SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_038210510.1 NCBI__GCF_000745855.1:WP_038210510.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q46444 Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase; QH-ADH; Alcohol dehydrogenase (azurin); PQQ-containing alcohol dehydrogenase; PQQ-dependent ADH; Quinohaemoprotein ethanol dehydrogenase type I; QH-EDHI; EC 1.1.9.1 from Comamonas testosteroni (Pseudomonas testosteroni) (see 3 papers)
28% identity, 78% coverage: 153:755/773 of query aligns to 56:571/708 of Q46444

query
sites
Q46444
R
 
R
P
 
T
V
 
P
D
 
D
W
 
W
S
 
P
A
 
T
Y
 
I
G
 
G
R
 
V
T
 
D
T
 
Y
E
 
A
G
 
E
R
 
T
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
R
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
A
E
 
A
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
D
L
 
L
K
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
Y
R
 
N
T
 
L
G
 
E
D
 
S
T
 
T
Q
 
R
P
 
-
G
 
G
V
 
V
D
x
E
Q
 
A
N
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
V
Q
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
L
 
I
V
 
M
Y
 
Y
S
 
V
C
 
S
T
 
A
R
 
S
N
 
W
D
 
S
K
 
V
L
 
V
I
 
H
A
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
T
D
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
N
E
 
R
R
 
I
W
 
W
V
 
T
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
A
 
I
-
 
D
K
 
R
S
 
S
P
 
T
F
 
G
W
 
F
Q
 
K
R
 
G
C
|
C
-
x
C
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
V
G
 
A
Y
 
L
W
 
W
K
 
K
A
 
G
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
K
I
 
V
V
 
Y
Q
 
V
T
 
G
T
 
A
I
 
W
D
 
D
A
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
E
F
 
V
G
 
W
D
 
H
K
 
Q
G
 
N
T
 
T
V
 
F
S
 
E
L
 
G
A
 
Q
H
 
K
G
 
G
M
 
S
G
 
L
T
 
T
V
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
T
|
T
S
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
R
V
 
V
A
 
F
R
 
K
D
 
G
L
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
K
W
 
R
V
x
G
V
x
A
D
x
E
N
 
Y
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
Y
I
 
I
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
A
R
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
R
V
 
K
W
 
W
A
 
R
W
 
W
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
G
D
 
D
L
 
P
G
 
S
N
 
K
P
 
P
-
 
F
D
 
E
I
 
D
T
 
E
K
 
S
L
 
M
P
 
K
P
 
R
E
 
A
G
 
A
Q
 
R
T
 
T
Y
 
W
T
 
D
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
W
-
 
W
-
 
E
-
 
A
-
 
G
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
M
W
 
W
T
 
D
T
 
S
A
 
M
A
 
T
Y
 
F
D
 
D
D
 
A
K
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
T
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
P
 
G
L
 
T
G
 
G
N
|
N
A
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
W
Y
 
S
F
 
H
G
 
K
Q
 
V
G
 
R
R
 
S
P
 
P
A
 
K
H
 
G
S
 
G
D
 
D
E
 
N
-
 
L
Y
 
Y
N
 
L
A
 
A
T
 
S
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
Y
R
 
K
W
 
W
K
 
H
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
E
V
 
T
H
 
P
H
 
G
D
 
D
I
 
N
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
-
L
 
T
P
 
S
S
 
T
Q
 
Q
P
 
P
A
 
M
L
 
I
I
 
L
D
 
A
L
 
D
P
 
I
D
 
K
G
 
I
K
 
A
G
 
G
G
 
K
T
 
P
V
 
R
P
 
K
A
 
V
V
 
I
L
 
L
Q
 
H
T
 
A
T
 
P
K
|
K
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
F
F
 
F
L
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
T
T
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
F
L
 
I
A
 
S
E
 
A
V
 
K
A
 
N
E
 
F
K
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
N
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
M
 
-
W
 
W
G
 
A
M
 
-
T
 
S
M
 
G
F
 
Y
D
 
D
Q
 
K
L
 
H
L
 
G
C
 
K
R
 
P
I
 
I
E
 
G
F
 
I
R
 
A
T
 
A
L
 
A
R
 
R
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
G
T
 
S
P
 
K
P
 
P
G
 
-
L
 
-
Q
 
Q
R
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
G
N
 
P
V
 
Y
G
 
G
G
 
A
L
 
H
N
|
N
W
|
W
G
 
H
S
 
P
V
 
M
S
 
S
V
 
F
D
 
N
T
 
P
A
 
Q
N
 
T
Q
 
G
R
 
L
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
N
 
P
D
 
A
I
 
Q
R
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
V
V
 
N
F
 
L
Q
 
M
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
D
D
 
D
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
K
K
 
K
Y
 
W
P
 
E
P
 
F
V
 
N
S
 
Q
D
 
A
G
 
G
H
 
P
G
 
G
P
 
-
S
 
K
T
 
P
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
T
P
 
-
Y
 
-
G
 
G
I
 
W
Y
 
N
T
 
T
T
 
A
I
 
K
W
 
F
F
 
F
S
 
N
R
 
-
L
 
-
G
 
A
V
 
E
P
 
P
C
 
P
V
 
K
Q
 
S
P
 
K
P
 
P
F
 
F
G
 
G
T
 
R
L
 
L
T
 
L
A
 
A
I
 
W
D
 
D
L
 
P
K
 
V
T
 
A
R
 
Q
K
 
K
V
 
A
A
 
A
W
 
W
Q
 
S
V
 
V
P
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
E
Q
 
H
L
 
V
G
 
S
P
 
P
L
 
W
G
 
N
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
T
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
L
 
V
V
 
V
F
 
-
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
T
 
T
Q
 
A
D
 
D
F
 
G
Y
 
R
L
 
L
R
 
V
A
 
A
Y
 
Y
D
 
H
A
 
A
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
E
E
 
K
V
 
L
W
 
W
K
 
E
H
 
A
A
 
P
M
 
T
P
 
G
V
 
T
G
 
G
S
 
V
S
 
V
A
 
A
T
 
A
P
 
P
M
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
M
S
 
V
P
 
-
R
 
-
T
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
V
 
S
I
 
V
S
 
A
A
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1yiqA Molecular cloning and structural analysis of quinohemoprotein alcohol dehydrogenase adhiig from pseudomonas putida hk5. Compariison to the other quinohemoprotein alcohol dehydrogenase adhiib found in the same microorganism. (see paper)
27% identity, 79% coverage: 151:760/773 of query aligns to 16:544/684 of 1yiqA

query
sites
1yiqA
D
 
D
N
 
K
R
 
E
P
 
P
V
 
G
D
 
N
W
 
W
S
 
M
A
 
S
Y
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
T
 
Y
E
 
D
G
 
E
R
 
Q
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
S
R
 
D
E
 
Q
T
 
N
V
 
V
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
Y
R
 
K
T
 
L
G
 
-
D
 
D
T
 
L
Q
 
D
P
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
-
Q
x
E
N
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
I
Q
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
L
 
V
V
 
M
Y
 
Y
S
 
T
C
 
T
T
 
G
R
 
P
N
 
F
D
 
S
K
 
V
L
 
V
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
R
S
 
D
G
 
G
Q
 
R
E
 
L
R
 
I
W
 
W
V
 
K
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
A
 
S
-
 
D
K
 
R
S
 
H
P
 
R
F
 
A
W
 
G
Q
 
E
R
 
A
C
|
C
-
x
C
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
V
G
 
A
Y
 
V
W
 
W
K
 
K
A
 
G
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
K
I
 
V
V
 
Y
Q
 
V
T
 
G
T
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
E
E
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
R
C
 
A
E
 
W
E
 
S
F
 
V
G
 
D
D
 
T
K
 
R
G
 
A
T
 
D
V
 
H
S
 
K
L
 
R
A
 
S
H
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
Y
F
 
T
Q
 
I
T
|
T
S
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
R
V
 
V
A
 
V
R
 
N
D
 
G
L
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
N
W
x
G
V
x
G
V
x
A
D
x
E
N
 
F
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
Y
I
 
V
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
A
R
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
E
V
 
A
W
 
W
A
 
R
W
 
F
D
 
-
L
 
Y
G
 
T
N
 
V
P
 
P
D
 
G
I
 
D
T
 
P
K
 
K
L
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Q
 
K
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
W
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
Y
T
 
V
Y
 
E
T
 
Q
P
 
G
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
A
W
|
W
T
 
D
T
 
S
A
 
F
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
I
P
 
G
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
G
T
 
S
-
 
L
-
 
W
-
 
D
P
 
P
D
 
K
Y
 
W
F
 
R
G
 
S
Q
 
Q
G
 
A
R
 
K
P
 
-
A
 
-
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
L
Y
 
F
N
 
L
A
 
S
T
 
S
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
V
D
 
N
V
 
A
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
E
P
 
Y
R
 
V
W
 
W
K
 
H
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
V
 
T
H
 
P
H
 
G
D
 
D
I
 
A
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
T
L
 
A
P
 
T
S
 
Q
Q
 
H
P
 
M
A
 
I
L
 
L
I
 
A
D
 
E
L
 
L
P
 
P
-
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
P
G
 
R
T
 
K
V
 
V
P
 
-
A
 
-
V
 
L
L
 
M
Q
 
Q
T
 
A
T
 
P
K
|
K
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
F
F
 
Y
L
 
V
L
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
L
 
L
A
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
S
Q
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
Q
P
 
S
Y
 
W
S
 
T
V
 
K
G
 
G
M
 
M
P
 
D
-
 
M
T
 
K
V
 
T
G
 
G
A
 
R
E
 
P
R
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
-
R
 
-
M
 
-
W
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
C
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
E
F
 
N
R
 
A
T
 
A
L
 
Y
R
 
W
Y
 
K
D
 
N
G
 
G
D
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
K
R
 
R
A
 
N
I
 
L
E
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
A
N
 
F
V
 
W
G
 
G
G
 
A
L
 
H
N
x
D
W
|
W
G
 
Q
S
 
P
V
 
M
S
 
S
V
 
Y
D
 
N
T
 
P
A
 
D
N
 
T
Q
 
G
R
 
L
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
N
 
P
D
 
A
I
 
H
R
 
I
V
 
M
P
 
S
S
 
A
V
 
Y
F
 
Y
Q
 
E
L
 
H
V
 
I
P
 
P
R
 
E
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
A
K
 
P
K
 
K
Y
 
R
P
 
N
P
 
P
V
 
F
S
 
K
D
 
S
G
 
M
H
 
Y
G
 
Q
P
 
L
S
 
G
T
 
L
Q
 
R
A
 
T
G
 
G
-
 
M
T
 
M
P
 
P
Y
 
E
G
 
G
I
 
A
Y
 
E
T
 
G
T
 
L
I
 
L
W
 
E
F
 
M
S
 
A
R
 
K
L
 
S
G
 
W
V
 
S
P
 
-
C
 
-
V
 
-
Q
 
-
P
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
A
I
 
W
D
 
D
L
 
P
K
 
V
T
 
K
R
 
Q
K
 
Q
V
 
A
A
 
A
W
 
W
Q
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
Y
G
 
V
T
 
T
A
 
I
E
x
F
Q
 
N
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
-
F
 
F
A
 
E
G
 
G
T
 
S
Q
 
A
D
 
D
F
 
G
Y
 
R
L
 
V
R
 
I
A
 
A
Y
 
Y
D
 
A
A
 
A
Q
 
D
T
 
T
G
 
G
A
 
E
E
 
K
V
 
L
W
 
W
K
 
E
H
 
Q
A
 
P
M
 
A
P
 
A
V
 
S
G
 
G
S
 
V
S
 
M
A
 
A
T
 
A
P
 
P
M
 
V
T
 
T
Y
 
Y
V
 
S
S
 
V
P
 
-
R
 
-
T
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
I
 
F
S
 
M
A
 
A
G
 
G
-
 
W
G
 
G
A
 
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Q4W6G0 Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADH-IIG; ADH IIG; Alcohol dehydrogenase (azurin); EC 1.1.9.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
27% identity, 79% coverage: 151:760/773 of query aligns to 45:573/718 of Q4W6G0

query
sites
Q4W6G0
D
|
D
N
x
K
R
x
E
P
|
P
V
x
G
D
x
N
W
|
W
S
x
M
A
x
S
Y
x
T
G
|
G
R
|
R
T
|
T
T
x
Y
E
x
D
G
x
E
R
x
Q
R
|
R
D
x
Y
A
x
S
P
|
P
F
x
L
D
x
K
Q
|
Q
I
|
I
N
x
S
R
x
D
E
x
Q
T
x
N
V
|
V
S
x
G
Q
|
Q
L
|
L
K
x
G
L
|
L
A
|
A
W
|
W
S
|
S
Y
|
Y
R
x
K
T
x
L
G
 
-
D
|
D
T
x
L
Q
x
D
P
x
R
G
|
G
V
|
V
D
x
E
Q
x
A
N
 
-
T
|
T
P
|
P
L
x
I
Q
x
V
I
x
V
G
x
D
D
x
G
L
x
A
V
x
M
Y
|
Y
S
x
T
C
x
T
T
x
G
R
x
P
N
x
F
D
x
S
K
x
V
L
x
V
I
x
Y
A
|
A
L
|
L
D
|
D
A
|
A
D
x
R
S
x
D
G
|
G
Q
x
R
E
x
L
R
x
I
W
|
W
V
x
K
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Q
|
Q
A
x
S
-
x
D
K
x
R
S
x
H
P
x
R
F
x
A
W
x
G
Q
x
E
R
x
A
C
|
C
-
x
C
-
x
D
-
x
A
-
x
V
-
x
N
R
|
R
G
|
G
L
x
V
G
x
A
Y
x
V
W
|
W
K
|
K
A
x
G
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
x
K
I
x
V
V
x
Y
Q
x
V
T
x
G
T
x
V
I
x
L
D
|
D
A
x
G
R
|
R
L
|
L
I
x
E
E
x
A
L
x
I
D
|
D
A
|
A
R
x
K
T
|
T
G
|
G
K
x
Q
P
x
R
C
x
A
E
x
W
E
x
S
F
x
V
G
x
D
D
x
T
K
x
R
G
x
A
T
x
D
V
x
H
S
x
K
L
x
R
A
x
S
H
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
|
Y
F
x
T
Q
x
I
T
|
T
S
x
G
A
|
A
P
|
P
L
x
R
V
|
V
A
x
V
R
x
N
D
x
G
L
x
K
I
x
V
V
|
V
V
x
I
G
|
G
G
x
N
W
x
G
V
x
G
V
x
A
D
x
E
N
x
F
Q
x
G
M
x
V
R
|
R
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
|
G
V
x
Y
I
x
V
R
x
T
A
|
A
F
x
Y
S
x
D
A
|
A
R
x
E
T
|
T
G
|
G
E
x
K
L
x
E
V
x
A
W
|
W
A
x
R
W
x
F
D
 
-
L
x
Y
G
x
T
N
x
V
P
|
P
D
x
G
I
x
D
T
x
P
K
|
K
L
|
L
P
|
P
P
|
P
E
|
E
G
|
G
Q
x
K
-
x
G
-
x
M
-
x
E
-
x
I
-
x
A
-
x
A
-
x
K
-
x
T
-
x
W
-
x
F
-
x
G
-
x
D
-
x
A
-
x
Y
T
x
V
Y
x
E
T
x
Q
P
x
G
G
|
G
T
x
G
P
x
G
N
x
T
M
x
A
W
|
W
T
x
D
T
x
S
A
x
F
A
|
A
Y
|
Y
D
|
D
D
x
P
K
x
E
L
|
L
G
x
N
L
|
L
I
x
L
Y
|
Y
A
x
I
P
x
G
L
x
V
G
|
G
N
|
N
A
x
G
T
x
S
-
x
L
-
x
W
-
x
D
P
|
P
D
x
K
Y
x
W
F
x
R
G
x
S
Q
|
Q
G
x
A
R
x
K
P
 
-
A
 
-
H
x
G
S
x
D
D
x
N
E
x
L
Y
x
F
N
x
L
A
x
S
T
x
S
L
x
I
V
|
V
A
|
A
L
x
V
D
x
N
V
x
A
A
x
D
T
|
T
G
|
G
R
x
E
P
x
Y
R
x
V
W
|
W
K
x
H
F
x
Y
Q
|
Q
T
|
T
V
x
T
H
x
P
H
x
G
D
|
D
I
x
A
W
|
W
D
|
D
Y
|
Y
D
x
T
L
x
A
P
x
T
S
x
Q
Q
x
H
P
x
M
A
x
I
L
|
L
I
x
A
D
x
E
L
|
L
P
|
P
-
x
I
D
|
D
G
|
G
K
|
K
G
x
P
G
x
R
T
x
K
V
|
V
P
 
-
A
 
-
V
x
L
L
x
M
Q
|
Q
T
x
A
T
x
P
K
|
K
R
x
N
G
|
G
Q
x
F
L
x
F
F
x
Y
L
x
V
L
x
I
D
|
D
R
|
R
A
|
A
T
|
T
G
|
G
Q
x
E
P
x
L
L
|
L
A
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
T
x
S
Q
x
A
E
x
K
G
|
G
A
x
I
V
|
V
P
|
P
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
|
Q
P
x
S
Y
x
W
S
x
T
V
x
K
G
|
G
M
|
M
P
x
D
-
x
M
T
x
K
V
x
T
G
|
G
A
x
R
E
x
P
R
x
I
L
|
L
D
|
D
E
|
E
R
 
-
R
 
-
M
 
-
W
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
C
 
-
R
 
-
I
 
-
E
|
E
F
x
N
R
x
A
T
x
A
L
x
Y
R
x
W
Y
x
K
D
x
N
G
|
G
D
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
x
K
R
|
R
A
x
N
I
x
L
E
x
V
H
x
T
P
|
P
G
x
A
N
x
F
V
x
W
G
|
G
G
x
A
L
x
H
N
x
D
W
|
W
G
x
Q
S
x
P
V
x
M
S
|
S
V
x
Y
D
x
N
T
x
P
A
x
D
N
x
T
Q
x
G
R
x
L
V
|
V
F
x
Y
L
x
I
N
x
P
D
x
A
I
x
H
R
x
I
V
x
M
P
x
S
S
x
A
V
x
Y
F
x
Y
Q
x
E
L
x
H
V
x
I
P
|
P
R
x
E
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
|
A
K
x
P
K
|
K
Y
x
R
P
x
N
P
|
P
V
x
F
S
x
K
D
x
S
G
x
M
H
x
Y
G
x
Q
P
x
L
S
x
G
T
x
L
Q
x
R
A
x
T
G
|
G
-
x
M
T
x
M
P
|
P
Y
x
E
G
|
G
I
x
A
Y
x
E
T
x
G
T
x
L
I
x
L
W
x
E
F
x
M
S
x
A
R
x
K
L
x
S
G
x
W
V
x
S
P
 
-
C
 
-
V
 
-
Q
 
-
P
 
-
P
 
-
F
 
-
G
|
G
T
x
K
L
|
L
T
x
I
A
|
A
I
x
W
D
|
D
L
x
P
K
x
V
T
x
K
R
x
Q
K
x
Q
V
x
A
A
|
A
W
|
W
Q
x
E
V
|
V
P
|
P
A
x
Y
G
x
V
T
|
T
A
x
I
E
x
F
Q
x
N
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
x
G
G
|
G
T
|
T
L
|
L
A
x
S
T
|
T
A
|
A
G
|
G
G
x
N
L
|
L
V
|
V
F
 
-
F
|
F
A
x
E
G
|
G
T
x
S
Q
x
A
D
|
D
F
x
G
Y
x
R
L
x
V
R
x
I
A
|
A
Y
|
Y
D
x
A
A
|
A
Q
x
D
T
|
T
G
|
G
A
x
E
E
x
K
V
x
L
W
|
W
K
x
E
H
x
Q
A
x
P
M
x
A
P
x
A
V
x
S
G
|
G
S
x
V
S
x
M
A
|
A
T
x
A
P
|
P
M
x
V
T
|
T
Y
|
Y
V
x
S
S
x
V
P
 
-
R
 
-
T
x
D
G
|
G
K
x
E
Q
|
Q
Y
|
Y
V
|
V
V
x
T
I
x
F
S
x
M
A
|
A
G
|
G
-
x
W
G
|
G
A
x
G
A
|
A
Y
x
F
S
|
S

Sites not aligning to the query:

1kb0A Crystal structure of quinohemoprotein alcohol dehydrogenase from comamonas testosteroni (see paper)
28% identity, 78% coverage: 153:755/773 of query aligns to 25:540/670 of 1kb0A

query
sites
1kb0A
R
 
R
P
 
T
V
 
P
D
 
D
W
 
W
S
 
P
A
 
T
Y
 
I
G
 
G
R
 
V
T
 
D
T
 
Y
E
 
A
G
 
E
R
 
T
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
R
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
A
E
 
A
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
D
L
 
L
K
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
Y
R
 
N
T
 
L
G
 
E
D
 
S
T
 
T
Q
 
R
P
 
-
G
 
G
V
 
V
D
x
E
Q
 
A
N
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
V
Q
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
L
 
I
V
 
M
Y
 
Y
S
 
V
C
 
S
T
 
A
R
 
S
N
 
W
D
 
S
K
 
V
L
 
V
I
 
H
A
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
T
D
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
N
E
 
R
R
 
I
W
 
W
V
 
T
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
A
 
I
-
 
D
K
 
R
S
 
S
P
 
T
F
 
G
W
 
F
Q
 
K
R
 
G
C
|
C
-
x
C
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
V
G
 
A
Y
 
L
W
 
W
K
 
K
A
 
G
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
K
I
 
V
V
 
Y
Q
 
V
T
 
G
T
 
A
I
 
W
D
 
D
A
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
E
F
 
V
G
 
W
D
 
H
K
 
Q
G
 
N
T
 
T
V
 
F
S
 
E
L
 
G
A
 
Q
H
 
K
G
 
G
M
 
S
G
 
L
T
 
T
V
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
T
|
T
S
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
R
V
 
V
A
 
F
R
 
K
D
 
G
L
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
N
W
x
G
V
x
G
V
x
A
D
x
E
N
 
Y
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
Y
I
 
I
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
A
R
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
R
V
 
K
W
 
W
A
 
R
W
 
W
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
G
D
 
D
L
 
P
G
 
S
N
 
K
P
 
P
-
 
F
D
 
E
I
 
D
T
 
E
K
 
S
L
 
M
P
 
K
P
 
R
E
 
A
G
 
A
Q
 
R
T
 
T
Y
 
W
T
 
D
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
W
-
 
W
-
 
E
-
 
A
-
 
G
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
M
W
|
W
T
 
D
T
 
S
A
 
M
A
 
T
Y
 
F
D
 
D
D
 
A
K
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
T
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
P
 
G
L
 
T
G
 
G
N
|
N
A
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
W
Y
 
S
F
 
H
G
 
K
Q
 
V
G
 
R
R
 
S
P
 
P
A
 
K
H
 
G
S
 
G
D
 
D
E
 
N
-
 
L
Y
 
Y
N
 
L
A
 
A
T
 
S
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
Y
R
 
K
W
 
W
K
 
H
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
E
V
 
T
H
 
P
H
 
G
D
 
D
I
 
N
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
-
L
 
T
P
 
S
S
 
T
Q
 
Q
P
 
P
A
 
M
L
 
I
I
 
L
D
 
A
L
 
D
P
 
I
D
 
K
G
 
I
K
 
A
G
 
G
G
 
K
T
 
P
V
 
R
P
 
K
A
 
V
V
 
I
L
 
L
Q
 
H
T
 
A
T
 
P
K
|
K
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
F
F
 
F
L
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
T
T
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
F
L
 
I
A
 
S
E
 
A
V
 
K
A
 
N
E
 
F
K
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
N
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
M
 
-
W
 
W
G
 
-
M
 
A
T
 
S
M
 
G
F
 
Y
D
 
D
Q
 
K
L
 
H
L
 
G
C
 
K
R
 
P
I
 
I
E
 
G
F
 
I
R
 
A
T
 
A
L
 
A
R
 
R
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
G
T
 
S
P
 
K
P
 
P
G
 
-
L
 
-
Q
 
Q
R
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
G
N
x
P
V
 
Y
G
 
G
G
 
A
L
 
H
N
|
N
W
|
W
G
 
H
S
 
P
V
 
M
S
 
S
V
 
F
D
 
N
T
 
P
A
 
Q
N
 
T
Q
 
G
R
 
L
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
N
 
P
D
 
A
I
 
Q
R
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
V
V
 
N
F
 
L
Q
 
M
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
D
D
 
D
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
K
K
 
K
Y
 
W
P
 
E
P
 
F
V
 
N
S
 
Q
D
 
A
G
 
G
H
 
P
G
 
G
P
 
-
S
 
K
T
 
P
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
T
P
 
-
Y
 
-
G
 
G
I
 
W
Y
 
N
T
 
T
T
 
A
I
 
K
W
 
F
F
 
F
S
 
N
R
 
-
L
 
-
G
 
A
V
 
E
P
 
P
C
 
P
V
 
K
Q
 
S
P
 
K
P
 
P
F
 
F
G
 
G
T
 
R
L
 
L
T
 
L
A
 
A
I
 
W
D
 
D
L
 
P
K
 
V
T
 
A
R
 
Q
K
 
K
V
 
A
A
 
A
W
 
W
Q
 
S
V
 
V
P
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
E
Q
 
H
L
 
V
G
 
S
P
 
P
L
x
W
G
 
N
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
T
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
L
 
V
V
 
V
F
 
-
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
T
 
T
Q
 
A
D
 
D
F
 
G
Y
 
R
L
 
L
R
 
V
A
 
A
Y
 
Y
D
 
H
A
 
A
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
E
E
 
K
V
 
L
W
 
W
K
 
E
H
 
A
A
 
P
M
 
T
P
 
G
V
 
T
G
 
G
S
 
V
S
 
V
A
 
A
T
 
A
P
 
P
M
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
M
S
 
V
P
 
-
R
 
-
T
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
V
 
S
I
 
V
S
 
A
A
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q8GR64 Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADH IIB; ADH IIB; Alcohol dehydrogenase (azurin); EC 1.1.9.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 3 papers)
27% identity, 78% coverage: 156:755/773 of query aligns to 39:543/690 of Q8GR64

query
sites
Q8GR64
D
x
E
W
|
W
S
x
L
A
x
S
Y
x
H
G
|
G
R
|
R
T
|
T
T
x
Y
E
x
A
G
x
E
R
x
Q
R
|
R
D
x
F
A
x
S
P
|
P
F
x
L
D
x
K
Q
|
Q
I
|
I
N
x
D
R
x
A
E
x
S
T
x
N
V
|
V
S
x
R
Q
x
S
L
|
L
K
x
G
L
|
L
A
|
A
W
|
W
S
 
-
Y
|
Y
R
x
M
T
x
D
G
x
L
D
|
D
T
x
N
Q
x
T
P
x
R
G
|
G
V
x
L
D
x
E
Q
x
A
N
 
-
T
|
T
P
|
P
L
|
L
Q
x
F
I
x
H
G
x
D
D
x
G
L
x
V
V
x
I
Y
|
Y
S
x
T
C
x
S
T
x
M
R
x
S
N
x
W
D
x
S
K
x
R
L
x
V
I
|
I
A
|
A
L
x
V
D
|
D
A
|
A
D
x
A
S
|
S
G
|
G
Q
x
K
E
|
E
R
x
L
W
|
W
V
x
R
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Q
x
E
-
x
V
A
|
A
K
|
K
S
x
V
P
x
K
F
x
A
W
x
R
Q
x
T
R
x
S
C
|
C
-
x
C
-
x
D
-
x
A
-
x
V
-
x
N
R
|
R
G
|
G
L
x
V
G
x
A
Y
x
L
W
|
W
K
x
G
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
x
D
R
x
K
I
x
V
V
x
Y
Q
x
V
T
x
G
T
|
T
I
x
L
D
|
D
A
x
G
R
|
R
L
|
L
I
|
I
E
x
A
L
|
L
D
|
D
A
|
A
R
x
K
T
|
T
G
|
G
K
|
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
T
x
A
V
x
I
S
x
W
L
x
S
A
x
Q
H
x
Q
G
x
T
M
x
T
G
x
D
T
x
P
V
x
A
R
x
K
P
|
P
G
 
-
F
 
-
Y
|
Y
F
x
S
Q
x
I
T
|
T
S
x
G
A
|
A
P
|
P
L
x
R
V
|
V
A
x
V
R
x
K
D
x
G
L
x
K
I
x
V
V
x
I
V
x
I
G
|
G
G
x
N
W
x
G
V
x
G
V
x
A
D
x
E
N
x
Y
Q
x
G
M
x
V
R
|
R
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
|
G
V
x
F
I
x
V
R
x
S
A
|
A
F
x
Y
S
x
D
A
|
A
R
x
D
T
|
T
G
|
G
E
x
K
L
|
L
V
x
A
W
|
W
A
x
R
W
x
F
D
x
Y
L
x
T
-
x
V
-
x
P
G
|
G
N
x
D
P
|
P
D
x
A
I
x
L
T
x
P
K
x
Y
L
x
E
P
x
H
P
|
P
E
|
E
-
x
L
-
x
R
-
x
E
-
x
A
-
x
A
-
x
K
-
x
T
-
x
W
-
x
Q
G
|
G
Q
x
D
T
x
Q
Y
|
Y
-
x
W
-
x
K
T
x
L
P
x
G
G
|
G
T
x
G
P
x
G
N
x
T
M
x
V
W
|
W
T
x
D
T
x
S
A
x
M
A
|
A
Y
|
Y
D
|
D
D
x
P
K
x
E
L
|
L
G
x
D
L
|
L
I
x
L
Y
|
Y
A
x
V
P
x
G
L
x
T
G
|
G
N
|
N
A
x
G
T
x
S
P
|
P
D
x
W
Y
x
N
F
x
R
G
x
E
Q
x
V
G
x
R
R
x
S
P
|
P
A
x
G
H
x
G
S
x
G
D
|
D
E
x
N
-
x
L
Y
|
Y
N
x
L
A
x
S
T
x
S
L
x
I
V
x
L
A
|
A
L
x
I
D
x
R
V
x
P
A
x
D
T
|
T
G
|
G
R
x
K
P
x
L
R
x
A
W
|
W
K
x
H
F
x
Y
Q
|
Q
T
x
V
V
x
T
H
x
P
H
x
G
D
|
D
I
x
S
W
|
W
D
|
D
Y
x
F
D
x
T
L
x
A
P
x
T
S
x
Q
Q
|
Q
P
x
I
A
x
T
L
|
L
I
x
A
D
x
E
L
|
L
P
x
N
-
x
I
D
|
D
G
|
G
K
|
K
G
x
P
G
x
R
T
x
K
V
|
V
P
 
-
A
 
-
V
x
L
L
x
M
Q
|
Q
T
x
A
T
x
P
K
|
K
R
x
N
G
|
G
Q
x
F
L
x
F
F
x
Y
L
x
V
L
|
L
D
|
D
R
|
R
A
x
T
T
x
N
G
|
G
Q
x
K
P
x
L
L
x
I
A
x
S
E
x
A
V
x
E
A
x
K
E
x
F
K
x
G
P
x
K
V
|
V
T
|
T
Q
x
W
E
x
A
G
x
E
A
x
K
V
|
V
P
x
D
E
x
L
E
x
A
T
|
T
L
x
G
S
x
R
P
|
P
T
x
V
Q
x
E
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
M
x
A
P
|
P
T
x
G
V
|
V
G
x
R
A
x
Y
E
|
E
R
x
K
L
 
-
D
x
E
E
x
P
R
x
I
R
x
V
M
|
M
W
|
W
G
 
-
M
 
-
T
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
C
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
P
|
P
G
x
S
N
x
P
V
x
F
G
|
G
G
x
A
L
x
H
N
|
N
W
|
W
G
x
H
S
|
S
V
x
M
S
|
S
V
x
F
D
x
N
T
x
P
A
x
G
N
x
T
Q
x
G
R
x
L
V
|
V
F
x
Y
L
x
I
N
x
P
D
x
Y
I
x
Q
R
x
E
V
|
V
P
|
P
S
x
G
V
|
V
F
x
Y
Q
x
R
L
x
N
V
x
E
P
x
G
R
x
K
D
|
D
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
x
F
F
x
V
A
x
T
K
x
R
K
|
K
Y
x
A
P
x
F
P
x
N
V
x
T
S
x
A
D
x
A
G
|
G
H
x
F
G
x
A
P
x
D
S
x
A
T
|
T
Q
x
D
A
 
-
G
 
-
T
x
V
P
|
P
Y
x
A
G
x
A
I
x
V
Y
x
V
T
x
S
T
 
-
I
 
-
W
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
C
 
-
V
 
-
Q
 
-
P
 
-
P
 
-
F
 
-
G
|
G
T
x
A
L
|
L
T
x
L
A
|
A
I
x
W
D
|
D
L
x
P
K
x
V
T
x
K
R
x
Q
K
|
K
V
x
A
A
|
A
W
|
W
Q
x
K
V
|
V
P
|
P
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
x
Y
P
|
P
T
|
T
Y
x
H
-
x
W
-
x
N
A
x
G
G
|
G
T
|
T
L
|
L
A
x
S
T
|
T
A
|
A
G
|
G
G
x
N
L
|
L
V
|
V
F
 
-
F
|
F
A
x
Q
G
|
G
T
|
T
Q
x
A
D
x
A
F
x
G
Y
x
Q
L
x
M
R
x
H
A
|
A
Y
|
Y
D
x
S
A
|
A
Q
x
D
T
x
K
G
|
G
A
x
E
E
x
A
V
x
L
W
|
W
K
x
Q
H
x
F
A
x
E
M
x
A
P
x
Q
V
x
S
G
|
G
S
x
I
S
x
V
A
|
A
T
x
A
P
|
P
M
|
M
T
|
T
Y
x
F
V
 
-
S
 
-
P
x
E
R
x
L
T
x
A
G
|
G
K
x
R
Q
|
Q
Y
|
Y
V
|
V
V
x
A
I
|
I
S
x
M
A
|
A
G
|
G

Sites not aligning to the query:

1kv9A Structure at 1.9 a resolution of a quinohemoprotein alcohol dehydrogenase from pseudomonas putida hk5 (see paper)
27% identity, 78% coverage: 156:755/773 of query aligns to 17:521/664 of 1kv9A

query
sites
1kv9A
D
 
E
W
 
W
S
 
L
A
 
S
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
T
 
Y
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
R
 
R
D
 
F
A
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
D
R
 
A
E
 
S
T
 
N
V
 
V
S
 
R
Q
 
S
L
 
L
K
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
-
Y
 
Y
R
 
M
T
 
D
G
 
L
D
 
D
T
 
N
Q
 
T
P
 
R
G
 
G
V
 
L
D
x
E
Q
 
A
N
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Q
 
F
I
 
H
G
 
D
D
 
G
L
 
V
V
 
I
Y
 
Y
S
 
T
C
 
S
T
 
M
R
 
S
N
 
W
D
 
S
K
 
R
L
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
E
 
E
R
 
L
W
 
W
V
 
R
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
-
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
V
P
 
K
F
x
A
W
x
R
Q
 
T
R
 
S
C
|
C
-
x
C
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
V
G
 
A
Y
 
L
W
 
W
K
 
G
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
D
R
 
K
I
 
V
V
 
Y
Q
 
V
T
 
G
T
 
T
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
A
V
 
I
S
 
W
L
 
S
A
 
Q
H
 
Q
G
 
T
M
 
T
G
 
D
T
 
P
V
 
A
R
 
K
P
 
P
G
 
-
F
 
-
Y
 
Y
F
 
S
Q
 
I
T
|
T
S
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
R
V
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
G
L
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
N
W
x
G
V
 
G
V
x
A
D
x
E
N
 
Y
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
F
I
 
V
R
 
S
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
A
R
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
L
V
 
A
W
 
W
A
 
R
W
 
F
D
 
Y
L
 
T
-
 
V
-
 
P
G
 
G
N
 
D
P
 
P
D
 
A
I
 
L
T
 
P
K
 
Y
L
 
E
P
 
H
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
W
-
 
Q
G
 
G
Q
 
D
T
 
Q
Y
 
Y
-
 
W
-
 
K
T
 
L
P
 
G
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
V
W
|
W
T
 
D
T
 
S
A
 
M
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
V
P
 
G
L
 
T
G
 
G
N
|
N
A
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
W
Y
 
N
F
 
R
G
 
E
Q
 
V
G
 
R
R
 
S
P
 
P
A
 
G
H
 
G
S
 
G
D
 
D
E
 
N
-
 
L
Y
 
Y
N
 
L
A
 
S
T
 
S
L
 
I
V
 
L
A
 
A
L
 
I
D
 
R
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
L
R
 
A
W
 
W
K
 
H
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
V
V
 
T
H
 
P
H
 
G
D
 
D
I
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
T
L
 
A
P
 
T
S
 
Q
Q
 
Q
P
 
I
A
 
T
L
 
L
I
 
A
D
 
E
L
 
L
P
 
N
-
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
P
G
 
R
T
 
K
V
 
V
P
 
-
A
 
-
V
 
L
L
 
M
Q
 
Q
T
 
A
T
 
P
K
|
K
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
F
F
 
Y
L
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
T
T
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
L
L
 
I
A
 
S
E
 
A
V
 
E
A
 
K
E
 
F
K
 
G
P
 
K
V
 
V
T
 
T
Q
 
W
E
 
A
G
 
E
A
 
K
V
 
V
P
 
D
E
 
L
E
 
A
T
 
T
L
 
G
S
 
R
P
 
P
T
 
V
Q
 
E
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
V
G
 
R
A
 
Y
E
 
E
R
 
K
L
 
-
D
 
E
E
 
P
R
 
I
R
 
V
M
 
M
W
 
W
G
 
-
M
 
-
T
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
C
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
S
N
 
P
V
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
H
N
|
N
W
|
W
G
 
H
S
 
S
V
 
M
S
 
S
V
 
F
D
 
N
T
 
P
A
 
G
N
 
T
Q
 
G
R
 
L
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
N
 
P
D
 
Y
I
 
Q
R
 
E
V
 
V
P
 
P
S
 
G
V
 
V
F
 
Y
Q
 
R
L
 
N
V
 
E
P
 
G
R
 
K
D
 
D
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
F
F
 
V
A
 
T
K
 
R
K
 
K
Y
 
A
P
 
F
P
 
N
V
 
T
S
 
A
D
 
A
G
 
G
H
 
F
G
 
A
P
 
D
S
 
A
T
 
T
Q
 
D
A
 
-
G
 
-
T
 
V
P
 
P
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
V
T
 
S
T
 
-
I
 
-
W
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
C
 
-
V
 
-
Q
 
-
P
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
T
 
A
L
 
L
T
 
L
A
 
A
I
 
W
D
 
D
L
 
P
K
 
V
T
 
K
R
 
Q
K
 
K
V
 
A
A
 
A
W
 
W
Q
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
Y
P
 
P
T
 
T
Y
 
H
-
x
W
-
 
N
A
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
-
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
T
 
T
Q
 
A
D
 
A
F
 
G
Y
 
Q
L
 
M
R
 
H
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
A
Q
 
D
T
 
K
G
 
G
A
 
E
E
 
A
V
 
L
W
 
W
K
 
Q
H
 
F
A
 
E
M
 
A
P
 
Q
V
 
S
G
 
G
S
 
I
S
 
V
A
 
A
T
 
A
P
 
P
M
 
M
T
 
T
Y
 
F
V
 
-
S
 
-
P
 
E
R
 
L
T
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
V
 
A
I
 
I
S
 
M
A
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

O05542 Alcohol dehydrogenase (quinone), dehydrogenase subunit; ADH; Alcohol dehydrogenase (quinone), acceptor subunit; Alcohol dehydrogenase (quinone), subunit I; Ethanol:Q2 reductase; G3-ADH subunit I; Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase; Quinohemoprotein-cytochrome c complex; Ubiquinol oxidase; EC 1.1.5.5 from Gluconobacter oxydans (strain 621H) (Gluconobacter suboxydans) (see paper)
25% identity, 81% coverage: 132:755/773 of query aligns to 29:584/757 of O05542

query
sites
O05542
M
x
V
P
|
P
H
x
V
G
x
A
V
x
F
V
x
A
R
x
Q
P
 
E
D
 
D
A
 
T
S
 
G
M
 
T
A
 
A
Y
 
I
T
 
T
P
 
S
P
 
S
G
 
D
G
 
N
D
 
G
N
 
G
R
 
H
P
 
P
V
 
G
D
 
D
W
 
W
S
 
L
A
 
S
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
S
T
 
Y
E
 
S
G
 
E
R
 
Q
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
E
T
 
N
V
 
V
S
 
G
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
H
Y
 
Y
R
 
D
T
 
L
G
 
-
D
 
D
T
 
T
Q
 
N
P
 
R
G
 
G
V
 
-
D
 
Q
Q
 
E
N
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Q
 
I
I
 
V
G
 
N
D
 
G
L
 
V
V
 
M
Y
 
Y
S
 
A
C
 
T
T
 
T
R
 
N
N
 
W
D
 
S
K
 
K
L
 
M
I
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
A
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
E
 
L
R
 
L
W
 
W
V
 
S
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
K
 
P
S
 
G
P
 
N
F
 
I
W
 
A
Q
 
D
R
 
R
-
 
G
-
 
C
-
 
C
-
 
D
-
 
T
-
 
V
C
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
A
G
 
A
Y
 
Y
W
 
W
K
 
N
A
 
G
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
K
I
 
V
V
 
Y
Q
 
F
T
 
G
T
 
T
I
 
F
D
 
D
A
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
L
C
 
V
E
 
W
E
 
S
F
 
V
G
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
Y
T
 
T
V
 
I
S
 
P
L
 
K
A
 
E
H
 
A
G
 
Q
M
 
L
G
 
G
T
 
H
V
 
Q
R
 
R
P
 
S
G
 
-
F
 
-
Y
 
Y
F
 
T
Q
 
V
T
 
D
S
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
K
D
 
G
L
 
K
I
 
V
V
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
N
W
 
G
V
 
G
V
 
A
D
 
E
N
 
F
Q
 
G
M
 
A
R
 
R
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
F
I
 
V
R
 
S
A
 
A
F
 
F
S
 
D
A
 
A
R
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
L
V
 
D
W
 
W
A
 
R
-
 
F
W
 
F
D
 
T
L
 
V
G
 
P
N
 
N
P
 
P
D
 
E
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
L
I
 
M
T
 
S
K
 
K
L
 
A
P
 
Y
P
 
P
E
 
T
-
 
W
G
 
G
Q
 
K
T
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
W
-
 
K
Y
 
Q
T
 
Q
P
 
G
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
 
T
M
 
V
W
 
W
T
 
D
T
 
S
A
 
L
A
 
V
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
V
L
 
T
G
 
D
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
A
 
L
P
 
G
L
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
G
T
 
S
P
 
P
-
 
W
D
 
N
Y
 
Y
F
 
K
G
 
F
Q
 
R
G
 
S
R
 
E
P
 
G
A
 
K
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
L
Y
 
F
N
 
L
A
 
G
T
 
S
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
I
D
 
N
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
Y
R
 
V
W
 
W
K
 
H
F
 
F
Q
 
Q
T
 
E
V
 
T
H
 
P
H
 
M
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
 
D
Y
 
Y
D
 
T
L
 
S
P
 
V
S
 
Q
Q
 
Q
P
 
I
A
 
M
L
 
T
I
 
L
D
 
D
L
 
M
P
 
P
D
 
V
G
 
-
K
 
N
G
 
G
G
 
E
T
 
M
V
 
R
P
 
H
A
 
V
V
 
I
L
 
V
Q
 
H
T
 
A
T
 
P
K
 
K
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
F
F
 
Y
L
 
I
L
 
I
D
 
D
R
 
A
A
 
K
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
F
V
 
I
A
 
T
E
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
Y
T
 
T
Q
 
Y
E
 
E
G
 
N
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
W
S
 
A
V
 
N
G
 
G
M
 
L
-
 
D
P
 
P
T
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
R
E
 
P
R
 
N
L
 
Y
D
 
V
E
 
P
R
 
D
R
 
A
M
 
L
W
 
W
G
 
T
M
 
L
T
 
T
M
 
G
F
 
K
D
 
P
Q
 
W
L
 
L
L
 
G
C
 
I
R
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
G
N
 
E
V
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
H
N
 
N
W
 
F
G
 
A
S
 
A
V
 
M
S
 
A
V
 
Y
D
 
S
T
 
P
A
 
K
N
 
T
Q
 
K
R
 
L
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
N
 
P
D
 
A
I
 
Q
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
S
 
L
V
 
L
F
 
Y
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
D
G
 
G
H
 
Q
G
 
K
P
 
G
S
 
G
T
 
F
Q
 
K
A
 
A
G
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
Y
T
 
H
T
 
D
I
 
A
W
 
W
-
 
N
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
D
F
 
M
S
 
N
R
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
L
P
 
F
C
 
D
V
 
D
Q
 
N
P
 
D
P
 
P
F
 
E
G
 
H
T
 
V
L
 
A
T
 
A
A
 
K
I
 
K
D
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
G
R
 
W
K
 
T
V
 
V
A
 
A
W
 
W
Q
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
M
V
 
A
P
 
P
A
 
A
G
 
F
T
 
T
A
 
I
E
 
N
Q
 
H
L
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
W
G
 
N
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
G
G
 
G
T
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
L
 
V
V
 
I
F
 
-
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
T
 
L
Q
 
A
D
 
N
F
 
G
Y
 
E
L
 
F
R
 
H
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
T
T
 
N
G
 
G
A
 
N
E
 
D
V
 
L
W
 
Y
K
 
S
H
 
F
A
 
P
M
 
A
P
 
Q
V
 
S
G
 
A
S
 
I
S
 
I
A
 
A
T
 
P
P
 
P
M
 
V
T
 
T
Y
 
Y
V
 
T
S
 
A
P
 
-
R
 
-
T
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
V
 
A
I
 
V
S
 
E
A
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8gy2A Cryo-em structure of membrane-bound alcohol dehydrogenase from gluconobacter oxydans
25% identity, 80% coverage: 138:755/773 of query aligns to 1:550/723 of 8gy2A

query
sites
8gy2A
R
 
Q
P
 
E
D
 
D
A
 
T
S
 
G
M
 
T
A
 
A
Y
 
I
T
 
T
P
 
S
P
 
S
G
 
D
G
 
N
D
 
G
N
 
G
R
 
H
P
 
P
V
 
G
D
 
D
W
 
W
S
 
L
A
 
S
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
S
T
 
Y
E
 
S
G
 
E
R
 
Q
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
E
T
 
N
V
 
V
S
 
G
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
H
Y
 
Y
R
 
D
T
 
L
G
 
-
D
 
D
T
 
T
Q
 
N
P
 
R
G
 
G
V
 
-
D
 
Q
Q
 
E
N
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Q
 
I
I
 
V
G
 
N
D
 
G
L
 
V
V
 
M
Y
 
Y
S
 
A
C
 
T
T
 
T
R
 
N
N
 
W
D
 
S
K
 
K
L
 
M
I
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
A
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
E
 
L
R
 
L
W
 
W
V
 
S
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
K
 
P
S
 
G
P
 
N
F
 
I
W
 
A
Q
x
D
R
 
R
-
 
G
-
x
C
-
x
C
-
 
D
-
 
T
-
 
V
C
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
A
G
 
A
Y
 
Y
W
 
W
K
 
N
A
 
G
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
K
I
 
V
V
 
Y
Q
 
F
T
 
G
T
 
T
I
 
F
D
 
D
A
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
L
C
 
V
E
 
W
E
 
S
F
 
V
G
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
Y
T
 
T
V
 
I
S
 
P
L
 
K
A
 
E
H
 
A
G
 
Q
M
 
L
G
 
G
T
 
H
V
 
Q
R
 
R
P
 
S
G
 
-
F
 
-
Y
 
Y
F
 
T
Q
 
V
T
x
D
S
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
K
D
 
G
L
 
K
I
 
V
V
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
N
W
 
G
V
x
G
V
x
A
D
x
E
N
 
F
Q
 
G
M
 
A
R
 
R
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
F
I
 
V
R
 
S
A
 
A
F
 
F
S
 
D
A
 
A
R
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
L
V
 
D
W
 
W
A
 
R
-
 
F
W
 
F
D
 
T
L
 
V
G
 
P
N
 
N
P
 
P
D
 
E
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
L
I
 
M
T
 
S
K
 
K
L
 
A
P
 
Y
P
 
P
E
 
T
-
 
W
G
 
G
Q
 
K
T
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
W
-
 
K
Y
 
Q
T
 
Q
P
 
G
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
 
T
M
 
V
W
|
W
T
 
D
T
 
S
A
 
L
A
 
V
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
V
L
 
T
G
 
D
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
A
 
L
P
 
G
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
G
T
 
S
P
 
P
-
 
W
D
 
N
Y
 
Y
F
 
K
G
 
F
Q
 
R
G
 
S
R
 
E
P
 
G
A
 
K
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
L
Y
 
F
N
 
L
A
 
G
T
 
S
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
I
D
 
N
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
Y
R
 
V
W
 
W
K
 
H
F
 
F
Q
 
Q
T
 
E
V
 
T
H
 
P
H
 
M
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
T
L
 
S
P
 
V
S
 
Q
Q
 
Q
P
 
I
A
 
M
L
 
T
I
 
L
D
 
D
L
 
M
P
 
P
D
 
V
G
 
-
K
 
N
G
 
G
G
 
E
T
 
M
V
 
R
P
 
H
A
 
V
V
 
I
L
 
V
Q
 
H
T
 
A
T
 
P
K
|
K
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
F
F
 
Y
L
 
I
L
 
I
D
 
D
R
 
A
A
 
K
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
F
V
 
I
A
 
T
E
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
Y
T
 
T
Q
 
Y
E
 
E
G
 
N
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
W
S
 
A
V
 
N
G
 
G
M
 
L
-
 
D
P
 
P
T
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
R
E
 
P
R
 
N
L
 
Y
D
 
V
E
 
P
R
 
D
R
 
A
M
 
L
W
 
W
G
 
T
M
 
L
T
 
T
M
 
G
F
 
K
D
 
P
Q
 
W
L
 
L
L
 
G
C
 
I
R
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
G
N
 
E
V
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
H
N
 
N
W
x
F
G
 
A
S
 
A
V
 
M
S
 
A
V
 
Y
D
 
S
T
 
P
A
 
K
N
 
T
Q
 
K
R
 
L
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
N
 
P
D
 
A
I
 
Q
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
S
 
L
V
 
L
F
 
Y
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
D
G
 
G
H
 
Q
G
 
K
P
 
G
S
 
G
T
 
F
Q
 
K
A
 
A
G
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
Y
T
 
H
T
 
D
I
 
A
W
 
W
-
 
N
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
D
F
 
M
S
 
N
R
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
L
P
 
F
C
 
D
V
 
D
Q
 
N
P
 
D
P
 
P
F
 
E
G
 
H
T
 
V
L
 
A
T
 
A
A
 
K
I
 
K
D
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
G
R
 
W
K
 
T
V
 
V
A
 
A
W
 
W
Q
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
M
V
 
A
P
 
P
A
 
A
G
 
F
T
 
T
A
 
I
E
 
N
Q
 
H
L
 
K
G
 
G
P
 
P
L
x
W
G
 
N
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
G
G
 
G
T
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
L
 
V
V
 
I
F
 
-
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
T
 
L
Q
 
A
D
 
N
F
 
G
Y
 
E
L
 
F
R
 
H
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
T
T
 
N
G
 
G
A
 
N
E
 
D
V
 
L
W
 
Y
K
 
S
H
 
F
A
 
P
M
 
A
P
 
Q
V
 
S
G
 
A
S
 
I
S
 
I
A
 
A
T
 
P
P
 
P
M
 
V
T
 
T
Y
 
Y
V
 
T
S
 
A
P
 
-
R
 
-
T
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
V
 
A
I
 
V
S
 
E
A
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7o6zB Structure of a neodymium-containing, xoxf1-type methanol dehydrogenase (see paper)
25% identity, 78% coverage: 153:755/773 of query aligns to 10:541/588 of 7o6zB

query
sites
7o6zB
R
 
N
P
 
P
V
 
K
D
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
R
 
K
T
 
D
T
 
Y
E
 
A
G
 
N
R
 
T
R
 
R
D
 
H
A
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
Q
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
G
L
 
L
K
 
H
L
 
M
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
L
Q
 
R
P
 
G
G
 
H
V
x
E
D
 
G
Q
 
Q
N
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
R
V
 
M
Y
 
Y
S
 
V
C
 
V
T
 
T
R
 
P
N
 
Y
D
 
P
K
 
N
L
 
I
I
 
V
-
 
W
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
I
D
 
S
S
 
K
G
 
G
Q
 
N
E
 
S
R
 
Y
W
 
E
V
 
V
F
 
L
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
P
 
-
F
 
-
W
 
-
Q
 
-
R
 
-
C
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
W
 
W
K
 
K
-
 
Y
A
 
A
P
 
P
Q
 
R
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
A
 
K
A
 
A
P
 
V
E
 
S
G
 
T
A
 
A
C
|
C
R
x
C
E
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
N
-
x
R
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
V
Q
 
F
T
 
N
T
 
T
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
Y
L
 
V
I
 
V
E
 
C
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
E
C
 
L
-
 
W
-
 
K
E
 
T
E
 
K
F
 
F
G
 
A
D
 
D
-
 
V
-
 
N
K
 
K
G
 
G
T
 
E
V
 
T
S
 
S
L
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
T
|
T
S
 
P
A
 
A
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
T
G
 
G
G
 
Y
W
x
G
V
x
G
V
x
D
D
x
E
N
 
F
Q
 
G
M
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
R
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
F
R
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
D
A
 
L
R
 
N
T
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
A
 
Q
W
 
A
D
 
Y
L
 
S
G
 
N
N
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
N
T
 
S
K
 
K
L
 
H
P
 
P
P
 
E
E
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
E
Y
 
W
T
 
K
P
 
R
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
 
C
M
 
A
W
|
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
K
L
 
L
G
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
P
 
N
L
 
T
G
 
G
N
|
N
A
 
P
-
 
G
-
 
L
-
x
W
T
 
S
P
 
P
D
 
S
Y
 
Y
F
 
R
G
 
T
Q
 
E
G
 
A
R
 
K
P
 
T
A
 
H
H
 
E
S
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
W
-
 
K
-
 
W
-
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
M
T
 
T
L
 
I
V
 
F
A
 
A
L
 
R
D
 
K
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
E
P
 
A
R
 
V
W
 
W
K
 
G
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
V
 
T
H
 
P
H
 
F
D
 
D
I
 
Q
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
L
 
G
P
 
I
S
 
N
Q
 
E
P
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
T
D
 
-
G
 
V
K
 
D
G
 
G
G
 
S
T
 
K
V
 
K
P
 
P
A
 
C
V
 
L
L
 
V
Q
 
H
T
 
F
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
C
F
 
Y
L
 
V
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
T
T
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
I
L
 
I
A
 
R
E
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
N
K
 
K
P
 
F
V
 
V
T
 
T
Q
 
V
E
 
N
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
W
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
I
D
 
D
E
 
M
R
 
K
R
 
T
M
 
G
W
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
C
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
R
T
 
P
L
 
V
R
 
K
Y
 
V
D
 
K
G
 
-
D
 
E
F
 
H
T
 
S
P
 
P
P
 
F
G
 
E
L
 
V
Q
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
-
 
A
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
N
 
A
V
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
K
N
x
D
W
 
Q
G
 
Q
S
 
P
V
 
V
S
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
A
 
-
N
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
K
V
 
E
P
 
P
S
 
N
V
 
V
F
 
F
Q
 
-
L
 
Y
V
 
A
P
 
P
R
 
T
D
 
N
D
 
N
Y
 
W
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
G
K
 
M
K
 
T
Y
 
L
P
 
E
P
 
P
V
 
M
S
 
E
D
 
R
G
 
A
H
 
H
G
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
T
Q
 
N
A
 
Q
G
 
G
T
 
S
P
 
V
Y
 
Y
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
V
W
 
F
F
 
A
S
 
N
R
 
V
L
 
L
G
 
M
V
 
K
P
 
P
C
 
E
V
 
K
Q
 
P
P
 
G
P
 
V
F
 
M
G
 
G
T
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
A
I
 
F
D
 
D
L
 
V
K
 
I
T
 
T
R
 
G
K
 
K
V
 
A
A
 
R
W
 
W
Q
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
E
G
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
Y
x
W
A
 
S
G
 
G
T
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
T
A
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
F
F
 
Y
A
 
-
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
D
 
D
F
 
G
Y
 
W
L
 
F
R
 
K
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
R
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
A
 
K
E
 
V
V
 
L
W
 
W
K
 
Q
H
 
Q
A
 
K
M
 
L
P
 
G
V
 
S
G
 
G
S
 
I
S
 
I
A
 
G
T
 
N
P
 
P
M
 
I
T
 
S
Y
 
Y
V
 
-
S
 
-
P
 
E
R
 
V
T
 
G
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
V
 
S
I
 
V
S
 
L
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7o6zA Structure of a neodymium-containing, xoxf1-type methanol dehydrogenase (see paper)
25% identity, 78% coverage: 153:755/773 of query aligns to 10:541/588 of 7o6zA

query
sites
7o6zA
R
 
N
P
 
P
V
 
K
D
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
R
 
K
T
 
D
T
 
Y
E
 
A
G
 
N
R
 
T
R
 
R
D
 
H
A
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
Q
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
G
L
 
L
K
 
H
L
 
M
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
L
Q
 
R
P
 
G
G
 
H
V
 
E
D
 
G
Q
 
Q
N
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
R
V
 
M
Y
 
Y
S
 
V
C
 
V
T
 
T
R
 
P
N
 
Y
D
 
P
K
 
N
L
 
I
I
 
V
-
 
W
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
I
D
 
S
S
 
K
G
 
G
Q
 
N
E
 
S
R
 
Y
W
 
E
V
 
V
F
 
L
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
P
 
-
F
 
-
W
 
-
Q
 
-
R
 
-
C
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
W
 
W
K
 
K
-
 
Y
A
 
A
P
 
P
Q
 
R
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
A
 
K
A
 
A
P
 
V
E
 
S
G
 
T
A
 
A
C
 
C
R
 
C
E
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
N
-
 
R
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
V
Q
 
F
T
 
N
T
 
T
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
Y
L
 
V
I
 
V
E
 
C
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
E
C
 
L
-
 
W
-
 
K
E
 
T
E
 
K
F
 
F
G
 
A
D
 
D
-
 
V
-
 
N
K
 
K
G
 
G
T
 
E
V
 
T
S
 
S
L
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
T
 
T
S
 
P
A
 
A
P
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
T
G
 
G
G
 
Y
W
 
G
V
 
G
V
 
D
D
x
E
N
 
F
Q
 
G
M
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
R
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
F
R
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
D
A
 
L
R
 
N
T
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
A
 
Q
W
 
A
D
 
Y
L
 
S
G
 
N
N
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
N
T
 
S
K
 
K
L
 
H
P
 
P
P
 
E
E
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
E
Y
 
W
T
 
K
P
 
R
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
 
C
M
 
A
W
 
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
K
L
 
L
G
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
P
 
N
L
 
T
G
 
G
N
|
N
A
 
P
-
 
G
-
 
L
-
x
W
T
 
S
P
 
P
D
 
S
Y
 
Y
F
 
R
G
 
T
Q
 
E
G
 
A
R
 
K
P
 
T
A
 
H
H
 
E
S
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
W
-
 
K
-
 
W
-
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
M
T
 
T
L
 
I
V
 
F
A
 
A
L
 
R
D
 
K
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
E
P
 
A
R
 
V
W
 
W
K
 
G
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
V
 
T
H
 
P
H
 
F
D
 
D
I
 
Q
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
L
 
G
P
 
I
S
 
N
Q
 
E
P
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
T
D
 
-
G
 
V
K
 
D
G
 
G
G
 
S
T
 
K
V
 
K
P
 
P
A
 
C
V
 
L
L
 
V
Q
 
H
T
 
F
T
 
D
K
 
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
C
F
 
Y
L
 
V
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
T
T
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
I
L
 
I
A
 
R
E
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
N
K
 
K
P
 
F
V
 
V
T
 
T
Q
 
V
E
 
N
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
W
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
I
D
 
D
E
 
M
R
 
K
R
 
T
M
 
G
W
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
C
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
R
T
 
P
L
 
V
R
 
K
Y
 
V
D
 
K
G
 
-
D
 
E
F
 
H
T
 
S
P
 
P
P
 
F
G
 
E
L
 
V
Q
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
-
 
A
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
N
 
A
V
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
K
N
 
D
W
 
Q
G
 
Q
S
 
P
V
 
V
S
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
A
 
-
N
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
K
V
 
E
P
 
P
S
 
N
V
 
V
F
 
F
Q
 
-
L
 
Y
V
 
A
P
 
P
R
 
T
D
 
N
D
 
N
Y
 
W
P
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
G
K
 
M
K
 
T
Y
 
L
P
 
E
P
 
P
V
 
M
S
 
E
D
 
R
G
 
A
H
 
H
G
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
T
Q
 
N
A
 
Q
G
 
G
T
 
S
P
 
V
Y
 
Y
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
V
W
 
F
F
 
A
S
 
N
R
 
V
L
 
L
G
 
M
V
 
K
P
 
P
C
 
E
V
 
K
Q
 
P
P
 
G
P
 
V
F
 
M
G
 
G
T
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
A
I
 
F
D
 
D
L
 
V
K
 
I
T
 
T
R
 
G
K
 
K
V
 
A
A
 
R
W
 
W
Q
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
E
G
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
Y
 
W
A
 
S
G
 
G
T
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
T
A
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
F
F
 
Y
A
 
-
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
D
 
D
F
 
G
Y
 
W
L
 
F
R
 
K
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
R
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
A
 
K
E
 
V
V
 
L
W
 
W
K
 
Q
H
 
Q
A
 
K
M
 
L
P
 
G
V
 
S
G
 
G
S
 
I
S
 
I
A
 
G
T
 
N
P
 
P
M
 
I
T
 
S
Y
 
Y
V
 
-
S
 
-
P
 
E
R
 
V
T
 
G
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
V
 
S
I
 
V
S
 
L
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6damA Crystal structure of lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylomicrobium buryatense 5g (see paper)
25% identity, 80% coverage: 153:773/773 of query aligns to 10:562/563 of 6damA

query
sites
6damA
R
 
N
P
 
P
V
 
A
D
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
T
Y
 
W
G
 
G
R
 
G
T
 
N
T
 
Y
E
 
H
G
 
G
R
 
T
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
E
F
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
S
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
N
L
 
L
K
 
Q
L
 
P
A
 
A
W
 
W
S
 
T
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
L
Q
 
R
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
x
E
N
 
G
T
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
V
G
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
M
Y
 
Y
S
 
I
C
 
H
T
 
T
-
 
P
R
 
F
N
 
P
D
 
N
K
 
T
L
 
V
I
 
Y
A
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
D
 
K
S
 
T
G
 
Q
Q
 
A
E
 
V
R
 
I
W
 
W
V
 
E
F
 
Y
D
 
T
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
D
S
 
A
P
 
D
F
 
V
W
 
T
-
 
I
-
 
P
-
 
V
Q
 
M
R
x
C
C
|
C
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
G
K
 
D
A
 
G
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
K
I
 
I
V
 
F
Q
 
L
T
 
Q
T
 
Q
I
 
S
D
 
D
A
 
T
R
 
V
L
 
L
I
 
T
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
R
C
 
V
E
 
W
E
 
S
F
 
V
G
 
Q
D
 
N
K
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
G
T
 
D
V
 
P
R
 
K
P
 
L
G
 
G
F
 
M
Y
 
-
F
 
T
Q
 
N
T
|
T
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
T
G
 
G
G
 
-
W
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
Q
 
-
M
 
I
R
x
S
G
|
G
E
x
G
P
x
E
S
 
F
G
 
G
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
F
I
 
L
R
 
A
A
 
A
F
 
Y
S
 
N
A
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
D
W
 
W
-
 
K
A
 
G
W
 
Y
D
 
S
L
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
I
N
 
N
P
 
P
D
 
T
I
 
K
T
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
W
-
 
K
-
 
D
-
 
G
K
 
K
L
 
V
P
 
Q
P
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
T
-
 
W
E
 
E
G
 
G
Q
 
D
T
 
Q
Y
 
W
T
 
K
P
 
I
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
T
W
|
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
A
 
Y
P
 
G
L
 
S
G
 
G
N
|
N
A
 
-
T
 
-
P
 
P
D
 
S
Y
 
T
F
 
W
G
 
N
Q
 
P
G
 
A
R
 
Q
P
 
R
A
 
P
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
M
T
 
S
L
 
L
V
 
W
A
 
A
L
 
R
D
 
N
V
 
A
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
E
P
 
V
R
 
K
W
 
W
K
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
V
 
T
H
 
P
H
 
H
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
L
 
G
P
 
I
S
 
N
Q
 
E
P
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
-
P
 
Q
D
 
E
G
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
Q
T
 
M
V
 
R
P
 
K
A
 
T
V
 
A
L
 
V
Q
 
H
T
 
F
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
G
F
 
Y
L
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
F
D
 
D
E
 
K
R
 
A
R
 
V
M
 
N
W
 
W
G
 
A
M
 
-
T
 
S
M
 
H
F
 
V
D
 
D
Q
 
M
L
 
K
L
 
S
C
 
G
R
 
R
I
 
P
E
 
Q
F
 
V
R
 
V
T
 
S
L
 
-
R
 
Q
Y
 
Y
D
 
S
G
 
T
D
 
E
F
 
Y
T
 
N
P
 
G
P
 
E
G
 
D
L
 
V
Q
 
N
R
 
T
A
 
E
I
 
G
E
 
V
H
 
C
P
 
P
G
 
A
N
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
S
L
 
K
N
|
N
W
 
Q
G
 
Q
S
 
P
V
 
V
S
 
S
V
 
Y
D
 
S
T
 
P
A
 
Q
N
 
T
Q
 
G
R
 
Y
V
 
F
F
 
Y
L
 
I
N
 
S
D
 
G
I
 
N
R
 
H
V
 
V
P
 
C
S
 
M
V
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
D
 
D
Y
 
Y
P
 
E
A
 
P
F
 
F
A
 
E
K
 
V
K
 
E
Y
 
Y
P
 
T
P
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
G
 
V
I
 
G
Y
 
A
T
 
T
T
 
L
I
 
S
W
 
M
F
 
F
S
 
P
R
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
I
L
 
T
G
 
G
V
 
K
P
 
E
C
 
D
V
 
G
Q
 
S
P
 
N
P
 
N
F
 
L
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
A
 
A
I
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
T
T
 
T
R
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
I
W
 
W
Q
 
S
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
N
A
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
G
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
S
T
 
V
Y
x
W
A
 
S
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
A
 
-
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
D
 
E
F
 
G
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
A
 
K
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
K
 
R
H
 
F
A
 
K
M
 
T
P
 
P
V
 
S
G
 
G
S
 
I
S
 
I
A
 
G
T
 
N
P
 
V
M
 
N
T
 
T
Y
 
W
V
 
-
S
 
-
P
 
E
R
 
Y
T
 
E
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
V
 
G
I
 
V
S
 
L
A
 
S
G
 
G
G
 
V
A
 
G
A
x
G
Y
x
W
S
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
K
 
T
E
 
K
R
 
L
G
 
G
D
 
G
Y
 
T
V
 
L
M
 
T
A
 
V
F
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P

A0A3F2YLY8 Lanthanide-dependent methanol dehydrogenase XoxF; Lanthanide-dependent MDH; Ln(3+)-dependent MDH; EC 1.1.2.10 from Methylotuvimicrobium buryatense (Methylomicrobium buryatense) (see paper)
25% identity, 78% coverage: 153:755/773 of query aligns to 36:566/617 of A0A3F2YLY8

query
sites
A0A3F2YLY8
R
 
N
P
 
P
V
 
A
D
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
T
Y
 
W
G
 
G
R
 
G
T
 
N
T
 
Y
E
 
H
G
 
G
R
 
T
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
E
F
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
S
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
N
L
 
L
K
 
Q
L
 
P
A
 
A
W
 
W
S
 
T
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
L
Q
 
R
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
 
E
N
 
G
T
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
V
G
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
M
Y
 
Y
S
 
I
C
 
H
T
 
T
-
 
P
R
 
F
N
 
P
D
 
N
K
 
T
L
 
V
I
 
Y
A
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
D
 
K
S
 
T
G
 
Q
Q
 
A
E
 
V
R
 
I
W
 
W
V
 
E
F
 
Y
D
 
T
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
D
S
 
A
P
 
D
F
 
V
W
 
T
-
 
I
-
 
P
-
 
V
Q
 
M
R
x
C
C
|
C
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
G
K
 
D
A
 
G
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
K
I
 
I
V
 
F
Q
 
L
T
 
Q
T
 
Q
I
 
S
D
 
D
A
 
T
R
 
V
L
 
L
I
 
T
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
R
C
 
V
E
 
W
E
 
S
F
 
V
G
 
Q
D
 
N
K
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
G
T
 
D
V
 
P
R
 
K
P
 
L
G
 
G
F
 
M
Y
 
-
F
 
T
Q
 
N
T
|
T
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
T
G
 
G
G
 
-
W
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
Q
 
-
M
 
I
R
x
S
G
|
G
E
x
G
P
x
E
S
 
F
G
 
G
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
F
I
 
L
R
 
A
A
 
A
F
 
Y
S
 
N
A
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
D
W
 
W
-
 
K
A
 
G
W
 
Y
D
 
S
L
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
I
N
 
N
P
 
P
D
 
T
I
 
K
T
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
W
-
 
K
-
 
D
-
 
G
K
 
K
L
 
V
P
 
Q
P
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
T
-
 
W
E
 
E
G
 
G
Q
 
D
T
 
Q
Y
 
W
T
 
K
P
 
I
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
T
W
|
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
A
 
Y
P
 
G
L
 
S
G
 
G
N
|
N
A
 
-
T
 
-
P
 
P
D
 
S
Y
 
T
F
 
W
G
 
N
Q
 
P
G
 
A
R
 
Q
P
 
R
A
 
P
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
M
T
 
S
L
 
L
V
 
W
A
 
A
L
 
R
D
 
N
V
 
A
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
E
P
 
V
R
 
K
W
 
W
K
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
V
 
T
H
 
P
H
 
H
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
L
 
G
P
 
I
S
 
N
Q
 
E
P
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
-
P
 
Q
D
 
E
G
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
Q
T
 
M
V
 
R
P
 
K
A
 
T
V
 
A
L
 
V
Q
 
H
T
 
F
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
G
F
 
Y
L
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
F
D
 
D
E
 
K
R
 
A
R
 
V
M
 
N
W
 
W
G
 
A
M
 
-
T
 
S
M
 
H
F
 
V
D
 
D
Q
 
M
L
 
K
L
 
S
C
 
G
R
 
R
I
 
P
E
 
Q
F
 
V
R
 
V
T
 
S
L
 
-
R
 
Q
Y
 
Y
D
 
S
G
 
T
D
 
E
F
 
Y
T
 
N
P
 
G
P
 
E
G
 
D
L
 
V
Q
 
N
R
 
T
A
 
E
I
 
G
E
 
V
H
x
C
P
 
P
G
 
A
N
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
S
L
 
K
N
|
N
W
 
Q
G
 
Q
S
 
P
V
 
V
S
 
S
V
 
Y
D
 
S
T
 
P
A
 
Q
N
 
T
Q
 
G
R
 
Y
V
 
F
F
 
Y
L
 
I
N
 
S
D
 
G
I
 
N
R
 
H
V
 
V
P
x
C
S
 
M
V
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
D
 
D
Y
 
Y
P
 
E
A
 
P
F
 
F
A
 
E
K
 
V
K
 
E
Y
 
Y
P
 
T
P
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
G
 
V
I
 
G
Y
 
A
T
 
T
T
 
L
I
 
S
W
 
M
F
 
F
S
 
P
R
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
I
L
 
T
G
 
G
V
 
K
P
 
E
C
 
D
V
 
G
Q
 
S
P
 
N
P
 
N
F
 
L
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
A
 
A
I
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
T
T
 
T
R
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
I
W
 
W
Q
 
S
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
N
A
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
G
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
S
T
 
V
Y
x
W
A
 
S
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
A
 
-
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
D
 
E
F
 
G
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
A
 
K
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
K
 
R
H
 
F
A
 
K
M
 
T
P
 
P
V
 
S
G
 
G
S
 
I
S
 
I
A
 
G
T
 
N
P
 
V
M
 
N
T
 
T
Y
 
W
V
 
-
S
 
-
P
 
E
R
 
Y
T
 
E
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
V
 
G
I
 
V
S
 
L
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

C5B120 Lanthanide-dependent methanol dehydrogenase; Lanthanide-dependent MDH; Ln(3+)-dependent MDH; La(3+)- and PQQ-dependent MDH; La(3+)-dependent methanol dehydrogenase; La(3+)-dependent MDH; EC 1.1.2.10 from Methylorubrum extorquens (strain ATCC 14718 / DSM 1338 / JCM 2805 / NCIMB 9133 / AM1) (Methylobacterium extorquens) (see 2 papers)
26% identity, 76% coverage: 168:755/773 of query aligns to 46:554/601 of C5B120

query
sites
C5B120
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
K
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
A
E
 
S
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
N
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
A
 
A
W
 
W
S
 
T
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
L
Q
 
R
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
 
E
N
 
G
T
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
N
L
 
I
V
 
M
Y
 
Y
S
 
V
C
 
H
T
 
T
R
 
P
N
 
F
D
 
P
K
 
N
L
 
I
I
 
V
-
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
Q
 
A
E
 
K
-
 
I
R
 
V
W
 
W
V
 
K
F
 
Y
D
 
E
P
 
P
-
 
K
Q
 
Q
A
 
D
K
 
P
S
 
S
P
 
V
F
 
I
W
 
P
Q
 
V
R
 
M
C
 
C
-
 
C
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
L
Q
 
L
T
 
H
T
 
Q
I
 
A
D
 
D
A
 
T
R
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
N
L
 
W
A
 
S
H
 
V
G
 
K
M
 
N
G
 
G
T
 
D
V
 
P
R
 
S
P
 
K
G
 
G
F
 
-
Y
 
E
F
 
T
Q
 
N
T
|
T
S
 
A
A
 
T
P
 
V
L
 
L
V
 
P
A
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
-
W
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
Q
 
-
M
 
I
R
x
S
G
|
G
E
x
G
P
x
E
S
 
F
G
 
G
V
 
V
-
 
Q
-
 
C
-
 
H
I
 
V
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
L
R
 
K
T
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
K
V
 
V
W
 
W
-
 
R
A
 
G
W
 
Y
D
 
S
L
 
I
G
 
G
N
 
P
P
 
D
D
 
D
I
 
Q
T
 
L
K
 
I
L
 
V
P
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
-
Q
 
K
T
 
T
Y
 
T
T
 
S
P
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
W
-
 
E
-
 
G
N
 
D
M
 
Q
W
 
W
T
 
K
T
 
T
A
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
C
-
 
T
-
x
W
-
 
G
-
 
W
-
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
K
L
 
L
G
 
D
L
 
L
I
 
M
Y
 
Y
A
 
-
P
 
-
L
 
Y
G
 
G
N
 
S
A
 
G
T
x
N
P
 
P
D
 
S
Y
 
T
F
 
W
G
 
N
Q
 
P
G
 
K
R
 
Q
P
 
R
A
 
P
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
M
T
 
T
L
 
I
V
 
W
A
 
A
L
 
R
D
 
N
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
M
P
 
A
R
 
K
W
 
W
K
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
V
 
T
H
 
P
H
 
H
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
L
 
G
P
 
I
S
 
N
Q
 
E
P
 
M
A
 
I
L
 
L
I
 
T
D
 
D
L
 
Q
P
 
K
-
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
-
G
 
-
T
 
D
V
 
R
P
 
P
A
 
L
V
 
L
L
 
T
Q
 
H
T
 
F
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
G
F
 
Y
L
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
V
E
 
A
V
 
E
A
 
K
E
 
F
K
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
V
Q
 
N
E
 
W
G
 
-
A
 
A
V
 
T
P
 
K
E
 
V
E
 
D
T
 
L
L
 
D
S
 
K
P
 
G
T
 
S
Q
 
K
P
 
T
Y
 
Y
S
 
-
V
 
-
G
 
G
M
 
R
P
 
P
T
 
L
V
 
V
G
 
V
A
 
S
E
 
K
R
 
Y
L
 
S
D
 
T
E
 
E
R
 
Q
R
 
N
M
 
-
W
 
-
G
 
G
M
 
E
T
 
D
M
 
V
F
 
N
D
 
S
Q
 
K
L
 
G
L
 
I
C
 
C
R
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
P
P
 
A
G
 
A
L
 
L
Q
 
G
R
 
T
A
 
K
I
 
D
E
 
Q
H
 
Q
P
 
P
G
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
-
W
 
-
G
 
A
S
 
A
V
 
F
S
 
S
V
 
P
D
 
K
T
 
T
A
 
G
N
 
L
Q
 
F
R
 
Y
V
 
V
F
 
P
L
 
T
N
 
N
D
 
H
I
 
V
R
 
C
V
 
M
P
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
D
 
D
Y
 
Y
P
 
E
A
 
P
F
 
F
A
 
R
K
 
V
K
 
T
Y
 
Y
P
 
T
P
 
P
V
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
G
 
V
I
 
G
Y
 
A
T
 
T
T
 
-
I
 
-
W
 
-
F
 
L
S
 
S
R
 
M
L
 
Y
G
 
P
V
 
A
P
 
P
C
 
G
V
 
S
Q
 
H
P
 
G
P
 
G
F
 
M
G
 
G
T
 
N
L
 
F
T
 
I
A
 
A
I
 
W
D
 
D
L
 
N
K
 
L
T
 
Q
R
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
K
W
 
W
Q
 
S
V
 
N
P
 
P
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
G
 
S
P
 
A
L
x
W
G
 
G
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
G
T
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
D
L
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
A
 
-
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
D
 
E
F
 
G
Y
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
S
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
A
 
K
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
K
 
K
H
 
F
A
 
K
M
 
T
P
 
P
V
 
S
G
 
G
S
 
I
S
 
I
A
 
G
T
 
N
P
 
V
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
V
 
-
S
 
-
P
 
E
R
 
H
T
 
K
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
V
V
 
A
I
 
V
S
 
L
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2d0vA Crystal structure of methanol dehydrogenase from hyphomicrobium denitrificans (see paper)
27% identity, 44% coverage: 152:489/773 of query aligns to 9:347/597 of 2d0vA

query
sites
2d0vA
N
 
N
R
 
S
P
 
N
V
 
E
D
 
N
W
 
W
S
 
V
A
 
M
Y
 
P
G
 
G
R
 
K
T
 
N
T
 
Y
E
 
D
G
 
S
R
 
N
R
 
N
D
 
Y
A
 
S
P
 
T
F
 
S
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
V
E
 
D
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
L
 
H
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
E
T
 
L
Q
 
H
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
x
E
N
 
G
T
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
V
V
 
M
Y
 
Y
-
 
V
S
 
H
C
 
S
T
 
S
R
 
F
N
 
P
D
 
N
K
 
K
L
 
T
I
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
L
A
 
N
D
 
D
S
 
P
G
 
G
Q
 
H
E
 
I
R
 
L
W
 
W
V
 
Q
F
 
H
-
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
Q
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
S
 
S
P
 
V
F
 
-
W
 
-
Q
 
-
R
 
A
C
 
C
-
 
C
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
W
K
 
P
A
 
G
P
 
D
Q
 
D
E
 
K
A
 
T
A
 
P
A
 
S
A
 
L
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
I
Q
 
K
T
 
T
T
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
H
L
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
-
P
 
-
C
 
-
E
 
E
E
 
E
F
 
F
G
 
W
-
 
K
-
 
V
D
 
E
K
 
N
G
 
G
T
 
D
V
 
I
S
 
K
L
 
V
A
 
G
H
 
Q
G
 
T
M
 
L
G
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
T
|
T
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
R
 
H
D
 
D
L
 
L
I
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
S
W
x
S
V
x
G
V
x
A
D
x
E
N
 
L
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
H
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
V
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
S
 
N
A
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
Q
V
 
A
W
 
W
A
 
R
W
 
Y
D
 
Y
L
 
A
G
 
T
N
 
G
P
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
D
I
 
F
T
 
N
K
 
S
L
 
A
P
 
N
P
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
W
E
 
E
G
 
G
Q
 
D
T
 
A
Y
 
W
T
 
K
P
 
I
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
N
W
|
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
A
L
 
A
G
 
N
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
P
 
G
L
 
S
G
 
G
N
|
N
A
 
P
T
 
A
P
 
P
D
 
-
Y
 
W
F
 
N
G
 
E
Q
 
T
G
 
M
R
 
R
P
 
P
A
 
G
H
 
-
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
T
A
 
M
T
 
T
L
 
I
V
 
T
A
 
A
L
 
R
D
 
D
V
 
A
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
M
R
 
K
W
 
F
K
 
G
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
K
V
 
T
H
 
P
H
 
H
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
A
L
 
G
P
 
V
S
 
N
Q
 
V
P
 
I
A
 
M
L
 
L
I
 
S
D
 
E
L
 
Q
P
 
T
D
 
D
G
 
K
K
 
T
G
 
G
G
 
K
T
 
K
V
 
R
P
 
K
A
 
L
V
 
L
L
 
T
Q
 
H
T
 
P
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
F
 
Y
L
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
E
T
 
N
G
 
G
Q
 
D
P
 
L
L
 
I
A
 
S

Sites not aligning to the query:

6oc6A Lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylobacterium extorquens, in complex with lanthanum and pyrroloquinoline quinone (see paper)
26% identity, 76% coverage: 168:755/773 of query aligns to 25:533/579 of 6oc6A

query
sites
6oc6A
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
K
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
A
E
 
S
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
N
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
A
 
A
W
 
W
S
 
T
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
L
Q
 
R
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
x
E
N
 
G
T
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
N
L
 
I
V
 
M
Y
 
Y
S
 
V
C
 
H
T
 
T
R
 
P
N
 
F
D
 
P
K
 
N
L
 
I
I
 
V
-
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
Q
 
A
E
 
K
-
 
I
R
 
V
W
 
W
V
 
K
F
 
Y
D
 
E
P
 
P
-
 
K
Q
 
Q
A
 
D
K
 
P
S
 
S
P
 
V
F
 
I
W
 
P
Q
 
V
R
 
M
C
|
C
-
x
C
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
L
Q
 
L
T
 
H
T
 
Q
I
 
A
D
 
D
A
 
T
R
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
N
L
 
W
A
 
S
H
 
V
G
 
K
M
 
N
G
 
G
T
 
D
V
 
P
R
 
S
P
 
K
G
 
G
F
 
-
Y
 
E
F
 
T
Q
 
N
T
|
T
S
 
A
A
 
T
P
 
V
L
 
L
V
 
P
A
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
-
W
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
Q
 
-
M
 
I
R
x
S
G
|
G
E
x
G
P
x
E
S
 
F
G
 
G
V
 
V
-
 
Q
-
 
C
-
 
H
I
 
V
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
L
R
 
K
T
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
K
V
 
V
W
 
W
-
 
R
A
 
G
W
 
Y
D
 
S
L
 
I
G
 
G
N
 
P
P
 
D
D
 
D
I
 
Q
T
 
L
K
 
I
L
 
V
P
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
-
Q
 
K
T
 
T
Y
 
T
T
 
S
P
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
W
-
 
E
-
 
G
N
 
D
M
 
Q
W
 
W
T
 
K
T
 
T
A
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
C
-
 
T
-
x
W
-
 
G
-
 
W
-
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
K
L
 
L
G
 
D
L
 
L
I
 
M
Y
 
Y
A
 
-
P
 
-
L
 
Y
G
 
G
N
 
S
A
 
G
T
x
N
P
 
P
D
 
S
Y
 
T
F
 
W
G
 
N
Q
 
P
G
 
K
R
 
Q
P
 
R
A
 
P
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
M
T
 
T
L
 
I
V
 
W
A
 
A
L
 
R
D
 
N
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
M
P
 
A
R
 
K
W
 
W
K
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
V
 
T
H
 
P
H
 
H
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
L
 
G
P
 
I
S
 
N
Q
 
E
P
 
M
A
 
I
L
 
L
I
 
T
D
 
D
L
 
Q
P
 
K
-
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
-
G
 
-
T
 
D
V
 
R
P
 
P
A
 
L
V
 
L
L
 
T
Q
 
H
T
 
F
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
G
F
 
Y
L
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
V
E
 
A
V
 
E
A
 
K
E
 
F
K
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
V
Q
 
N
E
 
W
G
 
-
A
 
A
V
 
T
P
 
K
E
 
V
E
 
D
T
 
L
L
 
D
S
 
K
P
 
G
T
 
S
Q
 
K
P
 
T
Y
 
Y
S
 
-
V
 
-
G
 
G
M
 
R
P
 
P
T
 
L
V
 
V
G
 
V
A
 
S
E
 
K
R
 
Y
L
 
S
D
 
T
E
 
E
R
 
Q
R
 
N
M
 
-
W
 
-
G
 
G
M
 
E
T
 
D
M
 
V
F
 
N
D
 
S
Q
 
K
L
 
G
L
 
I
C
 
C
R
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
P
P
 
A
G
 
A
L
 
L
Q
 
G
R
 
T
A
 
K
I
x
D
E
 
Q
H
 
Q
P
 
P
G
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
-
W
 
-
G
 
A
S
 
A
V
 
F
S
 
S
V
 
P
D
 
K
T
 
T
A
 
G
N
 
L
Q
 
F
R
 
Y
V
 
V
F
 
P
L
 
T
N
 
N
D
 
H
I
 
V
R
 
C
V
 
M
P
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
D
 
D
Y
 
Y
P
 
E
A
 
P
F
 
F
A
 
R
K
 
V
K
 
T
Y
 
Y
P
 
T
P
 
P
V
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
G
 
V
I
 
G
Y
 
A
T
 
T
T
 
-
I
 
-
W
 
-
F
 
L
S
 
S
R
 
M
L
 
Y
G
 
P
V
 
A
P
 
P
C
 
G
V
 
S
Q
 
H
P
 
G
P
 
G
F
 
M
G
 
G
T
 
N
L
 
F
T
 
I
A
 
A
I
 
W
D
 
D
L
 
N
K
 
L
T
 
Q
R
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
K
W
 
W
Q
 
S
V
 
N
P
 
P
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
G
 
S
P
 
A
L
x
W
G
 
G
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
G
T
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
D
L
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
A
 
-
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
D
 
E
F
 
G
Y
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
S
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
A
 
K
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
K
 
K
H
 
F
A
 
K
M
 
T
P
 
P
V
 
S
G
 
G
S
 
I
S
 
I
A
 
G
T
 
N
P
 
V
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
V
 
-
S
 
-
P
 
E
R
 
H
T
 
K
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
V
V
 
A
I
 
V
S
 
L
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

C5AXV8 Lanthanide-dependent ethanol dehydrogenase; Lanthanide-dependent EtDH; Ln-dependent EtDH; Lanthanide-dependent formaldehyde dehydrogenase; PQQ-dependent ethanol dehydrogenase; EC 1.1.2.-; EC 1.2.2.- from Methylorubrum extorquens (strain ATCC 14718 / DSM 1338 / JCM 2805 / NCIMB 9133 / AM1) (Methylobacterium extorquens) (see paper)
25% identity, 43% coverage: 160:489/773 of query aligns to 46:360/587 of C5AXV8

query
sites
C5AXV8
Y
 
Y
G
 
G
R
 
L
T
 
G
T
 
P
E
 
Q
G
 
A
R
 
Q
R
 
R
D
 
F
A
 
S
P
 
P
F
 
I
D
 
K
Q
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
D
T
 
N
V
 
I
S
 
K
Q
 
G
L
 
L
K
 
V
L
 
P
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
F
R
 
S
T
 
F
G
 
G
D
 
G
T
 
E
Q
 
K
P
 
Q
G
 
R
V
 
G
D
 
Q
Q
 
E
N
 
S
T
 
Q
P
 
A
L
 
L
Q
 
V
I
 
K
G
 
D
D
 
G
L
 
V
V
 
L
Y
 
Y
S
 
V
C
 
T
T
 
G
R
 
S
N
 
Y
D
 
S
K
 
R
L
 
L
I
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
E
 
K
R
 
K
W
 
W
V
 
E
F
 
Y
D
 
N
P
 
A
Q
 
R
A
 
L
K
 
P
S
 
E
P
 
G
F
 
I
W
 
L
Q
 
P
R
 
C
C
 
C
R
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
E
 
D
A
 
V
A
 
V
A
 
N
A
 
R
P
 
G
E
 
A
G
 
A
A
 
L
C
 
Y
R
 
K
E
 
D
R
 
K
I
 
V
V
 
Y
Q
 
F
T
 
G
T
 
T
I
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
V
L
 
W
A
 
R
H
 
K
G
 
D
M
 
I
G
 
D
T
 
D
V
 
F
R
 
K
P
 
S
G
 
G
F
 
Y
Y
 
S
F
 
Y
Q
 
-
T
 
T
S
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
M
V
 
I
A
 
V
R
 
K
D
 
G
L
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
T
G
 
G
G
 
-
W
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
Q
 
-
M
 
V
R
 
S
G
 
G
E
 
G
P
 
E
S
 
F
G
 
G
V
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
R
I
 
V
R
 
E
A
 
A
F
 
R
S
 
D
A
 
A
R
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
V
W
 
W
A
 
K
W
 
R
D
 
P
L
 
V
G
 
I
N
 
E
P
 
G
D
 
H
I
 
M
T
 
G
K
 
E
L
 
L
P
 
N
P
 
G
E
 
K
-
 
P
-
 
S
-
 
T
-
 
M
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
W
-
 
P
G
 
G
Q
 
D
T
 
T
Y
 
W
T
 
K
P
 
F
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
 
A
M
 
T
W
 
W
T
 
L
T
 
G
A
 
G
A
 
T
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
F
P
 
G
L
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
P
T
 
G
P
 
P
D
 
-
Y
 
W
F
 
N
G
 
S
Q
 
A
G
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
G
H
 
-
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
A
T
 
S
L
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
D
 
N
V
 
P
A
 
D
T
 
N
G
 
G
R
 
E
P
 
I
R
 
V
W
 
W
K
 
G
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
V
 
T
H
 
P
H
 
H
D
 
D
I
 
G
W
 
W
D
 
D
Y
 
Y
D
|
D
L
 
G
P
 
V
S
 
N
Q
 
E
P
 
F
A
 
V
L
 
P
I
 
F
D
 
D
L
 
M
-
 
Q
P
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
-
G
 
-
T
 
T
V
 
V
P
 
K
A
 
A
V
 
G
L
 
A
Q
 
T
T
 
A
T
 
D
K
 
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
F
F
 
Y
L
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
T
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
P
 
F
L
 
L
A
 
S

4aahA Methanol dehydrogenase from methylophilus w3a1 (see paper)
29% identity, 42% coverage: 167:494/773 of query aligns to 24:343/571 of 4aahA

query
sites
4aahA
R
 
Q
R
 
H
D
 
N
A
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
A
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
K
E
 
S
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
N
L
 
V
K
 
K
L
 
A
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
L
Q
 
N
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
x
E
N
 
G
T
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
M
V
 
M
Y
 
Y
-
 
V
-
 
H
S
 
S
C
 
A
T
 
F
R
 
P
N
 
N
D
 
N
K
 
T
L
 
Y
I
 
A
A
 
L
L
 
N
D
 
L
A
 
N
D
 
D
S
 
P
G
 
G
Q
 
K
E
 
I
R
 
V
W
 
W
V
 
Q
F
 
H
D
 
K
P
 
P
Q
 
K
-
 
Q
-
 
D
A
 
A
K
 
S
S
 
T
P
 
K
F
 
A
W
 
V
Q
 
M
R
x
C
C
|
C
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
D
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
A
C
 
G
R
 
Q
E
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
V
Q
 
K
T
 
K
T
 
Q
I
 
A
D
 
N
A
 
G
R
 
H
L
 
L
I
 
L
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
I
C
 
N
E
 
W
E
 
E
F
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
E
L
 
V
A
 
C
H
 
D
-
 
P
G
 
K
M
 
V
G
 
G
T
 
S
V
 
T
R
 
L
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
T
 
T
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
K
D
 
D
L
 
T
I
 
V
V
 
L
V
 
M
G
 
G
G
 
C
W
x
S
V
 
G
V
x
A
D
x
E
N
 
L
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
A
I
 
V
R
 
N
A
 
A
F
 
F
S
 
D
A
 
L
R
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
K
W
 
W
-
 
R
A
 
A
W
 
F
D
 
A
L
 
T
G
 
G
N
 
S
P
 
D
D
 
D
I
 
S
T
 
V
K
 
R
L
 
L
P
 
A
P
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
N
-
 
S
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
Q
-
 
F
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
T
-
 
W
E
 
E
G
 
G
Q
 
D
T
 
A
Y
 
W
T
 
K
P
 
I
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
 
T
M
 
N
W
|
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
K
L
 
L
G
 
N
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
A
 
Y
P
 
G
L
 
S
G
 
G
N
|
N
A
 
P
T
 
A
P
 
P
D
 
-
Y
 
W
F
 
N
G
 
E
Q
 
T
G
 
M
R
 
R
P
 
P
A
 
G
H
 
-
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
T
A
 
M
T
 
T
L
 
I
V
 
W
A
 
G
L
 
R
D
 
D
V
 
L
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
M
P
 
A
R
 
K
W
 
W
K
 
G
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
K
V
 
T
H
 
P
H
 
H
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
A
L
 
G
P
 
V
S
 
N
Q
 
Q
P
 
M
A
 
V
L
 
L
I
 
T
D
 
D
L
 
Q
P
 
P
D
 
V
G
 
-
K
 
N
G
 
G
G
 
K
T
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
L
V
 
L
L
 
S
Q
 
H
T
 
I
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
I
L
 
L
F
 
Y
L
 
T
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
E
T
 
N
G
 
G
Q
 
N
P
 
L
L
 
I
A
 
-
E
 
-
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

5xm3A Crystal structure of methanol dehydrogenase from methylophaga aminisulfidivorans (see paper)
26% identity, 43% coverage: 156:486/773 of query aligns to 13:344/596 of 5xm3A

query
sites
5xm3A
D
 
N
W
 
W
S
 
V
A
 
M
Y
 
Q
G
 
G
R
 
K
T
 
D
T
 
F
E
 
S
G
 
G
R
 
T
R
 
H
D
 
Y
A
 
S
P
 
T
F
 
A
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
K
E
 
D
T
 
N
V
 
V
S
 
K
Q
 
K
L
 
L
K
 
R
L
 
P
A
 
S
W
 
W
S
 
S
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
V
T
 
L
Q
 
N
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
x
E
N
 
G
T
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
V
G
 
N
D
 
G
L
 
T
V
 
M
Y
 
Y
S
 
I
C
 
H
T
 
T
-
 
P
R
 
F
N
 
P
D
 
N
K
 
N
L
 
T
I
 
F
A
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
L
D
 
D
S
 
E
-
 
P
G
 
G
Q
 
V
E
 
I
R
 
K
W
 
W
V
 
E
F
 
H
-
 
K
-
 
P
-
 
K
-
 
Q
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
S
 
A
P
 
V
F
 
-
W
 
-
Q
 
A
R
x
C
C
 
C
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
W
K
 
P
A
 
G
P
 
D
Q
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
P
A
 
A
A
 
M
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
V
Q
 
K
T
 
S
T
 
L
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
H
L
 
V
I
 
V
E
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
R
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
E
C
 
Y
E
 
W
E
 
K
F
 
V
G
 
-
D
 
E
K
 
N
G
 
G
T
 
D
V
 
I
S
 
S
L
 
V
A
 
G
H
 
Q
G
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
T
Q
 
E
T
|
T
S
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
I
V
 
Q
G
 
G
G
 
S
W
x
S
V
x
G
V
x
A
D
x
E
N
 
L
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
Y
I
 
V
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
I
R
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
M
V
 
V
W
 
W
A
 
R
W
 
W
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
A
D
 
D
L
 
V
G
 
G
-
 
L
N
 
D
P
 
K
D
 
D
I
 
F
T
 
N
K
 
K
L
 
H
P
 
N
P
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
T
-
 
W
E
 
E
G
 
D
Q
 
N
T
 
A
Y
 
W
T
 
K
P
 
I
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
N
W
|
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
Q
L
 
L
G
 
D
L
 
M
I
 
F
Y
 
Y
A
 
Y
P
 
G
L
 
S
G
 
G
N
|
N
A
 
P
T
 
A
P
 
P
D
 
-
Y
 
W
F
 
N
G
 
E
Q
 
T
G
 
M
R
 
R
P
 
P
A
 
G
H
 
-
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
T
A
 
M
T
 
T
L
 
I
V
 
W
A
 
G
L
 
R
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
A
R
 
K
W
 
F
K
 
G
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
K
V
 
T
H
 
P
H
 
H
D
 
D
I
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
L
 
G
P
 
V
S
 
N
Q
 
V
P
 
M
A
 
M
L
 
L
I
 
S
D
 
E
L
 
Q
P
 
K
D
 
D
G
 
K
K
 
N
G
 
G
G
 
K
T
 
M
V
 
R
P
 
K
A
 
L
V
 
L
L
 
T
Q
 
H
T
 
P
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
I
L
 
I
F
 
Y
L
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
E
T
 
T
G
 
G
Q
 
D

Sites not aligning to the query:

I0JWN7 Lanthanide-dependent methanol dehydrogenase; Lanthanide-dependent MDH; Ln(3+)-dependent MDH; Ln-MDH; EC 1.1.2.10 from Methylacidiphilum fumariolicum (strain SolV) (see 2 papers)
27% identity, 48% coverage: 151:521/773 of query aligns to 42:412/611 of I0JWN7

query
sites
I0JWN7
D
 
E
N
 
K
R
 
E
P
 
P
V
 
G
D
 
Q
W
 
W
S
 
V
A
 
M
Y
 
Q
G
 
N
R
 
K
T
 
N
T
 
Y
E
 
A
G
 
N
R
 
T
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
E
F
 
L
D
 
N
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
K
T
 
N
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
A
T
 
L
Q
 
R
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
 
E
N
 
G
T
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
T
L
 
T
V
 
M
Y
 
Y
-
 
V
S
 
H
C
 
S
T
 
A
R
 
Y
N
 
P
D
 
N
K
 
H
L
 
V
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
L
D
 
T
S
 
Q
G
 
K
-
 
P
-
 
Y
Q
 
A
E
 
I
R
 
K
W
 
W
V
 
Q
F
 
Y
D
 
T
P
 
P
-
 
V
Q
 
Q
A
 
N
K
 
S
S
 
Q
P
 
A
F
 
V
W
 
A
Q
 
V
R
 
A
C
|
C
-
x
C
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
A
R
 
N
E
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
F
Q
 
M
T
 
T
T
 
T
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
Q
L
 
I
I
 
I
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
E
F
 
L
G
 
W
D
 
K
K
 
M
G
 
K
T
 
H
V
 
A
S
 
D
L
 
V
A
 
T
H
 
K
G
 
G
M
 
E
G
 
T
T
 
I
V
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
T
|
T
S
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
K
I
 
V
V
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
V
W
x
S
V
x
G
V
x
G
D
x
E
N
 
F
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
R
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
V
R
 
G
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
I
R
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
N
L
 
R
V
 
V
W
 
W
-
 
L
A
 
A
W
 
Y
D
 
S
L
 
Q
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
L
N
 
D
P
 
S
D
 
D
I
 
F
T
 
N
K
 
K
L
 
E
P
 
F
P
 
P
E
 
Q
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
T
-
 
W
-
 
P
G
 
G
Q
 
E
T
 
Q
Y
 
W
T
 
K
P
 
L
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
T
W
|
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
D
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
A
 
-
P
 
-
L
 
Y
G
 
G
N
 
T
A
 
S
T
x
N
P
 
P
-
 
G
D
 
T
Y
 
W
F
 
N
G
 
A
Q
 
E
G
 
Q
R
 
R
P
 
K
A
 
G
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
C
T
 
T
L
 
I
V
 
F
A
 
A
L
 
R
D
 
R
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
A
R
 
R
W
 
W
K
 
A
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
V
 
T
H
 
P
H
 
W
D
 
D
I
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
L
 
G
P
 
V
S
 
N
Q
 
E
P
 
M
A
 
I
L
 
L
I
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
T
D
 
V
G
 
-
K
 
K
G
 
G
G
 
K
T
 
K
V
 
T
P
 
P
A
 
C
V
 
L
L
 
V
Q
 
H
T
 
F
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
G
F
 
Y
L
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
R
T
 
T
G
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
A
 
V
E
 
Y
V
 
V
A
 
N
-
 
W
E
 
A
K
 
K
P
 
E
V
 
I
T
 
S
Q
 
K
E
 
E
G
 
N
A
 
D
V
 
R
P
 
P
E
 
V
E
 
E
T
 
I
L
 
-
S
 
-
P
 
P
T
 
E
Q
 
K
P
 
R
Y
 
T
S
 
K
V
 
Q
G
 
G
M
 
V
P
 
D
T
 
T
V
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6fkwA Europium-containing methanol dehydrogenase (see paper)
27% identity, 48% coverage: 151:521/773 of query aligns to 8:378/576 of 6fkwA

query
sites
6fkwA
D
 
E
N
 
K
R
 
E
P
 
P
V
 
G
D
 
Q
W
 
W
S
 
V
A
 
M
Y
 
Q
G
 
N
R
 
K
T
 
N
T
 
Y
E
 
A
G
 
N
R
 
T
R
 
R
D
 
Y
A
 
S
P
 
E
F
 
L
D
 
N
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
K
T
 
N
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
Y
 
F
R
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
A
T
 
L
Q
 
R
P
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
H
Q
x
E
N
 
G
T
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
T
L
 
T
V
 
M
Y
 
Y
-
 
V
S
 
H
C
 
S
T
 
A
R
 
Y
N
 
P
D
 
N
K
 
H
L
 
V
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
L
D
 
T
S
 
Q
G
 
K
-
 
P
-
 
Y
Q
 
A
E
 
I
R
 
K
W
 
W
V
 
Q
F
 
Y
D
 
T
P
 
P
-
 
V
Q
 
Q
A
 
N
K
 
S
S
 
Q
P
 
A
F
 
V
W
 
A
Q
 
V
R
 
A
C
|
C
-
x
C
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
W
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
A
R
 
N
E
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
F
Q
 
M
T
 
T
T
 
T
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
Q
L
 
I
I
 
I
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
-
C
 
-
E
 
-
E
 
E
F
 
L
G
 
W
D
 
K
K
 
M
G
 
K
T
 
H
V
 
A
S
 
D
L
 
V
A
 
T
H
 
K
G
 
G
M
 
E
G
 
T
T
 
I
V
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
T
|
T
S
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
K
I
 
V
V
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
V
W
x
S
V
x
G
V
x
G
D
x
E
N
 
F
Q
 
G
M
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
R
P
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
V
R
 
G
A
 
A
F
 
Y
S
 
D
A
 
I
R
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
N
L
 
R
V
 
V
W
 
W
-
 
L
A
 
A
W
 
Y
D
 
S
L
 
Q
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
L
N
 
D
P
 
S
D
 
D
I
 
F
T
 
N
K
 
K
L
 
E
P
 
F
P
 
P
E
 
Q
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
T
-
 
W
-
 
P
G
 
G
Q
 
E
T
 
Q
Y
 
W
T
 
K
P
 
L
G
 
G
T
 
G
P
 
G
N
x
T
M
 
T
W
|
W
T
 
G
T
 
W
A
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
D
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
A
 
-
P
 
-
L
 
Y
G
 
G
N
 
T
A
 
S
T
x
N
P
 
P
-
 
G
D
 
T
Y
 
W
F
 
N
G
 
A
Q
 
E
G
 
Q
R
 
R
P
 
K
A
 
G
H
 
G
S
 
D
D
 
N
E
 
K
Y
 
W
N
 
S
A
 
C
T
 
T
L
 
I
V
 
F
A
 
A
L
 
R
D
 
R
V
 
P
A
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
A
R
 
R
W
 
W
K
 
A
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
M
V
 
T
H
 
P
H
 
W
D
 
D
I
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
L
 
G
P
 
V
S
 
N
Q
 
E
P
 
M
A
 
I
L
 
L
I
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
T
D
 
V
G
 
-
K
 
K
G
 
G
G
 
K
T
 
K
V
 
T
P
 
P
A
 
C
V
 
L
L
 
V
Q
 
H
T
 
F
T
 
D
K
x
R
R
 
N
G
 
G
Q
 
F
L
 
G
F
 
Y
L
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
R
T
 
T
G
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
A
 
V
E
 
Y
V
 
V
A
 
N
-
 
W
E
 
A
K
 
K
P
 
E
V
 
I
T
 
S
Q
 
K
E
 
E
G
 
N
A
 
D
V
 
R
P
 
P
E
 
V
E
 
E
T
 
I
L
 
-
S
 
-
P
 
P
T
 
E
Q
 
K
P
 
R
Y
 
T
S
 
K
V
 
Q
G
 
G
M
 
V
P
 
D
T
 
T
V
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_038210510.1 NCBI__GCF_000745855.1:WP_038210510.1
MLVVSRVWALLVALMGLGLALGGARLLLLGGSPYYVAAGLVLLWAALQMWRRRRSSALWV
AALAVLTLPWALWESGLDFWALFPRLMAPLALAAVSLLLAPRAPEGGSAAPWRLAGAVFA
LLFVLGFGLAFMPHGVVRPDASMAYTPPGGDNRPVDWSAYGRTTEGRRDAPFDQINRETV
SQLKLAWSYRTGDTQPGVDQNTPLQIGDLVYSCTRNDKLIALDADSGQERWVFDPQAKSP
FWQRCRGLGYWKAPQEAAAAPEGACRERIVQTTIDARLIELDARTGKPCEEFGDKGTVSL
AHGMGTVRPGFYFQTSAPLVARDLIVVGGWVVDNQMRGEPSGVIRAFSARTGELVWAWDL
GNPDITKLPPEGQTYTPGTPNMWTTAAYDDKLGLIYAPLGNATPDYFGQGRPAHSDEYNA
TLVALDVATGRPRWKFQTVHHDIWDYDLPSQPALIDLPDGKGGTVPAVLQTTKRGQLFLL
DRATGQPLAEVAEKPVTQEGAVPEETLSPTQPYSVGMPTVGAERLDERRMWGMTMFDQLL
CRIEFRTLRYDGDFTPPGLQRAIEHPGNVGGLNWGSVSVDTANQRVFLNDIRVPSVFQLV
PRDDYPAFAKKYPPVSDGHGPSTQAGTPYGIYTTIWFSRLGVPCVQPPFGTLTAIDLKTR
KVAWQVPAGTAEQLGPLGVRLGLPMPIGMPTYAGTLATAGGLVFFAGTQDFYLRAYDAQT
GAEVWKHAMPVGSSATPMTYVSPRTGKQYVVISAGGAAYSKERGDYVMAFALP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory