SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_037577100.1 NCBI__GCF_000744815.1:WP_037577100.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07003 Pyruvate dehydrogenase [ubiquinone]; Pyruvate oxidase; POX; Pyruvate:ubiquinone-8 oxidoreductase; EC 1.2.5.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
33% identity, 98% coverage: 1:586/600 of query aligns to 1:569/572 of P07003

query
sites
P07003
M
|
M
S
x
K
E
x
Q
Q
x
T
V
|
V
S
x
A
D
x
A
F
x
Y
I
|
I
L
x
A
R
x
K
R
x
T
L
|
L
R
x
E
E
x
S
W
x
A
D
x
G
V
|
V
D
x
K
Y
x
R
V
x
I
F
x
W
G
|
G
Y
x
V
P
x
T
G
|
G
D
|
D
G
x
S
I
x
L
N
|
N
G
|
G
L
|
L
L
x
S
S
x
D
A
x
S
W
x
L
E
x
N
R
|
R
A
x
M
G
|
G
D
 
-
Q
x
T
P
x
I
R
x
E
F
x
W
I
x
M
Q
x
S
A
x
T
R
|
R
H
|
H
E
|
E
E
|
E
M
x
V
A
|
A
A
|
A
F
|
F
E
x
A
A
|
A
V
x
G
G
x
A
Y
x
E
A
|
A
K
x
Q
F
x
L
S
|
S
G
|
G
R
x
E
V
x
L
G
x
A
V
|
V
C
|
C
A
|
A
A
x
G
T
x
S
S
x
C
G
|
G
P
|
P
G
|
G
A
x
N
I
x
L
H
|
H
L
|
L
L
x
I
N
|
N
G
|
G
L
|
L
Y
x
F
D
|
D
A
x
C
K
x
H
L
x
R
D
x
N
H
|
H
V
|
V
P
|
P
V
|
V
V
x
L
A
|
A
L
x
I
V
x
A
G
x
A
Q
x
H
T
x
I
A
x
P
Q
x
S
T
x
S
A
x
E
I
|
I
G
|
G
G
x
S
S
x
G
Y
|
Y
Q
x
F
Q
|
Q
E
|
E
V
x
T
D
x
H
L
x
P
P
x
Q
N
x
E
L
|
L
Y
x
F
K
x
R
D
x
E
V
 
-
A
x
C
S
|
S
E
x
H
Y
|
Y
C
|
C
Q
x
E
L
|
L
V
|
V
T
x
S
T
x
S
P
|
P
E
|
E
Q
|
Q
L
x
I
P
|
P
N
x
Q
V
|
V
L
|
L
D
x
A
R
x
I
A
|
A
M
|
M
R
|
R
I
x
K
A
|
A
Q
x
V
A
x
L
R
x
N
K
x
R
T
x
G
V
|
V
T
x
S
A
x
V
V
|
V
I
x
V
V
x
L
P
|
P
A
x
G
D
|
D
V
|
V
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
H
 
-
A
 
-
F
 
-
K
x
A
M
x
L
V
x
K
P
|
P
S
x
A
S
x
P
L
x
E
G
|
G
F
x
A
S
x
T
G
x
M
S
x
H
A
x
W
Y
|
Y
-
x
H
-
x
A
-
x
P
-
x
Q
-
x
P
-
x
V
-
x
V
V
x
T
P
|
P
H
x
E
E
|
E
D
x
E
D
x
E
L
|
L
A
x
R
R
x
K
A
x
L
A
|
A
E
x
Q
V
x
L
L
|
L
N
x
R
S
x
Y
G
x
S
S
|
S
K
x
N
V
x
I
A
|
A
I
x
L
L
x
M
A
x
C
G
|
G
Q
x
S
G
|
G
A
x
C
R
x
A
G
|
G
A
|
A
S
x
H
A
x
K
E
|
E
L
|
L
I
x
V
E
|
E
T
x
F
A
|
A
E
x
G
V
x
K
L
x
I
G
x
K
A
|
A
G
x
P
V
x
I
A
x
V
K
x
H
A
|
A
L
|
L
L
x
R
G
|
G
K
|
K
D
x
E
V
x
H
L
x
V
P
x
E
D
x
Y
D
|
D
L
x
N
P
|
P
F
x
Y
V
x
D
T
x
V
G
|
G
A
x
M
S
x
T
G
|
G
L
|
L
L
x
I
G
|
G
T
x
F
R
x
S
P
x
S
T
x
G
Y
x
F
E
x
H
L
x
T
M
|
M
K
x
M
D
x
N
C
x
A
D
|
D
T
|
T
L
|
L
L
x
V
V
x
L
I
x
L
G
|
G
S
x
T
S
x
Q
F
|
F
P
|
P
Y
|
Y
S
x
R
Q
x
A
F
|
F
L
x
Y
P
|
P
E
x
T
F
 
-
G
 
-
Q
x
D
A
|
A
R
x
K
A
x
I
V
x
I
Q
|
Q
I
|
I
D
|
D
I
|
I
D
x
N
P
|
P
G
x
A
R
x
S
I
|
I
G
|
G
M
x
A
R
x
H
Y
x
S
P
x
K
F
x
V
E
x
D
V
x
M
N
x
A
L
|
L
V
|
V
G
|
G
D
|
D
A
x
I
R
x
K
E
x
S
T
|
T
L
|
L
R
|
R
R
x
A
L
|
L
L
|
L
P
|
P
L
|
L
L
x
V
S
x
E
R
x
E
K
|
K
E
x
A
D
|
D
R
|
R
G
x
K
W
x
F
R
x
L
E
x
D
K
|
K
I
x
A
E
x
L
Q
x
E
N
x
D
N
x
Y
S
x
R
R
x
D
W
x
A
W
x
R
E
x
K
V
x
G
M
x
L
K
x
D
R
x
D
R
x
L
A
|
A
S
x
K
V
x
P
E
x
S
A
x
E
D
x
K
P
x
A
I
|
I
N
x
H
P
|
P
E
x
Q
Y
|
Y
A
x
L
V
x
A
H
x
Q
V
x
Q
L
x
I
D
x
S
G
x
H
L
x
F
L
x
A
P
x
A
G
x
D
R
x
D
A
|
A
I
|
I
I
x
F
T
|
T
A
x
C
D
|
D
S
x
V
G
|
G
S
x
T
A
x
P
A
x
T
N
x
V
W
|
W
Y
x
A
A
|
A
R
|
R
H
x
Y
L
|
L
R
x
K
I
x
M
-
x
N
-
x
G
R
x
K
E
x
R
G
x
R
I
x
L
N
x
L
G
|
G
S
|
S
L
x
F
S
x
N
G
x
H
T
 
-
L
 
-
A
x
G
T
x
S
M
|
M
G
x
A
P
x
N
G
x
A
V
x
M
P
|
P
Y
x
Q
A
|
A
I
x
L
G
|
G
A
|
A
K
x
Q
F
x
A
S
x
T
C
x
E
P
|
P
D
x
E
R
|
R
P
x
Q
A
x
V
I
x
V
A
|
A
L
x
M
V
x
C
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
G
M
x
F
Q
x
S
M
|
M
N
x
L
G
 
-
L
x
M
A
x
G
E
x
D
L
x
F
I
x
L
T
x
S
V
|
V
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
x
V
E
x
Q
W
x
M
R
x
K
D
x
L
P
|
P
R
x
V
L
x
K
V
x
I
V
|
V
C
 
-
V
|
V
L
x
F
N
|
N
N
|
N
Q
x
S
D
x
V
L
|
L
N
x
G
Q
x
F
V
|
V
T
x
A
W
x
M
E
|
E
M
|
M
R
x
K
S
x
A
M
 
-
S
 
-
G
 
-
S
x
G
P
x
G
Q
x
Y
F
x
L
L
x
T
P
x
D
S
x
G
Q
x
T
Q
x
E
L
|
L
P
x
H
D
|
D
V
x
T
R
x
N
Y
x
F
A
|
A
D
x
R
F
x
I
A
|
A
R
x
E
G
x
A
L
x
C
G
|
G
L
x
I
H
x
T
G
|
G
I
|
I
R
|
R
V
|
V
E
|
E
K
|
K
P
x
A
E
x
S
E
|
E
V
|
V
E
x
D
P
x
E
A
|
A
W
x
L
R
x
Q
A
x
R
A
|
A
L
x
F
E
x
S
S
x
I
D
|
D
R
x
G
P
|
P
C
x
V
V
x
L
L
x
V
D
|
D
V
|
V
L
x
V
T
x
V
D
x
A
P
x
K
A
x
E
V
x
E
P
x
L
P
x
A
I
|
I
P
|
P
P
|
P
H
x
Q
A
x
I
T
x
K
W
x
L
D
x
E
Q
|
Q
I
x
A
E
x
K
A
x
G
T
x
F
A
x
S
S
x
L
S
x
Y
L
x
M
L
|
L
H
x
R
G
x
A
-
x
I
D
x
I
S
|
S
D
x
G
R
|
R
G
|
G
H
x
D
V
x
E
I
x
V
K
x
I
Q
x
E
G
x
L
A
|
A
K
|
K
A
x
T
K
x
N

Sites not aligning to the query:

3ey9A Structural basis for membrane binding and catalytic activation of the peripheral membrane enzyme pyruvate oxidase from escherichia coli (see paper)
33% identity, 97% coverage: 3:586/600 of query aligns to 2:568/571 of 3ey9A

query
sites
3ey9A
E
 
Q
Q
 
T
V
 
V
S
 
A
D
 
A
F
 
Y
I
 
I
L
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
R
 
E
E
 
S
W
 
A
D
 
G
V
 
V
D
 
K
Y
 
R
V
 
I
F
 
W
G
 
G
Y
x
V
P
x
T
G
|
G
D
|
D
G
x
S
I
x
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
S
S
 
D
A
 
S
W
 
L
E
 
N
R
 
R
A
 
M
G
 
G
D
 
-
Q
 
T
P
 
I
R
 
E
F
 
W
I
 
M
Q
 
S
A
 
T
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
A
A
 
A
V
 
G
G
 
A
Y
 
E
A
 
A
K
 
Q
F
 
L
S
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
A
 
A
A
 
G
T
x
S
S
 
C
G
 
G
P
 
P
G
|
G
A
 
N
I
 
L
H
|
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
A
 
C
K
 
H
L
 
R
D
 
N
H
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
I
V
 
A
G
 
A
Q
 
H
T
 
I
A
 
P
Q
 
S
T
 
S
A
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
S
S
 
G
Y
 
Y
Q
x
F
Q
|
Q
E
 
E
V
 
T
D
 
H
L
 
P
P
 
Q
N
 
E
L
 
L
Y
 
F
K
 
R
D
 
E
V
 
-
A
 
C
S
 
S
E
 
H
Y
 
Y
C
 
C
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
S
T
 
S
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
N
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
A
R
 
I
A
 
A
M
 
M
R
 
R
I
 
K
A
 
A
Q
 
V
A
 
L
R
 
N
K
 
R
T
 
G
V
 
V
T
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
P
 
P
A
x
G
D
 
D
V
 
V
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
H
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
A
M
 
L
V
 
K
P
 
P
S
 
A
S
 
P
L
 
E
G
 
G
F
 
A
S
 
T
G
 
M
S
 
H
A
 
W
Y
 
Y
-
 
H
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
V
-
 
V
V
 
T
P
 
P
H
 
E
E
 
E
D
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
R
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
Q
V
 
L
L
 
L
N
 
R
S
 
Y
G
 
S
S
 
S
K
 
N
V
 
I
A
 
A
I
 
L
L
 
M
A
 
C
G
|
G
Q
x
S
G
|
G
A
 
C
R
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
H
A
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
E
T
 
F
A
 
A
E
 
G
V
 
K
L
 
I
G
 
K
A
 
A
G
 
P
V
 
I
A
 
V
K
 
H
A
|
A
L
|
L
L
x
R
G
 
G
K
 
K
D
 
E
V
 
H
L
 
V
P
 
E
D
 
Y
D
 
D
L
 
N
P
 
P
F
 
Y
V
 
D
T
 
V
G
 
G
A
 
M
S
x
T
G
|
G
L
|
L
L
x
I
G
 
G
T
 
F
R
 
S
P
 
S
T
 
G
Y
 
F
E
 
H
L
 
T
M
 
M
K
 
M
D
 
N
C
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
V
V
 
L
I
 
L
G
|
G
S
x
T
S
x
Q
F
|
F
P
 
P
Y
|
Y
S
 
R
Q
x
A
F
 
F
L
 
Y
P
 
P
E
 
T
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
A
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
N
P
 
P
G
 
A
R
x
S
I
 
I
G
 
G
M
 
A
R
 
H
Y
 
S
P
 
K
F
 
V
E
 
D
V
 
M
N
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
D
|
D
A
x
I
R
 
K
E
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
V
S
 
E
R
 
E
K
 
K
E
 
A
D
 
D
R
 
R
G
 
K
W
 
F
R
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
A
E
 
L
Q
 
E
N
 
D
N
 
Y
S
 
R
R
 
D
W
 
A
W
 
R
E
 
K
V
 
G
M
 
L
K
 
D
R
 
D
R
 
L
A
 
A
S
 
K
V
 
P
E
 
S
A
 
E
D
 
K
P
 
A
I
 
I
N
 
H
P
 
P
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
L
V
 
A
H
 
Q
V
 
Q
L
 
I
D
 
S
G
 
H
L
 
F
L
 
A
P
 
A
G
 
D
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
F
T
 
T
A
 
C
D
 
D
S
x
V
G
|
G
S
x
T
A
x
P
A
x
T
N
 
V
W
 
W
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
L
 
L
R
 
K
I
 
M
-
 
N
-
 
G
R
 
K
E
 
R
G
 
R
I
 
L
N
 
L
G
 
G
S
 
S
L
x
F
S
x
N
G
 
H
T
 
-
L
 
-
A
x
G
T
 
S
M
|
M
G
 
A
P
 
N
G
 
A
V
 
M
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
F
 
A
S
 
T
C
 
E
P
 
P
D
 
E
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
C
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
G
M
 
F
Q
 
S
M
 
M
N
 
L
G
 
-
L
 
M
A
 
G
E
 
D
L
 
F
I
 
L
T
 
S
V
 
V
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
V
E
 
Q
W
 
M
R
 
K
D
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
K
V
 
I
V
 
V
C
 
-
V
 
V
L
 
F
N
 
N
N
|
N
Q
 
S
D
x
V
L
|
L
N
x
G
Q
x
F
V
|
V
T
 
A
W
 
M
E
|
E
M
 
M
R
 
K
S
 
A
M
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
G
P
 
G
Q
 
Y
F
 
L
L
 
T
P
 
D
S
 
G
Q
 
T
Q
 
E
L
 
L
P
 
H
D
 
D
V
 
T
R
 
N
Y
 
F
A
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
A
L
 
C
G
 
G
L
 
I
H
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
D
P
 
E
A
 
A
W
 
L
R
 
Q
A
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
S
S
 
I
D
 
D
R
 
G
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
V
T
 
V
D
 
A
P
x
K
A
 
E
V
 
E
P
 
L
P
 
A
I
 
I
P
 
P
P
 
P
H
 
Q
A
 
I
T
 
K
W
 
L
D
 
E
Q
 
Q
I
 
A
E
 
K
A
 
G
T
 
F
A
 
S
S
 
L
S
x
Y
L
 
M
L
 
L
H
 
R
G
 
A
-
 
I
D
 
I
S
 
S
D
 
G
R
 
R
G
 
G
H
 
D
V
 
E
I
 
V
K
 
I
Q
 
E
G
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
T
K
 
N

9ev3A Corynebacterium glutamicum pyruvate:quinone oxidoreductase (pqo) purified from bacteria grown in acetate minimal medium (see paper)
30% identity, 92% coverage: 9:561/600 of query aligns to 8:545/577 of 9ev3A

query
sites
9ev3A
I
 
L
L
 
I
R
 
D
R
 
T
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
Q
D
 
G
V
 
V
D
 
K
Y
 
R
V
 
I
F
 
Y
G
 
G
Y
 
L
P
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
S
I
 
L
N
 
N
G
 
P
L
 
I
L
 
V
S
 
D
A
 
A
W
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
S
G
 
D
D
 
I
Q
 
E
P
 
-
R
 
-
F
 
W
I
 
V
Q
 
H
A
 
V
R
 
R
H
 
N
E
 
E
E
 
E
M
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
A
A
 
A
V
 
G
G
 
A
Y
 
E
A
 
S
K
 
L
F
 
I
S
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
A
 
A
A
 
A
T
 
S
S
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
N
I
 
T
H
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
K
 
H
L
 
R
D
 
N
H
 
G
V
 
A
P
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
I
V
 
A
G
 
S
Q
 
H
T
 
I
A
 
P
Q
 
S
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
G
 
S
S
 
T
Y
 
F
Q
 
F
Q
 
Q
E
 
E
V
 
T
D
 
H
L
 
P
P
 
E
N
 
I
L
 
L
Y
 
F
K
 
K
D
 
E
V
 
-
A
 
C
S
 
S
E
 
G
Y
 
Y
C
 
C
Q
 
E
L
 
M
V
 
V
T
 
N
T
 
G
P
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
G
P
 
E
N
 
R
V
 
I
L
 
L
D
 
H
R
 
H
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
I
 
S
A
 
T
Q
 
M
A
 
A
R
 
G
K
 
K
T
 
G
V
 
V
T
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
I
Q
 
A
D
 
K
L
 
E
E
 
D
Y
 
A
S
 
G
A
 
D
P
 
G
T
 
T
H
 
Y
A
 
S
F
 
N
K
 
S
M
 
T
V
 
I
P
 
S
S
 
S
S
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
G
S
 
T
A
 
P
Y
 
V
V
 
V
-
 
F
P
 
P
H
 
D
E
 
P
D
 
T
D
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
I
N
 
N
S
 
N
G
 
A
S
 
K
K
 
S
V
 
V
A
 
T
I
 
L
L
 
F
A
 
C
G
|
G
Q
 
A
G
|
G
A
 
V
R
 
K
G
 
N
A
 
A
S
 
R
A
 
A
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
E
 
E
T
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
K
L
 
I
G
 
K
A
 
S
G
 
P
V
 
I
A
 
G
K
 
H
A
|
A
L
|
L
L
x
G
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
V
 
Y
L
 
I
P
 
Q
D
 
H
D
 
E
L
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
E
T
 
V
G
 
G
A
 
M
S
 
S
G
|
G
L
 
L
L
|
L
G
 
G
T
 
Y
R
 
G
P
 
A
T
 
C
Y
 
V
E
 
D
L
 
A
M
 
S
K
 
N
D
 
E
C
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
L
L
 
I
V
 
L
I
 
L
G
|
G
S
x
T
S
x
D
F
|
F
P
|
P
Y
|
Y
S
 
S
Q
 
D
F
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
K
F
 
D
G
 
N
Q
 
V
A
 
A
R
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
I
 
V
D
|
D
I
|
I
D
 
N
P
 
G
G
 
A
R
x
H
I
 
I
G
 
G
M
 
R
R
 
R
Y
 
T
P
 
T
F
 
V
E
 
K
V
 
Y
N
 
P
L
 
V
V
 
T
G
 
G
D
|
D
A
x
V
R
 
A
E
 
A
T
 
T
L
 
I
R
 
E
R
 
N
L
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
H
L
 
V
S
 
K
R
 
E
K
 
K
E
 
T
D
 
D
R
 
R
G
 
S
W
 
F
R
 
L
E
 
D
K
 
R
I
 
M
E
 
L
Q
 
K
N
 
A
N
 
H
S
 
E
R
 
R
W
 
K
W
 
L
E
 
S
-
 
S
-
 
V
V
 
V
M
 
E
K
 
T
R
 
Y
R
 
T
A
 
H
S
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
K
D
 
H
-
 
V
P
 
P
I
 
I
N
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
V
 
A
H
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
N
G
 
E
L
 
L
L
 
A
P
 
D
G
 
K
R
 
D
A
 
A
I
 
V
I
 
F
T
 
T
A
 
V
D
 
D
S
 
T
G
|
G
S
x
M
A
 
C
A
x
N
N
 
V
W
 
W
Y
 
H
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
L
 
I
R
 
E
I
 
N
R
 
P
E
 
E
G
 
G
I
 
T
N
 
R
G
 
D
S
 
F
L
 
V
-
 
G
S
 
S
G
x
F
T
x
R
L
 
H
A
 
G
T
 
T
M
|
M
G
 
A
P
 
N
G
 
A
V
 
L
P
 
P
Y
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
F
 
S
S
 
V
C
 
D
P
 
R
D
 
N
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
C
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
G
M
 
L
Q
 
G
M
|
M
N
 
L
G
 
L
L
 
G
A
 
E
E
 
L
L
 
L
I
 
T
T
 
V
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
K
W
 
L
R
 
H
D
 
Q
P
 
L
R
 
P
L
 
L
V
 
K
V
 
A
C
 
V
V
 
V
L
 
F
N
 
N
N
|
N
Q
 
S
D
x
S
L
|
L
N
x
G
Q
x
M
V
|
V
T
 
K
W
 
L
E
 
E
M
 
M
R
 
L
S
 
-
M
 
V
S
 
E
G
 
G
S
 
Q
P
 
P
Q
 
E
F
 
F
L
 
G
P
 
T
S
 
D
Q
 
H
Q
 
E
L
 
-
P
 
-
D
 
E
V
 
V
R
 
N
Y
 
F
A
 
A
D
 
E
F
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
K
G
 
S
I
 
V
R
 
R
V
 
I
E
 
T
K
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
K
V
 
V
E
 
R
P
 
E
A
 
Q
W
 
L
R
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
A
S
 
Y
D
 
P
R
 
G
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
V
T
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
N
V
 
A
P
 
L
P
 
S
I
 
I
P
 
P
P
 
P
H
 
T
A
 
I
T
 
T
W
 
W
D
 
E
Q
 
Q
I
 
V

2ezuA Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate 2-acetyl-thiamin diphosphate (see paper)
29% identity, 89% coverage: 9:544/600 of query aligns to 9:535/585 of 2ezuA

query
sites
2ezuA
I
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
Y
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
L
E
 
S
R
 
A
A
 
E
G
 
R
D
 
D
Q
 
R
P
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
G
I
 
T
H
 
H
L
 
L
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
H
|
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
A
 
G
Q
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
M
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
E
|
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
P
 
N
N
 
P
L
 
I
Y
 
Y
K
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
-
E
 
D
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
V
L
 
T
V
 
A
T
 
V
T
 
N
P
 
A
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
P
 
P
N
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
R
I
 
R
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
W
E
 
Y
Y
 
A
S
 
S
A
 
A
P
 
N
T
 
S
H
 
Y
A
 
Q
F
 
T
K
 
P
M
 
L
V
 
L
P
 
P
S
 
E
S
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
D
E
 
V
D
 
Q
D
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
N
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
G
 
K
A
 
A
S
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
E
E
 
Q
T
 
L
A
 
S
E
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
I
G
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
D
 
G
V
 
I
L
 
V
P
 
A
D
 
D
D
 
R
L
 
Y
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
T
 
L
G
 
G
A
 
S
S
x
A
G
x
N
L
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
M
 
L
K
 
A
D
 
Q
C
 
A
D
 
D
T
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
S
 
A
Q
x
E
F
 
V
L
 
S
P
 
K
E
 
A
F
 
F
G
 
K
Q
 
N
A
 
T
R
 
R
A
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
K
F
 
T
E
 
D
V
 
I
N
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
A
L
 
Q
L
 
V
S
 
S
R
 
E
K
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
T
G
 
P
W
 
W
R
 
W
E
 
Q
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
A
N
 
N
N
 
V
S
 
K
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
A
V
 
Y
M
 
L
K
 
A
R
 
S
R
 
L
A
 
E
S
 
D
V
 
K
E
 
Q
A
 
E
D
 
G
P
 
P
I
 
L
N
 
Q
P
 
A
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
L
H
 
R
V
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
E
G
 
P
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
x
D
A
 
I
A
 
N
N
 
L
W
 
N
Y
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
K
I
 
L
R
 
T
E
 
P
G
 
S
I
 
N
N
 
R
G
 
H
S
 
I
L
 
T
S
 
S
G
x
N
T
 
L
L
 
F
A
|
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
N
C
 
Y
P
 
P
D
 
E
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
F
A
 
N
L
 
L
V
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
-
 
G
-
 
A
A
 
S
M
 
M
Q
 
T
M
 
M
N
 
Q
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
Q
I
 
V
T
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
Q
W
 
Y
R
 
H
D
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
V
C
 
V
V
 
F
L
 
T
N
|
N
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
C
Q
|
Q
V
x
Y
T
x
G
W
|
W
E
x
I
M
 
K
R
 
D
S
x
E
M
 
Q
S
 
E
G
 
D
S
 
T
P
 
N
Q
 
Q
-
 
N
-
 
D
F
 
F
L
 
I
P
 
-
S
 
G
Q
 
V
Q
 
E
L
 
F
P
 
N
D
 
D
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
S
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
H
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
I
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
K
P
 
I
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
E
 
P
P
 
D
A
 
V
W
 
F
R
 
E
-
 
Q
-
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
Q
D
 
H
R
 
E
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

2ez9A Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate analogue 2-phosphonolactyl-thiamin diphosphate (see paper)
29% identity, 89% coverage: 9:544/600 of query aligns to 9:535/585 of 2ez9A

query
sites
2ez9A
I
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
Y
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
L
E
 
S
R
 
A
A
 
E
G
 
R
D
 
D
Q
 
R
P
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
G
I
 
T
H
 
H
L
 
L
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
H
|
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
A
 
G
Q
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
M
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
E
|
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
P
 
N
N
 
P
L
 
I
Y
 
Y
K
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
-
E
 
D
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
V
L
 
T
V
 
A
T
 
V
T
 
N
P
 
A
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
P
 
P
N
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
R
I
 
R
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
W
E
 
Y
Y
 
A
S
 
S
A
 
A
P
 
N
T
 
S
H
 
Y
A
 
Q
F
 
T
K
 
P
M
 
L
V
 
L
P
 
P
S
 
E
S
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
D
E
 
V
D
 
Q
D
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
N
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
G
 
K
A
 
A
S
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
E
E
 
Q
T
 
L
A
 
S
E
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
I
G
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
D
 
G
V
 
I
L
 
V
P
 
A
D
 
D
D
 
R
L
 
Y
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
T
 
L
G
 
G
A
 
S
S
x
A
G
x
N
L
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
M
 
L
K
 
A
D
 
Q
C
 
A
D
 
D
T
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
S
 
A
Q
x
E
F
 
V
L
 
S
P
 
K
E
 
A
F
 
F
G
 
K
Q
 
N
A
 
T
R
 
R
A
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
K
F
 
T
E
 
D
V
 
I
N
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
A
L
 
Q
L
 
V
S
 
S
R
 
E
K
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
T
G
 
P
W
 
W
R
 
W
E
 
Q
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
A
N
 
N
N
 
V
S
 
K
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
A
V
 
Y
M
 
L
K
 
A
R
 
S
R
 
L
A
 
E
S
 
D
V
 
K
E
 
Q
A
 
E
D
 
G
P
 
P
I
 
L
N
 
Q
P
 
A
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
L
H
 
R
V
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
E
G
 
P
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
x
D
A
 
I
A
 
N
N
 
L
W
 
N
Y
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
K
I
 
L
R
 
T
E
 
P
G
 
S
I
 
N
N
 
R
G
 
H
S
 
I
L
 
T
S
 
S
G
x
N
T
 
L
L
 
F
A
|
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
N
C
 
Y
P
 
P
D
 
E
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
F
A
 
N
L
 
L
V
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
-
 
G
-
 
A
A
 
S
M
 
M
Q
 
T
M
 
M
N
 
Q
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
Q
I
 
V
T
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
Q
W
 
Y
R
 
H
D
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
V
C
 
V
V
 
F
L
 
T
N
|
N
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
C
Q
|
Q
V
x
Y
T
x
G
W
|
W
E
x
I
M
 
K
R
 
D
S
x
E
M
 
Q
S
 
E
G
 
D
S
 
T
P
 
N
Q
 
Q
-
 
N
-
 
D
F
 
F
L
 
I
P
 
-
S
 
G
Q
 
V
Q
 
E
L
 
F
P
 
N
D
 
D
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
S
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
H
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
I
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
K
P
 
I
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
E
 
P
P
 
D
A
 
V
W
 
F
R
 
E
-
 
Q
-
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
Q
D
 
H
R
 
E
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

2ez8A Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate 2-lactyl-thiamin diphosphate (see paper)
29% identity, 89% coverage: 9:544/600 of query aligns to 9:535/585 of 2ez8A

query
sites
2ez8A
I
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
Y
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
L
E
 
S
R
 
A
A
 
E
G
 
R
D
 
D
Q
 
R
P
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
G
I
 
T
H
 
H
L
 
L
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
H
|
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
A
 
G
Q
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
M
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
E
|
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
P
 
N
N
 
P
L
 
I
Y
 
Y
K
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
-
E
 
D
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
V
L
 
T
V
 
A
T
 
V
T
 
N
P
 
A
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
P
 
P
N
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
R
I
 
R
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
W
E
 
Y
Y
 
A
S
 
S
A
 
A
P
 
N
T
 
S
H
 
Y
A
 
Q
F
 
T
K
 
P
M
 
L
V
 
L
P
 
P
S
 
E
S
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
D
E
 
V
D
 
Q
D
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
N
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
G
 
K
A
 
A
S
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
E
E
 
Q
T
 
L
A
 
S
E
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
I
G
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
D
 
G
V
 
I
L
 
V
P
 
A
D
 
D
D
 
R
L
 
Y
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
T
 
L
G
 
G
A
 
S
S
x
A
G
x
N
L
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
M
 
L
K
 
A
D
 
Q
C
 
A
D
 
D
T
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
S
 
A
Q
x
E
F
 
V
L
 
S
P
 
K
E
 
A
F
 
F
G
 
K
Q
 
N
A
 
T
R
 
R
A
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
K
F
 
T
E
 
D
V
 
I
N
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
A
L
 
Q
L
 
V
S
 
S
R
 
E
K
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
T
G
 
P
W
 
W
R
 
W
E
 
Q
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
A
N
 
N
N
 
V
S
 
K
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
A
V
 
Y
M
 
L
K
 
A
R
 
S
R
 
L
A
 
E
S
 
D
V
 
K
E
 
Q
A
 
E
D
 
G
P
 
P
I
 
L
N
 
Q
P
 
A
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
L
H
 
R
V
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
E
G
 
P
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
x
D
A
 
I
A
x
N
N
 
L
W
 
N
Y
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
K
I
 
L
R
 
T
E
 
P
G
 
S
I
 
N
N
 
R
G
 
H
S
 
I
L
 
T
S
 
S
G
x
N
T
 
L
L
 
F
A
|
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
N
C
 
Y
P
 
P
D
 
E
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
F
A
 
N
L
 
L
V
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
-
 
G
-
 
A
A
 
S
M
 
M
Q
 
T
M
 
M
N
 
Q
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
Q
I
 
V
T
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
Q
W
 
Y
R
 
H
D
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
V
C
 
V
V
 
F
L
 
T
N
|
N
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
C
Q
|
Q
V
x
Y
T
x
G
W
|
W
E
x
I
M
 
K
R
 
D
S
x
E
M
 
Q
S
 
E
G
 
D
S
 
T
P
 
N
Q
 
Q
-
 
N
-
 
D
F
 
F
L
 
I
P
 
-
S
 
G
Q
 
V
Q
 
E
L
 
F
P
 
N
D
 
D
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
S
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
H
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
I
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
K
P
 
I
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
E
 
P
P
 
D
A
 
V
W
 
F
R
 
E
-
 
Q
-
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
Q
D
 
H
R
 
E
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

2ez4B Pyruvate oxidase variant f479w (see paper)
29% identity, 89% coverage: 9:544/600 of query aligns to 9:535/585 of 2ez4B

query
sites
2ez4B
I
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
Y
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
L
E
 
S
R
 
A
A
 
E
G
 
R
D
 
D
Q
 
R
P
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
G
I
 
T
H
 
H
L
 
L
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
H
|
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
A
 
G
Q
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
M
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
E
|
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
P
 
N
N
 
P
L
 
I
Y
 
Y
K
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
-
E
 
D
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
V
L
 
T
V
 
A
T
 
V
T
 
N
P
 
A
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
P
 
P
N
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
R
I
 
R
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
W
E
 
Y
Y
 
A
S
 
S
A
 
A
P
 
N
T
 
S
H
 
Y
A
 
Q
F
 
T
K
 
P
M
 
L
V
 
L
P
 
P
S
 
E
S
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
D
E
 
V
D
 
Q
D
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
N
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
G
 
K
A
 
A
S
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
E
E
 
Q
T
 
L
A
 
S
E
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
I
G
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
D
 
G
V
 
I
L
 
V
P
 
A
D
 
D
D
 
R
L
 
Y
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
T
 
L
G
 
G
A
 
S
S
x
A
G
x
N
L
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
M
 
L
K
 
A
D
 
Q
C
 
A
D
 
D
T
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
S
 
A
Q
x
E
F
 
V
L
 
S
P
 
K
E
 
A
F
 
F
G
 
K
Q
 
N
A
 
T
R
 
R
A
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
K
F
 
T
E
 
D
V
 
I
N
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
A
L
 
Q
L
 
V
S
 
S
R
 
E
K
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
T
G
 
P
W
 
W
R
 
W
E
 
Q
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
A
N
 
N
N
 
V
S
 
K
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
A
V
 
Y
M
 
L
K
 
A
R
 
S
R
 
L
A
 
E
S
 
D
V
 
K
E
 
Q
A
 
E
D
 
G
P
 
P
I
 
L
N
 
Q
P
 
A
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
L
H
 
R
V
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
E
G
 
P
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
x
D
A
 
I
A
 
N
N
 
L
W
 
N
Y
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
K
I
 
L
R
 
T
E
 
P
G
 
S
I
 
N
N
 
R
G
 
H
S
 
I
L
 
T
S
 
S
G
x
N
T
 
L
L
 
F
A
|
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
N
C
 
Y
P
 
P
D
 
E
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
F
A
 
N
L
 
L
V
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
-
x
G
-
 
A
A
 
S
M
 
M
Q
 
T
M
 
M
N
 
Q
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
Q
I
 
V
T
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
Q
W
 
Y
R
 
H
D
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
V
C
 
V
V
 
F
L
 
T
N
|
N
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
C
Q
|
Q
V
x
Y
T
x
G
W
|
W
E
x
I
M
 
K
R
 
D
S
x
E
M
 
Q
S
 
E
G
 
D
S
 
T
P
 
N
Q
 
Q
-
 
N
-
 
D
F
 
F
L
 
I
P
 
-
S
 
G
Q
 
V
Q
 
E
L
 
F
P
 
N
D
 
D
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
S
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
H
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
I
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
K
P
 
I
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
E
 
P
P
 
D
A
 
V
W
 
F
R
 
E
-
 
Q
-
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
Q
D
 
H
R
 
E
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4feeA High-resolution structure of pyruvate oxidase in complex with reaction intermediate 2-hydroxyethyl-thiamin diphosphate carbanion-enamine, crystal b (see paper)
28% identity, 89% coverage: 9:544/600 of query aligns to 9:535/586 of 4feeA

query
sites
4feeA
I
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
G
 
G
D
 
G
G
 
S
I
 
I
N
 
N
G
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
L
E
 
S
R
 
A
A
 
E
G
 
R
D
 
D
Q
 
R
P
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V
R
 
R
H
 
H
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
F
A
 
G
T
 
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
G
I
 
T
H
 
H
L
 
L
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
H
|
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
A
 
G
Q
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
M
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
T
Q
 
F
Q
 
Q
E
 
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
P
 
N
N
 
P
L
 
I
Y
 
Y
K
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
-
E
 
D
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
V
L
 
T
V
 
A
T
 
V
T
 
N
P
 
A
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
P
 
P
N
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
R
I
 
R
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
 
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
W
E
 
Y
Y
 
A
S
 
S
A
 
A
P
 
N
T
 
S
H
 
Y
A
 
Q
F
 
T
K
 
P
M
 
L
V
 
L
P
 
P
S
 
E
S
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
D
E
 
V
D
 
Q
D
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
N
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
G
 
K
A
 
A
S
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
E
E
 
Q
T
 
L
A
 
S
E
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
I
G
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
D
 
G
V
 
I
L
 
V
P
 
A
D
 
D
D
 
R
L
 
Y
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
T
 
L
G
 
G
A
 
S
S
x
A
G
x
N
L
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
M
 
L
K
 
A
D
 
Q
C
 
A
D
 
D
T
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
S
 
A
Q
 
E
F
 
V
L
 
S
P
 
K
E
 
A
F
 
F
G
 
K
Q
 
N
A
 
T
R
 
R
A
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
K
F
 
T
E
 
D
V
 
I
N
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
A
L
 
Q
L
 
V
S
 
S
R
 
E
K
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
T
G
 
P
W
 
W
R
 
W
E
 
Q
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
A
N
 
N
N
 
V
S
 
K
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
A
V
 
Y
M
 
L
K
 
A
R
 
S
R
 
L
A
 
E
S
 
D
V
 
K
E
 
Q
A
 
E
D
 
G
P
 
P
I
 
L
N
 
Q
P
 
A
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
L
H
 
R
V
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
E
G
 
P
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
x
D
A
 
I
A
x
N
N
 
L
W
 
N
Y
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
K
I
 
L
R
 
T
E
 
P
G
 
S
I
 
N
N
 
R
G
 
H
S
 
I
L
 
T
S
 
S
G
x
N
T
 
L
L
 
F
A
|
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
N
C
 
Y
P
 
P
D
 
E
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
F
A
 
N
L
 
L
V
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
-
 
G
-
 
A
A
 
S
M
 
M
Q
 
T
M
 
M
N
 
Q
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
Q
I
 
V
T
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
Q
W
 
Y
R
 
H
D
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
V
C
 
V
V
 
F
L
 
T
N
|
N
N
 
C
Q
|
Q
D
 
-
L
 
-
N
x
Y
Q
x
G
V
x
F
T
x
I
W
 
K
E
 
D
M
 
E
R
 
Q
S
 
E
M
 
D
S
 
T
G
 
N
S
 
Q
P
 
N
Q
 
D
F
 
F
L
 
I
P
 
-
S
 
G
Q
 
V
Q
 
E
L
 
F
P
 
N
D
 
D
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
S
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
H
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
I
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
K
P
 
I
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
E
 
P
P
 
D
A
 
V
W
 
F
R
 
E
-
 
Q
-
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
Q
D
 
H
R
 
E
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1powA The refined structures of a stabilized mutant and of wild-type pyruvate oxidase from lactobacillus plantarum (see paper)
28% identity, 89% coverage: 9:544/600 of query aligns to 9:535/585 of 1powA

query
sites
1powA
I
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
Y
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
L
E
 
S
R
 
A
A
 
E
G
 
R
D
 
D
Q
 
R
P
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
G
I
 
T
H
 
H
L
 
L
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
H
|
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
A
 
G
Q
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
M
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
E
|
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
P
 
N
N
 
P
L
 
I
Y
 
Y
K
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
-
E
 
D
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
V
L
 
T
V
 
A
T
 
V
T
 
N
P
 
A
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
P
 
P
N
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
R
I
 
R
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
W
E
 
Y
Y
 
A
S
 
S
A
 
A
P
 
N
T
 
S
H
 
Y
A
 
Q
F
 
T
K
 
P
M
 
L
V
 
L
P
 
P
S
 
E
S
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
D
E
 
V
D
 
Q
D
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
N
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
G
 
K
A
 
A
S
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
E
E
 
Q
T
 
L
A
 
S
E
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
I
G
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
 
P
G
 
A
K
 
K
D
 
G
V
 
I
L
 
V
P
 
A
D
 
D
D
 
R
L
 
Y
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
T
 
L
G
 
G
A
 
S
S
x
A
G
 
N
L
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
M
 
L
K
 
A
D
 
Q
C
 
A
D
 
D
T
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
x
Y
P
|
P
Y
x
F
S
 
A
Q
x
E
F
 
V
L
 
S
P
 
K
E
 
A
F
 
F
G
 
K
Q
 
N
A
 
T
R
 
R
A
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
K
F
 
T
E
 
D
V
 
I
N
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
A
L
 
Q
L
 
V
S
 
S
R
 
E
K
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
T
G
 
P
W
 
W
R
 
W
E
 
Q
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
A
N
 
N
N
 
V
S
 
K
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
A
V
 
Y
M
 
L
K
 
A
R
 
S
R
 
L
A
 
E
S
 
D
V
 
K
E
 
Q
A
 
E
D
 
G
P
 
P
I
 
L
N
 
Q
P
 
A
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
L
H
 
R
V
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
E
G
 
P
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
x
D
A
 
I
A
 
N
N
 
L
W
 
N
Y
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
K
I
 
L
R
 
T
E
 
P
G
 
S
I
 
N
N
 
R
G
 
H
S
 
I
L
 
T
S
 
S
G
x
N
T
 
L
L
 
F
A
|
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
N
C
 
Y
P
 
P
D
 
E
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
F
A
 
N
L
 
L
V
 
A
G
 
G
D
|
D
G
|
G
-
 
G
-
 
A
A
 
S
M
 
M
Q
 
T
M
 
M
N
 
Q
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
Q
I
 
V
T
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
Q
W
 
Y
R
 
H
D
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
V
C
 
V
V
 
F
L
 
T
N
|
N
N
 
C
Q
|
Q
D
 
-
L
 
-
N
x
Y
Q
x
G
V
x
F
T
x
I
W
 
K
E
 
D
M
x
E
R
 
Q
S
 
E
M
 
D
S
 
T
G
 
N
S
 
Q
P
 
N
Q
 
D
F
 
F
L
 
I
P
 
-
S
 
G
Q
 
V
Q
 
E
L
 
F
P
 
N
D
 
D
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
S
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
H
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
I
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
K
P
 
I
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
E
 
P
P
 
D
A
 
V
W
 
F
R
 
E
-
 
Q
-
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
Q
D
 
H
R
 
E
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

9ev4A Pyruvate:quinone oxidoreductase (pqo) from corynebacterium glutamicum cs176 (see paper)
30% identity, 92% coverage: 9:561/600 of query aligns to 7:522/553 of 9ev4A

query
sites
9ev4A
I
 
L
L
 
I
R
 
D
R
 
T
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
Q
D
 
G
V
 
V
D
 
K
Y
 
R
V
 
I
F
 
Y
G
 
G
Y
 
L
P
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
S
I
 
L
N
 
N
G
 
P
L
 
I
L
 
V
S
 
D
A
 
A
W
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
I
Q
 
E
P
 
-
R
 
-
F
 
W
I
 
V
Q
 
H
A
 
V
R
 
R
H
 
N
E
 
E
E
 
E
M
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
A
A
 
A
V
 
G
G
 
A
Y
 
E
A
 
S
K
 
L
F
 
I
S
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
A
 
A
A
 
A
T
 
S
S
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
N
I
 
T
H
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
K
 
H
L
 
R
D
 
N
H
 
G
V
 
A
P
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
I
V
 
A
G
 
S
Q
 
H
T
 
I
A
 
P
Q
 
S
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
G
 
S
S
 
T
Y
 
F
Q
 
F
Q
 
Q
E
 
E
V
 
T
D
 
H
L
 
P
P
 
E
N
 
I
L
 
L
Y
 
F
K
 
K
D
 
E
V
 
-
A
 
C
S
 
S
E
 
G
Y
 
Y
C
 
C
Q
 
E
L
 
M
V
 
V
T
 
N
T
 
G
P
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
G
P
 
E
N
 
R
V
 
I
L
 
L
D
 
H
R
 
H
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
I
 
S
A
 
T
Q
 
M
A
 
A
R
 
G
K
 
K
T
 
G
V
 
V
T
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
I
Q
 
A
D
 
K
L
 
E
E
 
D
Y
 
A
S
 
G
A
 
D
P
 
G
T
 
T
H
 
Y
A
 
S
F
 
N
K
 
S
M
 
T
V
 
I
P
 
S
S
 
S
S
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
G
S
 
T
A
 
P
Y
 
V
V
 
V
-
 
F
P
 
P
H
 
D
E
 
P
D
 
T
D
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
I
N
 
N
S
 
N
G
 
A
S
 
K
K
 
S
V
 
V
A
 
T
I
 
L
L
 
F
A
 
C
G
|
G
Q
x
A
G
|
G
A
 
V
R
 
K
G
 
N
A
 
A
S
 
R
A
 
A
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
E
 
E
T
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
K
L
 
I
G
 
K
A
 
S
G
 
P
V
 
I
A
 
G
K
 
H
A
|
A
L
|
L
L
x
G
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
V
 
Y
L
 
I
P
 
Q
D
 
H
D
 
E
L
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
E
T
 
V
G
 
G
A
 
M
S
 
S
G
|
G
L
 
L
L
|
L
G
 
G
T
 
Y
R
 
G
P
 
A
T
 
C
Y
 
V
E
 
D
L
 
A
M
 
S
K
 
N
D
 
E
C
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
L
L
 
I
V
 
L
I
 
L
G
|
G
S
x
T
S
x
D
F
|
F
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
Q
 
D
F
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
K
F
 
D
G
 
N
Q
 
V
A
 
A
R
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
I
 
V
D
|
D
I
|
I
D
 
N
P
 
G
G
 
A
R
x
H
I
 
I
G
 
G
M
 
R
R
 
R
Y
 
T
P
 
T
F
 
V
E
 
K
V
 
Y
N
 
P
L
 
V
V
 
T
G
 
G
D
|
D
A
x
V
R
 
A
E
 
A
T
 
T
L
 
I
R
 
E
R
 
N
L
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
H
L
 
V
S
 
K
R
 
E
K
 
K
E
 
T
D
 
D
R
 
R
G
 
S
W
 
F
R
 
L
E
 
D
K
 
R
I
 
M
E
 
L
Q
 
K
N
 
A
N
 
H
S
 
E
R
 
R
W
 
K
W
 
L
E
 
S
-
 
S
-
 
V
V
 
V
M
 
E
K
 
T
R
 
Y
R
 
T
A
 
H
S
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
K
D
 
H
-
 
V
P
 
P
I
 
I
N
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
V
 
A
H
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
N
G
 
E
L
 
L
L
 
A
P
 
D
G
 
K
R
 
D
A
 
A
I
 
V
I
 
F
T
 
T
A
 
V
D
 
D
S
 
T
G
 
G
S
 
M
A
 
C
A
x
N
N
 
V
W
 
W
Y
 
H
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
L
 
I
R
 
E
I
 
N
R
 
P
E
 
E
G
 
G
I
 
T
N
 
R
G
 
D
S
 
F
L
 
V
-
 
G
S
 
S
G
x
F
T
x
R
L
 
H
A
 
G
T
 
T
M
 
M
G
 
A
P
 
N
G
 
A
V
 
L
P
 
P
Y
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
F
 
S
S
 
V
C
 
D
P
 
R
D
 
N
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
C
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
G
M
 
L
Q
 
G
M
 
M
N
 
L
G
 
L
L
 
G
A
 
E
E
 
L
L
 
L
I
 
T
T
 
V
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
K
W
 
L
R
 
H
D
 
K
P
 
L
R
 
P
L
 
L
V
 
K
V
 
A
C
 
V
V
 
V
L
 
F
N
 
N
N
 
N
Q
 
S
D
 
E
L
 
V
N
 
N
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
W
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
Y
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
K
G
 
S
I
 
V
R
 
R
V
 
I
E
 
T
K
 
D
P
 
P
E
 
T
E
 
K
V
 
V
E
 
R
P
 
E
A
 
Q
W
 
L
R
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
S
 
Y
D
 
P
R
 
G
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
V
T
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
N
V
 
A
P
 
L
P
 
S
I
 
I
P
 
P
P
 
P
H
 
T
A
 
I
T
 
T
W
 
W
D
 
E
Q
 
Q
I
 
V

1v5gA Crystal structure of the reaction intermediate between pyruvate oxidase containing fad and tpp, and substrate pyruvate (see paper)
28% identity, 88% coverage: 9:537/600 of query aligns to 9:525/589 of 1v5gA

query
sites
1v5gA
I
 
V
L
 
M
R
 
K
R
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
S
W
 
W
D
 
G
V
 
A
D
 
D
Y
 
T
V
 
I
F
 
Y
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
G
 
S
D
 
G
G
 
T
I
 
L
N
 
S
G
 
S
L
 
L
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
M
E
 
G
R
 
E
A
 
E
G
 
E
D
 
N
Q
 
N
P
 
V
R
 
K
F
 
F
I
 
L
Q
 
Q
A
 
V
R
 
K
H
 
H
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
M
Y
 
Q
A
 
S
K
 
K
F
 
F
S
 
G
G
 
G
R
 
N
V
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
T
A
 
V
A
 
G
T
 
S
S
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
A
L
 
M
D
 
D
H
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
Q
 
S
T
 
R
A
 
P
Q
 
Q
T
 
R
A
 
E
I
 
L
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
E
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
Q
P
 
N
N
 
P
L
 
M
Y
 
Y
K
 
D
D
 
H
V
 
I
A
 
A
S
 
V
E
 
-
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
R
L
 
R
V
 
V
T
 
A
T
 
Y
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
N
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
A
R
 
R
I
 
M
A
 
A
Q
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
R
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
L
I
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
F
Q
 
A
D
 
K
L
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
W
Y
 
Y
S
 
S
A
 
S
P
 
A
T
 
N
H
 
S
A
 
L
F
 
R
K
 
K
M
 
Y
V
 
A
P
 
P
S
 
I
S
 
A
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
A
E
 
A
D
 
Q
D
 
D
L
 
I
A
 
D
R
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
N
S
 
N
G
 
S
S
 
K
K
 
R
V
 
P
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
T
R
 
M
G
 
G
A
 
H
S
 
G
A
 
P
E
 
A
L
 
V
I
 
Q
E
 
E
T
 
L
A
 
A
E
 
R
V
 
K
L
 
I
G
 
K
A
 
A
G
 
P
V
 
V
A
 
I
K
 
T
A
x
T
L
x
G
L
x
K
G
 
N
K
 
F
D
 
E
V
 
T
L
 
F
P
 
E
D
 
W
D
 
D
L
 
F
P
 
E
F
 
A
V
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
x
T
G
x
Y
L
x
R
L
x
V
G
 
G
T
 
W
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
T
M
 
I
K
 
L
D
 
E
C
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
A
G
|
G
S
|
S
S
x
N
F
|
F
P
 
P
Y
x
F
S
 
S
Q
 
E
F
 
V
L
 
E
P
 
G
E
 
T
F
 
F
G
 
R
Q
 
N
A
 
V
-
 
D
R
 
N
A
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
M
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
H
F
 
A
E
 
D
V
 
V
N
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
D
|
D
A
|
A
R
 
A
E
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
D
R
 
E
L
 
I
L
 
L
P
 
N
L
 
K
L
 
V
S
 
D
R
 
A
K
 
V
E
 
E
D
 
E
R
 
S
G
 
A
W
 
W
R
 
W
E
 
T
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
K
N
 
N
N
 
I
S
 
A
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
E
V
 
Y
M
 
I
K
 
N
R
 
M
R
 
L
A
 
E
S
 
T
V
 
K
E
 
E
A
 
E
D
 
G
P
 
D
I
 
L
N
 
Q
P
 
F
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
Y
H
 
N
V
 
A
L
 
I
D
 
N
G
 
N
L
 
H
L
 
A
P
 
D
G
 
E
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
x
N
A
 
S
A
 
T
N
 
Q
W
 
T
Y
 
S
A
 
I
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
H
I
 
M
R
 
T
E
 
P
G
 
K
I
 
N
N
 
M
G
 
W
S
 
R
L
 
T
S
 
S
G
x
P
T
 
L
L
 
F
A
 
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
F
 
N
S
 
T
C
 
Y
P
 
P
D
 
D
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
W
A
 
N
L
 
I
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
M
 
F
Q
 
S
M
 
M
N
 
T
G
 
-
L
 
Y
A
 
P
E
 
D
L
 
V
I
 
V
T
 
T
V
 
N
G
 
V
K
 
R
Y
 
Y
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
N
P
 
M
R
 
P
L
 
V
V
 
I
V
 
N
C
 
V
V
 
V
L
 
F
N
 
S
N
|
N
Q
 
T
D
x
E
L
x
Y
N
x
A
Q
x
F
V
x
I
T
 
K
W
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
N
S
 
K
M
 
Y
S
 
E
G
 
D
S
 
T
P
 
N
Q
 
K
F
 
N
L
 
L
P
 
F
S
 
G
Q
 
V
Q
 
D
L
 
F
P
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
D
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
A
L
 
Q
G
 
G
L
 
A
H
 
K
G
 
G
I
 
F
R
 
T
V
 
V
E
 
S
K
 
R
P
 
I
E
 
E
E
 
D
V
 
M
E
 
D
P
 
R
A
 
V
W
 
M
R
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
A
D
 
N
R
 
K

1v5fA Crystal structure of pyruvate oxidase complexed with fad and tpp, from aerococcus viridans (see paper)
28% identity, 88% coverage: 9:537/600 of query aligns to 9:525/589 of 1v5fA

query
sites
1v5fA
I
 
V
L
 
M
R
 
K
R
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
S
W
 
W
D
 
G
V
 
A
D
 
D
Y
 
T
V
 
I
F
 
Y
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
G
 
S
D
 
G
G
 
T
I
 
L
N
 
S
G
 
S
L
 
L
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
M
E
 
G
R
 
E
A
 
E
G
 
E
D
 
N
Q
 
N
P
 
V
R
 
K
F
 
F
I
 
L
Q
 
Q
A
 
V
R
 
K
H
 
H
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
M
Y
 
Q
A
 
S
K
 
K
F
 
F
S
 
G
G
 
G
R
 
N
V
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
T
A
 
V
A
 
G
T
 
S
S
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
A
L
 
M
D
 
D
H
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
Q
 
S
T
 
R
A
 
P
Q
 
Q
T
 
R
A
 
E
I
 
L
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
E
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
Q
P
 
N
N
 
P
L
 
M
Y
 
Y
K
 
D
D
 
H
V
 
I
A
 
A
S
 
V
E
 
-
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
R
L
 
R
V
 
V
T
 
A
T
 
Y
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
N
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
A
R
 
R
I
 
M
A
 
A
Q
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
R
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
L
I
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
F
Q
 
A
D
 
K
L
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
W
Y
 
Y
S
 
S
A
 
S
P
 
A
T
 
N
H
 
S
A
 
L
F
 
R
K
 
K
M
 
Y
V
 
A
P
 
P
S
 
I
S
 
A
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
A
E
 
A
D
 
Q
D
 
D
L
 
I
A
 
D
R
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
N
S
 
N
G
 
S
S
 
K
K
 
R
V
 
P
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
T
R
 
M
G
 
G
A
 
H
S
 
G
A
 
P
E
 
A
L
 
V
I
 
Q
E
 
E
T
 
L
A
 
A
E
 
R
V
 
K
L
 
I
G
 
K
A
 
A
G
 
P
V
 
V
A
 
I
K
 
T
A
x
T
L
x
G
L
x
K
G
 
N
K
 
F
D
 
E
V
 
T
L
 
F
P
 
E
D
 
W
D
 
D
L
 
F
P
 
E
F
 
A
V
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
x
T
G
x
Y
L
x
R
L
x
V
G
 
G
T
 
W
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
T
M
 
I
K
 
L
D
 
E
C
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
A
G
|
G
S
|
S
S
x
N
F
|
F
P
|
P
Y
x
F
S
 
S
Q
 
E
F
 
V
L
 
E
P
 
G
E
 
T
F
 
F
G
 
R
Q
 
N
A
 
V
-
 
D
R
 
N
A
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
M
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
H
F
 
A
E
 
D
V
 
V
N
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
D
|
D
A
|
A
R
 
A
E
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
D
R
 
E
L
 
I
L
 
L
P
 
N
L
 
K
L
 
V
S
 
D
R
 
A
K
 
V
E
 
E
D
 
E
R
 
S
G
 
A
W
 
W
R
 
W
E
 
T
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
K
N
 
N
N
 
I
S
 
A
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
E
V
 
Y
M
 
I
K
 
N
R
 
M
R
 
L
A
 
E
S
 
T
V
 
K
E
 
E
A
 
E
D
 
G
P
 
D
I
 
L
N
 
Q
P
 
F
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
Y
H
 
N
V
 
A
L
 
I
D
 
N
G
 
N
L
 
H
L
 
A
P
 
D
G
 
E
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
 
V
G
 
G
S
x
N
A
x
S
A
 
T
N
 
Q
W
 
T
Y
 
S
A
 
I
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
H
I
 
M
R
 
T
E
 
P
G
 
K
I
 
N
N
 
M
G
 
W
S
 
R
L
 
T
S
 
S
G
x
P
T
 
L
L
 
F
A
 
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
F
 
N
S
 
T
C
 
Y
P
 
P
D
 
D
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
W
A
 
N
L
 
I
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
 
A
M
 
F
Q
 
S
M
 
M
N
 
T
G
 
-
L
 
Y
A
 
P
E
 
D
L
 
V
I
 
V
T
 
T
V
 
N
G
 
V
K
 
R
Y
 
Y
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
N
P
 
M
R
 
P
L
 
V
V
 
I
V
 
N
C
 
V
V
 
V
L
 
F
N
 
S
N
|
N
Q
 
T
D
 
E
L
x
Y
N
x
A
Q
x
F
V
x
I
T
 
K
W
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
N
S
 
K
M
 
Y
S
 
E
G
 
D
S
 
T
P
 
N
Q
 
K
F
 
N
L
 
L
P
 
F
S
 
G
Q
 
V
Q
 
D
L
 
F
P
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
D
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
A
L
 
Q
G
 
G
L
 
A
H
 
K
G
 
G
I
 
F
R
 
T
V
 
V
E
 
S
K
 
R
P
 
I
E
 
E
E
 
D
V
 
M
E
 
D
P
 
R
A
 
V
W
 
M
R
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
A
D
 
N
R
 
K

2djiA Crystal structure of pyruvate oxidase from aerococcus viridans containing fad (see paper)
28% identity, 88% coverage: 9:537/600 of query aligns to 10:526/590 of 2djiA

query
sites
2djiA
I
 
V
L
 
M
R
 
K
R
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
S
W
 
W
D
 
G
V
 
A
D
 
D
Y
 
T
V
 
I
F
 
Y
G
 
G
Y
x
I
P
 
P
G
x
S
D
x
G
G
x
T
I
x
L
N
 
S
G
 
S
L
 
L
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
M
E
 
G
R
 
E
A
 
E
G
 
E
D
 
N
Q
 
N
P
 
V
R
 
K
F
 
F
I
 
L
Q
 
Q
A
 
V
R
 
K
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
M
Y
 
Q
A
 
S
K
 
K
F
 
F
S
 
G
G
 
G
R
 
N
V
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
T
A
 
V
A
 
G
T
x
S
S
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
A
L
 
M
D
 
D
H
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
Q
 
S
T
 
R
A
 
P
Q
 
Q
T
 
R
A
 
E
I
 
L
G
 
N
G
 
M
S
 
D
Y
 
A
Q
x
F
Q
|
Q
E
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
Q
P
 
N
N
 
P
L
 
M
Y
 
Y
K
 
D
D
 
H
V
 
I
A
 
A
S
 
V
E
 
-
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
R
L
 
R
V
 
V
T
 
A
T
 
Y
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
N
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
A
R
 
R
I
 
M
A
 
A
Q
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
R
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
L
I
 
E
V
 
V
P
 
P
A
x
G
D
 
D
V
 
F
Q
 
A
D
 
K
L
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
W
Y
 
Y
S
 
S
A
 
S
P
 
A
T
 
N
H
 
S
A
 
L
F
 
R
K
 
K
M
 
Y
V
 
A
P
 
P
S
 
I
S
 
A
L
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
A
E
 
A
D
 
Q
D
 
D
L
 
I
A
 
D
R
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
N
S
 
N
G
 
S
S
 
K
K
 
R
V
 
P
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
|
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
T
R
 
M
G
 
G
A
 
H
S
 
G
A
 
P
E
 
A
L
 
V
I
 
Q
E
 
E
T
 
L
A
 
A
E
 
R
V
 
K
L
 
I
G
 
K
A
 
A
G
 
P
V
 
V
A
 
I
K
 
T
A
x
T
L
x
G
L
x
K
G
 
N
K
 
F
D
 
E
V
 
T
L
 
F
P
 
E
D
 
W
D
 
D
L
 
F
P
 
E
F
 
A
V
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
x
T
G
x
Y
L
x
R
L
x
V
G
 
G
T
 
W
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
T
M
 
I
K
 
L
D
 
E
C
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
A
G
|
G
S
|
S
S
x
N
F
|
F
P
|
P
Y
x
F
S
 
S
Q
x
E
F
 
V
L
 
E
P
 
G
E
 
T
F
 
F
G
 
R
Q
 
N
A
 
V
-
 
D
R
 
N
A
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
M
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
H
F
 
A
E
 
D
V
 
V
N
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
D
|
D
A
|
A
R
 
A
E
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
D
R
 
E
L
 
I
L
 
L
P
 
N
L
 
K
L
 
V
S
 
D
R
 
A
K
 
V
E
 
E
D
 
E
R
 
S
G
 
A
W
 
W
R
 
W
E
 
T
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
K
N
 
N
N
 
I
S
 
A
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
E
V
 
Y
M
 
I
K
 
N
R
 
M
R
 
L
A
 
E
S
 
T
V
 
K
E
 
E
A
 
E
D
 
G
P
 
D
I
 
L
N
 
Q
P
 
F
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
Y
H
 
N
V
 
A
L
 
I
D
 
N
G
 
N
L
 
H
L
 
A
P
 
D
G
 
E
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
 
N
A
 
S
A
 
T
N
 
Q
W
 
T
Y
 
S
A
 
I
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
H
I
 
M
R
 
T
E
 
P
G
 
K
I
 
N
N
 
M
G
 
W
S
 
R
L
 
T
S
 
S
G
x
P
T
 
L
L
 
F
A
|
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
F
 
N
S
 
T
C
 
Y
P
 
P
D
 
D
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
W
A
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
G
A
 
A
M
 
F
Q
 
S
M
 
M
N
 
T
G
 
-
L
 
Y
A
 
P
E
 
D
L
 
V
I
 
V
T
 
T
V
 
N
G
 
V
K
 
R
Y
 
Y
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
N
P
 
M
R
 
P
L
 
V
V
 
I
V
 
N
C
 
V
V
 
V
L
 
F
N
 
S
N
|
N
Q
 
T
D
x
E
L
x
Y
N
 
A
Q
x
F
V
x
I
T
 
K
W
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
N
S
x
K
M
 
Y
S
 
E
G
 
D
S
 
T
P
 
N
Q
 
K
F
 
N
L
 
L
P
 
F
S
 
G
Q
 
V
Q
 
D
L
 
F
P
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
D
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
E
G
 
A
L
 
Q
G
 
G
L
 
A
H
 
K
G
 
G
I
 
F
R
 
T
V
 
V
E
 
S
K
 
R
P
 
I
E
 
E
E
 
D
V
 
M
E
 
D
P
 
R
A
 
V
W
 
M
R
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
A
D
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

1y9dD Pyruvate oxidase variant v265a from lactobacillus plantarum (see paper)
28% identity, 89% coverage: 9:544/600 of query aligns to 9:510/560 of 1y9dD

query
sites
1y9dD
I
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
Y
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
A
W
 
L
E
 
S
R
 
A
A
 
E
G
 
R
D
 
D
Q
 
R
P
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
|
P
G
 
G
A
 
G
I
 
T
H
|
H
L
 
L
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
H
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
A
 
G
Q
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
E
|
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
P
 
N
N
 
P
L
 
I
Y
 
Y
K
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
-
E
 
D
Y
 
Y
C
 
N
Q
 
V
L
 
T
V
 
A
T
 
V
T
 
N
P
 
A
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
P
 
P
N
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
D
R
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
R
I
 
R
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
T
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
H
 
-
A
 
P
F
 
W
K
 
Q
M
 
Q
V
 
I
P
 
P
S
 
A
S
 
E
L
 
-
G
 
D
F
 
W
S
 
Y
G
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
P
V
 
E
P
 
P
H
 
D
E
 
V
D
 
Q
D
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
N
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
 
G
Q
x
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
G
 
K
A
 
A
S
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
E
E
 
Q
T
 
L
A
 
S
E
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
I
G
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
 
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
D
 
G
V
 
I
L
 
V
P
 
A
D
 
D
D
 
R
L
 
Y
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
T
 
L
G
 
G
A
 
S
S
 
A
G
 
N
L
x
R
L
 
A
G
 
A
T
 
Q
R
 
K
P
 
P
T
 
A
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
M
 
L
K
 
A
D
 
Q
C
 
A
D
 
D
T
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
F
I
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
 
N
Y
 
T
S
 
R
Q
 
Y
F
 
F
L
 
L
P
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
Y
 
H
P
 
K
F
 
T
E
 
D
V
 
I
N
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
A
L
 
Q
L
 
V
S
 
S
R
 
E
K
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
T
G
 
P
W
 
W
R
 
W
E
 
Q
K
 
A
I
 
N
E
 
L
Q
 
A
N
 
N
N
 
V
S
 
K
R
 
N
W
 
W
W
 
R
E
 
A
V
 
Y
M
 
L
K
 
A
R
 
S
R
 
L
A
 
E
S
 
D
V
 
K
E
 
Q
A
 
E
D
 
G
P
 
P
I
 
L
N
 
Q
P
 
A
E
 
Y
Y
 
Q
A
 
V
V
 
L
H
 
R
V
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
L
 
I
L
 
A
P
 
E
G
 
P
R
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
Y
T
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
S
x
D
A
 
I
A
 
N
N
 
L
W
 
N
Y
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
L
 
L
R
 
K
I
 
L
R
 
T
E
 
P
G
 
S
I
 
N
N
 
R
G
 
H
S
 
I
L
 
T
S
 
S
G
 
N
T
 
L
L
 
F
A
|
A
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
L
S
 
N
C
 
Y
P
 
P
D
 
E
R
 
R
P
 
Q
A
 
V
I
 
F
A
 
N
L
 
L
V
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
-
 
G
-
 
A
A
 
S
M
 
M
Q
 
T
M
 
M
N
 
Q
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
Q
I
 
V
T
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
Q
W
 
Y
R
 
H
D
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
V
C
 
V
V
 
F
L
 
T
N
|
N
N
 
C
Q
|
Q
D
 
-
L
 
-
N
x
Y
Q
x
G
V
x
F
T
x
I
W
 
K
E
 
D
M
x
E
R
 
Q
S
 
E
M
 
D
S
 
T
G
 
N
S
 
Q
P
 
N
Q
 
D
F
 
F
L
 
I
P
 
-
S
 
G
Q
 
V
Q
 
E
L
 
F
P
 
N
D
 
D
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
S
D
 
K
F
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
H
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
I
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
K
P
 
I
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
E
 
P
P
 
D
A
 
V
W
 
F
R
 
E
-
 
Q
-
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
Q
D
 
H
R
 
E
P
 
P
C
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

8x3xB Thdp-dependent hka synthase
33% identity, 91% coverage: 7:551/600 of query aligns to 7:523/537 of 8x3xB

query
sites
8x3xB
D
 
E
F
 
L
I
 
L
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
L
 
M
R
 
E
E
 
A
W
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
G
 
G
D
x
G
G
 
P
I
 
L
N
x
M
G
 
P
L
 
L
L
 
Y
S
 
E
A
 
A
-
 
I
W
 
F
E
 
S
R
 
R
A
 
K
G
 
K
D
 
I
Q
 
Q
P
 
P
R
 
-
F
 
-
I
 
I
Q
 
L
A
 
T
R
 
K
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
M
A
 
A
V
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
V
S
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
C
A
 
A
T
|
T
S
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
T
H
 
N
L
 
A
L
 
L
N
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
 
A
D
 
C
A
 
A
K
 
Y
L
 
S
D
 
D
H
 
S
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
L
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
Q
T
 
V
A
 
G
Q
 
T
T
 
A
A
 
A
I
 
F
G
 
G
G
 
K
S
 
G
Y
 
A
Q
 
L
Q
 
Q
E
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
V
-
 
H
-
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
P
 
V
N
 
S
L
 
I
Y
 
F
K
 
S
D
 
P
V
 
I
A
 
-
S
 
T
E
 
K
Y
 
L
C
 
S
Q
 
V
L
 
M
V
 
I
T
 
P
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
K
L
 
M
P
 
G
N
 
E
V
 
M
L
 
T
D
 
R
R
 
R
A
 
A
M
 
L
R
 
R
I
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
-
 
G
R
|
R
K
 
P
T
 
G
V
 
P
T
 
I
A
 
H
V
 
L
I
 
N
V
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
D
V
 
I
Q
 
A
D
 
-
L
 
-
E
 
K
Y
 
H
S
 
P
A
 
V
P
 
P
T
 
L
H
 
E
A
 
V
F
 
F
K
 
P
M
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
P
L
 
M
G
 
N
F
 
Y
S
 
R
G
 
G
S
 
G
A
 
K
Y
 
P
V
 
A
P
 
P
H
 
T
E
 
I
D
 
M
D
 
D
L
 
V
A
 
V
R
 
R
A
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
F
S
 
H
G
 
A
S
 
K
K
 
R
V
 
P
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
|
G
Q
x
H
G
 
G
A
 
I
R
 
E
G
x
C
A
|
A
S
 
K
A
 
A
-
 
W
-
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
D
T
 
F
A
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
T
A
x
T
L
 
P
L
x
K
G
 
G
K
 
K
D
 
S
V
 
S
L
 
F
P
 
P
D
 
E
D
 
N
L
 
H
P
 
A
F
 
L
V
 
S
T
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
F
G
 
G
L
 
F
L
 
A
G
 
G
T
 
H
R
 
Q
P
 
K
T
 
A
-
 
T
-
 
D
Y
 
Y
E
 
L
L
 
L
M
 
S
K
 
G
D
 
D
C
 
V
D
 
D
T
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
S
|
S
S
|
S
F
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
W
P
x
Q
Y
 
T
S
 
N
Q
 
S
F
 
W
L
 
D
P
 
P
E
 
R
F
 
L
G
 
T
Q
 
P
A
 
S
R
 
V
A
 
A
-
 
L
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
M
R
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
K
R
 
N
Y
 
Y
P
 
P
F
 
V
E
 
D
V
 
V
N
 
G
L
 
I
V
 
N
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
S
E
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
R
 
A
L
 
L
L
 
I
P
 
-
L
 
L
L
 
C
S
 
I
R
 
R
K
 
S
E
 
S
D
 
G
R
 
K
G
 
G
W
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
N
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
W
 
-
E
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
N
 
H
P
 
P
E
 
A
Y
 
M
A
 
V
V
 
V
H
 
E
V
 
A
L
 
M
D
 
Q
G
 
N
L
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
A
R
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
L
T
 
F
A
 
V
D
 
D
S
 
N
G
 
G
S
|
S
A
 
C
A
 
I
N
 
N
W
 
W
Y
 
G
A
 
V
R
 
H
H
 
C
L
 
Y
R
 
L
I
 
A
R
 
Q
E
 
T
G
 
P
I
 
G
N
 
A
G
 
F
S
 
Q
L
 
I
S
 
G
G
 
L
T
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
A
M
|
M
G
 
G
P
 
H
G
 
A
V
 
V
P
 
A
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
G
K
 
K
F
 
L
S
 
A
C
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
x
A
A
|
A
M
 
F
Q
 
A
M
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
M
A
 
-
E
 
E
L
 
I
I
 
H
T
 
T
V
 
A
G
 
A
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
E
W
 
Y
R
 
K
D
 
I
P
 
P
R
 
-
L
 
V
V
 
T
V
 
W
C
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
D
x
G
L
x
H
N
x
G
Q
x
L
V
|
V
T
 
H
W
 
L
E
x
G
M
 
E
R
 
Q
S
 
H
M
x
Q
S
 
F
G
 
D
S
 
S
P
 
-
Q
 
K
F
 
F
L
 
D
P
 
I
S
 
S
Q
 
S
Q
 
F
L
 
R
P
 
K
D
 
S
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
C
D
 
K
F
 
M
A
 
A
R
 
E
G
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
V
H
 
K
G
 
S
I
 
Y
R
 
R
V
 
A
E
 
E
K
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
D
V
 
F
E
 
D
P
 
A
A
 
A
W
 
L
R
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
A
S
 
M
D
 
N
R
 
T
P
 
P
C
 
C
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
T
 
V
D
 
D
P
 
I
A
 
D
V
 
V
P
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8xodA BbmA-G484F complex with CBOA
33% identity, 91% coverage: 7:551/600 of query aligns to 8:524/532 of 8xodA

query
sites
8xodA
D
 
E
F
 
L
I
 
L
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
L
 
M
R
 
E
E
 
A
W
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
G
 
G
D
x
G
G
 
P
I
 
L
N
 
M
G
 
P
L
 
L
L
 
Y
S
 
E
A
 
A
-
 
I
W
 
F
E
 
S
R
 
R
A
 
K
G
 
K
D
 
I
Q
 
Q
P
 
P
R
 
-
F
 
-
I
 
I
Q
 
L
A
 
T
R
 
K
H
 
H
E
|
E
E
 
E
M
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
M
A
 
A
V
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
V
S
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
C
A
 
A
T
 
T
S
 
T
G
 
G
P
|
P
G
 
G
A
 
A
I
 
T
H
 
N
L
 
A
L
 
L
N
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
 
A
D
 
C
A
 
A
K
 
Y
L
 
S
D
 
D
H
 
S
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
L
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
Q
T
 
V
A
 
G
Q
 
T
T
 
A
A
 
A
I
 
F
G
 
G
G
 
K
S
 
G
Y
 
A
Q
 
L
Q
 
Q
E
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
V
-
 
H
-
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
P
 
V
N
 
S
L
 
I
Y
 
F
K
 
S
D
 
P
V
 
I
A
 
-
S
 
T
E
 
K
Y
 
L
C
 
S
Q
 
V
L
 
M
V
 
I
T
 
P
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
K
L
 
M
P
 
G
N
 
E
V
 
M
L
 
T
D
 
R
R
 
R
A
 
A
M
 
L
R
 
R
I
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
-
 
G
R
|
R
K
 
P
T
 
G
V
 
P
T
 
I
A
 
H
V
 
L
I
 
N
V
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
D
V
 
I
Q
 
A
D
 
-
L
 
-
E
 
K
Y
 
H
S
 
P
A
 
V
P
 
P
T
 
L
H
 
E
A
 
V
F
 
F
K
 
P
M
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
P
L
 
M
G
 
N
F
 
Y
S
 
R
G
 
G
S
 
G
A
 
K
Y
 
P
V
 
A
P
 
P
H
 
T
E
 
I
D
 
M
D
 
D
L
 
V
A
 
V
R
 
R
A
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
F
S
 
H
G
 
A
S
 
K
K
 
R
V
 
P
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
|
G
Q
x
H
G
|
G
A
 
I
R
 
E
G
 
C
A
|
A
S
 
K
A
 
A
-
 
W
-
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
D
T
 
F
A
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
T
A
x
T
L
 
P
L
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
S
V
 
S
L
 
F
P
 
P
D
 
E
D
 
N
L
 
H
P
 
A
F
 
L
V
 
S
T
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
F
G
 
G
L
 
F
L
 
A
G
 
G
T
 
H
R
 
Q
P
 
K
T
 
A
-
 
T
-
 
D
Y
 
Y
E
 
L
L
 
L
M
 
S
K
 
G
D
 
D
C
 
V
D
 
D
T
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
S
|
S
S
|
S
F
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
W
P
x
Q
Y
 
T
S
 
N
Q
 
S
F
 
W
L
 
D
P
 
P
E
 
R
F
 
L
G
 
T
Q
 
P
A
 
S
R
 
V
A
 
A
-
 
L
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
P
G
 
M
R
x
E
I
 
I
G
 
G
M
 
K
R
 
N
Y
 
Y
P
 
P
F
 
V
E
 
D
V
 
V
N
 
G
L
 
I
V
 
N
G
 
A
D
 
D
A
|
A
R
 
S
E
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
R
 
A
L
 
L
L
 
I
P
 
-
L
 
L
L
 
C
S
 
I
R
 
R
K
 
S
E
 
S
D
 
G
R
 
K
G
 
G
W
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
N
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
W
 
-
E
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
N
 
H
P
 
P
E
 
A
Y
 
M
A
 
V
V
 
V
H
 
E
V
 
A
L
 
M
D
 
Q
G
 
N
L
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
A
R
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
L
T
 
F
A
 
V
D
 
D
S
 
N
G
 
G
S
|
S
A
 
C
A
 
I
N
 
N
W
 
W
Y
 
G
A
 
V
R
 
H
H
 
C
L
 
Y
R
 
L
I
 
A
R
 
Q
E
 
T
G
 
P
I
 
G
N
 
A
G
 
F
S
 
Q
L
 
I
S
 
G
G
 
L
T
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
A
M
|
M
G
 
G
P
 
H
G
 
A
V
 
V
P
 
A
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
G
K
 
K
F
 
L
S
 
A
C
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
x
A
A
|
A
M
 
F
Q
 
A
M
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
M
A
 
-
E
 
E
L
 
I
I
 
H
T
 
T
V
 
A
G
 
A
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
E
W
 
Y
R
 
K
D
 
I
P
 
P
R
 
-
L
 
V
V
 
T
V
 
W
C
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
D
 
G
L
x
H
N
x
G
Q
x
L
V
 
V
T
 
H
W
 
L
E
 
F
M
 
E
R
 
Q
S
 
H
M
 
Q
S
 
F
G
 
D
S
 
S
P
 
-
Q
 
K
F
 
F
L
 
D
P
 
I
S
 
S
Q
 
S
Q
 
F
L
 
R
P
 
K
D
 
S
V
 
I
R
 
D
Y
 
F
A
 
C
D
 
K
F
 
M
A
 
A
R
 
E
G
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
V
H
 
K
G
 
S
I
 
Y
R
 
R
V
 
A
E
 
E
K
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
D
V
 
F
E
 
D
P
 
A
A
 
A
W
 
L
R
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
A
S
 
M
D
 
N
R
 
T
P
 
P
C
 
C
V
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
T
 
V
D
 
D
P
 
I
A
 
D
V
 
V
P
 
L
P
 
P

7tzzA Crystal structure of arabidopsis thaliana acetohydroxyacid synthase p197t mutant in complex with bispyribac-sodium (see paper)
31% identity, 93% coverage: 6:561/600 of query aligns to 15:575/582 of 7tzzA

query
sites
7tzzA
S
 
A
D
 
D
F
 
I
I
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
W
 
Q
D
 
G
V
 
V
D
 
E
Y
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
G
G
x
A
I
 
S
N
 
M
G
 
E
L
 
I
L
 
H
S
 
Q
A
 
A
W
 
L
E
 
T
R
 
R
A
 
S
G
 
S
D
 
S
Q
 
I
P
 
-
R
 
R
F
 
N
I
 
V
Q
 
L
A
 
P
R
 
R
H
 
H
E
 
E
E
 
Q
M
 
G
A
 
G
A
 
V
F
 
F
E
 
A
A
 
A
V
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
S
S
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
P
G
 
G
V
 
I
C
 
C
A
 
I
A
 
A
T
|
T
S
|
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
T
H
 
N
L
 
L
L
 
V
N
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
A
 
T
Q
 
R
T
 
R
A
 
M
I
 
I
G
 
G
G
 
T
S
 
D
Y
 
A
Q
 
F
Q
|
Q
E
 
E
V
 
T
D
 
P
L
 
I
P
 
V
N
 
E
L
 
V
Y
 
T
K
 
R
D
 
S
V
 
I
A
 
-
S
 
T
E
 
K
Y
 
H
C
 
N
Q
 
Y
L
 
L
V
 
V
T
 
M
T
 
D
P
 
V
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
P
 
P
N
 
R
V
 
I
L
 
I
D
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
F
R
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
T
A
 
S
-
 
G
R
|
R
K
 
P
T
 
G
V
 
P
T
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
D
V
 
I
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
-
E
 
Q
Y
 
L
S
 
A
A
 
I
P
 
P
T
 
N
H
 
W
A
 
E
F
 
Q
K
 
A
M
 
M
-
 
R
V
 
L
P
 
P
S
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
G
F
 
Y
S
 
M
G
 
S
S
 
R
A
 
M
Y
 
P
V
 
K
P
 
P
H
 
P
E
 
E
D
 
D
D
 
S
-
 
H
L
 
L
A
 
E
R
 
Q
A
 
I
A
 
V
E
 
R
V
 
L
L
 
I
N
 
S
S
 
E
G
 
S
S
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
|
G
Q
x
G
G
|
G
A
 
C
R
 
L
G
 
N
A
 
S
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
G
E
 
R
T
 
F
A
 
V
E
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
S
A
x
T
L
|
L
L
x
M
G
 
G
K
 
L
D
 
G
V
 
S
L
 
Y
P
 
P
D
 
C
D
 
D
L
 
D
P
 
E
F
 
L
V
 
S
T
 
L
G
 
H
A
x
M
S
x
L
G
 
G
L
x
M
L
x
H
G
 
G
T
 
T
R
 
V
P
 
Y
T
 
A
Y
 
N
E
 
Y
L
 
A
M
 
V
K
 
E
D
 
H
C
 
S
D
 
D
T
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
A
I
 
F
G
|
G
S
 
V
S
x
R
F
 
F
P
 
D
-
 
D
-
x
R
Y
x
V
S
 
T
Q
 
G
F
 
K
L
 
L
P
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
A
-
 
S
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
S
G
 
A
R
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
K
R
 
N
Y
 
K
P
 
T
F
 
P
E
 
H
V
 
V
N
 
S
L
 
V
V
 
C
G
 
G
D
|
D
A
x
V
R
 
K
E
 
L
T
 
A
L
 
L
R
 
Q
R
 
G
L
 
M
L
 
N
P
 
K
L
 
V
L
 
L
S
 
E
R
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
L
K
 
K
E
 
L
D
 
D
R
 
F
G
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
E
 
N
K
 
E
I
 
L
E
 
N
Q
 
V
N
 
Q
N
 
K
S
 
Q
R
 
K
W
 
F
W
 
P
E
 
L
V
 
S
M
 
F
K
 
K
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
T
E
 
F
A
 
G
D
 
E
P
 
A
I
 
I
N
 
P
P
 
P
E
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
V
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
E
L
 
L
L
 
T
P
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
T
D
 
G
S
x
V
G
|
G
S
x
Q
A
x
H
A
 
Q
N
x
M
W
 
W
Y
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
F
L
 
Y
R
 
N
I
 
Y
R
 
K
E
 
K
G
 
P
I
 
R
N
 
Q
G
 
W
S
 
L
L
 
S
S
 
S
G
|
G
T
 
G
L
 
L
A
x
G
T
 
A
M
|
M
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
S
F
 
V
S
 
A
C
 
N
P
 
P
D
 
D
R
 
A
P
 
I
A
 
V
I
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
D
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
M
 
F
Q
 
I
M
|
M
N
 
N
G
 
-
L
 
V
A
x
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
A
T
 
T
V
 
I
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
R
W
 
V
R
 
E
D
 
N
P
 
L
R
 
P
L
 
V
V
 
K
V
 
V
C
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
N
N
|
N
Q
 
Q
D
x
H
L
|
L
N
x
G
Q
x
M
V
|
V
T
 
M
-
 
Q
W
|
W
E
 
E
M
 
D
R
 
R
S
 
F
M
 
Y
S
 
K
G
 
A
S
 
N
-
 
R
-
 
A
P
 
H
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
D
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
I
L
 
F
P
 
P
D
 
N
V
 
M
R
 
L
Y
 
L
A
 
-
D
 
-
F
 
F
A
 
A
R
 
A
G
 
A
L
 
C
G
 
G
L
 
I
H
 
P
G
 
A
I
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
T
K
 
K
P
x
K
E
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
R
P
 
E
A
 
A
W
 
I
R
 
Q
A
 
T
A
 
M
L
 
L
E
 
D
S
 
T
D
 
P
R
 
G
P
 
P
C
 
Y
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
I
T
 
C
-
 
P
-
 
H
-
 
Q
D
 
E
P
 
H
A
 
V
V
 
L
P
 
P
P
 
M
I
 
I
P
 
P
P
x
S
H
 
G
A
 
G
T
 
T
W
 
F
D
 
N
Q
 
D
I
 
V

5k2oA Crystal structure of arabidopsis thaliana acetohydroxyacid synthase in complex with a pyrimidinyl-benzoate herbicide, pyrithiobac (see paper)
31% identity, 93% coverage: 6:561/600 of query aligns to 15:575/585 of 5k2oA

query
sites
5k2oA
S
 
A
D
 
D
F
 
I
I
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
W
 
Q
D
 
G
V
 
V
D
 
E
Y
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
|
Y
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
A
I
x
S
N
 
M
G
 
E
L
 
I
L
 
H
S
 
Q
A
 
A
W
 
L
E
 
T
R
 
R
A
 
S
G
 
S
D
 
S
Q
 
I
P
 
-
R
 
R
F
 
N
I
 
V
Q
 
L
A
 
P
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
Q
M
 
G
A
 
G
A
 
V
F
 
F
E
 
A
A
 
A
V
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
S
S
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
P
G
 
G
V
 
I
C
 
C
A
 
I
A
 
A
T
|
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
T
H
 
N
L
 
L
L
 
V
N
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
A
 
P
Q
 
R
T
 
R
A
 
M
I
 
I
G
 
G
G
 
T
S
 
D
Y
 
A
Q
x
F
Q
|
Q
E
|
E
V
 
T
D
 
P
L
 
I
P
 
V
N
 
E
L
 
V
Y
 
T
K
 
R
D
 
S
V
 
I
A
 
-
S
 
T
E
 
K
Y
 
H
C
 
N
Q
 
Y
L
 
L
V
 
V
T
 
M
T
 
D
P
 
V
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
P
 
P
N
 
R
V
 
I
L
 
I
D
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
F
R
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
T
A
 
S
-
 
G
R
|
R
K
 
P
T
 
G
V
 
P
T
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
D
V
 
V
P
 
P
A
x
K
D
 
D
V
 
I
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
-
E
 
Q
Y
 
L
S
 
A
A
 
I
P
 
P
T
 
N
H
 
W
A
 
E
F
 
Q
K
 
A
M
 
M
-
 
R
V
 
L
P
 
P
S
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
G
F
 
Y
S
 
M
G
 
S
S
 
R
A
 
M
Y
 
P
V
 
K
P
 
P
H
 
P
E
 
E
D
 
D
D
 
S
-
 
H
L
 
L
A
 
E
R
 
Q
A
 
I
A
 
V
E
 
R
V
 
L
L
 
I
N
 
S
S
 
E
G
 
S
S
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
|
G
Q
x
G
G
|
G
A
 
C
R
 
L
G
 
N
A
 
S
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
G
E
 
R
T
 
F
A
 
V
E
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
S
A
x
T
L
|
L
L
x
M
G
 
G
K
 
L
D
 
G
V
 
S
L
 
Y
P
 
P
D
 
C
D
 
D
L
 
D
P
 
E
F
 
L
V
 
S
T
 
L
G
 
H
A
 
M
S
x
L
G
 
G
L
x
M
L
 
H
G
 
G
T
 
T
R
 
V
P
 
Y
T
 
A
Y
 
N
E
 
Y
L
 
A
M
 
V
K
 
E
D
 
H
C
 
S
D
 
D
T
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
A
I
 
F
G
|
G
S
 
V
S
x
R
F
 
F
P
x
D
-
 
D
-
x
R
Y
x
V
S
 
T
Q
 
G
F
 
K
L
 
L
P
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
A
-
 
S
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
S
G
 
A
R
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
K
R
 
N
Y
 
K
P
 
T
F
 
P
E
 
H
V
 
V
N
 
S
L
 
V
V
 
C
G
 
G
D
|
D
A
x
V
R
 
K
E
 
L
T
 
A
L
 
L
R
 
Q
R
 
G
L
 
M
L
 
N
P
 
K
L
 
V
L
 
L
S
 
E
R
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
L
K
 
K
E
 
L
D
 
D
R
 
F
G
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
E
 
N
K
 
E
I
 
L
E
 
N
Q
 
V
N
 
Q
N
 
K
S
 
Q
R
 
K
W
 
F
W
 
P
E
 
L
V
 
S
M
 
F
K
 
K
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
T
E
 
F
A
 
G
D
 
E
P
 
A
I
 
I
N
 
P
P
 
P
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
E
L
 
L
L
 
T
P
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
T
D
 
G
S
x
V
G
|
G
S
x
Q
A
x
H
A
x
Q
N
x
M
W
 
W
Y
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
F
L
 
Y
R
 
N
I
 
Y
R
 
K
E
 
K
G
 
P
I
 
R
N
 
Q
G
 
W
S
 
L
L
 
S
S
 
S
G
|
G
T
 
G
L
 
L
A
x
G
T
 
A
M
|
M
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
S
F
 
V
S
 
A
C
 
N
P
 
P
D
 
D
R
 
A
P
 
I
A
 
V
I
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
D
G
 
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
M
 
F
Q
 
I
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
V
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
A
T
 
T
V
 
I
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
R
W
 
V
R
 
E
D
 
N
P
 
L
R
 
P
L
 
V
V
 
K
V
 
V
C
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
N
N
|
N
Q
 
Q
D
x
H
L
|
L
N
x
G
Q
x
M
V
|
V
T
 
M
-
 
Q
W
|
W
E
 
E
M
 
D
R
 
R
S
 
F
M
 
Y
S
 
K
G
 
A
S
 
N
-
 
R
-
 
A
P
 
H
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
D
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
I
L
 
F
P
 
P
D
 
N
V
 
M
R
 
L
Y
 
L
A
 
-
D
 
-
F
 
F
A
 
A
R
 
A
G
 
A
L
 
C
G
 
G
L
 
I
H
 
P
G
 
A
I
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
T
K
 
K
P
 
K
E
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
R
P
 
E
A
 
A
W
 
I
R
 
Q
A
 
T
A
 
M
L
 
L
E
 
D
S
 
T
D
 
P
R
 
G
P
 
P
C
 
Y
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
I
T
 
C
-
 
P
-
x
H
-
 
Q
D
 
E
P
 
H
A
 
V
V
 
L
P
 
P
P
 
M
I
 
I
P
 
P
P
x
S
H
 
G
A
 
G
T
 
T
W
 
F
D
 
N
Q
 
D
I
 
V

P17597 Acetolactate synthase, chloroplastic; AtALS; Acetohydroxy-acid synthase; Protein CHLORSULFURON RESISTANT 1; EC 2.2.1.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 8 papers)
31% identity, 93% coverage: 6:561/600 of query aligns to 100:660/670 of P17597

query
sites
P17597
S
 
A
D
 
D
F
 
I
I
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
W
 
Q
D
 
G
V
 
V
D
 
E
Y
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
G
G
x
A
I
 
S
N
x
M
G
 
E
L
 
I
L
 
H
S
 
Q
A
 
A
W
 
L
E
 
T
R
 
R
A
 
S
G
 
S
D
 
S
Q
 
I
P
 
-
R
 
R
F
 
N
I
 
V
Q
 
L
A
 
P
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
Q
M
 
G
A
 
G
A
 
V
F
 
F
E
 
A
A
 
A
V
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
S
S
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
P
G
 
G
V
 
I
C
 
C
A
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
T
H
 
N
L
 
L
L
 
V
N
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
L
L
 
L
D
 
D
H
x
S
V
 
V
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
A
x
P
Q
 
R
T
x
R
A
 
M
I
 
I
G
 
G
G
 
T
S
 
D
Y
 
A
Q
 
F
Q
|
Q
E
 
E
V
 
T
D
 
P
L
 
I
P
 
V
N
 
E
L
 
V
Y
 
T
K
 
R
D
 
S
V
 
I
A
 
-
S
 
T
E
x
K
Y
 
H
C
 
N
Q
 
Y
L
 
L
V
 
V
T
 
M
T
 
D
P
 
V
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
P
 
P
N
 
R
V
 
I
L
 
I
D
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
F
R
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
T
A
 
S
-
 
G
R
|
R
K
 
P
T
 
G
V
 
P
T
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
D
V
 
V
P
 
P
A
x
K
D
 
D
V
 
I
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
-
E
 
Q
Y
 
L
S
 
A
A
 
I
P
 
P
T
 
N
H
 
W
A
 
E
F
 
Q
K
 
A
M
 
M
-
 
R
V
 
L
P
 
P
S
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
G
F
 
Y
S
 
M
G
 
S
S
 
R
A
 
M
Y
 
P
V
 
K
P
 
P
H
 
P
E
 
E
D
 
D
D
 
S
-
 
H
L
 
L
A
 
E
R
 
Q
A
 
I
A
 
V
E
 
R
V
 
L
L
 
I
N
 
S
S
 
E
G
 
S
S
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
 
G
Q
x
G
G
 
G
A
 
C
R
 
L
G
 
N
A
 
S
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
G
E
 
R
T
 
F
A
 
V
E
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
S
A
x
T
L
|
L
L
 
M
G
 
G
K
 
L
D
 
G
V
 
S
L
 
Y
P
 
P
D
x
C
D
 
D
L
 
D
P
 
E
F
 
L
V
 
S
T
 
L
G
 
H
A
 
M
S
x
L
G
|
G
L
x
M
L
x
H
G
 
G
T
 
T
R
 
V
P
 
Y
T
 
A
Y
 
N
E
 
Y
L
 
A
M
 
V
K
 
E
D
 
H
C
 
S
D
 
D
T
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
A
I
 
F
G
|
G
S
x
V
S
x
R
F
|
F
P
x
D
-
x
D
-
x
R
Y
 
V
S
 
T
Q
 
G
F
 
K
L
 
L
P
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
A
-
 
S
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
S
G
 
A
R
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
K
R
 
N
Y
 
K
P
 
T
F
 
P
E
 
H
V
 
V
N
 
S
L
 
V
V
 
C
G
 
G
D
|
D
A
x
V
R
 
K
E
 
L
T
 
A
L
 
L
R
 
Q
R
 
G
L
 
M
L
 
N
P
 
K
L
 
V
L
 
L
S
 
E
R
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
L
K
 
K
E
 
L
D
 
D
R
 
F
G
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
E
 
N
K
 
E
I
 
L
E
 
N
Q
 
V
N
 
Q
N
 
K
S
 
Q
R
 
K
W
 
F
W
 
P
E
 
L
V
 
S
M
 
F
K
 
K
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
T
E
 
F
A
 
G
D
 
E
P
 
A
I
 
I
N
 
P
P
 
P
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
E
L
 
L
L
 
T
P
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
T
D
 
G
S
 
V
G
 
G
S
x
Q
A
x
H
A
 
Q
N
 
M
W
 
W
Y
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
F
L
 
Y
R
 
N
I
 
Y
R
 
K
E
 
K
G
 
P
I
 
R
N
 
Q
G
 
W
S
 
L
L
 
S
S
 
S
G
|
G
T
x
G
L
 
L
A
x
G
T
x
A
M
|
M
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
S
F
 
V
S
 
A
C
 
N
P
 
P
D
 
D
R
 
A
P
 
I
A
 
V
I
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
D
G
 
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
M
 
F
Q
 
I
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
V
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
A
T
 
T
V
 
I
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
R
W
 
V
R
 
E
D
 
N
P
 
L
R
 
P
L
 
V
V
 
K
V
 
V
C
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
N
N
|
N
Q
|
Q
D
x
H
L
|
L
N
x
G
Q
x
M
V
 
V
T
 
M
-
 
Q
W
|
W
E
 
E
M
 
D
R
 
R
S
 
F
M
 
Y
S
 
K
G
 
A
S
 
N
-
 
R
-
 
A
P
 
H
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
D
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
I
L
 
F
P
 
P
D
 
N
V
 
M
R
 
L
Y
 
L
A
 
-
D
 
-
F
 
F
A
 
A
R
 
A
G
 
A
L
 
C
G
 
G
L
 
I
H
 
P
G
 
A
I
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
T
K
 
K
P
 
K
E
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
R
P
 
E
A
 
A
W
 
I
R
 
Q
A
 
T
A
 
M
L
 
L
E
 
D
S
 
T
D
 
P
R
 
G
P
 
P
C
 
Y
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
I
T
 
C
-
 
P
-
 
H
-
 
Q
D
 
E
P
 
H
A
 
V
V
 
L
P
 
P
P
 
M
I
 
I
P
 
P
P
x
S
H
 
G
A
 
G
T
 
T
W
 
F
D
 
N
Q
 
D
I
 
V

9c4rA Acetolactate synthase, chloroplastic (see paper)
31% identity, 93% coverage: 6:561/600 of query aligns to 15:575/582 of 9c4rA

query
sites
9c4rA
S
 
A
D
 
D
F
 
I
I
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
W
 
Q
D
 
G
V
 
V
D
 
E
Y
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
G
G
 
A
I
 
S
N
 
M
G
 
E
L
 
I
L
 
H
S
 
Q
A
 
A
W
 
L
E
 
T
R
 
R
A
 
S
G
 
S
D
 
S
Q
 
I
P
 
-
R
 
R
F
 
N
I
 
V
Q
 
L
A
 
P
R
 
R
H
 
H
E
 
E
E
 
Q
M
 
G
A
 
G
A
 
V
F
 
F
E
 
A
A
 
A
V
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
S
S
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
P
G
 
G
V
 
I
C
 
C
A
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
T
H
 
N
L
 
L
L
 
V
N
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
A
 
P
Q
 
R
T
 
R
A
 
M
I
 
I
G
 
G
G
 
T
S
 
D
Y
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
E
 
E
V
 
T
D
 
P
L
 
I
P
 
V
N
 
E
L
 
V
Y
 
T
K
 
R
D
 
S
V
 
I
A
 
-
S
 
T
E
 
K
Y
 
H
C
 
N
Q
 
Y
L
 
L
V
 
V
T
 
M
T
 
D
P
 
V
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
P
 
P
N
 
R
V
 
I
L
 
I
D
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
F
R
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
T
A
 
S
-
 
G
R
|
R
K
 
P
T
 
G
V
 
P
T
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
K
D
 
D
V
 
I
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
-
E
 
Q
Y
 
L
S
 
A
A
 
I
P
 
P
T
 
N
H
 
W
A
 
E
F
 
Q
K
 
A
M
 
M
-
 
R
V
 
L
P
 
P
S
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
G
F
 
Y
S
 
M
G
 
S
S
 
R
A
 
M
Y
 
P
V
 
K
P
 
P
H
 
P
E
 
E
D
 
D
D
 
S
-
 
H
L
 
L
A
 
E
R
 
Q
A
 
I
A
 
V
E
 
R
V
 
L
L
 
I
N
 
S
S
 
E
G
 
S
S
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
|
G
Q
x
G
G
|
G
A
 
C
R
 
L
G
 
N
A
 
S
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
G
E
 
R
T
 
F
A
 
V
E
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
S
A
x
T
L
|
L
L
x
M
G
 
G
K
 
L
D
 
G
V
 
S
L
 
Y
P
 
P
D
 
C
D
 
D
L
 
D
P
 
E
F
 
L
V
 
S
T
 
L
G
 
H
A
 
M
S
x
L
G
 
G
L
x
M
L
x
H
G
 
G
T
 
T
R
 
V
P
 
Y
T
 
A
Y
 
N
E
 
Y
L
 
A
M
 
V
K
 
E
D
 
H
C
 
S
D
 
D
T
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
A
I
 
F
G
|
G
S
x
V
S
x
R
F
 
F
P
x
D
-
 
D
-
x
R
Y
x
V
S
 
T
Q
 
G
F
 
K
L
 
L
P
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
A
-
 
S
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
|
D
I
|
I
D
 
D
P
 
S
G
 
A
R
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
K
R
 
N
Y
 
K
P
 
T
F
 
P
E
 
H
V
 
V
N
 
S
L
 
V
V
 
C
G
 
G
D
|
D
A
x
V
R
 
K
E
 
L
T
 
A
L
 
L
R
 
Q
R
 
G
L
 
M
L
 
N
P
 
K
L
 
V
L
 
L
S
 
E
R
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
L
K
 
K
E
 
L
D
 
D
R
 
F
G
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
E
 
N
K
 
E
I
 
L
E
 
N
Q
 
V
N
 
Q
N
 
K
S
 
Q
R
 
K
W
 
F
W
 
P
E
 
L
V
 
S
M
 
F
K
 
K
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
T
E
 
F
A
 
G
D
 
E
P
 
A
I
 
I
N
 
P
P
 
P
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
E
L
 
L
L
 
T
P
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
T
D
 
G
S
x
V
G
|
G
S
x
Q
A
x
H
A
 
Q
N
x
M
W
 
W
Y
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
F
L
 
Y
R
 
N
I
 
Y
R
 
K
E
 
K
G
 
P
I
 
R
N
 
Q
G
 
W
S
 
L
L
 
S
S
 
S
G
|
G
T
 
G
L
 
L
A
x
G
T
 
A
M
|
M
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
S
F
 
V
S
 
A
C
 
N
P
 
P
D
 
D
R
 
A
P
 
I
A
 
V
I
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
D
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
M
 
F
Q
 
I
M
|
M
N
 
N
G
 
-
L
 
V
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
A
T
 
T
V
 
I
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
R
W
 
V
R
 
E
D
 
N
P
 
L
R
 
P
L
 
V
V
 
K
V
 
V
C
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
N
N
|
N
Q
 
Q
D
x
H
L
|
L
N
x
G
Q
x
M
V
|
V
T
 
M
-
 
Q
W
|
W
E
 
E
M
 
D
R
 
R
S
 
F
M
 
Y
S
 
K
G
 
A
S
 
N
-
 
R
-
 
A
P
 
H
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
D
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
I
L
 
F
P
 
P
D
 
N
V
 
M
R
 
L
Y
 
L
A
 
-
D
 
-
F
 
F
A
 
A
R
 
A
G
 
A
L
 
C
G
 
G
L
 
I
H
 
P
G
 
A
I
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
T
K
 
K
P
 
K
E
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
R
P
 
E
A
 
A
W
 
I
R
 
Q
A
 
T
A
 
M
L
 
L
E
 
D
S
 
T
D
 
P
R
 
G
P
 
P
C
 
Y
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
I
T
 
C
-
 
P
-
 
H
-
 
Q
D
 
E
P
 
H
A
 
V
V
 
L
P
 
P
P
 
M
I
 
I
P
 
P
P
x
S
H
 
G
A
 
G
T
 
T
W
 
F
D
 
N
Q
 
D
I
 
V

Query Sequence

>WP_037577100.1 NCBI__GCF_000744815.1:WP_037577100.1
MSEQVSDFILRRLREWDVDYVFGYPGDGINGLLSAWERAGDQPRFIQARHEEMAAFEAVG
YAKFSGRVGVCAATSGPGAIHLLNGLYDAKLDHVPVVALVGQTAQTAIGGSYQQEVDLPN
LYKDVASEYCQLVTTPEQLPNVLDRAMRIAQARKTVTAVIVPADVQDLEYSAPTHAFKMV
PSSLGFSGSAYVPHEDDLARAAEVLNSGSKVAILAGQGARGASAELIETAEVLGAGVAKA
LLGKDVLPDDLPFVTGASGLLGTRPTYELMKDCDTLLVIGSSFPYSQFLPEFGQARAVQI
DIDPGRIGMRYPFEVNLVGDARETLRRLLPLLSRKEDRGWREKIEQNNSRWWEVMKRRAS
VEADPINPEYAVHVLDGLLPGRAIITADSGSAANWYARHLRIREGINGSLSGTLATMGPG
VPYAIGAKFSCPDRPAIALVGDGAMQMNGLAELITVGKYWQEWRDPRLVVCVLNNQDLNQ
VTWEMRSMSGSPQFLPSQQLPDVRYADFARGLGLHGIRVEKPEEVEPAWRAALESDRPCV
LDVLTDPAVPPIPPHATWDQIEATASSLLHGDSDRGHVIKQGAKAKIQDFLHGRRGEDDS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory