SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041100171.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041100171.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
55% identity, 95% coverage: 7:264/271 of query aligns to 4:261/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
V
 
V
E
 
E
I
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
N
 
T
F
 
F
T
 
K
Y
x
R
D
 
G
S
 
S
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
F
T
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
D
M
 
V
T
 
R
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
G
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
A
G
 
S
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
P
 
P
T
 
S
S
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
W
V
 
V
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
N
V
 
L
H
 
P
E
 
Q
L
 
L
G
 
S
S
 
R
D
 
G
G
 
D
L
 
L
Y
 
F
G
 
D
L
 
M
R
 
R
R
 
K
R
 
Q
M
 
F
G
 
G
M
 
V
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
T
D
 
D
M
 
L
S
 
D
V
 
V
Y
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
P
M
 
L
R
 
R
E
 
V
H
 
H
T
 
T
N
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
M
 
M
K
 
K
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
V
D
 
E
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
K
R
 
R
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
M
 
Q
L
 
I
I
 
L
M
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
S
 
A
L
 
M
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
V
E
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
L
L
 
L
T
 
N
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
L
Q
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
A
K
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
F
 
I
V
 
V
S
 
G
E
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
V
V
 
L
A
 
G
E
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
D
E
 
V
M
 
L
K
 
K
H
 
E
S
 
T
T
 
D
V
 
D
P
 
P
Y
 
R
V
 
I
H
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
V
W
 
K
G
 
G
E
 
I
A
 
P
D
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
F
Q
 
H
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
R
 
R
P
 
D
Y
 
Y
G
 
R
E
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
L

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
56% identity, 94% coverage: 4:259/271 of query aligns to 2:257/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
V
R
 
K
D
 
N
L
 
L
N
 
S
F
 
F
T
 
N
Y
 
R
D
 
G
S
 
E
R
 
R
P
 
V
I
 
I
L
 
Y
T
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
T
 
N
I
 
I
P
 
R
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
V
 
T
A
 
A
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
 
G
C
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
L
V
 
L
G
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
D
V
 
I
H
 
A
E
 
Q
L
 
M
G
 
S
S
 
R
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
Y
 
F
G
 
A
L
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
R
M
 
M
G
 
G
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
T
D
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
P
M
 
I
R
 
R
E
 
A
H
 
H
T
 
T
N
 
K
L
 
L
P
 
S
E
 
E
A
 
N
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
M
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
L
H
 
E
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
T
H
 
E
D
 
Q
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
T
E
|
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
|
M
A
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
M
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
S
 
V
L
 
K
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
T
E
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
S
L
 
L
T
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
L
S
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
I
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
V
Q
 
P
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
F
 
V
V
 
V
S
 
A
E
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
H
 
A
S
 
Y
T
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
F
V
 
V
H
 
K
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
W
 
T
G
 
G
E
 
S
A
 
A
D
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
E
F
 
Y
Q
 
Q
Y
 
F
P
 
S
S
 
H
R
 
Q
P
 
A
Y
 
Y

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
56% identity, 94% coverage: 4:259/271 of query aligns to 2:257/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
V
R
 
K
D
 
N
L
 
L
N
 
S
F
 
F
T
 
N
Y
x
R
D
 
G
S
 
E
R
|
R
P
 
V
I
 
I
L
 
Y
T
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
T
 
N
I
 
I
P
 
R
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
V
 
T
A
 
A
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
C
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
L
V
 
L
G
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
D
V
 
I
H
 
A
E
 
Q
L
 
M
G
 
S
S
 
R
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
Y
 
F
G
 
A
L
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
R
M
 
M
G
 
G
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
T
D
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
P
M
 
I
R
 
R
E
 
A
H
 
H
T
 
T
N
 
K
L
 
L
P
 
S
E
 
E
A
 
N
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
M
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
L
H
 
E
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
T
H
 
E
D
 
Q
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
M
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
S
 
V
L
 
K
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
T
E
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
S
L
 
L
T
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
L
S
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
I
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
V
Q
 
P
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
F
 
V
V
 
V
S
 
A
E
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
H
 
A
S
 
Y
T
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
F
V
 
V
H
 
K
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
W
 
T
G
 
G
E
 
S
A
 
A
D
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
E
F
 
Y
Q
 
Q
Y
 
F
P
 
S
S
 
H
R
 
Q
P
 
A
Y
 
Y

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
57% identity, 92% coverage: 5:254/271 of query aligns to 1:250/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
S
 
S
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
V
R
 
K
D
 
N
L
 
L
N
 
S
F
 
F
T
 
N
Y
x
R
D
 
G
S
 
E
R
 
R
P
 
V
I
 
I
L
 
Y
T
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
T
 
N
I
 
I
P
 
R
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
V
 
T
A
 
A
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
C
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
L
V
 
L
G
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
D
V
 
I
H
 
A
E
 
Q
L
 
M
G
 
S
S
 
R
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
Y
 
F
G
 
A
L
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
R
M
 
M
G
 
G
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
|
Q
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
T
D
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
P
M
 
I
R
 
R
E
 
A
H
 
H
T
 
T
N
 
K
L
 
L
P
 
S
E
 
E
A
 
N
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
M
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
L
H
 
E
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
T
H
 
E
D
 
Q
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
M
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
S
 
V
L
 
K
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
T
E
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
S
L
 
L
T
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
L
S
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
I
V
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
D
V
 
V
Q
 
P
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
F
 
V
V
 
V
S
 
A
E
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
H
 
A
S
 
Y
T
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
F
V
 
V
H
 
K
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
W
 
T
G
 
G
E
 
S
A
 
A
D
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
E
F
 
Y
Q
 
Q
Y
 
F

7ch8I Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with adp-v (see paper)
55% identity, 95% coverage: 7:264/271 of query aligns to 4:258/259 of 7ch8I

query
sites
7ch8I
V
 
V
E
 
E
I
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
N
 
T
F
 
F
T
 
K
Y
x
R
D
 
G
S
 
S
R
|
R
P
 
A
I
 
I
L
 
F
T
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
D
M
 
V
T
 
R
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
G
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
|
S
S
 
-
G
 
G
C
 
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
A
G
 
S
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
P
 
P
T
 
S
S
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
W
V
 
V
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
N
V
 
L
H
 
P
E
 
Q
L
 
L
G
 
S
S
 
R
D
 
G
G
 
D
L
 
L
Y
 
F
G
 
D
L
 
M
R
 
R
R
 
K
R
 
Q
M
 
F
G
 
G
M
 
V
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
T
D
 
D
M
 
L
S
 
D
V
 
V
Y
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
P
M
 
L
R
 
R
E
 
V
H
 
H
T
 
T
N
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
M
 
M
K
 
K
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
V
D
 
E
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
K
R
 
R
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
M
 
Q
L
 
I
I
 
L
M
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
-
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
-
D
 
Q
P
 
P
I
 
I
S
 
A
L
 
M
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
V
E
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
L
L
 
L
T
 
N
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
L
Q
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
A
K
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
F
 
I
V
 
V
S
 
G
E
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
V
V
 
L
A
 
G
E
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
D
E
 
V
M
 
L
K
 
K
H
 
E
S
 
T
T
 
D
V
 
D
P
 
P
Y
 
R
V
 
I
H
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
V
W
 
K
G
 
G
E
 
I
A
 
P
D
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
F
Q
 
H
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
R
 
R
P
 
D
Y
 
Y
G
 
R
E
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
L

7ch6C Cryo-em structure of e.Coli mlafeb with amppnp (see paper)
54% identity, 97% coverage: 5:267/271 of query aligns to 3:265/265 of 7ch6C

query
sites
7ch6C
S
 
N
L
 
L
V
 
V
E
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
N
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
x
R
D
 
G
S
 
N
R
|
R
P
 
C
I
 
I
L
 
F
T
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
T
 
T
I
 
V
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
I
V
 
T
A
 
A
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
C
 
I
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
 
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
K
 
A
P
 
P
T
 
D
S
 
H
G
 
G
E
 
E
V
 
I
R
 
L
V
 
F
G
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
N
V
 
I
H
 
P
E
 
A
L
 
M
G
 
S
S
 
R
D
 
S
G
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
T
L
 
V
R
 
R
R
 
K
R
 
R
M
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
T
D
 
D
M
 
M
S
 
N
V
 
V
Y
 
F
D
 
D
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
Y
Q
 
P
M
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
T
 
T
N
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
P
L
 
L
I
 
L
R
 
H
D
 
S
L
 
T
V
 
V
M
 
M
M
 
M
K
 
K
L
 
L
H
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
A
D
 
K
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
E
P
 
P
M
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
Y
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
S
 
T
L
 
M
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
V
E
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
S
K
 
E
L
 
L
T
 
N
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
S
 
C
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
V
Q
 
P
E
 
E
S
 
V
L
 
L
K
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
H
V
 
A
Y
 
W
F
 
I
V
 
L
S
 
A
E
 
D
G
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
M
 
L
K
 
Q
H
 
A
S
 
N
T
 
P
V
 
D
P
 
P
Y
 
R
V
 
V
H
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
W
 
D
G
 
G
E
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
F
Q
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
R
 
G
P
 
D
Y
 
Y
G
 
H
E
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
P
G
 
G
A
 
S

6xgyA Crystal structure of e. Coli mlafb abc transport subunits in the dimeric state (see paper)
55% identity, 97% coverage: 5:266/271 of query aligns to 3:264/264 of 6xgyA

query
sites
6xgyA
S
 
N
L
 
L
V
 
V
E
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
N
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
x
R
D
 
G
S
 
N
R
 
R
P
 
C
I
 
I
L
 
F
T
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
T
 
T
I
 
V
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
I
V
 
T
A
 
A
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
C
 
I
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
K
 
A
P
 
P
T
 
D
S
 
H
G
 
G
E
 
E
V
 
I
R
 
L
V
 
F
G
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
N
V
 
I
H
 
P
E
 
A
L
 
M
G
 
S
S
 
R
D
 
S
G
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
T
L
 
V
R
 
R
R
 
K
R
 
R
M
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
T
D
 
D
M
 
M
S
 
N
V
 
V
Y
 
F
D
 
D
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
Y
Q
 
P
M
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
T
 
T
N
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
P
L
 
L
I
 
L
R
 
H
D
 
S
L
 
T
V
 
V
M
 
M
M
 
M
K
 
K
L
 
L
H
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
A
D
 
K
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
E
P
 
P
M
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
Y
 
F
D
|
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
S
 
T
L
 
M
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
V
E
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
S
K
 
E
L
 
L
T
 
N
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
S
 
C
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
V
Q
 
P
E
 
E
S
 
V
L
 
L
K
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
H
V
 
A
Y
 
W
F
 
I
V
 
L
S
 
A
E
 
D
G
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
M
 
L
K
 
Q
H
 
A
S
 
N
T
 
P
V
 
D
P
 
P
Y
 
R
V
 
V
H
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
W
 
D
G
 
G
E
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
F
Q
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
R
 
G
P
 
D
Y
 
Y
G
 
H
E
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
P
G
 
G

7cgnB The overall structure of the mlafedb complex in atp-bound eqtall conformation (mutation of e170q on mlaf) (see paper)
54% identity, 96% coverage: 5:264/271 of query aligns to 3:262/263 of 7cgnB

query
sites
7cgnB
S
 
N
L
 
L
V
 
V
E
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
N
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
x
R
D
 
G
S
 
N
R
 
R
P
 
C
I
 
I
L
 
F
T
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
S
M
 
L
T
 
T
I
 
V
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
I
V
 
T
A
 
A
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
C
x
I
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
K
 
A
P
 
P
T
 
D
S
 
H
G
 
G
E
 
E
V
 
I
R
 
L
V
 
F
G
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
N
V
 
I
H
 
P
E
 
A
L
 
M
G
 
S
S
 
R
D
 
S
G
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
T
L
 
V
R
 
R
R
 
K
R
 
R
M
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
T
D
 
D
M
 
M
S
 
N
V
 
V
Y
 
F
D
 
D
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
Y
Q
 
P
M
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
T
 
T
N
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
P
L
 
L
I
 
L
R
 
H
D
 
S
L
 
T
V
 
V
M
 
M
M
 
M
K
 
K
L
 
L
H
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
A
D
 
K
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
E
P
 
P
M
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
M
Y
 
F
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
S
 
T
L
 
M
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
V
E
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
S
K
 
E
L
 
L
T
 
N
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
S
 
C
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
V
Q
 
P
E
 
E
S
 
V
L
 
L
K
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
D
Y
 
H
V
 
A
Y
 
W
F
 
I
V
 
L
S
 
A
E
 
D
G
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
M
 
L
K
 
Q
H
 
A
S
 
N
T
 
P
V
 
D
P
 
P
Y
 
R
V
 
V
H
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
W
 
D
G
 
G
E
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
F
Q
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
R
 
G
P
 
D
Y
 
Y
G
 
H
E
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
L

Q9AT00 Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic; ABC transporter I family member 13; ABC transporter ABCI.13; AtABCI13; Non-intrinsic ABC protein 11; AtNAP11 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
42% identity, 91% coverage: 6:252/271 of query aligns to 84:345/345 of Q9AT00

query
sites
Q9AT00
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
C
R
 
R
D
 
D
L
 
V
N
 
Y
F
 
K
T
 
S
Y
x
F
D
 
G
S
 
E
R
 
K
P
 
H
I
 
I
L
 
L
T
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
S
M
 
F
T
 
K
I
 
I
P
 
R
R
 
H
G
 
G
K
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
G
V
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
 
G
C
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
T
 
I
L
 
L
R
 
K
L
 
I
I
 
M
G
 
A
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
K
 
A
P
 
P
T
 
D
S
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
Y
V
 
I
G
 
R
G
 
G
Q
 
K
V
 
K
V
 
R
H
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
I
S
 
S
D
 
D
G
 
E
-
 
E
L
 
I
Y
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
-
R
 
-
M
 
I
G
 
G
M
 
L
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
D
D
 
S
M
 
L
S
 
S
V
 
V
Y
 
R
D
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
G
F
 
F
Q
 
L
M
 
L
R
 
Y
E
 
E
H
 
R
T
 
S
N
 
K
L
 
M
P
 
S
E
 
E
A
 
N
L
 
Q
I
 
I
R
 
S
D
 
E
L
 
L
V
 
V
M
 
T
M
 
Q
K
 
T
L
 
L
H
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
V
H
 
E
D
 
N
L
 
R
M
 
L
P
 
P
A
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
K
R
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
S
I
 
L
A
 
I
L
 
F
D
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
E
P
 
P
M
 
E
L
 
V
I
 
L
M
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
I
S
 
A
L
 
S
S
 
T
I
 
V
V
 
V
G
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
S
L
 
V
-
 
H
-
 
M
-
 
T
-
 
D
T
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
K
-
 
I
A
 
A
S
 
S
S
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
Q
V
 
H
Q
 
S
E
 
T
S
 
I
L
 
Q
K
 
R
I
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
R
V
 
L
Y
 
L
F
 
F
V
 
L
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
W
E
 
Q
G
 
G
T
 
M
A
 
T
E
 
H
E
 
E
M
 
F
K
 
T
H
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
N
P
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
I
 
A
W
 
T
G
 
G
E
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
R
F
 
Y

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
33% identity, 89% coverage: 22:261/271 of query aligns to 21:260/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
L
T
 
N
G
 
N
I
 
V
N
 
S
M
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
T
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
I
 
V
G
 
N
G
 
L
Q
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
R
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
E
V
 
L
H
 
T
E
 
T
L
 
L
G
 
S
S
 
E
D
 
S
G
 
E
L
 
L
Y
 
T
G
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
M
 
I
G
 
G
M
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
F
 
H
G
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
L
T
 
S
D
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
Y
 
F
D
 
G
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
L
Q
 
P
M
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
L
T
 
D
N
 
N
L
 
T
P
 
P
E
 
K
A
 
D
L
 
E
I
 
V
R
 
K
D
 
R
L
 
R
V
 
V
M
 
T
M
 
E
K
 
L
L
 
L
H
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
G
G
 
D
A
 
K
H
 
H
D
 
D
L
 
S
M
 
Y
P
 
P
A
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
A
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
S
D
 
N
P
 
P
M
 
K
L
 
V
I
 
L
M
 
L
Y
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
F
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
A
S
 
T
L
 
T
S
 
R
I
 
S
V
 
I
G
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
K
K
 
D
L
 
I
T
 
N
D
 
R
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
T
S
 
I
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
Q
 
D
E
 
V
S
 
V
L
 
K
K
 
R
I
 
I
V
 
C
D
 
D
Y
 
C
V
 
V
Y
 
A
F
 
V
V
 
I
S
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
T
 
T
A
 
V
E
 
S
E
 
E
M
 
V
-
 
F
K
 
S
H
 
H
S
 
P
T
 
K
V
 
T
P
 
P
Y
 
L
V
 
A
H
 
Q
Q
 
K
F
 
F
I
 
I
W
 
Q
G
 
S
E
 
T
A
 
L
D
 
H
G
 
L
P
 
D
V
 
I
P
 
P
F
 
E
Q
 
D
Y
 
Y
P
 
Q
S
 
E
R
 
R
P
 
L
Y
 
Q
G
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
32% identity, 89% coverage: 22:261/271 of query aligns to 22:261/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
L
T
 
N
G
 
N
I
 
V
N
 
S
M
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
A
S
 
S
G
|
G
C
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
T
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
I
 
V
G
 
N
G
 
L
Q
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
R
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
E
V
 
L
H
 
T
E
 
T
L
 
L
G
 
S
S
 
E
D
 
S
G
 
E
L
 
L
Y
 
T
G
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
M
 
I
G
 
G
M
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
F
 
H
G
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
L
T
 
S
D
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
Y
 
F
D
 
G
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
L
Q
 
P
M
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
L
T
 
D
N
 
N
L
 
T
P
 
P
E
 
K
A
 
D
L
 
E
I
 
V
R
 
K
D
 
R
L
 
R
V
 
V
M
 
T
M
 
E
K
 
L
L
 
L
H
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
G
G
 
D
A
 
K
H
 
H
D
 
D
L
 
S
M
 
Y
P
 
P
A
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
A
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
S
D
 
N
P
 
P
M
 
K
L
 
V
I
 
L
M
 
L
Y
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
F
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
A
S
 
T
L
 
T
S
 
R
I
 
S
V
 
I
G
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
K
K
 
D
L
 
I
T
 
N
D
 
R
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
T
S
 
I
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
Q
 
D
E
 
V
S
 
V
L
 
K
K
 
R
I
 
I
V
 
C
D
 
D
Y
 
C
V
 
V
Y
 
A
F
 
V
V
 
I
S
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
T
 
T
A
 
V
E
 
S
E
 
E
M
 
V
-
 
F
K
 
S
H
 
H
S
 
P
T
 
K
V
 
T
P
 
P
Y
 
L
V
 
A
H
 
Q
Q
 
K
F
 
F
I
 
I
W
 
Q
G
 
S
E
 
T
A
 
L
D
 
H
G
 
L
P
 
D
V
 
I
P
 
P
F
 
E
Q
 
D
Y
 
Y
P
 
Q
S
 
E
R
 
R
P
 
L
Y
 
Q
G
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
32% identity, 89% coverage: 22:261/271 of query aligns to 22:261/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
L
T
 
N
G
 
N
I
 
V
N
 
S
M
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
A
S
 
S
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
T
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
I
 
V
G
 
N
G
 
L
Q
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
R
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
E
V
 
L
H
 
T
E
 
T
L
 
L
G
 
S
S
 
E
D
 
S
G
 
E
L
 
L
Y
 
T
G
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
M
 
I
G
 
G
M
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
F
 
H
G
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
L
T
 
S
D
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
Y
 
F
D
 
G
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
L
Q
 
P
M
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
L
T
 
D
N
 
N
L
 
T
P
 
P
E
 
K
A
 
D
L
 
E
I
 
V
R
 
K
D
 
R
L
 
R
V
 
V
M
 
T
M
 
E
K
 
L
L
 
L
H
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
G
G
 
D
A
 
K
H
 
H
D
 
D
L
 
S
M
 
Y
P
 
P
A
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
A
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
S
D
 
N
P
 
P
M
 
K
L
 
V
I
 
L
M
 
L
Y
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
F
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
A
S
 
T
L
 
T
S
 
R
I
 
S
V
 
I
G
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
K
K
 
D
L
 
I
T
 
N
D
 
R
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
T
S
 
I
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
Q
 
D
E
 
V
S
 
V
L
 
K
K
 
R
I
 
I
V
 
C
D
 
D
Y
 
C
V
 
V
Y
 
A
F
 
V
V
 
I
S
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
T
 
T
A
 
V
E
 
S
E
 
E
M
 
V
-
 
F
K
 
S
H
 
H
S
 
P
T
 
K
V
 
T
P
 
P
Y
 
L
V
 
A
H
 
Q
Q
 
K
F
 
F
I
 
I
W
 
Q
G
 
S
E
 
T
A
 
L
D
 
H
G
 
L
P
 
D
V
 
I
P
 
P
F
 
E
Q
 
D
Y
 
Y
P
 
Q
S
 
E
R
 
R
P
 
L
Y
 
Q
G
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
32% identity, 89% coverage: 22:261/271 of query aligns to 22:261/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
L
T
 
N
G
 
N
I
 
V
N
 
S
M
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
T
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
I
 
V
G
 
N
G
 
L
Q
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
R
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
E
V
 
L
H
 
T
E
 
T
L
 
L
G
 
S
S
 
E
D
 
S
G
 
E
L
 
L
Y
 
T
G
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
M
 
I
G
 
G
M
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
F
 
H
G
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
L
T
 
S
D
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
Y
 
F
D
 
G
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
L
Q
 
P
M
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
L
T
 
D
N
 
N
L
 
T
P
 
P
E
 
K
A
 
D
L
 
E
I
 
V
R
 
K
D
 
R
L
 
R
V
 
V
M
 
T
M
 
E
K
 
L
L
 
L
H
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
G
G
 
D
A
 
K
H
 
H
D
 
D
L
 
S
M
 
Y
P
 
P
A
 
S
E
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
x
Q
A
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
S
D
 
N
P
 
P
M
 
K
L
 
V
I
 
L
M
 
L
Y
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
F
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
A
S
 
T
L
 
T
S
 
R
I
 
S
V
 
I
G
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
K
K
 
D
L
 
I
T
 
N
D
 
R
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
T
S
 
I
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
|
H
D
 
E
V
 
M
Q
 
D
E
 
V
S
 
V
L
 
K
K
 
R
I
 
I
V
 
C
D
 
D
Y
 
C
V
 
V
Y
 
A
F
 
V
V
 
I
S
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
T
 
T
A
 
V
E
 
S
E
 
E
M
 
V
-
 
F
K
 
S
H
 
H
S
 
P
T
 
K
V
 
T
P
 
P
Y
 
L
V
 
A
H
 
Q
Q
 
K
F
 
F
I
 
I
W
 
Q
G
 
S
E
 
T
A
 
L
D
 
H
G
 
L
P
 
D
V
 
I
P
 
P
F
 
E
Q
 
D
Y
 
Y
P
 
Q
S
 
E
R
 
R
P
 
L
Y
 
Q
G
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
35% identity, 82% coverage: 26:248/271 of query aligns to 46:269/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
N
 
N
M
 
F
T
 
E
I
 
I
P
 
N
R
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
I
V
 
F
A
 
V
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
L
S
 
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
N
G
 
R
Q
 
L
L
 
I
K
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
I
R
 
F
V
 
I
G
 
D
G
 
N
Q
 
Q
V
 
D
V
 
V
H
 
A
E
 
T
L
 
L
G
 
N
S
 
K
D
 
E
G
 
D
L
 
L
Y
 
L
G
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
K
-
 
T
M
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
F
 
N
G
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
F
T
 
P
D
 
H
M
 
R
S
 
T
V
 
I
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
T
A
 
E
F
 
Y
Q
 
G
M
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
V
T
 
Q
N
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
K
A
 
E
L
 
E
I
 
R
R
 
R
D
 
K
L
 
R
V
 
A
M
 
E
M
 
K
K
 
A
L
 
L
H
 
D
A
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
R
 
L
G
 
D
A
 
F
H
 
K
D
 
D
L
 
Q
M
 
Y
P
 
P
A
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
N
D
 
D
P
 
P
M
 
E
L
 
I
I
 
L
M
 
L
Y
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
F
 
F
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
L
S
 
I
L
 
R
S
 
R
I
 
E
V
 
M
G
 
Q
E
 
D
L
 
E
I
 
L
R
 
L
K
 
E
L
 
L
T
 
Q
D
 
A
A
 
K
L
 
F
G
 
Q
A
 
K
S
 
T
S
 
I
I
 
I
V
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
L
Q
 
N
E
 
E
S
 
A
L
 
L
K
 
R
I
 
I
V
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
Y
 
A
F
 
I
V
 
M
S
 
K
E
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
Q
E
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
I
M
 
L
K
 
T
H
 
N
S
 
P
T
 
A
V
 
N
P
 
D
Y
 
Y
V
 
V
H
 
K
Q
 
T
F
 
F
I
 
V
W
 
E
G
 
D
E
 
T
A
 
A
D
 
E
G
 
N

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
35% identity, 82% coverage: 26:248/271 of query aligns to 46:269/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
N
 
N
M
 
F
T
 
E
I
 
I
P
 
N
R
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
I
V
 
F
A
 
V
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
L
S
 
S
G
 
G
C
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
N
G
 
R
Q
 
L
L
 
I
K
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
I
R
 
F
V
 
I
G
 
D
G
 
N
Q
 
Q
V
 
D
V
 
V
H
 
A
E
 
T
L
 
L
G
 
N
S
 
K
D
 
E
G
 
D
L
 
L
Y
 
L
G
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
K
-
 
T
M
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
F
 
N
G
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
F
T
 
P
D
 
H
M
 
R
S
 
T
V
 
I
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
T
A
 
E
F
 
Y
Q
 
G
M
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
V
T
 
Q
N
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
K
A
 
E
L
 
E
I
 
R
R
 
R
D
 
K
L
 
R
V
 
A
M
 
E
M
 
K
K
 
A
L
 
L
H
 
D
A
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
R
 
L
G
 
D
A
 
F
H
 
K
D
 
D
L
 
Q
M
 
Y
P
 
P
A
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
N
D
 
D
P
 
P
M
 
E
L
 
I
I
 
L
M
 
L
Y
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
F
 
F
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
L
S
 
I
L
 
R
S
 
R
I
 
E
V
 
M
G
 
Q
E
 
D
L
 
E
I
 
L
R
 
L
K
 
E
L
 
L
T
 
Q
D
 
A
A
 
K
L
 
F
G
 
Q
A
 
K
S
 
T
S
 
I
I
 
I
V
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
L
Q
 
N
E
 
E
S
 
A
L
 
L
K
 
R
I
 
I
V
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
Y
 
A
F
 
I
V
 
M
S
 
K
E
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
Q
E
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
I
M
 
L
K
 
T
H
 
N
S
 
P
T
 
A
V
 
N
P
 
D
Y
 
Y
V
 
V
H
 
K
Q
 
T
F
 
F
I
 
V
W
 
E
G
 
D
E
 
T
A
 
A
D
 
E
G
 
N

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
33% identity, 83% coverage: 6:230/271 of query aligns to 1:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
M
V
 
I
E
 
F
I
 
V
R
 
N
D
 
D
L
 
V
N
 
Y
F
 
K
T
 
N
Y
x
F
D
 
G
S
 
S
R
 
L
P
 
E
I
x
V
L
 
L
T
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
T
M
 
L
T
 
K
I
 
V
P
 
N
R
 
K
G
 
G
K
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
I
M
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
C
I
 
I
G
 
N
G
 
L
Q
 
L
L
 
E
K
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
F
V
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
K
V
 
I
H
 
N
E
 
N
L
 
-
G
 
G
S
 
K
D
 
V
G
 
N
L
 
I
Y
 
N
G
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
R
 
K
M
 
V
G
 
G
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
F
 
H
G
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
T
 
P
D
 
H
M
 
L
S
 
T
V
 
A
Y
 
I
D
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
T
F
 
L
Q
 
A
M
 
P
R
 
V
E
 
K
H
 
V
T
 
K
N
 
K
L
 
M
P
 
N
E
 
K
A
 
K
L
 
E
I
 
A
R
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
A
M
 
V
M
 
D
K
 
L
L
 
L
H
 
A
A
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
L
G
 
D
A
 
K
H
 
K
D
 
D
L
 
Q
M
 
Y
P
 
P
A
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
A
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
Q
P
 
P
M
 
E
L
 
V
I
 
M
M
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
E
S
 
M
L
 
V
S
 
K
I
 
E
V
 
V
G
 
L
E
 
N
L
 
V
I
 
M
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
T
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
-
G
 
G
A
 
M
S
 
T
S
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
E
V
 
M
Q
 
G
E
 
F
S
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
V
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
Y
 
I
F
 
F
V
 
M
S
 
D
E
 
D
G
 
G
K
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
I

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
35% identity, 76% coverage: 26:230/271 of query aligns to 46:250/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
N
 
N
M
 
F
T
 
E
I
 
I
P
 
N
R
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
I
V
 
F
A
 
V
V
 
I
M
 
M
G
 
G
S
 
L
S
|
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
T
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
N
G
 
R
Q
 
L
L
 
I
K
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
I
R
 
F
V
 
I
G
 
D
G
 
N
Q
 
Q
V
 
D
V
 
V
H
 
A
E
 
T
L
 
L
G
 
N
S
 
K
D
 
E
G
 
D
L
 
L
Y
 
L
G
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
K
-
 
T
M
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
|
Q
F
 
N
G
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
F
T
 
P
D
 
H
M
 
R
S
 
T
V
 
I
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
T
A
 
E
F
 
Y
Q
 
G
M
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
V
T
 
Q
N
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
K
A
 
E
L
 
E
I
 
R
R
 
R
D
 
K
L
 
R
V
 
A
M
 
E
M
 
K
K
 
A
L
 
L
H
 
D
A
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
R
 
L
G
 
D
A
 
F
H
 
K
D
 
D
L
 
Q
M
 
Y
P
 
P
A
x
K
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
|
M
A
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
N
D
 
D
P
 
P
M
 
E
L
 
I
I
 
L
M
 
L
Y
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
F
 
F
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
L
S
 
I
L
 
R
S
 
R
I
 
E
V
 
M
G
 
Q
E
 
D
L
 
E
I
 
L
R
 
L
K
 
E
L
 
L
T
 
Q
D
 
A
A
 
K
L
 
F
G
 
Q
A
 
K
S
 
T
S
 
I
I
 
I
V
 
F
V
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
D
V
 
L
Q
 
N
E
 
E
S
 
A
L
 
L
K
 
R
I
 
I
V
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
Y
 
A
F
 
I
V
 
M
S
 
K
E
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
Q
E
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
G
E
 
E
E
 
E
M
 
I

Sites not aligning to the query:

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
32% identity, 83% coverage: 6:230/271 of query aligns to 17:235/378 of P69874

query
sites
P69874
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
I
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
I
N
 
R
F
 
K
T
x
C
Y
x
F
D
 
D
S
 
G
R
 
K
P
 
E
I
 
V
L
 
I
T
 
P
G
 
Q
I
 
L
N
 
D
M
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
N
R
 
N
G
 
G
K
 
E
V
x
F
V
 
L
A
 
T
V
 
L
M
 
L
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
T
 
V
L
|
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Q
 
L
L
 
E
K
 
T
P
 
V
T
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
I
R
 
M
V
x
L
G
 
D
G
 
N
Q
 
E
V
 
D
V
 
I
H
 
T
E
 
H
L
 
V
G
 
P
S
 
A
D
 
E
G
 
N
L
 
R
Y
 
Y
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
M
 
V
G
 
N
M
 
T
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
P
D
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
Y
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
G
M
 
L
R
 
R
E
 
M
H
 
Q
T
 
K
N
 
T
L
 
-
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
E
I
 
I
R
 
T
D
 
P
L
 
R
V
 
V
M
 
M
M
 
E
K
 
A
L
 
L
H
 
R
A
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
R
 
E
G
 
T
A
 
F
H
 
A
D
 
Q
L
 
R
M
 
K
P
 
P
A
 
H
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
A
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
V
L
 
N
D
 
K
P
 
P
M
 
R
L
 
L
I
 
L
M
 
L
Y
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
F
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
I
 
K
S
 
L
L
 
R
S
 
K
I
 
Q
V
 
M
G
 
Q
E
 
N
L
 
E
I
 
L
R
 
K
K
 
A
L
 
L
T
 
Q
D
 
R
A
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
I
S
 
T
S
 
F
I
 
V
V
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
Q
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
L
K
 
T
I
 
M
V
 
S
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
Y
 
V
F
 
V
V
 
M
S
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
E
A
 
Q
E
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
R
E
 
E
M
 
I

Sites not aligning to the query:

8y5iA Cryo-em structure of e.Coli spermidine transporter potd-potabc in translocation intermidiate state (see paper)
32% identity, 83% coverage: 6:230/271 of query aligns to 2:220/358 of 8y5iA

query
sites
8y5iA
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
I
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
I
N
 
R
F
 
K
T
 
C
Y
x
F
D
 
D
S
 
G
R
x
K
P
 
E
I
 
V
L
 
I
T
 
P
G
 
Q
I
 
L
N
 
D
M
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
N
R
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
F
V
 
L
A
 
T
V
 
L
M
 
L
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
C
 
C
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
V
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Q
 
L
L
 
E
K
 
T
P
 
V
T
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
I
R
 
M
V
 
L
G
 
D
G
 
N
Q
 
E
V
 
D
V
 
I
H
 
T
E
 
H
L
 
V
G
 
P
S
 
A
D
 
E
G
 
N
L
 
R
Y
 
Y
G
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
M
 
V
G
 
N
M
 
T
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
F
 
S
G
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
P
D
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
Y
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
G
M
 
L
R
 
R
E
 
M
H
 
Q
T
 
K
N
 
T
L
 
-
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
E
I
 
I
R
 
T
D
 
P
L
 
R
V
 
V
M
 
M
M
 
E
K
 
A
L
 
L
H
 
R
A
 
M
V
 
V
G
 
Q
L
 
L
R
 
E
G
 
T
A
 
F
H
 
A
D
 
Q
L
x
R
M
 
K
P
 
P
A
 
H
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
A
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
V
L
 
N
D
 
K
P
 
P
M
 
R
L
 
L
I
 
L
M
 
L
Y
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
S
F
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
I
 
K
S
 
L
L
 
R
S
 
K
I
 
Q
V
 
M
G
 
Q
E
 
N
L
 
E
I
 
L
R
 
K
K
 
A
L
 
L
T
 
Q
D
 
R
A
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
I
S
 
T
S
 
F
I
 
V
V
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
Q
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
L
K
 
T
I
 
M
V
 
S
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
Y
 
V
F
 
V
V
 
M
S
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
E
A
 
Q
E
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
R
E
 
E
M
 
I

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
33% identity, 83% coverage: 5:230/271 of query aligns to 2:225/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
S
 
Q
L
 
M
V
 
I
E
 
D
I
 
V
R
 
H
D
 
Q
L
 
L
N
 
K
F
 
K
T
 
S
Y
x
F
D
 
G
S
 
S
R
 
L
P
 
E
I
x
V
L
 
L
T
 
K
G
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
V
T
 
H
I
 
I
P
 
R
R
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
T
 
F
L
 
L
R
 
R
L
 
C
I
 
L
G
 
N
G
 
L
Q
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
T
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
R
 
I
V
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
-
V
 
I
V
 
N
H
 
L
E
 
K
L
 
A
G
 
K
S
 
D
D
 
T
G
 
N
L
 
L
Y
 
N
G
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
R
 
E
M
 
V
G
 
G
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
F
 
R
G
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
T
 
P
D
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
Y
 
L
D
 
N
N
 
N
I
 
I
A
 
T
F
 
L
Q
 
A
M
 
P
R
 
M
E
 
K
H
 
V
T
 
R
N
 
K
L
 
W
P
 
P
E
 
R
A
 
E
L
 
K
I
 
A
R
 
E
D
 
A
L
 
K
V
 
A
M
 
M
M
 
E
K
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
A
 
K
H
 
A
D
 
H
L
 
A
M
 
Y
P
 
P
A
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
P
 
P
M
 
K
L
 
I
I
 
M
M
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
E
S
 
M
L
 
V
S
 
G
I
 
E
V
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
I
 
M
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
T
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
-
G
 
G
A
 
M
S
 
T
S
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
Q
 
G
E
 
F
S
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
V
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
Y
 
L
F
 
F
V
 
M
S
 
D
E
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
D
M
 
L

Query Sequence

>WP_041100171.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041100171.1
MSQESLVEIRDLNFTYDSRPILTGINMTIPRGKVVAVMGSSGCGKTTTLRLIGGQLKPTS
GEVRVGGQVVHELGSDGLYGLRRRMGMLFQFGALFTDMSVYDNIAFQMREHTNLPEALIR
DLVMMKLHAVGLRGAHDLMPAELSGGMARRVALARAIALDPMLIMYDEPFAGLDPISLSI
VGELIRKLTDALGASSIVVTHDVQESLKIVDYVYFVSEGKIVAEGTAEEMKHSTVPYVHQ
FIWGEADGPVPFQYPSRPYGEELMEGAVRRG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory