SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_040474509.1 NCBI__GCF_000170835.1:WP_040474509.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 6 hits to proteins with known functional sites (download)

7yleA Rndmpx in complex with dmsp (see paper)
60% identity, 93% coverage: 22:320/322 of query aligns to 1:298/299 of 7yleA

query
sites
7yleA
D
 
E
C
 
C
G
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
S
I
 
I
T
 
T
E
 
E
M
 
M
G
 
N
W
|
W
A
 
A
S
 
S
N
 
A
T
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
T
V
 
V
A
 
A
K
 
T
F
 
F
I
 
L
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
D
 
A
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
S
D
 
S
T
|
T
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
S
E
 
E
N
 
T
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
I
V
 
L
T
 
T
E
 
E
L
 
L
W
|
W
L
 
L
N
 
S
S
 
S
A
 
L
G
 
P
E
 
N
A
 
-
Y
 
Y
L
 
A
E
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
T
I
 
V
E
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
K
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
S
P
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
W
W
 
W
I
 
V
P
 
P
T
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
I
M
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
G
N
 
G
R
 
R
F
 
F
N
 
H
N
 
R
C
 
S
P
 
P
S
 
D
G
 
G
W
|
W
G
x
A
C
x
A
R
 
A
V
 
I
V
 
V
S
 
D
D
 
S
N
 
S
L
 
L
I
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
L
E
 
E
S
 
G
S
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
V
F
 
F
N
 
A
H
 
H
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
T
S
 
S
M
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
Y
Q
 
A
S
 
D
E
 
R
E
 
E
P
 
P
W
 
W
F
 
F
G
 
G
Y
|
Y
Y
 
Y
W
|
W
G
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
S
P
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
F
 
F
D
 
P
M
 
M
T
 
V
R
 
M
V
 
V
E
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
K
 
D
P
 
A
E
 
D
V
 
I
H
 
H
T
 
A
R
 
C
N
 
N
Q
 
S
T
 
K
Q
 
A
D
 
D
A
 
C
D
 
A
N
 
N
P
 
V
G
 
G
V
 
K
S
 
S
E
 
P
F
 
Y
P
 
P
A
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
L
 
I
T
 
T
S
 
A
V
 
V
T
 
T
T
 
P
D
 
G
F
 
F
K
 
A
D
 
E
R
 
E
E
 
N
P
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
S
K
 
N
L
 
L
T
 
S
F
 
F
K
 
T
T
 
N
D
 
D
T
 
Q
M
 
M
S
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
A
W
 
W
M
 
Q
D
 
E
S
 
E
N
 
N
N
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
 
W
F
 
F
L
 
L
S
 
S
N
 
N
N
 
N
S
 
S
D
 
D
E
 
I
W
 
W
S
 
A
S
 
G
W
 
W
L
 
V
N
 
N
D
 
D
S
 
A
A
 
A
K
 
R
K
 
E
R
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
A
V
 
L
L
 
I

Q4FL33 Trimethylamine N-oxide-binding protein; TMAO-binding protein from Pelagibacter ubique (strain HTCC1062) (see paper)
22% identity, 95% coverage: 1:305/322 of query aligns to 1:310/314 of Q4FL33

query
sites
Q4FL33
M
 
M
R
 
K
K
 
K
L
 
I
T
 
V
P
 
S
V
 
L
A
 
M
L
 
S
L
 
A
C
 
L
A
 
V
M
 
I
S
 
S
V
 
V
P
 
V
A
 
S
L
 
F
A
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
N
Q
 
A
A
 
A
D
 
D
C
 
S
G
 
K
E
 
K
-
 
P
V
 
I
S
 
V
I
 
I
T
 
P
E
 
T
M
 
H
G
 
N
W
|
W
A
 
S
S
 
S
N
 
Q
T
 
I
V
 
V
V
 
M
T
 
A
S
 
H
V
 
V
A
 
I
K
 
G
F
 
G
I
 
I
M
 
F
E
 
E
Q
 
S
G
 
-
Y
 
M
G
 
G
C
 
N
D
 
N
V
 
V
T
 
K
V
 
Y
V
 
V
P
 
N
S
 
T
D
 
D
T
 
S
V
 
-
P
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
S
 
E
V
 
S
A
 
I
E
 
R
N
 
L
G
 
G
E
 
D
P
 
V
D
 
S
I
 
L
V
 
S
T
 
H
E
 
E
L
 
V
W
|
W
L
 
E
N
 
S
S
 
A
A
x
F
G
 
G
E
 
K
A
 
S
Y
 
F
L
 
T
E
 
T
L
 
A
E
 
L
E
 
D
Q
 
K
G
 
G
K
 
G
I
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
W
-
 
G
E
 
D
R
 
H
L
 
E
T
 
A
K
 
R
V
 
T
L
 
L
E
|
E
P
 
D
G
 
M
G
 
G
V
 
Y
E
 
P
G
 
N
W
 
W
W
 
V
I
 
A
P
 
E
T
 
K
Y
 
G
L
 
L
A
 
C
E
 
P
K
 
G
H
 
L
P
 
P
E
 
D
L
 
W
T
 
T
T
 
A
I
 
L
E
 
K
G
 
-
V
 
-
M
 
-
A
 
-
N
 
N
P
 
P
E
 
A
L
 
C
V
 
A
E
 
K
N
 
N
R
 
-
F
 
F
N
 
T
N
 
T
C
 
P
P
 
D
S
 
S
G
 
G
W
 
G
G
 
K
C
 
G
R
 
R
V
 
M
V
 
L
S
 
E
D
 
G
N
 
P
L
 
Q
I
 
T
R
 
W
A
 
H
L
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
I
S
 
P
S
 
Q
G
 
R
I
 
V
E
 
D
V
 
A
F
 
L
N
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
W
-
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
F
H
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
A
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
W
S
 
A
S
 
E
M
 
L
A
 
V
S
 
A
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
S
 
E
E
 
G
E
 
R
P
 
G
W
 
T
F
 
I
G
 
I
Y
x
F
Y
 
N
W
|
W
G
 
T
P
 
P
T
 
N
V
 
F
P
 
T
L
 
-
G
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
D
M
 
G
T
 
A
R
 
G
V
 
F
E
 
T
L
 
F
G
 
I
D
 
D
Y
 
F
K
 
P
P
 
P
E
 
-
V
 
-
H
 
Y
T
 
T
R
 
A
N
 
G
Q
 
C
T
 
R
Q
 
P
D
 
E
A
 
D
D
 
G
N
 
G
P
 
D
G
 
G
V
 
K
S
 
C
E
 
G
F
 
S
P
 
P
A
 
D
A
 
G
T
 
Y
V
 
L
L
 
K
T
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
N
T
 
A
D
 
D
F
 
F
K
 
P
D
 
K
R
 
T
E
 
H
P
 
P
E
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
A
M
 
T
L
 
F
S
 
K
K
 
K
L
 
M
T
 
S
F
 
F
K
 
S
T
 
T
D
 
S
T
 
H
M
 
I
S
 
G
A
 
A
L
 
M
L
 
A
A
 
A
W
 
L
M
 
V
D
 
D
S
 
V
N
 
D
N
 
K
A
 
M
S
 
T
A
 
H
E
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
K
Y
 
K
F
 
W
L
 
L
S
 
A
N
 
D
N
 
N
S
 
K
D
 
S
E
 
V
W
 
W
S
 
T

2regA Abc-transporter choline binding protein in complex with choline (see paper)
22% identity, 91% coverage: 23:314/322 of query aligns to 5:275/290 of 2regA

query
sites
2regA
C
 
C
G
 
G
E
 
T
V
 
V
S
 
R
I
 
F
T
 
S
E
 
D
M
 
V
G
 
G
W
|
W
A
 
T
S
 
D
N
 
I
T
 
T
V
 
A
V
 
T
T
 
T
S
 
A
V
 
T
A
 
A
K
 
T
F
 
T
I
 
I
M
 
L
E
 
E
Q
 
A
-
 
L
G
 
G
Y
 
Y
G
 
E
C
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
K
V
 
V
V
 
L
P
 
-
S
 
-
D
 
-
T
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
T
T
 
Y
S
 
T
V
 
S
A
 
L
E
 
K
N
 
N
G
 
K
E
 
D
P
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
F
T
 
L
E
 
G
L
 
N
W
|
W
L
 
M
N
 
P
S
 
T
A
 
M
G
 
E
E
 
A
A
 
D
Y
 
I
L
 
A
E
 
P
L
 
Y
E
 
R
E
 
E
Q
 
D
G
 
K
K
 
S
I
 
V
E
 
E
R
 
T
L
 
V
T
 
R
K
 
E
V
 
N
L
 
L
E
 
-
P
 
-
G
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
K
G
 
-
W
x
Y
W
 
T
I
 
L
P
 
A
T
 
T
Y
 
N
L
 
A
A
 
K
E
 
G
K
 
A
H
 
E
P
 
L
E
 
G
L
 
I
T
 
K
T
 
D
I
 
F
E
 
K
G
 
D
V
 
I
M
 
A
A
 
A
N
 
H
P
 
K
E
 
D
L
 
E
V
 
L
E
 
D
N
 
G
R
 
K
F
 
I
N
 
Y
N
 
G
C
 
I
-
 
E
P
 
P
S
 
G
G
x
N
W
x
D
G
 
G
C
 
N
R
 
R
V
 
L
V
 
I
S
 
I
D
 
D
N
 
-
L
 
M
I
 
V
R
 
E
A
 
K
L
 
G
D
 
T
L
 
F
E
 
D
S
 
L
S
 
K
G
 
G
I
 
F
E
 
E
V
 
V
F
 
V
N
 
-
H
 
E
G
 
S
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
T
 
G
L
 
M
A
 
L
S
 
A
S
 
Q
M
 
V
A
 
A
S
 
R
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
S
 
S
E
 
G
E
 
D
P
 
P
W
 
I
F
 
V
G
 
F
Y
 
L
Y
 
G
W
|
W
G
 
E
P
 
P
T
 
H
V
 
P
P
 
M
L
 
N
G
 
A
K
 
N
F
 
F
D
 
K
M
 
L
T
 
T
R
 
Y
V
 
L
E
 
S
L
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
-
D
 
D
A
 
V
D
 
F
N
 
G
P
 
P
G
 
-
V
 
-
S
 
-
E
 
N
F
 
Y
P
 
G
A
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
L
 
H
T
 
T
S
 
N
V
 
V
T
 
R
T
 
A
D
 
G
F
 
Y
K
 
T
D
 
T
R
 
E
E
 
C
P
 
P
E
 
N
V
 
V
A
 
D
E
 
K
M
 
L
L
 
L
S
 
Q
K
 
N
L
 
L
T
 
S
F
 
F
K
 
S
T
 
L
D
 
Q
T
 
M
M
 
E
S
 
N
A
 
E
L
 
I
L
 
M
A
 
G
W
 
K
M
 
I
D
 
L
S
 
N
N
 
D
N
 
G
A
 
E
S
 
D
A
 
P
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
A
Y
 
A
F
 
W
L
 
L
S
 
K
N
 
D
N
 
N
S
 
P
D
 
Q
E
 
S
W
 
I
S
 
E
S
 
P
W
 
W
L
 
L
N
 
S
D
 
G
S
 
V
A
 
A
K
 
T
K
 
K

2rinA Abc-transporter choline binding protein in complex with acetylcholine (see paper)
22% identity, 91% coverage: 23:314/322 of query aligns to 3:273/288 of 2rinA

query
sites
2rinA
C
 
C
G
 
G
E
 
T
V
 
V
S
 
R
I
 
F
T
 
S
E
 
D
M
 
V
G
 
G
W
|
W
A
 
T
S
x
D
N
 
I
T
 
T
V
 
A
V
 
T
T
 
T
S
 
A
V
 
T
A
 
A
K
 
T
F
 
T
I
 
I
M
 
L
E
 
E
Q
 
A
-
 
L
G
 
G
Y
 
Y
G
 
E
C
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
K
V
 
V
V
 
L
P
 
-
S
 
-
D
 
-
T
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
T
T
 
Y
S
 
T
V
 
S
A
 
L
E
 
K
N
 
N
G
 
K
E
 
D
P
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
F
T
 
L
E
 
G
L
 
N
W
|
W
L
 
M
N
 
P
S
 
T
A
 
M
G
 
E
E
 
A
A
 
D
Y
 
I
L
 
A
E
 
P
L
 
Y
E
 
R
E
 
E
Q
 
D
G
 
K
K
 
S
I
 
V
E
 
E
R
 
T
L
 
V
T
 
R
K
 
E
V
 
N
L
 
L
E
 
-
P
 
-
G
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
K
G
 
-
W
x
Y
W
 
T
I
 
L
P
 
A
T
 
T
Y
 
N
L
 
A
A
 
K
E
 
G
K
 
A
H
 
E
P
 
L
E
 
G
L
 
I
T
 
K
T
 
D
I
 
F
E
 
K
G
 
D
V
 
I
M
 
A
A
 
A
N
 
H
P
 
K
E
 
D
L
 
E
V
 
L
E
 
D
N
 
G
R
 
K
F
 
I
N
 
Y
N
 
G
C
x
I
-
 
E
P
 
P
S
 
G
G
x
N
W
x
D
G
 
G
C
 
N
R
 
R
V
 
L
V
 
I
S
 
I
D
 
D
N
 
-
L
 
M
I
 
V
R
 
E
A
 
K
L
 
G
D
 
T
L
 
F
E
 
D
S
 
L
S
 
K
G
 
G
I
 
F
E
 
E
V
 
V
F
 
V
N
 
-
H
 
E
G
 
S
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
T
 
G
L
 
M
A
 
L
S
 
A
S
 
Q
M
 
V
A
 
A
S
 
R
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
S
 
S
E
 
G
E
 
D
P
 
P
W
 
I
F
 
V
G
 
F
Y
 
L
Y
 
G
W
|
W
G
 
E
P
 
P
T
 
H
V
 
P
P
 
M
L
 
N
G
 
A
K
 
N
F
 
F
D
 
K
M
 
L
T
 
T
R
 
Y
V
 
L
E
 
S
L
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
-
D
 
D
A
 
V
D
 
F
N
 
G
P
 
P
G
 
-
V
 
-
S
 
-
E
 
N
F
 
Y
P
 
G
A
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
L
 
H
T
 
T
S
 
N
V
 
V
T
 
R
T
 
A
D
 
G
F
 
Y
K
 
T
D
 
T
R
 
E
E
 
C
P
 
P
E
 
N
V
 
V
A
 
D
E
 
K
M
 
L
L
 
L
S
 
Q
K
 
N
L
 
L
T
 
S
F
 
F
K
 
S
T
 
L
D
 
Q
T
 
M
M
 
E
S
 
N
A
 
E
L
 
I
L
 
M
A
 
G
W
 
K
M
 
I
D
 
L
S
 
N
N
 
D
N
 
G
A
 
E
S
 
D
A
 
P
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
A
Y
 
A
F
 
W
L
 
L
S
 
K
N
 
D
N
 
N
S
 
P
D
 
Q
E
 
S
W
 
I
S
 
E
S
 
P
W
 
W
L
 
L
N
 
S
D
 
G
S
 
V
A
 
A
K
 
T
K
 
K

Q5LT66 Trimethylamine N-oxide-binding protein; TMAO-binding protein from Ruegeria pomeroyi (strain ATCC 700808 / DSM 15171 / DSS-3) (Silicibacter pomeroyi) (see paper)
23% identity, 88% coverage: 26:309/322 of query aligns to 48:332/333 of Q5LT66

query
sites
Q5LT66
V
 
I
S
 
V
I
 
I
T
 
P
E
 
I
M
 
H
G
 
N
W
|
W
A
 
S
S
 
S
N
 
Q
T
 
I
V
 
V
V
 
M
T
 
S
S
 
N
V
 
V
A
 
V
K
 
G
F
 
Q
I
 
I
M
 
F
E
 
E
Q
 
E
G
 
-
Y
 
M
G
 
G
C
 
V
D
 
A
V
 
V
T
 
E
V
 
F
V
 
V
P
 
T
S
 
T
D
 
D
T
 
S
V
 
-
P
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
S
 
E
V
 
S
A
 
V
E
 
R
N
 
L
G
 
G
E
 
D
P
 
V
D
 
T
I
 
L
V
 
E
T
 
L
E
 
E
L
 
V
W
|
W
L
 
E
N
 
G
S
 
A
A
x
F
G
 
G
E
 
A
A
 
S
Y
 
F
L
 
R
E
 
A
L
 
A
E
 
L
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
K
 
G
I
 
I
E
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
V
K
 
D
V
 
V
L
 
G
E
 
D
P
 
H
G
 
D
G
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
R
E
|
E
G
 
D
W
 
W
W
 
W
I
 
Y
P
 
P
T
 
M
Y
 
W
L
 
T
A
 
K
E
 
D
K
 
A
H
 
C
P
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
W
-
 
K
E
 
A
L
 
L
T
 
N
T
 
D
I
 
C
E
 
A
G
 
A
V
 
V
M
 
F
A
 
A
N
 
T
P
 
A
E
 
E
L
 
T
V
 
G
E
 
D
N
 
K
-
 
G
R
 
R
F
 
Y
N
 
L
N
 
D
C
 
G
P
 
P
S
 
V
G
 
D
W
|
W
G
 
L
C
 
K
R
 
H
V
 
-
V
 
-
S
 
G
D
 
K
N
 
E
L
 
R
I
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
G
L
 
M
E
 
N
S
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
F
E
 
E
V
 
V
F
 
I
N
 
N
H
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
A
E
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
W
S
 
A
S
 
E
M
 
I
A
 
G
S
 
A
A
 
A
V
 
E
Q
 
A
S
 
D
E
 
K
E
 
R
P
 
P
W
 
V
F
 
V
G
 
V
Y
x
F
Y
 
N
W
|
W
G
 
T
P
 
P
T
 
N
V
 
F
P
 
A
L
 
E
G
 
A
K
 
V
F
 
W
D
 
P
M
 
G
T
 
E
R
 
F
V
 
V
E
 
E
L
 
F
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
V
-
 
D
-
 
G
G
 
C
D
 
D
Y
 
K
K
 
D
P
|
P
E
 
A
V
|
V
H
 
G
T
 
P
R
x
N
-
 
P
N
 
D
Q
x
A
T
 
L
Q
 
Y
D
|
D
A
 
C
D
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
A
V
 
T
S
 
G
E
 
Y
F
 
L
P
 
K
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
W
T
 
E
D
 
G
F
 
M
K
 
E
D
 
A
R
 
K
E
 
W
P
 
P
E
 
D
V
 
A
A
 
Y
E
 
A
M
 
V
L
 
L
S
 
T
K
 
R
L
 
I
T
 
S
F
 
F
K
 
T
T
 
N
D
 
P
T
 
Q
M
 
I
S
 
A
A
 
E
L
 
M
L
 
A
A
 
K
W
 
L
M
 
V
D
 
D
S
 
V
N
 
D
N
 
E
A
 
M
S
 
E
A
 
P
E
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
E
Y
 
A
F
 
W
L
 
L
S
 
E
N
 
A
N
 
N
S
 
E
D
 
D
E
 
V
W
 
W
S
 
R
S
 
P
W
 
W
L
 
L
N
 
D

Sites not aligning to the query:

4xz6A Tmox in complex with tmao (see paper)
23% identity, 88% coverage: 26:309/322 of query aligns to 6:290/291 of 4xz6A

query
sites
4xz6A
V
 
I
S
 
V
I
 
I
T
 
P
E
 
I
M
 
H
G
 
N
W
|
W
A
 
S
S
 
S
N
 
Q
T
 
I
V
 
V
V
 
M
T
 
S
S
 
N
V
 
V
A
 
V
K
 
G
F
 
Q
I
 
I
M
 
F
E
 
E
Q
 
E
G
 
-
Y
 
M
G
 
G
C
 
V
D
 
A
V
 
V
T
 
E
V
 
F
V
 
V
P
 
T
S
 
T
D
 
D
T
 
S
V
 
-
P
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
S
 
E
V
 
S
A
 
V
E
 
R
N
 
L
G
 
G
E
 
D
P
 
V
D
 
T
I
 
L
V
 
E
T
 
L
E
 
E
L
 
V
W
|
W
L
 
E
N
 
G
S
 
A
A
x
F
G
 
G
E
 
A
A
 
S
Y
 
F
L
 
R
E
 
A
L
 
A
E
 
L
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
K
 
G
I
 
I
E
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
V
K
 
D
V
 
V
L
 
G
E
 
D
P
 
H
G
 
D
G
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
R
E
|
E
G
 
D
W
 
W
W
 
W
I
 
Y
P
 
P
T
 
M
Y
 
W
L
 
T
A
 
K
E
 
D
K
 
A
H
 
C
P
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
W
-
 
K
E
 
A
L
 
L
T
 
N
T
 
D
I
 
C
E
 
A
G
 
A
V
 
V
M
 
F
A
 
A
N
 
T
P
 
A
E
 
E
L
 
T
V
 
G
E
 
D
N
 
K
-
 
G
R
 
R
F
 
Y
N
 
L
N
 
D
C
 
G
P
 
P
S
 
V
G
 
D
W
|
W
G
 
L
C
 
K
R
 
H
V
 
-
V
 
-
S
 
G
D
 
K
N
 
E
L
 
R
I
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
G
L
 
M
E
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
N
I
 
F
E
 
E
V
 
V
F
 
I
N
 
N
H
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
A
E
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
W
S
 
A
S
 
E
M
 
I
A
 
G
S
 
A
A
 
A
V
 
E
Q
 
A
S
 
D
E
 
K
E
 
R
P
 
P
W
 
V
F
 
V
G
 
V
Y
x
F
Y
 
N
W
|
W
G
 
T
P
 
P
T
 
N
V
 
F
P
 
A
L
 
E
G
 
A
K
 
V
F
 
W
D
 
P
M
 
G
T
 
E
R
 
F
V
 
V
E
 
E
L
 
F
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
V
-
 
D
-
 
G
G
 
C
D
 
D
Y
 
K
K
 
D
P
|
P
E
 
A
V
|
V
H
 
G
T
 
P
R
x
N
-
 
P
N
 
D
Q
x
A
T
 
L
Q
 
Y
D
|
D
A
 
C
D
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
A
V
 
T
S
 
G
E
 
Y
F
 
L
P
 
K
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
W
T
 
E
D
 
G
F
 
M
K
 
E
D
 
A
R
 
K
E
 
W
P
 
P
E
 
D
V
 
A
A
 
Y
E
 
A
M
 
V
L
 
L
S
 
T
K
 
R
L
 
I
T
 
S
F
 
F
K
 
T
T
 
N
D
 
P
T
 
Q
M
 
I
S
 
A
A
 
E
L
 
M
L
 
A
A
 
K
W
 
L
M
 
V
D
 
D
S
 
V
N
 
D
N
 
E
A
 
M
S
 
E
A
 
P
E
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
E
Y
 
A
F
 
W
L
 
L
S
 
E
N
 
A
N
 
N
S
 
E
D
 
D
E
 
V
W
 
W
S
 
R
S
 
P
W
 
W
L
 
L
N
 
D

Query Sequence

>WP_040474509.1 NCBI__GCF_000170835.1:WP_040474509.1
MRKLTPVALLCAMSVPALAQADCGEVSITEMGWASNTVVTSVAKFIMEQGYGCDVTVVPS
DTVPAVTSVAENGEPDIVTELWLNSAGEAYLELEEQGKIERLTKVLEPGGVEGWWIPTYL
AEKHPELTTIEGVMANPELVENRFNNCPSGWGCRVVSDNLIRALDLESSGIEVFNHGSGE
TLASSMASAVQSEEPWFGYYWGPTVPLGKFDMTRVELGDYKPEVHTRNQTQDADNPGVSE
FPAATVLTSVTTDFKDREPEVAEMLSKLTFKTDTMSALLAWMDSNNASAEEAAVYFLSNN
SDEWSSWLNDSAKKRLASVLGE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory