SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_038211943.1 NCBI__GCF_000745855.1:WP_038211943.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
54% identity, 99% coverage: 3:262/262 of query aligns to 2:257/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
P
 
K
R
 
R
L
 
L
D
 
E
Q
 
G
R
 
K
H
 
S
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
G
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
E
A
 
A
C
 
Y
R
 
V
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
C
 
V
T
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
I
-
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
G
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
-
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
L
 
-
H
 
Y
Y
 
A
V
 
V
A
 
Q
A
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
D
D
 
S
I
 
I
D
 
D
R
 
A
L
 
A
L
 
I
P
 
A
E
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
E
R
 
H
F
 
A
G
 
G
P
 
G
V
 
L
H
 
D
T
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
V
E
 
E
S
 
I
D
 
T
E
 
R
A
 
E
S
 
S
F
 
Y
D
 
E
R
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
A
G
 
G
M
 
T
F
 
L
F
 
F
V
 
T
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
M
 
M
V
 
I
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
T
 
-
Q
 
R
G
 
G
A
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
|
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
A
H
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
D
M
 
L
A
 
I
P
 
K
H
 
H
G
 
R
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
G
P
 
E
M
x
H
W
|
W
E
 
D
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
L
F
|
F
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
R
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
R
 
R
Q
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
E
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
L
 
T
P
 
A
Q
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
M
A
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
A
 
S
R
 
D
Y
 
Y
I
 
I
T
 
V
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
Y
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
W
M
 
M
N
 
S

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 98% coverage: 5:261/262 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
D
 
Q
Q
 
G
R
 
K
H
 
V
V
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
M
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
N
C
 
L
R
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
I
T
 
F
L
 
F
-
x
N
V
x
Y
D
x
N
R
x
G
A
x
S
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
P
 
A
A
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
A
A
 
K
A
 
L
L
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
H
P
 
G
Q
 
V
A
 
E
L
 
V
H
 
E
Y
 
A
V
 
M
A
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
I
R
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
F
L
 
F
P
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
R
V
 
V
H
 
D
T
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
V
x
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
E
 
R
S
 
M
D
 
K
E
 
E
A
 
D
S
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
F
 
L
V
 
C
M
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
R
 
R
H
 
T
M
 
M
V
 
M
E
 
K
A
 
-
G
 
-
T
 
Q
Q
 
R
G
 
A
A
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
E
 
N
A
 
A
L
 
G
V
x
Q
S
 
A
H
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
T
A
 
A
L
 
R
A
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
M
W
 
T
E
 
D
Q
 
K
V
 
L
D
 
D
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
K
K
 
T
R
 
K
Q
 
E
V
 
A
G
 
M
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
L
 
T
P
 
T
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
S
R
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
V
 
V
M
 
M

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:262/262 of query aligns to 5:257/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
G
M
 
I
A
 
S
L
 
E
A
 
K
C
 
L
R
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
D
C
 
I
T
 
A
L
 
V
V
 
A
D
|
D
-
x
L
-
 
P
R
 
Q
A
x
Q
P
 
E
Q
 
E
A
 
Q
P
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
I
A
 
K
A
 
L
L
 
I
A
 
E
S
 
A
H
 
A
P
 
D
Q
 
Q
A
 
K
L
 
A
H
 
V
Y
 
F
V
 
V
A
 
G
A
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
R
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
F
D
 
D
R
 
S
L
 
A
L
 
I
P
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
P
 
G
V
 
F
H
 
D
T
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
V
D
 
T
E
 
E
A
 
E
S
 
D
F
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
S
M
 
V
F
 
F
F
 
F
V
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
S
R
 
R
H
 
K
M
 
F
V
 
D
E
 
E
A
 
L
G
 
G
T
 
V
Q
 
K
G
 
G
A
 
K
S
 
I
V
 
I
I
 
N
N
 
A
M
 
A
A
x
S
S
 
I
Q
 
A
A
 
A
G
 
-
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
H
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
H
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
T
|
T
P
 
G
M
|
M
W
|
W
E
 
E
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
R
 
K
H
 
I
E
 
N
N
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
Q
 
E
V
 
Y
G
 
S
L
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
N
A
 
S
R
 
N
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
L
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
V
 
L
M
 
Y
N
 
N

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:262/262 of query aligns to 6:258/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
A
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
G
M
 
I
A
 
S
L
 
E
A
 
K
C
 
L
R
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
D
C
 
I
T
 
A
L
 
V
V
 
A
D
|
D
-
 
L
-
 
P
R
 
Q
A
x
Q
P
 
E
Q
 
E
A
 
Q
P
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
I
A
 
K
A
 
L
L
 
I
A
 
E
S
 
A
H
 
A
P
 
D
Q
 
Q
A
 
K
L
 
A
H
 
V
Y
 
F
V
 
V
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
R
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
F
D
 
D
R
 
S
L
 
A
L
 
I
P
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
P
 
G
V
 
F
H
 
D
T
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
V
D
 
T
E
 
E
A
 
E
S
 
D
F
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
S
M
 
V
F
 
F
F
 
F
V
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
S
R
 
R
H
 
K
M
 
F
V
 
D
E
 
E
A
 
L
G
 
G
T
 
V
Q
 
K
G
 
G
A
 
K
S
 
I
V
 
I
I
 
N
N
 
A
M
 
A
A
 
S
S
x
I
Q
 
A
A
 
A
G
 
-
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
x
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
H
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
H
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
D
x
G
T
|
T
P
 
G
M
 
M
W
 
W
E
 
E
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
A
L
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
K
H
 
I
E
 
N
N
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
Q
 
E
V
 
Y
G
 
S
L
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
N
A
 
S
R
 
N
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
L
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
V
 
L
M
 
Y
N
 
N

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
38% identity, 98% coverage: 7:262/262 of query aligns to 1:255/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
Q
 
K
R
 
K
H
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
R
C
 
L
R
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
A
C
 
V
T
 
A
L
 
I
V
 
A
D
|
D
R
x
Y
A
 
-
P
 
N
Q
 
D
A
 
A
P
 
T
A
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
E
A
 
I
S
 
N
H
 
Q
P
 
A
Q
 
G
A
 
G
L
 
-
H
 
H
Y
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
-
 
K
-
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
I
 
V
D
 
F
R
 
A
L
 
A
L
 
V
P
 
E
E
 
Q
A
 
A
V
 
R
A
 
K
R
 
T
F
 
L
G
 
G
P
 
G
V
 
F
H
 
D
T
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
V
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
V
D
 
T
E
 
E
A
 
E
S
 
D
F
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
S
M
 
V
F
 
F
F
 
F
V
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
V
R
 
E
H
 
A
M
 
F
V
 
K
E
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
-
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
H
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
T
|
T
P
 
G
M
|
M
W
|
W
E
 
E
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
R
 
K
H
 
I
E
 
N
N
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
Q
 
E
V
 
Y
G
 
S
L
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
D
A
 
S
R
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
V
 
V
M
 
F
N
 
N

C1DMX5 L-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD(P)(+)); RhaDH; AvLRA1; EC 1.1.1.378 from Azotobacter vinelandii (strain DJ / ATCC BAA-1303) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:262/262 of query aligns to 3:254/256 of C1DMX5

query
sites
C1DMX5
L
 
L
D
 
I
Q
 
D
R
 
K
H
 
T
V
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
E
C
 
C
R
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
C
 
V
T
 
V
L
 
I
V
 
G
D
 
H
R
x
S
A
 
G
P
 
S
Q
 
D
A
 
E
P
 
G
A
 
R
E
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
E
H
 
E
P
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
F
H
 
G
Y
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
I
D
 
A
V
 
V
-
 
G
T
 
A
R
x
D
R
x
A
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
P
 
A
E
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
V
H
 
D
T
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
 
C
D
 
P
L
x
F
A
 
H
P
 
S
L
 
F
L
 
L
E
 
D
S
 
M
D
 
P
E
 
R
A
 
E
S
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
V
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
N
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
F
 
F
V
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
R
M
 
M
V
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
-
Q
 
R
G
 
G
A
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
x
Q
S
 
T
H
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
Y
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
x
T
V
x
I
D
 
A
T
 
T
P
 
D
M
x
I
W
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
x
N
H
 
K
E
 
E
N
x
D
L
 
L
P
 
S
R
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
R
 
E
Q
 
R
V
 
M
G
 
T
L
 
S
A
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
E
P
 
P
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
M
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
V
 
F
M
 
V
N
 
N

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
37% identity, 98% coverage: 5:262/262 of query aligns to 5:258/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
D
 
S
Q
 
G
R
 
R
H
 
K
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
S
G
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
A
C
 
L
R
 
D
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
C
 
V
T
 
A
L
 
I
V
 
A
D
|
D
R
x
L
A
 
D
P
 
V
Q
 
M
A
 
A
P
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
G
H
 
L
P
 
E
Q
 
N
A
 
G
L
 
G
H
 
F
Y
 
A
V
 
V
A
 
E
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
R
 
R
A
 
A
D
 
S
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
A
L
 
M
P
 
Q
E
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
D
R
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
G
V
 
F
H
 
D
T
 
L
L
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
 
V
F
 
S
D
 
T
L
 
M
A
 
R
P
 
P
L
 
A
L
 
V
E
 
D
S
 
I
D
 
T
E
 
D
A
 
E
S
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
F
L
 
N
F
 
F
A
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
A
K
 
R
G
 
G
M
 
V
F
 
F
F
 
L
V
 
A
M
 
N
Q
 
Q
A
 
I
V
 
A
L
 
C
R
 
R
H
 
H
M
 
F
V
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
N
T
 
T
Q
 
K
G
 
G
A
 
V
S
 
-
V
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
K
R
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
P
L
 
L
V
x
L
S
 
A
H
 
H
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
F
S
 
G
Y
 
W
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
R
A
 
E
M
 
M
A
 
A
P
 
P
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
V
 
F
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
 
A
M
|
M
W
 
Q
E
 
E
Q
 
R
V
 
E
D
 
I
G
 
I
L
 
W
F
x
E
A
 
A
R
 
E
H
 
L
E
 
R
N
 
G
L
 
M
-
 
T
P
 
P
R
 
E
G
 
A
E
 
V
K
 
R
K
 
A
R
 
E
Q
 
Y
V
 
V
G
 
S
L
 
L
A
 
-
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
E
L
 
E
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
D
A
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
V
V
 
R
M
 
M
N
 
D

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:262/262 of query aligns to 3:254/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
L
 
L
D
 
I
Q
 
D
R
 
K
H
 
T
V
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
E
C
 
C
R
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
C
 
V
T
 
V
L
 
I
V
 
G
D
 
H
R
x
S
A
 
G
P
 
S
Q
 
D
A
 
E
P
 
G
A
 
R
E
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
E
H
 
E
P
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
F
H
 
G
Y
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
I
D
 
A
V
 
V
-
 
G
T
 
A
R
x
D
R
x
A
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
P
 
A
E
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
V
H
 
D
T
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
x
I
F
 
C
D
 
P
L
x
F
A
 
H
P
 
S
L
 
F
L
 
L
E
 
D
S
 
M
D
 
P
E
 
R
A
 
E
S
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
V
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
N
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
F
 
F
V
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
R
M
 
M
V
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
-
Q
 
R
G
 
G
A
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
x
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
x
Q
S
 
T
H
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
Y
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
D
M
x
I
W
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
x
N
H
 
K
E
 
E
N
 
D
L
 
L
P
 
S
R
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
R
 
E
Q
 
R
V
 
M
G
 
T
L
 
S
A
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
E
P
 
P
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
|
D
E
x
M
A
 
A
R
|
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
V
 
F
M
 
V
N
 
N

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:262/262 of query aligns to 3:254/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
L
 
L
D
 
I
Q
 
D
R
 
K
H
 
T
V
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
E
C
 
C
R
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
C
 
V
T
 
V
L
 
I
V
 
G
D
 
H
R
 
S
A
 
G
P
 
S
Q
 
D
A
 
E
P
 
G
A
 
R
E
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
E
H
 
E
P
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
F
H
 
G
Y
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
I
D
 
A
V
 
V
-
 
G
T
 
A
R
x
D
R
x
A
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
P
 
A
E
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
V
H
 
D
T
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
x
I
F
 
C
D
 
P
L
 
F
A
 
H
P
 
S
L
 
F
L
 
L
E
 
D
S
 
M
D
 
P
E
 
R
A
 
E
S
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
V
x
T
N
 
N
V
 
L
K
 
N
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
F
 
F
V
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
R
M
 
M
V
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
-
Q
 
R
G
 
G
A
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
S
 
T
H
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
Y
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
D
M
x
I
W
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
N
H
 
K
E
 
E
N
 
D
L
 
L
P
 
S
R
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
R
 
E
Q
 
R
V
 
M
G
 
T
L
 
S
A
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
E
P
 
P
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
M
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
V
 
F
M
 
V
N
 
N

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:261/262 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
D
 
Q
Q
 
D
R
 
K
H
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
M
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
V
C
 
F
R
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
C
 
V
T
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
R
x
F
A
 
N
P
 
E
Q
 
A
A
 
A
P
 
G
A
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
N
P
 
P
Q
 
G
A
 
V
L
 
V
H
 
-
Y
 
F
V
 
I
A
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
 
R
A
 
E
D
 
S
I
 
V
D
 
H
R
 
R
L
 
L
L
 
V
P
 
E
E
 
N
A
 
V
V
 
A
A
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
I
H
 
D
T
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
x
I
F
 
T
D
 
R
L
x
D
A
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
S
E
x
K
S
 
M
D
 
T
E
 
V
A
 
D
S
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
L
 
V
F
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
M
 
V
F
 
F
F
 
H
V
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
P
H
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
K
Q
 
-
G
 
-
A
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
R
 
Y
G
 
G
E
x
N
A
x
V
L
 
G
V
x
Q
S
 
T
H
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
Y
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
W
A
 
A
L
 
K
A
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
D
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
W
 
V
E
 
A
Q
 
E
V
 
V
D
 
P
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
E
 
E
N
 
K
L
 
V
P
 
I
R
 
E
G
x
K
E
 
M
K
 
K
K
 
A
R
 
Q
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
K
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
Y
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
R
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
G
Q
 
H
T
 
V
L
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
I
V
 
M
M
 
M

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
34% identity, 98% coverage: 1:258/262 of query aligns to 1:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
T
 
I
P
 
M
R
 
N
L
 
L
D
 
T
Q
 
D
R
 
K
H
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
M
 
A
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
C
 
F
R
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
V
V
 
A
D
|
D
R
 
-
A
x
I
P
 
D
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
A
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
V
A
 
R
L
 
K
A
 
E
S
 
N
H
 
N
P
 
D
Q
 
R
A
 
-
L
 
L
H
 
H
Y
 
F
V
 
V
A
 
Q
A
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
R
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
C
D
 
Q
R
 
H
L
 
A
L
 
V
P
 
E
E
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
H
R
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
L
H
 
D
T
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
V
 
I
F
 
E
D
 
I
L
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
H
E
 
E
S
 
M
D
 
E
E
 
L
A
 
S
S
 
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
L
 
V
F
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
M
 
M
F
 
F
F
 
L
V
 
M
M
 
S
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
L
 
L
R
 
K
H
 
H
M
 
M
V
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
K
Q
 
-
G
 
-
A
 
G
S
 
N
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
L
R
 
V
G
 
A
E
 
W
A
 
P
L
 
D
V
 
I
S
 
P
H
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
S
 
Q
Y
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
D
M
 
Y
A
 
A
P
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
x
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
L
W
 
N
E
 
E
Q
 
K
V
 
S
D
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
F
A
 
L
R
 
E
H
 
N
E
 
N
N
 
E
L
 
G
P
 
T
R
 
L
G
 
E
E
 
E
K
 
I
K
 
K
R
 
K
Q
 
E
V
 
K
G
 
A
L
 
K
A
 
V
V
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
K
P
 
P
Q
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
S
R
 
S
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
S
T
 
A
L
 
I
N
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
33% identity, 98% coverage: 7:262/262 of query aligns to 2:256/256 of Q48436

query
sites
Q48436
Q
 
K
R
 
K
H
 
V
V
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
x
K
A
|
A
M
x
I
A
|
A
L
|
L
A
x
R
C
x
L
R
x
V
A
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
R
x
A
C
x
V
T
x
A
L
x
I
V
x
A
D
|
D
R
 
Y
A
 
N
P
 
D
Q
 
A
A
 
T
P
 
A
A
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
E
L
 
I
A
 
N
S
 
Q
H
 
A
P
 
G
Q
 
G
A
 
R
L
 
A
H
 
M
Y
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
R
 
D
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
I
 
V
D
 
F
R
 
A
L
 
A
L
 
V
P
 
E
E
 
Q
A
 
A
V
 
R
A
 
K
R
 
T
F
 
L
G
 
G
P
 
G
V
 
F
H
 
D
T
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
A
D
 
P
L
 
S
A
 
T
P
 
P
L
 
I
L
 
E
E
 
S
S
 
I
D
 
T
E
 
P
A
 
E
S
 
I
F
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
Y
A
 
N
V
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
G
M
 
V
F
 
I
F
 
W
V
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
V
R
 
E
H
 
A
M
 
F
V
 
K
E
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
-
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
S
 
A
H
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
K
T
 
T
P
 
P
M
 
M
W
 
W
E
 
A
Q
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
R
L
 
Q
F
 
V
A
 
S
R
 
E
H
 
A
E
 
A
N
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
R
 
A
Q
 
E
V
 
F
G
 
A
L
 
K
A
 
R
V
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
L
 
E
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
C
A
 
V
V
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
D
A
 
S
R
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
V
 
V
M
 
F
N
 
N

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 98% coverage: 7:262/262 of query aligns to 2:256/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
Q
 
K
R
 
K
H
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
R
C
 
L
R
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
A
C
 
V
T
 
A
L
 
I
V
 
A
D
|
D
R
x
Y
A
 
-
P
 
N
Q
 
D
A
 
A
P
 
T
A
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
E
A
 
I
S
 
N
H
 
Q
P
 
A
Q
 
G
A
 
G
L
 
-
H
 
H
Y
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
-
 
K
-
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
|
R
A
x
D
D
 
Q
I
 
V
D
x
F
R
 
A
L
 
A
L
 
V
P
 
E
E
 
Q
A
 
A
V
 
R
A
 
K
R
 
T
F
 
L
G
 
G
P
 
G
V
 
F
H
 
D
T
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
V
 
V
F
 
A
D
 
P
L
 
S
A
 
T
P
 
P
L
 
I
L
 
E
E
 
S
S
 
I
D
 
T
E
 
P
A
 
E
S
 
I
F
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
Y
A
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
G
M
 
V
F
 
I
F
 
W
V
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
V
R
x
E
H
 
A
M
 
F
V
 
K
E
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
-
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
S
 
A
H
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
 
P
M
|
M
W
 
W
E
 
A
Q
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
R
L
 
Q
F
x
V
A
 
S
R
 
E
H
 
A
E
 
A
N
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
R
 
A
Q
 
E
V
 
F
G
 
A
L
 
K
A
 
R
V
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
L
 
E
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
C
A
 
V
V
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
D
A
 
S
R
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
V
 
V
M
 
F
N
 
N

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:261/262 of query aligns to 5:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
R
 
K
L
 
L
D
 
A
Q
 
S
R
 
K
H
 
T
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
F
A
 
G
M
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
V
C
 
L
R
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
C
 
V
T
 
I
L
 
I
V
 
A
D
|
D
R
|
R
A
 
D
P
 
A
Q
 
H
A
 
G
P
 
E
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
L
L
 
R
A
 
E
S
 
S
H
 
G
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
H
 
-
Y
 
F
V
 
I
A
 
S
A
x
C
D
 
N
V
x
I
T
 
A
R
 
E
R
 
K
A
 
T
D
 
Q
I
 
V
D
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
F
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
V
 
E
A
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
H
 
D
T
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
V
x
I
F
 
N
D
 
R
L
 
D
A
 
A
P
 
M
L
 
L
L
 
H
E
 
K
S
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
T
L
 
V
F
 
I
A
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
F
 
L
V
 
C
M
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
A
L
 
A
R
 
I
H
 
R
M
 
M
V
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
T
 
A
Q
 
-
G
 
-
A
 
G
S
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
I
A
 
A
S
 
S
Q
 
-
A
 
A
G
 
S
R
 
W
R
 
L
G
 
G
E
 
N
A
 
V
L
 
G
V
 
Q
S
 
T
H
 
N
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
A
A
 
C
L
 
R
A
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
K
H
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
D
T
|
T
P
 
D
M
 
M
W
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
P
x
T
R
 
R
G
 
G
-
 
V
-
 
P
E
 
E
K
 
N
K
 
V
R
 
W
Q
 
Q
V
 
I
G
 
M
L
 
V
A
 
S
-
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
Y
M
 
A
G
 
G
L
 
E
P
 
A
Q
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
G
G
 
E
A
 
C
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
G
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
T
 
N
A
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
M
V
 
V
M
 
L

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 5:262/262 of query aligns to 3:245/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
L
 
L
D
 
I
Q
 
D
R
 
K
H
 
T
V
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
E
C
 
C
R
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
C
 
V
T
 
V
L
 
I
V
 
G
D
x
H
R
x
S
A
 
G
P
 
S
Q
 
D
A
 
E
P
x
G
A
 
R
E
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
E
H
 
E
P
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
F
H
 
G
Y
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
I
D
 
A
V
 
V
-
 
G
T
 
A
R
x
D
R
x
A
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
P
 
A
E
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
V
H
 
D
T
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
x
I
F
 
C
D
 
P
L
 
F
A
 
H
P
 
S
L
 
F
L
 
L
E
 
D
S
 
M
D
 
P
E
 
R
A
 
E
S
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
V
x
T
N
 
N
V
 
L
K
 
N
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
F
 
F
V
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
R
M
 
M
V
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
-
Q
 
R
G
 
G
A
 
G
S
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
S
 
T
H
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
Y
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
T
V
x
I
D
 
A
T
 
D
P
 
L
M
 
-
W
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
K
K
 
R
R
 
E
Q
 
R
V
 
M
G
 
T
L
 
S
A
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
E
P
 
P
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
M
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
V
 
F
M
 
V
N
 
N

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:258/262 of query aligns to 8:262/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
T
 
T
P
 
T
R
 
R
L
 
F
D
 
T
Q
 
D
R
 
R
H
 
V
V
 
V
L
|
L
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
G
|
G
G
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
L
x
R
A
|
A
M
x
T
A
|
A
L
x
V
A
x
R
C
x
L
R
x
A
A
|
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
R
x
K
C
x
L
T
x
S
L
|
L
V
 
V
D
 
D
R
 
V
A
 
S
P
 
S
Q
 
E
A
 
G
-
 
L
P
 
E
A
 
A
E
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
E
S
 
T
H
 
A
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
-
 
E
L
 
V
H
 
L
Y
 
T
V
 
T
A
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
R
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
D
 
E
R
 
A
L
 
Y
L
 
V
P
 
T
E
 
A
A
 
T
V
 
T
A
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
R
V
 
I
H
 
D
T
 
G
L
 
F
I
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
x
E
D
 
G
L
 
K
A
 
Q
P
 
N
L
 
P
L
 
T
E
 
E
S
 
S
-
 
F
D
 
T
E
 
A
A
 
A
S
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
R
G
 
G
M
 
V
F
 
F
F
 
L
V
 
G
M
 
L
Q
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
K
H
 
I
M
 
M
V
 
R
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
S
Q
 
-
G
 
-
A
 
G
S
 
M
V
 
V
I
 
V
N
 
N
M
 
T
A
 
A
S
 
S
Q
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
I
A
 
G
L
 
N
V
 
Q
S
 
S
H
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
R
S
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
E
M
 
Y
A
 
G
P
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
A
V
 
I
D
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
W
 
V
E
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
M
-
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
D
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
P
E
 
E
N
 
N
L
 
-
P
 
P
R
 
R
-
 
K
-
 
A
G
 
A
E
 
E
K
 
E
K
 
F
R
 
I
Q
 
Q
V
 
V
G
 
N
L
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
S
G
 
K
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
L
 
E
P
 
A
Q
 
P
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
A
Q
 
T
T
 
V
L
 
V
N
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
32% identity, 100% coverage: 1:261/262 of query aligns to 1:244/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
M
 
M
T
 
K
P
 
F
R
 
E
L
 
F
D
 
E
Q
 
N
R
 
R
H
 
T
V
 
L
L
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
x
N
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
L
C
 
F
R
 
H
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
L
T
 
V
L
 
L
V
 
T
D
|
D
R
x
L
A
 
D
P
 
R
Q
 
E
A
 
G
P
 
L
A
 
D
E
 
A
A
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
G
S
 
S
H
 
-
P
 
P
Q
 
E
A
 
R
L
 
I
H
 
A
Y
 
T
V
 
I
A
 
K
A
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
S
R
 
S
R
 
A
A
 
D
D
 
D
I
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
T
L
 
V
P
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
I
H
 
D
T
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
P
N
x
S
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
 
Y
D
 
Q
L
 
A
A
 
K
P
 
P
L
 
F
L
 
A
E
 
E
S
 
M
D
 
S
E
 
D
A
 
A
S
 
D
F
 
W
D
 
H
R
 
R
L
 
T
F
 
I
A
 
S
V
x
I
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
F
F
 
Y
V
 
L
M
 
C
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
L
 
L
R
 
P
H
 
A
M
 
L
V
 
K
E
 
E
A
 
-
G
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
D
A
 
S
S
 
S
V
 
I
I
 
V
N
 
T
M
 
L
A
 
A
S
|
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
Y
R
 
R
G
 
G
E
 
A
A
 
Y
L
 
V
V
x
N
S
 
A
H
 
H
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
M
I
 
V
S
 
S
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
R
A
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
K
G
 
-
I
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
x
I
D
 
E
T
|
T
P
 
P
M
|
M
W
 
T
E
 
S
Q
 
E
V
 
L
D
 
-
G
 
-
L
 
L
F
 
K
A
 
T
R
 
R
H
 
M
E
 
D
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
T
K
 
M
R
 
T
Q
 
Q
V
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
K
R
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
K
P
 
P
Q
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
V
A
 
I
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
R
 
S
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
I
N
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
I
V
 
Y
M
 
M

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
37% identity, 97% coverage: 4:258/262 of query aligns to 1:253/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
R
 
R
L
 
F
D
 
T
Q
 
D
R
 
R
H
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
G
G
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
R
C
 
L
R
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
C
 
L
T
 
S
L
 
L
V
 
V
D
|
D
R
x
V
A
 
S
P
 
S
Q
 
E
A
 
G
-
 
L
P
 
E
A
 
A
E
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
E
S
 
T
H
 
A
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
-
 
E
L
 
V
H
 
L
Y
 
T
V
 
T
A
 
V
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
D
 
E
R
 
A
L
 
Y
L
 
V
P
 
T
E
 
A
A
 
T
V
 
T
A
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
R
V
 
I
H
 
D
T
 
G
L
 
F
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
V
x
I
F
 
E
D
 
G
L
 
K
A
 
Q
P
 
N
L
 
P
L
 
T
E
 
E
S
 
S
-
 
F
D
 
T
E
 
A
A
 
A
S
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
R
G
 
G
M
 
V
F
 
F
F
 
L
V
 
G
M
 
L
Q
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
K
H
 
I
M
 
M
V
 
R
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
S
Q
 
-
G
 
-
A
 
G
S
 
M
V
 
V
I
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
I
A
 
G
L
 
N
V
x
Q
S
 
S
H
 
G
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
R
S
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
E
M
 
Y
A
 
G
P
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
A
V
 
I
D
 
W
T
|
T
P
|
P
M
|
M
W
 
V
E
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
M
-
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
D
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
P
E
 
E
N
 
N
L
 
-
P
 
P
R
 
R
-
 
K
-
 
A
G
 
A
E
 
E
K
 
E
K
 
F
R
 
I
Q
 
Q
V
 
V
G
 
N
L
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
S
G
 
K
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
L
 
E
P
 
A
Q
 
P
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
A
Q
 
T
T
 
V
L
 
V
N
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:258/262 of query aligns to 8:243/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
L
 
L
D
 
Q
Q
 
G
R
 
K
H
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
G
x
D
G
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
L
 
Q
A
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
I
A
 
G
C
 
L
R
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
-
R
 
-
C
 
C
T
 
D
L
 
I
V
 
V
D
 
G
R
 
V
A
 
N
P
x
I
Q
 
V
A
 
E
P
 
P
A
 
K
E
 
D
A
 
T
A
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
T
S
 
A
H
 
L
P
 
G
Q
 
R
A
 
R
L
 
F
H
 
L
Y
 
S
V
 
L
A
 
T
A
 
A
D
|
D
V
x
M
T
 
S
R
 
N
R
 
V
A
 
S
D
 
G
I
 
H
D
 
A
R
 
E
L
 
L
L
 
V
P
 
E
E
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
P
 
H
V
 
V
H
 
D
T
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
 
I
F
 
I
D
 
R
L
 
R
A
 
E
P
 
D
L
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
F
D
 
S
E
 
E
A
 
K
S
 
N
F
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
M
A
 
N
V
x
L
N
 
N
V
 
I
K
 
K
G
 
S
M
 
V
F
 
F
F
 
F
V
 
M
M
 
S
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
M
 
F
V
 
I
E
 
K
A
 
Q
G
 
G
T
 
-
Q
 
K
G
 
G
A
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
M
A
 
L
G
 
S
R
 
F
R
 
Q
G
 
G
E
 
G
A
 
I
L
 
R
V
 
V
S
 
P
H
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
S
A
 
A
V
 
V
I
 
M
S
 
G
Y
 
V
T
 
T
Q
 
R
S
 
L
A
 
M
A
 
A
L
 
N
A
 
E
M
 
W
A
 
A
P
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
V
 
Y
V
x
M
D
 
A
T
|
T
P
 
N
M
x
N
W
 
T
E
 
Q
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
R
K
 
S
R
 
K
Q
 
E
V
 
I
G
 
L
L
 
D
A
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
W
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
L
A
 
M
G
 
G
A
 
P
A
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
A
A
 
S
R
 
D
Y
 
Y
I
 
I
T
 
N
A
 
G
Q
 
Y
T
 
T
L
 
I
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
36% identity, 97% coverage: 4:258/262 of query aligns to 3:245/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
R
 
R
L
 
L
D
 
L
Q
 
N
R
 
K
H
 
T
V
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
N
G
x
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
T
A
 
A
L
 
K
A
 
R
C
 
F
R
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
C
 
V
T
 
F
L
 
I
V
 
V
D
 
G
R
|
R
A
x
R
P
 
R
Q
 
K
A
 
E
P
 
L
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
G
S
 
R
H
 
N
P
 
V
Q
 
T
A
 
A
L
 
-
H
 
-
Y
 
-
V
 
V
A
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
R
 
L
A
 
E
D
 
D
I
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
Y
P
 
A
E
 
I
A
 
V
V
 
R
A
 
E
R
 
Q
F
 
R
G
 
G
P
 
S
V
 
I
H
 
D
T
 
V
L
 
L
I
 
F
N
 
A
N
|
N
A
x
S
A
x
G
V
 
A
F
 
I
D
 
E
L
 
Q
A
 
K
P
 
T
L
 
L
L
 
E
E
 
E
S
 
I
D
 
T
E
 
P
A
 
E
S
 
H
F
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
V
K
 
R
G
 
G
M
 
L
F
 
I
F
 
F
V
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
P
H
 
L
M
 
L
V
 
R
E
 
D
A
 
G
G
 
G
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
L
M
 
T
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
V
R
 
L
G
 
G
E
 
L
A
 
Q
L
 
A
V
x
H
S
 
D
H
 
T
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
S
Y
 
L
T
 
A
Q
 
R
S
 
T
A
 
W
A
 
T
L
 
T
A
 
E
M
 
L
A
 
K
P
 
G
H
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
S
P
 
P
G
|
G
V
 
A
V
x
I
D
 
D
T
|
T
P
 
P
M
x
I
W
 
I
E
 
E
Q
 
-
V
 
-
D
 
N
G
 
Q
L
 
V
F
 
S
A
 
T
R
x
Q
H
 
E
E
 
E
N
 
A
L
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
D
E
 
E
K
 
L
K
 
R
R
 
A
Q
 
K
V
 
F
G
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
V
G
 
G
L
 
R
P
 
P
Q
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
S
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
A
A
 
G
Q
 
I
T
 
E
L
 
L
N
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_038211943.1 NCBI__GCF_000745855.1:WP_038211943.1
MTPRLDQRHVLITGAGGGIGLAMALACRAEGARCTLVDRAPQAPAEAAAALASHPQALHY
VAADVTRRADIDRLLPEAVARFGPVHTLINNAAVFDLAPLLESDEASFDRLFAVNVKGMF
FVMQAVLRHMVEAGTQGASVINMASQAGRRGEALVSHYCATKAAVISYTQSAALAMAPHG
IRVNGIAPGVVDTPMWEQVDGLFARHENLPRGEKKRQVGLAVPLGRMGLPQDVAGAAVFL
ASDEARYITAQTLNVDGGNVMN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory