SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_037571724.1 NCBI__GCF_000744815.1:WP_037571724.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3rfvA Crystal structure of uronate dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens complexed with nadh and product (see paper)
43% identity, 98% coverage: 7:277/277 of query aligns to 1:262/265 of 3rfvA

query
sites
3rfvA
A
 
A
P
 
M
R
 
K
T
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
x
Q
V
x
L
G
 
G
S
 
R
F
 
V
L
 
M
R
 
R
A
 
E
S
 
R
L
 
L
P
 
-
A
 
A
E
 
P
Y
 
M
G
 
A
Y
 
E
D
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
A
D
|
D
Q
x
L
A
 
S
P
 
P
I
 
L
E
 
D
G
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
P
E
 
N
P
 
E
E
 
E
A
 
C
I
 
V
T
 
Q
A
 
C
P
x
D
L
|
L
S
 
A
D
 
D
T
 
A
A
 
N
A
 
A
L
 
V
R
 
N
K
 
A
A
 
M
A
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
|
L
A
x
G
G
|
G
I
 
I
S
|
S
V
 
V
E
 
E
A
 
K
P
 
P
F
 
F
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
I
E
 
I
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
K
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
H
G
 
G
V
 
Q
R
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
|
A
S
 
S
S
|
S
N
|
N
H
|
H
A
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
Y
E
 
P
R
 
Q
P
 
T
E
 
E
G
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
R
S
 
L
G
 
G
A
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
A
E
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
P
 
P
D
 
D
T
 
G
Y
 
L
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
S
 
S
K
|
K
C
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
R
L
 
M
Y
 
Y
A
 
F
D
 
D
K
 
K
H
 
F
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
T
 
T
V
 
A
S
 
L
I
 
V
R
 
R
I
|
I
G
 
G
S
|
S
C
|
C
F
 
T
A
 
P
K
 
E
P
 
P
R
 
N
T
 
N
V
 
Y
R
|
R
M
 
M
L
 
L
D
 
S
T
 
T
W
 
W
L
 
F
S
 
S
P
 
H
A
 
D
D
 
D
C
 
F
H
 
V
R
 
S
L
 
L
I
 
I
H
 
E
A
 
A
S
 
V
I
 
F
T
 
R
A
 
A
E
 
P
L
 
V
P
 
-
A
 
-
H
 
-
S
 
-
H
 
L
G
 
G
H
 
C
H
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
I
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
N
T
 
D
R
 
A
A
 
G
W
 
W
W
 
W
S
 
D
L
 
N
D
 
S
S
 
H
A
 
L
R
 
G
E
 
F
I
 
L
G
 
G
F
 
W
E
 
K
P
 
P
Q
 
K
D
 
D
D
 
N
S
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
F
A
 
R
A
 
R
E
 
H
V
 
I
I
 
T
A
 
E
E
 
T
L
 
T
G
 
P
E
 
P
L
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
N
D
 
D
P
 
A
E
 
L
Y
 
V
R
 
R
Y
 
F
F
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
T
F
|
F
T
 
V
Q
 
D
Q
 
N
Q
 
P
V
 
I

Q7CRQ0 Uronate dehydrogenase; D-galacturonate dehydrogenase; D-glucuronate dehydrogenase; Hexuronate dehydrogenase; EC 1.1.1.203 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
43% identity, 97% coverage: 9:277/277 of query aligns to 2:261/265 of Q7CRQ0

query
sites
Q7CRQ0
R
 
K
T
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
S
 
R
F
 
V
L
 
M
R
 
R
A
 
E
S
 
R
L
 
L
P
 
-
A
 
A
E
 
P
Y
 
M
G
 
A
Y
 
E
D
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
S
P
 
P
I
 
L
E
 
D
G
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
P
E
 
N
P
 
E
E
 
E
A
 
C
I
 
V
T
 
Q
A
 
C
P
 
D
L
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
A
A
 
N
A
 
A
L
 
V
R
 
N
K
 
A
A
 
M
A
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
G
I
 
I
S
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
K
P
 
P
F
 
F
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
I
E
 
I
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
K
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
H
G
 
G
V
 
Q
R
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
H
 
H
A
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
Y
E
 
P
R
 
Q
P
 
T
E
 
E
G
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
R
S
 
L
G
 
G
A
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
A
E
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
P
 
P
D
 
D
T
 
G
Y
 
L
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
S
 
S
K
 
K
C
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
R
L
 
M
Y
 
Y
A
 
F
D
 
D
K
 
K
H
 
F
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
T
 
T
V
 
A
S
 
L
I
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
S
C
 
C
F
 
T
A
 
P
K
 
E
P
 
P
R
 
N
T
 
N
V
 
Y
R
 
R
M
 
M
L
 
L
D
 
S
T
 
T
W
 
W
L
 
F
S
 
S
P
 
H
A
 
D
D
 
D
C
 
F
H
 
V
R
 
S
L
 
L
I
 
I
H
 
E
A
 
A
S
 
V
I
 
F
T
 
R
A
 
A
E
 
P
L
 
V
P
 
-
A
 
-
H
 
-
S
 
-
H
 
L
G
 
G
H
 
C
H
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
I
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
N
T
 
D
R
 
A
A
 
G
W
 
W
W
 
W
S
 
D
L
 
N
D
 
S
S
 
H
A
 
L
R
 
G
E
 
F
I
 
L
G
 
G
F
 
W
E
 
K
P
 
P
Q
 
K
D
 
D
D
 
N
S
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
F
A
 
R
A
 
R
E
 
H
V
 
I
I
 
T
A
 
E
E
 
T
L
 
T
G
 
P
E
 
P
L
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
N
D
 
D
P
 
A
E
 
L
Y
 
V
R
 
R
Y
 
F
F
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
T
F
 
F
T
 
V
Q
 
D
Q
 
N
Q
 
P
V
 
I

3rfxA Crystal structure of uronate dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens, y136a mutant complexed with NAD (see paper)
42% identity, 98% coverage: 7:277/277 of query aligns to 1:262/265 of 3rfxA

query
sites
3rfxA
A
 
A
P
 
M
R
 
K
T
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
x
Q
V
x
L
G
 
G
S
 
R
F
 
V
L
 
M
R
 
R
A
 
E
S
 
R
L
 
L
P
 
-
A
 
A
E
 
P
Y
 
M
G
 
A
Y
 
E
D
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
A
D
|
D
Q
x
L
A
 
S
P
 
P
I
 
L
E
 
D
G
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
P
E
 
N
P
 
E
E
 
E
A
 
C
I
 
V
T
 
Q
A
 
C
P
x
D
L
|
L
S
 
A
D
 
D
T
 
A
A
 
N
A
 
A
L
 
V
R
 
N
K
 
A
A
 
M
A
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
|
G
I
 
I
S
|
S
V
 
V
E
 
E
A
 
K
P
 
P
F
 
F
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
I
E
 
I
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
K
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
H
G
 
G
V
 
Q
R
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
H
 
H
A
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
Y
E
 
P
R
 
Q
P
 
T
E
 
E
G
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
R
S
 
L
G
 
G
A
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
A
E
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
P
 
P
D
 
D
T
 
G
Y
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
S
K
 
K
C
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
R
L
 
M
Y
 
Y
A
 
F
D
 
D
K
 
K
H
 
F
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
T
 
T
V
 
A
S
 
L
I
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
S
C
 
C
F
 
T
A
 
P
K
 
E
P
 
P
R
 
N
T
 
N
V
 
Y
R
 
R
M
 
M
L
 
L
D
 
S
T
 
T
W
 
W
L
 
F
S
 
S
P
 
H
A
 
D
D
 
D
C
 
F
H
 
V
R
 
S
L
 
L
I
 
I
H
 
E
A
 
A
S
 
V
I
 
F
T
 
R
A
 
A
E
 
P
L
 
V
P
 
-
A
 
-
H
 
-
S
 
-
H
 
L
G
 
G
H
 
C
H
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
I
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
N
T
 
D
R
 
A
A
 
G
W
 
W
W
 
W
S
 
D
L
 
N
D
 
S
S
 
H
A
 
L
R
 
G
E
 
F
I
 
L
G
 
G
F
 
W
E
 
K
P
 
P
Q
 
K
D
 
D
D
 
N
S
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
F
A
 
R
A
 
R
E
 
H
V
 
I
I
 
T
A
 
E
E
 
T
L
 
T
G
 
P
E
 
P
L
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
N
D
 
D
P
 
A
E
 
L
Y
 
V
R
 
R
Y
 
F
F
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
T
F
 
F
T
 
V
Q
 
D
Q
 
N
Q
 
P
V
 
I

4id9B Crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase superfamily protein from agrobacterium tumefaciens (target efi-506441) with bound NAD, monoclinic form 1
39% identity, 59% coverage: 11:173/277 of query aligns to 3:160/328 of 4id9B

query
sites
4id9B
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
G
|
G
G
x
R
V
|
V
G
 
G
S
 
R
F
 
A
L
 
V
R
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
R
A
 
T
E
 
Q
Y
 
-
G
 
G
Y
 
R
D
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
G
F
 
F
D
|
D
Q
x
L
A
 
R
P
 
P
I
 
S
E
 
G
G
 
T
E
 
G
P
 
G
E
 
E
A
 
E
I
 
V
T
 
V
A
 
G
P
x
S
L
|
L
S
 
E
D
 
D
T
 
G
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
D
A
 
A
A
 
I
E
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
L
H
 
H
L
|
L
A
 
G
G
x
A
I
 
F
S
 
M
V
 
S
E
 
W
A
 
A
P
 
P
F
 
-
A
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
D
-
 
R
I
 
M
L
 
F
G
 
A
A
x
V
N
 
N
I
 
V
E
 
E
G
 
G
T
 
T
Y
 
R
N
 
R
L
 
L
Y
 
L
K
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
|
S
N
 
G
H
 
E
A
 
V
V
 
Y
G
 
-
F
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
N
A
 
R
P
 
P
E
 
E
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
F
V
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
T
-
 
E
E
 
D
T
 
H
R
 
P
L
 
L
R
 
C
P
 
P
D
 
N
T
 
S
Y
 
P
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
|
K
C
 
L
F
 
L
G
 
G
E
 
E
N
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
R
L
 
F
Y
 
H
A
 
Q
D
 
R
K
 
S
H
 
G
G
 
A
I
 
M
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
I
I
 
L
R
 
R
I
x
F

Sites not aligning to the query:

4id9A Crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase superfamily protein from agrobacterium tumefaciens (target efi-506441) with bound NAD, monoclinic form 1
39% identity, 59% coverage: 11:173/277 of query aligns to 2:159/321 of 4id9A

query
sites
4id9A
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
G
|
G
G
x
R
V
|
V
G
 
G
S
 
R
F
 
A
L
 
V
R
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
R
A
 
T
E
 
Q
Y
 
-
G
 
G
Y
 
R
D
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
G
F
 
F
D
|
D
Q
x
L
A
x
R
P
 
P
I
 
S
E
 
G
G
 
T
E
 
G
P
 
G
E
 
E
A
 
E
I
 
V
T
 
V
A
 
G
P
x
S
L
|
L
S
 
E
D
 
D
T
 
G
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
D
A
 
A
A
 
I
E
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
L
H
 
H
L
|
L
A
 
G
G
x
A
I
 
F
S
 
M
V
 
S
E
 
W
A
 
A
P
 
P
F
 
-
A
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
D
-
 
R
I
 
M
L
 
F
G
 
A
A
x
V
N
 
N
I
 
V
E
 
E
G
 
G
T
 
T
Y
 
R
N
 
R
L
 
L
Y
 
L
K
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
|
S
N
 
G
H
 
E
A
 
V
V
 
Y
G
 
-
F
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
N
A
 
R
P
 
P
E
 
E
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
F
V
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
T
-
 
E
E
 
D
T
 
H
R
 
P
L
 
L
R
 
C
P
 
P
D
 
N
T
 
S
Y
 
P
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
|
K
C
 
L
F
 
L
G
 
G
E
 
E
N
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
R
L
 
F
Y
 
H
A
 
Q
D
 
R
K
 
S
H
 
G
G
 
A
I
 
M
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
I
I
 
L
R
 
R
I
x
F

Sites not aligning to the query:

3a1nA Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
34% identity, 58% coverage: 11:172/277 of query aligns to 2:163/315 of 3a1nA

query
sites
3a1nA
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
G
x
Q
V
x
I
G
 
G
S
 
T
F
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
P
S
 
Y
L
 
L
P
 
A
A
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
S
D
|
D
L
x
I
R
 
V
L
 
Q
F
 
R
D
 
D
Q
 
T
A
 
G
P
 
G
I
 
I
E
 
K
G
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
F
I
 
I
T
 
T
A
x
L
P
x
D
L
 
V
S
 
S
D
 
N
T
 
R
A
 
D
A
 
E
L
 
I
R
 
D
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
G
|
G
I
 
I
-
x
L
-
 
S
-
 
A
S
 
K
V
 
G
E
 
E
A
 
K
P
 
D
F
 
P
A
 
A
D
 
L
I
 
A
L
 
Y
G
 
K
A
 
V
N
 
N
I
 
M
E
 
N
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
A
 
H
G
 
R
V
 
V
R
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
P
S
|
S
S
x
T
N
 
I
H
 
G
A
 
V
V
 
F
G
 
G
F
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
-
A
 
T
P
 
P
E
 
K
S
 
N
G
 
-
A
 
-
T
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
S
E
 
I
T
 
T
R
 
I
L
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
Y
 
M
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
S
 
T
K
|
K
C
 
I
F
 
A
G
 
A
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
Q
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
Y
D
 
E
K
 
K
H
 
F
G
 
G
I
 
L
E
 
D
T
 
V
V
 
R
S
 
S
I
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3a4vA Crystal structure of pyruvate bound l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
34% identity, 58% coverage: 11:172/277 of query aligns to 2:163/311 of 3a4vA

query
sites
3a4vA
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
G
x
Q
V
x
I
G
 
G
S
 
T
F
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
P
S
 
Y
L
 
L
P
 
A
A
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
S
D
|
D
L
x
I
R
 
V
L
 
Q
F
 
R
D
 
D
Q
 
T
A
 
G
P
 
G
I
 
I
E
 
K
G
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
F
I
 
I
T
 
T
A
x
L
P
x
D
L
x
V
S
 
S
D
 
N
T
 
R
A
 
D
A
 
E
L
 
I
R
 
D
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
G
|
G
I
 
I
-
x
L
-
x
S
-
 
A
S
 
K
V
 
G
E
 
E
A
 
K
P
 
D
F
 
P
A
 
A
D
 
L
I
 
A
L
 
Y
G
 
K
A
 
V
N
 
N
I
 
M
E
 
N
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
A
 
H
G
 
R
V
 
V
R
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
A
x
P
S
|
S
S
x
T
N
 
I
H
 
G
A
 
V
V
 
F
G
 
G
F
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
-
A
 
T
P
 
P
E
 
K
S
 
N
G
 
-
A
 
-
T
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
S
E
 
I
T
 
T
R
 
I
L
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
Y
 
M
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
S
 
T
K
|
K
C
 
I
F
 
A
G
 
A
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
Q
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
Y
D
 
E
K
 
K
H
 
F
G
 
G
I
 
L
E
 
D
T
 
V
V
 
R
S
 
S
I
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3a9wA Crystal structure of l-threonine bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
33% identity, 58% coverage: 11:172/277 of query aligns to 2:163/315 of 3a9wA

query
sites
3a9wA
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
G
x
Q
V
x
I
G
 
G
S
 
T
F
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
P
S
 
Y
L
 
L
P
 
A
A
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
S
D
|
D
L
x
I
R
 
V
L
 
Q
F
 
R
D
 
D
Q
 
T
A
 
G
P
 
G
I
 
I
E
 
K
G
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
F
I
 
I
T
 
T
A
x
L
P
x
D
L
x
V
S
 
S
D
 
N
T
 
R
A
 
D
A
 
E
L
 
I
R
 
D
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
G
 
G
I
 
I
-
x
L
-
x
S
-
 
A
S
 
K
V
 
G
E
 
E
A
 
K
P
 
D
F
 
P
A
 
A
D
 
L
I
 
A
L
 
Y
G
 
K
A
x
V
N
 
N
I
 
M
E
 
N
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
A
 
H
G
 
R
V
 
V
R
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
A
x
P
S
|
S
S
x
T
N
 
I
H
 
G
A
 
V
V
 
F
G
 
G
F
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
-
A
 
T
P
 
P
E
 
K
S
 
N
G
 
-
A
 
-
T
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
S
E
 
I
T
 
T
R
 
I
L
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
Y
 
M
Y
x
F
G
 
G
L
 
V
S
 
T
K
|
K
C
 
I
F
 
A
G
 
A
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
Q
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
Y
D
 
E
K
 
K
H
 
F
G
 
G
I
 
L
E
 
D
T
 
V
V
 
R
S
 
S
I
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3ajrA Crystal structure of l-3-hydroxynorvaline bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
33% identity, 58% coverage: 11:172/277 of query aligns to 2:163/314 of 3ajrA

query
sites
3ajrA
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
G
x
Q
V
x
I
G
 
G
S
 
T
F
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
P
S
 
Y
L
 
L
P
 
A
A
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
S
D
|
D
L
x
I
R
 
V
L
 
Q
F
 
R
D
 
D
Q
 
T
A
 
G
P
 
G
I
 
I
E
 
K
G
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
F
I
 
I
T
 
T
A
x
L
P
x
D
L
x
V
S
 
S
D
 
N
T
 
R
A
 
D
A
 
E
L
 
I
R
 
D
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
G
|
G
I
 
I
-
x
L
-
x
S
-
 
A
S
 
K
V
 
G
E
 
E
A
 
K
P
 
D
F
 
P
A
 
A
D
 
L
I
 
A
L
 
Y
G
 
K
A
 
V
N
 
N
I
 
M
E
 
N
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
A
 
H
G
 
R
V
 
V
R
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
A
x
P
S
|
S
S
x
T
N
x
I
H
 
G
A
 
V
V
 
F
G
 
G
F
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
-
A
 
T
P
 
P
E
 
K
S
 
N
G
 
-
A
 
-
T
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
S
E
 
I
T
 
T
R
 
I
L
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
Y
 
M
Y
x
F
G
 
G
L
 
V
S
 
T
K
|
K
C
 
I
F
 
A
G
 
A
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
Q
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
Y
D
 
E
K
 
K
H
 
F
G
 
G
I
 
L
E
 
D
T
 
V
V
 
R
S
 
S
I
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6wj9B Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-glcnac (see paper)
34% identity, 62% coverage: 11:181/277 of query aligns to 4:178/308 of 6wj9B

query
sites
6wj9B
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
G
x
F
V
x
I
G
 
G
S
 
S
F
 
H
L
 
L
R
 
V
A
 
D
S
 
A
L
 
L
P
 
L
A
 
A
E
 
K
Y
 
-
G
 
G
Y
 
Y
D
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
V
F
 
L
D
|
D
-
x
D
-
 
L
-
x
S
-
x
T
-
x
G
-
 
K
-
 
V
-
 
G
Q
 
N
A
 
L
P
 
P
I
 
M
-
 
G
E
 
D
G
 
A
E
 
G
P
 
L
E
 
E
A
 
L
I
 
L
T
 
V
A
 
G
P
x
D
L
x
A
S
 
A
D
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
L
R
 
A
K
 
D
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
G
x
A
I
 
V
-
 
A
S
 
S
V
|
V
E
 
Q
A
 
A
P
 
S
F
 
V
A
 
E
D
 
D
I
 
P
L
 
V
G
 
A
-
 
T
-
 
H
-
 
Q
A
x
S
N
 
N
I
 
F
E
 
I
G
 
A
T
 
T
Y
 
L
N
 
R
L
 
L
Y
 
C
K
 
E
A
 
A
A
 
M
R
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
|
A
S
 
S
S
x
A
N
 
-
H
 
-
A
|
A
V
x
A
G
 
V
F
 
Y
T
 
G
E
 
N
R
 
N
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
I
P
 
A
V
 
E
E
 
D
T
 
T
R
 
P
L
 
K
R
 
S
P
 
P
D
 
L
T
 
T
Y
 
P
Y
x
F
G
 
A
L
 
A
S
 
D
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
S
E
 
E
N
 
Y
L
 
Y
A
 
L
S
 
D
L
 
F
Y
 
Y
A
 
R
D
 
R
K
 
Q
H
 
H
G
 
G
I
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
S
 
I
I
 
L
R
 
R
I
x
F
G
x
F
S
x
N
C
x
I
F
 
F
A
 
G
K
 
-
P
 
P
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6wjaA Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-galnac (see paper)
34% identity, 62% coverage: 11:181/277 of query aligns to 3:177/307 of 6wjaA

query
sites
6wjaA
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
G
x
F
V
x
I
G
 
G
S
 
S
F
 
H
L
 
L
R
 
V
A
 
D
S
 
A
L
 
L
P
 
L
A
 
A
E
 
K
Y
 
-
G
 
G
Y
 
Y
D
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
V
F
 
L
D
|
D
-
x
D
-
 
L
-
x
S
-
x
T
-
x
G
-
 
K
-
 
V
-
 
G
Q
 
N
A
 
L
P
 
P
I
 
M
-
 
G
E
 
D
G
 
A
E
 
G
P
 
L
E
 
E
A
 
L
I
 
L
T
 
V
A
 
G
P
 
D
L
x
A
S
 
A
D
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
L
R
 
A
K
 
D
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
G
x
A
I
 
V
-
 
A
S
 
S
V
|
V
E
 
Q
A
 
A
P
 
S
F
 
V
A
 
E
D
 
D
I
 
P
L
 
V
G
 
A
-
 
T
-
 
H
-
 
Q
A
x
S
N
 
N
I
 
F
E
 
I
G
 
A
T
 
T
Y
 
L
N
 
R
L
 
L
Y
 
C
K
 
E
A
 
A
A
 
M
R
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
x
A
N
 
-
H
 
-
A
|
A
V
x
A
G
 
V
F
 
Y
T
 
G
E
 
N
R
 
N
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
I
P
 
A
V
 
E
E
 
D
T
 
T
R
 
P
L
 
K
R
 
S
P
 
P
D
 
L
T
 
T
Y
 
P
Y
x
F
G
 
A
L
 
A
S
 
D
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
S
E
 
E
N
 
Y
L
 
Y
A
 
L
S
 
D
L
 
F
Y
 
Y
A
 
R
D
 
R
K
 
Q
H
 
H
G
 
G
I
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
S
 
I
I
 
L
R
 
R
I
x
F
G
x
F
S
x
N
C
x
I
F
 
F
A
 
G
K
 
-
P
 
P
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3c1tB Binding of two substrate analogue molecules to dihydroflavonol 4- reductase alters the functional geometry of the catalytic site (see paper)
29% identity, 58% coverage: 10:171/277 of query aligns to 7:185/326 of 3c1tB

query
sites
3c1tB
T
 
T
V
 
V
L
 
C
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
x
F
V
x
I
G
 
G
S
 
S
F
 
W
L
 
L
R
 
V
A
 
M
S
 
R
L
 
L
P
 
-
A
 
L
E
 
E
Y
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
T
L
 
V
R
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
x
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
K
-
x
K
-
 
V
-
 
K
-
 
H
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Q
 
L
A
 
P
P
 
K
I
 
A
E
 
E
G
 
T
E
 
H
P
 
L
E
 
T
A
 
L
I
 
W
T
 
K
A
 
A
P
x
D
L
|
L
S
 
A
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
S
L
 
F
R
 
D
K
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
K
G
 
G
V
 
C
D
 
T
A
 
G
I
 
V
V
 
F
H
 
H
L
x
V
A
|
A
G
x
T
I
 
P
S
x
M
V
 
S
E
 
K
A
 
D
P
 
P
F
 
E
A
 
N
D
 
E
I
 
V
L
 
I
G
 
K
A
 
P
N
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
M
Y
 
L
N
 
G
L
 
I
Y
 
M
K
 
K
A
 
S
A
 
C
R
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
K
-
 
T
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
F
A
x
T
S
|
S
S
|
S
N
x
A
H
 
G
A
 
T
V
 
V
G
x
N
F
 
I
T
 
Q
E
 
E
R
 
H
P
 
Q
E
 
L
G
 
P
A
 
V
P
 
Y
E
 
D
S
 
E
G
 
S
A
 
C
T
 
W
V
 
S
P
 
D
V
 
M
E
 
E
-
 
F
T
 
C
R
 
R
L
 
A
R
 
K
P
 
K
D
 
M
T
|
T
-
x
A
-
 
W
Y
 
M
Y
|
Y
G
x
F
L
 
V
S
 
S
K
|
K
C
 
T
F
 
L
G
 
A
E
 
E
N
 
Q
L
 
A
A
 
A
S
 
W
L
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
K
 
E
H
 
N
G
 
N
I
 
I
E
 
D
T
 
F
V
 
I
S
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7cgvA Full consensus l-threonine 3-dehydrogenase, fctdh-iiym (NAD+ bound form) (see paper)
29% identity, 59% coverage: 9:172/277 of query aligns to 1:165/310 of 7cgvA

query
sites
7cgvA
R
 
K
T
 
R
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
I
G
|
G
A
 
A
A
 
N
G
|
G
G
x
Q
V
x
I
G
 
G
S
 
S
F
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
P
S
 
A
L
 
L
P
 
R
A
 
K
E
 
R
Y
 
Y
G
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
I
-
 
A
Y
 
S
D
|
D
L
x
I
R
|
R
-
 
P
-
 
P
-
 
N
L
 
L
F
 
Y
D
 
E
Q
 
A
A
 
G
P
 
P
I
 
F
E
 
E
G
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
Y
A
x
L
P
x
D
L
x
V
S
 
L
D
 
D
T
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
A
K
 
E
A
 
L
A
 
V
E
 
K
G
 
K
-
 
Y
-
 
K
V
 
I
D
 
T
A
 
Q
I
 
I
V
 
Y
H
 
H
L
 
L
A
|
A
G
x
A
I
 
L
-
x
L
-
 
S
-
 
A
S
 
T
V
 
G
E
 
E
A
 
K
P
 
N
F
 
P
A
 
Q
D
 
K
I
 
A
L
 
W
G
 
D
A
 
L
N
 
N
I
 
M
E
 
D
G
 
G
T
 
L
Y
 
L
N
 
N
L
 
V
Y
 
L
K
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
R
G
 
G
V
 
P
R
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
F
F
 
W
A
x
P
S
 
S
S
|
S
N
 
I
H
 
A
A
 
A
V
 
F
G
 
G
F
 
P
T
 
N
E
 
T
R
 
P
P
 
K
E
 
D
G
 
N
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
D
T
 
T
R
 
I
L
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
T
T
 
T
Y
 
I
Y
|
Y
G
 
G
L
 
I
S
 
S
K
|
K
C
 
V
F
 
A
G
 
G
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
C
S
 
E
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
H
D
 
T
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
V
V
 
R
S
 
S
I
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

A0A059TC02 Cinnamoyl-CoA reductase 1; Ph-CCR1; Coniferylaldehyde synthase; Coumaroyl-CoA reductase; Feruloyl-CoA reductase; Sinapoyl-CoA reductase; EC 1.2.1.44 from Petunia hybrida (Petunia) (see paper)
34% identity, 59% coverage: 9:172/277 of query aligns to 7:183/333 of A0A059TC02

query
sites
A0A059TC02
R
 
Q
T
 
V
V
 
V
L
 
C
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
G
|
G
G
x
F
V
x
I
G
x
A
S
 
S
F
 
W
L
 
L
R
 
V
A
 
K
S
 
I
L
 
L
P
 
-
A
 
L
E
 
E
Y
 
K
G
 
G
Y
 
Y
D
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
G
F
 
T
D
 
V
Q
x
R
A
 
N
P
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
P
-
x
K
-
 
N
-
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
A
P
 
K
E
 
E
A
 
R
I
 
L
T
 
T
-
 
L
-
 
C
-
 
K
A
 
A
P
x
D
L
|
L
S
 
L
D
 
D
T
 
Y
A
 
Q
A
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
N
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
G
I
 
V
V
 
F
H
 
H
L
x
T
A
|
A
G
x
S
I
 
P
S
 
V
V
 
T
E
 
D
A
 
D
P
 
P
F
 
E
A
 
Q
D
 
M
I
 
V
L
 
E
G
 
P
A
 
A
N
 
V
I
 
I
E
 
-
G
 
G
T
 
T
Y
 
K
N
 
N
L
 
V
Y
 
I
K
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
T
S
 
S
S
 
S
N
 
I
H
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
Y
F
 
M
T
 
D
E
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
N
G
 
R
A
 
D
P
 
P
E
 
E
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
T
V
 
V
P
 
V
V
 
D
E
 
E
T
 
T
R
 
C
L
 
W
R
 
S
-
 
D
P
 
P
D
 
D
-
 
F
-
x
C
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
K
T
 
N
Y
 
W
Y
|
Y
G
x
C
L
 
Y
S
 
G
K
|
K
C
 
M
F
 
V
G
 
A
E
 
E
N
 
Q
L
 
A
A
 
A
S
 
W
L
 
E
Y
 
E
A
 
A
D
 
K
K
 
E
H
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
L
V
 
V
S
 
V
I
 
I
R
 
N

Sites not aligning to the query:

4r1sA Crystal structure of petunia hydrida cinnamoyl-coa reductase (see paper)
34% identity, 59% coverage: 9:172/277 of query aligns to 4:180/319 of 4r1sA

query
sites
4r1sA
R
 
Q
T
 
V
V
 
V
L
 
C
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
G
x
F
V
x
I
G
 
A
S
 
S
F
 
W
L
 
L
R
 
V
A
 
K
S
 
I
L
 
L
P
 
-
A
 
L
E
 
E
Y
 
K
G
 
G
Y
 
Y
D
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
G
F
 
T
D
 
V
Q
x
R
A
 
N
P
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
P
-
x
K
-
 
N
-
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
A
P
 
K
E
 
E
A
 
R
I
 
L
T
 
T
-
 
L
-
 
C
-
 
K
A
 
A
P
x
D
L
|
L
S
 
L
D
 
D
T
 
Y
A
 
Q
A
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
N
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
G
I
 
V
V
 
F
H
 
H
L
x
T
A
 
A
G
x
S
I
 
P
S
 
V
V
 
T
E
 
D
A
 
D
P
 
P
F
 
E
A
 
Q
D
 
M
I
 
V
L
 
E
G
 
P
A
 
A
N
 
V
I
 
I
E
 
-
G
 
G
T
 
T
Y
 
K
N
 
N
L
 
V
Y
 
I
K
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
x
T
S
 
S
S
 
S
N
 
I
H
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
Y
F
 
M
T
 
D
E
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
N
G
 
R
A
 
D
P
 
P
E
 
E
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
T
V
 
V
P
 
V
V
 
D
E
 
E
T
 
T
R
 
C
L
 
W
R
 
S
-
 
D
P
 
P
D
 
D
-
 
F
-
 
C
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
K
T
 
N
Y
 
W
Y
|
Y
G
 
C
L
 
Y
S
 
G
K
|
K
C
 
M
F
 
V
G
 
A
E
 
E
N
 
Q
L
 
A
A
 
A
S
 
W
L
 
E
Y
 
E
A
 
A
D
 
K
K
 
E
H
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
L
V
 
V
S
 
V
I
 
I
R
 
N

Sites not aligning to the query:

5z75A Artificial l-threonine 3-dehydrogenase designed by ancestral sequence reconstruction. (see paper)
27% identity, 58% coverage: 11:172/277 of query aligns to 5:166/306 of 5z75A

query
sites
5z75A
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
I
G
|
G
A
 
A
A
x
C
G
|
G
G
x
Q
V
x
I
G
 
G
S
 
T
F
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
V
S
 
A
L
 
L
P
 
R
A
 
E
E
 
I
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
N
-
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
S
D
|
D
L
x
I
R
 
R
L
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
E
P
 
P
E
 
N
A
 
E
I
 
E
T
 
S
A
 
G
P
 
P
L
 
F
S
 
E
D
 
K
T
x
L
A
 
D
A
x
V
L
 
M
R
 
D
K
 
K
A
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
R
V
 
L
D
 
E
A
 
E
I
 
I
V
 
V
H
 
E
L
 
K
A
 
H
G
 
K
I
 
I
S
 
T
V
 
Q
E
 
V
A
 
Y
P
 
H
F
x
L
A
|
A
D
 
A
I
 
I
L
|
L
G
 
S
A
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
W
-
 
D
-
 
L
N
 
N
I
 
M
E
 
N
G
 
S
T
 
L
Y
 
L
N
 
N
L
 
V
Y
 
L
K
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
G
G
 
K
V
 
I
R
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
F
F
 
W
A
x
P
S
 
S
S
|
S
N
 
I
H
 
A
A
 
V
V
 
F
G
 
G
F
 
P
T
 
T
E
 
T
R
 
P
P
 
K
E
 
E
G
 
N
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
H
T
 
T
R
 
V
L
 
M
R
 
D
P
 
P
D
 
S
T
 
T
Y
 
V
Y
|
Y
G
 
G
L
 
I
S
 
S
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
G
E
 
E
N
 
R
L
 
W
A
 
C
S
 
E
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
H
D
 
E
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
V
V
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3bxxA Binding of two substrate analogue molecules to dihydroflavonol 4- reductase alters the functional geometry of the catalytic site (see paper)
28% identity, 58% coverage: 10:171/277 of query aligns to 2:183/324 of 3bxxA

query
sites
3bxxA
T
 
T
V
 
V
L
 
C
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
x
F
V
x
I
G
 
G
S
 
S
F
 
W
L
 
L
R
 
V
A
 
M
S
 
R
L
 
L
P
 
-
A
 
L
E
 
E
Y
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
T
L
 
V
R
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
x
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
K
-
x
K
-
 
V
-
 
K
-
 
H
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Q
 
L
A
 
P
P
 
K
I
 
A
E
 
E
G
 
T
E
 
H
P
 
L
E
 
T
A
 
L
I
 
W
T
 
K
A
 
A
P
x
D
L
|
L
S
 
A
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
S
L
 
F
R
 
D
K
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
K
G
 
G
V
 
C
D
 
T
A
 
G
I
 
V
V
 
F
H
 
H
L
x
V
A
 
A
-
x
T
-
x
P
-
 
M
G
 
D
I
 
F
S
 
E
V
 
S
E
 
K
A
 
D
P
 
P
F
 
E
A
 
N
D
 
E
I
 
V
L
 
I
G
 
K
A
 
P
N
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
M
Y
 
L
N
 
G
L
 
I
Y
 
M
K
 
K
A
 
S
A
 
C
R
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
K
-
 
T
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
T
S
 
S
S
|
S
N
 
A
H
x
G
A
 
T
V
 
V
G
 
N
F
 
I
T
 
Q
E
 
E
R
 
H
P
 
Q
E
 
L
G
 
P
A
 
V
P
 
Y
E
 
D
S
 
E
G
 
S
A
 
C
T
 
W
V
 
S
P
 
D
V
 
M
E
 
E
-
 
F
T
 
C
R
 
R
L
 
A
R
 
K
P
 
K
D
 
M
T
 
T
-
 
A
-
 
W
Y
 
M
Y
|
Y
G
x
F
L
 
V
S
 
S
K
 
K
C
 
T
F
 
L
G
 
A
E
 
E
N
 
Q
L
 
A
A
 
A
S
 
W
L
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
K
 
E
H
 
N
G
 
N
I
 
I
E
 
D
T
 
F
V
 
I
S
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2nnlD Binding of two substrate analogue molecules to dihydroflavonol-4- reductase alters the functional geometry of the catalytic site
28% identity, 58% coverage: 10:171/277 of query aligns to 2:183/324 of 2nnlD

query
sites
2nnlD
T
 
T
V
 
V
L
 
C
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
x
F
V
x
I
G
 
G
S
 
S
F
 
W
L
 
L
R
 
V
A
 
M
S
 
R
L
 
L
P
 
-
A
 
L
E
 
E
Y
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
T
L
 
V
R
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
x
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
K
-
x
K
-
 
V
-
 
K
-
 
H
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Q
 
L
A
 
P
P
 
K
I
 
A
E
 
E
G
 
T
E
 
H
P
 
L
E
 
T
A
 
L
I
 
W
T
 
K
A
 
A
P
x
D
L
|
L
S
 
A
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
S
L
 
F
R
 
D
K
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
K
G
 
G
V
 
C
D
 
T
A
 
G
I
 
V
V
 
F
H
 
H
L
x
V
A
|
A
-
x
T
-
 
P
-
 
M
G
 
D
I
x
F
S
 
E
V
 
S
E
 
K
A
 
D
P
 
P
F
 
E
A
 
N
D
 
E
I
 
V
L
 
I
G
 
K
A
 
P
N
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
M
Y
 
L
N
 
G
L
 
I
Y
 
M
K
 
K
A
 
S
A
 
C
R
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
K
-
 
T
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
F
A
x
T
S
 
S
S
 
S
N
x
A
H
 
G
A
 
T
V
 
V
G
x
N
F
 
I
T
 
Q
E
 
E
R
 
H
P
 
Q
E
 
L
G
 
P
A
 
V
P
 
Y
E
 
D
S
 
E
G
 
S
A
 
C
T
 
W
V
 
S
P
 
D
V
 
M
E
 
E
-
 
F
T
 
C
R
 
R
L
 
A
R
 
K
P
 
K
D
 
M
T
 
T
-
 
A
-
 
W
Y
 
M
Y
|
Y
G
 
F
L
 
V
S
 
S
K
|
K
C
 
T
F
 
L
G
 
A
E
 
E
N
 
Q
L
 
A
A
 
A
S
 
W
L
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
K
 
E
H
 
N
G
 
N
I
 
I
E
 
D
T
 
F
V
 
I
S
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2c29D Structure of dihydroflavonol reductase from vitis vinifera at 1.8 a. (see paper)
28% identity, 58% coverage: 10:171/277 of query aligns to 2:183/324 of 2c29D

query
sites
2c29D
T
 
T
V
 
V
L
 
C
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
x
F
V
x
I
G
 
G
S
 
S
F
 
W
L
 
L
R
 
V
A
 
M
S
 
R
L
 
L
P
 
-
A
 
L
E
 
E
Y
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
T
L
 
V
R
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
x
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
K
-
x
K
-
 
V
-
 
K
-
 
H
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Q
 
L
A
 
P
P
 
K
I
 
A
E
 
E
G
 
T
E
 
H
P
 
L
E
 
T
A
 
L
I
 
W
T
 
K
A
 
A
P
x
D
L
|
L
S
 
A
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
S
L
 
F
R
 
D
K
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
K
G
 
G
V
 
C
D
 
T
A
 
G
I
 
V
V
 
F
H
 
H
L
x
V
A
|
A
-
x
T
-
 
P
-
 
M
G
 
D
I
 
F
S
 
E
V
 
S
E
 
K
A
 
D
P
 
P
F
 
E
A
 
N
D
 
E
I
 
V
L
 
I
G
 
K
A
 
P
N
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
M
Y
 
L
N
 
G
L
 
I
Y
 
M
K
 
K
A
 
S
A
 
C
R
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
K
-
 
T
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
L
V
 
V
F
 
F
A
x
T
S
 
S
S
|
S
N
x
A
H
 
G
A
 
T
V
 
V
G
x
N
F
 
I
T
 
Q
E
 
E
R
 
H
P
 
Q
E
 
L
G
 
P
A
 
V
P
 
Y
E
 
D
S
 
E
G
 
S
A
 
C
T
 
W
V
 
S
P
 
D
V
 
M
E
 
E
-
 
F
T
 
C
R
 
R
L
 
A
R
 
K
P
 
K
D
 
M
T
 
T
-
 
A
-
 
W
Y
 
M
Y
|
Y
G
 
F
L
 
V
S
 
S
K
|
K
C
 
T
F
 
L
G
 
A
E
 
E
N
 
Q
L
 
A
A
 
A
S
 
W
L
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
K
 
E
H
 
N
G
 
N
I
 
I
E
 
D
T
 
F
V
 
I
S
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6jygD Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from phytophthora infestans (see paper)
29% identity, 58% coverage: 11:172/277 of query aligns to 3:162/307 of 6jygD

query
sites
6jygD
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
T
G
|
G
G
x
Q
V
x
I
G
 
G
S
 
M
F
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
P
S
 
Y
L
 
M
P
 
R
A
 
Q
E
 
L
Y
 
F
G
 
G
Y
 
A
D
 
D
L
 
T
R
 
I
L
 
V
F
 
N
D
 
S
Q
x
D
A
x
I
P
x
K
I
 
A
E
 
P
G
 
G
-
 
R
E
 
D
P
 
G
E
 
N
A
 
F
I
 
V
T
 
Y
A
 
C
P
x
D
L
x
V
S
 
Q
D
 
D
T
 
R
A
 
D
A
 
S
L
 
M
R
 
A
K
 
R
A
 
I
A
 
V
-
 
T
-
 
E
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
T
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
x
M
A
|
A
G
x
S
I
 
L
S
x
L
V
x
S
-
 
A
-
 
V
-
 
G
E
 
E
A
 
A
P
 
N
F
 
P
A
 
S
D
 
L
I
 
A
L
 
L
G
 
S
A
x
V
N
 
N
I
 
T
E
 
R
G
 
G
T
 
I
Y
 
Q
N
 
N
L
 
V
Y
 
L
K
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
A
 
Y
G
 
Q
V
 
L
R
 
R
R
 
-
V
 
-
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
x
P
S
|
S
N
x
T
H
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
F
F
 
G
T
 
P
E
 
S
R
 
T
P
 
P
E
 
Q
G
 
D
A
 
E
P
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
T
P
 
P
V
 
D
E
 
T
T
 
T
R
 
I
L
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
T
T
 
T
Y
 
M
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
|
K
C
 
V
F
 
H
G
 
V
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
E
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
Y
D
 
N
K
 
K
H
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
F
V
 
R
S
 
S
I
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_037571724.1 NCBI__GCF_000744815.1:WP_037571724.1
MSPAPAAPRTVLLTGAAGGVGSFLRASLPAEYGYDLRLFDQAPIEGEPEAITAPLSDTAA
LRKAAEGVDAIVHLAGISVEAPFADILGANIEGTYNLYKAARAAGVRRVVFASSNHAVGF
TERPEGAPESGATVPVETRLRPDTYYGLSKCFGENLASLYADKHGIETVSIRIGSCFAKP
RTVRMLDTWLSPADCHRLIHASITAELPAHSHGHHVVYGISANTRAWWSLDSAREIGFEP
QDDSEVFAAEVIAELGELTPEDPEYRYFGGAFTQQQV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory