SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_038023314.1 NCBI__GCF_000757425.2:WP_038023314.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3efvA Crystal structure of a putative succinate-semialdehyde dehydrogenase from salmonella typhimurium lt2 with bound NAD (see paper)
66% identity, 99% coverage: 5:457/458 of query aligns to 6:458/459 of 3efvA

query
sites
3efvA
A
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
E
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Y
 
M
P
 
P
F
 
W
Q
 
A
G
 
N
S
 
A
D
 
Q
A
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
H
S
 
A
L
 
L
Q
 
S
R
 
L
S
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
G
F
 
F
A
 
K
T
 
K
W
 
W
R
 
K
V
 
M
T
 
T
P
 
S
M
 
V
E
 
A
T
 
Q
R
 
R
V
 
A
K
 
Q
V
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
D
L
 
I
A
 
G
A
 
Q
R
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
A
R
 
H
S
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
M
A
 
A
K
 
Q
M
 
C
M
 
I
T
 
T
L
 
R
E
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
K
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
V
 
V
N
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
A
Q
 
A
V
 
L
C
 
C
E
 
D
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
D
 
E
N
 
H
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
M
L
 
L
A
 
N
A
 
P
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
Q
 
L
V
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
W
 
V
Q
 
I
E
 
E
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
V
x
I
M
|
M
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
Y
 
L
W
 
W
Q
|
Q
I
 
V
L
 
L
R
|
R
G
 
G
A
 
A
A
 
V
G
 
P
M
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
S
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
K
|
K
H
 
H
A
|
A
P
 
P
N
 
N
V
 
V
M
 
T
G
 
G
C
 
C
A
 
A
T
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
A
E
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
A
S
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
T
P
 
P
E
 
A
G
 
G
T
 
V
F
 
Y
E
 
G
L
 
W
L
 
V
N
 
N
V
 
A
D
 
N
N
|
N
A
 
E
G
 
G
V
|
V
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
T
V
 
V
T
|
T
G
|
G
S
|
S
V
 
V
R
 
R
A
|
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
C
V
 
V
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
|
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
N
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
|
C
M
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
R
F
 
F
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
E
P
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
F
 
F
E
 
T
S
 
D
R
 
R
F
 
F
S
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
S
 
M
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
L
D
 
V
E
 
E
A
 
E
T
 
N
Y
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
D
 
A
T
 
S
L
 
V
N
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
L
C
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
P
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
T
E
 
P
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
A
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
E
|
E
I
 
L
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
R
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
S
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
A
T
 
T
V
 
I
W
 
F
T
 
T
A
 
A
N
 
D
E
 
D
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
A
H
 
E
F
 
M
A
 
A
D
 
A
S
 
R
L
 
L
E
 
E
T
 
C
G
 
G
A
 
G
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
S
A
 
A
S
 
S
D
 
D
P
 
A
R
 
R
V
 
V
T
 
A
I
x
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
N
 
S
H
 
H
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
E
 
E
F
 
F
C
 
C
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
W
 
W
R
 
K
N
 
N
R
 
R

4itbA Structure of bacterial enzyme in complex with cofactor and substrate (see paper)
43% identity, 98% coverage: 7:454/458 of query aligns to 4:451/453 of 4itbA

query
sites
4itbA
S
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
I
L
 
C
A
 
Q
R
 
R
Y
 
F
P
 
K
F
 
A
Q
 
L
G
 
T
S
 
P
D
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
D
S
 
A
S
 
K
L
 
L
Q
 
A
R
 
K
S
 
A
A
 
Q
S
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
Q
T
 
A
W
 
Y
R
 
R
V
 
R
T
 
T
P
 
S
M
 
F
E
 
S
T
 
Q
R
 
R
V
 
R
K
 
Q
V
 
W
L
 
L
R
 
E
A
 
N
L
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
R
R
 
D
S
 
T
E
 
S
A
 
K
L
 
F
A
 
A
K
 
E
M
 
I
M
 
M
T
 
T
L
 
T
E
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
T
I
 
H
V
 
Q
Q
 
S
A
 
A
R
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
A
N
 
E
K
 
K
C
 
S
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
C
 
C
E
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
D
 
E
N
 
H
G
 
G
P
 
E
A
 
Q
V
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
N
Q
 
E
P
 
Y
T
 
T
Q
 
E
V
 
T
E
 
Q
N
 
A
Q
 
T
Q
 
E
A
 
S
W
 
Y
Q
 
V
E
 
C
F
 
Y
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
I
I
 
L
L
 
L
A
 
A
V
|
V
M
|
M
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
Y
 
F
W
 
W
Q
 
Q
I
 
V
L
 
F
R
 
R
G
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
V
Y
 
A
I
 
V
L
 
L
K
|
K
H
 
H
A
|
A
P
x
S
N
 
N
V
 
V
M
 
P
G
 
Q
C
 
C
A
 
A
T
 
L
L
 
A
L
 
V
Q
 
E
E
 
A
V
 
I
M
 
L
N
 
E
S
 
A
V
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
Q
L
 
T
L
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
G
N
x
A
A
 
S
G
 
Q
V
|
V
S
 
E
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
N
 
K
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
T
V
 
L
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
E
R
 
P
A
|
A
G
 
G
A
 
A
A
x
S
I
 
L
A
 
A
T
 
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
E
L
 
I
K
 
K
K
 
P
T
 
T
V
 
L
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
P
 
P
F
 
F
I
 
V
V
 
V
L
 
F
A
 
P
D
 
S
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
V
A
 
G
V
 
T
A
 
V
G
 
A
R
 
R
Y
 
T
Q
 
M
N
 
N
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
S
C
|
C
M
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
R
F
 
F
I
 
I
I
 
L
E
 
H
A
 
E
P
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
L
S
 
E
R
 
K
F
 
L
S
 
H
A
 
L
A
 
K
V
 
F
Q
 
A
A
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
M
D
 
A
E
 
P
A
 
E
T
 
T
Y
 
D
L
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
A
R
 
T
Y
 
E
D
 
G
L
 
I
R
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
I
H
 
S
Q
 
R
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
D
D
 
Q
T
 
A
L
 
V
N
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
I
V
 
L
C
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
R
K
 
P
I
 
L
A
 
D
G
 
R
V
 
A
G
 
G
N
 
Y
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
T
D
 
E
V
 
I
S
 
P
E
 
P
E
 
G
M
 
A
T
 
K
A
 
I
F
 
L
R
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
L
F
|
F
G
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
M
L
 
V
T
 
F
V
 
T
A
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
L
E
 
D
H
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
I
E
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
A
W
 
W
T
 
T
A
 
N
N
 
D
E
 
P
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
D
 
Q
H
 
R
F
 
F
A
 
I
D
 
Q
S
 
E
L
 
L
E
 
D
T
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
Y
 
M
G
 
V
A
 
K
S
|
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
T
 
P
I
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
T
K
 
K
K
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
N
 
G
H
 
L
F
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
R
E
 
T
F
 
F
C
 
V
N
 
N
I
 
A
Q
 
K
T
 
T
V
 
V
W
 
W

3vz3A Structural insights into substrate and cofactor selection by sp2771 (see paper)
43% identity, 98% coverage: 7:454/458 of query aligns to 4:451/453 of 3vz3A

query
sites
3vz3A
S
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
I
L
 
C
A
 
Q
R
 
R
Y
 
F
P
 
K
F
 
A
Q
 
L
G
 
T
S
 
P
D
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
D
S
 
A
S
 
K
L
 
L
Q
 
A
R
 
K
S
 
A
A
 
Q
S
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
Q
T
 
A
W
 
Y
R
 
R
V
 
R
T
 
T
P
 
S
M
 
F
E
 
S
T
 
Q
R
 
R
V
 
R
K
 
Q
V
 
W
L
 
L
R
 
E
A
 
N
L
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
R
R
 
D
S
 
T
E
 
S
A
 
K
L
 
F
A
 
A
K
 
E
M
 
I
M
 
M
T
 
T
L
 
T
E
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
T
I
 
H
V
 
Q
Q
 
S
A
 
A
R
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
A
N
 
E
K
 
K
C
 
S
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
C
 
C
E
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
D
 
E
N
 
H
G
 
G
P
 
E
A
 
Q
V
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
N
Q
 
E
P
 
Y
T
 
T
Q
 
E
V
 
T
E
 
Q
N
 
A
Q
 
T
Q
 
E
A
 
S
W
 
Y
Q
 
V
E
 
C
F
 
Y
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
I
I
 
L
L
 
L
A
 
A
V
|
V
M
|
M
P
 
P
W
|
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
Y
 
F
W
|
W
Q
|
Q
I
 
V
L
 
F
R
|
R
G
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
V
Y
 
A
I
 
V
L
 
L
K
|
K
H
 
H
A
|
A
P
x
S
N
 
N
V
 
V
M
 
P
G
 
Q
C
 
C
A
 
A
T
 
L
L
 
A
L
 
V
Q
 
E
E
 
A
V
 
I
M
 
L
N
 
E
S
 
A
V
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
Q
L
 
T
L
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
G
N
x
A
A
 
S
G
 
Q
V
|
V
S
 
E
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
N
 
K
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
T
V
 
L
T
|
T
G
|
G
S
|
S
V
 
E
R
 
P
A
|
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
A
T
 
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
E
L
 
I
K
 
K
K
 
P
T
 
T
V
 
L
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
|
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
P
 
P
F
 
F
I
 
V
V
 
V
L
 
F
A
 
P
D
 
S
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
V
A
 
G
V
 
T
A
 
V
G
 
A
R
 
R
Y
 
T
Q
 
M
N
 
N
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
x
S
C
x
A
M
x
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
R
F
 
F
I
 
I
I
 
L
E
 
H
A
 
E
P
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
L
S
 
E
R
 
K
F
 
L
S
 
H
A
 
L
A
 
K
V
 
F
Q
 
A
A
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
M
D
 
A
E
 
P
A
 
E
T
 
T
Y
 
D
L
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
A
R
 
T
Y
 
E
D
 
G
L
 
I
R
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
I
H
 
S
Q
 
R
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
D
D
 
Q
T
 
A
L
 
V
N
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
I
V
 
L
C
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
R
K
 
P
I
 
L
A
 
D
G
 
R
V
 
A
G
 
G
N
 
Y
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
T
D
 
E
V
 
I
S
 
P
E
 
P
E
 
G
M
 
A
T
 
K
A
 
I
F
 
L
R
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
L
F
|
F
G
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
M
L
 
V
T
 
F
V
 
T
A
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
L
E
 
D
H
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
I
E
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
A
W
 
W
T
 
T
A
 
N
N
 
D
E
 
P
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
D
 
Q
H
 
R
F
 
F
A
 
I
D
 
Q
S
 
E
L
 
L
E
 
D
T
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
Y
 
M
G
 
V
A
 
K
S
|
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
T
 
P
I
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
T
K
 
K
K
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
N
 
G
H
 
L
F
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
R
E
 
T
F
 
F
C
 
V
N
 
N
I
 
A
Q
 
K
T
 
T
V
 
V
W
 
W

4ywuA Structural insight into the substrate inhibition mechanism of NADP+- dependent succinic semialdehyde dehydrogenase from streptococcus pyogenes (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:454/458 of query aligns to 4:452/455 of 4ywuA

query
sites
4ywuA
S
 
T
I
 
I
N
 
Y
P
 
P
A
 
Y
T
 
T
G
 
N
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
H
R
 
T
Y
 
F
P
 
D
F
 
N
Q
 
M
G
 
T
S
 
D
D
 
Q
A
 
G
I
 
L
E
 
A
S
 
D
S
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
R
S
 
A
A
 
H
S
 
L
A
 
L
F
 
Y
A
 
K
T
 
K
W
 
W
R
 
R
V
 
K
T
 
E
P
 
D
-
 
H
M
 
L
E
 
E
T
 
E
R
 
R
V
 
K
K
 
A
V
 
Q
L
 
L
R
 
H
A
 
Q
L
 
V
A
 
A
A
 
N
R
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
R
R
 
D
S
 
R
E
 
D
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
K
 
E
M
 
I
M
 
M
T
 
T
L
 
K
E
 
D
M
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
F
V
 
T
Q
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
G
E
 
E
V
 
V
N
 
D
K
 
L
C
 
C
A
 
A
Q
 
D
V
 
I
C
 
A
E
 
D
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
N
 
K
G
 
A
P
 
D
A
 
E
V
 
F
L
 
L
A
 
M
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
T
 
L
Q
 
E
V
 
T
E
 
D
N
 
S
Q
 
G
Q
 
Q
A
 
A
W
 
Y
Q
 
Y
E
 
L
F
 
K
R
 
Q
P
 
S
L
 
T
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
M
 
E
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
Y
 
Y
W
 
Y
Q
|
Q
I
 
I
L
 
M
R
|
R
G
 
V
A
 
F
A
 
A
G
 
P
M
 
N
L
 
F
L
 
I
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
M
I
 
V
L
 
L
K
|
K
H
 
H
A
 
A
P
 
S
N
 
I
V
 
C
M
 
P
G
 
R
C
 
S
A
 
A
T
 
Q
L
 
S
L
 
F
Q
 
E
E
 
E
V
 
L
M
 
V
N
 
L
S
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
A
P
 
E
E
 
A
G
 
G
T
 
S
F
 
I
E
 
T
L
 
N
L
 
L
N
 
F
V
 
I
D
 
S
N
 
Y
A
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
N
 
A
D
 
D
P
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
E
R
 
R
A
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
 
I
A
 
A
T
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
K
A
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
T
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
D
 
D
P
 
A
F
 
F
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
W
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
V
 
E
K
 
K
A
 
V
A
 
L
V
 
Y
A
 
F
G
 
S
R
 
R
Y
 
L
Q
 
Y
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
|
V
C
|
C
M
 
T
A
 
S
A
 
S
K
 
K
R
 
R
F
 
F
I
 
I
I
 
V
E
 
L
A
 
D
P
 
K
V
 
D
A
 
Y
A
 
D
E
 
R
F
 
F
E
 
K
S
 
E
R
 
L
F
 
L
S
 
T
A
 
K
A
 
V
V
 
F
Q
 
K
A
 
T
L
 
A
K
 
K
S
 
W
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
M
D
 
D
E
 
P
A
 
E
T
 
T
Y
 
T
L
 
L
G
 
A
P
 
P
M
 
L
A
 
S
R
 
S
Y
 
A
D
 
Q
L
 
A
R
 
K
D
 
A
E
 
D
L
 
V
H
 
L
Q
 
D
Q
 
Q
V
 
I
Q
 
K
D
 
L
T
 
A
L
 
L
N
 
D
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
V
C
 
Y
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
A
I
 
I
A
 
D
G
 
H
V
 
P
G
 
G
N
 
H
Y
 
F
Y
 
V
A
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
I
A
 
A
D
 
G
V
 
L
S
 
T
E
 
K
E
 
D
M
 
N
T
 
P
A
 
I
F
 
Y
R
 
Y
E
 
Q
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
G
A
 
E
L
 
I
T
 
Y
V
 
K
A
 
V
R
 
S
D
 
S
A
 
E
E
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
S
E
 
N
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
G
T
 
T
V
 
I
W
 
F
T
 
S
A
 
S
N
 
N
E
 
Q
A
 
E
L
 
H
A
 
A
D
 
K
H
 
A
F
 
V
A
 
A
D
 
A
S
 
K
L
 
I
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
M
V
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
S
Y
 
G
G
 
W
A
 
T
S
 
S
D
 
L
P
 
P
R
 
E
V
 
L
T
 
P
I
x
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
K
 
H
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
N
 
S
H
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
T
E
 
S
F
 
F
C
 
V
N
 
N
I
 
E
Q
 
H
T
 
L
V
 
I
W
 
Y

4ohtA Crystal structure of succinic semialdehyde dehydrogenase from streptococcus pyogenes in complex with NADP+ as the cofactor (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:454/458 of query aligns to 4:452/455 of 4ohtA

query
sites
4ohtA
S
 
T
I
 
I
N
 
Y
P
 
P
A
 
Y
T
 
T
G
 
N
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
H
R
 
T
Y
 
F
P
 
D
F
 
N
Q
 
M
G
 
T
S
 
D
D
 
Q
A
 
G
I
 
L
E
 
A
S
 
D
S
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
R
S
 
A
A
 
H
S
 
L
A
 
L
F
 
Y
A
 
K
T
 
K
W
 
W
R
 
R
V
 
K
T
 
E
P
 
D
-
 
H
M
 
L
E
 
E
T
 
E
R
 
R
V
 
K
K
 
A
V
 
Q
L
 
L
R
 
H
A
 
Q
L
 
V
A
 
A
A
 
N
R
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
R
R
 
D
S
 
R
E
 
D
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
K
 
E
M
 
I
M
 
M
T
 
T
L
 
K
E
 
D
M
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
F
V
 
T
Q
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
G
E
 
E
V
 
V
N
 
D
K
 
L
C
 
C
A
 
A
Q
 
D
V
 
I
C
 
A
E
 
D
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
N
 
K
G
 
A
P
 
D
A
 
E
V
 
F
L
 
L
A
 
M
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
T
 
L
Q
 
E
V
 
T
E
 
D
N
 
S
Q
 
G
Q
 
Q
A
 
A
W
 
Y
Q
 
Y
E
 
L
F
 
K
R
 
Q
P
 
S
L
 
T
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
V
|
V
M
x
E
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
Y
 
Y
W
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
L
 
M
R
 
R
G
 
V
A
 
F
A
 
A
G
 
P
M
 
N
L
 
F
L
 
I
A
 
V
G
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
M
I
 
V
L
 
L
K
|
K
H
|
H
A
|
A
P
x
S
N
 
I
V
 
C
M
 
P
G
 
R
C
 
S
A
 
A
T
 
Q
L
 
S
L
 
F
Q
 
E
E
 
E
V
 
L
M
 
V
N
 
L
S
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
A
P
 
E
E
 
A
G
 
G
T
 
S
F
 
I
E
 
T
L
 
N
L
 
L
N
 
F
V
 
I
D
 
S
N
x
Y
A
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
N
 
A
D
 
D
P
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
L
T
 
T
G
 
G
S
|
S
V
 
E
R
 
R
A
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
|
I
A
 
A
T
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
K
A
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
T
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
D
 
D
P
 
A
F
 
F
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
W
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
V
 
E
K
 
K
A
 
V
A
 
L
V
 
Y
A
 
F
G
 
S
R
 
R
Y
 
L
Q
 
Y
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
|
C
M
 
T
A
 
S
A
 
S
K
 
K
R
 
R
F
 
F
I
 
I
I
 
V
E
 
L
A
 
D
P
 
K
V
 
D
A
 
Y
A
 
D
E
 
R
F
 
F
E
 
K
S
 
E
R
 
L
F
 
L
S
 
T
A
 
K
A
 
V
V
 
F
Q
 
K
A
 
T
L
 
A
K
 
K
S
 
W
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
M
D
 
D
E
 
P
A
 
E
T
 
T
Y
 
T
L
 
L
G
 
A
P
 
P
M
 
L
A
 
S
R
 
S
Y
 
A
D
 
Q
L
 
A
R
 
K
D
 
A
E
 
D
L
 
V
H
 
L
Q
 
D
Q
 
Q
V
 
I
Q
 
K
D
 
L
T
 
A
L
 
L
N
 
D
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
V
C
 
Y
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
A
I
 
I
A
 
D
G
 
H
V
 
P
G
 
G
N
 
H
Y
 
F
Y
 
V
A
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
I
A
 
A
D
 
G
V
 
L
S
 
T
E
 
K
E
 
D
M
 
N
T
 
P
A
 
I
F
 
Y
R
 
Y
E
 
Q
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
G
A
 
E
L
 
I
T
 
Y
V
 
K
A
 
V
R
 
S
D
 
S
A
 
E
E
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
S
E
 
N
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
G
T
 
T
V
 
I
W
 
F
T
 
S
A
 
S
N
 
N
E
 
Q
A
 
E
L
 
H
A
 
A
D
 
K
H
 
A
F
 
V
A
 
A
D
 
A
S
 
K
L
 
I
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
M
V
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
S
Y
 
G
G
 
W
A
 
T
S
 
S
D
 
L
P
 
P
R
 
E
V
 
L
T
 
P
I
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
K
 
H
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
N
 
S
H
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
T
E
 
S
F
 
F
C
 
V
N
 
N
I
 
E
Q
 
H
T
 
L
V
 
I
W
 
Y

P25526 Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] GabD; SSDH; Glutarate-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.79; EC 1.2.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 97% coverage: 9:451/458 of query aligns to 32:476/482 of P25526

query
sites
P25526
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
G
 
G
E
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
G
R
 
S
Y
 
V
P
 
P
F
 
K
Q
 
M
G
 
G
S
 
A
D
 
D
A
 
E
I
 
T
E
 
R
S
 
A
S
 
A
L
 
I
Q
 
D
R
 
A
S
 
A
A
 
N
S
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
P
T
 
A
W
 
W
R
 
R
V
 
A
T
 
L
P
 
T
M
 
A
E
 
K
T
 
E
R
 
R
V
 
A
K
 
T
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
N
L
 
W
A
 
F
A
 
N
R
 
L
L
 
M
R
 
M
E
 
E
R
 
H
S
 
Q
E
 
D
A
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
L
M
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
G
E
 
E
V
 
I
N
 
S
K
 
Y
C
 
A
A
 
A
Q
 
S
V
 
F
C
 
I
E
 
E
W
 
W
Y
 
F
A
 
A
D
 
E
N
 
E
G
 
G
P
 
K
A
 
R
V
 
I
L
 
Y
A
 
G
A
 
D
Q
 
T
-
 
I
P
 
P
T
 
G
Q
 
H
V
 
Q
E
 
A
N
 
D
Q
 
K
Q
 
R
A
 
L
W
 
I
Q
 
V
E
 
I
F
 
K
R
 
Q
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
T
L
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
T
P
 
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
Y
 
A
W
 
A
Q
 
M
I
 
I
L
 
T
R
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
G
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
Y
 
M
I
 
V
L
 
L
K
|
K
H
x
P
A
|
A
P
x
S
N
 
Q
V
 
T
M
 
P
G
 
F
C
 
S
A
 
A
T
 
L
L
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
V
 
L
M
 
A
N
 
I
S
 
R
V
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
N
L
 
V
L
 
V
N
 
T
V
 
G
D
 
S
N
 
A
A
 
G
G
 
A
V
 
V
-
 
G
S
 
N
Q
 
E
L
 
L
I
 
T
N
 
S
D
 
N
P
 
P
R
 
L
V
 
V
A
 
R
A
 
K
V
 
L
A
 
S
V
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
R
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
A
 
M
T
 
E
Q
 
Q
A
 
C
G
 
A
A
 
K
A
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
K
T
 
V
V
 
S
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
N
D
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
S
R
 
K
Y
 
F
Q
 
R
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
C
 
C
M
 
V
A
 
C
A
 
A
K
 
N
R
 
R
F
 
L
I
 
Y
I
 
V
E
 
Q
A
 
D
P
 
G
V
 
V
A
 
Y
A
 
D
E
 
R
F
 
F
E
 
A
S
 
E
R
 
K
F
 
L
S
 
Q
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
A
 
K
L
 
L
K
 
H
S
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
N
A
 
G
T
 
V
Y
 
T
L
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
I
R
 
D
Y
 
E
D
 
K
L
 
A
R
 
V
D
 
A
E
 
K
L
 
V
H
 
E
Q
 
E
Q
 
H
V
 
I
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
L
N
 
E
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
V
V
 
V
C
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
K
K
 
A
I
 
H
A
 
E
G
 
R
V
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
Y
 
F
A
 
Q
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
P
E
 
A
E
 
N
M
 
A
T
 
K
A
 
V
F
 
S
R
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
P
L
 
L
T
 
F
V
 
R
A
 
F
R
 
K
D
 
D
A
 
E
E
 
A
H
 
D
A
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
T
 
Y
V
 
F
W
 
Y
T
 
A
A
 
R
N
 
D
E
 
L
A
 
S
L
 
R
A
 
V
D
 
F
H
 
R
F
 
V
A
 
G
D
 
E
S
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
Y
G
 
G
A
 
I
V
 
V
F
 
G
I
 
I
N
 
N
G
 
T
Y
 
G
G
 
I
A
 
I
S
 
S
D
 
N
P
 
E
R
 
V
V
 
A
T
 
P
I
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
K
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
G
N
 
S
H
 
K
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
H
 
E
E
 
D
F
 
Y
C
 
L
N
 
E
I
 
I
Q
 
K

3jz4A Crystal structure of e. Coli NADP dependent enzyme (see paper)
34% identity, 97% coverage: 9:451/458 of query aligns to 31:475/481 of 3jz4A

query
sites
3jz4A
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
G
 
G
E
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
G
R
 
S
Y
 
V
P
 
P
F
 
K
Q
 
M
G
 
G
S
 
A
D
 
D
A
 
E
I
 
T
E
 
R
S
 
A
S
 
A
L
 
I
Q
 
D
R
 
A
S
 
A
A
 
N
S
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
P
T
 
A
W
 
W
R
 
R
V
 
A
T
 
L
P
 
T
M
 
A
E
 
K
T
 
E
R
 
R
V
 
A
K
 
T
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
N
L
 
W
A
 
F
A
 
N
R
 
L
L
 
M
R
 
M
E
 
E
R
 
H
S
 
Q
E
 
D
A
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
L
M
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
G
E
 
E
V
 
I
N
 
S
K
 
Y
C
 
A
A
 
A
Q
 
S
V
 
F
C
 
I
E
 
E
W
 
W
Y
 
F
A
 
A
D
 
E
N
 
E
G
 
G
P
 
K
A
 
R
V
 
I
L
 
Y
A
 
G
A
 
D
Q
 
T
-
 
I
P
 
P
T
 
G
Q
 
H
V
 
Q
E
 
A
N
 
D
Q
 
K
Q
 
R
A
 
L
W
 
I
Q
 
V
E
 
I
F
 
K
R
 
Q
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
T
L
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
T
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
Y
 
A
W
 
A
Q
 
M
I
 
I
L
 
T
R
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
G
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
Y
 
M
I
 
V
L
 
L
K
|
K
H
 
P
A
|
A
P
x
S
N
 
Q
V
 
T
M
 
P
G
 
F
C
 
S
A
 
A
T
 
L
L
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
V
 
L
M
 
A
N
 
I
S
 
R
V
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
N
L
 
V
L
 
V
N
 
T
V
 
G
D
 
S
N
x
A
A
 
G
G
 
A
V
 
V
-
x
G
S
 
N
Q
 
E
L
 
L
I
 
T
N
 
S
D
 
N
P
 
P
R
 
L
V
 
V
A
 
R
A
 
K
V
 
L
A
 
S
V
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
R
 
E
A
x
I
G
 
G
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
A
 
M
T
 
E
Q
 
Q
A
 
C
G
 
A
A
 
K
A
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
K
T
 
V
V
 
S
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
N
D
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
S
R
 
K
Y
 
F
Q
 
R
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
C
|
C
M
 
V
A
 
C
A
 
A
K
 
N
R
 
R
F
 
L
I
 
Y
I
 
V
E
 
Q
A
 
D
P
 
G
V
 
V
A
 
Y
A
 
D
E
 
R
F
 
F
E
 
A
S
 
E
R
 
K
F
 
L
S
 
Q
A
 
Q
A
 
A
V
 
M
Q
 
S
A
 
K
L
 
L
K
 
H
S
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
N
A
 
G
T
 
V
Y
 
T
L
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
I
R
 
D
Y
 
E
D
 
K
L
 
A
R
 
V
D
 
A
E
x
K
L
 
V
H
 
E
Q
 
E
Q
 
H
V
 
I
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
L
N
 
E
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
V
V
 
V
C
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
K
K
 
A
I
 
H
A
 
E
G
 
R
V
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
Y
 
F
A
 
Q
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
P
E
 
A
E
 
N
M
 
A
T
 
K
A
 
V
F
 
S
R
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
T
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
P
L
 
L
T
 
F
V
 
R
A
 
F
R
 
K
D
 
D
A
 
E
E
 
A
H
 
D
A
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
T
 
Y
V
 
F
W
 
Y
T
 
A
A
 
R
N
 
D
E
 
L
A
 
S
L
 
R
A
 
V
D
 
F
H
 
R
F
 
V
A
 
G
D
 
E
S
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
Y
G
 
G
A
 
I
V
 
V
F
 
G
I
 
I
N
 
N
G
 
T
Y
 
G
G
 
I
A
 
I
S
 
S
D
 
N
P
 
E
R
 
V
V
 
A
T
 
P
I
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
K
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
G
N
 
S
H
 
K
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
H
 
E
E
 
D
F
 
Y
C
 
L
N
 
E
I
 
I
Q
 
K

8of1A Structure of aldh5f1 from moss physcomitrium patens in complex with NAD+ in the contracted conformation
35% identity, 97% coverage: 9:453/458 of query aligns to 49:495/505 of 8of1A

query
sites
8of1A
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
I
L
 
L
A
 
T
R
 
S
Y
 
V
P
 
P
F
 
F
Q
 
M
G
 
G
S
 
K
D
 
R
A
 
E
I
 
A
E
 
E
S
 
K
S
 
A
L
 
I
Q
 
A
R
 
A
S
 
A
A
 
S
S
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
T
T
 
S
W
 
W
R
 
S
V
 
K
T
 
R
P
 
T
M
 
A
E
 
N
T
 
D
R
 
R
V
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
L
 
W
A
 
F
A
 
N
R
 
L
L
 
L
R
 
I
E
 
K
R
 
N
S
 
K
E
 
D
A
 
D
L
 
L
A
 
G
K
 
K
M
 
L
M
 
I
T
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
G
E
 
E
V
 
I
N
 
V
K
 
Y
C
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
F
C
 
V
E
 
E
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
D
 
E
N
 
E
G
 
A
P
 
K
A
 
R
V
 
V
L
 
Y
A
 
G
-
 
D
A
 
I
Q
 
I
P
 
P
T
 
S
Q
 
P
V
 
F
E
 
P
N
 
E
Q
 
K
Q
 
R
A
 
M
W
 
L
Q
 
V
E
 
M
F
 
K
R
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
A
 
V
I
 
V
L
 
A
A
 
A
V
x
I
M
x
A
P
|
P
W
|
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
Y
 
L
W
 
A
Q
 
M
I
 
I
L
 
T
R
 
R
G
 
K
A
 
V
A
 
A
G
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
Y
 
V
I
 
V
L
 
I
K
|
K
H
 
P
A
 
S
P
 
E
N
 
L
V
 
T
M
 
P
G
 
L
C
 
T
A
 
A
T
 
L
L
 
A
L
 
A
Q
 
A
E
 
E
V
 
L
M
 
A
N
 
L
S
 
Q
V
 
A
G
 
G
F
 
I
P
 
P
E
 
P
G
 
G
T
 
V
F
 
V
E
 
N
L
 
V
L
 
V
N
 
M
V
 
G
D
 
D
N
x
A
A
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
G
Q
 
D
-
 
A
L
 
M
I
 
L
N
 
D
D
 
S
P
 
T
R
 
E
V
 
V
A
 
R
A
 
K
V
 
I
A
 
T
V
x
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
R
 
G
A
x
V
G
 
G
A
 
K
A
x
M
I
 
L
A
 
L
T
 
A
Q
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
K
A
 
T
L
 
V
K
 
K
K
 
K
T
 
V
V
 
S
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
N
D
 
A
P
 
P
F
 
C
I
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
G
A
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
C
|
C
M
 
V
A
 
C
A
 
I
K
 
N
R
 
K
F
 
I
I
 
F
I
 
V
E
 
Q
A
 
D
P
 
G
V
 
I
A
 
Y
A
 
D
E
 
K
F
 
F
E
 
A
S
 
E
R
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
A
 
G
L
 
L
K
 
R
S
 
A
G
 
G
D
 
N
P
 
G
L
 
L
D
 
E
E
 
P
A
 
G
T
 
I
Y
 
T
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
I
R
 
N
Y
 
E
D
 
T
L
 
A
R
 
L
D
 
E
E
x
K
L
 
V
H
 
E
Q
 
R
Q
 
H
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
T
 
A
L
 
V
N
 
S
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
L
C
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
K
K
 
R
I
 
H
A
 
S
G
 
L
V
 
G
G
 
R
N
 
T
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
G
D
 
N
V
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
E
M
 
M
T
 
L
A
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
P
L
 
L
T
 
V
V
 
R
A
 
F
R
 
N
D
 
T
A
 
D
E
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
N
S
 
S
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
T
 
Y
V
 
A
W
 
F
T
 
T
A
 
E
N
 
N
E
 
I
A
 
T
L
 
R
A
 
G
D
 
W
H
 
R
F
 
V
A
 
A
D
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
T
 
F
G
 
G
A
 
M
V
 
V
F
 
G
I
 
L
N
 
N
G
 
E
Y
 
G
G
 
L
A
 
I
S
 
S
D
 
T
P
 
E
R
 
V
V
 
A
T
 
P
I
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
M
K
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
G
N
 
S
H
 
K
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
H
 
D
E
 
E
F
 
Y
C
 
L
N
 
E
I
 
M
Q
 
K
T
 
Y
V
 
V

4cazA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa in complex with nadh
34% identity, 98% coverage: 7:453/458 of query aligns to 25:478/489 of 4cazA

query
sites
4cazA
S
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
P
 
Q
F
 
R
Q
 
A
G
 
S
S
 
R
D
 
E
A
 
D
I
 
V
E
 
E
S
 
R
S
 
A
L
 
V
Q
 
Q
R
 
S
S
 
A
A
 
V
S
 
E
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
T
 
V
W
 
W
R
 
A
V
 
A
T
 
M
P
 
T
M
 
A
E
 
M
T
 
Q
R
 
R
V
 
S
K
 
R
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
R
L
 
A
A
 
V
A
 
D
R
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
S
 
N
E
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
M
 
L
M
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
M
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Q
 
E
A
 
T
R
 
R
A
 
S
-
 
V
E
 
D
V
 
I
N
 
V
K
 
T
C
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
C
 
L
E
 
E
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
D
 
G
N
 
L
G
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
E
A
 
G
A
 
E
Q
 
Q
P
 
I
T
 
P
Q
 
L
V
 
R
E
 
E
N
 
T
Q
 
S
Q
 
F
A
 
V
W
 
Y
Q
 
T
E
 
R
F
 
R
R
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
V
L
 
A
A
 
G
V
x
I
M
x
G
P
 
A
W
|
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
Y
 
V
W
 
Q
Q
 
I
I
 
A
L
 
L
R
 
W
G
 
K
A
 
S
A
 
A
G
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
Y
 
M
I
 
I
L
 
F
K
|
K
H
 
P
A
 
S
P
x
E
N
 
V
V
 
T
M
 
P
G
 
L
C
 
T
A
 
A
T
 
L
L
 
K
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
V
 
I
M
 
Y
N
 
T
S
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
P
E
 
D
G
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
N
L
 
V
L
 
L
N
 
T
V
 
G
D
 
S
N
x
G
A
 
R
G
 
E
V
 
V
S
x
G
Q
 
Q
-
 
W
L
 
L
I
 
T
N
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
V
 
I
A
 
E
A
 
K
V
 
I
A
 
S
V
x
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
V
 
T
R
 
S
A
x
T
G
 
G
A
 
K
A
 
K
I
x
V
-
 
M
A
 
A
T
 
S
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
S
A
 
S
L
 
L
K
 
K
K
 
E
T
 
V
V
 
T
L
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
K
D
 
S
P
 
P
F
 
L
I
 
I
V
 
I
L
 
F
A
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
A
K
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
M
G
 
A
R
 
N
Y
 
F
Q
 
F
N
 
S
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
|
C
M
 
T
A
 
N
A
 
G
K
 
T
R
 
R
F
 
V
I
 
F
I
 
I
E
 
H
A
 
R
P
 
S
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
E
 
R
F
 
F
E
 
E
S
 
A
R
 
K
F
 
V
S
 
L
A
 
E
A
 
R
V
 
V
Q
 
Q
A
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
Q
D
 
D
E
 
E
A
 
N
T
 
T
Y
 
N
L
 
F
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
V
R
 
S
Y
 
F
D
 
P
L
 
H
R
 
M
D
 
E
E
 
S
L
 
V
H
 
L
Q
 
G
Q
 
Y
V
 
I
Q
 
E
D
 
S
T
 
G
L
 
K
N
 
A
Q
 
Q
G
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
L
C
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
I
 
V
A
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
F
G
 
G
V
 
K
G
 
G
N
 
A
Y
 
Y
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
A
 
T
D
 
D
V
 
C
S
 
R
E
 
D
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
I
F
 
V
R
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
M
A
 
S
L
 
I
T
 
L
V
 
V
A
 
Y
R
 
D
D
 
D
A
 
E
E
 
D
H
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
T
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
T
 
G
V
 
V
W
 
V
T
 
T
A
 
Q
N
 
D
E
 
L
A
 
A
L
 
R
A
 
A
D
 
H
H
 
R
F
 
A
A
 
I
D
 
H
S
 
R
L
 
L
E
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
I
V
 
C
F
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
P
P
 
A
R
 
E
V
 
M
T
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
N
N
 
G
H
 
L
F
 
T
G
 
T
L
 
L
H
 
A
E
 
H
F
 
Y
C
 
T
N
 
R
I
 
I
Q
 
K
T
 
S
V
 
V

2woxA Betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with NAD(p) h-catalytic thiol adduct. (see paper)
34% identity, 98% coverage: 7:453/458 of query aligns to 25:478/489 of 2woxA

query
sites
2woxA
S
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
P
 
Q
F
 
R
Q
 
A
G
 
S
S
 
R
D
 
E
A
 
D
I
 
V
E
 
E
S
 
R
S
 
A
L
 
V
Q
 
Q
R
 
S
S
 
A
A
 
V
S
 
E
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
T
 
V
W
 
W
R
 
A
V
 
A
T
 
M
P
 
T
M
 
A
E
 
M
T
 
Q
R
 
R
V
 
S
K
 
R
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
R
L
 
A
A
 
V
A
 
D
R
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
S
 
N
E
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
M
 
L
M
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
M
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
A
Q
 
E
A
 
T
R
 
R
A
 
S
-
 
V
E
 
D
V
 
I
N
 
V
K
 
T
C
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
C
 
L
E
 
E
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
D
 
G
N
 
L
G
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
E
A
 
G
A
 
E
Q
 
Q
P
 
I
T
 
P
Q
 
L
V
 
R
E
 
E
N
 
T
Q
 
S
Q
 
F
A
 
V
W
 
Y
Q
 
T
E
 
R
F
 
R
R
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
V
L
 
A
A
 
G
V
x
I
M
x
G
P
 
A
W
|
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
Y
 
V
W
 
Q
Q
 
I
I
 
A
L
 
L
R
 
W
G
 
K
A
 
S
A
 
A
G
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
Y
 
M
I
 
I
L
 
F
K
|
K
H
 
P
A
x
S
P
x
E
N
 
V
V
 
T
M
 
P
G
 
L
C
 
T
A
 
A
T
 
L
L
 
K
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
V
 
I
M
 
Y
N
 
T
S
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
V
P
 
P
E
 
D
G
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
N
L
 
V
L
 
L
N
 
T
V
 
G
D
 
S
N
x
G
A
 
R
G
 
E
V
 
V
S
x
G
Q
 
Q
-
 
W
L
 
L
I
 
T
N
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
V
 
I
A
 
E
A
 
K
V
 
I
A
 
S
V
x
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
V
 
T
R
 
S
A
x
T
G
 
G
A
 
K
A
 
K
I
x
V
-
 
M
A
 
A
T
 
S
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
S
A
 
S
L
 
L
K
 
K
K
 
E
T
 
V
V
 
T
L
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
K
D
 
S
P
 
P
F
 
L
I
 
I
V
 
I
L
 
F
A
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
A
K
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
M
G
 
A
R
 
N
Y
 
F
Q
 
F
N
 
S
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
|
C
M
 
T
A
 
N
A
 
G
K
 
T
R
 
R
F
 
V
I
 
F
I
 
I
E
 
H
A
 
R
P
 
S
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
E
 
R
F
 
F
E
 
E
S
 
A
R
 
K
F
 
V
S
 
L
A
 
E
A
 
R
V
 
V
Q
 
Q
A
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
Q
D
 
D
E
 
E
A
 
N
T
 
T
Y
 
N
L
 
F
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
V
R
 
S
Y
 
F
D
 
P
L
 
H
R
 
M
D
 
E
E
 
S
L
 
V
H
 
L
Q
 
G
Q
 
Y
V
 
I