SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_038020048.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_038020048.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8bp7E Citrate-bound hexamer of synechococcus elongatus citrate synthase (see paper)
56% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 4:377/379 of 8bp7E

query
sites
8bp7E
E
 
E
Y
 
F
L
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
R
 
L
S
 
S
N
 
S
I
 
I
S
 
S
F
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
I
P
 
S
I
 
I
E
 
E
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
Q
S
 
S
T
 
S
F
 
F
E
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
W
G
 
G
Q
 
H
L
|
L
P
|
P
T
 
T
A
 
Q
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
E
 
T
E
 
E
F
 
F
D
 
E
R
 
H
A
 
E
M
 
I
R
 
R
N
 
Y
T
 
H
R
 
R
R
 
R
V
 
I
K
 
K
Y
 
F
N
 
R
V
 
I
R
 
R
E
 
D
M
 
M
M
 
M
K
 
K
F
 
C
M
 
F
P
 
P
V
 
D
T
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
S
V
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
L
F
 
F
Y
 
Y
P
 
S
A
 
R
Y
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
D
D
 
D
L
 
P
D
 
E
Y
 
Y
V
 
I
H
 
R
K
 
A
M
 
A
S
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
M
V
 
V
T
 
A
M
 
A
W
 
F
E
 
Q
H
 
L
I
 
I
R
 
R
N
 
K
G
 
G
N
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
R
 
R
D
 
D
D
 
E
L
 
L
T
 
D
H
 
Y
A
 
A
E
 
A
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
K
 
T
G
 
E
K
 
R
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
P
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
F
D
 
D
V
 
I
C
 
C
L
 
L
I
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
S
V
 
A
L
 
M
V
 
V
A
 
T
G
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
T
S
 
D
P
 
P
Y
 
Y
G
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
E
V
 
V
V
 
L
E
 
D
M
 
M
L
 
L
M
 
E
E
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
S
A
 
V
K
 
E
N
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
P
I
 
Y
I
 
L
D
 
D
A
 
H
R
 
C
L
 
I
A
 
A
R
 
T
K
 
K
E
 
T
K
 
R
I
 
I
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
 
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
V
K
 
K
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
V
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
G
 
N
L
 
L
M
 
A
D
 
E
R
 
Q
L
 
L
A
 
F
E
 
D
Q
 
I
R
 
F
G
 
G
L
 
-
K
 
-
H
 
H
S
 
D
R
 
P
L
 
Y
F
 
Y
E
 
E
T
 
I
A
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
V
Y
 
Y
Y
 
R
E
 
K
M
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
V
F
 
F
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
V
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
L
A
 
A
H
 
H
W
 
W
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
S
 
N
D
 
E
N
 
N
R
 
R
I
 
I
F
 
F
R
 
R
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
S
R
 
H
Q
 
N
R
 
L
E
 
D
Y
 
Y
V
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
A
R
 
D
R
 
R

1iomA Crystal structure of citrate synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
46% identity, 96% coverage: 11:388/392 of query aligns to 4:374/374 of 1iomA

query
sites
1iomA
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
L
A
 
F
T
 
T
R
 
E
S
 
S
N
 
R
I
 
M
S
 
C
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
K
L
 
L
E
 
Y
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
F
 
I
P
 
P
I
 
I
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
K
S
 
S
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
T
L
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
H
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
T
 
R
A
 
R
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
S
R
 
A
A
 
A
M
 
L
R
 
A
N
 
R
T
 
R
R
 
R
R
 
A
V
 
L
K
 
P
Y
 
A
N
 
H
V
 
L
R
 
L
E
 
E
M
 
S
M
 
F
K
 
K
F
 
R
M
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
S
G
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
S
M
 
F
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
E
L
 
F
G
 
G
M
 
M
F
 
L
Y
 
D
P
 
P
A
 
T
Y
 
E
D
 
G
L
 
D
L
 
I
A
 
S
N
 
R
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
E
Y
 
A
V
 
L
H
 
Y
K
 
E
M
 
K
S
 
G
V
 
L
R
 
D
I
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
K
M
 
F
P
 
A
T
 
T
L
 
I
V
 
V
T
 
A
M
 
A
W
 
N
E
 
K
H
 
R
I
 
L
R
 
K
N
 
E
G
 
G
N
 
K
D
 
E
P
 
P
V
 
I
P
 
P
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
S
H
 
H
A
 
A
E
 
A
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
A
K
 
N
G
 
G
K
 
V
Q
 
E
P
 
P
D
 
S
P
 
P
L
 
E
F
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
L
L
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
E
H
|
H
T
 
G
I
 
F
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
L
 
I
V
 
A
A
 
A
G
 
F
S
 
S
T
 
T
L
 
E
A
 
T
S
 
D
P
 
L
Y
 
Y
G
 
S
V
 
A
I
 
I
A
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
A
T
 
S
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
R
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
R
M
 
M
L
 
I
M
 
Q
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
T
A
 
P
K
 
E
N
 
R
V
 
A
D
 
R
R
 
E
I
 
W
I
 
V
D
 
R
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
K
E
 
E
K
 
R
I
 
I
W
 
M
G
 
G
M
 
M
G
 
G
H
|
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
A
K
 
F
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
T
 
G
I
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
K
L
 
L
M
 
A
D
 
R
R
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
R
 
H
G
 
G
L
 
-
K
 
-
H
 
H
S
 
S
R
 
K
L
 
E
F
 
Y
E
 
Q
T
 
I
A
 
L
M
 
K
A
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
E
A
 
A
E
 
G
R
 
K
R
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
P
K
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
D
M
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
S
T
 
L
D
 
E
L
 
F
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
V
A
 
A
R
|
R
S
 
I
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
V
A
 
G
H
 
H
W
 
I
R
 
L
E
 
E
-
 
Y
Q
 
Q
L
 
E
S
 
L
D
 
D
N
 
N
R
 
R
I
 
L
F
 
L
R
 
R
P
 
P
T
 
G
Q
 
A
V
 
K
Y
 
Y
T
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
L
Q
 
D
R
 
V
E
 
P
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
A
R
 
R

1ixeA Crystal structure of citrate synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
45% identity, 96% coverage: 11:388/392 of query aligns to 4:371/371 of 1ixeA

query
sites
1ixeA
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
L
A
 
F
T
 
T
R
 
E
S
 
S
N
 
R
I
 
M
S
 
C
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
K
L
 
L
E
 
Y
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
F
 
I
P
 
P
I
 
I
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
K
S
 
S
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
T
L
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
H
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
T
 
R
A
 
R
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
S
R
 
A
A
 
A
M
 
L
R
 
A
N
 
R
T
 
R
R
 
R
R
 
A
V
 
L
K
 
P
Y
 
A
N
 
H
V
 
L
R
 
L
E
 
E
M
 
S
M
 
F
K
 
K
F
 
R
M
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
S
G
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
S
M
 
F
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
E
L
 
F
G
 
G
M
 
M
F
 
L
Y
 
D
P
 
P
A
 
T
Y
 
E
D
 
G
L
 
D
L
 
I
A
 
S
N
 
R
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
E
Y
 
A
V
 
L
H
 
Y
K
 
E
M
 
K
S
 
G
V
 
L
R
 
D
I
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
K
M
 
F
P
 
A
T
 
T
L
 
I
V
 
V
T
 
A
M
 
A
W
 
N
E
 
K
H
 
R
I
 
L
R
 
K
N
 
E
G
 
G
N
 
K
D
 
E
P
 
P
V
 
I
P
 
P
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
S
H
 
H
A
 
A
E
 
A
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
A
K
 
N
G
 
G
K
 
V
Q
 
E
P
 
P
D
 
S
P
 
P
L
 
E
F
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
L
L
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
G
I
 
F
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
L
 
I
V
 
A
A
 
A
G
 
F
S
 
S
T
 
T
L
 
E
A
 
T
S
 
D
P
 
L
Y
 
Y
G
 
S
V
 
A
I
 
I
A
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
A
T
 
S
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
R
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
R
M
 
M
L
 
I
M
 
Q
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
T
A
 
P
K
 
E
N
 
R
V
 
A
D
 
R
R
 
E
I
 
W
I
 
V
D
 
R
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
K
E
 
E
K
x
R
I
|
I
W
x
M
G
|
G
M
|
M
G
|
G
H
|
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
A
K
 
F
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
T
 
G
I
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
K
L
 
L
M
 
A
D
 
R
R
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
H
S
 
S
R
 
K
L
 
E
F
 
Y
E
 
Q
T
 
I
A
 
L
M
 
K
A
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
E
A
 
A
E
 
G
R
 
K
R
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
P
K
x
R
G
 
G
V
x
I
Y
 
Y
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
Y
 
S
E
 
D
M
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
S
T
 
L
D
 
E
L
 
F
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
I
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
V
A
 
G
H
 
H
W
 
I
R
 
L
E
 
E
-
 
Y
Q
 
Q
L
 
E
S
 
L
D
 
D
N
 
N
R
 
R
I
 
L
F
 
L
R
 
R
P
 
P
T
 
G
Q
 
A
V
 
K
Y
 
Y
T
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
L
Q
 
D
R
 
V
E
 
P
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
A
R
 
R

1aj8A Citrate synthase from pyrococcus furiosus (see paper)
43% identity, 96% coverage: 11:388/392 of query aligns to 4:370/371 of 1aj8A

query
sites
1aj8A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
V
 
V
P
 
Y
A
 
I
T
 
D
R
 
Q
S
 
T
N
 
N
I
 
I
S
 
C
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
E
G
 
G
L
 
K
L
 
L
E
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
S
I
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
L
S
 
S
T
 
T
F
 
F
E
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
V
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
W
D
 
W
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
S
A
 
L
A
 
S
A
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
N
F
 
F
D
 
K
R
 
K
A
 
E
M
 
L
R
 
A
N
 
K
T
 
S
R
 
R
R
 
G
V
 
L
K
 
P
Y
 
K
N
 
E
V
 
V
R
 
I
E
 
E
M
 
I
M
 
M
K
 
E
F
 
A
M
 
L
P
 
P
V
 
K
T
 
N
G
 
T
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
G
M
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
A
 
I
V
 
I
A
 
S
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
M
 
N
F
 
I
Y
 
D
P
 
D
A
 
S
Y
 
G
D
 
D
L
 
I
L
 
P
A
 
V
N
 
T
G
 
P
P
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
E
Y
 
E
V
 
V
H
 
Y
K
 
R
M
 
I
S
 
G
V
 
I
R
 
S
I
 
V
I
 
T
A
 
A
R
 
K
M
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
I
V
 
V
T
 
A
M
 
N
W
 
W
E
 
Y
H
 
R
I
 
I
R
 
K
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
E
P
 
Y
V
 
V
P
 
P
P
 
P
R
 
K
D
 
E
D
 
K
L
 
L
T
 
S
H
 
H
A
 
A
E
 
A
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
K
 
H
G
 
G
K
 
E
Q
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
K
L
 
E
F
 
W
A
 
E
R
 
K
I
 
A
L
 
M
D
 
D
V
 
V
C
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
E
I
 
I
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
M
V
 
T
A
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
S
S
 
D
P
 
Y
Y
 
Y
G
 
S
V
 
A
I
 
I
A
 
L
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
L
x
I
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
V
E
 
E
K
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
K
M
 
Q
L
 
F
M
 
M
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
S
A
 
P
K
 
E
N
 
K
V
 
V
D
 
E
R
 
E
I
 
W
I
 
F
D
 
F
A
 
K
R
 
A
L
 
L
A
 
Q
R
 
Q
K
 
K
E
 
R
K
|
K
I
|
I
W
 
M
G
|
G
M
x
A
G
|
G
H
|
H
R
|
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
T
K
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
T
 
R
I
 
I
L
 
F
Q
 
K
G
 
K
L
 
Y
M
 
A
D
 
S
R
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
D
Q
 
K
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
-
S
 
-
R
 
K
L
 
L
F
 
F
E
 
E
T
 
I
A
 
A
M
 
E
A
 
R
V
 
L
E
 
E
K
 
R
A
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
E
R
 
Y
L
 
L
A
 
S
E
 
K
K
|
K
G
 
G
V
x
I
Y
 
S
P
 
I
N
|
N
V
 
V
D
|
D
F
 
Y
Y
 
W
S
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
V
Y
 
F
Y
 
Y
E
 
G
M
 
M
G
 
K
I
 
I
K
 
P
T
 
I
D
 
E
L
 
L
F
 
Y
T
 
T
P
 
T
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
G
R
 
R
S
 
I
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
A
 
A
H
 
H
W
 
L
R
 
A
E
 
E
Q
 
Y
L
 
V
S
 
S
D
 
H
N
 
N
R
 
R
I
 
I
F
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
L
V
 
Q
Y
 
Y
T
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
I
Q
 
G
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
L
 
I
E
 
E
R
 
L
R
 
R

6abxA Crystal structure of citrate synthase (msed_1522) from metallosphaera sedula in complex with citrate (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 2:370/370 of 6abxA

query
sites
6abxA
E
 
E
Y
 
L
L
 
R
P
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
V
 
I
P
 
A
A
 
I
T
 
K
R
 
E
S
 
T
N
 
S
I
 
I
S
 
T
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
R
L
 
L
E
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
S
I
 
I
E
 
F
T
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
F
S
 
S
T
 
N
F
 
F
E
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
W
D
 
Y
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
R
A
 
H
A
 
E
L
 
L
E
 
D
E
 
D
F
 
F
D
 
K
R
 
S
A
 
R
M
 
L
R
 
A
N
 
E
T
 
E
R
 
R
R
 
S
V
 
I
K
 
S
Y
 
E
N
 
D
V
 
I
R
 
S
E
 
T
M
 
F
M
 
V
K
 
K
F
 
R
M
 
T
P
 
A
V
 
K
T
 
F
G
 
G
H
 
N
P
 
P
M
 
M
D
 
D
M
 
I
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
A
 
T
V
 
V
A
 
S
S
 
M
L
 
M
G
 
G
M
 
L
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
E
P
 
D
R
 
R
S
 
S
D
 
E
L
 
G
D
 
D
Y
 
L
V
 
I
H
 
G
K
 
K
M
 
-
S
 
A
V
 
I
R
 
K
I
 
M
I
 
T
A
 
A
R
 
K
M
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
I
V
 
I
T
 
S
M
 
L
W
 
I
E
 
Q
H
 
R
I
 
T
R
 
R
N
 
R
G
 
N
N
 
Q
D
 
E
P
 
F
V
 
V
P
 
E
P
 
P
R
 
D
D
 
P
D
 
S
L
 
L
T
 
S
H
 
H
A
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
I
K
 
R
G
 
G
K
 
E
Q
 
R
P
 
P
D
 
S
P
 
P
L
 
S
F
 
D
A
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
S
L
 
L
I
 
M
L
 
L
H
 
H
A
 
M
E
 
D
H
|
H
T
 
E
I
 
M
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
M
A
 
A
V
 
C
L
 
L
V
 
V
A
 
V
G
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
S
S
 
D
P
 
I
Y
 
Y
G
 
S
V
 
S
I
 
V
A
 
V
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
S
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
|
H
G
|
G
G
|
G
A
 
A
N
 
N
E
 
S
K
 
E
V
 
A
V
 
L
E
 
K
M
 
Q
L
 
F
M
 
M
E
 
E
I
 
I
G
 
E
D
 
T
A
 
P
K
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
Y
I
 
V
D
 
M
A
 
N
R
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
S
K
 
G
E
 
Q
K
 
R
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
E
 
I
Y
 
Y
K
 
K
T
 
T
K
 
M
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
L
 
Y
M
 
A
D
 
N
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
E
 
K
Q
 
N
R
 
E
G
 
E
L
 
I
K
 
K
H
 
-
S
 
-
R
 
R
L
 
L
F
 
F
E
 
E
T
 
I
A
 
A
M
 
N
A
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
I
A
 
G
E
 
I
R
 
K
R
 
I
L
 
L
A
 
G
E
 
K
K
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
V
Y
 
F
Y
 
Y
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
F
K
 
D
T
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
P
P
 
T
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
S
A
 
A
R
|
R
S
 
V
A
 
I
G
 
G
W
 
W
L
 
T
A
 
A
H
 
H
W
 
V
R
 
D
E
 
E
Q
 
Y
L
 
L
S
 
K
D
 
D
N
 
N
R
 
K
I
 
L
F
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
K
Q
 
A
V
 
I
Y
 
Y
T
 
V
G
 
G
E
 
D
R
 
L
Q
 
G
R
 
K
E
 
R
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
L
 
I
E
 
E
R
 
E
R
 
R

6abyA Crystal structure of citrate synthase (msed_1522) from metallosphaera sedula in complex with oxaloacetate (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 2:370/372 of 6abyA

query
sites
6abyA
E
 
E
Y
 
L
L
 
R
P
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
V
 
I
P
 
A
A
 
I
T
 
K
R
 
E
S
 
T
N
 
S
I
 
I
S
 
T
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
R
L
 
L
E
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
S
I
 
I
E
 
F
T
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
F
S
 
S
T
 
N
F
 
F
E
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
W
D
 
Y
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
R
A
 
H
A
 
E
L
 
L
E
 
D
E
 
D
F
 
F
D
 
K
R
 
S
A
 
R
M
 
L
R
 
A
N
 
E
T
 
E
R
 
R
R
 
S
V
 
I
K
 
S
Y
 
E
N
 
D
V
 
I
R
 
S
E
 
T
M
 
F
M
 
V
K
 
K
F
 
R
M
 
T
P
 
A
V
 
K
T
 
F
G
 
G
H
 
N
P
 
P
M
 
M
D
 
D
M
 
I
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
A
 
T
V
 
V
A
 
S
S
 
M
L
 
M
G
 
G
M
 
L
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
E
P
 
D
R
 
R
S
 
S
D
 
E
L
 
G
D
 
D
Y
 
L
V
 
I
H
 
G
K
 
K
M
 
-
S
 
A
V
 
I
R
 
K
I
 
M
I
 
T
A
 
A
R
 
K
M
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
I
V
 
I
T
 
S
M
 
L
W
 
I
E
 
Q
H
 
R
I
 
T
R
 
R
N
 
R
G
 
N
N
 
Q
D
 
E
P
 
F
V
 
V
P
 
E
P
 
P
R
 
D
D
 
P
D
 
S
L
 
L
T
 
S
H
 
H
A
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
I
K
 
R
G
 
G
K
 
E
Q
 
R
P
 
P
D
 
S
P
 
P
L
 
S
F
 
D
A
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
S
L
 
L
I
 
M
L
 
L
H
 
H
A
 
M
E
 
D
H
|
H
T
 
E
I
 
M
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
M
A
 
A
V
 
C
L
 
L
V
 
V
A
 
V
G
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
S
S
 
D
P
 
I
Y
 
Y
G
 
S
V
 
S
I
 
V
A
 
V
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
S
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
S
K
 
E
V
 
A
V
 
L
E
 
K
M
 
Q
L
 
F
M
 
M
E
 
E
I
 
I
G
 
E
D
 
T
A
 
P
K
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
Y
I
 
V
D
 
M
A
 
N
R
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
S
K
 
G
E
 
Q
K
x
R
I
x
L
W
 
M
G
 
G
M
x
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
E
 
I
Y
 
Y
K
 
K
T
 
T
K
 
M
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
L
 
Y
M
 
A
D
 
N
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
E
 
K
Q
 
N
R
 
E
G
 
E
L
 
I
K
 
K
H
 
-
S
 
-
R
 
R
L
 
L
F
 
F
E
 
E
T
 
I
A
 
A
M
 
N
A
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
I
A
 
G
E
 
I
R
 
K
R
 
I
L
 
L
A
 
G
E
 
K
K
x
R
G
 
G
V
x
I
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
V
Y
 
F
Y
 
Y
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
F
K
 
D
T
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
P
P
 
T
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
S
A
 
A
R
|
R
S
 
V
A
 
I
G
 
G
W
 
W
L
 
T
A
 
A
H
 
H
W
 
V
R
 
D
E
 
E
Q
 
Y
L
 
L
S
 
K
D
 
D
N
 
N
R
 
K
I
 
L
F
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
K
Q
 
A
V
 
I
Y
 
Y
T
 
V
G
 
G
E
 
D
R
 
L
Q
 
G
R
 
K
E
 
R
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
L
 
I
E
 
E
R
 
E
R
 
R

P39120 Citrate synthase 2; Citrate synthase II; EC 2.3.3.16 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
42% identity, 97% coverage: 11:389/392 of query aligns to 6:372/372 of P39120

query
sites
P39120
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
T
S
 
S
N
 
S
I
 
V
S
 
S
F
 
S
I
 
I
D
 
I
G
 
D
R
 
D
A
 
T
G
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
T
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
D
I
 
I
E
 
D
T
 
D
L
 
L
A
 
T
E
 
E
H
 
N
S
 
A
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
T
 
I
A
 
I
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
W
D
 
H
G
 
L
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
T
 
N
A
 
K
A
 
K
A
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
F
 
L
D
 
K
R
 
Q
A
 
Q
M
 
L
R
 
A
N
 
K
T
 
E
R
 
A
R
 
A
V
 
V
K
 
P
Y
 
Q
N
 
E
V
 
I
R
 
I
E
 
E
M
 
H
M
 
F
K
 
K
F
 
S
M
 
Y
P
 
S
V
 
L
T
 
E
G
 
N
-
 
V
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
M
 
A
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
S
S
 
L
L
 
L
G
 
G
M
 
L
F
 
L
Y
 
D
P
 
S
A
 
E
Y
 
A
D
 
D
L
 
T
L
 
M
A
 
-
N
 
-
G
 
N
P
 
P
R
 
E
S
 
A
D
 
N
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
V
 
-
H
 
Y
K
 
R
M
 
K
S
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
L
I
 
Q
A
 
A
R
 
K
M
 
V
P
 
P
T
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
A
M
 
A
W
 
F
E
 
S
H
 
R
I
 
I
R
 
R
N
 
K
G
 
G
N
 
L
D
 
E
P
 
P
V
 
V
P
 
E
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
T
 
G
H
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
T
L
 
L
K
 
N
G
 
G
K
 
E
Q
 
E
P
 
P
D
 
S
P
 
P
L
 
I
F
 
E
A
 
V
R
 
E
I
 
A
L
 
F
D
 
N
V
 
K
C
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
E
I
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
C
G
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
S
S
 
D
P
 
I
Y
 
Y
G
 
S
V
 
G
I
 
I
A
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
G
V
 
V
V
 
M
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
T
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
E
A
 
V
K
 
E
N
 
N
V
 
A
D
 
E
R
 
P
I
 
Y
I
 
I
D
 
R
A
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
K
K
 
K
E
 
E
K
 
K
I
 
I
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
 
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
H
K
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
K
I
 
H
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
L
 
M
M
 
S
D
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
T
E
 
N
Q
 
L
R
 
T
G
 
G
L
 
-
K
 
-
H
 
E
S
|
S
R
 
K
L
 
W
F
 
Y
E
 
E
T
 
M
A
 
S
M
 
I
A
 
R
V
 
I
E
 
E
K
 
D
A
 
I
A
 
V
E
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
T
A
 
S
E
 
E
K
 
K
G
 
K
V
 
L
Y
 
P
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
A
V
 
S
L
 
V
Y
 
Y
Y
 
H
E
 
S
M
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
D
T
 
H
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
V
A
 
S
R
 
R
S
 
M
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
L
A
 
A
H
 
H
W
 
I
R
 
L
E
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
S
 
D
D
 
N
N
 
N
R
 
R
I
 
L
F
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
A
V
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
P
R
 
D
Q
 
K
R
 
Q
E
 
K
Y
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
I
E
 
E
R
 
E
R
 
R
G
 
A

2h12B Structure of acetobacter aceti citrate synthase complexed with oxaloacetate and carboxymethyldethia coenzyme a (cmx) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 4:388/392 of query aligns to 30:426/426 of 2h12B

query
sites
2h12B
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
A
Y
 
Q
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
F
-
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
E
 
G
G
 
E
V
 
T
P
 
A
A
 
A
T
 
C
R
 
N
S
 
S
N
 
K
I
 
I
S
 
T
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
D
A
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
E
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
I
 
I
E
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
N
S
 
A
T
 
S
F
 
Y
E
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
I
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
N
A
 
K
A
 
A
A
 
Q
L
 
Y
E
 
D
E
 
T
F
 
F
D
 
T
R
 
N
A
 
T
M
 
L
R
 
T
N
 
N
T
 
H
R
 
T
R
 
L
V
 
L
K
 
H
Y
 
E
N
 
Q
V
 
I
R
 
R
E
 
N
M
 
F
M
 
F
K
 
N
F
 
G
M
 
F
P
 
R
V
 
R
T
 
D
G
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
M
 
I
L
 
L
Q
 
C
T
 
G
A
 
T
V
 
V
A
 
G
S
 
A
L
 
L
G
 
S
M
 
A
F
 
F
Y
 
Y
P
 
P
A
 
D
Y
 
A
D
 
N
L
 
D
L
 
I
A
 
A
N
 
I
G
 
P
P
 
A
R
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
D
 
-
Y
 
-
V
 
-
H
 
-
K
 
-
M
 
A
S
 
A
V
 
M
R
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
K
M
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
I
V
 
A
T
 
A
M
 
W
W
 
A
E
 
Y
H
 
K
I
 
Y
R
 
T
N
 
Q
G
 
G
N
 
E
D
 
A
P
 
F
V
 
I
P
 
Y
P
 
P
R
 
R
D
 
N
D
 
D
L
 
L
T
 
N
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
S
M
 
M
L
 
M
K
 
F
G
 
A
K
 
R
-
 
M
-
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
Y
Q
 
K
P
 
V
D
 
N
P
 
P
L
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
A
L
 
M
D
 
N
V
 
R
C
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
|
H
T
 
E
I
 
Q
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
T
L
 
G
A
 
A
S
 
N
P
 
P
Y
 
F
G
 
A
V
 
C
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
A
T
 
A
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
x
A
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
A
E
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
K
A
 
K
K
 
E
N
 
N
V
 
I
D
 
P
R
 
A
I
 
F
I
 
I
D
 
-
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
A
 
K
R
 
D
K
 
K
E
 
N
-
 
S
-
 
G
-
 
V
K
|
K
I
x
L
W
 
M
G
|
G
M
x
F
G
|
G
H
|
H
R
|
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
F
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
M
Q
 
Q
G
 
Q
L
 
T
M
 
C
D
 
H
R
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
T
Q
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
K
H
 
D
S
 
D
R
 
P
L
 
L
F
 
L
E
 
D
T
 
L
A
 
A
M
 
V
A
 
E
V
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
S
E
 
D
R
 
D
R
x
Y
L
 
F
A
 
V
E
 
Q
K
x
R
G
 
K
V
x
L
Y
 
Y
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
K
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
T
D
 
S
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
A
M
 
V
A
 
A
R
|
R
S
 
T
A
 
T
G
 
G
W
 
W
L
 
V
A
 
S
H
 
Q
W
 
W
R
 
K
E
 
E
Q
 
M
L
 
I
S
 
E
D
 
E
-
 
P
-
 
G
N
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
S
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
T
 
I
G
 
G
E
 
A
R
 
P
Q
 
Q
R
 
R
E
 
D
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
L
 
L
E
 
A
R
 
K
R
 
R

4jagA Structural determination of the a50t:s279g:s280k:v281k:k282e:h283n variant of citrate synthase from e. Coli complexed with oxaloacetate (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:382/392 of query aligns to 44:420/426 of 4jagA

query
sites
4jagA
P
 
P
G
 
G
L
 
F
E
 
T
G
 
S
V
 
T
P
 
T
A
 
S
T
 
C
R
 
E
S
 
S
N
 
K
I
 
I
S
 
T
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
D
A
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
D
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
T
H
 
D
S
 
S
T
 
N
F
 
Y
E
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
C
L
 
Y
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
L
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
E
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
K
R
 
T
A
 
T
M
 
V
R
 
T
N
 
R
T
 
H
R
 
T
R
 
M
V
 
I
K
 
H
Y
 
E
N
 
Q
V
 
I
R
 
T
E
 
R
M
 
L
M
 
F
K
 
H
F
 
A
M
 
F
P
 
R
V
 
R
T
 
D
G
 
S
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
M
 
V
L
 
M
Q
 
C
T
 
G
A
 
I
V
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
A
F
 
F
Y
 
Y
P
 
-
A
 
-
Y
 
H
D
 
D
L
 
S
L
 
L
-
 
D
A
 
V
N
 
N
G
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
H
V
 
R
H
 
E
K
 
I
M
 
A
S
 
A
V
 
F
R
 
R
I
 
L
I
 
L
A
 
S
R
 
K
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
A
M
 
M
W
 
C
E
 
Y
H
 
K
I
 
Y
R
 
S
N
 
I
G
 
G
N
 
Q
D
 
P
P
 
F
V
 
V
P
 
Y
P
 
P
R
 
R
D
 
N
D
 
D
L
 
L
T
 
S
H
 
Y
A
 
A
E
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
M
 
M
L
 
M
K
 
F
G
 
S
K
 
T
-
 
P
-
 
C
-
 
E
-
 
P
-
 
Y
Q
 
E
P
 
V
D
 
N
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
E
R
 
R
I
 
A
L
 
M
D
 
D
V
 
R
C
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
|
H
T
 
E
I
 
Q
N
|
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
G
A
 
A
S
 
N
P
 
P
Y
 
F
G
 
A
V
 
C
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
A
T
 
S
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
K
A
 
K
K
 
E
N
 
N
V
 
I
D
 
P
R
 
E
I
 
F
I
 
V
D
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
R
A
 
A
R
 
K
K
 
D
E
 
K
-
 
N
-
 
D
-
 
S
-
 
F
K
 
R
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
 
H
R
|
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
M
Q
 
R
G
 
E
L
 
T
M
 
C
D
 
H
R
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
T
K
 
K
H
 
D
S
 
D
R
 
-
L
 
L
F
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
L
E
 
E
K
 
N
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
N
E
 
D
R
 
P
R
 
Y
L
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
G
 
K
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
K
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
S
D
 
S
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
R
|
R
S
 
T
A
 
V
G
 
G
W
 
W
L
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
W
R
 
S
E
 
E
Q
 
M
L
 
H
S
 
S
D
 
D
N
 
G
-
 
M
R
 
K
I
 
I
F
 
A
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
E
Q
 
K
R
 
R
E
 
D
Y
 
F

4jaeA Structural determination of the a50t:s279g:s280k:v281k:k282e:h283n variant of citrate synthase from e. Coli complexed with s- carboxymethyl-coa (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:382/392 of query aligns to 44:420/426 of 4jaeA

query
sites
4jaeA
P
 
P
G
 
G
L
 
F
E
 
T
G
 
S
V
 
T
P
 
T
A
 
S
T
 
C
R
 
E
S
 
S
N
 
K
I
 
I
S
 
T
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
D
A
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
D
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
T
H
 
D
S
 
S
T
 
N
F
 
Y
E
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
C
L
 
Y
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
L
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
E
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
K
R
 
T
A
x
T
M
 
V
R
x
T
N
x
R
T
x
H
R
x
T
R
x
M
V
 
I
K
 
H
Y
 
E
N
 
Q
V
 
I
R
 
T
E
 
R
M
 
L
M
 
F
K
 
H
F
 
A
M
 
F
P
 
R
V
 
R
T
 
D
G
 
S
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
M
 
V
L
 
M
Q
 
C
T
 
G
A
 
I
V
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
A
F
 
F
Y
 
Y
P
 
-
A
 
-
Y
 
H
D
 
D
L
 
S
L
 
L
-
 
D
A
 
V
N
 
N
G
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
H
V
 
R
H
x
E
K
x
I
M
 
A
S
 
A
V
 
F
R
|
R
I
 
L
I
 
L
A
 
S
R
x
K
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
A
M
 
M
W
 
C
E
 
Y
H
 
K
I
 
Y
R
 
S
N
 
I
G
 
G
N
 
Q
D
 
P
P
 
F
V
 
V
P
 
Y
P
 
P
R
 
R
D
x
N
D
 
D
L
 
L
T
 
S
H
 
Y
A
 
A
E
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
M
 
M
L
 
M
K
 
F
G
 
S
K
 
T
-
 
P
-
 
C
-
 
E
-
 
P
-
 
Y
Q
 
E
P
 
V
D
 
N
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
E
R
 
R
I
 
A
L
 
M
D
 
D
V
 
R
C
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
E
I
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
G
A
 
A
S
 
N
P
 
P
Y
 
F
G
 
A
V
 
C
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
A
T
 
S
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
K
A
 
K
K
 
E
N
 
N
V
 
I
D
 
P
R
 
E
I
 
F
I
 
V
D
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
R
A
 
A
R
 
K
K
 
D
E
 
K
-
 
N
-
 
D
-
 
S
-
 
F
K
 
R
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
 
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
M
Q
 
R
G
 
E
L
 
T
M
 
C
D
 
H
R
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
T
K
 
K
H
 
D
S
 
D
R
 
-
L
 
L
F
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
L
E
 
E
K
 
N
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
N
E
 
D
R
 
P
R
 
Y
L
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
G
 
K
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
K
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
S
D
 
S
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
T
A
 
V
G
 
G
W
 
W
L
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
W
R
 
S
E
 
E
Q
 
M
L
 
H
S
 
S
D
 
D
N
 
G
-
 
M
R
 
K
I
 
I
F
 
A
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
E
Q
 
K
R
 
R
E
 
D
Y
 
F

6s87D Crystal structure of 2-methylcitrate synthase (prpc) from pseudomonas aeruginosa in complex with oxaloacetate.
37% identity, 96% coverage: 11:388/392 of query aligns to 1:365/365 of 6s87D

query
sites
6s87D
G
 
G
L
 
L
E
 
R
G
 
G
V
 
Q
P
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
Q
S
 
T
N
 
A
I
 
L
S
 
S
F
 
T
I
 
V
D
 
G
G
 
Q
R
 
E
A
 
G
G
 
A
L
 
G
L
 
L
E
 
T
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
D
I
 
V
E
 
R
T
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
A
S
 
A
T
 
I
F
 
F
E
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
Y
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
N
A
 
K
A
 
Q
A
 
Q
L
 
L
E
 
D
E
 
A
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
A
 
K
M
 
L
R
 
Q
N
 
G
T
 
Q
R
 
R
R
 
D
V
 
L
K
 
P
Y
 
Q
N
 
A
V
 
L
R
 
K
E
 
E
M
 
V
M
 
L
K
 
E
F
 
R
M
 
I
P
 
P
V
 
K
T
 
D
G
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
M
 
V
L
 
M
Q
 
R
T
 
T
A
 
G
V
 
A
A
 
S
S
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
T
F
 
L
Y
 
E
P
 
P
A
 
E
Y
 
L
D
 
S
L
 
F
L
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
D
Y
 
Q
V
 
Q
H
 
R
K
 
D
M
 
V
S
 
A
V
 
D
R
 
R
I
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
A
M
 
F
P
 
P
T
 
A
L
 
I
V
 
M
T
 
T
M
 
Y
W
 
W
-
 
Y
E
 
R
H
 
F
I
 
T
R
 
H
N
 
E
G
 
G
N
 
Q
D
 
R
P
 
I
V
 
D
P
 
C
P
 
N
R
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
P
T
 
T
H
 
I
A
 
G
E
 
G
N
 
H
F
 
F
L
 
L
Y
 
A
M
 
L
L
 
L
K
 
H
G
 
G
K
 
K
Q
 
K
P
 
P
D
 
S
P
 
E
L
 
L
F
 
H
A
 
V
R
 
K
I
 
V
L
 
M
D
 
N
V
 
V
C
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
|
H
T
 
E
I
 
F
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
C
G
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
S
S
 
D
P
 
L
Y
 
Y
G
 
S
V
 
C
I
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
S
L
 
L
S
 
R
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
A
V
 
M
E
 
E
M
 
L
L
 
I
M
 
E
E
 
R
I
 
F
G
 
S
D
 
S
A
 
P
K
 
Q
N
 
E
V
 
A
D
 
T
R
 
A
I
 
E
I
 
L
D
 
L
A
 
K
R
 
M
L
 
L
A
 
E
R
 
R
K
 
K
E
 
D
K
 
K
I
 
I
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
A
E
 
I
Y
 
Y
K
 
K
T
 
D
K
 
S
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
N
T
 
E
I
 
V
L
 
I
Q
 
K
G
 
G
L
 
W
M
 
S
D
 
K
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
E
R
 
V
G
 
G
L
 
D
K
 
K
H
 
-
S
 
-
R
 
V
L
 
L
F
 
F
E
 
A
T
 
V
A
 
S
M
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
D
K
 
K
A
 
T
A
 
M
E
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
W
A
 
E
E
 
Q
K
 
K
G
 
K
V
 
L
Y
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
A
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
H
G
 
A
V
 
S
L
 
A
Y
 
Y
Y
 
H
E
 
F
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
T
D
 
K
L
 
L
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
V
M
 
C
A
 
S
R
|
R
S
 
T
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
T
A
 
A
H
 
H
W
 
V
R
 
F
E
 
E
Q
 
Q
L
 
R
S
 
A
D
 
N
N
 
N
R
 
R
I
 
I
F
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
A
V
 
E
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
V
R
 
E
Q
 
Q
R
 
R
E
 
A
Y
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
R
 
R

P0ABH7 Citrate synthase; EC 2.3.3.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
38% identity, 95% coverage: 10:382/392 of query aligns to 45:421/427 of P0ABH7

query
sites
P0ABH7
P
 
P
G
 
G
L
 
F
E
 
T
G
 
S
V
 
T
P
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
E
S
 
S
N
 
K
I
 
I
S
 
T
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
D
A
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
D
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
T
H
 
D
S
 
S
T
 
N
F
 
Y
E
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
C
L
 
Y
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
L
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
E
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
K
R
 
T
A
 
T
M
 
V
R
 
T
N
 
R
T
 
H
R
 
T
R
 
M
V
 
I
K
 
H
Y
 
E
N
 
Q
V
 
I
R
 
T
E
 
R
M
 
L
M
 
F
K
 
H
F
 
A
M
 
F
P
 
R
V
 
R
T
 
D
G
 
S
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
M
 
V
L
 
M
Q
 
C
T
 
G
A
 
I
V
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
A
F
 
F
Y
 
Y
P
 
-
A
 
-
Y
 
H
D
 
D
L
 
S
L
 
L
-
 
D
A
 
V
N
 
N
G
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
H
V
 
R
H
 
E
K
 
I
M
 
A
S
 
A
V
 
F
R
 
R
I
 
L
I
 
L
A
 
S
R
 
K
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
A
M
 
M
W
 
C
E
 
Y
H
 
K
I
 
Y
R
 
S
N
 
I
G
 
G
N
 
Q
D
 
P
P
 
F
V
 
V
P
 
Y
P
 
P
R
 
R
D
 
N
D
 
D
L
 
L
T
 
S
H
 
Y
A
 
A
E
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
M
 
M
L
 
M
K
 
F
G
 
S
K
 
T
-
 
P
-
x
C
-
x
E
-
 
P
-
 
Y
Q
 
E
P
 
V
D
 
N
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
E
R
 
R
I
 
A
L
 
M
D
 
D
V
 
R
C
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
E
I
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
G
A
 
A
S
 
N
P
 
P
Y
 
F
G
 
A
V
 
C
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
A
T
 
S
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
S
D
 
S
A
 
V
K
|
K
N
 
H
V
 
I
D
 
P
R
 
E
I
 
F
I
 
V
D
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
R
A
 
A
R
 
K
K
 
D
E
 
K
-
 
N
-
 
D
-
 
S
-
 
F
K
 
R
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
 
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
M
Q
 
R
G
 
E
L
 
T
M
 
C
D
 
H
R
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
T
K
 
K
H
 
D
S
 
D
R
 
-
L
 
L
F
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
L
E
 
E
K
 
N
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
N
E
 
D
R
 
P
R
 
Y
L
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
G
 
K
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
K
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
S
D
 
S
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
T
A
 
V
G
 
G
W
 
W
L
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
W
R
 
S
E
 
E
Q
 
M
L
 
H
S
 
S
D
 
D
N
 
G
-
 
M
R
 
K
I
 
I
F
 
A
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
E
Q
 
K
R
 
R
E
 
D
Y
 
F

1owbA Three dimensional structure analysis of the variant r109l nadh complex of type ii citrate synthase from e. Coli (see paper)
38% identity, 95% coverage: 10:382/392 of query aligns to 44:420/426 of 1owbA

query
sites
1owbA
P
 
P
G
 
G
L
 
F
E
 
T
G
 
S
V
 
T
P
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
E
S
 
S
N
 
K
I
 
I
S
 
T
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
D
A
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
D
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
T
H
 
D
S
 
S
T
 
N
F
 
Y
E
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
C
L
 
Y
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
L
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
E
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
K
R
 
T
A
 
T
M
 
V
R
x
T
N
x
L
T
x
H
R
x
T
R
x
M
V
 
I
K
x
H
Y
 
E
N
 
Q
V
 
I
R
 
T
E
 
R
M
 
L
M
 
F
K
 
H
F
 
A
M
 
F
P
 
R
V
 
R
T
 
D
G
 
S
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
M
 
V
L
 
M
Q
 
C
T
 
G
A
 
I
V
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
A
F
 
F
Y
|
Y
P
 
-
A
 
-
Y
 
H
D
 
D
L
 
S
L
 
L
-
 
D
A
 
V
N
 
N
G
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
H
V
 
R
H
 
E
K
x
I
M
 
A
S
 
A
V
x
F
R
|
R
I
 
L
I
 
L
A
 
S
R
x
K
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
A
M
 
M
W
 
C
E
 
Y
H
 
K
I
 
Y
R
 
S
N
 
I
G
 
G
N
 
Q
D
 
P
P
 
F
V
 
V
P
 
Y
P
 
P
R
 
R
D
x
N
D
 
D
L
 
L
T
 
S
H
 
Y
A
 
A
E
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
M
 
M
L
 
M
K
 
F
G
 
S
K
 
T
-
 
P
-
 
C
-
 
E
-
 
P
-
 
Y
Q
 
E
P
 
V
D
 
N
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
E
R
 
R
I
 
A
L
 
M
D
 
D
V
 
R
C
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
E
I
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
G
A
 
A
S
 
N
P
 
P
Y
 
F
G
 
A
V
 
C
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
A
T
 
S
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
S
D
 
S
A
 
V
K
 
K
N
 
H
V
 
I
D
 
P
R
 
E
I
 
F
I
 
F
D
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
R
A
 
A
R
 
K
K
 
D
E
 
K
-
 
N
-
 
D
-
 
S
-
 
F
K
 
R
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
 
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
M
Q
 
R
G
 
E
L
 
T
M
 
C
D
 
H
R
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
T
K
 
K
H
 
D
S
 
D
R
 
-
L
 
L
F
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
L
E
 
E
K
 
N
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
N
E
 
D
R
 
P
R
 
Y
L
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
G
 
K
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
K
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
S
D
 
S
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
T
A
 
V
G
 
G
W
 
W
L
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
W
R
 
S
E
 
E
Q
 
M
L
 
H
S
 
S
D
 
D
N
 
G
-
 
M
R
 
K
I
 
I
F
 
A
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
E
Q
 
K
R
 
R
E
 
D
Y
 
F

I6Y9Q3 2-methylcitrate synthase; 2-MCS; MCS; Citrate synthase; EC 2.3.3.5; EC 2.3.3.16 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)
38% identity, 96% coverage: 3:380/392 of query aligns to 23:387/393 of I6Y9Q3

query
sites
I6Y9Q3
D
 
D
K
 
E
L
 
R
P
 
P
E
 
D
Y
 
I
L
 
K
P
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
V
A
 
V
T
 
D
R
 
T
S
 
T
N
 
A
I
 
I
S
 
S
F
 
K
I
 
V
D
 
V
G
 
P
R
 
Q
A
 
T
G
 
N
L
 
S
L
 
L
E
 
T
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
I
 
V
E
 
Q
T
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
R
S
 
C
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
W
D
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
L
E
 
A
E
 
L
F
 
F
D
 
S
R
 
Q
A
x
R
M
 
E
R
 
R
N
 
A
T
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
D
Y
 
R
N
 
S
V
 
M
R
 
L
E
 
S
M
 
L
M
 
L
K
 
A
F
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
D
T
 
N
G
 
C
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
M
 
V
L
 
V
Q
 
R
T
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
S
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
M
 
A
F
 
E
Y
 
D
P
 
P
A
 
D
Y
 
E
D
 
D
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
D
L
 
A
D
 
A
Y
 
A
V
 
N
H
 
R
K
 
A
M
 
K
S
 
A
V
 
M
R
 
R
I
 
M
I
 
M
A
 
A
R
 
V
M
 
L
P
 
P
T
 
T
L
 
I
V
 
V
T
 
A
M
 
I
W
 
D
E
 
M
H
 
R
I
 
R
R
 
R
N
 
R
G
 
G
N
 
L
D
 
P
P
 
P
V
 
I
P
 
A
P
 
P
R
 
H
D
 
S
D
 
G
L
 
L
T
 
G
H
 
Y
A
 
A
E
 
Q
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
H
M
 
M
L
 
C
K
 
F
G
 
G
K
 
E
Q
 
V
P
 
P
D
 
E
P
 
T
L
 
A
F
 
V
A
 
V
R
 
S
I
 
A
L
 
F
D
 
E
V
 
Q
C
 
S
L
 
M
I
 
I
L
 
L
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
|
H
T
 
G
I
 
F
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
V
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
V
G
 
T
S
 
S
T
 
T
L
 
Q
A
 
S
S
 
D
P
 
I
Y
 
Y
G
 
S
V
 
A
I
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
R
L
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
H
M
 
D
L
 
M
M
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
P
K
 
A
N
 
N
V
 
A
D
 
R
R
 
E
I
 
W
I
 
L
D
 
R
A
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
E
 
E
K
 
K
I
 
I
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
R
T
 
H
K
 
G
D
 
D
P
 
S
R
|
R
A
 
V
T
 
P
I
 
T
L
 
M
Q
 
K
G
 
R
L
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
V
A
 
G
E
 
T
Q
 
V
R
 
R
G
 
D
L
 
G
K
 
Q
H
 
R
S
 
W
R
 
L
L
 
D
F
 
I
E
 
Y
T
 
Q
A
 
V
M
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
K
 
M
A
 
A
A
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
S
E
 
A
K
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
 
L
P
 
P
N
 
N
V
 
L
D
 
D
F
 
F
Y
 
P
S
 
T
G
 
G
V
 
P
L
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
L
M
 
M
G
 
G
I
 
F
K
 
D
T
 
I
D
 
A
L
 
S
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
V
M
 
M
A
 
S
R
|
R
S
 
I
A
 
T
G
 
G
W
 
W
L
 
T
A
 
A
H
 
H
W
 
I
R
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
A
S
 
T
D
 
A
N
 
N
R
 
A
I
 
L
F
 
I
R
|
R
P
 
P
T
 
L
Q
 
S
V
 
A
Y
 
Y
T
 
C
G
 
G
E
 
H
R
 
E
Q
 
Q
R
 
R

1nxgA The f383a variant of type ii citrate synthase complexed with nadh (see paper)
38% identity, 95% coverage: 10:382/392 of query aligns to 44:420/426 of 1nxgA

query
sites
1nxgA
P
 
P
G
 
G
L
 
F
E
 
T
G
 
S
V
 
T
P
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
E
S
 
S
N
 
K
I
 
I
S
 
T
F
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
D
A
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
D
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
T
H
 
D
S
 
S
T
 
N
F
 
Y
E
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
C
L
 
Y
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
L
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
E
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
K
R
 
T
A
x
T
M
 
V
R
 
T
N
x
R
T
x
H
R
x
T
R
x
M
V
x
I
K
x
H
Y
 
E
N
 
Q
V
 
I
R
 
T
E
 
R
M
 
L
M
 
F
K
 
H
F
 
A
M
 
F
P
 
R
V
 
R
T
 
D
G
 
S
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
M
 
V
L
 
M
Q
 
C
T
 
G
A
 
I
V
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
A
F
 
F
Y
|
Y
P
 
-
A
 
-
Y
 
H
D
 
D
L
 
S
L
 
L
-
 
D
A
 
V
N
 
N
G
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
H
V
 
R
H
 
E
K
 
I
M
 
A
S
 
A
V
x
F
R
|
R
I
 
L
I
 
L
A
 
S
R
x
K
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
A
M
 
M
W
 
C
E
 
Y
H
 
K
I
 
Y
R
 
S
N
 
I
G
 
G
N
 
Q
D
 
P
P
 
F
V
 
V
P
 
Y
P
 
P
R
 
R
D
 
N
D
 
D
L
 
L
T
 
S
H
 
Y
A
 
A
E
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
M
 
M
L
 
M
K
 
F
G
 
S
K
 
T
-
 
P
-
 
C
-
 
E
-
 
P
-
 
Y
Q
 
E
P
 
V
D
 
N
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
E
R
 
R
I
 
A
L
 
M
D
 
D
V
 
R
C
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
E
I
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
G
A
 
A
S
 
N
P
 
P
Y
 
F
G
 
A
V
 
C
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
A
T
 
S
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
A
V
 
L
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
S
D
 
S
A
 
V
K
 
K
N
 
H
V
 
I
D
 
P
R
 
E
I
 
F
I
 
F
D
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
R
A
 
A
R
 
K
K
 
D
E
 
K
-
 
N
-
 
D
-
 
S
-
 
F
K
 
R
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
 
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
M
Q
 
R
G
 
E
L
 
T
M
 
C
D
 
H
R
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
T
K
 
K
H
 
D
S
 
D
R
 
-
L
 
L
F
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
L
E
 
E
K
 
N
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
N
E
 
D
R
 
P
R
 
Y
L
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
G
 
K
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
K
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
S
D
 
S
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
V
I
 
I
F
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
T
A
 
V
G
 
G
W
 
W
L
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
W
R
 
S
E
 
E
Q
 
M
L
 
H
S
 
S
D
 
D
N
 
G
-
 
M
R
 
K
I
 
I
F
 
A
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
E
Q
 
K
R
 
R
E
 
D
Y
 
F

P9WPD5 Citrate synthase 1; EC 2.3.3.16 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 11:388/392 of query aligns to 48:431/431 of P9WPD5

query
sites
P9WPD5
G
 
G
L
 
F
E
 
A
G
 
N
V
 
T
P
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
K
S
 
S
N
 
S
I
 
I
S
 
T
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
R
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
I
 
I
E
 
D
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
K
S
 
S
T
 
T
F
 
F
E
 
I
E
 
E
T
 
V
A
 
C
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
Y
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
D
A
 
T
A
 
D
A
 
Q
L
 
L
E
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
T
R
 
G
A
 
R
M
 
I
R
 
Q
N
 
R
T
 
H
R
 
T
R
 
M
V
 
L
K
 
H
Y
 
E
N
 
D
V
 
L
R
 
K
E
 
R
M
 
F
M
 
F
K
 
D
F
 
G
M
 
F
P
 
P
V
 
R
T
 
N
G
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
P
M
 
V
L
 
L
Q
 
S
T
 
S
A
 
V
V
 
V
A
 
N
S
 
A
L
 
L
G
 
S
M
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
P
 
Q
-
 
D
A
 
A
Y
 
L
D
 
D
L
 
P
L
 
M
A
 
D
N
 
N
G
 
G
P
 
Q
R
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
V
 
V
H
 
E
K
 
L
M
 
S
S
 
T
V
 
I
R
 
R
I
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
L
P
 
P
T
 
T
L
 
I
V
 
A
T
 
A
M
 
Y
W
 
A
E
 
Y
H
 
K
I
 
K
R
 
S
N
 
V
G
 
G
N
 
Q
D
 
P
P
 
F
V
 
L
P
 
Y
P
 
P
R
 
D
D
 
N
D
 
S
L
 
L
T
 
T
H
 
L
A
 
V
E
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
R
M
 
L
L
 
T
K
 
F
G
 
G
-
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
P
K
 
Y
Q
 
Q
P
 
A
D
 
D
P
 
P
L
 
E
F
 
V
A
 
V
R
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
M
C
 
L
L
 
F
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
E
I
 
Q
N
 
N
A
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
L
A
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
R
A
 
A
S
 
N
P
 
L
Y
 
F
G
 
T
V
 
S
I
 
I
A
 
S
G
 
G
A
 
G
I
 
I
G
 
N
T
 
A
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
Q
K
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
M
 
M
L
 
L
M
 
E
E
 
G
I
 
I
G
 
R
D
 
D
A
 
S
K
 
G
N
 
D
V
 
D
D
 
V
R
 
S
I
 
E
I
 
F
D
 
V
A
 
R
R
 
K
L
 
V
A
 
K
R
 
N
K
 
R
E
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
K
 
K
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
 
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
R
I
 
I
L
 
V
Q
 
K
G
 
E
L
 
Q
M
 
A
D
 
D
R
x
K
L
 
I
A
 
L
E
 
A
Q
 
K
R
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
D
H
 
D
S
 
S
R
 
-
L
 
L
F
 
L
E
 
G
T
 
I
A
 
A
M
 
K
A
 
E
V
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
T
E
 
D
R
 
D
R
 
Y
L
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
K
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
T
G
 
G
V
 
L
L
 
I
Y
 
Y
Y
 
R
E
 
A
M
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
P
T
 
T
D
 
R
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
A
M
 
L
A
 
G
R
 
R
S
 
L
A
 
P
G
 
G
W
 
W
L
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
W
R
 
R
E
 
E
-
 
M
-
 
H
Q
 
D
L
 
E
S
 
G
D
 
D
N
 
S
R
 
K
I
 
I
F
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
T
Q
 
E
R
 
R
E
 
D
Y
 
Y
V
 
V
P
 
T
L
 
I
E
 
D
R
 
A
R
 
R

3msuA Crystal structure of citrate synthase from francisella tularensis
38% identity, 96% coverage: 8:382/392 of query aligns to 50:415/415 of 3msuA

query
sites
3msuA
Y
 
Y
L
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
F
E
 
M
G
 
S
V
 
T
P
 
A
A
 
A
T
 
C
R
 
E
S
 
S
N
 
K
I
 
I
S
 
T
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
G
A
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
E
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
I
 
I
E
 
E
T
 
E
L
 
W
A
 
T
E
 
Q
H
 
K
S
 
S
T
 
N
F
x
Y
E
x
R
E
 
T
T
 
L
A
 
C
L
 
Y
L
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
Y
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
D
A
 
E
A
 
Q
L
 
V
E
 
K
E
 
S
F
 
F
D
x
R
R
 
Q
A
 
E
M
 
I
R
 
I
N
 
N
T
 
K
R
 
M
R
 
P
V
 
V
K
x
C
Y
 
E
N
x
H
V
 
V
R
 
K
E
 
A
M
 
A
M
 
I
K
 
A
F
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
Q
T
 
H
G
 
T
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
S
M
 
S
L
 
L
Q
 
I
T
 
A
A
 
G
V
 
V
A
 
N
S
 
V
L
 
L
G
 
-
M
 
-
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
A
Y
 
A
D
 
E
L
 
H
L
 
I
A
 
H
N
 
N
G
 
G
P
 
Q
R
 
K
S
 
E
D
 
S
L
 
Q
D
 
D
Y
 
E
V
 
V
H
 
A
K
 
K
M
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
N
I
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
K
M
 
I
P
 
A
T
 
T
L
 
I
V
 
A
T
 
A
M
 
M
W
 
A
E
 
Y
H
 
R
I
 
H
R
 
N
N
 
H
G
 
G
N
 
K
D
 
K
P
 
F
V
 
L
P
 
E
P
 
P
R
 
K
D
 
M
D
 
E
L
 
Y
T
 
G
H
x
Y
A
 
A
E
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
M
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
D
K
 
E
G
 
S
K
 
Y
Q
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
E
L
 
L
F
 
H
A
 
I
R
 
K
I
 
A
L
 
M
D
|
D
V
 
T
C
 
I
L
 
F
I
 
M
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
E
I
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
T
L
 
G
A
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
G
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
I
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
T
T
 
A
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
 
A
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
S
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
S
A
 
T
K
 
E
N
 
N
V
 
I
D
 
D
R
 
K
I
 
Y
I
 
I
D
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
A
A
 
K
R
 
A
K
 
K
E
 
D
K
 
K
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
T
 
T
I
 
A
L
 
M
Q
 
K
G
 
K
L
 
N
M
 
C
D
 
E
R
 
E
L
 
I
A
 
L
E
 
A
Q
 
K
R
 
L
G
 
G
L
 
H
K
 
S
H
 
D
S
 
N
R
 
P
L
 
L
F
 
L
E
 
T
T
 
V
A
 
A
M
 
K
A
 
K
V
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
I
A
 
A
-
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
F
P
 
S
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
K
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
E
D
 
D
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
A
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
T
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
I
A
 
S
H
 
Q
W
 
W
R
 
I
E
 
E
Q
 
M
L
 
V
S
 
N
D
 
D
-
 
P
-
 
A
N
 
Q
R
 
K
I
 
I
F
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
A
R
 
T
Q
 
N
R
 
R
E
 
N
Y
 
F

3msuB Crystal structure of citrate synthase from francisella tularensis
37% identity, 96% coverage: 8:382/392 of query aligns to 50:426/426 of 3msuB

query
sites
3msuB
Y
 
Y
L
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
F
E
 
M
G
 
S
V
 
T
P
 
A
A
 
A
T
 
C
R
 
E
S
 
S
N
 
K
I
 
I
S
 
T
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
G
A
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
E
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
I
 
I
E
 
E
T
 
E
L
 
W
A
 
T
E
 
Q
H
 
K
S
 
S
T
 
N
F
x
Y
E
x
R
E
 
T
T
 
L
A
x
C
L
 
Y
L
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
Y
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
D
A
 
E
A
 
Q
L
 
V
E
 
K
E
 
S
F
 
F
D
x
R
R
 
Q
A
 
E
M
 
I
R
 
I
N
 
N
T
 
K
R
 
M
R
 
P
V
 
V
K
 
C
Y
 
E
N
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
A
M
 
A
M
 
I
K
 
A
F
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
Q
T
 
H
G
 
T
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
S
M
 
S
L
 
L
Q
 
I
T
 
A
A
 
G
V
 
V
A
 
N
S
 
V
L
 
L
G
 
-
M
 
-
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
A
Y
 
A
D
 
E
L
 
H
L
 
I
A
 
H
N
 
N
G
 
G
P
 
Q
R
 
K
S
 
E
D
 
S
L
 
Q
D
 
D
Y
 
E
V
 
V
H
 
A
K
 
K
M
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
N
I
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
K
M
 
I
P
 
A
T
 
T
L
 
I
V
 
A
T
 
A
M
 
M
W
 
A
E
 
Y
H
 
R
I
 
H
R
 
N
N
 
H
G
 
G
N
 
K
D
 
K
P
 
F
V
 
L
P
 
E
P
 
P
R
 
K
D
 
M
D
 
E
L
 
Y
T
 
G
H
x
Y
A
 
A
E
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
M
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
D
K
 
E
G
 
S
K
 
Y
Q
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
E
L
 
L
F
 
H
A
 
I
R
 
K
I
 
A
L
 
M
D
 
D
V
 
T
C
 
I
L
 
F
I
 
M
L
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
E
I
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
R
V
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
T
L
 
G
A
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
G
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
I
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
T
T
 
A
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
L
 
A
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
K
M
 
M
L
 
L
M
 
S
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
S
A
 
T
K
 
E
N
 
N
V
 
I
D
 
D
R
 
K
I
 
Y
I
 
I
D
 
-
A
 
A
R
 
K
L
 
A
A
 
K
R
 
D
K
 
K
E
 
D
-
 
D
-
 
P
-
 
F
K
 
R
I
 
L
W
 
M
G
 
G
M
 
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
T
 
T
I
 
A
L
 
M
Q
 
K
G
 
K
L
 
N
M
 
C
D
 
E
R
 
E
L
 
I
A
 
L
E
 
A
Q
 
K
R
 
L
G
 
G
L
 
H
K
 
S
H
 
D
S
 
N
R
 
P
L
 
L
F
 
L
E
 
T
T
 
V
A
 
A
M
 
K
A
 
K
V
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
Q
E
 
D
R
 
E
R
 
F
L
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
K
V
 
L
Y
 
F
P
 
S
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
K
E
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
P
T
 
E
D
 
D
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
A
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
T
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
I
A
 
S
H
 
Q
W
 
W
R
 
I
E
 
E
Q
 
M
L
 
V
S
 
N
D
 
D
-
 
P
-
 
A
N
 
Q
R
 
K
I
 
I
F
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
R
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
A
R
 
T
Q
 
N
R
 
R
E
 
N
Y
 
F

1a59A Cold-active citrate synthase (see paper)
36% identity, 96% coverage: 6:381/392 of query aligns to 2:375/377 of 1a59A

query
sites
1a59A
P
 
P
E
 
T
Y
 
I
L
 
H
P
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
A
 
A
T
 
D
R
 
V
S
 
T
N
 
A
I
 
I
S
 
S
F
 
K
I
 
V
D
 
N
G
 
S
R
 
D
A
 
T
G
 
N
L
 
S
L
 
L
E
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
I
 
V
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
K
S
 
C
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
W
D
 
N
G
 
S
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
N
A
 
D
A
 
S
A
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
A
F
 
F
D
 
V
R
 
N
A
 
F
M
 
E
R
 
R
N
 
S
T
 
H
R
 
R
R
 
K
V
 
L
K
 
D
Y
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
K
E
 
G
M
 
A
M
 
I
K
 
D
F
 
L
M
 
L
P
 
S
V
 
T
T
 
A
G
 
C
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
M
 
V
L
 
A
Q
 
R
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
A
F
 
N
Y
 
H
P
 
A
-
 
R
A
 
A
Y
 
Q
D
 
D
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
S
G
 
S
P
 
P
R
 
E
S
 
A
D
 
N
L
 
L
D
 
E
Y
 
-
V
 
-
H
 
-
K
 
-
M
 
K
S
 
A
V
 
M
R
 
S
I
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
T
M
 
F
P
 
P
T
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
A
M
 
Y
W
 
D
E
 
Q
H
 
R
I
 
R
R
 
R
N
 
R
G
 
G
N
 
E
D
 
E
P
 
L
V
 
I
P
 
E
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
D
H
 
Y
A
 
S
E
 
A
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
W
M
 
M
L
 
T
K
 
F
G
 
G
K
 
E
Q
 
E
P
 
A
D
 
A
P
 
P
L
 
E
F
 
V
A
 
V
R
 
E
I
 
A
L
 
F
D
 
N
V
 
V
C
 
S
L
 
M
I
 
I
L
 
L
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
S
I
 
F
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
I
G
 
T
S
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
L
Y
 
H
G
 
S
V
 
A
I
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
H
M
 
T
L
 
F
M
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
I
A
 
R
K
 
K
N
 
D
-
 
E
-
 
S
V
 
L
D
 
D
R
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
W
I
 
M
I
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
-
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
E
 
K
K
|
K
I
x
V
W
x
M
G
|
G
M
x
F
G
|
G
H
|
H
R
|
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
G
D
 
D
P
 
S
R
|
R
A
 
V
T
 
P
I
 
T
L
 
M
Q
 
K
G
 
S
L
 
A
M
 
L
D
 
D
R
 
A
L
 
M
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
I
K
 
K
H
 
H
S
 
Y
R
 
D
L
 
R
F
 
P
E
 
E
T
 
M
A
 
-
M
 
L
A
 
G
V
 
L
E
 
Y
K
 
N
A
 
G
A
 
L
E
 
E
R
 
A
R
 
A
L
 
M
A
 
E
E
 
E
-
 
A
K
 
K
G
 
Q
V
x
I
Y
 
K
P
 
P
N
|
N
V
 
L
D
|
D
F
 
Y
Y
 
P
S
 
A
G
 
G
V
 
P
L
 
T
Y
 
Y
Y
 
N
E
 
L
M
 
M
G
 
G
I
 
F
K
 
D
T
 
T
D
 
E
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
L
F
 
F
A
 
I
M
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
I
A
 
T
G
 
G
W
 
W
L
 
T
A
 
A
H
 
H
W
 
I
R
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
S
 
A
D
 
D
N
 
N
R
 
A
I
 
L
F
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
L
Q
 
S
V
 
E
Y
 
Y
T
 
N
G
 
G
E
 
P
R
 
E
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q

O34002 2-methylcitrate synthase; 2-MCS; MCS; Citrate synthase; EC 2.3.3.5; EC 2.3.3.16 from Antarctic bacterium DS2-3R (see 2 papers)
36% identity, 96% coverage: 6:381/392 of query aligns to 4:377/379 of O34002

query
sites
O34002
P
 
P
E
 
T
Y
 
I
L
 
H
P
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
A
 
A
T
 
D
R
 
V
S
 
T
N
 
A
I
 
I
S
 
S
F
 
K
I
 
V
D
 
N
G
 
S
R
 
D
A
 
T
G
 
N
L
 
S
L
 
L
E
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
I
 
V
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
K
S
 
C
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
W
D
 
N
G
 
S
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
N
A
 
D
A
 
S
A
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
A
F
 
F
D
 
V
R
 
N
A
 
F
M
 
E
R
 
R
N
 
S
T
 
H
R
 
R
R
 
K
V
 
L
K
 
D
Y
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
K
E
 
G
M
 
A
M
 
I
K
 
D
F
 
L
M
 
L
P
 
S
V
 
T
T
 
A
G
 
C
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
M
 
V
L
 
A
Q
 
R
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
A
F
 
N
Y
 
H
P
 
A
-
 
R
A
 
A
Y
 
Q
D
 
D
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
S
G
 
S
P
 
P
R
 
E
S
 
A
D
 
N
L
 
L
D
 
E
Y
 
-
V
 
-
H
 
-
K
 
-
M
 
K
S
 
A
V
 
M
R
 
S
I
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
T
M
 
F
P
 
P
T
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
A
M
 
Y
W
 
D
E
 
Q
H
 
R
I
 
R
R
 
R
N
 
R
G
 
G
N
 
E
D
 
E
P
 
L
V
 
I
P
 
E
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
D
H
 
Y
A
 
S
E
 
A
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
W
M
 
M
L
 
T
K
 
F
G
 
G
K
 
E
Q
 
E
P
 
A
D
 
A
P
 
P
L
 
E
F
 
V
A
 
V
R
 
E
I
 
A
L
 
F
D
 
N
V
 
V
C
 
S
L
 
M
I
 
I
L
 
L
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
S
I
 
F
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
I
G
 
T
S
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
L
Y
 
H
G
 
S
V
 
A
I
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
H
M
 
T
L
 
F
M
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
I
A
 
R
K
 
K
N
 
D
-
 
E
-
 
S
V
 
L
D
 
D
R
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
W
I
 
M
I
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
-
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
E
 
K
K
|
K
I
x
V
W
x
M
G
|
G
M
x
F
G
 
G
H
|
H
R
 
R
E
 
V
Y
 
Y
K
 
K
T
 
N
K
 
G
D
 
D
P
 
S
R
|
R
A
 
V
T
 
P
I
 
T
L
 
M
Q
 
K
G
 
S
L
 
A
M
 
L
D
 
D
R
 
A
L
 
M
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
I
K
 
K
H
 
H
S
 
Y
R
 
D
L
 
R
F
 
P
E
 
E
T
 
M
A
 
-
M
 
L
A
 
G
V
 
L
E
 
Y
K
 
N
A
 
G
A
 
L
E
 
E
R
 
A
R
 
A
L
 
M
A
 
E
E
 
E
-
 
A
K
 
K
G
 
Q
V
 
I
Y
 
K
P
 
P
N
 
N
V
 
L
D
|
D
F
 
Y
Y
 
P
S
 
A
G
 
G
V
 
P
L
 
T
Y
 
Y
Y
 
N
E
 
L
M
 
M
G
 
G
I
 
F
K
 
D
T
 
T
D
 
E
L
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
L
F
 
F
A
 
I
M
 
A
A
 
A
R
|
R
S
 
I
A
 
T
G
 
G
W
 
W
L
 
T
A
 
A
H
 
H
W
 
I
R
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
S
 
A
D
 
D
N
 
N
R
 
A
I
 
L
F
 
I
R
 
R
P
 
P
T
 
L
Q
 
S
V
 
E
Y
 
Y
T
 
N
G
 
G
E
 
P
R
 
E
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_038020048.1 NCBI__GCF_000423825.1:WP_038020048.1
MQDKLPEYLPGLEGVPATRSNISFIDGRAGLLEYRGFPIETLAEHSTFEETALLLLDGQL
PTAAALEEFDRAMRNTRRVKYNVREMMKFMPVTGHPMDMLQTAVASLGMFYPAYDLLANG
PRSDLDYVHKMSVRIIARMPTLVTMWEHIRNGNDPVPPRDDLTHAENFLYMLKGKQPDPL
FARILDVCLILHAEHTINASTFAVLVAGSTLASPYGVIAGAIGTLSGPLHGGANEKVVEM
LMEIGDAKNVDRIIDARLARKEKIWGMGHREYKTKDPRATILQGLMDRLAEQRGLKHSRL
FETAMAVEKAAERRLAEKGVYPNVDFYSGVLYYEMGIKTDLFTPIFAMARSAGWLAHWRE
QLSDNRIFRPTQVYTGERQREYVPLERRGAEA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory