SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041091109.1 NCBI__GCF_000829435.1:WP_041091109.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 92% coverage: 8:239/252 of query aligns to 19:251/265 of P07821

query
sites
P07821
F
 
F
K
 
R
M
 
V
F
 
P
G
 
G
K
 
R
K
 
T
K
 
-
V
 
L
V
 
L
G
 
H
D
 
P
V
 
L
S
 
S
I
 
L
T
 
T
L
 
F
Q
 
P
K
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
V
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
K
M
 
M
V
 
L
S
 
G
R
 
R
L
 
H
L
 
Q
T
 
P
A
 
P
D
 
S
G
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
A
L
 
Q
D
 
P
I
 
L
A
 
E
R
 
S
C
 
W
R
 
S
G
 
S
N
 
K
D
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
R
K
 
K
I
 
V
S
 
A
I
 
Y
L
 
L
K
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
N
 
L
H
 
P
I
 
P
T
 
A
L
 
E
R
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
R
D
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
F
 
I
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
Y
 
W
-
 
H
-
 
G
S
 
A
Q
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
F
T
 
G
K
 
A
E
 
A
D
 
D
W
 
R
H
 
E
H
 
K
V
 
V
N
 
E
K
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
S
Y
 
L
M
 
V
E
 
G
L
 
L
T
 
K
D
 
P
M
 
L
Q
 
A
D
 
H
S
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
L
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
T
 
S
E
 
R
Y
 
C
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
I
K
 
A
H
 
H
A
 
Q
V
 
V
Q
 
D
M
 
V
M
 
L
K
 
S
V
 
L
L
 
V
R
 
H
K
 
R
L
 
L
V
 
S
D
 
Q
D
 
E
L
 
R
G
 
G
K
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
I
I
 
A
V
 
V
I
 
L
H
 
H
D
 
D
I
 
I
N
 
N
F
 
M
A
 
A
S
 
A
C
 
R
Y
 
Y
S
 
C
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
I
 
V
A
 
A
M
 
L
K
 
R
D
 
G
G
 
G
K
 
E
V
 
M
L
 
I
R
 
A
E
 
Q
G
 
G
E
 
T
T
 
P
K
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
M
Q
 
R
P
 
G
D
 
E
I
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
M
I
 
I
Y
 
Y
D
 
G
M
 
I
D
 
P
I
 
M
D
 
G
I
 
I

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
31% identity, 89% coverage: 1:224/252 of query aligns to 1:224/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
V
 
I
V
 
F
A
 
V
K
 
N
G
 
D
V
 
V
F
 
Y
K
 
K
M
 
N
F
|
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
K
 
E
V
|
V
V
 
L
G
 
K
D
 
G
V
 
V
S
 
T
I
 
L
T
 
K
L
 
V
Q
 
N
K
 
K
G
 
G
K
 
E
I
 
V
T
 
V
S
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
M
 
C
V
 
I
S
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
E
A
 
P
D
 
T
G
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
I
D
 
D
E
 
G
L
 
V
D
 
K
I
 
I
-
 
N
-
 
N
A
 
G
R
 
K
C
 
V
R
 
N
G
 
I
N
 
N
D
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
Q
K
 
K
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
H
N
 
F
H
 
N
I
 
L
T
 
F
L
 
P
R
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
K
 
I
D
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
T
F
 
L
G
 
A
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
V
S
 
K
Q
 
V
G
 
K
K
 
K
L
 
M
T
 
N
K
 
K
E
 
K
D
 
E
W
 
A
H
 
E
H
 
E
V
 
L
N
 
-
K
 
-
A
 
A
I
 
V
E
 
D
Y
 
L
M
 
L
E
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
G
L
 
L
T
 
L
D
 
D
M
 
K
Q
 
K
D
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
P
D
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
Q
T
 
P
E
 
E
Y
 
V
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
P
K
 
E
H
 
M
A
 
V
V
 
K
Q
 
E
M
 
V
M
 
L
K
 
N
V
 
V
L
 
M
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
V
 
A
D
 
N
D
 
E
L
 
-
G
 
G
K
 
M
T
 
T
V
 
M
A
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
T
H
|
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
R
C
 
E
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
I
L
 
V
R
 
E
E
 
E
G
 
G
E
 
T
T
 
P
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
F

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
32% identity, 89% coverage: 1:225/252 of query aligns to 17:237/378 of P69874

query
sites
P69874
M
 
L
V
 
V
V
 
Q
A
 
L
K
 
A
G
 
G
V
 
I
F
 
R
K
 
K
M
x
C
F
|
F
G
 
D
K
 
G
K
 
K
K
 
E
V
 
V
V
 
I
G
 
P
D
 
Q
V
 
L
S
 
D
I
 
L
T
 
T
L
 
I
Q
 
N
K
 
N
G
 
G
K
 
E
I
x
F
T
 
L
S
 
T
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
L
|
L
S
 
R
M
 
L
V
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
T
A
 
V
D
 
D
G
 
S
G
 
G
E
 
R
I
 
I
T
 
M
I
x
L
D
 
D
E
 
N
L
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
T
R
 
H
C
 
V
R
 
P
G
 
A
N
 
E
D
 
N
L
 
-
A
 
-
K
 
R
K
 
Y
I
 
V
S
 
N
I
 
T
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
S
N
 
Y
H
 
A
I
 
L
T
 
F
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
F
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
L
F
 
-
P
 
-
Y
 
R
S
 
M
Q
 
Q
G
 
K
K
 
T
L
 
P
T
 
A
K
 
A
E
 
E
D
 
I
W
 
T
H
 
P
H
 
R
V
 
V
N
 
M
K
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
R
Y
 
M
M
x
V
E
 
Q
L
 
L
T
 
E
D
 
T
M
 
F
Q
 
A
D
 
Q
S
 
R
Y
 
K
L
 
P
D
 
H
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
V
A
 
V
Q
 
N
D
 
K
T
 
P
E
 
R
Y
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
L
 
L
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
Y
K
 
K
H
 
L
A
 
R
V
 
K
Q
 
Q
M
 
M
M
 
Q
K
 
N
V
 
E
L
 
L
R
 
K
K
 
A
L
 
L
V
 
Q
D
 
R
D
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
I
T
 
T
V
 
F
A
 
V
I
 
F
V
 
V
I
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
E
F
 
E
A
 
A
S
 
L
C
 
T
Y
 
M
S
 
S
D
 
D
Y
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
V
M
 
M
K
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
I
L
 
E
R
 
Q
E
 
D
G
 
G
E
 
T
T
 
P
K
 
R
E
 
E
I
 
I
I
 
Y
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
32% identity, 79% coverage: 19:217/252 of query aligns to 23:226/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
D
 
N
V
 
V
S
 
N
I
 
L
T
 
N
L
 
I
Q
 
K
K
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
F
T
 
V
S
 
S
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
S
 
N
M
 
I
V
 
I
S
 
G
R
 
C
L
 
L
L
 
D
T
 
K
A
 
P
D
 
T
G
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
Y
I
 
I
D
 
D
E
 
N
L
 
I
D
 
K
I
 
T
A
 
N
R
 
D
C
 
L
R
 
D
G
 
D
N
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
T
K
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
G
I
 
F
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
N
 
F
H
 
N
I
 
L
T
 
I
L
 
P
R
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
A
K
 
L
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
E
F
 
L
G
 
P
R
 
L
F
 
I
P
 
F
Y
 
K
S
 
Y
Q
 
R
G
 
G
K
 
A
L
 
M
T
 
S
K
 
G
E
 
E
D
 
E
W
 
R
H
 
R
H
 
K
V
 
-
N
 
-
K
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
Y
 
C
M
 
L
E
 
K
L
 
M
T
 
A
D
 
E
M
 
L
Q
 
E
D
 
E
S
 
R
Y
 
F
L
 
A
D
 
N
-
 
H
-
 
K
-
 
P
-
 
N
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
N
D
 
N
T
 
P
E
 
P
Y
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
S
K
 
K
H
 
T
A
 
G
V
 
E
Q
 
K
M
 
I
M
 
M
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
R
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
N
D
 
E
D
 
E
L
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
I
N
 
N
F
 
V
A
 
A
S
 
R
C
 
-
Y
 
F
S
 
G
D
 
E
Y
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
Y
M
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
E
R
 
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
33% identity, 79% coverage: 19:217/252 of query aligns to 23:226/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
D
 
N
V
 
V
S
 
N
I
 
L
T
 
N
L
 
I
Q
 
K
K
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
F
T
 
V
S
 
S
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
S
 
N
M
 
I
V
 
I
S
 
G
R
 
C
L
 
L
L
 
D
T
 
K
A
 
P
D
 
T
G
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
Y
I
 
I
D
 
D
E
 
N
L
 
I
D
 
K
I
 
T
A
 
N
R
 
D
C
 
L
R
 
D
G
 
D
N
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
T
K
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
G
-
 
F
I
 
V
L
 
F
K
 
Q
Q
 
Q
A
 
F
N
 
N
H
 
L
I
 
I
T
 
P
L
 
L
R
 
-
L
 
L
T
 
T
V
 
A
K
 
L
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
E
F
 
L
G
 
P
R
 
L
F
 
I
P
 
F
Y
 
K
S
 
Y
Q
 
R
G
 
G
K
 
A
L
 
M
T
 
S
K
 
G
E
 
E
D
 
E
W
 
R
H
 
R
H
 
K
V
 
-
N
 
-
K
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
Y
 
C
M
 
L
E
 
K
L
 
M
T
 
A
D
 
E
M
 
L
Q
 
E
D
 
E
S
 
R
Y
x
F
L
 
A
D
 
N
-
 
H
-
 
K
-
 
P
-
 
N
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
N
D
 
N
T
 
P
E
 
P
Y
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
T
N
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
S
K
 
K
H
 
T
A
 
G
V
 
E
Q
 
K
M
 
I
M
 
M
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
R
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
N
D
 
E
D
 
E
L
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
I
N
 
N
F
 
V
A
 
A
S
 
R
C
 
-
Y
 
F
S
 
G
D
 
E
Y
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
Y
M
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
E
R
 
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
30% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 7:252/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
K
 
K
G
 
G
V
 
L
F
 
T
K
 
F
M
 
K
F
x
R
G
 
G
K
 
S
K
 
R
K
 
A
V
 
I
V
 
F
G
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
D
I
 
V
T
 
R
L
 
I
Q
 
P
K
 
R
G
 
G
K
 
K
I
 
V
T
 
T
S
 
G
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
M
 
L
V
 
I
S
 
A
R
 
S
L
 
Q
L
 
L
T
 
R
A
 
P
D
 
S
G
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
W
I
 
V
D
 
N
E
 
G
L
 
Q
D
 
N
I
 
L
A
 
P
R
 
Q
-
 
L
C
 
S
R
 
R
G
 
G
N
 
D
-
 
L
-
 
F
D
 
D
L
 
M
A
 
R
K
 
K
K
 
Q
I
 
F
S
 
G
I
 
V
L
 
L
K
 
F
Q
 
Q
A
 
S
N
 
G
H
 
A
I
 
L
T
 
F
L
 
T
R
 
D
L
 
L
T
 
D
V
 
V
K
 
F
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
F
 
F
G
 
P
R
 
L
F
 
R
P
 
V
Y
 
H
S
 
T
Q
 
Q
G
 
L
K
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
V
L
 
L
T
 
M
K
 
K
E
 
L
D
 
Q
W
 
A
H
 
V
H
 
G
V
 
L
N
 
R
K
 
G
A
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
L
M
 
M
E
 
P
L
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
Q
 
-
D
 
-
S
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
L
D
 
D
T
 
P
E
 
Q
Y
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
F
N
 
V
N
 
G
L
 
Q
D
 
D
M
 
P
K
 
I
H
 
A
A
 
M
V
 
G
Q
 
V
M
 
L
M
 
V
K
 
R
V
 
L
L
 
I
R
 
R
K
 
L
L
 
L
V
 
N
D
 
D
D
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
I
T
 
T
V
 
S
A
 
I
I
 
V
V
 
V
I
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
A
F
 
E
A
 
T
S
 
A
C
 
S
Y
 
I
S
 
A
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
I
 
Y
A
 
I
M
 
V
K
 
G
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
G
E
 
H
G
 
G
E
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
-
Q
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
E
 
E
I
 
T
Y
 
D
D
 
D
M
 
P
D
 
R
I
 
I
D
 
R
-
 
Q
-
 
F
I
 
V
K
 
K
D
 
G
V
 
I
N
 
P
D
 
D
N
 
G
K
 
P
I
 
V
C
 
P
V
 
F
Y
 
H
Y
 
Y
A
 
P

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
30% identity, 87% coverage: 7:225/252 of query aligns to 11:229/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
V
 
T
F
 
Y
K
 
A
M
x
F
F
 
P
G
 
G
K
 
G
K
x
V
K
 
K
V
x
A
V
 
L
G
 
D
D
 
D
V
 
L
S
 
S
I
 
L
T
 
A
L
 
V
Q
 
P
K
 
K
G
 
G
K
 
E
I
 
S
T
 
L
S
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
L
M
 
H
V
 
L
S
 
N
R
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
R
A
 
P
D
 
Q
G
 
S
G
 
G
E
 
R
I
 
V
T
 
L
I
 
L
D
 
G
E
 
G
L
 
T
D
 
A
I
 
T
A
 
G
R
 
H
C
 
S
R
 
R
G
 
-
N
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
T
-
 
G
-
 
W
-
 
R
K
 
R
K
 
R
I
 
V
S
 
G
-
 
L
I
 
V
L
 
L
K
x
Q
Q
 
D
A
 
A
N
 
D
H
 
D
I
 
Q
T
 
L
L
 
F
R
 
A
L
 
T
T
 
T
V
 
V
K
 
F
D
 
E
L
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
F
G
 
G
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
L
S
 
N
Q
 
L
G
 
G
K
 
L
L
 
S
T
 
E
K
 
A
E
 
E
D
 
A
W
 
R
H
 
A
H
 
R
V
 
V
N
 
E
K
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
Y
 
A
M
 
L
E
 
S
L
 
I
T
 
S
D
 
D
M
 
L
Q
 
R
D
 
D
S
 
R
Y
 
P
L
 
T
D
x
H
E
x
M
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
G
V
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
M
D
 
R
T
 
P
E
 
E
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
L
 
T
N
 
A
N
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
L
K
 
A
H
 
G
A
 
T
V
 
E
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
K
 
T
V
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
G
L
 
L
V
 
-
D
 
R
D
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
M
T
 
T
V
 
L
A
 
V
I
 
F
V
 
S
I
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
V
N
 
E
F
 
L
A
 
A
S
 
A
C
 
A
Y
 
L
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
A
A
 
L
M
 
F
K
 
R
D
 
T
G
 
G
K
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
E
G
 
G
E
 
A
T
 
A
K
 
E
E
 
A
I
 
V
I
 
L
Q
 
S

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
32% identity, 87% coverage: 7:224/252 of query aligns to 32:251/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
V
 
I
F
 
L
K
 
K
M
 
K
F
 
T
G
 
G
K
 
A
K
x
T
K
x
V
V
x
G
V
 
V
G
 
Y
D
 
D
V
 
T
S
 
N
I
 
F
T
 
E
L
 
I
Q
 
N
K
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
I
T
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
M
 
L
V
 
L
S
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
E
A
 
P
D
 
T
G
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
I
T
 
F
I
 
I
D
 
D
E
 
N
L
 
Q
D
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
T
C
 
L
R
 
N
G
 
K
N
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
L
K
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
Q
A
 
V
N
 
R
H
 
R
I
 
K
T
 
T
L
 
M
R
 
S
L
 
M
T
 
V
V
 
F
K
 
Q
D
 
N
L
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
G
 
G
R
 
L
F
 
F
P
 
P
Y
 
H
S
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
T
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
V
Q
 
Q
G
 
N
K
 
V
L
 
P
T
 
K
K
 
E
E
 
E
D
 
R
W
 
R
H
 
K
H
 
R
V
 
A
N
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
N
M
 
A
E
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
D
M
 
F
Q
 
K
D
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
P
D
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
T
 
P
E
 
E
Y
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
L
 
F
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
P
K
 
L
H
 
I
A
 
R
V
 
R
Q
 
E
M
 
M
M
 
Q
K
 
D
V
 
E
L
 
L
R
 
L
K
 
E
L
 
L
V
 
Q
D
 
A
D
 
K
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
T
 
T
V
 
I
A
 
I
I
 
F
V
 
V
I
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
F
 
E
A
 
A
S
 
L
C
 
R
Y
 
I
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
I
I
 
A
A
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
I
L
 
M
R
 
Q
E
 
I
G
 
G
E
 
T
T
 
G
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
32% identity, 87% coverage: 7:224/252 of query aligns to 32:251/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
V
 
I
F
 
L
K
 
K
M
 
K
F
 
T
G
 
G
K
 
A
K
 
T
K
 
V
V
 
G
V
 
V
G
 
Y
D
 
D
V
 
T
S
 
N
I
 
F
T
 
E
L
 
I
Q
 
N
K
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
I
T
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
M
 
L
V
 
L
S
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
E
A
 
P
D
 
T
G
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
I
T
 
F
I
 
I
D
 
D
E
 
N
L
 
Q
D
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
T
C
 
L
R
 
N
G
 
K
N
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
L
K
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
Q
A
 
V
N
 
R
H
 
R
I
 
K
T
 
T
L
 
M
R
 
S
L
 
M
T
 
V
V
 
F
K
 
Q
D
 
N
L
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
G
 
G
R
 
L
F
 
F
P
 
P
Y
 
H
S
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
T
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
V
Q
 
Q
G
 
N
K
 
V
L
 
P
T
 
K
K
 
E
E
 
E
D
 
R
W
 
R
H
 
K
H
 
R
V
 
A
N
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
N
M
 
A
E
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
D
M
 
F
Q
 
K
D
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
P
D
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
T
 
P
E
 
E
Y
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
L
 
F
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
P
K
 
L
H
 
I
A
 
R
V
 
R
Q
 
E
M
 
M
M
 
Q
K
 
D
V
 
E
L
 
L
R
 
L
K
 
E
L
 
L
V
 
Q
D
 
A
D
 
K
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
T
 
T
V
 
I
A
 
I
I
 
F
V
 
V
I
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
F
 
E
A
 
A
S
 
L
C
 
R
Y
 
I
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
I
I
 
A
A
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
I
L
 
M
R
 
Q
E
 
I
G
 
G
E
 
T
T
 
G
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L

Sites not aligning to the query:

8hprD Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
33% identity, 83% coverage: 14:223/252 of query aligns to 16:221/362 of 8hprD

query
sites
8hprD
K
 
R
K
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
K
D
 
E
V
 
F
S
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
I
Q
 
A
K
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
F
T
 
I
S
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
V
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
T
I
 
S
D
 
G
E
 
E
L
 
L
D
 
R
I
 
I
A
 
G
R
 
G
C
 
E
R
 
R
G
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
K
A
 
A
K
 
P
K
 
K
-
 
D
-
 
R
-
 
D
I
 
I
S
 
A
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
|
Q
A
 
S
N
 
Y
H
 
A
I
 
L
T
 
Y
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
R
D
 
Q
L
 
N
V
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
L
S
 
T
Q
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
P
K
 
K
-
 
A
E
 
E
D
 
I
W
 
A
H
 
A
H
 
K
V
 
V
N
 
E
K
 
E
A
 
T
I
 
A
E
 
K
Y
 
I
M
 
L
E
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
E
M
 
L
Q
 
L
D
 
D
S
x
R
Y
 
K
L
 
P
D
 
G
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
M
A
 
G
M
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
V
Q
 
R
D
 
S
T
 
P
E
 
K
Y
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
L
 
L
N
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
D
M
 
A
K
 
K
H
 
L
A
 
R
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
M
 
R
K
 
A
V
 
E
L
 
I
R
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
T
T
 
T
V
 
T
A
 
V
I
 
Y
V
 
V
I
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
T
F
 
E
A
 
A
S
 
M
C
 
T
Y
 
L
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
Q
R
 
Q
E
 
I
G
 
G
E
 
T
T
 
P
K
 
D
E
 
E
I
 
L

Sites not aligning to the query:

8hplC Lpqy-sugabc in state 1 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 13:223/252 of query aligns to 13:219/384 of 8hplC

query
sites
8hplC
K
 
P
K
 
R
K
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
K
D
 
E
V
 
F
S
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
I
Q
 
A
K
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
F
T
 
I
S
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
V
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
T
I
 
S
D
 
G
E
 
E
L
 
L
D
 
R
I
 
I
A
 
G
R
 
G
C
 
E
R
 
R
G
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
K
A
 
A
K
 
P
K
 
K
-
 
D
-
 
R
-
 
D
I
 
I
S
 
A
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
S
N
 
Y
H
 
A
I
 
L
T
 
Y
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
R
D
 
Q
L
 
N
V
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
L
S
 
T
Q
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
P
K
 
K
-
 
A
E
 
E
D
 
I
W
 
A
H
 
A
H
 
K
V
 
V
N
 
E
K
 
E
A
 
T
I
 
A
E
 
K
Y
 
I
M
 
L
E
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
E
M
 
L
Q
 
L
D
 
D
S
 
R
Y
 
K
L
 
P
D
 
G
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
M
A
 
G
M
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
V
Q
 
R
D
 
S
T
 
P
E
 
K
Y
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
N
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
D
M
 
A
K
 
K
H
 
L
A
 
R
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
M
 
R
K
 
A
V
 
E
L
 
I
R
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
T
T
 
T
V
 
T
A
 
V
I
 
Y
V
 
V
I
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
T
F
 
E
A
 
A
S
 
M
C
 
T
Y
 
L
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
Q
R
 
Q
E
 
I
G
 
G
E
 
T
T
 
P
K
 
D
E
 
E
I
 
L

Sites not aligning to the query:

8hprC Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
33% identity, 83% coverage: 14:223/252 of query aligns to 16:221/363 of 8hprC

query
sites
8hprC
K
 
R
K
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
K
D
 
E
V
 
F
S
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
I
Q
 
A
K
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
F
T
 
I
S
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
V
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
T
I
 
S
D
 
G
E
 
E
L
 
L
D
 
R
I
 
I
A
 
G
R
 
G
C
 
E
R
 
R
G
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
K
A
 
A
K
 
P
K
 
K
-
 
D
-
 
R
-
 
D
I
 
I
S
 
A
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
|
Q
A
 
S
N
 
Y
H
 
A
I
 
L
T
 
Y
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
R
D
 
Q
L
 
N
V
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
L
S
 
T
Q
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
P
K
 
K
-
 
A
E
 
E
D
 
I
W
 
A
H
 
A
H
 
K
V
 
V
N
 
E
K
 
E
A
 
T
I
 
A
E
 
K
Y
 
I
M
 
L
E
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
E
M
 
L
Q
 
L
D
 
D
S
 
R
Y
 
K
L
 
P
D
 
G
E
x
Q
L
 
L
S
 
S
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
M
A
 
G
M
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
V
Q
 
R
D
 
S
T
 
P
E
 
K
Y
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
N
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
D
M
 
A
K
 
K
H
 
L
A
 
R
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
M
 
R
K
 
A
V
 
E
L
 
I
R
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
Q
D
 
D
D
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
T
T
 
T
V
 
T
A
 
V
I
 
Y
V
 
V
I
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
T
F
 
E
A
 
A
S
 
M
C
 
T
Y
 
L
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
Q
R
 
Q
E
 
I
G
 
G
E
 
T
T
 
P
K
 
D
E
 
E
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
32% identity, 87% coverage: 7:224/252 of query aligns to 32:251/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
V
 
I
F
 
L
K
 
K
M
 
K
F
 
T
G
 
G
K
 
A
K
x
T
K
 
V
V
 
G
V
 
V
G
 
Y
D
 
D
V
 
T
S
 
N
I
 
F
T
 
E
L
 
I
Q
 
N
K
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
I
T
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
M
 
L
V
 
L
S
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
E
A
 
P
D
 
T
G
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
I
T
 
F
I
 
I
D
 
D
E
 
N
L
 
Q
D
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
T
C
 
L
R
 
N
G
 
K
N
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
L
K
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
Q
A
 
V
N
 
R
H
 
R
I
 
K
T
 
T
L
 
M
R
 
S
L
 
M
T
 
V
V
 
F
K
x
Q
D
 
N
L
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
G
 
G
R
 
L
F
 
F
P
 
P
Y
 
H
S
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
T
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
V
Q
 
Q
G
 
N
K
 
V
L
 
P
T
 
K
K
 
E
E
 
E
D
 
R
W
 
R
H
 
K
H
 
R
V
 
A
N
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
N
M
 
A
E
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
D
M
 
F
Q
 
K
D
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
P
D
x
K
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
T
 
P
E
 
E
Y
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
L
 
F
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
P
K
 
L
H
 
I
A
 
R
V
 
R
Q
 
E
M
 
M
M
 
Q
K
 
D
V
 
E
L
 
L
R
 
L
K
 
E
L
 
L
V
 
Q
D
 
A
D
 
K
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
T
 
T
V
 
I
A
 
I
I
 
F
V
 
V
I
 
S
H
|
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
F
 
E
A
 
A
S
 
L
C
 
R
Y
 
I
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
I
I
 
A
A
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
I
L
 
M
R
 
Q
E
 
I
G
 
G
E
 
T
T
 
G
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
29% identity, 87% coverage: 5:224/252 of query aligns to 6:224/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
K
 
R
G
 
N
V
 
L
F
 
H
K
 
K
M
 
W
F
|
F
G
 
G
K
 
P
K
 
L
K
 
H
V
|
V
V
 
L
G
 
K
D
 
G
V
 
I
S
 
H
I
 
L
T
 
E
L
 
V
Q
 
A
K
 
P
G
 
G
K
 
E
I
 
K
T
 
L
S
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
S
 
R
M
 
T
V
 
I
S
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
E
T
 
D
A
 
F
D
 
Q
G
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
G
L
 
L
D
 
S
I
 
V
A
 
K
R
 
D
C
 
D
R
 
R
G
 
A
-
 
L
N
 
R
D
 
E
L
 
I
A
 
R
K
 
R
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
N
 
F
H
 
N
I
 
L
T
 
F
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
L
D
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
T
F
 
L
G
 
A
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
M
S
 
R
Q
 
V
G
 
R
K
 
R
L
 
W
T
 
P
K
 
R
E
 
E
D
 
K
W
 
A
H
 
E
H
 
-
V
 
-
N
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
L
E
 
E
Y
 
L
M
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
G
L
 
I
T
 
L
D
 
D
M
 
Q
Q
 
A
D
 
R
S
 
K
Y
 
Y
L
 
P
D
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
T
 
P
E
 
K
Y
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
P
K
 
E
H
 
M
A
 
V
V
 
G
Q
 
E
M
 
V
M
 
L
K
 
D
V
 
V
L
 
M
R
 
R
K
 
D
L
 
L
V
 
A
D
 
Q
D
 
G
L
 
-
G
 
G
K
 
M
T
 
T
V
 
M
A
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
R
C
 
E
Y
 
V
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
A
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
L
 
V
R
 
E
E
 
E
G
 
G
E
 
R
T
 
P
K
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
F

1g291 Malk (see paper)
33% identity, 86% coverage: 7:223/252 of query aligns to 9:227/372 of 1g291

query
sites
1g291
V
 
V
F
 
W
K
 
K
M
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
E
K
 
V
K
 
T
V
 
A
V
 
V
G
 
R
D
 
E
V
 
M
S
 
S
I
 
L
T
 
E
L
 
V
Q
 
K
K
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
F
T
 
M
S
 
I
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
S
 
R
M
 
M
V
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
E
A
 
P
D
 
S
G
 
R
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
Y
I
 
I
-
 
G
D
 
D
E
 
K
L
 
L
D
 
V
I
 
A
A
x
D
R
 
P
C
x
E
R
x
K
G
 
G
N
 
I
D
 
F
L
 
V
A
 
P
K
 
P
K
|
K
-
x
D
-
 
R
-
 
D
I
 
I
S
 
A
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
S
N
 
Y
H
 
A
I
 
L
T
 
Y
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
Y
D
 
D
L
 
N
V
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
L
S
 
K
Q
 
L
G
 
R
K
 
K
L
 
V
T
 
P
K
 
R
E
 
Q
D
 
E
W
 
I
-
 
D
H
 
Q
H
 
R
V
 
V
N
 
R
K
 
E
A
 
V
I
 
A
E
 
E
Y
 
L
M
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
E
M
 
L
Q
 
L
D
 
N
S
 
R
Y
 
K
L
 
P
D
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
L
A
 
G
M
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
V
Q
 
R
D
 
K
T
 
P
E
 
Q
Y
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
L
N
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
D
M
 
A
K
 
K
H
 
L
A
 
R
V
 
V
Q
 
R
M
 
M
M
 
R
K
 
A
V
 
E
L
 
L
R
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
Q
D
 
R
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
T
A
 
I
I
 
Y
V
 
V
I
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
V
F
 
E
A
 
A
S
 
M
C
 
T
Y
 
M
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
I
I
 
A
A
 
V
M
 
M
K
 
N
D
 
R
G
 
G
K
 
V
V
 
L
L
 
Q
R
 
Q
E
 
V
G
 
G
E
 
S
T
 
P
K
 
D
E
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

P9WQI3 Trehalose import ATP-binding protein SugC; MtbSugC; Nucleotide-binding domain of SugABC transporter; NBD of SugABC transporter; SugABC transporter ATPase SugC; EC 7.5.2.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
32% identity, 83% coverage: 17:225/252 of query aligns to 20:224/393 of P9WQI3

query
sites
P9WQI3
V
 
V
G
 
R
D
 
D
V
 
L
S
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
I
Q
 
A
K
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
F
T
 
L
S
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
V
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
E
E
 
D
I
 
I
T
 
S
I
 
S
D
 
G
E
 
E
L
 
L
D
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
G
C
 
E
R
 
R
G
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
K
A
 
A
K
 
P
K
 
K
-
 
D
-
 
R
-
 
D
I
 
I
S
 
A
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
S
N
 
Y
H
 
A
I
 
L
T
 
Y
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
R
D
 
Q
L
 
N
V
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
L
S
 
T
Q
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
M
T
 
R
K
 
K
E
 
A
D
 
D
-
 
I
W
 
A
H
 
Q
H
 
K
V
 
V
N
 
S
K
 
E
A
 
T
I
 
A
E
 
K
Y
 
I
M
 
L
E
 
D
L
 
L
T
 
T
D
 
N
M
 
L
Q
 
L
D
 
D
S
 
R
Y
 
K
L
 
P
D
 
S
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
M
A
 
G
M
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
V
Q
 
R
D
 
H
T
 
P
E
 
K
Y
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
L
N
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
D
M
 
A
K
 
K
H
 
L
A
 
R
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
M
 
R
K
 
G
V
 
E
L
 
I
R
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
Q
D
 
R
D
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
T
T
 
T
V
 
T
A
 
V
I
 
Y
V
 
V
I
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
T
F
 
E
A
 
A
S
 
M
C
 
T
Y
 
L
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
M
K
 
Y
D
 
G
G
 
G
K
 
I
V
 
A
L
 
Q
R
 
Q
E
 
I
G
 
G
E
 
T
T
 
P
K
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
Y
Q
 
E

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp- binding protein
32% identity, 86% coverage: 7:223/252 of query aligns to 12:230/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
V
 
I
F
 
W
K
 
K
M
 
R
F
 
F
G
 
G
K
 
D
K
 
V
K
 
T
V
 
A
V
 
V
G
 
K
D
 
D
V
 
L
S
 
S
I
 
L
T
 
E
L
 
I
Q
 
K
K
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
F
T
 
L
S
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
S
 
R
M
 
M
V
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
E
A
 
P
D
 
T
G
 
R
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
Y
I
 
I
D
 
E
E
 
D
L
 
N
D
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
D
C
 
P
-
 
E
R
 
K
G
 
G
N
 
V
D
 
F
L
 
V
A
 
P
K
 
P
K
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
D
I
 
V
S
 
A
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
S
N
 
Y
H
 
A
I
 
L
T
 
Y
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
Y
D
 
D
L
 
N
V
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
L
S
 
K
Q
 
L
G
 
R
K
 
K
L
 
V
T
 
P
K
 
K
E
 
Q
D
 
E
W
 
I
-
 
D
H
 
K
H
 
R
V
 
V
N
 
R
K
 
E
A
 
V
I
 
A
E
 
E
Y
 
M
M
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
E
M
 
L
Q
 
L
D
 
N
S
 
R
Y
 
K
L
 
P
D
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
L
A
 
G
M
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
I
Q
 
R
D
 
R
T
 
P
E
 
K
Y
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
L
N
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
D
M
 
A
K
 
K
H
 
L
A
 
R
V
 
V
Q
 
K
M
 
M
M
 
R
K
 
A
V
 
E
L
 
L
R
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
Q
D
 
R
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
V
T
 
T
V
 
T
A
 
I
I
 
Y
V
 
V
I
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
V
F
 
E
A
 
A
S
 
M
C
 
T
Y
 
M
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
I
I
 
A
A
 
V
M
 
M
K
 
N
D
 
K
G
 
G
K
 
E
V
 
L
L
 
Q
R
 
Q
E
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
P
K
 
D
E
 
E
I
 
V

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
29% identity, 86% coverage: 9:224/252 of query aligns to 11:226/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
K
 
K
M
 
S
F
|
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
K
 
E
V
|
V
V
 
L
G
 
K
D
 
G
V
 
I
S
 
N
I
 
V
T
 
H
L
 
I
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
V
T
 
V
S
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
S
 
R
M
 
C
V
 
L
S
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
D
A
 
F
D
 
D
G
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
G
L
 
I
D
 
N
I
 
L
A
 
K
R
 
A
-
 
K
-
 
D
C
 
T
R
 
N
G
 
L
N
 
N
D
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
R
N
 
F
H
 
N
I
 
L
T
 
F
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
L
D
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
F
 
L
G
 
A
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
M
S
 
K
Q
 
V
G
 
R
K
 
K
L
 
W
T
 
P
K
 
R
E
 
E
D
 
K
W
 
A
H
 
E
H
 
-
V
 
-
N
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
M
E
 
E
Y
 
L
M
 
L
E
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
G
L
 
L
T
 
K
D
 
D
M
 
K
Q
 
A
D
 
H
S
 
A
Y
 
Y
L
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
T
 
P
E
 
K
Y
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
P
K
 
E
H
 
M
A
 
V
V
 
G
Q
 
E
M
 
V
M
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
M
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
V
 
A
D
 
N
D
 
E
L
 
-
G
 
G
K
 
M
T
 
T
V
 
M
A
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
R
C
 
E
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
L
 
I
R
 
E
E
 
E
G
 
G
E
 
K
T
 
P
K
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
29% identity, 86% coverage: 9:224/252 of query aligns to 11:226/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
K
 
K
M
 
S
F
|
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
K
 
E
V
|
V
V
 
L
G
 
K
D
 
G
V
 
I
S
 
N
I
 
V
T
 
H
L
 
I
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
V
T
 
V
S
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
S
 
R
M
 
C
V
 
L
S
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
D
A
 
F
D
 
D
G
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
G
L
 
I
D
 
N
I
 
L
A
 
K
R
 
A
-
 
K
-
 
D
C
 
T
R
 
N
G
 
L
N
 
N
D
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
R
N
 
F
H
 
N
I
 
L
T
 
F
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
L
D
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
F
 
L
G
 
A
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
M
S
 
K
Q
 
V
G
 
R
K
 
K
L
 
W
T
 
P
K
 
R
E
 
E
D
 
K
W
 
A
H
 
E
H
 
-
V
 
-
N
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
M
E
 
E
Y
 
L
M
 
L
E
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
G
L
 
L
T
 
K
D
 
D
M
 
K
Q
 
A
D
 
H
S
 
A
Y
 
Y
L
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
T
 
P
E
 
K
Y
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
P
K
 
E
H
 
M
A
 
V
V
 
G
Q
 
E
M
 
V
M
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
M
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
V
 
A
D
 
N
D
 
E
L
 
-
G
 
G
K
 
M
T
 
T
V
 
M
A
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
R
C
 
E
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
L
 
I
R
 
E
E
 
E
G
 
G
E
 
K
T
 
P
K
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
29% identity, 86% coverage: 9:224/252 of query aligns to 11:226/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
K
 
K
M
 
S
F
|
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
K
 
E
V
|
V
V
 
L
G
 
K
D
 
G
V
 
I
S
 
N
I
 
V
T
 
H
L
 
I
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
V
T
 
V
S
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
S
 
R
M
 
C
V
 
L
S
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
D
A
 
F
D
 
D
G
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
G
L
 
I
D
 
N
I
 
L
A
 
K
R
 
A
-
 
K
-
 
D
C
 
T
R
 
N
G
 
L
N
 
N
D
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
I
 
V
S
 
G
I
 
M
L
 
V
K
 
F
Q
 
Q
A
 
R
N
 
F
H
 
N
I
 
L
T
 
F
L
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
K
 
L
D
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
F
 
L
G
 
A
R
 
-
F
 
-
P
 
P
Y
 
M
S
 
K
Q
 
V
G
 
R
K
 
K
L
 
W
T
 
P
K
 
R
E
 
E
D
 
K
W
 
A
H
 
E
H
 
-
V
 
-
N
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
M
E
 
E
Y
 
L
M
 
L
E
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
G
L
 
L
T
 
K
D
 
D
M
 
K
Q
 
A
D
 
H
S
 
A
Y
 
Y
L
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
T
 
P
E
 
K
Y
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
P
K
 
E
H
 
M
A
 
V
V
 
G
Q
 
E
M
 
V
M
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
M
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
V
 
A
D
 
N
D
 
E
L
 
-
G
 
G
K
 
M
T
 
T
V<