SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_038023268.1 NCBI__GCF_000757425.2:WP_038023268.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4mcaA Crystal structure of glycerol dehydrogenase from serratia to 1.9a
33% identity, 99% coverage: 4:355/356 of query aligns to 5:358/367 of 4mcaA

query
sites
4mcaA
I
 
I
K
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
G
G
 
K
Y
 
Y
F
 
I
Q
 
Q
E
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
A
R
 
L
T
 
A
Q
 
A
T
 
V
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
A
K
 
K
A
 
S
F
 
L
S
 
A
S
 
D
E
x
H
V
 
Y
R
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
F
A
 
V
W
 
M
K
 
K
A
 
L
V
 
A
N
 
G
P
 
D
E
 
T
L
 
L
S
 
M
H
 
G
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
E
 
Q
Q
 
H
G
 
G
I
 
V
R
 
K
W
 
H
Q
 
H
L
 
A
E
 
A
Y
 
L
L
 
F
N
 
N
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
C
Q
 
H
Q
 
K
A
 
E
I
 
I
D
 
D
T
 
R
L
 
L
Q
 
G
Q
 
R
N
 
E
L
 
L
L
 
K
A
 
A
Q
 
H
G
 
G
A
x
C
G
 
R
V
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
I
G
 
-
A
 
A
A
 
H
V
 
Y
P
 
Q
E
 
Q
V
 
L
K
 
P
V
 
V
V
 
V
N
 
L
M
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
 
D
A
 
A
A
 
P
W
 
T
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
A
R
 
E
S
 
Y
Q
 
L
L
 
I
L
 
Y
P
 
P
A
 
R
M
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
M
D
 
D
S
 
V
E
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
K
S
 
A
D
 
P
V
 
V
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
M
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
T
L
 
Y
F
 
F
E
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
C
F
 
F
R
 
D
P
 
A
Y
 
Q
Q
 
A
L
 
T
N
 
S
N
 
M
P
 
A
D
 
G
N
 
G
L
 
K
S
 
S
L
 
T
Q
 
L
L
 
A
K
 
A
I
 
L
L
 
S
P
 
L
A
 
A
Q
 
R
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
D
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
A
Y
 
E
G
 
G
D
 
V
Q
 
K
A
 
A
I
 
K
V
 
L
D
 
A
N
 
V
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
E
K
 
R
V
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
Y
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
I
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
S
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
I
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
F
T
 
T
H
 
V
Q
 
L
P
 
E
E
 
E
L
 
C
H
 
H
H
 
H
W
 
L
L
 
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
S
 
L
L
 
V
I
 
L
E
 
Q
N
 
N
N
 
S
G
 
P
Q
 
M
A
 
A
D
 
Q
A
 
I
E
 
E
L
 
T
V
 
V
-
 
L
E
 
A
L
 
F
L
 
C
Q
 
H
R
 
R
Y
 
I
S
 
G
A
 
L
P
 
P
L
 
I
K
 
T
L
 
L
P
 
A
A
 
E
F
 
M
T
 
G
E
 
V
D
 
S
R
 
G
K
 
D
A
 
A
V
 
V
-
 
E
-
 
K
I
 
I
R
 
M
T
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
Q
A
 
A
V
 
S
R
 
C
F
 
A
P
 
A
E
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
I
A
 
H
M
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
F
E
 
K
I
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
V
E
 
Q
K
 
A
A
 
A
F
 
I
L
 
L
L
 
T
A
 
A
D
 
D
T
 
R
L
 
L

8gobA Crystal structure of glycerol dehydrogenase in the presence of NAD+ (see paper)
33% identity, 98% coverage: 4:353/356 of query aligns to 5:356/367 of 8gobA

query
sites
8gobA
I
 
I
K
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
G
G
 
K
Y
 
Y
F
 
I
Q
 
Q
E
 
G
P
 
A
G
 
D
L
 
V
R
 
I
T
 
N
Q
 
R
T
 
L
G
 
G
S
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
P
F
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
R
V
 
W
R
 
L
I
 
V
I
 
V
S
 
G
S
x
D
P
 
K
A
x
F
A
 
V
W
 
L
K
 
G
A
 
F
V
 
A
N
 
Q
P
 
S
E
 
T
L
 
V
S
 
E
H
 
K
S
 
S
L
 
F
E
 
K
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
V
W
 
V
Q
 
E
L
 
I
E
 
A
Y
 
P
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
D
T
 
R
L
 
L
Q
 
R
Q
 
G
N
 
I
L
 
A
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
Q
A
 
C
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
R
x
K
V
 
T
M
 
L
D
|
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
-
A
 
A
A
 
H
V
 
F
P
 
M
E
 
G
V
 
V
K
 
P
V
 
V
V
 
A
N
 
I
M
 
A
P
 
P
T
|
T
L
x
I
A
 
A
A
x
S
T
|
T
C
x
D
A
|
A
A
 
P
W
 
C
S
|
S
P
 
A
V
x
L
S
 
S
I
x
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
T
D
 
D
Q
 
E
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
D
R
 
R
S
 
Y
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
N
M
 
N
P
 
P
E
 
N
L
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
G
S
x
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
A
Y
 
C
Q
 
S
L
 
R
N
 
S
N
 
G
P
 
A
D
 
T
N
 
T
L
 
M
S
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
C
L
 
T
Q
 
Q
L
 
A
K
 
A
I
 
L
L
 
A
P
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
N
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
E
Y
 
E
G
 
G
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
V
 
L
D
 
A
N
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
Y
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
V
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
A
Q
 
I
P
 
P
E
 
D
L
 
A
H
 
H
H
 
H
W
 
Y
L
 
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
T
Q
 
Q
S
 
L
L
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
N
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
D
 
P
A
 
V
E
 
E
L
 
E
V
 
I
E
 
E
L
 
T
L
 
V
Q
 
A
R
 
A
Y
 
L
S
 
S
A
 
H
P
 
A
L
 
V
K
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
D
F
 
I
T
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
V
K
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
M
R
 
R
T
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
C
F
 
A
P
 
E
E
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
I
A
 
H
M
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
G
E
 
G
I
 
A
S
 
T
P
 
P
A
 
D
S
 
Q
L
 
V
E
 
Y
K
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D

8goaA Crystal structure of glycerol dehydrogenase in the absence of NAD+ (see paper)
33% identity, 98% coverage: 4:353/356 of query aligns to 5:356/367 of 8goaA

query
sites
8goaA
I
 
I
K
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
G
G
 
K
Y
 
Y
F
 
I
Q
 
Q
E
 
G
P
 
A
G
 
D
L
 
V
R
 
I
T
 
N
Q
 
R
T
 
L
G
 
G
S
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
P
F
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
R
V
 
W
R
 
L
I
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
D
P
 
K
A
 
F
A
 
V
W
 
L
K
 
G
A
 
F
V
 
A
N
 
Q
P
 
S
E
 
T
L
 
V
S
 
E
H
 
K
S
 
S
L
 
F
E
 
K
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
V
W
 
V
Q
 
E
L
 
I
E
 
A
Y
 
P
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
D
T
 
R
L
 
L
Q
 
R
Q
 
G
N
 
I
L
 
A
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
Q
A
 
C
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
-
A
 
A
A
 
H
V
 
F
P
 
M
E
 
G
V
 
V
K
 
P
V
 
V
V
 
A
N
 
I
M
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
 
D
A
 
A
A
 
P
W
 
C
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
Q
 
E
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
D
R
 
R
S
 
Y
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
N
M
 
N
P
 
P
E
 
N
L
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
G
S
 
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
A
Y
 
C
Q
 
S
L
 
R
N
 
S
N
 
G
P
 
A
D
 
T
N
 
T
L
 
M
S
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
C
L
 
T
Q
 
Q
L
 
A
K
 
A
I
 
L
L
 
A
P
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
N
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
E
Y
 
E
G
 
G
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
V
 
L
D
 
A
N
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
Y
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
V
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
A
Q
 
I
P
 
P
E
 
D
L
 
A
H
 
H
H
 
H
W
 
Y
L
 
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
T
Q
 
Q
S
 
L
L
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
N
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
D
 
P
A
 
V
E
 
E
L
 
E
V
 
I
E
 
E
L
 
T
L
 
V
Q
 
A
R
 
A
Y
 
L
S
 
S
A
 
H
P
 
A
L
 
V
K
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
D
F
 
I
T
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
V
K
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
M
R
 
R
T
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
C
F
 
A
P
 
E
E
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
I
A
 
H
M
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
G
E
 
G
I
 
A
S
 
T
P
 
P
A
 
D
S
 
Q
L
 
V
E
 
Y
K
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D

5zxlA Structure of glda from e.Coli (see paper)
33% identity, 98% coverage: 4:353/356 of query aligns to 5:356/367 of 5zxlA

query
sites
5zxlA
I
 
I
K
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
G
G
 
K
Y
 
Y
F
 
I
Q
 
Q
E
 
G
P
 
A
G
 
D
L
 
V
R
 
I
T
 
N
Q
 
R
T
 
L
G
 
G
S
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
P
F
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
R
V
 
W
R
 
L
I
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
D
P
 
K
A
 
F
A
 
V
W
 
L
K
 
G
A
 
F
V
 
A
N
 
Q
P
 
S
E
 
T
L
 
V
S
 
E
H
 
K
S
 
S
L
 
F
E
 
K
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
V
W
 
V
Q
 
E
L
 
I
E
 
A
Y
 
P
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
D
T
 
R
L
 
L
Q
 
R
Q
 
G
N
 
I
L
 
A
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
Q
A
 
C
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
-
A
 
A
A
 
H
V
 
F
P
 
M
E
 
G
V
 
V
K
 
P
V
 
V
V
 
A
N
 
I
M
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
x
D
A
 
A
A
 
P
W
 
C
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
Q
 
E
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
D
R
 
R
S
 
Y
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
N
M
 
N
P
 
P
E
 
N
L
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
G
S
 
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
A
Y
 
C
Q
 
S
L
 
R
N
 
S
N
 
G
P
 
A
D
 
T
N
 
T
L
 
M
S
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
C
L
 
T
Q
 
Q
L
 
A
K
 
A
I
 
L
L
 
A
P
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
N
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
E
Y
 
E
G
 
G
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
V
 
L
D
 
A
N
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
Y
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
S
 
G
N
x
F
S
 
E
V
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
V
H
|
H
N
 
N
R
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
A
Q
 
I
P
 
P
E
 
D
L
 
A
H
 
H
H
 
H
W
 
Y
L
 
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
T
Q
 
Q
S
 
L
L
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
N
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
D
 
P
A
 
V
E
 
E
L
 
E
V
 
I
E
 
E
L
 
T
L
 
V
Q
 
A
R
 
A
Y
 
L
S
 
S
A
 
H
P
 
A
L
 
V
K
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
D
F
 
I
T
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
V
K
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
M
R
 
R
T
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
C
F
 
A
P
 
E
E
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
I
A
 
H
M
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
G
E
 
G
I
 
A
S
 
T
P
 
P
A
 
D
S
 
Q
L
 
V
E
 
Y
K
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D

P0A9S5 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; (R)-aminopropanol dehydrogenase; 1,2-propanediol dehydrogenase; D-1-amino-2-propanol oxidoreductase; EC 1.1.1.6; EC 1.1.1.75 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 4:353/356 of query aligns to 5:356/367 of P0A9S5

query
sites
P0A9S5
I
 
I
K
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
G
G
 
K
Y
 
Y
F
 
I
Q
 
Q
E
 
G
P
 
A
G
 
D
L
 
V
R
 
I
T
 
N
Q
 
R
T
 
L
G
 
G
S
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
P
F
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
R
V
 
W
R
 
L
I
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
D
P
 
K
A
 
F
A
 
V
W
 
L
K
 
G
A
 
F
V
 
A
N
 
Q
P
 
S
E
 
T
L
 
V
S
 
E
H
 
K
S
 
S
L
 
F
E
 
K
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
V
W
 
V
Q
 
E
L
 
I
E
 
A
Y
 
P
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
D
T
 
R
L
 
L
Q
 
R
Q
 
G
N
 
I
L
 
A
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
Q
A
 
C
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
-
A
 
A
A
 
H
V
 
F
P
 
M
E
 
G
V
 
V
K
 
P
V
 
V
V
 
A
N
 
I
M
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
x
D
A
 
A
A
 
P
W
 
C
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
Q
 
E
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
D
R
 
R
S
 
Y
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
N
M
 
N
P
 
P
E
 
N
L
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
G
S
 
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
A
Y
 
C
Q
 
S
L
 
R
N
 
S
N
 
G
P
 
A
D
 
T
N
 
T
L
 
M
S
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
C
L
 
T
Q
 
Q
L
 
A
K
 
A
I
 
L
L
 
A
P
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
N
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
E
Y
 
E
G
 
G
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
V
 
L
D
 
A
N
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
Y
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
V
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
A
Q
 
I
P
 
P
E
 
D
L
 
A
H
 
H
H
 
H
W
 
Y
L
 
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
T
Q
 
Q
S
 
L
L
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
N
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
D
 
P
A
 
V
E
 
E
L
 
E
V
 
I
E
 
E
L
 
T
L
 
V
Q
 
A
R
 
A
Y
 
L
S
 
S
A
 
H
P
 
A
L
 
V
K
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
D
F
 
I
T
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
V
K
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
M
R
 
R
T
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
C
F
 
A
P
 
E
E
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
I
A
 
H
M
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
G
E
 
G
I
 
A
S
 
T
P
 
P
A
 
D
S
 
Q
L
 
V
E
 
Y
K
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D

8k1hA Crystal structure of ethylene glycol-bound glycerol dehydrogenase from klebsiella pneumoniae
31% identity, 98% coverage: 4:353/356 of query aligns to 5:356/367 of 8k1hA

query
sites
8k1hA
I
 
I
K
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
G
G
 
K
Y
 
Y
F
 
I
Q
 
Q
E
 
G
P
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
I
T
 
K
Q
 
R
T
 
L
G
 
G
S
 
D
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
P
F
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
R
V
 
W
R
 
L
I
 
V
I
 
V
S
 
G
S
x
D
P
 
K
A
x
F
A
 
V
W
 
L
K
 
G
A
 
F
V
 
A
N
 
E
P
 
E
E
 
M
L
 
L
S
 
R
H
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
A
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
A
W
 
A
Q
 
E
L
 
I
E
 
A
Y
 
P
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
H
Q
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
N
T
 
R
L
 
L
Q
 
R
Q
 
D
N
 
I
L
 
A
L
 
G
A
 
N
Q
 
A
G
 
K
A
 
C
G
 
T
V
 
A
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
R
x
K
V
 
T
M
 
L
D
|
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
-
A
 
A
A
 
H
V
 
F
P
 
M
E
 
N
V
 
V
K
 
P
V
 
V
V
 
A
N
 
I
M
 
A
P
 
P
T
|
T
L
x
I
A
 
A
A
 
S
T
|
T
C
 
D
A
|
A
A
 
P
W
 
C
S
|
S
P
 
A
V
x
L
S
 
S
I
x
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
T
D
 
D
Q
 
E
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
D
R
 
S
S
 
Y
Q
 
L
L
 
M
L
 
L
P
 
P
A
 
R
M
 
N
P
 
P
E
 
N
L
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
Q
V
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
G
S
 
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
A
Y
 
C
Q
 
S
L
 
R
N
 
S
N
 
G
P
 
A
D
 
T
N
 
T
L
 
M
S
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
C
L
 
T
Q
 
Q
L
 
A
K
 
A
I
 
L
L
 
A
P
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
N
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
E
Y
 
E
G
 
G
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
V
 
L
D
 
A
N
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
Y
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
I
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
M
T
 
T
H
 
A
Q
 
I
P
 
P
E
 
D
L
 
A
H
 
H
H
 
H
W
 
Y
L
 
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
T
Q
 
Q
S
 
L
L
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
N
 
A
G
 
P
Q
 
V
A
 
D
D
 
E
A
 
I
E
 
E
L
 
T
V
 
V
-
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
C
Q
 
H
R
 
S
Y
 
V
S
 
G
A
 
L
P
 
P
L
 
I
K
 
T
L
 
L
P
 
A
A
 
Q
F
 
L
-
 
D
-
 
I
T
 
K
E
 
G
D
 
D
R
 
I
K
 
P
A
 
T
V
 
K
I
 
M
R
 
R
T
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
C
F
 
A
P
 
E
E
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
I
A
 
H
M
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
G
E
 
G
I
 
V
S
 
D
P
 
S
A
 
D
S
 
Q
L
 
V
E
 
Y
K
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D

8k1gA Crystal structure of ethylene glycol-bound glycerol dehydrogenase from klebsiella pneumoniae
31% identity, 98% coverage: 4:353/356 of query aligns to 5:356/367 of 8k1gA

query
sites
8k1gA
I
 
I
K
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
G
G
 
K
Y
 
Y
F
 
I
Q
 
Q
E
 
G
P
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
I
T
 
K
Q
 
R
T
 
L
G
 
G
S
 
D
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
P
F
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
R
V
 
W
R
 
L
I
 
V
I
 
V
S
 
G
S
 
D
P
 
K
A
 
F
A
 
V
W
 
L
K
 
G
A
 
F
V
 
A
N
 
E
P
 
E
E
 
M
L
 
L
S
 
R
H
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
A
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
A
W
 
A
Q
 
E
L
 
I
E
 
A
Y
 
P
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
H
Q
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
N
T
 
R
L
 
L
Q
 
R
Q
 
D
N
 
I
L
 
A
L
 
G
A
 
N
Q
 
A
G
 
K
A
 
C
G
 
T
V
 
A
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
-
A
 
A
A
 
H
V
 
F
P
 
M
E
 
N
V
 
V
K
 
P
V
 
V
V
 
A
N
 
I
M
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
x
D
A
 
A
A
 
P
W
 
C
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
Q
 
E
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
D
R
 
S
S
 
Y
Q
 
L
L
 
M
L
 
L
P
 
P
A
 
R
M
 
N
P
 
P
E
 
N
L
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
Q
V
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
G
S
 
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
A
Y
 
C
Q
 
S
L
 
R
N
 
S
N
 
G
P
 
A
D
 
T
N
 
T
L
 
M
S
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
C
L
 
T
Q
 
Q
L
 
A
K
 
A
I
 
L
L
 
A
P
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
N
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
E
Y
 
E
G
 
G
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
V
 
L
D
 
A
N
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
Y
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
I
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
M
T
 
T
H
 
A
Q
 
I
P
 
P
E
 
D
L
 
A
H
 
H
H
 
H
W
 
Y
L
 
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
T
Q
 
Q
S
 
L
L
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
N
 
A
G
 
P
Q
 
V
A
 
D
D
 
E
A
 
I
E
 
E
L
 
T
V
 
V
-
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
C
Q
 
H
R
 
S
Y
 
V
S
 
G
A
 
L
P
 
P
L
 
I
K
 
T
L
 
L
P
 
A
A
 
Q
F
 
L
-
 
D
-
 
I
T
 
K
E
 
G
D
 
D
R
 
I
K
 
P
A
 
T
V
 
K
I
 
M
R
 
R
T
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
C
F
 
A
P
 
E
E
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
I
A
 
H
M
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
G
E
 
G
I
 
V
S
 
D
P
 
S
A
 
D
S
 
Q
L
 
V
E
 
Y
K
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D

5xn8A Structure of glycerol dehydrogenase crystallised as a contaminant
31% identity, 99% coverage: 4:355/356 of query aligns to 5:358/365 of 5xn8A

query
sites
5xn8A
I
 
I
K
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
G
G
 
K
Y
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
E
 
G
P
 
P
G
 
D
L
 
A
R
 
S
T
 
T
Q
 
L
T
 
F
G
 
G
S
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
K
A
 
N
F
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
S
V
 
F
R
 
F
I
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
F
A
 
V
W
 
M
K
 
K
A
 
L
V
 
A
N
 
G
P
 
D
E
 
K
L
 
V
S
 
L
H
 
N
S
 
G
L
 
L
E
 
H
E
 
S
Q
 
H
G
 
D
I
 
I
R
 
S
W
 
L
Q
 
H
L
 
A
E
 
E
Y
 
R
L
 
F
N
 
N
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
H
Q
 
V
A
 
E
I
 
I
D
 
R
T
 
R
L
 
L
Q
 
I
Q
 
A
N
 
I
L
 
L
L
 
K
A
 
Q
Q
 
H
G
 
G
A
 
C
G
 
R
V
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
-
A
 
Y
V
 
Y
P
 
Q
E
 
K
V
 
L
K
 
P
V
 
V
V
 
V
N
 
V
M
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
 
D
A
 
A
A
 
P
W
 
T
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
E
Q
 
A
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
E
R
 
E
S
 
Y
Q
 
L
L
 
I
L
 
Y
P
 
P
A
 
K
M
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
M
D
 
D
S
 
T
E
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
K
S
 
A
D
 
P
V
 
V
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
V
A
 
S
G
 
G
M
 
M
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
K
P
 
A
Y
 
C
Q
 
Y
L
 
D
N
 
A
N
 
R
P
 
A
D
 
T
N
 
S
L
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
Q
S
 
S
L
 
T
Q
 
E
L
 
A
K
 
A
I
 
L
L
 
S
P
 
L
A
 
A
Q
 
R
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
D
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
A
Y
 
E
G
 
G
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
I
 
R
V
 
L
D
 
A
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
R
V
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
Y
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
I
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
S
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
I
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
F
T
 
T
H
 
I
Q
 
L
P
 
E
E
 
E
L
 
C
H
 
H
H
 
H
W
 
L
L
 
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
S
 
L
L
 
V
I
 
L
E
 
Q
N
 
N
N
 
S
G
 
P
Q
 
M
A
 
E
D
 
E
A
 
I
E
 
E
L
 
T
V
 
V
-
 
L
E
 
G
L
 
F
L
 
C
Q
 
E
R
 
K
Y
 
V
S
 
G
A
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
T
L
 
L
P
 
A
-
 
Q
-
 
M
A
 
G
F
 
V
T
 
K
E
 
E
D
 
G
R
 
I
K
 
D
A
 
D
V
 
K
I
 
I
R
 
A
T
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
K
A
 
A
V
 
T
R
 
C
F
 
A
P
 
E
E
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
I
A
 
H
M
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
F
E
 
A
I
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
E
S
 
Q
L
 
V
E
 
H
K
 
A
A
 
A
F
 
I
L
 
L
L
 
T
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
L

P32816 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; GlyDH; EC 1.1.1.6 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
32% identity, 87% coverage: 6:316/356 of query aligns to 9:316/370 of P32816

query
sites
P32816
S
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
K
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
E
 
G
P
 
K
G
 
N
L
 
V
R
 
I
T
 
T
Q
 
K
T
 
I
G
 
A
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E
A
 
G
F
 
I
S
 
G
S
 
N
E
 
K
V
 
T
R
 
V
I
 
V
I
 
I
S
 
A
S
x
D
P
 
E
A
 
I
A
 
V
W
 
W
K
 
K
A
 
I
V
 
A
N
 
G
P
 
H
E
 
T
L
 
I
S
 
V
H
 
N
S
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
K
Q
 
G
G
 
N
I
 
I
R
 
A
W
 
A
Q
 
E
L
 
E
E
 
V
Y
 
V
L
 
F
N
 
S
G
 
G
E
 
E
C
 
A
T
 
S
Q
 
R
Q
 
N
A
 
E
I
 
V
D
 
E
T
 
R
L
 
I
Q
 
A
Q
 
N
N
 
I
L
 
A
L
 
R
A
 
K
Q
 
A
G
 
E
A
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
R
x
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
D
A
 
E
V
 
L
P
 
-
E
 
D
V
 
A
K
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
I
M
 
V
P
 
P
T
|
T
L
 
A
A
 
A
A
x
S
T
 
T
C
x
D
A
 
A
A
 
P
W
 
T
S
|
S
P
 
A
V
x
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
S
D
 
D
Q
 
D
G
 
G
G
 
V
H
 
F
L
 
E
R
 
S
S
 
Y
Q
 
R
L
 
F
L
 
Y
P
 
K
A
 
K
M
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
N
S
 
A
D
 
P
V
 
P
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
G
M
 
I
V
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
V
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
S
Y
 
V
Q
 
I
L
 
K
N
 
S
N
 
G
P
 
G
D
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
G
Q
 
G
L
 
I
K
 
P
I
 
T
L
 
I
P
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
A
 
I
L
 
A
E
 
E
I
 
K
F
 
C
K
 
E
Q
 
Q
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
K
Y
 
Y
G
 
G
D
 
K
Q
 
L
A
 
A
I
 
Y
V
 
E
D
 
S
N
 
V
Q
 
K
A
 
A
G
 
K
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
A
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
G
N
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
F
A
 
E
T
 
S
P
 
G
G
 
G
F
 
L
-
 
A
-
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
I
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
F
T
 
T
H
 
A
-
 
L
Q
 
E
P
 
G
E
 
E
L
 
I
H
 
H
H
 
H
W
 
L
L
 
T
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
S
 
L
L
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
E
N
 
H
G
 
S
Q
 
Q
A
 
Q
D
 
E
A
 
I
E
 
E
-
 
R
L
 
Y
V
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
Y
Q
 
L
R
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
P
x
S
L
 
L
K
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
V
F
 
T
T
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
I
K
 
K

1jq5A Bacillus stearothermophilus glycerol dehydrogenase complex with NAD+ (see paper)
31% identity, 87% coverage: 6:316/356 of query aligns to 8:315/366 of 1jq5A

query
sites
1jq5A
S
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
K
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
E
 
G
P
 
K
G
 
N
L
 
V
R
 
I
T
 
T
Q
 
K
T
 
I
G
 
A
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E
A
 
G
F
 
I
S
 
G
S
 
N
E
 
K
V
 
T
R
 
V
I
 
V
I
 
I
S
 
A
S
x
D
P
 
E
A
 
I
A
 
V
W
 
W
K
 
K
A
x
I
V
 
A
N
 
G
P
 
H
E
 
T
L
 
I
S
 
V
H
 
N
S
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
K
Q
 
G
G
 
N
I
 
I
R
 
A
W
 
A
Q
 
E
L
 
E
E
 
V
Y
 
V
L
 
F
N
 
S
G
 
G
E
 
E
C
 
A
T
 
S
Q
 
R
Q
 
N
A
 
E
I
 
V
D
 
E
T
 
R
L
 
I
Q
 
A
Q
 
N
N
 
I
L
 
A
L
 
R
A
 
K
Q
 
A
G
 
E
A
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
R
x
K
V
 
T
M
 
L
D
|
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
D
A
 
E
V
 
L
P
 
-
E
 
D
V
 
A
K
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
I
M
 
V
P
 
P
T
|
T
L
 
A
A
 
A
A
x
S
T
|
T
C
x
D
A
|
A
A
 
P
W
 
T
S
|
S
P
 
A
V
x
L
S
 
S
I
x
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
S
D
 
D
Q
 
D
G
 
G
G
 
V
H
 
F
L
 
E
R
 
S
S
 
Y
Q
 
R
L
 
F
L
 
Y
P
 
K
A
 
K
M
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
N
S
x
A
D
x
P
V
 
P
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
G
M
 
I
V
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
V
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
S
Y
 
V
Q
 
I
L
 
K
N
 
S
N
 
G
P
 
G
D
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
G
Q
 
G
L
 
I
K
 
P
I
 
T
L
 
I
P
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
A
 
I
L
 
A
E
 
E
I
 
K
F
 
C
K
 
E
Q
 
Q
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
K
Y
 
Y
G
 
G
D
 
K
Q
 
L
A
 
A
I
 
Y
V
 
E
D
 
S
N
 
V
Q
 
K
A
 
A
G
 
K
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
A
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
G
N
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
F
A
 
E
T
 
S
P
 
G
G
 
G
F
 
L
-
 
A
-
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
I
H
|
H
N
 
N
R
 
G
L
 
F
T
 
T
H
 
A
-
 
L
Q
 
E
P
 
G
E
|
E
L
 
I
H
 
H
H
|
H
W
 
L
L
 
T
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
S
 
L
L
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
E
N
 
H
G
 
S
Q
 
Q
A
 
Q
D
 
E
A
 
I
E
 
E
L
 
-
V
 
-
E
 
R
L
 
Y
L
 
I
Q
 
E
R
 
L
Y
 
Y
S
 
L
A
 
C
P
 
-
L
 
L
K
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
V
F
 
T
T
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
I
K
 
K

3uhjA Crystal structure of a probable glycerol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021
28% identity, 99% coverage: 3:355/356 of query aligns to 4:353/357 of 3uhjA

query
sites
3uhjA
A
 
A
I
 
F
K
 
G
S
 
G
P
 
P
S
 
N
G
 
K
Y
 
Y
F
 
I
Q
 
Q
E
 
R
P
 
A
G
 
G
L
 
E
R
 
I
T
 
D
Q
 
K
T
 
L
G
 
A
S
 
A
Y
 
Y
L
 
L
K
 
A
A
 
P
F
 
L
S
 
G
S
 
K
E
 
R
V
 
A
R
 
L
I
 
V
I
 
L
S
 
I
S
 
D
P
 
R
A
 
V
A
 
L
W
 
F
K
 
D
A
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
E
E
 
R
L
 
I
S
 
S
H
 
L
S
 
D
L
 
I
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
W
 
-
Q
 
R
L
 
F
E
 
E
Y
 
R
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
C
Q
 
T
Q
 
S
A
 
E
I
 
I
D
 
E
T
 
R
L
 
V
Q
 
R
Q
 
K
N
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
E
Q
 
H
G
 
G
A
 
S
G
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
I
A
 
V
G
 
-
A
 
A
A
 
I
V
 
D
P
 
T
E
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
I
M
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
 
D
A
 
A
A
 
P
W
 
C
S
 
S
P
 
A
V
 
I
S
 
A
I
 
V
I
 
R
Y
 
Y
N
 
T
D
 
E
Q
 
H
G
 
G
G
 
V
H
 
Y
L
 
E
R
 
E
S
 
A
Q
 
L
L
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
R
M
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
S
E
 
A
V
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
A
S
 
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
K
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
I
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
S
Y
 
N
Q
 
I
L
 
E
N
 
S
N
 
R
P
 
T
D
 
D
N
 
N
L
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
P
S
 
A
L
 
T
Q
 
E
L
 
A
K
 
G
I
 
M
L
 
A
P
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
A
 
C
L
 
Q
E
 
D
I
 
V
F
 
L
K
 
T
Q
 
R
Y
 
D
G
 
A
D
 
V
Q
 
K
A
 
A
I
 
K
V
 
I
D
 
A
N
 
V
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
V
I
 
E
K
 
N
V
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
N
R
 
C
D
 
G
T
 
C
L
 
S
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
G
I
 
I
H
|
H
N
 
D
R
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
V
Q
 
L
P
 
E
E
 
E
L
 
V
H
 
H
H
 
G
W
 
Y
L
 
F
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
C
 
G
L
 
T
L
 
L
I
 
C
Q
 
L
S
 
L
L
 
M
I
 
L
E
 
E
N
 
N
N
 
R
G
 
D
Q
 
R
A
 
A
D
 
E
A
 
I
E
 
E
-
 
A
L
 
M
V
 
I
E
 
R
L
 
F
L
 
C
Q
 
R
R
 
S
Y
 
V
S
 
G
A
 
L
P
 
P
L
 
T
K
 
K
L
 
L
P
 
A
-
 
D
-
 
L
A
 
G
F
 
I
T
 
V
E
 
D
D
 
D
R
 
V
K
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
I
R
 
G
T
 
R
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
C
F
 
R
P
 
P
E
 
G
R
 
N
S
 
I
A
 
I
A
 
Y
M
 
A
L
 
T
P
 
P
F
 
V
E
 
T
I
 
I
S
 
T
P
 
V
A
 
P
S
 
A
L
 
V
E
 
R
K
 
D
A
 
A
F
 
I
L
 
L
L
 
A
A
 
L
D
 
D
T
 
A
L
 
F

Q9WYQ4 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; EC 1.1.1.6 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
34% identity, 71% coverage: 56:309/356 of query aligns to 56:304/364 of Q9WYQ4

query
sites
Q9WYQ4
I
 
V
R
 
R
W
 
V
Q
 
N
L
 
K
E
 
Q
Y
 
I
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
D
Q
 
E
A
 
E
I
 
I
D
 
E
T
 
R
L
 
L
Q
 
S
Q
 
-
N
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
E
A
 
T
G
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
Y
A
 
K
V
 
L
P
 
K
E
 
K
V
 
-
K
 
P
V
 
V
V
 
V
N
 
I
M
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
 
D
A
 
A
A
 
P
W
 
C
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
Q
 
N
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
K
R
 
R
S
 
Y
Q
 
L
L
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
R
M
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
E
V
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
K
S
 
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
K
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
M
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
E
P
 
S
Y
 
C
Q
 
K
L
 
Q
N
 
K
N
 
Y
P
 
A
D
 
P
N
 
N
L
 
M
S
 
T
L
 
G
Q
 
R
L
 
L
K
 
G
I
 
S
L
 
M
P
 
T
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
A
 
A
Q
 
R
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
E
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
E
Y
 
Y
G
 
G
D
 
V
Q
 
L
A
 
A
I
 
K
V
 
R
D
 
S
N
 
V
Q
 
E
A
 
E
G
 
K
V
 
S
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
K
V
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
I
H
 
H
N
 
N
R
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
V
Q
 
L
P
 
E
E
 
N
L
 
T
H
 
H
H
 
K
W
 
Y
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
I
C
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
A
Q
 
S
S
 
L
L
 
F
I
 
L
E
 
T
N
 
D
N
 
K
G
 
P
Q
 
R
A
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
K
L
 
M
V
 
I
E
 
E
L
 
E
L
 
V
Q
 
Y
R
 
S
Y
 
F
S
 
C
A
 
E
P
 
E
L
 
V
K
 
G
L
 
L
P
 
P

1kq3A Crystal structure of a glycerol dehydrogenase (tm0423) from thermotoga maritima at 1.5 a resolution (see paper)
34% identity, 71% coverage: 56:309/356 of query aligns to 57:305/364 of 1kq3A

query
sites
1kq3A
I
 
V
R
 
R
W
 
V
Q
 
N
L
 
K
E
 
Q
Y
 
I
L
 
F
N
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
T
 
S
Q
 
D
Q
 
E
A
 
E
I
 
I
D
 
E
T
 
R
L
 
L
Q
 
S
Q
 
-
N
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
E
A
 
T
G
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
Y
A
 
K
V
 
L
P
 
K
E
 
K
V
 
-
K
 
P
V
 
V
V
 
V
N
 
I
M
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
 
D
A
 
A
A
 
P
W
 
C
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
Q
 
N
G
 
G
G
 
E
H
 
F
L
 
K
R
 
R
S
 
Y
Q
 
L
L
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
R
M
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
E
V
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
K
S
 
A
D
 
P
V
 
A
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
K
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
M
V
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
F
E
 
E
F
 
A
R
 
E
P
 
S
Y
 
C
Q
 
K
L
 
Q
N
 
K
N
 
Y
P
 
A
D
 
P
N
 
N
L
 
M
S
 
T
L
 
G
Q
 
R
L
 
L
K
 
G
I
 
S
L
 
M
P
 
T
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
A
 
A
Q
 
R
Q
 
L
A
 
C
L
 
Y
E
 
E
I
 
T
F
 
L
K
 
L
Q
 
E
Y
 
Y
G
 
G
D
 
V
Q
 
L
A
 
A
I
 
K
V
 
R
D
 
S
N
 
V
Q
 
E
A
 
E
G
 
K
V
 
S
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
E
K
 
K
V
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
G
N
 
F
S
 
E
V
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
H
|
H
A
 
A
I
 
I
H
|
H
N
 
N
R
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
V
Q
 
L
P
 
E
E
 
N
L
 
T
H
 
H
H
 
K
W
 
Y
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
I
C
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
A
Q
 
S
S
 
L
L
 
F
I
 
L
E
 
T
N
 
D
N
 
K
G
 
P
Q
 
R
A
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
K
L
 
M
V
 
I
E
 
E
L
 
E
L
 
V
Q
 
Y
R
 
S
Y
 
F
S
 
C
A
 
E
P
 
E
L
 
V
K
 
G
L
 
L
P
 
P

1jqaA Bacillus stearothermophilus glycerol dehydrogenase complex with glycerol (see paper)
31% identity, 87% coverage: 6:316/356 of query aligns to 7:310/361 of 1jqaA

query
sites
1jqaA
S
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
K
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
E
 
G
P
 
K
G
 
N
L
 
V
R
 
I
T
 
T
Q
 
K
T
 
I
G
 
A
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E
A
 
G
F
 
I
S
 
G
S
 
N
E
 
K
V
 
T
R
 
V
I
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
D
P
 
E
A
 
I
A
 
V
W
 
W
K
 
K
A
 
I
V
 
A
N
 
G
P
 
H
E
 
T
L
 
I
S
 
V
H
 
N
S
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
K
Q
 
G
G
 
N
I
 
I
R
 
A
W
 
A
Q
 
E
L
 
E
E
 
V
Y
 
V
L
 
F
N
 
S
G
 
G
E
 
E
C
 
A
T
 
S
Q
 
R
Q
 
N
A
 
E
I
 
V
D
 
E
T
 
R
L
 
I
Q
 
A
Q
 
N
N
 
I
L
 
A
L
 
R
A
 
K
Q
 
A
G
 
E
A
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
D
A
 
E
V
 
L
P
 
-
E
 
D
V
 
A
K
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
I
M
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
A
A
 
A
A
 
S
T
 
T
C
x
D
A
 
A
A
 
P
W
 
T
S
 
S
P
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
V
D
 
F
Q
 
E
G
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
S
S
 
Y
Q
 
R
L
 
F
L
 
Y
P
 
K
A
 
K
M
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
E
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
A
R
 
N
S
 
A
D
 
P
V
 
P
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
G
M
 
I
V
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
L
 
W
F
 
V
E
 
E
F
 
A
R
 
R
P
 
S
Y
 
V
Q
 
I
L
 
K
N
 
S
N
 
G
P
 
G
D
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
G
Q
 
G
L
 
I
K
 
P
I
 
T
L
 
I
P
 
A
A