SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_038805763.1 NCBI__GCF_000382825.1:WP_038805763.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3asvA The closed form of serine dehydrogenase complexed with NADP+ (see paper)
44% identity, 98% coverage: 5:253/253 of query aligns to 3:248/248 of 3asvA

query
sites
3asvA
V
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
|
T
S
 
A
G
|
G
I
x
F
G
 
G
E
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
T
R
 
R
A
 
R
Y
 
F
L
 
I
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
E
 
H
N
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
A
T
 
T
G
 
G
R
|
R
R
|
R
T
 
Q
D
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
D
E
 
E
F
 
L
A
 
G
E
 
D
T
 
N
F
 
L
P
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
W
 
Y
T
 
I
F
 
A
P
 
Q
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
N
M
 
R
T
 
A
M
 
A
V
 
I
K
 
E
T
 
E
V
 
M
C
 
L
S
 
A
D
 
S
I
 
L
L
 
P
E
 
A
T
 
E
I
 
W
G
 
C
Q
 
N
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
E
P
 
P
Y
 
A
Q
 
H
D
 
K
Y
 
A
E
 
S
E
 
V
L
 
E
G
 
D
M
 
W
L
 
E
T
 
T
M
 
M
L
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
V
A
 
Y
V
 
M
T
 
T
R
 
R
C
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
V
 
V
K
 
E
A
 
R
N
 
N
Q
 
H
G
 
G
H
 
H
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
G
 
G
S
|
S
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
S
Y
 
W
A
 
P
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
N
V
 
V
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
F
V
 
V
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
S
 
S
D
 
L
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
T
D
 
D
T
 
L
I
 
H
A
 
G
T
 
T
D
 
A
I
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
T
T
 
D
I
 
I
Q
 
E
P
 
P
G
|
G
I
 
L
V
|
V
-
 
G
E
 
G
T
|
T
D
x
E
F
|
F
S
 
S
T
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
H
 
K
G
 
G
D
 
D
K
 
D
E
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
E
T
 
K
V
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
N
I
 
T
E
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
S
D
 
E
T
 
A
V
 
V
V
 
W
Y
 
W
V
 
V
T
 
S
S
 
T
Q
 
L
P
 
P
R
 
A
R
 
H
V
 
V
Q
 
N
I
 
I
T
 
N
D
 
T
M
 
L
T
 
E
I
 
M
M
 
M
A
 
P
-
 
V
N
 
T
Q
 
Q
Q
 
S
A
 
Y
T
 
A
G
 
G
F
 
L
M
 
N
V
 
V
H
 
H
K
 
R
K
 
Q

Q05016 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase; L-allo-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.381 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)
40% identity, 99% coverage: 3:252/253 of query aligns to 14:266/267 of Q05016

query
sites
Q05016
K
 
K
N
 
T
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
A
G
 
S
E
 
N
-
 
G
-
 
D
-
 
M
N
 
K
V
 
L
V
 
I
L
 
L
T
 
A
G
 
A
R
 
R
R
 
R
T
 
L
D
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
K
E
 
T
F
 
I
A
 
D
E
 
Q
T
 
E
F
 
F
P
 
P
N
 
N
Q
 
A
T
 
K
V
 
V
W
 
H
T
 
V
F
 
A
P
 
Q
L
 
L
D
 
D
V
 
I
T
 
T
D
 
Q
M
 
A
T
 
E
M
 
K
V
 
I
K
 
K
T
 
P
V
 
F
C
 
I
S
 
E
D
 
N
I
 
L
L
 
P
E
 
Q
T
 
E
I
 
F
G
 
K
Q
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
S
A
 
D
P
 
R
Y
 
V
Q
 
G
D
 
Q
Y
 
I
E
 
A
E
 
T
L
 
E
G
 
D
M
 
I
L
 
Q
T
 
D
M
 
V
L
 
F
D
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
V
K
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
I
A
 
N
V
 
I
T
 
T
R
 
Q
C
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
F
V
 
Q
K
 
A
A
 
K
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
D
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
L
G
 
G
S
 
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
R
Y
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
P
G
 
T
A
 
G
A
 
S
V
 
I
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
K
 
G
T
 
A
F
 
F
S
 
T
D
 
D
G
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
K
D
 
E
T
 
L
I
 
I
A
 
N
T
 
T
D
 
K
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
I
T
 
L
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
T
D
 
E
F
 
F
S
 
S
T
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
Y
H
 
R
G
 
G
D
 
N
K
 
E
E
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
T
 
N
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
K
G
 
D
I
 
T
E
 
T
A
 
P
L
 
L
Q
 
M
A
 
A
Q
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
T
 
L
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
T
 
T
S
 
S
Q
 
R
P
 
K
R
 
Q
R
 
N
V
 
T
Q
 
V
I
 
I
T
 
A
D
 
D
M
 
T
T
 
L
I
 
I
M
 
F
A
 
P
N
 
T
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
S
G
 
P
F
 
H
M
 
H
V
 
I
H
 
F
K
 
R

3rkuA Substrate fingerprint and the structure of NADP+ dependent serine dehydrogenase from saccharomyces cerevisiae complexed with NADP+
40% identity, 99% coverage: 3:252/253 of query aligns to 15:267/268 of 3rkuA

query
sites
3rkuA
K
 
K
N
 
T
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
A
G
 
S
E
 
N
-
 
G
-
 
D
-
 
M
N
 
K
V
 
L
V
 
I
L
 
L
T
 
A
G
 
A
R
|
R
R
|
R
T
 
L
D
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
K
E
 
T
F
 
I
A
 
D
E
 
Q
T
 
E
F
 
F
P
 
P
N
 
N
Q
 
A
T
 
K
V
 
V
W
 
H
T
 
V
F
 
A
P
 
Q
L
 
L
D
|
D
V
x
I
T
 
T
D
 
Q
M
 
A
T
 
E
M
 
K
V
 
I
K
 
K
T
 
P
V
 
F
C
 
I
S
 
E
D
 
N
I
 
L
L
 
P
E
 
Q
T
 
E
I
 
F
G
 
K
Q
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
K
A
|
A
L
 
L
G
 
G
L
 
S
A
 
D
P
 
R
Y
 
V
Q
 
G
D
 
Q
Y
 
I
E
 
A
E
 
T
L
 
E
G
 
D
M
 
I
L
 
Q
T
 
D
M
 
V
L
 
F
D
 
D
T
 
T
N
|
N
V
 
V
K
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
I
A
 
N
V
 
I
T
 
T
R
 
Q
C
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
F
V
 
Q
K
 
A
A
 
K
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
D
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
L
G
 
G
S
|
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
R
Y
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
P
G
 
T
A
 
G
A
 
S
V
 
I
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
K
 
G
T
 
A
F
 
F
S
 
T
D
 
D
G
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
K
D
 
E
T
 
L
I
 
I
A
 
N
T
 
T
D
 
K
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
I
T
 
L
I
 
I
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
L
V
|
V
E
 
E
T
|
T
D
x
E
F
|
F
S
 
S
T
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
Y
H
 
R
G
 
G
D
x
N
K
 
E
E
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
T
 
N
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
K
G
 
D
I
 
T
E
 
T
A
 
P
L
 
L
Q
 
M
A
 
A
Q
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
T
 
L
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
T
 
T
S
 
S
Q
 
R
P
 
K
R
 
Q
R
 
N
V
 
T
Q
 
V
I
 
I
T
 
A
D
 
D
M
 
T
T
 
L
I
 
I
M
 
F
A
 
P
N
 
T
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
S
G
 
P
F
 
H
M
 
H
V
 
I
H
 
F
K
 
R

Q9P7B4 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase; L-allo-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.381 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:253/253 of query aligns to 7:257/259 of Q9P7B4

query
sites
Q9P7B4
K
 
K
N
 
T
V
 
I
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
S
I
 
T
A
 
A
R
 
F
A
 
E
Y
 
I
L
 
A
E
 
K
Q
 
V
G
 
A
E
 
K
-
 
V
N
 
K
V
 
L
V
 
I
L
 
L
T
 
A
G
 
A
R
 
R
R
 
R
T
 
F
D
x
S
R
x
T
L
 
V
E
 
E
A
 
E
L
 
I
K
 
A
S
 
K
E
 
E
F
 
L
A
 
E
E
 
S
T
 
K
F
 
Y
P
 
-
N
 
E
Q
 
V
T
 
S
V
 
V
W
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
K
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
L
T
 
K
M
 
S
V
 
I
K
 
P
T
 
G
V
 
V
C
 
I
S
 
E
D
 
S
I
 
L
L
 
P
E
 
K
T
 
E
I
 
F
G
 
A
Q
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
T
A
 
D
P
 
K
Y
 
V
Q
 
I
D
 
D
Y
 
L
E
 
N
E
 
I
L
 
D
G
 
D
M
 
A
L
 
V
T
 
T
M
 
M
L
 
I
D
 
T
T
 
T
N
 
N
V
 
V
K
 
L
G
 
G
L
 
M
M
 
M
A
 
A
V
 
M
T
 
T
R
 
R
C
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
F
V
 
Y
K
 
S
A
 
K
N
 
N
Q
 
K
G
 
G
H
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
N
M
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
R
Y
 
E
A
 
S
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
A
 
G
A
 
S
V
 
V
Y
 
Y
S
 
C
A
 
S
T
 
T
K
 
K
A
 
S
A
 
A
V
 
L
K
 
A
T
 
Q
F
 
F
S
 
T
D
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
K
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
D
T
 
T
D
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
I
T
 
M
T
 
E
I
 
V
Q
 
D
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
T
D
 
E
F
 
F
S
 
S
T
 
V
V
 
V
R
 
R
F
 
F
H
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
K
E
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
D
T
 
N
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
K
G
 
N
I
 
S
E
 
E
A
 
P
L
 
L
Q
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
V
V
 
I
V
 
L
Y
 
F
V
 
A
T
 
L
S
 
T
Q
 
R
P
 
R
R
 
E
R
 
N
V
 
V
Q
 
V
I
 
I
T
 
A
D
 
D
M
 
T
T
 
L
I
 
V
M
 
F
A
 
P
N
 
S
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
G
T
 
G
G
 
A
F
 
N
M
 
H
V
 
V
H
 
Y
K
 
R
K
 
K

6ixjA The crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from klebsiella oxytoca (see paper)
41% identity, 96% coverage: 2:245/253 of query aligns to 1:242/251 of 6ixjA

query
sites
6ixjA
A
 
S
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
x
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
Y
 
F
L
 
A
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
E
 
W
N
 
S
V
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
G
R
|
R
R
|
R
T
 
F
D
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
K
A
 
T
L
 
L
K
 
Q
S
 
D
E
 
K
F
 
L
A
 
A
E
 
S
T
 
Q
F
 
V
P
 
P
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
V
 
V
W
 
H
T
 
I
F
 
I
P
 
E
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
M
 
S
T
 
D
M
 
S
V
 
V
K
 
A
T
 
A
V
 
A
C
 
V
S
 
A
D
 
A
I
 
L
L
 
P
E
 
A
T
 
D
I
 
F
G
 
A
Q
 
D
I
 
I
D
 
T
I
 
T
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
P
A
 
Q
P
 
P
Y
 
A
Q
 
Q
D
 
K
Y
 
V
E
 
D
E
 
L
L
 
D
G
 
D
M
 
W
L
 
K
T
 
T
M
 
M
L
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
V
 
V
K
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
V
A
 
N
V
 
V
T
 
T
R
 
H
C
 
A
F
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
T
M
 
L
V
 
I
K
 
N
A
 
H
N
 
G
Q
 
A
G
 
G
-
 
A
H
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
G
 
G
S
|
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
Y
 
W
A
 
P
Y
|
Y
A
 
P
G
 
G
A
 
S
A
 
H
V
 
V
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
F
V
 
V
K
 
K
T
 
Q
F
 
F
S
 
S
D
 
Y
G
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
C
D
 
D
T
 
L
I
 
L
A
 
G
T
 
T
D
 
G
I
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
T
T
 
D
I
 
L
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
I
V
x
A
E
 
E
T
|
T
D
x
E
F
|
F
S
 
T
T
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
T
H
 
K
G
 
G
D
 
D
K
 
Q
E
 
A
R
 
A
A
 
S
A
 
D
T
 
N
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
R
G
 
G
I
 
T
E
 
T
A
 
P
L
 
L
Q
 
S
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
Q
V
 
M
V
 
F
Y
 
Y
V
 
I
T
 
A
S
 
T
Q
 
L
P
 
P
R
 
D
R
 
H
V
 
M
Q
 
N
I
 
I
T
 
N
D
 
R
M
 
V
T
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
P
N
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A

2japA Clavulanic acid dehydrogenase: structural and biochemical analysis of the final step in the biosynthesis of the beta-lactamase inhibitor clavulanic acid (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:244/253 of query aligns to 6:244/245 of 2japA

query
sites
2japA
K
 
K
N
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
L
 
A
E
 
A
Q
 
E
G
 
G
E
 
A
N
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
I
T
 
A
G
x
A
R
|
R
R
|
R
T
 
V
D
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
G
S
 
D
E
 
E
F
 
L
A
 
-
E
 
-
T
 
T
F
 
A
P
 
A
N
 
G
Q
 
A
T
 
K
V
 
V
W
 
H
T
 
V
F
 
L
P
 
E
L
|
L
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
M
 
R
T
 
Q
M
 
G
V
 
V
K
 
D
T
 
A
V
 
A
C
 
V
S
 
A
D
 
S
I
 
T
L
 
V
E
 
E
T
 
A
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
x
M
L
 
L
G
 
-
L
 
L
A
 
G
P
 
P
Y
 
V
Q
 
E
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
E
 
T
L
 
T
G
 
D
M
 
W
L
 
T
T
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
V
 
L
K
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
Y
V
 
M
T
 
T
R
 
R
C
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
L
V
 
L
K
 
R
A
 
-
N
 
S
Q
 
K
G
 
G
H
 
T
I
 
V
I
 
V
N
 
Q
M
|
M
G
x
S
S
|
S
T
 
I
A
|
A
G
 
G
I
 
R
Y
 
V
A
 
N
Y
 
V
A
 
R
G
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
|
Y
S
 
Q
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
G
V
 
V
K
 
N
T
 
A
F
 
F
S
 
S
D
 
E
G
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
Q
D
 
E
T
 
V
I
 
T
A
 
E
T
 
R
D
 
G
I
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
V
T
 
V
I
 
I
Q
 
E
P
|
P
G
 
G
I
x
T
V
x
T
E
 
D
T
|
T
D
x
E
F
x
L
S
 
R
T
 
G
V
 
H
R
 
I
F
 
T
H
 
H
-
 
T
G
x
A
D
 
T
K
 
K
E
 
E
R
 
M
A
x
Y
A
 
E
T
 
Q
V
x
R
Y
 
I
Q
 
S
G
 
Q
I
 
I
E
 
R
A
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
V
V
 
R
Y
 
Y
V
 
A
T
 
V
S
 
T
Q
 
A
P
 
P
R
 
H
R
 
H
V
 
A
Q
 
T
I
 
V
T
 
H
D
 
E
M
 
I
T
 
F
I
 
I
M
 
R
A
 
P
N
 
T
Q
 
D
Q
 
Q

2jahC Biochemical and structural analysis of the clavulanic acid dehydeogenase (cad) from streptomyces clavuligerus (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:244/253 of query aligns to 7:245/246 of 2jahC

query
sites
2jahC
K
 
K
N
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
L
 
A
E
 
A
Q
 
E
G
 
G
E
 
A
N
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
I
T
 
A
G
x
A
R
|
R
R
|
R
T
 
V
D
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
G
S
 
D
E
 
E
F
 
L
A
 
-
E
 
-
T
 
T
F
 
A
P
 
A
N
 
G
Q
 
A
T
 
K
V
 
V
W
 
H
T
 
V
F
 
L
P
 
E
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
M
 
R
T
 
Q
M
 
G
V
 
V
K
 
D
T
 
A
V
 
A
C
 
V
S
 
A
D
 
S
I
 
T
L
 
V
E
 
E
T
 
A
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
 
M
L
 
L
G
 
-
L
 
L
A
 
G
P
 
P
Y
 
V
Q
 
E
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
E
 
T
L
 
T
G
 
D
M
 
W
L
 
T
T
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
V
 
L
K
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
Y
V
 
M
T
 
T
R
 
R
C
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
L
V
 
L
K
 
R
A
 
-
N
 
S
Q
 
K
G
 
G
H
 
T
I
 
V
I
 
V
N
 
Q
M
|
M
G
 
S
S
|
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
R
Y
 
V
A
 
N
Y
 
V
A
 
R
G
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
|
Y
S
 
Q
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
G
V
 
V
K
 
N
T
 
A
F
 
F
S
 
S
D
 
E
G
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
Q
D
 
E
T
 
V
I
 
T
A
 
E
T
 
R
D
 
G
I
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
V
T
 
V
I
 
I
Q
 
E
P
|
P
G
|
G
I
x
T
V
x
T
E
 
D
T
|
T
D
x
E
F
x
L
S
 
R
T
 
G
V
 
H
R
 
I
F
 
T
H
 
H
-
 
T
G
x
A
D
 
T
K
 
K
E
 
E
R
 
M
A
 
Y
A
 
E
T
 
Q
V
 
R
Y
 
I
Q
 
S
G
 
Q
I
 
I
E
 
R
A
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
V
V
 
R
Y
 
Y
V
 
A
T
 
V
S
 
T
Q
 
A
P
 
P
R
 
H
R
 
H
V
 
A
Q
 
T
I
 
V
T
 
H
D
 
E
M
 
I
T
 
F
I
 
I
M
 
R
A
 
P
N
 
T
Q
 
D
Q
 
Q

1xg5C Structure of human putative dehydrogenase mgc4172 in complex with nadp
34% identity, 92% coverage: 6:239/253 of query aligns to 14:252/257 of 1xg5C

query
sites
1xg5C
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
L
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
E
 
L
N
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
G
T
 
C
G
x
A
R
|
R
R
x
T
T
 
V
D
 
G
R
 
N
L
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
A
S
 
A
E
 
E
F
 
C
A
 
K
E
 
S
T
 
A
F
 
G
P
 
Y
N
 
P
Q
 
G
T
 
T
V
 
L
W
 
I
T
 
P
F
 
Y
P
 
R
L
 
C
D
|
D
V
x
L
T
 
S
D
 
N
M
 
E
T
 
E
M
 
D
V
 
I
K
 
L
T
 
S
V
 
M
C
 
F
S
 
S
D
 
A
I
 
I
L
 
R
E
 
S
T
 
Q
I
 
H
G
 
S
Q
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
C
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
L
A
 
A
L
 
R
G
 
P
L
 
D
A
 
T
P
 
L
Y
 
L
Q
 
S
D
 
G
Y
 
S
E
 
T
E
 
S
L
 
-
G
 
G
M
 
W
L
 
K
T
 
D
M
 
M
L
 
F
D
 
N
T
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
S
A
 
I
V
 
C
T
 
T
R
 
R
C
 
E
F
 
A
L
 
Y
P
 
Q
A
 
S
M
 
M
V
 
K
K
 
E
A
 
R
N
 
N
-
 
V
-
 
D
Q
 
D
G
 
G
H
 
H
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
G
 
N
S
|
S
T
 
M
A
 
S
G
 
G
-
 
H
-
 
R
I
 
V
Y
 
L
A
 
P
Y
 
L
A
 
S
G
 
V
A
 
T
A
 
H
V
 
F
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
 
T
T
 
A
F
 
L
S
 
T
D
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
R
-
 
Q
-
 
E
I
 
L
D
 
R
T
 
E
I
 
A
A
 
Q
T
 
T
D
 
H
I
 
I
K
 
R
V
 
A
T
 
T
T
 
C
I
 
I
Q
 
S
P
 
P
G
|
G
I
 
V
V
|
V
E
 
E
T
|
T
D
 
Q
F
|
F
S
 
A
T
 
F
V
x
K
R
 
L
F
 
H
H
 
D
G
 
K
D
 
D
K
 
P
E
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
T
Y
 
Y
Q
 
E
G
 
Q
I
 
M
E
 
K
A
 
C
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
V
 
V
T
 
L
S
 
S
Q
 
T
P
 
P
R
 
A
R
 
H
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
T
 
G
D
 
D
M
 
I
T
 
Q
I
 
M

A0A1U8QWA2 Glycine betaine reductase ATRR; Nonribosomal peptide synthetase-like protein ATRR; EC 1.2.1.-; EC 1.1.1.- from Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) (Aspergillus nidulans) (see paper)
31% identity, 94% coverage: 2:239/253 of query aligns to 1029:1263/1270 of A0A1U8QWA2

query
sites
A0A1U8QWA2
A
x
G
K
|
K
N
x
V
V
x
A
V
|
V
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
E
x
A
A
|
A
I
x
V
A
|
A
R
x
T
A
|
A
Y
x
L
L
x
A
E
x
R
Q
x
E
G
|
G
E
x
A
N
x
H
V
|
V
V
x
A
L
|
L
T
x
G
G
x
A
R
|
R
R
|
R
T
x
L
D
|
D
R
x
A
L
|
L
E
|
E
A
x
S
L
|
L
K
|
K
S
x
E
E
x
K
F
x
L
A
x
S
E
x
A
T
x
S
F
 
-
P
 
-
N
x
G
Q
x
V
T
x
K
V
|
V
W
x
V
T
|
T
F
x
C
P
x
K
L
x
T
D
|
D
V
|
V
T
|
T
D
|
D
M
x
R
T
x
K
M
x
Q
V
|
V
K
x
E
T
x
G
V
x
L
C
x
V
S
x
K
D
x
A
I
x
A
L
x
T
E
|
E
T
x
E
I
x
L
G
|
G
Q
x
P
I
x
V
D
|
D
I
|
I
L
|
L
V
|
V
N
x
A
N
x
C
A
|
A
G
|
G
L
x
V
A
x
M
-
x
Y
-
x
F
-
x
T
-
x
M
L
x
M
G
x
A
L
x
N
A
x
T
P
x
Q
Y
x
M
Q
x
D
D
x
E
Y
x
W
E
|
E
E
x
R
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
-
M
x
T
L
x
V
D
|
D
T
x
V
N
|
N
V
x
C
K
|
K
G
|
G
L
x
I
M
x
L
A
x
N
V
x
S
T
x
L
R
x
A
C
x
S
F
x
T
L
x
V
P
|
P
A
x
G
M
|
M
V
x
L
K
x
A
A
x
R
N
x
G
Q
x
K
G
|
G
H
|
H
I
x
V
I
x
V
N
x
A
M
x
I
G
x
S
S
|
S
T
x
D
A
|
A
G
|
G
I
x
R
Y
x
K
A
x
V
Y
x
F
A
x
P
G
|
G
A
x
L
A
x
G
V
|
V
Y
|
Y
S
|
S
A
|
A
T
x
S
K
|
K
A
x
F
A
x
F
V
|
V
K
x
E
T
x
A
F
x
T
S
x
L
D
x
Q
G
x
A
L
|
L
R
|
R
I
x
L
D
x
E
T
|
T
I
x
A
A
x
G
T
x
Q
D
x
G
I
x
L
K
x
R
V
|
V
T
|
T
T
x
A
I
x
V
Q
|
Q
P
|
P
G
|
G
I
x
N
V
x
T
E
x
A
T
|
T
D
|
D
F
x
L
S
x
L
T
x
G
V
x
M
R
x
S
F
x
T
H
x
D
G
x
A
D
x
E
K
x
A
E
x
I
R
x
K
A
x
K
A
x
Y
T
x
G
V
x
E
Y
x
P
Q
x
S
G
|
G
I
x
A
E
x
Q
A
x
I
L
|
L
Q
x
D
A
x
P
Q
x
E
D
|
D
I
x
V
A
|
A
D
x
N
T
x
S
V
x
I
V
x
I
Y
|
Y
V
x
A
T
x
L
S
x
R
Q
|
Q
P
|
P
R
x
E
R
x
H
V
|
V
Q
 
A
I
 
M
T
 
N
D
 
E
M
 
I
T
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3p19A Improved NADPH-dependent blue fluorescent protein (see paper)
36% identity, 96% coverage: 1:244/253 of query aligns to 1:237/239 of 3p19A

query
sites
3p19A
M
 
M
A
 
K
K
 
K
N
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
Y
 
F
L
 
S
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
E
 
H
N
 
P
V
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
L
G
x
A
R
|
R
R
|
R
T
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
-
S
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
N
F
 
L
P
 
P
N
 
N
Q
 
-
T
 
-
V
 
T
W
 
L
T
 
C
F
 
A
P
 
Q
L
 
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
M
 
K
T
 
Y
M
 
T
V
 
F
K
 
D
T
 
T
V
 
A
C
 
I
S
 
T
D
 
R
I
 
A
L
 
E
E
 
K
T
 
I
I
 
Y
G
 
G
Q
 
P
I
 
A
D
 
D
I
 
A
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
M
A
 
M
L
 
L
-
 
L
G
 
G
L
 
Q
A
 
I
P
 
D
Y
 
T
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
A
E
 
N
E
 
E
L
 
W
G
 
Q
M
 
-
L
 
-
T
 
R
M
 
M
L
 
F
D
 
D
T
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
L
A
 
N
V
 
G
T
 
M
R
 
Q
C
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
A
A
 
P
M
 
M
V
 
K
K
 
A
A
 
R
N
 
N
Q
 
C
G
 
G
H
 
T
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
G
 
S
S
|
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
K
Y
 
K
A
 
T
Y
 
F
A
 
P
G
 
D
A
 
H
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
S
 
C
A
 
G
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
K
 
H
T
 
A
F
 
I
S
 
S
D
 
E
G
 
N
L
 
V
R
 
R
I
 
E
D
 
E
T
 
V
I
 
A
A
 
A
T
 
S
D
 
N
I
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
M
T
 
T
I
 
I
Q
 
A
P
|
P
G
 
S
I
x
A
V
|
V
E
 
K
T
|
T
D
x
E
F
x
L
-
 
L
-
 
S
-
 
H
S
 
T
T
 
T
V
 
S
R
 
Q
F
 
Q
H
 
I
G
 
K
D
 
D
K
 
G
E
 
Y
R
 
D
A
 
A
A
 
W
T
 
R
V
 
V
Y
 
D
Q
 
M
G
 
G
I
 
-
E
 
G
A
 
V
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
R
T
 
A
V
 
V
V
 
L
Y
 
F
V
 
A
T
 
Y
S
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
R
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
C
I
 
I
T
 
R
D
 
E
M
 
I
T
 
A
I
 
L
M
 
A
A
 
P
N
 
T
Q
 
K
Q
 
Q

A0A140FAN3 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase; Steroleosin; EC 1.1.1.146; EC 1.1.1.62 from Pinus massoniana (Chinese red pine) (see paper)
36% identity, 77% coverage: 3:196/253 of query aligns to 48:238/356 of A0A140FAN3

query
sites
A0A140FAN3
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
L
 
A
E
 
K
Q
 
R
G
 
R
E
 
A
N
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
A
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
S
L
 
I
K
 
R
S
 
-
E
 
E
F
 
K
A
 
A
E
 
R
T
 
T
F
 
L
P
 
G
N
 
A
Q
 
K
T
 
N
V
 
V
W
 
L
T
 
V
F
 
I
P
 
A
L
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
V
D
 
K
M
 
E
T
 
E
M
 
D
V
 
C
K
 
K
T
 
R
V
 
F
C
 
I
S
 
D
D
 
E
I
 
T
L
 
I
E
 
N
T
 
Q
I
 
Y
G
 
G
Q
 
H
I
 
L
D
 
D
I
 
H
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
H
G
 
S
L
 
F
A
 
L
P
 
F
Y
 
E
Q
 
E
D
 
A
Y
 
S
E
 
D
E
 
T
L
 
S
G
 
G
M
 
F
L
 
A
T
 
H
M
 
M
L
 
M
D
 
D
T
 
I
N
 
N
V
 
F
K
 
W
G
 
G
L
 
S
M
 
V
A
 
Y
V
 
P
T
 
T
R
 
F
C
 
F
F
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
L
V
 
R
K
 
R
A
 
R
N
 
N
Q
 
-
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
V
M
 
N
G
 
A
S
 
S
T
 
V
A
 
E
G
 
G
I
 
W
Y
 
L
A
 
P
Y
 
M
A
 
P
G
 
R
A
 
M
A
 
S
V
 
L
Y
 
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
V
T
x
S
F
|
F
S
x
Y
D
x
E
G
x
T
L
|
L
R
|
R
I
|
I
D
x
E
T
 
-
I
|
I
A
x
G
T
x
G
D
x
A
I
|
I
K
x
D
V
x
I
T
|
T
T
x
I
I
x
A
Q
x
T
P
|
P
G
|
G
I
x
W
V
x
I
E
|
E
T
x
S
D
|
D
F
x
M
S
x
T
T
x
R
V
x
G
R
|
R
F
|
F

Sites not aligning to the query:

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
31% identity, 95% coverage: 2:242/253 of query aligns to 8:241/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
A
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
L
Y
 
L
L
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
E
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
T
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
T
 
E
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
S
S
 
D
E
 
Y
F
 
L
A
 
G
E
 
D
T
 
N
F
 
G
P
 
K
N
 
G
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
M
P
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
M
 
P
T
 
E
M
 
S
V
 
I
K
 
E
T
 
A
V
 
V
C
 
L
S
 
K
D
 
A
I
 
I
L
 
T
E
 
D
T
 
E
I
 
F
G
 
G
Q
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
x
I
A
 
T
L
 
R
-
 
D
G
 
N
L
 
L
A
 
L
P
 
M
Y
 
R
Q
 
M
D
 
K
Y
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
W
G
 
S
M
 
-
L
 
-
T
 
D
M
 
I
L
 
M
D
 
E
T
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
S
L
 
I
M
 
F
A
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
C
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
R
A
 
G
M
 
M
V
 
M
K
 
K
A
 
K
N
 
R
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
V
G
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
Y
 
M
A
 
G
Y
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
I
T
 
G
F
 
F
S
 
T
D
 
K
G
 
S
L
 
M
R
 
A
I
 
R
D
 
E
T
 
V
I
 
A
A
 
S
T
 
R
D
 
G
I
 
V
K
 
T
V
 
V
T
 
N
T
 
T
I
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
x
I
E
 
E
T
|
T
D
 
D
F
x
M
S
 
T
T
 
-
V
 
-
R
 
K
F
 
A
H
 
L
G
 
N
D
 
D
K
 
E
E
 
Q
R
 
R
A
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
L
Y
 
A
Q
 
Q
G
 
-
I
 
V
E
 
P
A
 
A
L
 
G
Q
 
R
A
 
L
Q
 
G
D
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
T
 
A
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
T
 
A
S
 
S
Q
 
-
P
 
P
R
 
E
R
 
A
V
 
A
Q
 
Y
I
 
I
T
 
T
D
 
G
M
 
E
T
 
T
I
 
L
M
 
H
A
 
V
N
 
N

4qecA Elxo with NADP bound (see paper)
31% identity, 75% coverage: 1:190/253 of query aligns to 1:188/248 of 4qecA

query
sites
4qecA
M
 
M
A
 
K
K
 
K
N
 
N
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
T
 
F
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
R
 
L
A
 
E
Y
 
F
L
 
L
E
 
K
Q
 
N
G
 
D
E
 
Y
N
 
H
V
 
V
V
 
C
L
 
I
T
 
T
G
x
S
R
|
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
E
R
x
K
T
 
E
D
 
K
R
 
R
L
 
I
E
 
P
A
 
H
L
 
L
K
 
F
S
 
S
E
 
S
F
 
Y
A
 
E
E
 
E
T
 
N
F
 
-
P
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
V
 
I
W
 
S
T
 
F
F
 
Y
P
 
Q
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
M
 
E
T
 
E
M
 
Q
V
 
V
K
 
N
T
 
E
V
 
I
C
 
I
S
 
N
D
 
K
I
 
I
L
 
V
E
 
K
T
 
K
I
 
F
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
 
S
L
 
L
G
 
S
L
 
D
A
 
G
P
 
L
Y
 
L
Q
 
T
D
 
E
Y
 
T
E
 
K
E
 
T
L
 
T
G
 
D
M
 
F
L
 
N
T
 
K
M
 
M
L
 
I
D
 
N
T
 
T
N
|
N
V
 
I
K
 
L
G
 
G
L
 
T
M
 
Y
A
 
F
V
 
C
T
 
M
R
 
K
C
 
Y
F
 
A
L
 
L
P
 
K
A
 
H
M
 
M
V
 
Q
K
 
K
A
 
V
N
 
S
Q
 
C
G
 
G
H
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
I
G
 
S
S
|
S
T
 
I
A
 
T
G
 
G
I
 
L
Y
 
S
A
 
G
Y
 
F
A
 
P
G
 
Y
A
 
S
A
 
I
V
 
L
Y
|
Y
S
 
G
A
 
S
T
 
T
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
I
T
 
G
F
 
L
S
 
T
D
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
A
I
 
V
D
 
E
T
 
F
I
 
A
A
 
D
T
 
K
D
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
I
T
 
N
T
 
A
I
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
 
G
I
 
I
V
x
I
E
 
K
T
 
T
D
 
E

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
31% identity, 95% coverage: 2:242/253 of query aligns to 8:237/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
A
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
L
Y
 
L
L
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
E
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
T
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
T
 
E
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
S
S
 
D
E
 
Y
F
 
L
A
 
G
E
 
D
T
 
N
F
 
G
P
 
K
N
 
G
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
M
P
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
M
 
P
T
 
E
M
 
S
V
 
I
K
 
E
T
 
A
V
 
V
C
 
L
S
 
K
D
 
A
I
 
I
L
 
T
E
 
D
T
 
E
I
 
F
G
 
G
Q
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
L
 
R
-
 
D
G
 
N
L
 
L
A
 
L
P
 
M
Y
 
R
Q
 
M
D
 
K
Y
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
W
G
 
S
M
 
-
L
 
-
T
 
D
M
 
I
L
 
M
D
 
E
T
 
T
N
|
N
V
 
L
K
 
T
G
 
S
L
 
I
M
 
F
A
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
C
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
R
A
 
G
M
 
M
V
 
M
K
 
K
A
 
K
N
 
R
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
V
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
Y
 
M
A
 
G
Y
 
N
A
 
A
G
 
G
A
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
I
T
 
G
F
 
F
S
 
T
D
 
K
G
 
S
L
 
M
R
 
A
I
 
R
D
 
E
T
 
V
I
 
A
A
 
S
T
 
R
D
 
G
I
 
V
K
 
T
V
 
V
T
 
N
T
 
T
I
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
D
 
D
F
 
M
S
 
N
T
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
D
K
 
E
E
 
Q
R
 
R
A
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
L
Y
 
A
Q
 
Q
G
 
-
I
 
V
E
 
P
A
 
A
L
 
G
Q
 
R
A
 
L
Q
 
G
D
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
T
 
A
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
T
 
A
S
 
S
Q
 
-
P
 
P
R
 
E
R
 
A
V
 
A
Q
 
Y
I
 
I
T
 
T
D
 
G
M
 
E
T
 
T
I
 
L
M
 
H
A
 
V
N
 
N

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
32% identity, 89% coverage: 3:227/253 of query aligns to 5:223/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
K
 
K
N
 
I
V
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
Y
 
F
L
 
V
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
E
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
T
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
T
 
E
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
S
S
 
G
E
 
Y
F
 
L
A
 
G
E
 
A
T
 
N
F
 
G
P
 
K
N
 
G
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
F
P
 
M
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
K
D
 
D
M
 
A
T
 
Q
M
 
S
V
 
I
K
 
D
T
 
S
V
 
V
C
 
L
S
 
A
D
 
S
I
 
I
L
 
R
E
 
A
T
 
E
I
 
F
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
x
I
A
 
T
-
 
R
-
 
D
-
 
N
-
 
L
L
 
L
G
 
M
L
 
R
A
 
M
P
 
K
Y
 
D
Q
 
D
D
 
E
Y
 
W
E
 
E
E
 
D
L
 
I
G
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
L
D
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
S
L
 
V
M
 
F
A
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
C
 
A
F
 
V
L
 
M
P
 
C
A
 
A
M
 
M
V
 
M
K
 
K
A
 
K
N
 
R
Q
 
F
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
M
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
Y
 
M
A
 
G
Y
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
K
 
I
T
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
K
G
 
S
L
 
L
R
 
A
I
 
R
D
 
E
T
 
V
I
 
A
A
 
S
T
 
R
D
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
T
 
V
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
Y
V
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
F
 
M
S
 
T
T
 
-
V
 
-
R
 
R
F
 
A
H
 
L
G
 
T
D
 
D
K
 
D
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
-
V
 
I
Y
 
L
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
P
A
 
A
L
 
N
Q
 
R
-
 
P
-
 
G
-
 
D
A
 
A
Q
 
K
D
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
T
 
A
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
T
 
A
S
 
S

P19337 3alpha-hydroxy bile acid-CoA-ester 3-dehydrogenase 2; 3alpha-hydroxysteroid dehydrogenase 2; 3alpha-HSDH 2; Bile acid-inducible protein BaiA2; EC 1.1.1.395 from Clostridium scindens (strain JCM 10418 / VPI 12708) (see paper)
29% identity, 75% coverage: 3:193/253 of query aligns to 7:196/249 of P19337

query
sites
P19337
K
 
K
N
 
V
V
 
T
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
T
|
T
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
I
Y
 
F
L
 
I
E
 
D
Q
 
N
G
 
G
E
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
S
L
 
I
T
 
F
G
 
G
R
x
E
R
 
T
T
 
Q
D
 
E
R
x
E
L
 
V
E
 
D
A
 
T
L
 
A
K
 
L
S
 
A
E
 
Q
F
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
E
Q
 
E
T
 
E
V
 
V
W
 
L
T
 
G
F
 
F
P
 
A
L
 
P
D
 
D
V
 
L
T
 
T
D
 
S
M
 
R
T
 
D
M
 
A
V
 
V
K
 
M
T
 
A
V
 
A
C
 
V
S
 
G
D
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
Q
T
 
K
I
 
Y
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
L
 
S
G
 
N
L
 
N
A
 
V
P
 
-
Y
 
F
Q
 
S
D
 
R
Y
 
V
E
 
S
E
 
E
L
 
E
G
 
E
M
 
F
L
 
K
T
 
H
M
 
I
L
 
M
D
 
D
T
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
T
G
 
G
L
 
V
M
 
F
A
 
N
V
 
G
T
 
A
R
 
W
C
 
C
F
 
A
L
 
Y
P
 
Q
A
 
C
M
 
M
V
 
K
K
 
D
A
 
A
N
 
K
Q
 
K
G
 
G
H
 
V
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
T
G
 
A
S
 
S
T
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
I
Y
 
F
A
 
G
Y
 
S
A
 
L
G
 
S
A
 
G
A
 
V
V
 
G
Y
 
Y
S
 
P
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
V
 
V
K
 
I
T
 
G
F
 
L
S
 
T
D
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
G
I
 
R
D
 
E
T
 
I
I
 
I
A
 
R
T
 
K
D
 
N
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
V
T
 
G
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
V
V
|
V
E
x
N
T
|
T
D
 
D
F
 
M
S
 
T
T
 
N

4is3C Crystal structure of a 3alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (baia2) associated with secondary bile acid synthesis from clostridium scindens vpi12708 in complex with a putative NAD(+)-oh- adduct at 2.0 a resolution
29% identity, 75% coverage: 3:193/253 of query aligns to 8:197/250 of 4is3C

query
sites
4is3C
K
 
K
N
 
V
V
 
T
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
T
|
T
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
I
Y
 
F
L
 
I
E
 
D
Q
 
N
G
 
G
E
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
S
L
 
I
T
 
F
G
 
G
R
x
E
R
 
T
T
 
Q
D
 
E
R
x
E
L
 
V
E
 
D
A
 
T
L
 
A
K
 
L
S
 
A
E
 
Q
F
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
E
Q
 
E
T
 
E
V
 
V
W
 
L
T
 
G
F
 
F
P
 
A
L
 
P
D
 
D
V
x
L
T
 
T
D
 
S
M
 
R
T
 
D
M
 
A
V
 
V
K
 
M
T
 
A
V
 
A
C
 
V
S
 
G
D
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
Q
T
 
K
I
 
Y
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
 
T
L
 
S
G
 
N
L
 
N
A
 
V
P
 
-
Y
 
F
Q
 
S
D
 
R
Y
 
V
E
 
S
E
 
E
L
 
E
G
x
E
M
 
F
L
 
K
T
 
H
M
 
I
L
 
M
D
 
D
T
x
I
N
 
N
V
 
V
K
 
T
G
 
G
L
 
V
M
 
F
A
 
N
V
 
G
T
 
A
R
 
W
C
 
C
F
 
A
L
 
Y
P
 
Q
A
 
C
M
 
M
V
 
K
K
 
D
A
 
A
N
 
K
Q
 
K
G
 
G
H
 
V
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
G
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
I
Y
 
F
A
 
G
Y
 
S
A
 
L
G
 
S
A
 
G
A
 
V
V
 
G
Y
|
Y
S
 
P
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
V
 
V
K
 
I
T
 
G
F
 
L
S
 
T
D
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
G
I
 
R
D
 
E
T
 
I
I
 
I
A
 
R
T
 
K
D
 
N
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
V
T
 
G
I
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
I
x
V
V
|
V
E
 
N
T
|
T
D
 
D
F
x
M
S
 
T
T
 
N

7w61A Crystal structure of farnesol dehydrogenase from helicoverpa armigera (see paper)
32% identity, 94% coverage: 1:239/253 of query aligns to 7:241/249 of 7w61A

query
sites
7w61A
M
 
V
A
 
G
K
 
K
N
 
T
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
C
R
 
V
A
 
E
Y
 
L
L
 
A
E
 
N
Q
 
A
G
 
G
E
 
I
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
G
T
 
V
G
x
A
R
|
R
R
|
R
T
 
T
D
 
G
R
 
P
L
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
T
E
 
Q
F
 
V
A
 
K
E
 
G
T
 
-
F
 
-
P
 
-
N
 
K
Q
 
G
T
 
S
V
 
I
W
 
T
T
 
A
F
 
R
P
 
Q
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
S
M
 
P
T
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
A
T
 
E
V
 
T
C
 
F
S
 
K
D
 
W
I
 
I
L
 
D
E
 
D
T
 
N
I
 
L
G
 
G
Q
 
C
I
 
V
D
 
H
I
 
I
L
 
M
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
A
 
F
L
 
T
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
T
P
 
D
Y
 
V
Q
 
G
D
 
G
-
 
D
-
 
M
Y
 
I
E
 
S
E
 
E
L
 
K
G
 
D
M
 
I
L
 
M
T
 
S
M
 
V
L
 
I
D
 
D
T
x
I
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
P
M
 
I
A
 
L
V
 
C
T
 
S
R
 
R
C
 
H
F
 
A
L
 
I
P
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
T
K
 
R
A
 
N
N
 
K
-
 
F
Q
 
D
G
 
G
H
 
H
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
I
G
 
N
S
 
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
H
Y
 
Y
A
 
V
Y
 
P
A
 
W
G
 
S
A
 
S
A
 
K
-
 
F
-
 
N
V
 
V
Y
|
Y
S
 
A
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
Y
A
 
G
V
 
L
K
 
T
T
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
A
G
 
S
L
 
L
R
 
-
I
 
L
D
 
N
T
 
E
I
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
H
-
 
K
T
 
N
D
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
V
T
 
T
T
 
S
I
 
V
Q
 
S
P
|
P
G
|
G
I
x
L
V
|
V
E
 
R
T
|
T
D
x
A
F
x
M
S
 
T
T
 
V
V
 
A
R
 
A
F
 
-
H
 
-
G
 
D
D
 
D
K
 
S
E
 
E
R
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
M
E
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
A
 
P
Q
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
T
 
A
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
T
 
I
S
 
S
Q
 
T
P
 
P
R
 
P
R
 
T
V
 
V
Q
 
N
I
 
I
T
 
N
D
 
E
M
 
L
T
 
T
I
 
I

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
31% identity, 89% coverage: 3:227/253 of query aligns to 6:224/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
K
 
K
N
 
I
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
T
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
Y
 
L
L
 
A
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
E
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
T
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
T
 
E
D
 
N
R
 
G
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
S
S
 
D
E
 
Y
F
 
L
A
 
G
E
 
A
T
 
N
F
 
G
P
 
K
N
 
G
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
L
P
 
M
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
M
 
P
T
 
A
M
 
S
V
 
I
K
 
E
T
 
S
V
 
V
C
 
L
S
 
E
D
 
K
I
 
I
L
 
R
E
 
A
T
 
E
I
 
F
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
L
 
R
G
 
D
-
 
N
-
 
L
L
 
L
A
 
M
P
 
R
Y
 
M
Q
 
K
D
 
D
Y
 
E
E
 
E
E
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
W
L
 
N
T
 
D
M
 
I
L
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
S
G
 
S
L
 
V
M
 
F
A
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
C
 
A
F
 
V
L
 
M
P
 
R
A
 
A
M
 
M
V
 
M
K
 
K
A
 
K
N
 
R
Q
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
M
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
Y
 
M
A
 
G
Y
 
N
A
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
x
A
A
|
A
T
x
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
K
 
I
T
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
K
G
 
S
L
 
L
R
 
A
I
 
R
D
 
E
T
 
V
I
 
A
A
 
S
T
 
R
D
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
T
 
V
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
V
x
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
F
 
M
S
 
T
T
 
-
V
 
-
R
 
R
F
 
A
H
 
L
G
 
S
D
 
D
K
 
D
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
I
V
 
L
Y
 
A
Q
 
Q
G
 
-
I
 
V
E
 
P
A
 
A
L
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
A
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
T
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
31% identity, 89% coverage: 3:227/253 of query aligns to 5:223/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
K
 
K
N
 
I
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
Y
 
L
L
 
A
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
E
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
T
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
T
 
E
D
 
N
R
 
G
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
S
S
 
D
E
 
Y
F
 
L
A
 
G
E
 
A
T
 
N
F
 
G
P
 
K
N
 
G
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
L
P
 
M
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
M
 
P
T
 
A
M
 
S
V
 
I
K
 
E
T
 
S
V
 
V
C
 
L
S
 
E
D
 
K
I
 
I
L
 
R
E
 
A
T
 
E
I
 
F
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
A
 
T
L
 
R
G
 
D
-
 
N
-
 
L
L
 
L
A
 
M
P
 
R
Y
 
M
Q
 
K
D
 
D
Y
 
E
E
|
E
E
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
W
L
 
N
T
 
D
M
 
I
L
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
S
G
 
S
L
 
V
M
 
F
A
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
C
 
A
F
 
V
L
 
M
P
 
R
A
 
A
M
 
M
V
 
M
K
 
K
A
 
K
N
 
R
Q
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
M
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
Y
 
M
A
 
G
Y
 
N
A
 
G
G
 
G
A
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
K
 
I
T
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
K
G
 
S
L
 
L
R
 
A
I
 
R
D
 
E
T
 
V
I
 
A
A
 
S
T
 
R
D
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
T
 
V
I
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
x
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
F
 
M
S
 
T
T
 
-
V
 
-
R
 
R
F
 
A
H
 
L
G
 
S
D
 
D
K
 
D
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
I
V
 
L
Y
 
A
Q
 
Q
G
 
-
I
 
V
E
 
P
A
 
A
L
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
A
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
T
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_038805763.1 NCBI__GCF_000382825.1:WP_038805763.1
MAKNVVITGATSGIGEAIARAYLEQGENVVLTGRRTDRLEALKSEFAETFPNQTVWTFPL
DVTDMTMVKTVCSDILETIGQIDILVNNAGLALGLAPYQDYEELGMLTMLDTNVKGLMAV
TRCFLPAMVKANQGHIINMGSTAGIYAYAGAAVYSATKAAVKTFSDGLRIDTIATDIKVT
TIQPGIVETDFSTVRFHGDKERAATVYQGIEALQAQDIADTVVYVTSQPRRVQITDMTIM
ANQQATGFMVHKK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory