SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_038806127.1 NCBI__GCF_000382825.1:WP_038806127.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q59931 NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [NADP(+)]; Non-phosphorylating glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase; Triosephosphate dehydrogenase; EC 1.2.1.9 from Streptococcus mutans serotype c (strain ATCC 700610 / UA159) (see 3 papers)
73% identity, 100% coverage: 3:474/474 of query aligns to 4:475/475 of Q59931

query
sites
Q59931
N
 
Q
Y
 
Y
Q
 
K
N
 
N
L
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
E
W
 
W
K
 
K
S
 
L
S
 
S
E
 
E
K
 
N
E
 
E
I
 
I
T
 
K
I
 
I
Y
 
Y
S
 
E
P
 
P
I
 
A
N
 
S
Q
 
G
E
 
A
K
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A
M
 
M
S
 
S
Q
 
T
A
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
D
E
 
Y
A
 
V
M
 
Y
K
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
Q
P
 
P
A
 
A
W
 
W
R
 
R
D
 
S
L
 
L
A
 
S
P
 
Y
V
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
K
 
K
T
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
M
R
 
R
D
 
D
K
 
K
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
V
G
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
|
R
T
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
N
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
M
T
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
M
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
N
 
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
x
S
P
 
P
F
 
F
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
A
G
 
G
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
V
V
 
I
M
 
A
F
 
F
K
|
K
P
 
P
P
 
P
T
|
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
E
 
E
H
 
H
K
 
Q
E
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
I
 
I
N
 
N
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
|
T
P
x
G
I
|
I
G
|
G
E
|
E
R
|
R
I
|
I
G
|
G
R
x
K
L
x
M
A
|
A
G
|
G
M
|
M
R
|
R
P
|
P
I
|
I
M
|
M
L
|
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
H
 
L
A
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
 
C
T
 
T
A
 
A
I
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
M
E
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
E
L
 
K
L
 
I
Q
 
R
A
 
E
E
 
K
V
 
V
A
 
L
K
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
P
F
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
T
A
 
K
S
 
S
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
I
 
V
W
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
N
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
T
P
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
L
 
L
I
 
I
W
 
C
P
 
P
G
 
I
L
 
L
F
 
F
D
 
D
Y
 
K
V
 
V
T
 
T
R
 
T
D
 
D
M
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
A
W
 
W
E
 
E
E
|
E
L
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
T
D
 
S
A
 
V
N
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
E
I
 
I
A
 
S
N
 
N
E
 
K
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
D
 
D
F
 
F
K
 
P
K
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
Q
L
 
L
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
H
 
H
I
 
I
N
 
N
N
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
P
 
T
D
 
D
N
 
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
K
G
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
I
 
V
K
 
K
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
N
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
S
I
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
V
 
I
K
 
K

2esdA Crystal structure of thioacylenzyme intermediate of an NADP dependent aldehyde dehydrogenase (see paper)
73% identity, 100% coverage: 3:474/474 of query aligns to 3:474/474 of 2esdA

query
sites
2esdA
N
 
Q
Y
 
Y
Q
 
K
N
 
N
L
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
E
W
 
W
K
 
K
S
 
L
S
 
S
E
 
E
K
 
N
E
 
E
I
 
I
T
 
K
I
 
I
Y
 
Y
S
 
E
P
 
P
I
 
A
N
 
S
Q
 
G
E
 
A
K
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A
M
 
M
S
 
S
Q
 
T
A
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
D
E
 
Y
A
 
V
M
 
Y
K
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
Q
P
 
P
A
 
A
W
 
W
R
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
Y
V
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
K
 
K
T
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
M
R
 
R
D
 
D
K
 
K
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
V
G
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
|
R
T
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
N
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
M
T
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
M
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
N
 
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
S
P
 
P
F
|
F
N
|
N
Y
|
Y
P
 
P
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
A
G
 
G
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
V
V
 
I
M
 
A
F
 
F
K
|
K
P
 
P
P
|
P
T
|
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
|
G
S
 
S
E
 
E
I
 
I
G
|
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
E
 
E
H
 
H
K
 
Q
E
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
I
 
I
N
 
N
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
T
 
T
P
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
P
I
 
I
M
 
M
L
 
L
E
x
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
H
 
L
A
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
C
|
C
T
|
T
A
 
A
I
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
M
E
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
E
L
 
K
L
 
I
Q
 
R
A
 
E
E
 
K
V
 
V
A
 
L
K
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
P
F
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
T
A
x
K
S
|
S
A
 
A
D
 
D
F
x
Y
I
 
V
W
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
N
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
T
P
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
L
 
L
I
 
I
W
 
C
P
 
P
G
 
I
L
 
L
F
 
F
D
 
D
Y
 
K
V
 
V
T
 
T
R
 
T
D
 
D
M
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
A
W
 
W
E
 
E
E
|
E
L
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
T
D
 
S
A
 
V
N
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
E
I
 
I
A
 
S
N
 
N
E
 
K
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
D
 
D
F
 
F
K
 
P
K
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
Q
L
 
L
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
H
 
H
I
 
I
N
 
N
N
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
|
Q
R
|
R
G
 
G
P
 
T
D
 
D
N
 
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
K
G
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
I
Q
|
Q
G
 
G
I
 
V
K
 
K
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
N
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
S
I
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
V
 
I
K
 
K

1qi1B Ternary complex of an NADP dependent aldehyde dehydrogenase (see paper)
73% identity, 100% coverage: 3:474/474 of query aligns to 3:474/474 of 1qi1B

query
sites
1qi1B
N
 
Q
Y
 
Y
Q
 
K
N
 
N
L
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
E
W
 
W
K
 
K
S
 
L
S
 
S
E
 
E
K
 
N
E
 
E
I
 
I
T
 
K
I
 
I
Y
 
Y
S
 
E
P
 
P
I
 
A
N
 
S
Q
 
G
E
 
A
K
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A
M
 
M
S
 
S
Q
 
T
A
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
D
E
 
Y
A
 
V
M
 
Y
K
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
Q
P
 
P
A
 
A
W
 
W
R
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
Y
V
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
K
 
K
T
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
M
R
 
R
D
 
D
K
 
K
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
V
G
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
T
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
N
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
M
T
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
M
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
N
 
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
S
P
|
P
F
|
F
N
|
N
Y
|
Y
P
 
P
V
 
V
N
 
N
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
S
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
V
V
 
I
M
 
A
F
 
F
K
|
K
P
 
P
P
|
P
T
|
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
|
G
S
 
S
E
 
E
I
 
I
G
|
G
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
E
 
E
H
 
H
K
 
Q
E
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
I
 
I
N
 
N
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
P
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
P
I
 
I
M
 
M
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
H
 
L
A
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
C
x
S
T
|
T
A
 
A
I
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
M
E
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
E
L
 
K
L
 
I
Q
 
R
A
 
E
E
 
K
V
 
V
A
 
L
K
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
P
F
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
T
A
 
K
S
 
S
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
I
 
V
W
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
N
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
T
P
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
N
L
 
L
I
 
I
W
 
C
P
 
P
G
 
I
L
 
L
F
 
F
D
 
D
Y
 
K
V
 
V
T
 
T
R
 
T
D
 
D
M
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
A
W
 
W
E
 
E
E
|
E
L
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
T
D
 
S
A
 
V
N
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
E
I
 
I
A
 
S
N
 
N
E
 
K
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
D
 
D
F
 
F
K
 
P
K
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
Q
L
 
L
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
H
 
H
I
 
I
N
 
N
N
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
P
 
T
D
 
D
N
 
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
K
G
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
I
Q
|
Q
G
 
G
I
 
V
K
 
K
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
N
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
S
I
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
V
 
I
K
 
K

3rhhD Crystal structure of NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase from bacillus halodurans c-125 complexed with NADP
56% identity, 99% coverage: 3:473/474 of query aligns to 3:475/480 of 3rhhD

query
sites
3rhhD
N
 
N
Y
 
A
Q
 
N
N
 
I
L
 
L
V
 
R
N
 
N
G
 
G
N
 
E
W
 
W
K
 
V
S
 
E
S
 
S
E
 
R
-
 
T
-
 
G
K
 
E
E
 
R
I
 
I
T
 
S
I
 
I
Y
 
S
S
 
A
P
 
P
I
 
A
N
 
S
Q
 
G
E
 
V
K
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
A
M
 
L
S
 
S
Q
 
Q
A
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
N
E
 
D
A
 
A
M
 
I
K
 
Q
A
 
G
A
 
A
R
 
K
A
 
D
A
 
A
L
 
Q
P
 
K
A
 
I
W
 
W
R
 
K
D
 
I
L
 
R
A
 
P
P
 
I
V
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
V
A
 
D
Y
 
L
L
 
L
H
 
Y
K
 
A
T
 
W
A
 
A
D
 
D
I
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
E
D
 
R
K
 
K
E
 
E
K
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
M
K
 
H
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
P
I
 
K
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
S
R
 
R
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
R
F
 
H
A
 
T
A
 
A
E
 
D
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
L
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
M
 
L
E
 
K
G
 
G
G
 
D
G
 
Q
F
 
F
E
 
K
A
 
G
A
 
G
S
 
S
K
 
S
N
 
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
|
I
A
 
S
P
|
P
F
|
F
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
T
V
 
V
M
 
V
F
 
F
K
|
K
P
|
P
P
x
A
T
|
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
L
S
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
K
L
 
M
A
 
V
K
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
A
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
I
N
 
Q
T
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
|
G
S
 
S
E
 
V
I
 
I
G
|
G
D
|
D
Y
 
H
I
 
L
I
 
V
E
 
E
H
 
H
K
 
P
E
 
G
V
 
I
N
 
D
F
 
M
I
 
I
N
 
T
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
T
 
T
P
 
T
I
x
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
G
 
S
R
 
E
L
 
K
A
 
A
G
 
K
M
 
M
R
 
I
P
 
P
I
 
V
M
 
V
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
D
A
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
K
H
 
L
A
 
T
A
 
A
K
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
I
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
V
 
Q
E
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
A
L
 
N
L
 
I
Q
 
K
A
 
E
E
 
L
V
 
V
A
 
E
K
 
Q
L
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
S
P
 
P
F
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
D
 
D
N
 
E
A
 
K
S
 
S
A
 
A
D
 
A
F
 
F
I
 
I
W
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
D
D
 
D
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
K
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
T
A
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
G
I
 
N
K
 
K
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
L
 
L
I
 
L
W
 
S
P
 
P
G
 
T
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
A
M
 
M
K
 
R
L
 
V
A
 
A
W
 
W
E
 
E
E
|
E
L
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
K
D
 
D
A
 
A
N
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
S
I
 
L
A
 
S
N
 
N
E
 
Q
S
 
S
E
 
D
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
K
D
 
D
F
 
T
K
 
D
K
 
R
A
 
A
F
 
I
E
 
N
I
 
I
A
 
G
E
 
K
K
 
H
L
 
L
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
H
 
H
I
 
I
N
 
N
N
 
A
K
 
K
T
 
T
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
N
 
H
F
 
F
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
G
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
|
Q
G
 
G
I
 
I
K
 
K
Y
 
P
S
 
S
I
 
L
E
 
L
A
 
S
M
 
M
T
 
T
N
 
R
V
 
E
K
 
R
S
 
V
I
 
T
V
 
V
F
 
L
D
 
N
V
 
L

3rhdA Crystal structure of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gapn from methanocaldococcus jannaschii dsm 2661 complexed with NADP
38% identity, 96% coverage: 15:471/474 of query aligns to 2:454/456 of 3rhdA

query
sites
3rhdA
S
 
N
E
 
R
K
 
E
E
 
D
I
 
M
T
 
D
I
 
V
Y
 
I
S
 
N
P
 
P
I
 
Y
N
 
S
Q
 
L
E
 
E
K
 
V
L
 
I
G
 
K
T
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
A
M
 
L
S
 
S
Q
 
R
A
 
E
E
 
E
V
 
A
D
 
K
E
 
E
A
 
A
M
 
I
K
 
D
A
 
T
A
 
A
R
 
E
A
 
K
A
 
Y
L
 
K
P
 
E
A
 
V
W
 
M
R
 
K
D
 
N
L
 
L
A
 
P
P
 
I
V
 
T
E
 
K
R
 
R
A
 
Y
A
 
N
Y
 
I
L
 
L
H
 
M
K
 
N
T
 
I
A
 
A
D
 
K
I
 
Q
L
 
I
E
 
K
R
 
E
D
 
K
K
 
K
E
 
E
K
 
E
I
 
L
G
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
D
V
 
A
A
 
G
K
 
K
G
 
P
I
 
I
K
 
K
A
 
Q
A
 
A
I
 
R
G
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
E
R
 
R
T
 
S
A
 
I
D
 
G
L
 
T
I
 
F
R
 
K
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
F
Q
 
Y
A
 
V
M
 
K
E
 
E
G
 
H
G
 
R
G
 
D
F
 
E
E
 
V
A
 
I
A
 
P
S
 
S
K
 
D
N
 
D
K
 
R
L
 
L
A
 
I
V
 
F
V
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
L
 
G
A
 
A
I
|
I
A
x
T
P
 
P
F
|
F
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
V
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
A
S
 
H
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
I
 
A
A
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
V
 
I
M
 
V
F
 
H
K
x
H
P
 
P
P
x
S
T
x
S
Q
x
K
G
 
A
S
 
P
I
 
L
S
 
V
G
 
C
L
 
I
L
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
I
F
 
I
D
 
E
E
 
N
A
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
G
 
N
I
 
V
P
 
P
A
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
T
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
A
G
|
G
S
x
E
E
 
V
I
 
V
G
|
G
D
|
D
Y
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
V
H
 
N
K
 
E
E
 
K
V
 
V
N
 
N
F
 
M
I
 
I
N
 
S
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
T
 
S
P
 
K
I
x
V
G
 
G
E
 
E
R
 
L
I
 
I
G
 
T
R
 
K
L
 
K
A
 
A
G
 
G
M
 
F
R
 
K
P
 
K
I
 
I
M
 
A
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
V
D
 
N
A
 
P
A
 
N
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
N
H
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
N
Q
 
A
I
 
L
V
 
I
G
 
K
G
 
G
A
 
S
F
 
F
S
 
I
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
I
A
 
S
I
 
V
K
 
G
R
 
M
V
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
D
E
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
K
L
 
F
A
 
I
E
 
E
L
 
M
L
 
F
Q
 
V
A
 
N
E
 
K
V
 
A
A
 
K
K
 
V
L
 
L
T
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
P
F
 
L
D
 
D
-
 
E
N
 
K
A
 
T
D
 
D
I
 
V
T
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
I
D
 
S
N
 
V
A
 
E
S
 
H
A
 
A
D
 
E
F
 
W
I
 
V
W
 
E
G
 
K
L
 
V
I
 
V
Q
 
E
D
 
K
A
 
A
Q
 
I
E
 
D
K
 
E
G
 
G
A
 
G
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
L
P
 
G
I
 
G
K
 
K
R
 
R
E
 
D
G
 
K
N
 
A
L
 
L
I
 
F
W
 
Y
P
 
P
G
 
T
L
 
I
F
 
L
D
 
E
Y
 
-
V
 
V
T
 
D
R
 
R
D
 
D
M
 
N
K
 
I
L
 
L
A
 
C
W
 
K
E
 
T
E
|
E
L
 
T
F
 
F
G
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
R
 
R
V
 
-
A
 
T
D
 
N
A
 
E
N
 
E
E
 
E
A
 
M
V
 
I
A
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
E
 
S
S
 
T
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
H
S
 
S
S
 
A
V
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
D
 
D
F
 
I
K
 
N
K
 
K
A
 
S
F
 
L
E
 
K
I
 
F
A
 
A
E
 
E
K
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
F
G
 
G
T
 
G
V
 
V
H
 
V
I
 
I
N
 
N
N
 
D
K
 
S
T
 
S
Q
 
L
R
 
F
G
 
R
P
 
Q
D
 
D
N
 
N
F
 
M
P
 
P
F
 
F
L
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
G
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
L
G
 
G
V
 
R
Q
x
E
G
 
G
I
 
V
K
 
K
Y
 
Y
S
 
A
I
 
M
E
 
E
A
 
E
M
 
M
T
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
K
S
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
I

8hapB Crystal structure of thermostable acetaldehyde dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon sulfolobus tokodaii (see paper)
38% identity, 95% coverage: 19:469/474 of query aligns to 3:461/466 of 8hapB

query
sites
8hapB
I
 
I
T
 
E
I
 
I
Y
 
K
S
 
S
P
 
P
I
 
S
N
 
N
Q
 
L
E
 
K
K
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
P
 
K
A
 
R
M
 
M
S
 
S
Q
 
K
A
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
R
E
 
G
A
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
K
A
 
G
L
 
F
P
 
E
A
 
T
W
 
I
R
 
S
D
 
R
L
 
M
A
 
P
P
 
L
V
 
Y
E
 
K
R
 
R
A
 
T
A
 
A
Y
 
I
L
 
L
H
 
R
K
 
K
T
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
R
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
K
 
R
I
 
L
G
 
A
T
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
M
E
 
E
V
 
A
A
 
G
K
 
K
G
 
P
I
 
I
K
 
K
A
 
D
A
 
S
I
 
R
G
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
M
R
 
R
T
 
A
A
 
S
D
 
R
L
 
L
I
 
F
R
 
R
F
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
A
-
 
A
L
 
I
R
 
V
I
 
L
T
 
E
G
 
G
Q
 
K
A
 
N
M
 
Y
E
 
R
G
 
V
G
 
D
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
-
 
Y
-
 
P
A
 
P
A
 
G
S
 
N
K
 
E
N
 
N
K
 
R
L
 
I
A
 
V
V
 
I
V
 
S
R
 
T
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
T
A
 
A
I
|
I
A
x
L
P
 
P
F
|
F
N
 
N
Y
 
F
P
 
P
V
 
I
N
 
N
L
 
S
S
 
F
G
 
A
S
 
H
K
 
K
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
S
V
 
V
M
 
V
F
 
V
K
|
K
P
 
P
P
x
S
T
x
I
Q
 
S
G
 
T
S
 
P
I
 
L
S
 
S
G
 
A
L
 
I
L
 
E
L
 
M
A
 
K
K
 
K
A
 
I
F
 
L
D
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
S
V
 
A
F
 
V
N
 
R
T
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Y
G
x
S
S
 
N
E
 
E
I
 
I
G
|
G
D
 
D
Y
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
K
 
P
E
 
L
V
 
V
N
 
G
F
 
L
I
 
I
N
 
T
F
 
L
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
P
 
Q
I
x
T
G
 
G
E
 
L
R
 
A
I
|
I
G
 
A
R
 
S
L
 
K
A
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
P
 
-
I
 
I
M
 
I
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
S
D
 
D
A
 
P
A
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
I
E
 
D
H
 
R
A
 
A
A
 
S
K
 
S
Q
 
I
I
 
A
V
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
R
F
 
Y
S
 
E
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
N
C
 
C
T
 
N
A
 
A
I
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
I
L
 
I
V
 
V
V
 
R
E
 
E
S
 
E
V
 
I
A
 
Y
D
 
D
R
 
K
L
 
F
A
 
V
E
 
K
L
 
A
L
 
F
Q
 
K
A
 
E
E
 
K
V
 
V
A
 
K
K
 
A
L
 
L
T
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
F
 
L
D
 
D
N
 
E
A
 
S
-
 
T
D
 
D
I
 
I
T
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
I
D
 
N
N
 
Q
A
 
E
S
 
S
A
 
V
D
 
E
F
 
K
I
 
L
W
 
N
G
 
K
L
 
A
I
 
L
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
K
 
K
G
 
G
-
 
G
-
 
N
A
 
V
K
 
E
A
 
V
L
 
L
S
 
N
P
 
K
I
 
G
K
 
P
R
 
E
E
 
T
G
 
G
N
 
Y
L
 
F
I
 
F
W
 
P
P
 
L
G
 
S
L
 
L
F
 
V
D
 
T
Y
 
N
V
 
P
T
 
S
R
 
L
D
 
D
M
 
M
K
 
L
L
 
V
A
 
L
W
 
K
E
 
T
E
 
E
L
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
I
L
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
V
R
 
S
V
 
V
A
 
K
D
 
S
A
 
D
N
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
N
I
 
I
A
 
A
N
 
N
E
 
S
S
 
T
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
S
 
A
V
 
I
F
 
F
T
 
S
N
 
N
D
 
D
F
 
V
K
 
N
K
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
K
K
 
E
L
 
L
E
 
K
V
 
F
G
 
G
T
 
A
V
 
I
H
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
D
K
 
S
T
 
T
Q
 
R
R
 
L
G
 
R
P
 
W
D
 
D
N
 
S
F
 
L
P
 
P
F
 
F
L
 
G
G
 
G
V
 
F
K
 
K
G
 
K
S
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
G
V
 
R
Q
 
E
G
 
G
I
 
V
K
 
R
Y
 
D
S
 
T
I
 
M
E
 
L
A
 
E
M
 
M
T
 
T
N
 
E
V
 
N
K
 
K
S
 
L
I
 
I

8hapA Crystal structure of thermostable acetaldehyde dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon sulfolobus tokodaii (see paper)
38% identity, 95% coverage: 19:469/474 of query aligns to 3:461/466 of 8hapA

query
sites
8hapA
I
 
I
T
 
E
I
 
I
Y
 
K
S
 
S
P
 
P
I
 
S
N
 
N
Q
 
L
E
 
K
K
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
P
 
K
A
 
R
M
 
M
S
 
S
Q
 
K
A
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
R
E
 
G
A
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
K
A
 
G
L
 
F
P
 
E
A
 
T
W
 
I
R
 
S
D
 
R
L
 
M
A
 
P
P
 
L
V
 
Y
E
 
K
R
 
R
A
 
T
A
 
A
Y
 
I
L
 
L
H
 
R
K
 
K
T
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
R
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
K
 
R
I
 
L
G
 
A
T
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
M
E
 
E
V
 
A
A
 
G
K
 
K
G
 
P
I
 
I
K
 
K
A
 
D
A
 
S
I
 
R
G
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
M
R
 
R
T
 
A
A
 
S
D
 
R
L
 
L
I
 
F
R
 
R
F
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
A
-
 
A
L
 
I
R
 
V
I
 
L
T
 
E
G
 
G
Q
 
K
A
 
N
M
 
Y
E
 
R
G
 
V
G
 
D
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
-
 
Y
-
 
P
A
 
P
A
 
G
S
 
N
K
 
E
N
 
N
K
 
R
L
 
I
A
 
V
V
 
I
V
 
S
R
 
T
R
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
T
A
 
A
I
|
I
A
x
L
P
 
P
F
|
F
N
 
N
Y
 
F
P
 
P
V
 
I
N
 
N
L
 
S
S
 
F
G
 
A
S
 
H
K
 
K
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
S
V
 
V
M
 
V
F
 
V
K
|
K
P
 
P
P
x
S
T
x
I
Q
 
S
G
 
T
S
 
P
I
 
L
S
 
S
G
 
A
L
 
I
L
 
E
L
 
M
A
 
K
K
 
K
A
 
I
F
 
L
D
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
S
V
 
A
F
 
V
N
 
R
T
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Y
G
x
S
S
 
N
E
 
E
I
 
I
G
|
G
D
 
D
Y
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
K
 
P
E
 
L
V
 
V
N
 
G
F
 
L
I
 
I
N
 
T
F
 
L
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
P
 
Q
I
x
T
G
 
G
E
 
L
R
 
A
I
|
I
G
 
A
R
 
S
L
 
K
A
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
G
 
G
M
 
K
R
 
R
P
 
-
I
 
I
M
 
I
L
 
M
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
S
D
 
D
A
 
P
A
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
I
E
 
D
H
 
R
A
 
A
A
 
S
K
 
S
Q
 
I
I
 
A
V
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
R
F
 
Y
S
 
E
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
N
C
|
C
T
 
N
A
 
A
I
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
I
L
 
I
V
 
V
V
 
R
E
 
E
S
 
E
V
 
I
A
 
Y
D
 
D
R
 
K
L
 
F
A
 
V
E
 
K
L
 
A
L
 
F
Q
 
K
A
 
E
E
 
K
V
 
V
A
 
K
K
 
A
L
 
L
T
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
F
 
L
D
 
D
N
 
E
A
 
S
-
 
T
D
 
D
I
 
I
T
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
I
D
 
N
N
 
Q
A
 
E
S
 
S
A
 
V
D
 
E
F
 
K
I
 
L
W
 
N
G
 
K
L
 
A
I
 
L
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
K
 
K
G
 
G
-
 
G
-
 
N
A
 
V
K
 
E
A
 
V
L
 
L
S
 
N
P
 
K
I
 
G
K
 
P
R
 
E
E
 
T
G
 
G
N
 
Y
L
 
F
I
 
F
W
 
P
P
 
L
G
 
S
L
 
L
F
 
V
D
 
T
Y
 
N
V
 
P
T
 
S
R
 
L
D
 
D
M
 
M
K
 
L
L
 
V
A
 
L
W
 
K
E
 
T
E
|
E
L
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
I
L
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
V
R
 
S
V
 
V
A
 
K
D
 
S
A
 
D
N
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
N
I
 
I
A
 
A
N
 
N
E
 
S
S
 
T
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
S
 
A
V
 
I
F
 
F
T
 
S
N
 
N
D
 
D
F
 
V
K
 
N
K
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
K
K
 
E
L
 
L
E
 
K
V
 
F
G
 
G
T
 
A
V
 
I
H
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
D
K
 
S
T
 
T
Q
 
R
R
 
L
G
 
R
P
 
W
D
 
D
N
 
S
F
 
L
P
 
P
F
 
F
L
 
G
G
 
G
V
 
F
K
 
K
G
 
K
S
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
G
V
 
R
Q
 
E
G
 
G
I
 
V
K
 
R
Y
 
D
S
 
T
I
 
M
E
 
L
A
 
E
M
 
M
T
 
T
N
 
E
V
 
N
K
 
K
S
 
L
I
 
I

P25526 Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] GabD; SSDH; Glutarate-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.79; EC 1.2.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:470/474 of query aligns to 12:479/482 of P25526

query
sites
P25526
Q
 
Q
N
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
G
N
 
E
W
 
W
K
 
L
S
 
D
S
 
A
E
 
N
-
 
N
-
 
G
K
 
E
E
 
A
I
 
I
T
 
D
I
 
V
Y
 
T
S
 
N
P
 
P
I
 
A
N
 
N
Q
 
G
E
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
K
M
 
M
S
 
G
Q
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
T
D
 
R
E
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
N
A
 
R
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
W
 
W
R
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
T
P
 
A
V
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
T
Y
 
I
L
 
L
H
 
R
K
 
N
T
 
W
A
 
F
D
 
N
I
 
L
L
 
M
E
 
M
R
 
E
D
 
H
K
 
Q
E
 
D
K
 
D
I
 
L
G
 
A
T
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
K
 
L
E
 
E
V
 
Q
A
 
G
K
 
K
G
 
P
I
 
L
K
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
S
R
 
Y
T
 
A
A
 
A
D
 
S
L
 
F
I
 
I
R
 
E
F
 
W
A
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
R
 
R
I
 
I
T
 
Y
G
 
G
Q
 
D
A
 
T
M
 
I
E
 
P
G
 
G
G
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
H
S
 
Q
K
 
A
N
 
D
K
 
K
L
 
R
A
 
L
V
 
I
V
 
V
R
 
I
R
 
K
E
 
Q
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
T
P
 
P
F
x
W
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
V
 
A
N
 
A
L
 
M
S
 
I
G
 
T
S
 
R
K
 
K
I
 
A
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
V
 
T
V
 
M
M
 
V
F
 
L
K
|
K
P
|
P
P
x
A
T
x
S
Q
 
Q
G
 
T
S
 
P
I
 
F
S
 
S
G
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
L
F
 
A
D
 
I
E
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
S
G
 
A
S
 
G
E
 
A
I
 
V
G
 
G
D
 
N
Y
 
E
I
 
L
I
 
T
E
 
S
H
 
N
K
 
P
E
 
L
V
 
V
N
 
R
F
 
K
I
 
L
N
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
P
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
R
R
 
Q
I
 
L
G
 
M
R
 
E
L
 
Q
A
 
C
G
 
A
-
 
K
-
 
D
M
 
I
R
 
K
P
 
K
I
 
V
M
 
S
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
N
D
 
A
A
 
P
A
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
H
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
E
Q
 
G
I
 
A
V
 
L
G
 
A
G
 
S
A
 
K
F
 
F
S
 
R
Y
 
N
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
C
 
C
T
 
V
A
 
C
I
 
A
K
 
N
R
 
R
V
 
L
L
 
Y
V
 
V
V
 
Q
E
 
D
S
 
G
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
L
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
S
K
 
K
L
 
L
T
 
H
V
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
G
F
 
L
D
 
D
N
 
N
A
 
G
-
 
V
D
 
T
I
 
I
T
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
E
A
 
K
S
 
A
A
 
V
D
 
A
F
 
K
I
 
V
W
 
E
G
 
E
L
 
H
I
 
I
Q
 
A
D
 
D
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
R
A
 
V
L
 
V
S
 
C
P
 
G
I
 
G
K
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
E
R
 
R
E
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
F
I
 
F
W
 
Q
P
 
P
G
 
T
L
 
I
F
 
L
D
 
V
Y
 
D
V
 
V
T
 
P
R
 
A
D
 
N
M
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
S
W
 
K
E
 
E
E
|
E
L
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
L
 
A
P
 
P
I
 
L
I
 
F
R
 
R
V
 
F
A
 
K
D
 
D
A
 
E
N
 
A
E
 
D
A
 
V
V
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
E
 
D
S
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
Y
V
 
F
F
 
Y
T
 
A
N
 
R
D
 
D
F
 
L
K
 
S
K
 
R
A
 
V
F
 
F
E
 
R
I
 
V
A
 
G
E
 
E
K
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
G
 
G
T
 
I
V
 
V
H
 
G
I
 
I
N
 
N
N
 
T
K
 
G
T
 
I
Q
 
I
R
 
S
G
 
N
P
 
-
D
 
E
N
 
V
F
 
A
P
 
P
F
 
F
L
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
G
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
L
G
 
G
V
 
R
Q
 
E
G
 
G
I
 
S
K
 
K
Y
 
Y
S
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
D
M
 
Y
T
 
L
N
 
E
V
 
I
K
 
K
S
 
Y
I
 
M
V
 
C

3jz4A Crystal structure of e. Coli NADP dependent enzyme (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:470/474 of query aligns to 11:478/481 of 3jz4A

query
sites
3jz4A
Q
 
Q
N
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
G
N
 
E
W
 
W
K
 
L
S
 
D
S
 
A
E
 
N
-
 
N
-
 
G
K
 
E
E
 
A
I
 
I
T
 
D
I
 
V
Y
 
T
S
 
N
P
 
P
I
 
A
N
 
N
Q
 
G
E
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
K
M
 
M
S
 
G
Q
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
T
D
 
R
E
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
N
A
 
R
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
W
 
W
R
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
T
P
 
A
V
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
T
Y
 
I
L
 
L
H
 
R
K
 
N
T
 
W
A
 
F
D
 
N
I
 
L
L
 
M
E
 
M
R
 
E
D
 
H
K
 
Q
E
 
D
K
 
D
I
 
L
G
 
A
T
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
K
 
L
E
 
E
V
 
Q
A
 
G
K
 
K
G
 
P
I
 
L
K
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
S
R
 
Y
T
 
A
A
 
A
D
 
S
L
 
F
I
 
I
R
 
E
F
 
W
A
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
R
 
R
I
 
I
T
 
Y
G
 
G
Q
 
D
A
 
T
M
 
I
E
 
P
G
 
G
G
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
H
S
 
Q
K
 
A
N
 
D
K
 
K
L
 
R
A
 
L
V
 
I
V
 
V
R
 
I
R
 
K
E
 
Q
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
T
P
|
P
F
x
W
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
V
 
A
N
 
A
L
 
M
S
 
I
G
 
T
S
 
R
K
 
K
I
 
A
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
V
 
T
V
 
M
M
 
V
F
 
L
K
|
K
P
 
P
P
x
A
T
x
S
Q
 
Q
G
 
T
S
 
P
I
 
F
S
 
S
G
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
L
F
 
A
D
 
I
E
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
S
G
x
A
S
 
G
E
 
A
I
 
V
G
|
G
D
 
N
Y
 
E
I
 
L
I
 
T
E
 
S
H
 
N
K
 
P
E
 
L
V
 
V
N
 
R
F
 
K
I
 
L
N
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
P
 
E
I
|
I
G
 
G
E
 
R
R
 
Q
I
 
L
G
 
M
R
 
E
L
 
Q
A
 
C
G
 
A
-
 
K
-
 
D
M
 
I
R
 
K
P
 
K
I
 
V
M
 
S
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
N
D
 
A
A
 
P
A
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
H
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
E
Q
 
G
I
 
A
V
 
L
G
 
A
G
 
S
A
 
K
F
 
F
S
 
R
Y
 
N
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
C
|
C
T
 
V
A
 
C
I
 
A
K
 
N
R
 
R
V
 
L
L
 
Y
V
 
V
V
 
Q
E
 
D
S
 
G
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
L
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
E
 
A
V
 
M
A
 
S
K
 
K
L
 
L
T
 
H
V
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
G
F
 
L
D
 
D
N
 
N
A
 
G
-
 
V
D
 
T
I
 
I
T
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
E
A
 
K
S
 
A
A
 
V
D
 
A
F
x
K
I
 
V
W
 
E
G
 
E
L
 
H
I
 
I
Q
 
A
D
 
D
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
R
A
 
V
L
 
V
S
 
C
P
 
G
I
 
G
K
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
E
R
 
R
E
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
F
I
 
F
W
 
Q
P
 
P
G
 
T
L
 
I
F
 
L
D
 
V
Y
 
D
V
 
V
T
 
P
R
 
A
D
 
N
M
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
S
W
 
K
E
 
E
E
|
E
L
 
T
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
L
 
A
P
 
P
I
 
L
I
 
F
R
 
R
V
 
F
A
 
K
D
 
D
A
 
E
N
 
A
E
 
D
A
 
V
V
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
E
 
D
S
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
Y
V
 
F
F
 
Y
T
 
A
N
 
R
D
 
D
F
 
L
K
 
S
K
 
R
A
 
V
F
 
F
E
 
R
I
 
V
A
 
G
E
 
E
K
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
G
 
G
T
 
I
V
 
V
H
 
G
I
 
I
N
 
N
N
 
T
K
 
G
T
 
I
Q
 
I
R
 
S
G
 
N
P
 
-
D
 
E
N
 
V
F
 
A
P
 
P
F
 
F
L
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
G
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
L
G
 
G
V
 
R
Q
x
E
G
 
G
I
 
S
K
 
K
Y
 
Y
S
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
D
M
 
Y
T
 
L
N
 
E
V
 
I
K
 
K
S
 
Y
I
 
M
V
 
C

5ekcE Thermostable aldehyde dehydrogenase from pyrobaculum sp.1860 complexed with NADP+
35% identity, 97% coverage: 6:464/474 of query aligns to 10:469/490 of 5ekcE

query
sites
5ekcE
N
 
N
L
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
N
 
E
W
 
F
K
 
K
-
 
E
-
 
P
S
 
S
S
 
T
E
 
G
K
 
A
E
 
F
I
 
Q
T
 
V
I
 
K
Y
 
T
S
 
S
P
 
P
I
 
V
N
 
D
Q
 
G
E
 
S
K
 
K
L
 
I
G
 
A
T
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
R
M
 
S
S
 
G
Q
 
R
A
 
E
E
 
D
V
 
A
D
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
I
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
F
A
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
K
A
 
A
W
 
W
R
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
P
P
 
A
V
 
I
E
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
E
Y
 
Y
L
 
L
H
 
Y
K
 
K
T
 
M
A
 
L
D
 
E
I
 
V
L
 
F
E
 
R
R
 
Q
D
 
M
K
 
K
E
 
E
K
 
D
I
 
F
G
 
M
T
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
T
K
 
V
E
 
E
V
 
G
A
 
G
K
 
G
G
 
T
I
 
Y
K
 
R
A
 
K
A
 
V
I
 
W
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
F
T
 
T
A
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
F
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
L
G
 
A
L
 
R
R
 
H
I
 
Y
T
 
Q
G
 
G
Q
 
R
A
 
V
M
 
L
E
 
Q
G
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
S
A
 
D
S
 
S
K
 
E
N
 
S
K
 
T
L
 
I
A
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
F
R
 
K
E
 
R
P
 
S
V
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
G
A
 
V
I
|
I
A
x
T
P
|
P
F
x
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
V
 
L
N
 
S
L
 
I
S
 
S
G
 
M
S
 
K
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
H
A
 
T
L
 
L
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
T
V
 
V
M
 
V
F
 
Y
K
|
K
P
 
P
P
 
A
T
x
S
Q
 
D
G
 
T
S
 
P
I
 
V
S
 
T
G
 
G
L
 
W
L
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
Q
A
 
M
F
 
V
D
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
L
I
 
V
T
 
I
G
 
G
R
 
P