SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_035241316.1 NCBI__GCF_000745975.1:WP_035241316.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 3 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9I2Y2 Phosphoserine phosphatase ThrH; PSP; PSPase; EC 3.1.3.3 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
55% identity, 96% coverage: 1:192/201 of query aligns to 1:192/205 of Q9I2Y2

query
sites
Q9I2Y2
M
 
M
K
 
E
I
 
I
L
 
A
V
 
C
A
 
L
D
|
D
L
 
L
E
|
E
G
 
G
V
 
V
F
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
A
V
 
F
A
 
A
K
 
E
K
 
K
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
A
T
 
T
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
P
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
T
 
K
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
R
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
H
 
H
H
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
L
K
 
G
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
G
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
T
L
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
V
Q
 
E
M
 
F
L
 
V
D
 
D
W
 
W
I
 
L
R
 
R
K
 
E
Q
 
R
T
 
F
Q
 
Q
I
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
F
 
F
E
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
M
 
M
E
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
C
H
 
H
N
 
K
L
 
L
T
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
D
T
 
S
N
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
Y
N
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
Q
D
 
K
N
 
D
Q
 
P
K
 
K
A
 
R
R
 
Q
A
 
S
V
 
V
N
 
I
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
G
 
S
L
 
L
N
 
Y
Y
 
Y
H
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
T
 
T
G
 
T
M
 
M
I
 
L
L
 
S
A
 
E
A
 
A
D
 
H
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
F
 
L
F
 
F
K
 
H
P
 
A
P
 
P
D
 
E
S
 
N
I
 
V
T
 
I
E
 
R
D
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
Q
I
 
F
P
 
P
I
 
A
T
 
V
R
 
H
S
 
T
Y
 
Y
D
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
K

1rkvA Structure of phosphate complex of thrh from pseudomonas aeruginosa (see paper)
55% identity, 96% coverage: 1:192/201 of query aligns to 2:193/206 of 1rkvA

query
sites
1rkvA
M
 
M
K
 
E
I
 
I
L
 
A
V
 
C
A
 
L
D
|
D
L
 
L
E
|
E
G
 
G
V
 
V
F
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
A
V
 
F
A
 
A
K
 
E
K
 
K
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
A
T
 
T
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
P
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
T
 
K
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
R
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
H
 
H
H
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
L
K
 
G
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
G
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
T
L
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
V
Q
 
E
M
 
F
L
 
V
D
 
D
W
 
W
I
 
L
R
 
R
K
 
E
Q
 
R
T
 
F
Q
 
Q
I
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
|
S
D
|
D
T
 
T
F
 
F
E
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
M
 
M
E
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
C
H
 
H
N
 
K
L
 
L
T
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
D
T
 
S
N
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
Y
N
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
Q
D
 
K
N
 
D
Q
 
P
K
|
K
A
 
R
R
 
Q
A
 
S
V
 
V
N
 
I
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
G
 
S
L
 
L
N
 
Y
Y
 
Y
H
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
T
 
T
G
 
T
M
 
M
I
 
L
L
 
S
A
 
E
A
 
A
D
 
H
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
F
 
L
F
 
F
K
 
H
P
 
A
P
 
P
D
 
E
S
 
N
I
 
V
T
 
I
E
 
R
D
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
Q
I
 
F
P
 
P
I
 
A
T
 
V
R
 
H
S
 
T
Y
 
Y
D
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
K

1rkuA Crystal structure of thrh gene product of pseudomonas aeruginosa (see paper)
55% identity, 96% coverage: 1:192/201 of query aligns to 2:193/206 of 1rkuA

query
sites
1rkuA
M
 
M
K
 
E
I
 
I
L
 
A
V
 
C
A
 
L
D
|
D
L
 
L
E
|
E
G
 
G
V
 
V
F
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
A
V
 
F
A
 
A
K
 
E
K
 
K
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
A
T
 
T
T
 
T
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
P
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
T
 
K
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
R
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
H
 
H
H
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
L
K
 
G
D
 
D
I
 
I
Q
 
Q
G
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
T
L
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
V
Q
 
E
M
 
F
L
 
V
D
 
D
W
 
W
I
 
L
R
 
R
K
 
E
Q
 
R
T
 
F
Q
 
Q
I
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
F
 
F
E
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
M
 
M
E
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
C
H
 
H
N
 
K
L
 
L
T
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
D
T
 
S
N
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
Y
N
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
Q
D
 
K
N
 
D
Q
 
P
K
 
K
A
 
R
R
 
Q
A
 
S
V
 
V
N
 
I
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
G
 
S
L
 
L
N
 
Y
Y
 
Y
H
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
T
 
T
G
 
T
M
 
M
I
 
L
L
 
S
A
 
E
A
 
A
D
 
H
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
F
 
L
F
 
F
K
 
H
P
 
A
P
 
P
D
 
E
S
 
N
I
 
V
T
 
I
E
 
R
D
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
Q
I
 
F
P
 
P
I
 
A
T
 
V
R
 
H
S
 
T
Y
 
Y
D
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
K

Query Sequence

>WP_035241316.1 NCBI__GCF_000745975.1:WP_035241316.1
MKILVADLEGVFLPEIWINVAKKTGIEELKLTTRDISDYDVLMTKRLSILDEHHLTLKDI
QGVIAGLEPLDGAKQMLDWIRKQTQIIILSDTFEEFAGPLMEKLGFPALLCHNLTVDATN
RITGYNLRIDNQKARAVNALQGLNYHVIAFGDSYNDTGMILAADQGFFFKPPDSITEDFP
DIPITRSYDELKVMLTNLLAN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory