x
T
L
 
I
G
 
A
G
|
G
N
|
N
V
 
I
A
x
S
E
x
T
C
 
N
A
|
A
G
|
G
G
 
G
P
 
M
R
 
R
C
 
A
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
 
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
A
T
 
N
G
 
G
D
 
E
R
 
I
I
 
I
E
 
E
T
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
K
T
 
I
M
 
V
K
 
K
G
 
N
V
 
S
V
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
L
 
L
T
 
K
K
 
D
L
 
L
F
 
V
C
 
I
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
C
V
 
V
I
|
I
T
 
T
K
 
K
I
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
L
P
 
P
Q
 
K
A
 
M
K
 
T
K
 
L
T
 
S
M
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
P
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
D
 
S
G
 
D
A
 
A
A
 
A
K
 
G
A
 
I
V
 
V
S
 
P
A
 
K
I
 
I
I
 
I
R
 
K
E
 
S
K
 
K
I
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
T
T
 
A
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
M
D
 
E
G
 
R
R
 
Q
T
 
T
L
 
I
D
 
L
C
 
F
L
 
A
R
 
E
Q
 
D
T
 
F
A
 
L
G
 
G
L
 
K
S
 
K
M
 
F
P
 
P
-
 
D
Q
 
S
A
 
S
A
 
S
R
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
L
I
 
L
E
 
T
V
 
F
D
 
D
G
 
G
D
 
N
-
 
T
R
 
K
E
 
E
F
 
Q
L
 
V
D
 
E
K
 
A
Q
 
E
T
 
Y
Q
 
E
R
 
T
I
 
V
L
 
A
T
 
N
V
 
L
I
 
C
E
 
L
S
 
A
L
 
E
G
 
G
V
 
A
L
 
K
E
 
D
N
 
V
R
 
Y
V
 
I
A
 
V
N
 
D
T
 
T
F
 
V
E
 
E
E
 
R
S
 
K
E
 
D
E
 
S
I
 
V
W
 
W
K
 
S
I
 
A
R
 
R
R
 
G
A
 
A
V
 
F
S
 
L
P
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
K
K
 
A
L
 
S
G
 
T
P
 
T
D
 
E
K
 
M
Y
 
D
N
 
E
E
 
C
D
 
D
I
 
V
C
 
V
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
N
R
 
R
L
 
I
P
 
A
E
 
E
M
 
F
I
 
I
R
 
E
R
 
F
I
 
T
E
 
H
K
 
D
I
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
E
Y
 
M
N
 
D
L
 
V
P
 
R
I
 
I
V
 
P
N
 
S
F
 
F
G
 
G
H
|
H
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
L
H
|
H
V
 
I
N
 
Y
I
 
V
I
 
C
A
 
R
D
 
D
K
 
E
-
 
L
S
 
C
D
 
Q
A
 
A
E
 
D
Q
 
W
K
 
E
I
 
A
K
 
K
A
 
L
A
 
A
H
 
E
A
 
A
I
 
M
E
 
D
A
 
R
L
 
M
F
 
Y
R
 
A
A
 
K
T
 
A
I
 
L
E
 
T
L
 
F
G
 
E
G
 
G
T
 
L
M
 
V
S
 
S
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
Y
M
 
A
K
 
K
A
 
R
P
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
L
L
 
N
E
 
D
L
 
F
S
 
G
T
 
T
E
 
E
S
 
H
I
 
L
R
 
A
Y
 
L
M
 
M
K
 
A
I
 
G
L
 
I
K
 
K
K
 
Q
A
 
T
L
 
F
D
 
D
P
 
P
H
 
K
N
 
N
I
 
L
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
K
K
 
K
I
 
V

8jduA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketovaleric acid (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:455/455 of 8jduA

query
sites
8jduA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
N
L
 
G
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
|
H
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdsA Crystal structure of mldhd in complex with pyruvate (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:456/456 of 8jdsA

query
sites
8jdsA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
x
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
|
H
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdtA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketobutanoic acid (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:455/455 of 8jdtA

query
sites
8jdtA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
G
L
 
S
E
 
H
N
 
F
R
 
S
V
 
W
A
 
A
N
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
|
H
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdeA Crystal structure of mldhd in complex with d-lactate (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:455/455 of 8jdeA

query
sites
8jdeA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
G
L
 
S
E
 
H
N
 
F
R
 
S
V
 
W
A
 
A
N
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
A
E
 
E
S
 
K
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
|
H
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdpA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisovaleric acid (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:455/455 of 8jdpA

query
sites
8jdpA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
 
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
S
K
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
 
A
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdvA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketohexanoic acid (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:454/454 of 8jdvA

query
sites
8jdvA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
x
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
G
N
 
S
T
 
H
F
 
F
-
 
S
-
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
x
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
|
H
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdxA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisovaleric acid (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:455/455 of 8jdxA

query
sites
8jdxA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
x
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
-
 
A
C
 
C
L
 
N
R
 
R
Q
 
H
T
 
S
A
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
|
H
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdrA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxy-3-methyl- valeric acid (see paper)
33% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:456/456 of 8jdrA

query
sites
8jdrA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
x
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
 
A
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdqA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisocaproic acid (see paper)
33% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:456/456 of 8jdqA

query
sites
8jdqA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
 
A
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdoA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyhexanoic acid (see paper)
33% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:456/456 of 8jdoA

query
sites
8jdoA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
x
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
 
A
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdnA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyvaleric acid (see paper)
33% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:456/456 of 8jdnA

query
sites
8jdnA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
 
A
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdgA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxybutanoic acid (see paper)
33% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:456/456 of 8jdgA

query
sites
8jdgA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
 
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
 
A
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdbA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyoctanoic acid (see paper)
33% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:456/456 of 8jdbA

query
sites
8jdbA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
x
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
C
 
A
L
 
C
R
 
N
Q
 
R
T
 
H
A
 
S
G
 
K
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
P
R
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
x
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
 
A
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

P9WIT1 Uncharacterized FAD-linked oxidoreductase Rv2280; EC 1.-.-.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 4:459/469 of query aligns to 2:458/459 of P9WIT1

query
sites
P9WIT1
K
 
S
R
 
E
M
 
M
I
 
T
Q
 
A
E
 
R
F
 
F
K
 
S
E
 
E
I
 
I
C
 
V
G
 
G
S
 
N
E
 
A
F
 
N
V
 
L
S
 
L
S
 
T
D
 
G
K
 
D
A
 
A
-
 
I
-
 
P
N
 
E
R
 
D
I
 
Y
L
 
A
H
 
H
S
 
D
Y
 
E
D
 
E
A
 
L
T
 
T
R
 
G
K
 
P
Q
 
P
F
 
Q
L
 
K
P
 
P
D
 
A
I
 
Y
V
 
A
V
 
A
H
 
K
P
 
P
A
 
A
D
 
T
A
 
P
R
 
E
A
 
E
V
 
V
S
 
A
R
 
Q
I
 
L
M
 
L
T
 
K
L
 
A
A
 
A
H
 
S
H
 
E
H
 
N
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
Y
 
T
P
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
C
G
 
G
F
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
R
P
 
P
V
 
V
C
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
L
V
 
L
M
 
I
G
 
S
M
 
F
S
 
D
R
 
R
M
 
M
N
 
N
R
 
K
I
 
V
L
 
L
D
 
E
I
 
V
D
 
D
Q
 
T
E
 
A
N
 
N
L
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
A
T
 
L
G
 
T
D
 
D
F
 
L
Q
 
D
K
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
R
Y
 
Y
P
 
T
P
 
V
D
 
Y
P
 
P
A
 
G
S
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
-
S
 
S
S
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
G
E
 
T
C
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
M
R
 
R
C
 
A
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
A
K
 
R
D
 
H
Y
 
N
V
 
V
I
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
T
G
 
G
D
 
E
R
 
I
I
 
I
E
 
R
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
R
T
 
M
M
 
A
K
 
K
G
 
V
V
 
S
V
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
L
 
L
F
 
I
C
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
K
 
E
I
 
V
I
 
I
L
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
R
P
 
L
Q
 
D
A
 
H
K
 
N
K
 
A
T
 
S
M
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
P
F
 
F
D
 
A
A
 
D
I
 
F
D
 
D
G
 
Q
A
 
V
A
 
M
K
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
P
A
 
K
I
 
I
I
 
L
R
 
A
E
 
S
K
 
G
I
 
L
I
 
A
P
 
P
A
 
D
T
 
I
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
M
 
I
D
 
D
G
 
N
R
 
T
T
 
S
L
 
M
D
 
A
C
 
A
L
 
L
R
 
I
Q
 
S
T
 
T
A
 
Q
G
 
N
L
 
L
S
 
E
M
 
L
-
 
G
-
 
I
P
 
P
Q
 
D
A
 
Q
A
 
I
R
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
C
-
 
E
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
I
 
L
I
 
V
E
 
A
V
 
L
D
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
I
G
 
A
D
 
D
R
 
R
E
 
L
F
 
F
L
 
E
D
 
D
K
 
I
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
-
R
 
-
I
 
V
L
 
G
T
 
E
V
 
M
I
 
L
E
 
M
S
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
Y
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
G
R
 
G
V
 
S
A
 
A
N
 
R
T
 
K
F
 
L
E
 
I
E
 
E
S
 
A
E
 
R
E
 
E
-
 
K
-
 
A
I
 
F
W
 
W
K
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
A
L
 
A
R
 
K
K
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
A
D
 
D
K
 
D
Y
 
I
N
 
I
E
 
-
D
 
D
I
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
S
L
 
M
P
 
P
E
x
K
M
 
F
I
 
L
R
 
S
R
 
T
I
 
A
E
 
R
K
 
G
I
 
L
A
 
A
D
 
A
L
 
A
Y
 
A
N
 
D
L
 
G
P
 
A
I
 
A
V
 
V
N
 
G
F
 
C
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
V
H
 
H
V
 
M
N
 
A
I
 
I
I
 
A
A
 
C
D
 
K
K
 
D
S
 
P
D
 
E
A
 
K
E
 
K
Q
 
K
K
 
K
I
 
L
K
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
I
 
M
E
 
T
A
 
D
L
 
I
F
 
F
R
 
A
A
 
L
T
 
A
I
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
A
M
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
E
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
R
M
 
A
K
 
K
A
 
T
P
 
G
Y
 
Y
L
 
F
S
 
-
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
E
T
 
D
E
 
P
-
 
V
S
 
K
I
 
I
R
 
S
Y
 
L
M
 
M
K
 
R
I
 
R
L
 
I
K
 
K
K
 
Q
A
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
H
 
A
N
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
K
 
V
I
 
V
F
 
F
P
 
G
D
 
D

8jdzA Crystal structure of mldhd in complex with 2-keto-3-methylvaleric acid (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:454/454 of 8jdzA

query
sites
8jdzA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
x
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
-
 
A
C
 
C
L
 
N
R
 
R
Q
 
H
T
 
S
A
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
-
R
 
-
A
 
P
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
|
H
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
-
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

8jdyA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisocaproic acid (see paper)
34% identity, 97% coverage: 2:457/469 of query aligns to 1:454/454 of 8jdyA

query
sites
8jdyA
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
D
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
I
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
P
F
 
H
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
A
K
 
S
A
 
A
N
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
Q
H
 
H
S
 
G
Y
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
R
 
M
K
 
H
Q
 
R
F
 
C
L
 
Q
P
 
P
-
 
P
D
 
D
I
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
W
P
 
P
A
 
Q
D
 
N
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
S
 
S
R
 
R
I
 
V
M
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
H
 
N
H
 
Q
R
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
S
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
L
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
C
M
 
I
G
 
N
M
x
L
S
 
T
R
 
H
M
 
M
N
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
T
D
 
E
I
 
L
D
 
N
Q
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
V
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
G
 
K
D
 
A
F
 
L
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
V
 
L
E
 
R
A
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
P
 
V
D
 
D
P
|
P
A
x
G
S
x
A
L
 
-
K
 
-
V
 
D
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
E
x
T
C
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
C
 
A
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
M
K
 
R
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
P
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
L
I
 
L
E
 
H
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
T
 
Y
M
 
R
K
 
K
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
L
F
 
F
C
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
K
 
S
I
 
T
I
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
T
K
 
V
T
 
A
M
 
A
L
 
T
V
 
C
V
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
D
A
 
S
V
 
T
S
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
P
P
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
I
E
 
E
F
 
F
M
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
V
T
 
M
L
 
M
D
 
D
-
 
A
C
 
C
L
 
N
R
 
R
Q
 
H
T
 
S
A
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
N
M
 
C
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
-
R
 
-
A
 
P
A
 
T
L
 
L
I
 
F
I
 
L
E
 
E
V
 
F
D
 
H
G
 
G
D
 
S
R
 
Q
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
D
 
A
K
 
E
Q
 
Q
T
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
L
 
E
T
 
A
V
 
I
I
 
T
E
 
Q
S
 
D
L
 
N
G
 
G
V
 
-
L
 
-
E
 
G
N
 
S
R
 
H
V
 
F
A
 
S
N
 
W
T
 
A
F
 
A
E
 
E
E
 
K
S
 
R
E
 
N
E
 
E
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
A
R
|
R
R
 
H
A
 
N
V
 
A
S
x
W
P
 
Y
S
 
A
L
 
A
R
 
L
K
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
P
D
 
G
K
 
S
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
N
x
S
E
 
T
D
 
D
I
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
V
R
 
E
I
 
T
E
 
K
K
 
E
I
 
E
A
 
I
D
 
K
L
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
G
V
 
A
N
 
I
F
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
F
H
|
H
V
 
C
N
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
V
D
 
D
K
 
P
S
 
-
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
K
 
Q
I
 
R
K
 
R
A
 
V
A
 
K
H
 
A
A
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
C
S
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
V
S
 
G
T
 
P
E
 
V
S
 
G
I
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
K
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
L

3pm9A Crystal structure of a putative dehydrogenase (rpa1076) from rhodopseudomonas palustris cga009 at 2.57 a resolution
31% identity, 97% coverage: 2:456/469 of query aligns to 2:464/465 of 3pm9A

query
sites
3pm9A
I
 
L
S
 
S
K
 
P
R
 
E
M
 
L
I
 
I
Q
 
A
E
 
R
F
 
F
K
 
T
E
 
A
I
 
I
C
 
V
G
 
G
S
 
D
E
 
K
F
 
H
V
 
A
S
 
L
S
 
T
D
 
D
K
 
P
A
 
L
N
 
E
R
 
-
I
 
-
L
 
L
H
 
E
S
 
A
Y
 
Y
D
 
I
A
 
T
T
 
E
R
 
E
K
 
R
Q
 
N
F
 
L
L
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
H
P
 
S
D
 
P
I
 
L
V
 
V
V
 
L
H
 
R
P
 
P
A
 
G
D
 
S
A
 
T
R
 
E
A
 
E
V
 
V
S
 
V
R
 
A
I
 
I
M
 
C
T
 
K
L
 
L
A
 
A
H
 
N
H
 
E
H
 
A
R
 
R
I
 
V
P
 
A
V
 
L
Y
 
V
P
|
P
R
x
Q
G
|
G
S
x
G
G
x
N
T
|
T
G
|
G
F
x
L
T
 
V
G
 
G
G
|
G
A
x
Q
L
 
T
P
 
P
V
 
H
C
 
N
G
 
G
G
 
E
I
 
V
V
 
V
M
 
I
G
 
S
M
x
L
S
 
K
R
 
R
M
 
M
N
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
R
D
 
E
I
 
I
D
 
D
Q
 
T
E
 
S
N
 
S
L
 
N
V
 
T
A
 
I
V
 
T
V
 
V
E
 
E
P
 
A
G
 
G
V
 
A
V
 
I
T
 
L
G
 
Q
D
 
R
F
 
V
Q
 
Q
K
 
E
A
 
K
V
 
A
E
 
A
A
 
E
L
 
V
G
 
D
L
 
R
F
 
L
Y
 
F
P
 
P
P
 
L
D
 
S
P
x
L
A
x
G
S
x
A
L
 
Q
K
 
G
V
 
S
S
x
C
S
x
T
L
 
I
G
|
G
G
|
G
N
 
N
V
 
L
A
x
S
E
x
T
C
 
N
A
|
A
G
|
G
G
 
G
P
 
T
R
 
A
C
 
A
V
 
L
K
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
x
L
T
 
A
K
 
R
D
 
D
Y
 
M
V
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
A
T
 
D
G
 
G
D
 
R
R
 
V
I
 
M
E
 
N
T
 
L
G
 
L
G
 
S
T
 
K
T
 
L
M
 
K
K
 
K
G
 
D
V
 
N
V
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
T
 
R
K
 
D
L
 
L
F
 
F
C
 
I
G
 
G
S
 
A
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
x
I
I
|
I
T
 
T
K
 
A
I
 
A
I
 
T
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
Q
 
R
A
 
A
K
 
V
K
 
E
T
 
T
M
 
A
L
 
F
V
 
V
V
 
G
F
 
L
D
 
Q
A
 
S
I
 
P
D
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
L
S
 
G
A
 
I
I
 
A
I
 
Q
R
 
G
E
 
E
K
 
A
I
 
A
I
 
G
P
 
N
A
 
L
T
 
T
-
 
S
L
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
I
D
 
A
G
 
E
R
 
T
T
 
P
L
 
L
D
 
D
C
 
F
L
 
S
R
 
V
Q
 
R
T
 
H
A
 
A
G
 
N
L
 
N
S
 
R
M
 
D
P
 
P
Q
 
L
A
 
E
A
 
A
R
 
R
-
 
Y
-
 
P
A
 
W
A
 
Y
L
 
V
I
 
L
I
 
I
E
 
E
V
 
L
D
 
S
G
 
S
D
 
P
R
 
R
E
 
D
F
 
D
L
 
A
D
 
R
K
 
A
Q
 
A
T
 
L
Q
 
E
R
 
S
I
 
I
L
 
L
T
 
E
V
 
R
-
 
G
I
 
F
E
 
E
S
 
D
L
 
G
G
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
D
N
 
A
R
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
S
F
 
V
E
 
Q
E
 
Q
S
 
Q
E
 
Q
E
 
A
I
 
F
W
 
W
K
 
K
I
 
L
R
 
R
R
 
E
A
 
E
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
A
L
 
Q
R
 
K
K
 
P
L
 
E
G
 
G
P
 
-
D
 
G
K
 
S
Y
 
I
N
 
K
E
 
H
D
 
D
I
 
I
C
 
S
V
 
V
P
 
P
R
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
F
I
 
I
R
 
E
R
 
Q
I
 
A
E
 
N
K
 
A
-
 
A
-
 
V
I
 
V
A
 
A
D
 
L
L
 
I
Y
 
P
N
 
G
L
 
A
P
 
R
I
 
P
V
 
V
N
 
P
F
 
F
G
 
G
H
 
H
A
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
I
H
 
H
V
 
Y
N
 
N
I
 
V
I
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
V
-
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
S
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
E
Q
 
F
K
 
L
I
 
A
K
 
R
A
 
W
A
 
H
H
 
D
A
 
V
I
 
S
E
 
Q
A
 
V
L
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
V
T
 
V
I
 
L
E
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
S
M
 
I
S
 
S
G
 
A
E
|
E
H
 
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
V
M
 
M
K
 
K
A
 
R
P
 
D
Y
 
E
L
 
L
S
 
A
L
 
E
E
 
V
L
 
K
S
 
D
T
 
K
E
 
T
S
 
A
I
 
I
R
 
E
Y
 
L
M
 
M
K
 
R
I
 
S
L
 
I
K
 
K
K
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
H
N
 
G
I
 
I
L
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V

Q8N465 D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial; EC 1.1.99.39 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
30% identity, 90% coverage: 42:461/469 of query aligns to 102:521/521 of Q8N465

query
sites
Q8N465
I
 
V
V
 
L
V
 
L
H
 
R
P
 
P
A
 
R
D
 
T
A
x
S
R
 
E
A
 
E
V
 
V
S
 
S
R
 
H
I
 
I
M
 
L
T
 
R
L
 
H
A
 
C
H
 
H
H
 
E
H
 
R
R
 
N
I
 
L
P
 
A
V
 
V
Y
x
N
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
S
x
G
G
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
M
T
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
V
P
 
P
V
 
V
C
 
F
G
 
D
G
 
E
I
 
I
V
x
I
M
 
L
G
 
S
M
 
T
S
 
A
R
 
R
M
|
M
N
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
L
D
 
S
I
 
F
D
 
H
Q
 
S
E
 
V
N
 
S
L
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
V
 
C
E
x
Q
P
x
A
G
|
G
V
x
C
V
|
V
T
x
L
G
x
E
D
x
E
F
x
L
Q
x
S
K
x
R
A
x
Y
V
|
V
E
|
E
A
x
E
L
x
R
G
x
D
L
x
F
F
x
I
Y
x
M
P
|
P
P
x
L
D
|
D
P
x
L
A
x
G
S
x
A
L
x
K
K
x
G
V
x
S
S
x
C
S
x
H
L
x
I
G
|
G
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
|
A
E
x
T
C
x
N
A
|
A
G
|
G
G
|
G
P
x
L
R
|
R
C
x
F
V
x
L
K
x
R
Y
|
Y
G
|
G
V
x
S
T
x
L
K
x
H
D
x
G
Y
x
T
V
|
V
I
x
L
G
|
G
L
|
L
E
|
E
V
|
V
V
|
V
T
x
L
P
x
A
T
x
D
G
|
G
D
x
T
R
x
V
I
x
L
E
x
D
T
x
C
G
x
L
G
x
T
T
x
S
T
x
L
M
x
R
K
|
K
G
x
D
V
x
N
V
x
T
G
|
G
Y
|
Y
D
|
D
L
|
L
T
x
K
K
x
Q
L
|
L
F
|
F
C
x
I
G
|
G
S
|
S
E
|
E
G
|
G
T
|
T
L
|
L
A
x
G
V
x
I
I
|
I
T
|
T
K
x
T
I
x
V
I
x
S
L
x
I
K
x
L
L
x
C
L
x
P
P
|
P
K
|
K
P
|
P
Q
x
R
A
|
A
K
x
V
K
x
N
T
 
-
M
 
-
L
 
-
V
|
V
V
x
A
F
|
F
D
x
L
A
x
G
I
x
C
D
x
P
G
|
G
A
x
F
A
|
A
K
x
E
A
x
V
V
x
L
S
x
Q
A
x
T
I
x
F
I
x
S
R
x
T
E
x
C
K
|
K
-
x
G
-
x
M
-
x
L
-
x
G
I
x
E
I
|
I
P
x
L
A
x
S
T
x
A
L
x
F
E
|
E
F
|
F
M
|
M
D
|
D
G
x
A
R
x
V
T
x
C
L
x
M
D
x
Q
C
x
L
L
x
V
R
x
G
Q
x
R
T
x
H
A
x
L
G
x
H
L
|
L
S
x
A
M
x
S
P
|
P
-
x
V
Q
|
Q
A
x
E
A
x
S
R
x
P
A
x
F
A
x
Y
L
x
V
I
x
L
I
|
I
E
|
E
V
x
T
D
x
S
G
|
G
D
x
S
R
x
N
E
x
A
F
x
G
L
x
H
D
|
D
-
x
A
-
x
E
K
|
K
Q
x
L
T
x
G
Q
x
H
R
x
F
I
x
L
L
x
E
T
x
H
V
x
A
I
x
L
E
x
G
S
|
S
L
x
G
G
x
L
V
|
V
L
x
T
E
x
D
N
x
G
R
x
T
V
x
M
A
|
A
N
x
T
T
x
D
F
x
Q
E
x
R
E
x
K
S
x
V
E
x
K
E
x
M
I
x
L
W
|
W
K
x
A
I
x
L
R
|
R
R
x
E
A
x
R
V
x
I
S
x
T
P
x
E
S
x
A
L
|
L
R
x
S
K
x
R
L
x
D
G
|
G
P
 
-
D
x
Y
K
x
V
Y
|
Y
N
x
K
E
x
Y
D
|
D
I
x
L
C
x
S
V
x
L
P
|
P
R
x
V
A
x
E
R
|
R
L
|
L
P
x
Y
E
x
D
M
x
I
I
x
V
R
x
T
R
x
D
I
x
L
E
x
R
K
x
A
I
x
R
A
x
L
D
x
G
L
x
P
Y
x
H
N
x
A
L
x
K
P
x
H
I
x
V
V
|
V
N
x
G
F
x
Y
G
|
G
H
|
H
A
x
L
G
|
G
D
|
D
G
|
G
N
|
N
I
x
L
H
|
H
V
x
L
N
|
N
I
x
V
I
x
T
A
|
A
D
 
-
K
 
-
S
 
-
D
x
E
A
|
A
E
x
F
Q
x
S
K
x
P
I
x
S
K
x
L
A
x
L
A
|
A
H
x
A
A
x
L
I
x
E
E
x
P
A
x
H
L
x
V
F
x
Y
R
x
E
A
x
W
T
|
T
I
x
A
E
x
G
L
x
Q
G
x
Q
G
|
G
T
x
S
M
x
V
S
|
S
G
x
A
E
|
E
H
|
H
G
|
G
V
|
V
G
|
G
I
x
F
M
x
R
K
|
K
A
x
R
P
x
D
Y
x
V
L
|
L
S
x
G
L
x
Y
E
x
S
L
x
K
S
x
P
T
x
P
E
x
G
S
x
A
I
x
L
R
x
Q
Y
x
L
M
|
M
K
x
Q
I
x
Q
L
|
L
K
|
K
K
x
A
A
x
L
L
|
L
D
|
D
P
|
P
H
x
K
N
x
G
I
|
I
L
|
L
N
|
N
P
|
P
G
x
Y
K
|
K
I
x
T
F
x
L
P
|
P
D
x
S
A
x
Q
A
|
A

Sites not aligning to the query:

6lpnB Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in apo form (see paper)
30% identity, 89% coverage: 42:459/469 of query aligns to 50:467/467 of 6lpnB

query
sites
6lpnB
I
 
V
V
 
L
V
 
L
H
 
R
P
 
P
A
 
R
D
 
T
A
 
S
R
 
E
A
 
E
V
 
V
S
 
S
R
 
H
I
 
I
M
 
L
T
 
R
L
 
H
A
 
C
H
 
H
H
 
E
H
 
R
R
 
N
I
 
L
P
 
A
V
 
V
Y
 
N
P
|
P
R
 
Q
G
|
G
S
x
G
G
x
N
T
|
T
G
|
G
F
x
M
T
 
V
G
 
G
G
|
G
A
x
S
L
 
V
P
 
P
V
 
V
C
 
F
G
 
D
G
 
E
I
 
I
V
 
I
M
 
L
G
 
S
M
 
T
S
 
A
R
 
R
M
 
M
N
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
L
D
 
S
I
 
F
D
 
H
Q
 
S
E
 
V
N
 
S
L
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
V
 
C
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
T
 
L
G
 
E
D
 
E
F
 
L
Q
 
S
K
 
R
A
 
Y
V
 
V
E
 
E
A
 
E
L
 
R
G
 
D
L
 
F
F
 
I
Y
 
M
P
 
P
P
 
L
D
 
D
P
x
L
A
 
G
S
x
A
L
 
K
K
 
G
V
 
S
S
x
C
S
x
H
L
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
V
 
V
A
|
A
E
x
T
C
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
L
R
 
R
C
 
F
V
 
L
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
S
T
 
L
K
 
H
D
 
G
Y
 
T
V
 
V
I
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
P
 
A
T
 
D
G
 
G
D
 
T
R
 
V
I
 
L
E
 
D
T
 
C
G
 
L
G
 
T
T
 
S
T
 
L
M
 
R
K
 
K
G
 
D
V
 
N
V
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
T
 
K
K
 
Q
L
 
L
F
 
F
C
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
A
 
G
V
x
I
I
|
I
T
 
T
K
 
T
I
 
V
I
 
S
L
 
I
K
 
L
L
 
C
L
 
P
P
 
P
K
 
K
P
 
P
Q
 
R
A
 
A
K
 
V
K
 
N
T
 
-
M
 
-
L
 
-
V
 
V
V
 
A
F
 
F
D
 
L
A
 
G
I
 
C
D
 
P
G
 
G
A
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
V
V
 
L
S
 
Q
A
 
T
I
 
F
I
 
S
R
 
T
E
 
C
K
 
K
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
G
I
 
E
I
 
I
P
 
L
A
 
S
T
 
A
L
 
F
E
 
E
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
A
R
 
V
T
 
C
L
 
M
D
 
Q
C
 
L
L
 
V
R
 
G
Q
 
R
T
 
H
A
 
L
G
 
H
L
 
L
S
 
A
M
 
S
P
 
P
-
 
V
Q
 
Q
A
 
E
A
 
S
R
 
P
A
 
F
A
 
Y
L
 
V
I
 
L
I
 
I
E
 
E
V
 
T
D
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
N
E
 
A
F
 
G
L
 
H
D
 
D
-
 
A
-
 
E
K
 
K
Q
 
L
T
 
G
Q
 
H
R
 
F
I
 
L
L
 
E
T
 
H
V
 
A
I
 
L
E
 
G
S
 
S
L
 
G
G
 
L
V
 
V
L
 
T
E
 
D
N
 
G
R
 
T
V
 
M
A
 
A
N
 
T
T
 
D
F
 
Q
E
 
R
E
 
K
S
 
V
E
 
K
E
 
M
I
 
L
W
 
W
K
 
A
I
 
L
R
 
R
R
 
E
A
 
R
V
 
I
S
 
T
P
 
E
S
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
R
L
 
D
G
 
G
P
 
-
D
 
Y
K
 
V
Y
 
Y
N
 
K
E
 
Y
D
 
D
I
 
L
C
 
S
V
 
L
P
 
P
R
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
Y
E
 
D
M
 
I
I
 
V
R
 
T
R
 
D
I
 
L
E
 
R
K
 
A
I
 
R
A
 
L
D
 
G
L
 
P
Y
 
H
N
 
A
L
 
K
P
 
H
I
 
V
V
 
V
N
 
G
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
I
 
L
H
 
H
V
 
L
N
 
N
I
 
V
I
 
T
A
 
A
D
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
A
E
 
F
Q
 
S
K
 
P
I
 
S
K
 
L
A
 
L
A
 
A
H
 
A
A
 
L
I
 
E
E
 
P
A
 
H
L
 
V
F
 
Y
R
 
E
A
 
W
T
 
T
I
 
A
E
 
G
L
 
Q
G
 
Q
G
 
G
T
 
S
M
 
V
S
 
S
G
 
A
E
|
E
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
F
M
 
R
K
 
K
A
 
R
P
 
D
Y
 
V
L
 
L
S
 
G
L
 
Y
E
 
S
L
 
K
S
 
P
T
 
P
E
 
G
S
 
A
I
 
L
R
 
Q
Y
 
L
M
 
M
K
 
Q
I
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
K
N
 
G
I
 
I
L
 
L
N
|
N
P
 
P
G
 
Y
K
 
K
I
 
T
F
 
L
P
 
P
D
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_035239519.1 NCBI__GCF_000745975.1:WP_035239519.1
MISKRMIQEFKEICGSEFVSSDKANRILHSYDATRKQFLPDIVVHPADARAVSRIMTLAH
HHRIPVYPRGSGTGFTGGALPVCGGIVMGMSRMNRILDIDQENLVAVVEPGVVTGDFQKA
VEALGLFYPPDPASLKVSSLGGNVAECAGGPRCVKYGVTKDYVIGLEVVTPTGDRIETGG
TTMKGVVGYDLTKLFCGSEGTLAVITKIILKLLPKPQAKKTMLVVFDAIDGAAKAVSAII
REKIIPATLEFMDGRTLDCLRQTAGLSMPQAARAALIIEVDGDREFLDKQTQRILTVIES
LGVLENRVANTFEESEEIWKIRRAVSPSLRKLGPDKYNEDICVPRARLPEMIRRIEKIAD
LYNLPIVNFGHAGDGNIHVNIIADKSDAEQKIKAAHAIEALFRATIELGGTMSGEHGVGI
MKAPYLSLELSTESIRYMKILKKALDPHNILNPGKIFPDAACPPPGEME

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory