SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_038208119.1 NCBI__GCF_000745855.1:WP_038208119.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:253/255 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
Q
 
S
R
 
R
F
 
L
E
 
Q
D
 
D
R
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
L
A
 
E
A
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
A
D
|
D
L
x
F
N
 
N
E
 
E
E
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
V
 
A
A
 
V
G
 
-
Q
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
E
A
 
A
G
 
N
G
 
P
R
 
G
A
 
V
E
 
V
A
 
F
V
 
I
R
 
R
C
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
E
Q
 
N
A
 
V
Q
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
G
A
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
x
D
K
 
S
P
 
M
F
 
L
T
 
S
R
x
K
T
 
M
T
 
T
S
 
V
A
 
D
D
 
Q
W
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
V
V
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
H
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
Q
K
 
G
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
T
A
 
G
R
 
T
V
 
Y
G
 
G
S
x
N
S
x
V
G
 
G
E
x
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
T
|
T
D
 
E
T
|
T
A
 
A
L
x
M
F
 
V
A
 
A
D
 
E
Y
 
V
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
V
M
 
I
E
 
E
A
x
K
F
 
M
T
 
K
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
M
M
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 5:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
R
 
K
F
 
L
E
 
A
D
 
S
R
 
K
T
 
T
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
F
A
 
G
A
 
I
C
 
A
R
 
Q
R
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
I
F
 
A
D
|
D
L
x
R
N
 
D
E
 
A
E
 
H
A
 
G
A
 
E
A
 
A
Q
 
-
V
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
S
I
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
A
E
 
L
A
 
F
V
 
I
R
 
S
C
|
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
R
 
K
A
 
T
S
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
F
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
R
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
P
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
x
I
D
 
N
V
 
R
F
 
D
K
 
A
P
 
M
F
 
L
T
 
H
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
E
 
D
R
 
T
L
 
V
V
 
I
A
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
-
 
F
L
 
L
H
 
C
M
 
M
H
 
Q
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
I
P
 
R
G
 
-
M
 
M
A
 
R
A
 
E
R
 
R
K
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
D
T
|
T
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
D
Y
 
M
R
x
T
E
 
R
G
 
G
A
 
V
G
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
N
L
 
V
M
 
W
E
 
Q
A
 
I
F
 
M
T
 
V
R
 
S
S
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
E
 
K
D
 
D
L
 
V
P
 
G
G
 
E
A
 
C
I
 
V
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
A
 
R
F
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
I
S
 
N
V
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
L

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
38% identity, 98% coverage: 2:252/255 of query aligns to 1:242/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
Q
 
M
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
N
R
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
G
 
E
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
V
 
L
F
 
A
D
|
D
L
 
W
N
 
A
E
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Q
 
S
I
 
L
R
 
P
E
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
V
 
V
R
 
H
C
 
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
H
A
 
V
S
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
Q
 
E
A
 
V
Q
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
V
D
 
H
V
 
V
F
 
A
K
 
G
P
 
S
F
 
V
T
 
L
R
 
E
T
 
T
T
 
S
S
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
R
R
 
R
L
 
I
V
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
F
M
 
C
H
 
S
H
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
A
 
L
A
 
K
R
 
T
K
 
K
A
 
-
G
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
D
x
V
A
x
S
A
 
G
R
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
D
S
 
W
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
H
A
 
G
R
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
T
x
V
D
 
K
T
|
T
A
 
N
L
 
M
F
 
T
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
N
G
 
G
N
 
W
P
 
P
E
 
Q
K
 
E
L
 
I
M
x
R
E
x
D
A
x
K
F
 
F
T
 
N
R
 
E
S
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
P
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
L
 
I
S
 
P
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:252/255 of query aligns to 2:242/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
N
R
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
G
 
E
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
V
 
L
F
 
A
D
|
D
L
x
W
N
x
A
E
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Q
 
S
I
 
L
R
 
P
E
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
V
 
V
R
 
H
C
x
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
H
A
 
V
S
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
Q
 
E
A
 
V
Q
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
V
D
 
H
V
 
V
F
 
A
K
 
G
P
 
S
F
 
V
T
 
L
R
 
E
T
 
T
T
 
S
S
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
R
R
 
R
L
 
I
V
 
A
A
 
G
V
|
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
F
M
 
C
H
 
S
H
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
A
 
L
A
 
K
R
 
T
K
 
K
A
 
-
G
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
x
S
A
 
G
R
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
D
S
 
W
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
H
A
 
G
R
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
S
P
x
L
T
x
V
D
 
K
T
|
T
A
x
N
L
x
M
F
x
T
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
N
G
 
G
N
 
W
P
 
P
E
 
Q
K
 
E
L
 
I
M
 
R
E
 
D
A
 
K
F
 
F
T
 
N
R
 
E
S
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
P
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
L
 
I
S
 
P
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:252/255 of query aligns to 4:244/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
N
R
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
G
 
E
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
V
 
L
F
 
A
D
|
D
L
x
W
N
 
A
E
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Q
 
S
I
 
L
R
 
P
E
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
V
 
V
R
 
H
C
x
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
H
A
 
V
S
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
Q
 
E
A
 
V
Q
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
W
 
V
D
 
H
V
 
V
F
 
A
K
 
G
P
 
S
F
 
V
T
 
L
R
 
E
T
 
T
T
 
S
S
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
R
R
 
R
L
 
I
V
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
F
M
 
C
H
 
S
H
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
A
 
L
A
 
K
R
 
T
K
 
K
A
 
-
G
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
S
A
 
G
R
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
D
S
 
W
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
H
A
 
G
R
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
T
 
V
D
 
K
T
 
T
A
 
N
L
 
M
F
 
T
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
N
G
 
G
N
 
W
P
 
P
E
 
Q
K
 
E
L
 
I
M
 
R
E
 
D
A
 
K
F
 
F
T
 
N
R
 
E
S
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
P
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
L
 
I
S
 
P
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:252/255 of query aligns to 2:242/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
N
R
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
G
 
E
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
V
 
L
F
 
A
D
|
D
L
x
W
N
x
A
E
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Q
 
S
I
 
L
R
 
P
E
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
V
 
V
R
 
H
C
x
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
H
A
 
V
S
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
Q
 
E
A
 
V
Q
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
V
D
 
H
V
 
V
F
 
A
K
 
G
P
 
S
F
 
V
T
 
L
R
 
E
T
 
T
T
 
S
S
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
R
R
 
R
L
 
I
V
 
A
A
 
G
V
|
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
F
M
 
C
H
 
S
H
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
A
 
L
A
 
K
R
 
T
K
 
K
A
 
-
G
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
S
A
 
G
R
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
D
S
 
W
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
H
A
 
G
R
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
x
S
P
x
L
T
x
V
D
 
K
T
|
T
A
x
N
L
x
M
F
x
T
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
N
G
 
G
N
 
W
P
 
P
E
 
Q
K
 
E
L
 
I
M
 
R
E
 
D
A
 
K
F
 
F
T
 
N
R
 
E
S
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
V
P
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
L
 
I
S
 
P
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 99% coverage: 1:252/255 of query aligns to 2:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
I
Q
 
M
R
 
N
F
 
L
E
 
T
D
 
D
R
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
K
 
N
V
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
A
D
|
D
L
x
I
N
 
D
E
 
E
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
Q
 
Q
V
 
G
A
 
E
G
 
A
Q
 
M
I
 
V
R
 
R
-
 
K
E
 
E
A
 
N
G
 
N
G
 
D
R
 
R
A
 
L
E
 
H
A
 
F
V
 
V
R
 
Q
C
x
T
D
 
D
I
|
I
T
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
C
D
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
S
A
 
A
Q
 
V
A
 
H
R
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
 
I
D
 
E
V
 
I
F
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
I
T
 
H
R
 
E
T
 
M
T
 
E
S
 
L
A
 
S
D
 
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
M
L
 
F
H
 
L
M
 
M
H
 
S
H
 
K
A
 
H
V
 
A
L
 
L
P
 
K
G
 
H
M
 
M
A
 
L
A
 
A
R
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
D
 
V
A
 
G
A
 
G
R
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
W
S
 
P
G
 
D
E
 
I
A
 
P
V
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
V
E
 
D
H
 
Y
A
 
A
R
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
x
I
T
x
I
D
 
D
T
 
T
A
 
P
L
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
S
F
 
F
A
 
L
D
 
E
Y
 
N
R
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
T
G
 
-
N
 
-
P
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
I
M
 
K
E
 
K
A
 
E
F
 
K
T
 
A
R
 
K
S
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
V
I
 
M
A
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
L
A
 
S
A
 
S
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
A
L
 
I
S
 
T
V
 
A
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
38% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
F
 
L
E
 
Q
D
 
G
R
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
R
A
 
D
A
 
I
C
 
A
R
 
I
R
 
N
F
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
I
A
 
-
V
 
F
F
 
F
D
x
N
L
x
Y
N
|
N
-
x
G
-
x
S
E
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
E
Q
 
E
V
 
T
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
K
C
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
I
R
 
A
A
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
F
V
 
F
A
 
K
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
R
 
R
T
 
M
T
 
K
S
 
E
A
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
D
R
 
D
L
 
V
V
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
G
 
T
M
 
M
A
 
M
A
 
K
R
 
Q
K
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
T
T
|
T
A
 
D
L
 
M
F
 
T
A
 
D
D
 
K
Y
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
D
E
 
E
K
 
K
L
 
T
M
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
M
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
I
 
Y
G
 
G
Q
 
T
P
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
A
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
F
 
F
E
 
E
D
 
G
R
 
K
T
 
I
V
 
V
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
A
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
F
A
 
V
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
E
 
E
E
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
G
Q
 
Y
I
 
L
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
V
 
F
R
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
K
D
 
D
R
 
A
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
R
 
R
T
 
M
T
 
K
S
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
E
R
 
D
L
 
I
V
 
L
A
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
C
G
 
A
M
 
M
A
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
T
 
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
A
 
D
D
 
D
Y
 
Q
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
N
R
 
R
I
 
P
G
 
G
Q
 
D
P
 
A
E
 
K
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
G
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
37% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
R
 
R
T
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
G
 
K
A
 
Q
A
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
N
D
|
D
L
x
I
N
 
D
E
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
V
A
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
V
G
 
D
Q
 
E
I
 
F
R
 
S
E
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
A
 
V
E
 
L
A
 
G
V
 
A
R
 
V
C
 
A
D
 
D
I
|
I
T
 
G
D
 
N
R
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
I
A
 
D
R
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
 
M
D
 
E
V
 
R
F
 
A
K
 
G
P
 
A
F
 
L
T
 
R
R
 
K
T
 
L
T
 
S
S
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
E
 
D
R
 
V
L
 
T
V
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
A
 
V
A
 
E
R
 
N
K
 
K
A
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
D
 
-
A
 
R
A
 
A
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
x
I
D
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
F
 
W
A
 
D
D
 
E
Y
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
D
M
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
T
 
L
R
 
S
S
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
T
I
 
L
A
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
A
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
M
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
37% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
R
 
R
T
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
K
A
 
Q
A
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
N
D
|
D
L
 
I
N
 
D
E
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
V
A
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
V
G
 
D
Q
 
E
I
 
F
R
 
S
E
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
A
 
V
E
 
L
A
 
G
V
 
A
R
 
V
C
 
A
D
|
D
I
|
I
T
 
G
D
 
N
R
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
I
A
 
D
R
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
M
D
 
E
V
 
R
F
 
A
K
 
G
P
 
A
F
 
L
T
 
R
R
 
K
T
 
L
T
 
S
S
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
E
 
D
R
 
V
L
 
T
V
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
A
 
V
A
 
E
R
 
N
K
 
K
A
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
-
A
 
R
A
 
A
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
 
I
D
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
F
 
W
A
 
D
D
 
E
Y
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
D
M
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
T
 
L
R
 
S
S
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
T
I
 
L
A
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
A
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
M
 
L

Sites not aligning to the query:

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
37% identity, 99% coverage: 1:252/255 of query aligns to 1:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
M
 
M
Q
 
T
R
 
K
F
 
L
E
 
L
D
 
D
-
 
G
R
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
L
A
 
E
A
 
I
C
 
A
R
 
K
R
 
K
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
S
D
|
D
L
x
M
N
 
N
E
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
A
 
Q
Q
 
E
V
 
T
A
 
A
G
 
N
Q
 
S
I
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
R
 
D
A
 
A
E
 
L
A
 
S
V
 
A
R
 
P
C
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
D
S
 
A
V
 
Y
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
Q
 
L
A
 
T
Q
 
Q
A
 
K
R
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
F
D
x
Q
V
 
H
F
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
I
T
 
E
R
 
E
T
 
F
T
 
P
S
 
T
A
 
A
D
 
V
W
 
F
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
I
M
 
G
H
 
I
H
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
A
 
K
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
A
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
D
 
I
A
x
N
A
 
G
R
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
F
S
 
A
G
 
G
E
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
C
A
 
A
R
 
R
H
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
 
Y
T
x
V
D
 
D
T
|
T
A
 
P
L
|
L
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
F
 
I
A
 
A
D
 
D
Y
 
L
R
 
A
E
 
K
-
 
T
-
 
R
G
 
N
A
 
V
G
 
S
N
 
L
P
 
D
E
 
S
K
 
A
L
 
L
M
 
E
E
 
D
A
 
V
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
M
I
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
I
 
L
G
 
L
Q
 
S
P
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
D
A
 
Y
I
 
A
A
 
I
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
G
F
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
L
 
V
S
 
V
V
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:252/255 of query aligns to 2:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
Q
 
K
R
 
L
F
 
L
E
 
D
D
 
G
R
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
L
A
 
E
A
 
I
C
 
A
R
 
K
R
 
K
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
S
D
|
D
L
x
M
N
 
N
E
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
A
 
Q
Q
 
E
V
 
T
A
 
A
G
 
N
Q
 
S
I
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
R
 
D
A
 
A
E
 
L
A
 
S
V
 
A
R
 
P
C
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
D
S
 
A
V
 
Y
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
Q
 
L
A
 
T
Q
 
Q
A
 
K
R
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
F
D
x
Q
V
 
H
F
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
I
T
 
E
R
 
E
T
 
F
T
 
P
S
 
T
A
 
A
D
 
V
W
 
F
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
I
M
 
G
H
 
I
H
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
A
 
K
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
A
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
D
 
I
A
 
N
A
 
G
R
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
F
S
 
A
G
 
G
E
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
C
A
 
A
R
 
R
H
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
x
Y
T
x
V
D
 
D
T
|
T
A
 
P
L
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
F
 
I
A
 
A
D
 
D
Y
 
L
R
 
A
E
 
K
-
 
T
-
 
R
G
 
N
A
 
V
G
 
S
N
 
L
P
 
D
E
 
S
K
 
A
L
 
L
M
 
E
E
 
D
A
 
V
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
M
I
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
I
 
L
G
 
L
Q
 
S
P
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
D
A
 
Y
I
 
A
A
 
I
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
G
F
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
L
 
V
S
 
V
V
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
38% identity, 97% coverage: 7:253/255 of query aligns to 3:255/256 of Q48436

query
sites
Q48436
R
 
K
T
 
V
V
 
A
V
x
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
G
x
A
G
|
G
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
G
x
K
A
|
A
A
x
I
C
x
A
R
x
L
R
|
R
F
x
L
A
x
V
R
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
K
x
A
V
|
V
A
|
A
V
x
I
F
x
A
D
|
D
L
 
Y
N
 
N
E
 
D
E
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
K
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
S
Q
 
E
I
 
I
R
 
N
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
V
 
V
R
 
K
C
 
V
D
|
D
I
 
V
T
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
D
S
 
Q
V
 
V
D
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
R
A
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
V
D
 
A
V
 
P
F
 
S
K
 
T
P
 
P
F
 
I
T
 
E
R
 
S
T
 
I
T
 
T
S
 
P
A
 
E
D
 
I
W
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
V
V
 
Y
A
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
I
H
 
W
M
 
G
H
 
I
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
V
P
 
E
G
 
A
M
 
F
A
 
K
A
 
K
R
 
E
-
 
G
K
 
H
A
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
A
A
 
C
S
 
S
D
 
Q
A
 
A
A
 
G
R
 
H
V
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
G
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
S
A
 
S
C
 
S
K
|
K
G
 
F
G
 
A
L
 
V
V
 
R
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
Q
T
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
G
V
 
Y
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
I
T
 
V
D
 
K
T
 
T
A
 
P
L
 
M
F
 
W
A
 
A
D
 
E
Y
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
R
 
S
E
 
E
G
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
G
L
 
Y
M
 
G
E
 
T
A
 
A
-
 
E
F
 
F
T
 
A
R
 
K
S
 
R
I
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
S
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
P
 
A
G
 
A
A
 
C
I
 
V
A
 
S
F
 
Y
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
S
L
 
L
S
 
L
V
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
F

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
F
 
F
E
 
E
D
 
G
R
 
K
T
 
I
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
A
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
E
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
D
Q
 
Y
I
 
L
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
V
 
L
R
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
K
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
R
 
R
T
 
M
T
 
K
S
 
D
A
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
L
 
I
V
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
C
x
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
D
D
 
D
Y
 
Q
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
F
 
F
E
 
E
D
 
G
R
 
K
T
 
I
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
A
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
E
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
D
Q
 
Y
I
 
L
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
V
 
L
R
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
K
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
R
 
R
T
 
M
T
 
K
S
 
D
A
 
E
D
x
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
L
 
I
V
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
D
D
 
D
Y
 
Q
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
x
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
F
 
F
E
 
E
D
 
G
R
 
K
T
 
I
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
A
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
E
 
E
E
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
D
Q
 
Y
I
 
L
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
V
 
L
R
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
N
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
R
 
R
T
 
M
T
 
K
S
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
L
 
I
V
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
A
 
D
D
 
E
Y
 
Q
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
L
R
 
A
S
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
N
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
F
 
F
E
 
E
D
 
G
R
 
K
T
 
I
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
A
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
x
A
L
x
T
N
 
S
E
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
D
Q
 
Y
I
 
L
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
V
 
L
R
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
K
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
R
 
R
T
 
M
T
 
K
S
 
D
A
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
L
 
I
V
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
D
D
 
D
Y
 
Q
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
F
 
F
E
 
E
D
 
G
R
 
K
T
 
I
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
G
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
A
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
L
 
T
N
 
S
E
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
A
 
K
Q
 
N
V
 
I
A
 
S
G
 
D
Q
 
Y
I
 
L
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
V
 
L
R
 
M
C
 
L
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
N
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
R
 
R
T
 
M
T
 
K
S
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
L
 
I
V
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
|
M
A
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
A
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
D
D
 
D
Y
 
Q
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
F
 
L
A
|
A
S
|
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
38% identity, 97% coverage: 7:253/255 of query aligns to 3:255/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
R
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
K
A
 
A
A
 
I
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
K
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
A
D
|
D
L
x
Y
N
 
N
E
 
D
E
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
K
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
S
Q
 
E
I
 
I
R
 
N
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
H
A
 
A
E
 
V
A
 
A
V
 
V
R
 
K
C
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
|
R
A
x
D
S
 
Q
V
 
V
D
x
F
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
R
A
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
 
V
D
 
A
V
 
P
F
 
S
K
 
T
P
 
P
F
 
I
T
 
E
R
 
S
T
 
I
T
 
T
S
 
P
A
 
E
D
 
I
W
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
V
V
 
Y
A
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
V
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
I
H
 
W
M
 
G
H
 
I
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
V
P
x
E
G
 
A
M
 
F
A
 
K
A
 
K
R
 
E
-
 
G
K
 
H
A
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
A
A
 
C
S
|
S
D
 
Q
A
 
A
A
 
G
R
 
H
V
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
G
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
C
 
S
K
|
K
G
 
F
G
 
A
L
 
V
V
 
R
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
Q
T
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
D
H
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
G
V
 
Y
C
 
C
P
|
P
G
 
G
P
 
I
T
x
V
D
 
K
T
|
T
A
 
P
L
x
M
F
 
W
A
 
A
D
 
E
Y
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
x
V
R
 
S
E
 
E
G
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
G
L
 
Y
M
 
G
E
 
T
A
 
A
-
 
E
F
 
F
T
 
A
R
 
K
S
 
R
I
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
S
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
P
 
A
G
 
A
A
 
C
I
 
V
A
 
S
F
 
Y
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
S
L
 
L
S
 
L
V
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
F

Query Sequence

>WP_038208119.1 NCBI__GCF_000745855.1:WP_038208119.1
MQRFEDRTVVVTGGGGGIGGAACRRFAREGAKVAVFDLNEEAAAQVAGQIREAGGRAEAV
RCDITDRASVDAAVAQAQARLGAIDVLVNNAGWDVFKPFTRTTSADWERLVAVNLTGALH
MHHAVLPGMAARKAGRIVNIASDAARVGSSGEAVYAACKGGLVALSKTLAREHARHGITV
NVVCPGPTDTALFADYREGAGNPEKLMEAFTRSIPLGRIGQPEDLPGAIAFFASDDAAFV
TGQVLSVSGGLTMAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory