SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041096374.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041096374.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6rxcD Leishmania major pteridine reductase 1 (lmptr1) in complex with inhibitor 4 (nmt-c0026) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 2:252/256 of 6rxcD

query
sites
6rxcD
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
G
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
G
 
L
A
 
R
V
 
A
D
 
M
T
 
E
A
 
T
A
 
A
W
 
T
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
 
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
L
G
 
G
Y
|
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
G
-
x
L
-
x
S
-
 
V
P
 
L
I
 
V
E
 
V
W
 
W
P
 
E
Q
 
G
N
 
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

6rxcA Leishmania major pteridine reductase 1 (lmptr1) in complex with inhibitor 4 (nmt-c0026) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 2:259/263 of 6rxcA

query
sites
6rxcA
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
R
G
 
E
A
 
A
V
 
M
D
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
T
W
 
-
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
|
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
 
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
|
L
K
 
L
G
 
G
Y
|
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
G
-
x
L
-
x
S
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
P
P
 
P
I
 
A
E
 
V
W
 
W
P
 
E
Q
 
G
N
 
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

7pxxA The crystal structure of leishmania major pteridine reductase 1 in complex with substrate folic acid (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 2:260/264 of 7pxxA

query
sites
7pxxA
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
-
 
L
-
 
R
G
 
E
A
 
A
V
 
M
D
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
T
W
 
-
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
x
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
|
L
K
 
L
G
 
G
Y
|
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
|
G
-
x
L
-
x
S
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
P
P
 
P
I
 
A
E
 
V
W
 
W
P
 
E
Q
 
G
N
x
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

2qhxA Structure of pteridine reductase from leishmania major complexed with a ligand (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 2:260/264 of 2qhxA

query
sites
2qhxA
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
x
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
|
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
-
 
L
-
 
R
G
 
E
A
 
A
V
 
M
D
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
T
W
 
-
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
x
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
x
Q
P
 
P
L
|
L
K
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
G
-
x
L
-
x
S
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
P
P
 
P
I
 
A
E
 
V
W
 
W
P
 
E
Q
 
G
N
 
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

4clhA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
40% identity, 95% coverage: 8:245/250 of query aligns to 3:246/252 of 4clhA

query
sites
4clhA
P
 
P
V
 
A
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
V
S
 
K
L
 
L
H
 
H
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
N
S
|
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
K
A
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
C
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
N
R
 
S
-
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
A
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
A
 
K
V
 
T
D
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
Q
W
 
V
D
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
x
T
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
Q
 
M
A
 
S
A
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
R
L
 
Q
E
 
K
R
 
S
S
 
S
G
 
N
G
 
L
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
L
T
 
C
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
V
E
 
D
R
 
Q
P
 
P
L
x
C
K
 
M
G
 
A
Y
x
F
P
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
A
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
-
 
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
P
|
P
I
 
V
E
 
A
W
 
M
P
 
G
Q
 
E
N
 
E
Q
 
E
H
 
K
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
K
A
x
W
R
 
R
T
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
P
L
 
L
L
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
F
 
S
-
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4cleA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
40% identity, 95% coverage: 8:245/250 of query aligns to 3:246/252 of 4cleA

query
sites
4cleA
P
 
P
V
 
A
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
V
S
 
K
L
 
L
H
 
H
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
H
 
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
N
S
|
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
K
A
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
C
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
N
R
 
S
-
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
A
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
A
 
K
V
 
T
D
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
Q
W
 
V
D
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
x
T
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
Q
 
M
A
 
S
A
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
R
L
 
Q
E
 
K
R
 
S
S
 
S
G
 
N
G
 
L
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
L
T
 
C
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
V
E
 
D
R
 
Q
P
 
P
L
x
C
K
 
M
G
 
A
Y
 
F
P
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
A
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
-
 
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
P
|
P
I
 
V
E
 
A
W
 
M
P
 
G
Q
 
E
N
 
E
Q
 
E
H
 
K
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
K
A
x
W
R
 
R
T
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
P
L
 
L
L
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
F
 
S
-
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5l42A Leishmania major pteridine reductase 1 (ptr1) in complex with compound 3 (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 2:261/265 of 5l42A

query
sites
5l42A
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
L
K
 
R
V
 
R
G
 
E
A
 
A
V
 
M
D
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
T
W
 
-
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
 
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
 
P
G
|
G
-
x
L
-
x
S
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
P
P
 
P
I
 
A
E
 
V
W
 
W
P
 
E
Q
 
G
N
 
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
x
Y
T
 
S

5l4nA Leishmania major pteridine reductase 1 (ptr1) in complex with compound 1 (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 2:250/254 of 5l4nA

query
sites
5l4nA
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
G
 
L
A
 
R
V
 
A
D
 
M
T
 
E
A
 
T
A
 
A
W
 
T
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
 
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
G
P
x
L
I
x
S
E
 
V
W
 
L
P
 
V
Q
 
G
N
 
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

2bfmA Leishmania major pteridine reductase 1 in complex with NADP and trimethoprim (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 1:262/266 of 2bfmA

query
sites
2bfmA
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
 
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
G
 
L
A
 
R
V
 
G
D
 
D
T
 
R
A
 
E
A
 
A
W
 
M
D
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
x
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
|
L
K
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
G
-
x
L
-
x
S
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
P
P
 
P
I
 
A
E
 
V
W
 
W
P
 
E
Q
 
G
N
x
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

7pxxC The crystal structure of leishmania major pteridine reductase 1 in complex with substrate folic acid (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 1:249/253 of 7pxxC

query
sites
7pxxC
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
G
 
L
A
 
R
V
 
A
D
 
M
T
 
E
A
 
T
A
 
A
W
 
T
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
 
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
|
G
P
x
L
I
x
S
E
 
V
W
 
L
P
 
V
Q
 
G
N
 
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

2qhxC Structure of pteridine reductase from leishmania major complexed with a ligand (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 1:250/254 of 2qhxC

query
sites
2qhxC
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
x
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
|
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
G
 
L
A
 
R
V
 
A
D
 
M
T
 
E
A
 
T
A
 
A
W
 
T
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
x
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
x
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
L
G
 
G
Y
|
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
G
P
x
L
I
x
S
E
 
V
W
 
L
P
 
V
Q
 
E
N
 
G
Q
 
H
H
 
R
D
 
S
F
 
K
P
 
V
P
 
P
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

3gn1C Structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor (ddd00067116) (see paper)
41% identity, 95% coverage: 8:245/250 of query aligns to 3:242/248 of 3gn1C

query
sites
3gn1C
P
 
P
V
 
A
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
V
S
 
K
L
 
L
H
 
H
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
N
S
|
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
K
A
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
C
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
N
R
 
S
-
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
A
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
-
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
T
D
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
Q
W
 
V
D
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
x
T
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
Q
 
M
A
 
S
A
 
F
A
 
A
P
 
-
H
 
-
L
 
-
E
 
Q
R
 
R
S
 
Q
G
 
N
G
 
L
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
L
T
x
C
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
V
E
 
D
R
 
Q
P
 
P
L
 
C
K
 
M
G
 
A
Y
 
F
P
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
A
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
-
x
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
P
 
P
I
 
V
E
 
A
W
 
M
P
 
G
Q
 
E
N
 
E
Q
 
E
H
 
K
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
K
A
 
W
R
 
R
T
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
P
L
 
L
L
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
F
 
S
-
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1p33B Pteridine reductase from leishmania tarentolae complex with NADPH and mtx (see paper)
40% identity, 97% coverage: 4:245/250 of query aligns to 1:263/269 of 1p33B

query
sites
1p33B
S
 
S
P
 
P
R
 
T
L
 
A
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
S
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
A
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
 
H
C
 
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
E
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
R
L
 
C
P
 
S
G
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
D
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
M
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
R
K
 
K
V
 
K
G
 
E
A
 
S
V
 
L
D
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
A
W
 
-
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
R
L
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
R
-
 
A
E
 
E
R
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
T
-
 
S
-
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
T
x
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
S
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
L
G
 
G
Y
|
Y
P
 
T
L
 
M
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
E
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
S
P
 
P
G
|
G
P
x
L
I
x
S
E
x
V
W
 
L
P
|
P
Q
 
D
N
 
D
Q
x
M
-
 
P
H
 
F
D
 
S
F
 
V
P
 
Q
P
 
E
D
 
D
A
 
Y
R
 
R
T
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
P
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
N
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
-
 
P
D
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3jq7C Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor 6- phenylpteridine-2,4,7-triamine (dx2) (see paper)
41% identity, 95% coverage: 8:245/250 of query aligns to 2:233/239 of 3jq7C

query
sites
3jq7C
P
 
P
V
 
A
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
V
S
 
K
L
 
L
H
 
H
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
H
 
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
N
S
|
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
K
A
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
C
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
N
R
 
S
-
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
A
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
-
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
T
D
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
Q
W
 
V
D
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
x
T
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
Q
 
M
A
 
S
A
 
F
A
 
A
P
 
-
H
 
-
L
 
-
E
 
Q
R
 
R
S
 
Q
G
 
N
G
 
L
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
L
T
x
C
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
V
E
 
D
R
 
Q
P
 
P
L
 
C
K
 
M
G
 
A
Y
 
F
P
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
A
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
|
G
P
x
V
I
x
S
E
x
L
W
x
L
P
|
P
Q
 
D
N
 
K
Q
 
W
H
 
R
D
 
R
F
 
K
P
 
V
P
 
P
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
F
 
S
-
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1e7wA One active site, two modes of reduction correlate the mechanism of leishmania pteridine reductase with pterin metabolism and antifolate drug resistance in trpanosomes (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 2:263/267 of 1e7wA

query
sites
1e7wA
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
G
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
-
 
L
-
 
R
G
 
E
A
 
A
V
 
M
D
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
T
W
 
-
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
 
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
|
L
K
 
L
G
 
G
Y
|
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
G
-
x
L
-
x
S
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
x
D
-
x
M
-
 
P
P
 
P
I
 
A
E
 
V
W
 
W
P
 
E
Q
 
G
N
 
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

3jq8A Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor 6,7,7- trimethyl-7,8-dihydropteridine-2,4-diamine (dx3) (see paper)
41% identity, 95% coverage: 8:245/250 of query aligns to 3:242/248 of 3jq8A

query
sites
3jq8A
P
 
P
V
 
A
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
V
S
 
K
L
 
L
H
 
H
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
H
|
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
N
S
|
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
K
A
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
C
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
N
R
 
S
-
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
A
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
-
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
T
D
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
Q
W
 
V
D
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
x
T
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
Q
 
M
A
 
S
A
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
R
L
 
-
E
 
-
R
 
Q
S
 
S
G
 
N
G
 
L
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
L
T
x
C
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
V
E
 
D
R
 
Q
P
 
P
L
 
C
K
 
M
G
 
A
Y
 
F
P
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
A
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
V
I
x
S
E
 
L
W
 
L
P
 
P
Q
 
A
N
 
M
Q
 
G
H
 
E
D
 
E
F
 
E
P
 
K
P
 
D
D
 
K
A
 
W
R
 
R
T
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
P
L
 
L
L
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
F
 
S
-
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2bfpA Leishmania major pteridine reductase 1 in complex with NADP and tetrahydrobiopterin (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 1:263/267 of 2bfpA

query
sites
2bfpA
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
L
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
L
H
 
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
R
S
|
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
P
D
 
N
S
 
S
A
 
A
A
 
I
V
 
T
F
 
V
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
S
D
 
N
S
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
C
V
 
Y
A
 
T
R
 
H
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
V
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
D
-
 
R
G
 
E
A
 
A
V
 
M
D
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
T
W
 
-
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
P
 
P
H
 
A
L
 
K
E
 
H
R
 
R
-
 
G
S
 
T
G
 
N
G
 
Y
C
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
T
 
V
D
|
D
I
 
A
H
 
M
A
 
T
E
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
K
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
T
L
 
I
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
G
-
x
L
-
x
S
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
P
P
 
P
I
 
A
E
 
V
W
 
W
P
 
E
Q
 
G
N
 
H
Q
 
R
H
 
S
D
 
K
F
 
V
P
 
P
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
I
 
D
G
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
S
R
 
D
T
 
V
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
C
F
 
S
D
 
S
-
 
K
A
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
I
 
V
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
S

4cmiA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
41% identity, 95% coverage: 8:245/250 of query aligns to 3:244/250 of 4cmiA

query
sites
4cmiA
P
 
P
V
 
A
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
V
S
 
K
L
 
L
H
 
H
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
H
 
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
N
S
|
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
K
A
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
|
L
L
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
C
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
N
R
 
S
-
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
S
 
A
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
-
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
T
D
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
Q
W
 
V
D
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
x
T
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
Q
 
M
A
 
S
A
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
R
L
 
-
E
 
Q
R
 
S
S
 
S
G
 
N
G
 
L
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
L
T
x
C
D
|
D
I
 
A
H
x
M
A
 
V
E
 
D
R
 
Q
P
 
P
L
x
C
K
 
M
G
 
A
Y
 
F
P
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
A
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
-
 
V
-
x
S
-
 
L
-
x
L
P
|
P
I
 
V
E
 
A
W
 
M
P
 
G
Q
 
E
N
 
E
Q
 
E
H
 
K
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
K
A
 
W
R
 
R
T
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
P
L
 
L
L
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
F
 
S
-
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4cmgA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
41% identity, 95% coverage: 8:245/250 of query aligns to 3:244/250 of 4cmgA

query
sites
4cmgA
P
 
P
V
 
A
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
V
S
 
K
L
 
L
H
 
H
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
H
 
H
C
x
Y
R
x
H
S
x
N
S
|
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
K
A
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
C
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
N
R
 
S
-
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
A
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
-
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
T
D
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
Q
W
 
V
D
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
x
T
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
Q
 
M
A
 
S
A
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
R
L
 
-
E
 
Q
R
 
S
S
 
S
G
 
N
G
 
L
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
L
T
x
C
D
|
D
I
 
A
H
x
M
A
 
V
E
 
D
R
 
Q
P
 
P
L
x
C
K
 
M
G
 
A
Y
 
F
P
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
A
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
-
x
V
-
x
S
-
 
L
-
x
L
P
 
P
I
 
V
E
 
A
W
x
M
P
 
G
Q
 
E
N
 
E
Q
 
E
H
 
K
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
K
A
x
W
R
 
R
T
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
P
L
 
L
L
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
F
 
S
-
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4cmaA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
41% identity, 95% coverage: 8:245/250 of query aligns to 3:244/250 of 4cmaA

query
sites
4cmaA
P
 
P
V
 
A
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
V
S
 
K
L
 
L
H
 
H
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
H
 
H
C
 
Y
R
x
H
S
x
N
S
|
S
V
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
K
A
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
A
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
T
D
 
N
S
 
S
A
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
C
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
N
R
 
S
-
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
S
 
A
F
|
F
F
 
Y
A
 
P
T
 
T
K
 
P
-
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
T
D
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
Q
W
 
V
D
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
x
T
N
 
N
L
 
A
K
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
F
F
 
L
L
 
L
S
 
T
Q
 
M
A
 
S
A
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
R
L
 
-
E
 
Q
R
 
S
S
 
S
G
 
N
G
 
L
C
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
L
T
 
C
D
|
D
I
 
A
H
x
M
A
 
V
E
 
D
R
 
Q
P
 
P
L
x
C
K
 
M
G
 
A
Y
 
F
P
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
A
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
Y
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
-
x
V
-
x
S
-
 
L
-
x
L
P
 
P
I
 
V
E
 
A
W
 
M
P
 
G
Q
 
E
N
 
E
Q
 
E
H
 
K
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
K
A
 
W
R
 
R
T
 
R
A
 
K
I
 
V
I
 
-
E
 
-
H
 
-
T
 
P
L
 
L
L
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
K
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
F
 
S
-
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_041096374.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041096374.1
MTNSPRLPVVLVTGAARRVGAEIARSLHAAGARVAIHCRSSVAEAEALAAELNGARADSA
AVFAADLLDSAALPGLVESVVARFGRLDALVNNASSFFATKVGAVDTAAWDDLIGSNLKA
PLFLSQAAAPHLERSGGCIVNITDIHAERPLKGYPLYCAAKAGLLGLSRALALELGPRVR
VNAVAPGPIEWPQNQHDFPPDARTAIIEHTLLKRIGSPADIARTVKFLVFDAPYVTGQVI
NVDGGRTAHL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory