SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_040688932.1 NCBI__GCF_000341125.1:WP_040688932.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
43% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 4:249/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
E
 
E
F
 
T
V
 
I
R
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
R
D
 
D
K
 
Q
E
 
R
H
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
G
V
 
I
I
 
I
R
 
T
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
x
Q
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
T
 
M
R
 
N
E
 
E
I
 
V
A
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
T
E
 
E
V
 
L
S
 
D
T
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
G
 
S
E
 
A
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
H
 
D
L
 
L
T
 
T
H
 
F
A
 
A
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
E
 
A
Y
 
F
S
x
T
R
 
A
G
 
D
L
 
F
Q
x
F
N
 
A
A
 
T
L
 
W
T
 
G
A
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
A
I
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
x
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
V
R
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
D
K
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
K
L
 
L
G
 
G
V
|
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
x
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
H
 
T
V
 
M
P
 
D
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
E
E
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
A
E
 
D
E
 
D
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
A
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
T
V
 
A
A
 
T
R
 
T
F
 
I
G
 
S
E
 
Q
G
 
M
P
 
S
A
 
A
V
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
V
D
 
N
R
 
R
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
S
D
 
S
L
 
L
D
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
E
x
L
I
 
Y
E
 
E
R
 
R
L
 
R
H
 
L
F
 
F
A
 
H
G
 
S
L
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
K
 
S
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
A
S
 
A
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
K

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
43% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 4:249/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
E
 
E
F
 
T
V
 
I
R
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
R
D
 
D
K
 
Q
E
 
R
H
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
G
V
 
I
I
 
I
R
 
T
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
T
 
M
R
 
N
E
 
E
I
 
V
A
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
T
E
 
E
V
 
L
S
 
D
T
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
G
 
S
E
 
A
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
H
 
D
L
 
L
T
 
T
H
 
F
A
 
A
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
E
 
A
Y
 
F
S
x
T
R
 
A
G
 
D
L
 
F
Q
x
F
N
 
A
A
 
T
L
 
W
T
 
G
A
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
A
I
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
A
-
 
G
-
x
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
V
R
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
D
K
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
K
L
|
L
G
 
G
V
|
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
H
 
T
V
 
M
P
 
D
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
E
E
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
A
E
 
D
E
 
D
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
A
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
T
V
 
A
A
 
T
R
 
T
F
 
I
G
 
S
E
 
Q
G
 
M
P
 
S
A
 
A
V
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
V
D
 
N
R
 
R
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
S
D
 
S
L
 
L
D
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
E
x
L
I
 
Y
E
 
E
R
 
R
L
 
R
H
 
L
F
 
F
A
 
H
G
 
S
L
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
K
 
S
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
A
S
 
A
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
K

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
43% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 3:248/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
R
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
R
D
 
D
K
 
Q
E
 
R
H
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
G
V
 
I
I
 
I
R
 
T
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
T
 
M
R
 
N
E
 
E
I
 
V
A
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
T
E
 
E
V
 
L
S
 
D
T
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
G
 
S
E
 
A
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
H
 
D
L
 
L
T
 
T
H
 
F
A
 
A
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
E
 
A
Y
 
F
S
x
T
R
 
A
G
 
D
L
 
F
Q
x
F
N
 
A
A
 
T
L
 
W
T
 
G
A
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
A
I
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
V
R
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
D
K
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
K
L
 
L
G
 
G
V
|
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
H
 
T
V
 
M
P
 
D
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
E
E
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
A
E
 
D
E
 
D
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
A
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
T
V
 
A
A
 
T
R
 
T
F
 
I
G
 
S
E
 
Q
G
 
M
P
 
S
A
 
A
V
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
V
D
 
N
R
 
R
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
S
D
 
S
L
 
L
D
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
E
x
L
I
 
Y
E
 
E
R
 
R
L
 
R
H
 
L
F
 
F
A
 
H
G
 
S
L
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
|
Q
K
 
S
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
A
S
 
A
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
K

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
36% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 2:251/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
E
 
E
F
 
F
V
 
E
R
 
T
V
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
K
K
 
K
E
 
E
H
 
G
P
 
-
A
 
N
V
 
L
A
 
F
V
 
W
I
 
I
R
 
T
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
D
A
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
V
 
L
T
 
L
R
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
D
E
 
R
A
 
A
A
 
V
A
 
S
E
 
Q
V
 
A
S
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
P
A
 
E
V
 
I
R
 
R
S
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
G
 
K
E
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
T
E
 
Q
M
x
F
A
 
N
H
 
Q
L
 
L
T
 
T
H
 
P
A
 
A
Q
 
E
M
 
A
L
 
W
E
 
K
Y
 
F
S
|
S
R
 
K
G
 
K
L
 
G
Q
x
R
N
 
E
A
 
I
L
 
M
T
 
D
A
 
K
V
 
I
A
 
E
R
 
A
I
 
L
P
 
S
K
 
K
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
M
V
 
I
X
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
L
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
D
 
D
F
 
I
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
E
K
 
E
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
N
L
 
L
G
 
G
V
x
I
I
 
Y
P
|
P
G
|
G
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
G
K
 
R
A
 
A
K
 
L
D
 
E
L
 
M
I
 
M
F
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
D
H
x
R
V
 
I
P
 
P
A
 
G
G
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
E
E
 
K
I
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
N
E
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
L
E
 
A
E
 
N
V
 
L
Y
 
E
S
 
Q
A
 
E
A
 
T
V
 
R
A
 
K
K
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
E
 
K
G
 
K
P
 
S
A
 
P
V
 
I
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
L
A
 
I
K
 
K
E
 
E
T
 
V
V
 
V
D
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
D
T
 
S
D
 
P
L
 
L
D
 
L
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
x
A
I
 
L
E
 
E
R
 
S
L
 
V
H
 
G
F
 
W
A
 
G
G
 
V
L
 
V
F
|
F
A
 
S
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
K
K
 
K
T
 
E
G
 
G
M
 
V
R
 
S
S
 
A
F
|
F
I
 
L
E
 
E
Q
x
K

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
37% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 2:250/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
E
 
Q
F
 
Y
V
 
I
R
 
I
V
 
T
E
 
E
T
 
K
D
 
K
K
 
G
E
 
K
H
 
N
P
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
R
 
Q
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
A
 
N
Q
 
G
V
 
L
T
 
I
R
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
A
A
 
L
A
 
E
E
 
T
V
 
F
S
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
H
 
N
L
 
R
T
 
T
H
 
F
A
 
Q
Q
 
D
M
 
C
L
 
-
E
 
-
Y
 
Y
S
|
S
R
 
G
G
 
K
L
 
F
Q
x
L
N
 
S
A
 
H
L
x
W
T
 
D
A
 
H
V
 
I
A
 
T
R
 
R
I
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
I
R
 
I
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
L
L
|
L
G
 
G
V
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
M
I
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
H
 
R
V
 
I
P
 
S
A
 
A
G
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
K
V
 
I
V
 
F
A
 
P
D
 
V
E
 
E
E
 
T
V
 
L
Y
 
V
S
 
E
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
K
 
C
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
E
 
N
G
 
N
P
 
S
A
 
K
V
 
I
A
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
S
V
 
V
D
 
N
R
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
E
x
K
I
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
K
H
 
L
F
 
F
A
 
Y
G
 
S
L
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
S
S
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
K

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
37% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 4:252/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
E
 
Q
F
 
Y
V
 
I
R
 
I
V
 
T
E
 
E
T
 
K
D
 
K
K
 
G
E
 
K
H
 
N
P
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
R
 
Q
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
A
 
N
Q
 
G
V
 
L
T
 
I
R
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
A
A
 
L
A
 
E
E
 
T
V
 
F
S
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
H
 
N
L
 
R
T
 
T
H
 
F
A
 
Q
Q
 
D
M
 
C
L
 
-
E
 
-
Y
 
Y
S
|
S
R
 
G
G
 
K
L
 
F
Q
x
L
N
 
S
A
 
H
L
 
W
T
 
D
A
 
H
V
 
I
A
 
T
R
 
R
I
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
N
-
 
G
-
x
Y
-
 
A
-
 
L
-
x
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
I
R
 
I
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
L
L
|
L
G
 
G
V
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
M
I
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
H
 
R
V
 
I
P
 
S
A
 
A
G
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
K
V
 
I
V
 
F
A
 
P
D
 
V
E
 
E
E
 
T
V
 
L
Y
 
V
S
 
E
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
K
 
C
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
E
 
N
G
 
N
P
 
S
A
 
K
V
 
I
A
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
S
V
 
V
D
 
N
R
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
E
x
K
I
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
K
H
 
L
F
|
F
A
 
Y
G
 
S
L
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
S
S
 
A
F
|
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
K

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
37% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 34:282/290 of P14604

query
sites
P14604
E
 
Q
F
 
Y
V
 
I
R
 
I
V
 
T
E
 
E
T
 
K
D
 
K
K
 
G
E
 
K
H
 
N
P
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
R
 
Q
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
C
A
 
N
Q
 
G
V
 
L
T
 
I
R
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
A
A
 
L
A
 
E
E
 
T
V
 
F
S
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
 
M
A
 
Q
H
 
N
L
 
R
T
 
T
H
 
F
A
 
Q
Q
 
D
M
 
C
L
 
-
E
 
-
Y
 
Y
S
 
S
R
 
G
G
 
K
L
 
F
Q
 
L
N
 
S
A
 
H
L
 
W
T
 
D
A
 
H
V
 
I
A
 
T
R
 
R
I
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
I
R
 
I
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
E
|
E
I
 
I
T
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
M
I
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
H
 
R
V
 
I
P
 
S
A
 
A
G
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
K
V
 
I
V
 
F
A
 
P
D
 
V
E
 
E
E
 
T
V
 
L
Y
 
V
S
 
E
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
K
 
C
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
E
 
N
G
 
N
P
 
S
A
 
K
V
 
I
A
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
S
V
 
V
D
 
N
R
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
E
 
K
I
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
K
H
 
L
F
 
F
A
 
Y
G
 
S
L
 
T
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
S
S
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
38% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 4:250/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
E
 
Q
F
 
Y
V
 
I
R
 
I
V
 
T
E
 
E
T
 
K
D
 
K
K
 
G
E
 
K
H
 
N
P
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
R
 
Q
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
A
 
N
Q
 
G
V
 
L
T
 
I
R
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
A
A
 
L
A
 
E
E
 
T
V
 
F
S
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
H
 
N
L
 
R
T
 
T
H
 
F
A
 
Q
Q
 
D
M
 
C
L
 
-
E
 
-
Y
 
Y
S
|
S
R
 
-
G
 
G
L
|
L
Q
 
S
N
 
H
A
 
-
L
 
W
T
 
D
A
 
H
V
 
I
A
 
T
R
 
R
I
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
I
R
 
I
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
L
L
|
L
G
 
G
V
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
M
I
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
H
 
R
V
 
I
P
 
S
A
 
A
G
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
K
V
 
I
V
 
F
A
 
P
D
 
V
E
 
E
E
 
T
V
 
L
Y
 
V
S
 
E
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
K
 
C
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
E
 
N
G
 
N
P
 
S
A
 
K
V
 
I
A
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
S
V
 
V
D
 
N
R
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
E
x
K
I
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
K
H
 
L
F
 
F
A
 
Y
G
 
S
L
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
S
S
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
K

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
41% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 3:244/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
E
 
E
F
 
T
V
 
I
R
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
R
D
 
D
K
 
Q
E
 
R
H
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
G
V
 
I
I
 
I
R
 
T
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
T
 
M
R
 
N
E
 
E
I
 
V
A
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
T
E
 
E
V
 
L
S
 
D
T
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
G
 
S
E
 
A
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
F
Q
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
F
T
|
T
A
 
A
-
 
D
-
 
F
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
W
-
 
G
-
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
A
I
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
V
R
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
D
K
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
K
L
 
L
G
 
G
V
|
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
H
 
T
V
 
M
P
 
D
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
E
E
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
A
E
 
D
E
 
D
V
 
L
Y
 
L
S
 
T
A
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
T
V
 
A
A
 
T
R
 
T
F
 
I
G
 
S
E
 
Q
G
 
M
P
 
S
A
 
A
V
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
V
D
 
N
R
 
R
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
S
D
 
S
L
 
L
D
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
E
x
L
I
 
Y
E
 
E
R
 
R
L
 
R
H
 
L
F
|
F
A
 
H
G
 
S
L
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
K
 
S
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
A
S
 
A
F
|
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
K

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
37% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 3:246/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
E
 
Q
F
 
Y
V
 
I
R
 
I
V
 
T
E
 
E
T
 
K
D
 
K
K
 
G
E
 
K
H
 
N
P
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
R
 
Q
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
A
 
N
Q
 
G
V
 
L
T
 
I
R
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
A
A
 
L
A
 
E
E
 
T
V
 
F
S
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
H
 
N
L
 
R
T
 
T
H
 
F
A
 
Q
Q
 
D
M
 
C
L
 
-
E
 
-
Y
 
Y
S
|
S
R
 
H
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
W
T
 
D
A
 
H
V
 
I
A
 
T
R
 
R
I
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
I
R
 
I
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
L
L
 
L
G
 
G
V
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
M
I
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
H
 
R
V
 
I
P
 
S
A
 
A
G
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
K
V
 
I
V
 
F
A
 
P
D
 
V
E
 
E
E
 
T
V
 
L
Y
 
V
S
 
E
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
K
 
C
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
E
 
N
G
 
N
P
 
S
A
 
K
V
 
I
A
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
S
V
 
V
D
 
N
R
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
E
x
K
I
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
K
H
 
L
F
 
F
A
 
Y
G
 
S
L
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
S
S
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
K

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
36% identity, 95% coverage: 3:244/254 of query aligns to 4:252/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
E
 
E
F
 
Y
V
 
I
R
 
I
V
 
A
E
 
E
T
 
K
D
 
R
K
 
G
E
 
K
H
 
N
P
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
R
 
Q
V
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
A
 
D
Q
 
G
V
 
L
T
 
I
R
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
A
A
 
L
A
 
K
E
 
I
V
 
F
S
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
D
R
x
K
A
 
A
F
 
F
V
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
H
 
N
L
 
L
T
 
S
H
 
F
A
 
Q
Q
 
D
M
 
C
L
 
-
E
 
-
Y
 
Y
S
|
S
R
 
S
G
 
K
L
 
F
Q
x
L
N
 
K
A
 
H
L
 
W
T
 
D
A
 
H
V
 
L
A
 
T
R
 
Q
I
 
V
P
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
X
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
x
F
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
C
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
C
D
 
D
F
 
I
R
 
I
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
L
 
F
G
 
A
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
T
 
L
L
 
I
G
 
G
V
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
M
I
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
H
 
R
V
 
I
P
 
S
A
 
A
G
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
E
 
K
V
 
I
V
 
C
A
 
P
D
 
V
E
 
E
E
 
T
V
 
L
Y
 
V
S
 
E
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
K
 
C
V
 
A
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
E
 
S
G
 
N
P
 
S
A
 
K
V
 
I
A
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
S
V
 
V
D
 
N
R
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
S
E
x
K
I
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
K
H
 
L
F
 
F
A
 
Y
G
 
S
L
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
K
 
K
T
 
E
G
 
G
M
 
M
R
 
T
S
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
K

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
35% identity, 96% coverage: 1:244/254 of query aligns to 4:253/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
M
 
M
G
 
P
E
 
E
F
 
F
V
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
K
T
 
V
D
 
D
K
 
A
E
 
R
H
 
G
P
 
P
A
 
-
V
 
I
A
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
G
P
 
E
K
x
S
A
x
R
L
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
I
N
 
S
A
 
R
Q
 
A
V
 
M
T
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
G
E
 
E
A
 
L
A
 
V
A
 
T
E
 
R
V
 
V
S
 
S
T
 
S
D
 
S
A
 
R
A
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
-
 
A
G
 
G
E
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
L
K
|
K
E
 
E
M
x
R
A
 
A
H
 
T
L
 
M
T
 
A
H
 
E
A
 
D
Q
 
E
M
 
V
L
 
R
E
 
A
Y
 
F
S
x
L
R
 
D
G
 
G
L
 
L
Q
x
R
N
 
R
A
 
T
L
 
F
T
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
K
I
 
S
P
 
D
K
 
C
P
 
V
V
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
X
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
x
L
-
x
G
-
x
G
-
 
G
-
 
T
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
D
 
D
F
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
P
K
 
A
A
 
A
K
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
x
T
E
|
E
I
 
V
T
 
K
L
|
L
G
 
G
V
x
I
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
G
K
 
R
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
A
R
 
R
H
x
R
V
 
I
P
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
F
E
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
D
 
N
E
 
R
V
 
L
V
 
A
A
 
P
D
 
E
E
 
G
E
 
H
V
 
L
Y
 
L
S
 
A
A
 
V
A
 
A
V
 
Y
A
 
G
K
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
S
F
 
V
G
 
V
E
 
E
G
 
N
P
 
A
A
 
P
V
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
H
T
 
A
V
 
I
D
 
D
R
 
E
G
 
G
L
 
T
E
 
G
T
 
L
D
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
D
G
 
A
L
 
L
E
x
A
I
 
L
E
 
E
R
 
L
L
 
R
H
 
K
F
 
Y
A
 
E
G
 
E
L
 
I
F
x
L
A
 
K
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
R
K
 
L
T
 
E
G
 
G
M
 
L
R
 
R
S
 
A
F
 
F
I
 
A
E
 
E
Q
 
K

Q13825 Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial; 3-MG-CoA hydratase; AU-specific RNA-binding enoyl-CoA hydratase; AU-binding protein/enoyl-CoA hydratase; Itaconyl-CoA hydratase; EC 4.2.1.18; EC 4.2.1.56 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
34% identity, 93% coverage: 10:246/254 of query aligns to 83:333/339 of Q13825

query
sites
Q13825
D
 
E
K
 
E
E
 
E
H
 
N
P
 
R
A
 
G
V
 
I
A
 
V
V
 
V
I
 
L
R
 
G
V
 
I
D
 
N
R
 
R
P
 
A
K
 
Y
A
 
G
L
 
K
N
 
N
A
 
S
L
 
L
N
 
S
A
x
K
Q
x
N
V
x
L
T
x
I
R
x
K
E
x
M
I
x
L
A
x
S
E
x
K
A
|
A
A
x
V
A
x
D
E
x
A
V
x
L
S
x
K
T
 
S
D
 
D
A
 
K
A
 
K
V
 
V
R
 
R
S
 
T
V
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
R
G
 
S
G
 
E
E
 
V
R
 
P
A
 
G
-
 
I
F
 
F
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
K
 
K
E
 
E
M
 
R
A
 
A
H
 
K
L
 
M
T
 
S
H
 
S
A
 
S
Q
 
E
M
 
V
L
 
G
E
 
P
Y
 
F
S
 
V
R
 
S
G
 
K
L
 
I
Q
 
R
N
 
A
A
 
V
L
 
I
T
 
N
A
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
N
I
 
L
P
 
P
K
 
V
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
L
X
 
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
D
 
D
F
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
S
K
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
V
E
 
E
I
 
T
T
 
K
L
 
L
G
 
A
V
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
M
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
L
I
 
I
F
 
F
T
 
S
G
x
A
R
 
R
H
 
V
V
 
L
P
 
D
A
 
G
G
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
A
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
S
E
 
H
V
 
V
V
 
L
A
 
E
D
 
Q
E
 
N
E
 
Q
V
 
E
Y
 
G
S
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
A
 
R
K
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
E
-
 
F
F
 
L
G
 
P
E
 
Q
G
 
G
P
 
P
A
 
-
V
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
R
A
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
L
T
 
A
V
 
I
D
 
N
R
 
Q
G
 
G
L
 
M
E
 
E
T
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
V
S
 
T
G
 
G
L
 
L
E
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
E
L
 
A
H
 
C
F
 
Y
A
 
A
G
 
Q
L
 
T
F
 
I
A
 
P
T
 
T
E
 
K
D
 
D
Q
 
R
K
 
L
T
 
E
G
 
G
M
 
L
R
 
L
S
 
A
F
 
F
I
 
K
E
 
E
Q
 
K
G
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q08426 Peroxisomal bifunctional enzyme; PBE; PBFE; L-bifunctional protein; LBP; Multifunctional enzyme 1; MFE1; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8; EC 1.1.1.35 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
38% identity, 71% coverage: 1:180/254 of query aligns to 1:178/723 of Q08426

query
sites
Q08426
M
 
M
G
 
A
E
|
E
F
 
Y
V
 
T
R
 
R
V
 
L
E
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
E
 
-
H
 
H
P
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
L
I
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
R
R
 
N
P
 
P
K
 
-
A
 
P
L
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
N
 
S
A
 
T
Q
 
T
V
 
L
T
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
K
E
 
E
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
E
 
K
V
 
A
S
x
V
T
x
I
D
 
D
A
 
H
A
 
T
V
 
I
R
 
K
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
G
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
K
F
 
F
V
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
K
 
R
E
 
G
M
 
F
A
 
S
H
 
A
L
 
P
T
 
R
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
T
Y
 
F
S
 
G
R
 
L
G
x
T
L
 
L
Q
 
G
N
 
H
A
 
V
L
 
V
T
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
I
 
N
P
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
I
X
 
Q
-
 
G
-
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
C
D
 
H
F
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
H
A
 
A
K
 
E
A
 
A
K
 
Q
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
L
I
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
V
A
 
P
K
 
A
A
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
T
T
 
S
G
 
G
R
 
R
H
 
R
V
 
I
P
 
L
A
 
A
G
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
x
K
I
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
E
x
K
V
 
V
V
 
V
A
 
N
D
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6z5oAAA Peroxisomal bifunctional enzyme (see paper)
36% identity, 71% coverage: 1:180/254 of query aligns to 7:183/716 of 6z5oAAA

query
sites
6z5oAAA
M
 
M
G
 
A
E
 
E
F
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
P
T
 
H
D
 
-
K
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
M
I
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
C
R
 
N
P
 
P
K
 
-
A
x
P
L
x
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
V
 
V
T
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
R
E
 
N
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
E
 
K
V
 
A
S
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
H
A
 
T
V
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
G
 
A
E
 
N
R
 
G
A
 
N
F
 
F
V
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
H
E
 
G
M
x
F
A
 
S
H
 
A
L
 
F
T
 
T
H
 
P
A
 
G
Q
 
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
A
L
 
L
Q
x
G
N
 
S
A
 
L
L
 
V
T
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
I
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
X
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
L
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
C
D
 
H
F
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
V
A
 
P
K
 
V
A
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
T
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
x
Y
V
 
L
P
 
S
A
 
A
G
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
K
D
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6zibAAA structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type-1 (rpmfe1) complexed with acetoacetyl-coa and nadh' (see paper)
36% identity, 71% coverage: 1:180/254 of query aligns to 6:182/723 of 6zibAAA

query
sites
6zibAAA
M
 
M
G
 
A
E
 
E
F
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
P
T
 
H
D
 
-
K
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
M
I
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
C
R
 
N
P
 
P
K
 
-
A
x
P
L
x
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
V
 
V
T
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
R
E
 
N
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
E
 
K
V
 
A
S
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
H
A
 
T
V
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
G
 
A
E
 
N
R
 
G
A
 
N
F
 
F
V
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
H
E
 
G
M
x
F
A
 
S
H
 
A
L
 
F
T
 
T
H
 
P
A
 
G
Q
 
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
A
L
 
L
Q
x
G
N
 
S
A
 
L
L
 
V
T
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
I
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
X
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
x
G
-
x
G
-
 
G
-
 
L
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
C
D
 
H
F
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
P
 
P
G
|
G
A
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
V
A
 
P
K
 
V
A
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
T
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
x
Y
V
 
L
P
 
S
A
 
A
G
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
K
D
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5omoA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type-1 (rpmfe1) complexed with with 3s-hydroxy-decanoyl-coa and 3-keto- decanoyl-coa
36% identity, 71% coverage: 1:180/254 of query aligns to 6:182/725 of 5omoA

query
sites
5omoA
M
 
M
G
 
A
E
 
E
F
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
P
T
 
H
D
 
-
K
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
M
I
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
C
R
 
N
P
 
P
K
 
-
A
x
P
L
x
V
N
 
N
A
|
A
L
 
V
N
 
S
A
x
P
Q
 
T
V
 
V
T
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
R
E
 
N
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
E
 
K
V
 
A
S
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
H
A
 
T
V
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
G
 
A
E
 
N
R
 
G
A
 
N
F
 
F
V
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
H
E
 
G
M
x
F
A
 
S
H
 
A
L
 
F
T
 
T
H
 
P
A
 
G
Q
 
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
A
L
 
L
Q
x
G
N
 
S
A
 
L
L
 
V
T
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
I
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
X
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
x
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
L
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
C
D
 
H
F
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
V
A
 
P
K
 
V
A
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
T
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
x
Y
V
 
L
P
 
S
A
 
A
G
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
K
D
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mgbA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type-1 (rpmfe1) complexed with acetoacetyl-coa and NAD (see paper)
36% identity, 71% coverage: 1:180/254 of query aligns to 6:182/725 of 5mgbA

query
sites
5mgbA
M
 
M
G
 
A
E
 
E
F
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
P
T
 
H
D
 
-
K
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
M
I
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
C
R
 
N
P
 
P
K
 
-
A
x
P
L
x
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
V
 
V
T
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
R
E
 
N
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
E
 
K
V
 
A
S
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
H
A
 
T
V
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
G
 
A
E
 
N
R
 
G
A
 
N
F
 
F
V
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
H
E
 
G
M
x
F
A
 
S
H
 
A
L
 
F
T
 
T
H
 
P
A
 
G
Q
 
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
A
L
 
L
Q
x
G
N
 
S
A
 
L
L
 
V
T
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
I
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
X
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
L
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
C
D
 
H
F
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
V
A
 
P
K
 
V
A
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
T
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
x
Y
V
 
L
P
 
S
A
 
A
G
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
K
D
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3zwcA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 1 (rpmfe1) complexed with 3s-hydroxy-decanoyl-coa (see paper)
36% identity, 71% coverage: 1:180/254 of query aligns to 6:182/725 of 3zwcA

query
sites
3zwcA
M
 
M
G
 
A
E
 
E
F
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
P
T
 
H
D
 
-
K
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
M
I
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
C
R
 
N
P
 
P
K
 
-
A
 
P
L
x
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
V
 
V
T
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
R
E
 
N
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
E
 
K
V
 
A
S
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
H
A
 
T
V
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
G
 
A
E
 
N
R
 
G
A
 
N
F
 
F
V
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
H
E
 
G
M
x
F
A
 
S
H
 
A
L
 
F
T
 
T
H
 
P
A
x
G
Q
x
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
A
L
|
L
Q
x
G
N
 
S
A
 
L
L
 
V
T
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
I
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
X
 
Q
-
 
G
-
x
V
-
 
A
-
 
L
-
x
G
-
x
G
-
 
G
-
 
L
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
C
D
 
H
F
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
V
A
 
P
K
 
V
A
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
T
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
V
 
L
P
 
S
A
 
A
G
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
K
D
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2x58A The crystal structure of mfe1 liganded with coa (see paper)
36% identity, 71% coverage: 1:180/254 of query aligns to 6:182/725 of 2x58A

query
sites
2x58A
M
 
M
G
 
A
E
 
E
F
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
P
T
 
H
D
 
-
K
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
M
I
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
C
R
 
N
P
 
P
K
 
-
A
 
P
L
x
V
N
 
N
A
|
A
L
 
V
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
V
 
V
T
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
R
E
 
N
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
E
 
K
V
 
A
S
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
H
A
 
T
V
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
G
 
A
E
 
N
R
 
G
A
 
N
F
 
F
V
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
H
E
 
G
M
x
F
A
 
S
H
 
A
L
 
F
T
 
T
H
 
P
A
 
G
Q
 
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
A
L
 
L
Q
x
G
N
 
S
A
 
L
L
 
V
T
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
Q
R
 
R
I
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
X
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
x
G
-
 
G
-
 
L
-
x
E
X
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
C
D
 
H
F
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
V
A
 
P
K
 
V
A
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
T
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
V
 
L
P
 
S
A
 
A
G
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
K
D
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_040688932.1 NCBI__GCF_000341125.1:WP_040688932.1
MGEFVRVETDKEHPAVAVIRVDRPKALNALNAQVTREIAEAAAEVSTDAAVRSVVLYGGE
RAFVAGADIKEMAHLTHAQMLEYSRGLQNALTAVARIPKPVVAAVXXALAADFRVAGAKA
KLGLPEITLGVIPGAGGTQRLPRLIGPAKAKDLIFTGRHVPAGEALEIGLVDEVVADEEV
YSAAVAKVARFGEGPAVALAAAKETVDRGLETDLDSGLEIERLHFAGLFATEDQKTGMRS
FIEQGPGKAEFSGR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory