SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_037571613.1 NCBI__GCF_000744815.1:WP_037571613.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4iv6B X-ray crystal structure of an isovaleryl-coa dehydrogenase from mycobacterium smegmatis (see paper)
48% identity, 96% coverage: 12:400/407 of query aligns to 2:376/383 of 4iv6B

query
sites
4iv6B
L
 
L
T
 
T
E
 
A
V
 
E
Q
 
E
R
 
E
D
 
T
I
 
I
L
 
V
A
 
K
T
 
T
V
 
V
R
 
H
D
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
E
K
 
K
E
 
Q
I
 
V
I
 
K
P
 
P
V
 
V
A
 
V
T
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
A
D
 
N
E
 
T
Y
 
Y
P
 
P
T
 
E
K
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
G
 
T
M
 
M
K
 
K
E
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
I
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
A
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
F
L
 
G
G
 
A
E
 
V
S
 
S
L
 
M
L
 
P
T
 
C
Y
 
Y
A
 
V
L
 
Q
V
 
V
V
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
G
W
 
W
M
 
M
S
 
S
V
 
L
S
 
A
G
 
G
I
 
A
V
 
M
N
 
G
T
 
G
H
 
H
F
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
S
H
 
K
M
 
L
I
 
L
N
 
L
A
 
L
H
 
F
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
E
 
Q
Y
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
R
 
R
G
 
A
A
 
T
F
 
M
S
 
A
M
x
L
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
L
x
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
I
 
M
R
 
R
T
 
T
K
 
V
A
 
A
V
 
R
Q
 
R
D
 
D
G
 
G
E
 
D
G
 
-
G
 
-
D
 
D
W
 
Y
V
 
V
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
T
W
|
W
L
x
I
T
x
S
N
 
N
G
 
A
G
 
R
S
 
R
S
 
S
T
 
D
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
C
H
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
D
N
 
A
T
 
Q
A
 
P
A
 
A
H
 
H
R
 
K
N
 
G
M
 
V
T
 
S
T
 
I
F
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
E
K
 
K
E
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
D
E
 
V
N
 
S
E
 
R
K
 
D
V
 
L
P
 
P
G
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
K
M
 
L
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
E
T
 
S
T
 
C
E
 
E
L
 
L
V
 
N
L
 
F
Q
 
T
D
 
D
V
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
V
D
 
S
R
 
S
V
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
D
A
 
D
S
 
E
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
Y
 
A
Q
 
Q
M
 
M
M
 
M
D
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
V
 
V
G
|
G
R
 
R
V
 
L
N
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
A
C
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
D
G
 
A
I
 
L
A
 
R
Y
 
Y
A
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
R
|
R
E
 
E
T
x
S
F
|
F
G
 
G
K
 
K
K
 
P
I
|
I
A
 
W
Q
 
Q
H
|
H
Q
 
Q
A
 
S
I
x
V
Q
 
G
F
 
N
K
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
M
A
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
E
 
Y
A
 
A
A
 
A
H
 
R
Q
 
S
M
 
L
M
 
L
V
 
L
M
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
K
K
 
F
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
N
 
C
D
 
D
L
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
L
L
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Y
 
T
C
 
A
K
 
M
E
 
Q
V
 
I
V
 
A
E
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
|
R
I
x
V
H
 
H
G
 
G
G
|
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
Y
S
 
S
K
 
T
E
 
E
Y
 
Y
E
 
D
I
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
Y
Y
 
F
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
P
M
x
L
L
 
M
L
 
I
I
 
V
G
|
G
E
|
E
G
 
G
T
|
T
A
 
N
E
|
E
I
|
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
N
I
 
V
V
 
I
G
 
A
R
x
K
R
 
Q
L
 
L
L
 
V

6es9A Methylsuccinyl-coa dehydrogenase of paracoccus denitrificans with bound flavin adenine dinucleotide (see paper)
42% identity, 96% coverage: 11:401/407 of query aligns to 160:545/545 of 6es9A

query
sites
6es9A
G
 
G
L
 
L
T
 
D
E
 
E
V
 
D
Q
 
L
R
 
E
D
 
M
I
 
I
L
 
R
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
R
 
R
D
 
R
F
 
Y
V
 
A
D
 
E
K
 
E
E
 
R
I
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
N
A
 
A
T
 
H
E
 
E
L
 
W
E
 
H
H
 
L
R
 
K
D
 
D
E
 
Q
Y
 
L
-
 
I
P
 
P
T
 
M
K
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
G
 
E
M
 
L
K
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
L
S
 
S
L
 
K
L
 
A
T
 
S
Y
 
M
A
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
S
R
 
R
G
 
G
W
 
Y
M
 
I
S
 
G
V
 
V
S
 
G
G
 
S
I
 
L
V
 
G
N
 
T
T
 
R
H
 
S
F
 
E
I
 
I
V
 
A
A
 
A
H
 
E
M
 
L
I
 
I
N
 
L
A
 
C
H
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
E
 
A
Q
 
Q
K
 
K
E
 
A
Y
 
K
F
 
W
L
 
L
P
 
P
R
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
R
 
L
G
 
S
A
 
T
F
x
A
S
 
V
M
x
F
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
N
L
 
T
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
L
A
 
G
A
 
S
I
 
L
R
 
R
T
 
T
K
 
R
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
-
G
 
-
D
 
D
W
 
W
V
 
V
V
 
V
N
 
T
G
 
G
Q
 
N
K
 
K
M
 
T
W
|
W
L
x
I
T
|
T
N
 
H
G
 
A
G
 
Q
S
 
R
S
 
T
T
 
H
L
 
V
V
 
M
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
T
D
 
D
E
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
E
N
 
T
T
 
T
A
 
D
A
 
-
H
 
W
R
 
R
N
 
G
M
 
L
T
 
S
T
 
M
F
 
F
L
 
L
I
 
A
E
 
E
K
 
K
E
 
E
P
 
P
G
 
G
F
 
T
G
 
D
E
 
D
N
 
D
E
 
P
-
 
F
K
 
P
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
-
P
 
G
G
 
G
K
 
E
I
 
I
E
 
E
K
 
V
M
 
L
G
 
G
Y
 
Y
K
 
R
G
 
G
V
 
M
D
 
K
T
x
E
T
 
Y
E
 
E
L
 
L
V
 
G
L
 
F
Q
 
D
D
 
G
V
 
F
R
 
R
V
 
I
P
 
K
A
 
G
D
 
E
R
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
E
S
 
P
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
Y
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
M
D
 
E
G
 
T
V
 
F
E
 
E
V
 
S
G
x
A
R
 
R
V
 
I
N
 
Q
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
R
 
S
A
 
A
F
 
A
E
 
E
L
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
V
Q
 
D
R
|
R
E
 
K
T
x
Q
F
|
F
G
 
G
K
 
K
K
 
S
I
x
L
A
 
I
Q
 
E
H
x
F
Q
 
P
A
 
R
I
 
V
Q
 
A
F
 
D
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
M
M
 
M
A
 
A
T
 
V
K
 
E
V
 
I
E
 
M
A
 
I
A
 
A
H
 
R
Q
 
Q
M
 
L
M
 
T
V
 
Y
M
x
F
A
 
S
A
 
A
R
x
W
K
 
E
K
 
K
D
 
D
S
 
H
G
 
G
E
 
R
R
 
R
N
 
C
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
A
E
 
R
Y
 
V
C
 
A
K
 
W
E
 
A
V
 
A
V
 
A
E
 
D
D
 
N
A
 
A
F
 
L
R
x
Q
I
|
I
H
 
H
G
|
G
G
|
G
Y
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
L
E
 
E
Y
 
Y
E
 
A
I
 
I
E
 
S
R
 
R
L
 
V
Y
 
L
R
 
C
E
 
D
A
 
A
P
 
R
M
 
I
L
 
L
L
 
N
I
 
I
G
x
F
E
 
E
G
 
G
T
x
A
A
 
A
E
|
E
I
|
I
Q
 
Q
K
 
A
M
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
A
R
|
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
D

Sites not aligning to the query:

2a1tC Structure of the human mcad:etf e165betaa complex (see paper)
40% identity, 97% coverage: 12:404/407 of query aligns to 8:387/388 of 2a1tC

query
sites
2a1tC
L
 
F
T
 
T
E
 
E
V
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
D
 
E
I
 
F
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
K
F
 
F
V
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
D
H
 
K
R
 
T
D
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
T
 
V
K
 
P
I
 
L
V
 
I
E
 
R
G
 
R
M
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
N
L
 
T
T
 
H
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
N
F
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
L
S
 
G
L
 
T
L
 
F
T
 
D
Y
 
A
A
 
C
L
 
L
V
 
I
V
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
G
 
G
W
 
C
M
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
Q
G
 
T
I
 
A
V
 
I
N
 
E
T
 
G
H
 
N
F
 
S
I
 
L
V
 
G
A
 
Q
H
 
M
M
 
P
I
 
I
N
 
I
A
 
I
H
 
A
G
 
G
T
 
N
Q
 
D
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
E
 
K
Y
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
G
R
 
R
M
 
M
A
 
T
A
 
E
G
 
E
E
 
P
V
 
L
R
 
M
G
 
C
A
 
A
F
x
Y
S
 
C
M
x
V
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
D
 
K
G
 
G
E
 
D
G
 
-
G
 
-
D
 
E
W
 
Y
V
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
|
Q
K
 
K
M
 
M
W
|
W
L
x
I
T
|
T
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
K
S
 
A
T
 
N
L
 
W
V
 
Y
A
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
S
D
 
D
E
 
P
G
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
N
 
-
T
 
A
A
 
P
A
 
A
H
 
N
R
 
K
N
 
A
M
 
F
T
 
T
T
 
G
F
 
F
L
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I
T
 
Q
V
 
I
P
 
G
G
 
R
K
 
K
I
 
E
E
 
L
K
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
Q
K
 
R
G
 
C
V
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
R
E
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
E
R
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
-
S
 
D
G
 
G
R
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
K
Q
 
V
M
 
A
M
 
M
D
 
G
G
 
A
V
 
F
E
 
D
V
 
K
G
x
T
R
 
R
V
 
P
N
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
G
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
D
L
 
E
G
 
A
I
 
T
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
L
Q
 
E
R
|
R
E
 
K
T
|
T
F
|
F
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
x
L
A
 
V
Q
 
E
H
|
H
Q
 
Q
A
 
A
I
|
I
Q
 
S
F
 
F
K
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
T
 
M
K
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
A
H
 
R
Q
 
M
M
 
S
M
 
Y
V
 
Q
M
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
W
K
 
E
K
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
R
 
R
N
 
N
D
 
T
L
 
Y
E
 
Y
A
 
A
G
 
S
M
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
G
E
 
D
Y
 
I
C
 
A
K
 
N
E
 
Q
V
 
L
V
 
A
E
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
x
Q
I
|
I
H
 
L
G
 
G
G
|
G
Y
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
N
K
 
T
E
 
E
Y
 
Y
E
 
P
I
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
M
x
I
L
 
Y
L
 
Q
I
 
I
G
 
Y
E
|
E
G
 
G
T
|
T
A
 
S
E
x
Q
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
A
R
|
R
R
 
E
L
 
H
L
 
I
E
 
D
E
 
K
Y
 
Y
R
 
K

3mdeA Crystal structures of medium chain acyl-coa dehydrogenase from pig liver mitochondria with and without substrate (see paper)
40% identity, 97% coverage: 12:404/407 of query aligns to 6:385/385 of 3mdeA

query
sites
3mdeA
L
 
L
T
 
T
E
 
E
V
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
D
 
E
I
 
F
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
K
F
 
F
V
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
D
H
 
R
R
 
T
D
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
T
 
V
K
 
P
I
 
L
V
 
L
E
 
K
G
 
R
M
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
N
L
 
T
T
 
H
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
L
S
 
G
L
 
I
L
 
I
T
 
D
Y
 
S
A
 
C
L
 
L
V
 
I
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
G
 
G
W
 
C
M
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
Q
G
x
T
I
 
A
V
 
I
N
x
E
T
 
A
H
 
N
F
 
T
I
x
L
V
 
G
A
 
Q
H
 
V
M
 
P
I
 
L
N
 
I
A
 
I
H
 
G
G
 
G
T
 
N
Q
 
Y
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
K
Y
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
G
R
 
R
M
 
M
A
 
T
A
 
E
G
 
E
E
 
P
V
 
L
R
 
M
G
 
C
A
 
A
F
x
Y
S
 
C
M
x
V
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
|
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
D
 
K
G
 
G
E
 
D
G
 
-
G
 
-
D
 
E
W
 
Y
V
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
W
|
W
L
x
I
T
|
T
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
K
S
 
A
T
 
N
L
 
W
V
 
Y
A
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
S
D
 
D
E
 
P
G
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
N
 
-
T
 
A
A
 
P
A
 
A
H
x
S
R
 
K
N
 
A
M
 
F
T
 
T
T
 
G
F
 
F
L
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
V
T
 
Q
V
 
I
P
 
G
G
 
R
K
 
K
I
 
E
E
 
I
K
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
Q
K
 
R
G
 
C
V
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
R
E
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
E
R
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
G
A
 
-
S
 
E
G
 
G
R
 
A
G
 
G
F
|
F
Y
 
K
Q
 
I
M
 
A
M
|
M
D
 
G
G
 
T
V
x
F
E
 
D
V
 
K
G
x
T
R
 
R
V
 
P
N
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
G
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
D
L
 
E
G
 
A
I
 
T
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
L
Q
 
E
R
|
R
E
 
K
T
|
T
F
|
F
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
x
L
A
 
A
Q
 
E
H
|
H
Q
 
Q
A
 
G
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
K
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
M
A
 
A
T
 
M
K
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
A
H
 
R
Q
 
L
M
 
S
M
 
Y
V
 
Q
M
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
W
K
 
E
K
 
I
D
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
R
|
R
N
 
N
D
 
T
L
 
Y
E
 
Y
A
 
A
G
 
S
M
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
L
 
Y
A
 
A
S
 
A
E
 
D
Y
 
I
C
 
A
K
 
N
E
 
Q
V
 
L
V
 
A
E
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
x
Q
I
x
V
H
 
F
G
 
G
G
|
G
Y
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
N
K
 
T
E
 
E
Y
 
Y
E
 
P
I
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
M
x
I
L
 
Y
L
 
Q
I
 
I
G
x
Y
E
|
E
G
|
G
T
|
T
A
 
A
E
x
Q
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
A
R
|
R
R
 
E
L
 
H
L
 
I
E
 
G
E
 
R
Y
 
Y
R
 
K

3mddA Crystal structures of medium chain acyl-coa dehydrogenase from pig liver mitochondria with and without substrate (see paper)
40% identity, 97% coverage: 12:404/407 of query aligns to 6:385/385 of 3mddA

query
sites
3mddA
L
 
L
T
 
T
E
 
E
V
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
D
 
E
I
 
F
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
K
F
 
F
V
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
D
H
 
R
R
 
T
D
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
T
 
V
K
 
P
I
 
L
V
 
L
E
 
K
G
 
R
M
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
N
L
 
T
T
 
H
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
L
S
 
G
L
 
I
L
 
I
T
 
D
Y
 
S
A
 
C
L
 
L
V
 
I
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
G
 
G
W
 
C
M
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
Q
G
 
T
I
 
A
V
 
I
N
 
E
T
 
A
H
 
N
F
 
T
I
 
L
V
 
G
A
 
Q
H
 
V
M
 
P
I
 
L
N
 
I
A
 
I
H
 
G
G
 
G
T
 
N
Q
 
Y
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
K
Y
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
G
R
 
R
M
 
M
A
 
T
A
 
E
G
 
E
E
 
P
V
 
L
R
 
M
G
 
C
A
 
A
F
x
Y
S
 
C
M
x
V
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
D
 
K
G
 
G
E
 
D
G
 
-
G
 
-
D
 
E
W
 
Y
V
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
W
|
W
L
 
I
T
|
T
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
K
S
 
A
T
 
N
L
 
W
V
 
Y
A
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
S
D
 
D
E
 
P
G
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
N
 
-
T
 
A
A
 
P
A
 
A
H
 
S
R
 
K
N
 
A
M
 
F
T
 
T
T
 
G
F
 
F
L
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
V
T
 
Q
V
 
I
P
 
G
G
 
R
K
 
K
I
 
E
E
 
I
K
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
Q
K
 
R
G
 
C
V
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
R
E
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
E
R
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
G
A
 
-
S
 
E
G
 
G
R
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
K
Q
 
I
M
 
A
M
 
M
D
 
G
G
 
T
V
 
F
E
 
D
V
 
K
G
x
T
R
 
R
V
 
P
N
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
G
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
D
L
 
E
G
 
A
I
 
T
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
L
Q
 
E
R
|
R
E
 
K
T
|
T
F
|
F
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
|
H
Q
 
Q
A
 
G
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
K
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
M
A
 
A
T
 
M
K
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
A
H
 
R
Q
 
L
M
 
S
M
 
Y
V
 
Q
M
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
W
K
 
E
K
 
I
D
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
R
 
R
N
 
N
D
 
T
L
 
Y
E
 
Y
A
 
A
G
 
S
M
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
L
 
Y
A
 
A
S
 
A
E
 
D
Y
 
I
C
 
A
K
 
N
E
 
Q
V
 
L
V
 
A
E
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
x
Q
I
x
V
H
 
F
G
 
G
G
|
G
Y
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
N
K
 
T
E
 
E
Y
 
Y
E
 
P
I
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
M
x
I
L
 
Y
L
 
Q
I
 
I
G
 
Y
E
|
E
G
 
G
T
|
T
A
 
A
E
x
Q
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
A
R
|
R
R
 
E
L
 
H
L
 
I
E
 
G
E
 
R
Y
 
Y
R
 
K

1udyA Medium-chain acyl-coa dehydrogenase with 3-thiaoctanoyl-coa (see paper)
40% identity, 97% coverage: 12:404/407 of query aligns to 6:385/385 of 1udyA

query
sites
1udyA
L
 
L
T
 
T
E
 
E
V
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
D
 
E
I
 
F
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
K
F
 
F
V
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
D
H
 
R
R
 
T
D
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
T
 
V
K
 
P
I
 
L
V
 
L
E
 
K
G
 
R
M
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
N
L
 
T
T
 
H
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
L
S
 
G
L
 
I
L
 
I
T
 
D
Y
 
S
A
 
C
L
 
L
V
 
I
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
G
 
G
W
 
C
M
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
Q
G
 
T
I
 
A
V
 
I
N
 
E
T
 
A
H
 
N
F
 
T
I
x
L
V
 
G
A
 
Q
H
 
V
M
 
P
I
 
L
N
 
I
A
 
I
H
 
G
G
 
G
T
 
N
Q
 
Y
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
K
Y
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
G
R
 
R
M
 
M
A
 
T
A
 
E
G
 
E
E
 
P
V
 
L
R
 
M
G
 
C
A
 
A
F
x
Y
S
 
C
M
x
V
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
D
 
K
G
 
G
E
 
D
G
 
-
G
 
-
D
 
E
W
 
Y
V
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
W
|
W
L
 
I
T
|
T
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
K
S
 
A
T
 
N
L
 
W
V
 
Y
A
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
S
D
 
D
E
 
P
G
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
N
 
-
T
 
A
A
 
P
A
 
A
H
x
S
R
 
K
N
 
A
M
 
F
T
 
T
T
 
G
F
 
F
L
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
V
T
 
Q
V
 
I
P
 
G
G
 
R
K
 
K
I
 
E
E
 
I
K
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
Q
K
 
R
G
 
C
V
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
R
E
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
E
R
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
G
A
 
-
S
 
E
G
 
G
R
 
A
G
 
G
F
|
F
Y
 
K
Q
 
I
M
 
A
M
|
M
D
 
G
G
 
T
V
x
F
E
 
D
V
 
K
G
x
T
R
 
R
V
 
P
N
 
P
V
|
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
G
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
D
L
 
E
G
 
A
I
 
T
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
L
Q
 
E
R
 
R
E
 
K
T
|
T
F
|
F
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
Q
 
Q
A
 
G
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
K
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
M
A
 
A
T
 
M
K
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
A
H
 
R
Q
 
L
M
 
S
M
 
Y
V
 
Q
M
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
W
K
 
E
K
 
I
D
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
R
|
R
N
 
N
D
 
T
L
 
Y
E
 
Y
A
 
A
G
 
S
M
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
L
 
Y
A
 
A
S
 
A
E
 
D
Y
 
I
C
 
A
K
 
N
E
 
Q
V
 
L
V
 
A
E
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
x
Q
I
x
V
H
 
F
G
 
G
G
|
G
Y
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
N
K
 
T
E
 
E
Y
 
Y
E
 
P
I
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
M
 
I
L
 
Y
L
 
Q
I
 
I
G
x
Y
E
|
E
G
|
G
T
|
T
A
 
A
E
x
Q
I
|
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
I
I
|
I
V
 
I
G
 
A
R
|
R
R
 
E
L
 
H
L
 
I
E
 
G
E
 
R
Y
 
Y
R
 
K

P11310 Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial; MCAD; Medium chain acyl-CoA dehydrogenase; MCADH; EC 1.3.8.7 from Homo sapiens (Human) (see 16 papers)
40% identity, 97% coverage: 12:404/407 of query aligns to 41:420/421 of P11310

query
sites
P11310
L
 
F
T
 
T
E
 
E
V
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
D
 
E
I
 
F
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
K
F
 
F
V
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
x
Y
E
 
D
H
 
K
R
 
T
D
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
T
 
V
K
 
P
I
 
L
V
 
I
E
 
R
G
 
R
M
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
|
L
F
 
M
G
 
N
L
 
T
T
 
H
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
N
F
 
C
G
 
G
G
 
G
L
|
L
G
 
G
E
x
L
S
 
G
L
 
T
L
 
F
T
 
D
Y
 
A
A
 
C
L
 
L
V
x
I
V
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
G
 
G
W
 
C
M
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
Q
G
 
T
I
 
A
V
 
I
N
 
E
T
 
G
H
 
N
F
 
S
I
 
L
V
 
G
A
 
Q
H
 
M
M
x
P
I
 
I
N
 
I
A
 
I
H
 
A
G
 
G
T
 
N
Q
 
D
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
E
 
K
Y
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
G
R
 
R
M
 
M
A
 
T
A
 
E
G
 
E
E
 
P
V
 
L
R
 
M
G
 
C
A
 
A
F
x
Y
S
x
C
M
x
V
S
x
T
E
|
E
P
|
P
G
|
G
L
x
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
D
 
K
G
 
G
E
 
D
G
 
-
G
 
-
D
 
E
W
 
Y
V
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
W
|
W
L
x
I
T
|
T
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
K
S
 
A
T
 
N
L
 
W
V
 
Y
A
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
S
D
 
D
E
 
P
G
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
N
 
-
T
 
A
A
 
P
A
 
A
H
 
N
R
 
K
N
 
A
M
 
F
T
 
T
T
 
G
F
 
F
L
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I
T
 
Q
V
 
I
P
 
G
G
 
R
K
 
K
I
x
E
E
 
L
K
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
Q
K
 
R
G
 
C
V
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
R
E
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
E
R
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
-
S
 
D
G
 
G
R
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
K
Q
 
V
M
 
A
M
 
M
D
 
G
G
 
A
V
 
F
E
x
D
V
 
K
G
x
T
R
|
R
V
 
P
N
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
G
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
D
L
 
E
G
 
A
I
 
T
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
L
Q
 
E
R
|
R
E
x
K
T
|
T
F
 
F
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
E
H
|
H
Q
|
Q
A
 
A
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
K
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
T
 
M
K
|
K
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
A
H
 
R
Q
 
M
M
 
S
M
 
Y
V
 
Q
M
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
W
K
 
E
K
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
R
 
R
N
 
N
D
 
T
L
 
Y
E
 
Y
A
 
A
G
 
S
M
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
G
E
 
D
Y
 
I
C
 
A
K
 
N
E
 
Q
V
 
L
V
 
A
E
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
x
Q
I
|
I
H
x
L
G
|
G
G
|
G
Y
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
N
K
 
T
E
|
E
Y
 
Y
E
 
P
I
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
M
 
I
L
 
Y
L
 
Q
I
 
I
G
 
Y
E
|
E
G
|
G
T
|
T
A
x
S
E
x
Q
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
H
L
 
I
E
 
D
E
 
K
Y
 
Y
R
 
K

P41367 Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial; MCAD; EC 1.3.8.7 from Sus scrofa (Pig) (see 2 papers)
40% identity, 97% coverage: 12:404/407 of query aligns to 41:420/421 of P41367

query
sites
P41367
L
 
L
T
 
T
E
 
E
V
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
D
 
E
I
 
F
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
K
F
 
F
V
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
D
H
 
R
R
 
T
D
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
T
 
V
K
 
P
I
 
L
V
 
L
E
 
K
G
 
R
M
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
N
L
 
T
T
 
H
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
L
S
 
G
L
 
I
L
 
I
T
 
D
Y
 
S
A
 
C
L
 
L
V
 
I
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
G
 
G
W
 
C
M
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
Q
G
 
T
I
 
A
V
 
I
N
 
E
T
 
A
H
 
N
F
 
T
I
 
L
V
 
G
A
 
Q
H
 
V
M
 
P
I
 
L
N
 
I
A
 
I
H
 
G
G
 
G
T
 
N
Q
 
Y
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
K
Y
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
G
R
 
R
M
 
M
A
 
T
A
 
E
G
 
E
E
 
P
V
 
L
R
 
M
G
 
C
A
 
A
F
x
Y
S
x
C
M
x
V
S
x
T
E
|
E
P
|
P
G
|
G
L
x
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
D
 
K
G
 
G
E
 
D
G
 
-
G
 
-
D
 
E
W
 
Y
V
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
W
|
W
L
x
I
T
|
T
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
K
S
 
A
T
 
N
L
 
W
V
 
Y
A
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
S
D
 
D
E
 
P
G
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
N
 
-
T
 
A
A
 
P
A
 
A
H
x
S
R
 
K
N
 
A
M
 
F
T
 
T
T
 
G
F
 
F
L
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
V
T
 
Q
V
 
I
P
 
G
G
 
R
K
 
K
I
 
E
E
 
I
K
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
Q
K
 
R
G
 
C
V
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
R
E
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
E
R
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
G
A
 
-
S
 
E
G
 
G
R
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
K
Q
 
I
M
 
A
M
 
M
D
 
G
G
 
T
V
 
F
E
x
D
V
 
K
G
 
T
R
|
R
V
 
P
N
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
G
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
D
L
 
E
G
 
A
I
 
T
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
L
Q
 
E
R
|
R
E
x
K
T
|
T
F
 
F
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
|
H
Q
|
Q
A
 
G
I
 
I
Q
 
S
F
 
F
K
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
M
A
 
A
T
 
M
K
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
A
H
 
R
Q
 
L
M
 
S
M
 
Y
V
 
Q
M
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
W
K
 
E
K
 
I
D
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
R
|
R
N
 
N
D
x
T
L
 
Y
E
 
Y
A
 
A
G
 
S
M
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
L
 
Y
A
 
A
S
 
A
E
 
D
Y
 
I
C
 
A
K
 
N
E
 
Q
V
 
L
V
 
A
E
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
x
Q
I
x
V
H
x
F
G
|
G
G
|
G
Y
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
N
K
 
T
E
 
E
Y
 
Y
E
 
P
I
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
M
 
I
L
 
Y
L
 
Q
I
 
I
G
 
Y
E
|
E
G
|
G
T
|
T
A
|
A
E
x
Q
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
H
L
 
I
E
 
G
E
 
R
Y
 
Y
R
 
K

1egcA Structure of t255e, e376g mutant of human medium chain acyl-coa dehydrogenase complexed with octanoyl-coa (see paper)
40% identity, 97% coverage: 12:404/407 of query aligns to 7:386/387 of 1egcA

query
sites
1egcA
L
 
F
T
 
T
E
 
E
V
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
D
 
E
I
 
F
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
K
F
 
F
V
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
D
H
 
K
R
 
T
D
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
T
 
V
K
 
P
I
 
L
V
 
I
E
 
R
G
 
R
M
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
N
L
 
T
T
 
H
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
N
F
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
L
S
 
G
L
 
T
L
 
F
T
 
D
Y
 
A
A
 
C
L
 
L
V
 
I
V
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
G
 
G
W
 
C
M
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
Q
G
 
T
I
 
A
V
 
I
N
x
E
T
 
G
H
 
N
F
 
S
I
x
L
V
 
G
A
 
Q
H
 
M
M
 
P
I
 
I
N
 
I
A
 
I
H
 
A
G
 
G
T
 
N
Q
 
D
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
E
 
K
Y
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
G
R
 
R
M
 
M
A
 
T
A
 
E
G
 
E
E
 
P
V
 
L
R
 
M
G
 
C
A
 
A
F
x
Y
S
 
C
M
x
V
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
|
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
D
 
K
G
 
G
E
 
D
G
 
-
G
 
-
D
 
E
W
 
Y
V
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
W
|
W
L
 
I
T
|
T
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
K
S
 
A
T
 
N
L
 
W
V
 
Y
A
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
S
D
 
D
E
 
P
G
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
N
 
-
T
 
A
A
 
P
A
 
A
H
x
N
R
 
K
N
 
A
M
 
F
T
 
T
T
 
G
F
 
F
L
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I
T
 
Q
V
 
I
P
 
G
G
 
R
K
 
K
I
 
E
E
 
L
K
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
Q
K
 
R
G
 
C
V
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
R
E
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
E
R
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
-
S
 
D
G
 
G
R
 
A
G
 
G
F
|
F
Y
 
K
Q
 
V
M
 
A
M
|
M
D
 
G
G
 
A
V
x
F
E
x
D
V
 
K
G
x
E
R
|
R
V
 
P
N
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
G
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
D
L
 
E
G
 
A
I
 
T
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
L
Q
 
E
R
|
R
E
 
K
T
|
T
F
|
F
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
x
L
A
 
V
Q
 
E
H
|
H
Q
 
Q
A
 
A
I
|
I
Q
 
S
F
 
F
K
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
T
 
M
K
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
A
H
 
R
Q
 
M
M
 
S
M
 
Y
V
 
Q
M
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
W
K
 
E
K
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
R
 
R
N
 
N
D
 
T
L
 
Y
E
 
Y
A
 
A
G
 
S
M
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
G
E
 
D
Y
 
I
C
 
A
K
 
N
E
 
Q
V
 
L
V
 
A
E
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
x
Q
I
|
I
H
 
L
G
 
G
G
|
G
Y
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
N
K
 
T
E
 
E
Y
 
Y
E
 
P
I
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
M
x
I
L
 
Y
L
 
Q
I
|
I
G
x
Y
E
x
G
G
|
G
T
|
T
A
 
S
E
x
Q
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
A
R
|
R
R
 
E
L
 
H
L
 
I
E
 
D
E
 
K
Y
 
Y
R
 
K

5lnxD Crystal structure of mmgc, an acyl-coa dehydrogenase from bacillus subtilis.
39% identity, 93% coverage: 23:400/407 of query aligns to 13:373/374 of 5lnxD

query
sites
5lnxD
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
A
D
 
R
K
 
K
E
 
E
I
 
I
I
 
A
P
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
E
E
 
I
L
 
M
E
 
E
H
 
K
R
 
T
D
 
D
E
 
E
Y
 
F
P
 
P
T
 
F
K
 
Q
I
 
L
V
 
I
E
 
K
G
 
K
M
 
M
K
 
G
E
 
K
L
 
H
G
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
G
L
 
I
T
 
P
I
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
E
 
A
S
 
D
L
 
V
L
 
V
T
 
S
Y
 
Y
A
 
I
L
 
L
V
 
A
V
 
I
E
 
H
E
 
E
I
 
I
A
 
S
R
 
R
G
 
I
W
 
S
M
 
A
S
 
A
V
 
V
S
 
G
G
 
V
I
 
I
V
 
L
N
 
S
T
 
V
H
 
H
F
 
T
I
 
S
V
 
V
-
 
G
A
 
T
H
 
N
M
 
P
I
 
I
N
 
L
A
 
Y
H
 
F
G
 
G
T
 
N
Q
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
E
 
M
Y
 
K
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
R
 
N
M
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
H
R
 
L
G
 
G
A
 
A
F
 
F
S
 
A
M
x
L
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
H
L
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
A
A
 
G
A
 
S
I
 
L
R
 
R
T
 
T
K
 
T
A
 
A
V
 
I
Q
 
K
D
 
-
G
 
-
E
 
K
G
 
N
G
 
G
D
 
K
W
 
Y
V
 
L
V
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
I
W
x
F
L
 
I
T
|
T
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
A
S
 
A
T
 
D
L
 
I
V
 
Y
A
 
I
L
 
T
L
 
F
A
 
A
H
 
L
T
 
T
-
 
A
-
 
P
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
D
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
R
R
 
H
N
 
G
M
 
I
T
 
S
T
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
K
E
 
N
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
F
T
 
T
V
 
V
P
 
G
G
 
K
K
 
K
I
 
E
E
 
R
K
 
K
M
 
L
G
 
G
Y
 
L
K
 
Y
G
 
G
V
 
S
D
 
N
T
 
T
T
 
T
E
 
E
L
 
L
V
 
I
L
 
F
Q
 
D
D
 
N
V
 
A
R
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
E
D
 
A
R
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
-
A
 
K
S
 
E
G
 
G
R
 
D
G
 
G
F
 
F
Y
 
H
Q
 
I
M
 
A
M
 
M
D
 
A
G
 
N
V
 
L
E
 
N
V
 
V
G
|
G
R
 
R
V
 
I
N
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
A
C
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
A
A
 
A
F
 
L
E
 
E
L
 
H
G
 
A
I
 
V
A
 
D
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
R
|
R
E
 
V
T
x
Q
F
|
F
G
 
G
K
 
R
K
 
P
I
|
I
A
 
A
Q
 
A
H
x
N
Q
 
Q
A
 
G
I
|
I
Q
 
S
F
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
M
A
 
A
T
 
T
K
 
R
V
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
R
Q
 
H
M
 
L
M
 
V
V
 
Y
M
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
D
S
 
L
G
 
H
E
 
N
R
 
R
N
 
L
D
 
N
L
 
C
-
 
G
-
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
S
M
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
Q
L
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
D
Y
 
A
C
 
A
K
 
V
E
 
K
V
 
A
V
 
L
E
 
-
D
 
D
A
 
A
F
 
V
R
x
Q
I
|
I
H
 
Y
G
 
G
G
|
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
Y
S
 
M
K
 
K
E
 
D
Y
 
Y
E
 
P
I
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
M
 
V
L
 
T
L
 
Q
I
 
I
G
x
Y
E
|
E
G
 
G
T
|
T
A
 
N
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
M
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
S
R
x
K
R
 
Y
L
 
L
L
 
L

7y0bA Crystal structure of human short-chain acyl-coa dehydrogenase
36% identity, 98% coverage: 6:404/407 of query aligns to 1:384/385 of 7y0bA

query
sites
7y0bA
L
 
I
Q
 
Y
Q
 
Q
T
 
S
D
 
V
G
 
E
L
 
L
T
 
P
E
 
E
V
 
T
Q
 
H
R
 
Q
D
 
M
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
T
V
 
C
R
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
A
D
 
E
K
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
F
P
 
P
V
 
I
A
 
A
T
 
A
E
 
Q
L
 
V
E
 
D
H
 
K
R
 
E
D
 
H
E
 
L
Y
 
F
P
 
P
T
 
A
K
 
A
I
 
Q
V
 
V
E
 
K
G
 
K
M
 
M
K
 
G
E
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
L
G
 
A
L
 
M
T
 
D
I
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
E
 
L
S
 
D
L
 
Y
L
 
L
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
V
 
A
V
 
M
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
S
R
 
R
G
 
G
W
 
C
M
 
A
S
 
S
V
 
T
S
 
G
G
 
V
I
 
I
-
 
M
-
 
S
V
 
V
N
 
N
T
 
N
H
 
S
F
 
L
I
 
Y
V
 
L
A
 
G
H
 
P
M
 
I
I
 
L
N
 
K
A
 
-
H
 
F
G
 
G
T
 
S
Q
 
K
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
E
 
Q
Y
 
A
F
 
W
L
 
V
P
 
T
R
 
P
M
 
F
A
 
T
A
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
K
R
 
I
G
 
G
A
 
C
F
|
F
S
 
A
M
x
L
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
V
 
A
A
 
G
A
 
A
I
 
A
R
 
S
T
 
T
K
 
T
A
 
A
V
 
-
Q
 
-
D
 
R
G
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
D
D
 
S
W
 
W
V
 
V
V
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
M
 
A
W
|
W
L
 
I
T
|
T
N
 
N
G
 
A
G
 
W
S
 
E
S
 
A
T
 
S
L
 
A
V
 
A
A
 
V
L
 
V
L
 
F
A
 
A
H
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
G
 
A
D
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
T
 
-
A
 
L
A
 
Q
H
 
N
R
 
K
N
 
G
M
 
I
T
 
S
T
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
V
E
 
P
K
 
M
E
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
P
V
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
L
P
 
G
G
 
K
K
 
K
I
 
E
E
 
D
K
 
K
M
 
L
G
 
G
Y
 
I
K
 
R
G
 
G
V
 
S
D
 
S
T
 
T
T
 
A
E
 
N
L
 
L
V
 
I
L
 
F
Q
 
E