SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041100439.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041100439.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3m4rA Structure of the n-terminal class ii aldolase domain of a conserved protein from thermoplasma acidophilum
42% identity, 31% coverage: 16:221/659 of query aligns to 14:213/213 of 3m4rA

query
sites
3m4rA
D
 
D
L
 
I
S
 
D
R
 
E
R
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
S
D
 
D
K
 
P
T
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
H
 
-
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
V
 
V
K
 
K
A
 
T
V
 
T
G
 
E
K
 
R
N
 
D
V
 
H
F
 
A
G
 
G
E
 
R
D
 
I
E
 
I
D
 
S
I
 
V
L
 
L
Y
 
R
V
 
V
K
 
K
G
 
N
S
 
S
G
 
G
W
 
S
D
 
N
L
 
L
E
 
G
K
 
T
I
 
I
E
 
D
E
 
S
G
 
R
G
 
G
F
 
F
A
 
T
P
 
G
V
 
I
H
 
R
L
 
M
G
 
D
H
 
D
L
 
A
K
 
L
R
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
K
L
 
I
P
 
D
S
 
K
L
 
M
S
 
T
D
 
D
P
 
E
D
 
A
M
 
M
V
 
V
N
 
D
E
 
Y
L
 
L
V
 
K
T
 
K
H
 
S
M
 
M
T
 
V
R
 
N
A
 
P
S
 
S
A
 
E
P
 
P
V
 
S
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
|
E
A
 
T
I
 
F
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
F
L
 
L
P
 
P
W
 
Y
K
 
K
Y
 
F
V
 
V
D
 
M
H
|
H
T
 
S
H
|
H
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
L
T
 
S
I
 
I
T
 
T
N
 
N
S
 
T
V
 
D
D
 
L
G
 
P
E
 
S
A
 
D
R
 
Q
I
 
I
R
 
A
E
 
K
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
M
 
P
P
 
P
G
 
G
F
 
F
D
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
K
L
 
E
C
 
V
A
 
M
E
 
N
Q
 
C
F
 
F
S
 
K
K
 
K
Q
 
G
A
 
I
G
 
D
P
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
G
M
 
I
V
 
V
L
 
L
L
 
R
N
 
K
H
|
H
G
 
G
I
 
L
F
 
L
S
 
T
F
 
F
G
 
G
E
 
D
T
 
T
A
 
G
R
 
K
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
E
 
D
R
 
R
M
 
H
I
 
I
D
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
N
Y
 
F
L
 
I
K
 
R

5fffA Noroxomaritidine/norcraugsodine reductase in complex with NADP+ and piperonal (see paper)
34% identity, 38% coverage: 405:654/659 of query aligns to 5:252/257 of 5fffA

query
sites
5fffA
K
 
K
P
 
R
A
 
W
A
 
S
F
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
T
S
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
H
A
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
V
A
 
G
R
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
Y
G
 
T
L
 
C
D
 
S
L
x
R
N
 
N
P
 
E
A
 
A
-
 
E
I
 
L
C
 
R
A
 
K
L
 
C
Y
 
L
Q
 
Q
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
N
-
 
L
R
 
K
P
 
Y
D
 
D
F
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
S
A
 
V
C
|
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
I
 
-
E
 
S
D
 
R
S
 
T
L
 
E
K
 
R
D
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
E
V
 
V
D
 
S
A
 
S
F
 
V
-
 
F
-
 
N
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
G
F
x
Y
P
 
V
G
 
N
G
 
K
C
 
-
R
 
P
I
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
F
K
 
T
T
 
A
D
 
E
E
 
D
W
 
F
R
 
S
K
 
F
V
 
L
M
 
V
Q
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
S
G
 
A
F
 
F
V
 
H
L
 
L
M
 
C
R
 
Q
E
 
L
A
 
A
H
 
H
P
 
P
F
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
-
A
 
A
P
 
S
R
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
S
V
 
I
V
 
V
I
 
H
I
|
I
G
 
S
S
 
S
K
 
C
N
 
C
V
 
A
P
 
Q
A
 
I
P
 
A
G
 
I
P
 
P
G
 
G
A
x
H
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
N
A
 
L
A
 
A
L
 
C
E
 
E
W
 
W
G
 
A
G
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
I
 
T
N
 
N
S
 
S
L
 
I
H
 
A
P
|
P
N
 
G
A
|
A
V
x
I
F
 
R
D
x
T
T
 
P
G
|
G
L
 
-
W
 
-
T
|
T
D
 
E
E
 
S
V
 
F
L
 
V
V
 
I
S
 
D
R
x
K
A
 
D
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
A
L
 
L
S
 
D
V
 
R
E
 
E
A
 
V
Y
 
S
K
 
R
T
 
V
N
 
P
N
 
-
I
 
-
L
 
F
G
 
G
T
 
R
E
 
I
V
 
G
T
 
E
S
 
P
R
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
F
M
 
L
C
 
C
G
 
M
A
 
P
L
 
S
F
 
A
A
 
S
K
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
V
V
 
I
P
 
C
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5ff9B Noroxomaritidine/norcraugsodine reductase in complex with NADP+ and tyramine (see paper)
34% identity, 38% coverage: 405:654/659 of query aligns to 5:252/257 of 5ff9B

query
sites
5ff9B
K
 
K
P
 
R
A
 
W
A
 
S
F
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
T
S
x
K
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
H
A
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
V
A
 
G
R
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
Y
G
 
T
L
 
C
D
x
S
L
x
R
N
 
N
P
 
E
A
 
A
-
 
E
I
 
L
C
 
R
A
 
K
L
 
C
Y
 
L
Q
 
Q
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
N
-
 
L
R
 
K
P
 
Y
D
 
D
F
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
S
A
 
V
C
|
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
I
 
-
E
 
S
D
 
R
S
 
T
L
 
E
K
 
R
D
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
E
V
 
V
D
 
S
A
 
S
F
 
V
-
 
F
-
 
N
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
G
F
x
Y
P
 
V
G
 
N
G
 
K
C
 
-
R
 
P
I
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
F
K
 
T
T
 
A
D
 
E
E
 
D
W
 
F
R
 
S
K
 
F
V
 
L
M
 
V
Q
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
S
G
 
A
F
 
F
V
 
H
L
 
L
M
 
C
R
 
Q
E
 
L
A
 
A
H
 
H
P
 
P
F
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
-
A
 
A
P
 
S
R
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
S
V
 
I
V
 
V
I
 
H
I
|
I
G
 
S
S
|
S
K
 
C
N
 
C
V
 
A
P
 
Q
A
 
I
P
 
A
G
x
I
P
 
P
G
 
G
A
x
H
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
N
A
 
L
A
 
A
L
 
C
E
 
E
W
 
W
G
 
A
G
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
I
 
T
N
 
N
S
 
S
L
 
I
H
 
A
P
|
P
N
 
G
A
|
A
V
x
I
F
 
R
D
x
T
T
 
P
G
|
G
L
 
-
W
 
-
T
|
T
D
 
E
E
 
S
V
 
F
L
 
V
V
 
I
S
 
D
R
x
K
A
 
D
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
A
L
 
L
S
 
D
V
 
R
E
 
E
A
 
V
Y
 
S
K
 
R
T
 
V
N
 
P
N
 
-
I
 
-
L
 
F
G
 
G
T
 
R
E
 
I
V
 
G
T
 
E
S
 
P
R
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
F
M
 
L
C
 
C
G
 
M
A
 
P
L
 
S
F
 
A
A
 
S
K
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
V
V
 
I
P
 
C
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

A0A1A9TAK5 Noroxomaritidine/norcraugsodine reductase; NorRed; EC 1.1.1.- from Narcissus pseudonarcissus (Daffodil) (see paper)
34% identity, 38% coverage: 405:654/659 of query aligns to 5:252/257 of A0A1A9TAK5

query
sites
A0A1A9TAK5
K
 
K
P
 
R
A
 
W
A
 
S
F
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
x
T
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
H
A
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
V
A
 
G
R
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
Y
G
 
T
L
 
C
D
x
S
L
x
R
N
 
N
P
 
E
A
 
A
-
 
E
I
 
L
C
 
R
A
 
K
L
 
C
Y
 
L
Q
 
Q
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
N
-
 
L
R
 
K
P
 
Y
D
 
D
F
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
S
A
 
V
C
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
I
 
-
E
 
S
D
 
R
S
 
T
L
 
E
K
 
R
D
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
E
V
 
V
D
 
S
A
 
S
F
 
V
-
 
F
-
 
N
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
G
F
x
Y
P
 
V
G
 
N
G
 
K
C
 
-
R
 
P
I
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
F
K
 
T
T
 
A
D
 
E
E
 
D
W
 
F
R
 
S
K
 
F
V
 
L
M
 
V
Q
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
S
G
 
A
F
 
F
V
 
H
L
 
L
M
 
C
R
 
Q
E
 
L
A
 
A
H
 
H
P
 
P
F
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
-
A
 
A
P
 
S
R
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
S
V
 
I
V
 
V
I
 
H
I
 
I
G
 
S
S
 
S
K
x
C
N
 
C
V
 
A
P
 
Q
A
 
I
P
 
A
G
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
H
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
N
A
 
L
A
 
A
L
 
C
E
 
E
W
 
W
G
 
A
G
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
I
 
T
N
 
N
S
 
S
L
 
I
H
 
A
P
 
P
N
 
G
A
 
A
V
x
I
F
x
R
D
x
T
T
x
P
G
|
G
L
 
-
W
 
-
T
|
T
D
 
E
E
 
S
V
 
F
L
 
V
V
 
I
S
 
D
R
 
K
A
 
D
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
A
L
 
L
S
 
D
V
 
R
E
 
E
A
 
V
Y
 
S
K
 
R
T
 
V
N
 
P
N
 
-
I
 
-
L
 
F
G
 
G
T
 
R
E
 
I
V
 
G
T
 
E
S
 
P
R
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
F
M
 
L
C
 
C
G
 
M
A
 
P
L
 
S
F
 
A
A
 
S
K
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
V
V
 
I
P
 
C
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
33% identity, 37% coverage: 411:654/659 of query aligns to 6:256/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
C
 
I
V
 
A
D
 
K
A
 
K
L
 
F
L
 
A
A
 
Q
R
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
I
L
 
S
D
|
D
L
x
M
N
 
N
P
 
A
A
 
E
I
 
K
C
 
C
A
 
Q
L
 
E
Y
 
T
-
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
E
Q
 
Q
R
 
G
P
 
F
D
 
D
F
 
A
L
 
L
G
 
S
I
 
A
A
 
P
C
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
I
 
D
E
 
E
D
 
D
S
 
A
L
 
Y
K
 
K
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
L
T
 
T
V
 
Q
D
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
M
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
-
F
 
F
P
x
Q
G
 
H
G
 
V
C
 
A
R
 
P
I
 
I
D
 
E
A
 
E
L
 
F
K
 
P
T
 
T
D
 
A
E
 
V
W
 
F
R
 
Q
K
 
K
V
 
L
M
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
D
 
T
A
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
I
L
 
G
M
 
I
R
 
K
E
 
H
A
 
V
H
 
L
P
 
P
F
 
I
L
 
M
K
 
K
L
 
-
A
 
A
P
 
Q
R
 
K
G
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
V
 
I
I
 
N
I
x
M
G
x
A
S
|
S
K
 
I
N
 
N
V
 
G
P
 
L
A
 
I
P
 
G
G
 
F
P
 
A
G
 
G
A
x
K
A
 
A
A
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
I
Q
 
G
L
 
L
A
 
T
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
C
G
 
A
G
 
R
D
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
A
L
 
L
H
 
C
P
 
P
N
 
G
A
x
Y
V
|
V
F
 
-
D
 
D
T
|
T
G
 
P
L
 
L
W
 
V
T
 
R
D
 
G
E
x
Q
V
 
I
L
 
-
V
 
A
S
 
D
R
 
L
A
 
A
K
 
K
H
 
T
Y
 
R
G
 
N
L
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
D
A
 
S
Y
 
A
K
 
L
T
 
E
N
 
D
N
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
A
T
 
M
E
 
V
V
 
P
T
 
Q
S
 
K
R
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
A
 
I
E
 
F
M
 
L
C
 
A
G
 
S
A
 
S
L
 
K
F
 
A
A
 
G
K
 
G
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
A
V
 
V
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
33% identity, 37% coverage: 411:654/659 of query aligns to 7:257/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
C
 
I
V
 
A
D
 
K
A
 
K
L
 
F
L
 
A
A
 
Q
R
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
I
L
 
S
D
|
D
L
x
M
N
 
N
P
 
A
A
 
E
I
 
K
C
 
C
A
 
Q
L
 
E
Y
 
T
-
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
E
Q
 
Q
R
 
G
P
 
F
D
 
D
F
 
A
L
 
L
G
 
S
I
 
A
A
 
P
C
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
I
 
D
E
 
E
D
 
D
S
 
A
L
 
Y
K
 
K
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
L
T
 
T
V
 
Q
D
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
M
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
-
F
 
F
P
x
Q
G
 
H
G
 
V
C
 
A
R
 
P
I
 
I
D
 
E
A
 
E
L
 
F
K
 
P
T
 
T
D
 
A
E
 
V
W
 
F
R
 
Q
K
 
K
V
 
L
M
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
D
 
T
A
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
I
L
 
G
M
 
I
R
 
K
E
 
H
A
 
V
H
 
L
P
 
P
F
 
I
L
 
M
K
 
K
L
 
-
A
 
A
P
 
Q
R
 
K
G
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
V
 
I
I
 
N
I
x
M
G
x
A
S
|
S
K
 
I
N
|
N
V
 
G
P
 
L
A
 
I
P
 
G
G
 
F
P
 
A
G
 
G
A
x
K
A
 
A
A
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
I
Q
 
G
L
 
L
A
 
T
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
C
G
 
A
G
 
R
D
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
A
L
 
L
H
 
C
P
|
P
N
x
G
A
 
Y
V
|
V
F
 
-
D
 
D
T
|
T
G
 
P
L
|
L
W
 
V
T
 
R
D
 
G
E
x
Q
V
 
I
L
 
-
V
 
A
S
 
D
R
 
L
A
 
A
K
 
K
H
 
T
Y
 
R
G
 
N
L
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
D
A
 
S
Y
 
A
K
 
L
T
 
E
N
 
D
N
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
A
T
 
M
E
 
V
V
 
P
T
 
Q
S
 
K
R
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
A
 
I
E
 
F
M
 
L
C
 
A
G
 
S
A
 
S
L
 
K
F
 
A
A
 
G
K
 
G
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
A
V
 
V
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q73SC8 Uncharacterized NAD-dependent oxidoreductase MAP_4146; EC 1.-.-.- from Mycolicibacterium paratuberculosis (strain ATCC BAA-968 / K-10) (Mycobacterium paratuberculosis)
30% identity, 38% coverage: 404:654/659 of query aligns to 3:271/275 of Q73SC8

query
sites
Q73SC8
G
 
G
K
 
Q
P
 
A
A
 
G
A
 
S
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
x
R
G
|
G
I
x
Q
G
 
G
K
 
R
A
 
S
C
 
H
V
 
A
D
 
V
A
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
D
V
 
I
V
 
I
G
 
A
L
 
C
D
|
D
L
x
I
N
 
C
P
 
A
A
 
P
I
 
V
C
 
S
A
 
A
L
 
S
Y
 
V
Q
 
T
R
 
Y
P
 
A
D
 
P
F
 
A
L
 
S
G
 
P
I
 
E
A
 
D
C
 
L
D
 
D
V
 
E
T
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
L
I
 
V
E
 
E
D
 
D
S
 
Q
L
 
G
K
 
R
D
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
R
T
 
V
V
 
L
D
|
D
A
x
V
-
 
R
-
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
M
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
F
 
L
P
 
S
G
 
W
G
 
G
C
 
-
R
 
R
I
 
V
D
 
W
A
 
E
L
 
L
K
 
T
T
 
D
D
 
E
E
 
Q
W
 
W
R
 
D
K
 
T
V
 
V
M
 
I
Q
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
T
A
 
G
G
 
T
F
 
W
V
 
R
L
 
T
M
 
L
R
 
R
E
 
A
A
 
T
H
 
V
P
 
P
F
 
A
L
 
M
K
 
I
L
 
E
A
 
A
P
 
G
R
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
S
V
 
I
V
 
V
I
 
V
I
 
V
G
 
S
S
 
S
K
 
S
N
 
A
V
 
G
P
 
L
A
 
K
P
 
A
G
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
N
A
 
G
A
 
H
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
N
V
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
G
 
E
D
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
H
 
H
P
 
P
N
 
Y
A
 
S
V
|
V
F
x
E
D
x
T
T
 
P
G
 
M
L
 
I
W
 
E
T
 
P
D
 
E
E
 
A
V
 
M
L
 
M
V
 
E
S
 
I
R
 
F
A
 
A
K
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
S
-
 
F
-
 
V
Y
 
H
G
 
S
L
 
F
S
 
P
V
 
P
E
 
M
A
 
P
Y
 
V
K
 
Q
T
 
P
N
 
N
N
 
G
I
 
F
L
 
M
G
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
T
S
 
A
R
 
D
D
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
W
M
 
L
C
 
A
G
 
G
A
 
D
L
 
G
F
 
S
A
 
G
K
 
T
T
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
K
G
 
G

3pgxA Crystal structure of a putative carveol dehydrogenase from mycobacterium paratuberculosis bound to nicotinamide adenine dinucleotide (see paper)
30% identity, 37% coverage: 408:654/659 of query aligns to 2:266/270 of 3pgxA

query
sites
3pgxA
A
 
S
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
R
G
|
G
I
x
Q
G
 
G
K
 
R
A
 
S
C
 
H
V
 
A
D
 
V
A
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
D
V
 
I
V
 
I
G
 
A
L
 
C
D
|
D
L
x
I
N
 
C
P
 
A
A
 
P
I
 
V
C
 
S
A
 
A
L
 
S
Y
 
V
Q
 
T
-
 
Y
-
 
A
-
 
P
-
x
A
R
 
S
P
 
P
D
 
E
F
 
D
L
 
L
G
 
D
I
 
E
A
 
T
C
 
A
D
 
R
V
 
L
T
 
-
I
 
V
E
 
E
D
 
D
S
 
Q
L
 
G
K
 
R
D
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
R
T
 
V
V
 
L
D
|
D
A
x
V
-
 
R
-
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
M
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
F
 
L
P
 
S
G
 
W
G
 
G
C
 
-
R
 
R
I
 
V
D
 
W
A
 
E
L
 
L
K
 
T
T
 
D
D
 
E
E
 
Q
W
 
W
R
 
D
K
 
T
V
 
V
M
 
I
Q
 
G
V
|
V
N
 
N
L
 
L
D
 
T
A
 
G
G
 
T
F
 
W
V
 
R
L
 
T
M
 
L
R
 
R
E
 
A
A
 
T
H
 
V
P
 
P
F
 
A
L
 
M
K
 
I
L
 
E
A
 
A
P
 
G
R
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
S
V
 
I
V
 
V
I
 
V
I
x
V
G
 
S
S
|
S
K
 
S
N
 
A
V
 
G
P
 
L
A
 
K
P
 
A
G
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
N
A
 
G
A
 
H
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
N
V
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
G
 
E
D
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
H
 
H
P
|
P
N
 
Y
A
 
S
V
|
V
F
 
E
D
x
T
T
 
P
G
x
M
L
x
I
W
 
E
T
 
P
D
 
E
E
 
A
V
 
M
L
 
M
V
 
E
S
 
I
R
 
F
A
 
A
K
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
S
-
 
F
-
 
V
Y
 
H
G
 
S
L
 
F
S
 
P
V
 
P
E
 
M
A
 
P
Y
 
V
K
 
Q
T
 
P
N
 
N
N
 
G
I
 
F
L
 
M
G
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
T
S
 
A
R
 
D
D
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
W
M
 
L
C
 
A
G
 
G
A
 
D
L
 
G
F
 
S
A
 
G
K
 
T
T
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
K
G
 
G

P50162 Tropinone reductase 1; Tropine dehydrogenase; Tropinone reductase I; TR-I; EC 1.1.1.206 from Datura stramonium (Jimsonweed) (Common thornapple) (see paper)
31% identity, 37% coverage: 408:654/659 of query aligns to 18:266/273 of P50162

query
sites
P50162
A
 
S
F
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
T
V
 
T
A
 
A
L
|
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
K
x
Y
A
|
A
C
x
I
V
|
V
D
x
E
A
x
E
L
|
L
L
x
A
A
x
G
R
x
L
G
|
G
A
|
A
A
x
R
V
|
V
V
x
Y
G
 
T
L
 
C
D
 
S
L
 
R
N
 
N
P
 
E
A
 
K
I
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
E
C
 
C
A
 
L
L
 
E
Y
 
I
Q
 
W
R
 
R
P
 
E
D
 
K
F
 
G
L
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
E
G
 
G
I
 
S
A
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
R
T
 
T
I
 
E
E
 
R
D
 
D
S
 
K
L
 
L
K
 
M
D
 
Q
A
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
H
T
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
-
F
 
-
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
F
 
V
P
 
I
G
 
H
G
 
K
C
 
E
R
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
F
L
 
T
K
 
E
T
 
K
D
 
D
E
 
-
W
 
Y
R
 
N
K
 
I
V
 
I
M
 
M
Q
 
G
V
 
T
N
 
N
L
 
F
D
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
H
L
 
L
M
 
S
R
 
Q
E
 
I
A
 
A
H
 
Y
P
 
P
F
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
-
A
 
A
P
 
S
R
 
Q
G
 
N
G
 
G
R
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
F
I
 
L
G
 
S
S
|
S
K
 
I
N
 
A
V
 
G
P
 
F
A
 
S
P
 
A
G
 
L
P
 
P
G
 
S
A
 
V
A
 
S
A
 
L
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
L
 
M
A
 
T
R
 
K
V
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
C
E
 
E
W
 
W
G
 
A
G
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
V
H
 
A
P
 
P
N
 
G
A
 
V
V
 
I
F
 
L
D
 
T
T
 
P
G
 
L
L
 
V
W
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
T
L
 
A
V
 
I
S
 
K
R
 
K
A
 
N
K
 
P
H
 
H
Y
 
Q
G
 
K
L
 
E
S
 
E
V
 
I
E
 
D
A
 
N
Y
 
F
K
 
I
T
 
V
N
 
K
N
 
T
I
 
P
L
 
M
G
 
G
T
 
R
E
 
A
V
 
G
T
 
K
S
 
P
R
 
Q
D
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
E
 
F
M
 
L
C
 
C
G
 
F
A
 
P
L
 
A
F
 
A
A
 
S
K
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
I
V
 
I
P
 
W
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1ae1B Tropinone reductase-i complex with NADP (see paper)
31% identity, 37% coverage: 408:654/659 of query aligns to 3:251/258 of 1ae1B

query
sites
1ae1B
A
 
S
F
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
T
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
Y
G
 
T
L
 
C
D
x
S
L
x
R
N
 
N
P
 
E
A
 
K
I
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
E
C
 
C
A
 
L
L
 
E
Y
 
I
Q
 
W
R
 
R
P
 
E
D
 
K
F
 
G
L
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
E
G
 
G
I
 
S
A
 
V
C
|
C
D
|
D
V
x
L
-
 
L
-
 
S
-
 
R
T
 
T
I
 
E
E
 
R
D
 
D
S
 
K
L
 
L
K
 
M
D
 
Q
A
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
H
T
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
-
F
 
-
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
V
F
 
V
P
 
I
G
 
H
G
 
K
C
 
E
R
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
F
L
 
T
K
 
E
T
 
K
D
 
D
E
 
-
W
 
Y
R
 
N
K
 
I
V
 
I
M
 
M
Q
 
G
V
 
T
N
 
N
L
 
F
D
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
H
L
 
L
M
 
S
R
 
Q
E
 
I
A
 
A
H
 
Y
P
 
P
F
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
-
A
 
A
P
 
S
R
 
Q
G
 
N
G
 
G
R
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
F
I
 
L
G
 
S
S
|
S
K
 
I
N
 
A
V
 
G
P
 
F
A
 
S
P
 
A
G
 
L
P
 
P
G
 
S
A
x
V
A
 
S
A
 
L
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
L
 
M
A
 
T
R
 
K
V
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
C
E
 
E
W
 
W
G
 
A
G
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
V
H
 
A
P
|
P
N
 
G
A
 
V
V
x
I
F
 
L
D
x
T
T
 
P
G
x
L
L
x
V
W
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
T
L
 
A
V
 
I
S
 
K
R
 
K
A
 
N
K
 
P
H
 
H
Y
 
Q
G
 
K
L
 
E
S
 
E
V
 
I
E
 
D
A
 
N
Y
 
F
K
 
I
T
 
V
N
 
K
N
 
T
I
 
P
L
 
M
G
 
G
T
 
R
E
 
A
V
 
G
T
 
K
S
 
P
R
 
Q
D
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
E
 
F
M
 
L
C
 
C
G
 
F
A
 
P
L
 
A
F
 
A
A
 
S
K
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
I
V
 
I
P
 
W
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
36% identity, 28% coverage: 409:594/659 of query aligns to 4:191/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
F
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
C
 
I
V
 
A
D
 
A
A
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
V
L
 
S
D
|
D
L
x
I
N
 
N
P
 
A
A
 
E
I
 
G
C
 
A
A
 
K
L
 
A
Y
 
A
Q
 
A
R
 
A
P
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
K
D
 
K
F
 
A
L
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
I
 
D
E
 
P
D
 
G
S
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
A
A
 
L
L
 
F
A
 
A
R
 
E
T
 
I
V
 
Q
D
 
A
A
 
L
F
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
M
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
S
I
 
I
F
 
V
P
 
P
G
 
F
G
 
-
C
 
V
R
 
A
I
 
W
D
 
D
A
 
D
L
 
V
K
 
D
T
 
L
D
 
D
E
 
H
W
 
W
R
 
R
K
 
K
V
 
I
M
 
I
Q
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
T
A
 
G
G
 
T
F
 
F
V
 
I
L
 
V
M
 
T
R
 
R
E
 
A
A
 
G
H
 
T
P
 
D
F
 
Q
L
 
M
K
 
R
L
 
A
A
 
A
P
 
G
R
 
K
G
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
S
I
|
I
G
 
A
S
|
S
K
x
N
N
x
T
V
 
F
P
 
F
A
 
A
P
 
G
G
 
T
P
 
P
G
 
N
A
x
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
L
 
V
N
 
I
Q
 
G
L
 
F
A
 
T
R
 
R
V
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
T
E
 
E
W
 
L
G
 
G
G
 
K
D
 
Y
N
 
N
I
 
I
R
 
T
I
 
A
N
 
N
S
 
A
L
 
V
H
 
T
P
|
P
N
 
G
A
x
L
V
x
I
F
 
E
D
x
S
T
 
D
G
|
G
L
x
V

Sites not aligning to the query:

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
36% identity, 28% coverage: 409:594/659 of query aligns to 4:191/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
F
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
C
 
I
V
 
A
D
 
A
A
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
V
L
 
S
D
|
D
L
x
I
N
 
N
P
 
A
A
 
E
I
 
G
C
 
A
A
 
K
L
 
A
Y
 
A
Q
 
A
R
 
A
P
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
K
D
 
K
F
 
A
L
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
I
 
D
E
 
P
D
 
G
S
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
A
A
 
L
L
 
F
A
 
A
R
 
E
T
 
I
V
 
Q
D
 
A
A
 
L
F
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
M
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
S
I
 
I
F
 
V
P
 
P
G
 
F
G
 
-
C
 
V
R
 
A
I
 
W
D
 
D
A
 
D
L
 
V
K
 
D
T
 
L
D
 
D
E
 
H
W
 
W
R
 
R
K
 
K
V
 
I
M
 
I
Q
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
D
 
T
A
 
G
G
 
T
F
 
F
V
 
I
L
 
V
M
 
T
R
 
R
E
 
A
A
 
G
H
 
T
P
 
D
F
 
Q
L
 
M
K
 
R
L
 
A
A
 
A
P
 
G
R
 
K
G
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
S
I
|
I
G
 
A
S
|
S
K
 
N
N
 
T
V
 
F
P
 
F
A
 
A
P
 
G
G
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
L
 
V
N
 
I
Q
 
G
L
 
F
A
 
T
R
 
R
V
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
T
E
 
E
W
 
L
G
 
G
G
 
K
D
 
Y
N
 
N
I
 
I
R
 
T
I
 
A
N
 
N
S
 
A
L
 
V
H
 
T
P
|
P
N
 
G
A
x
L
V
x
I
F
 
E
D
x
S
T
 
D
G
|
G
L
x
V

6zzpA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
34% identity, 34% coverage: 409:633/659 of query aligns to 8:240/265 of 6zzpA

query
sites
6zzpA
F
 
L
A
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
C
 
I
V
 
A
D
 
E
A
 
T
L
 
Y
L
 
A
A
 
K
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
G
G
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
I
N
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
V
P
 
D
A
 
A
I
 
I
C
 
E
A
 
A
L
 
A
Y
 
G
Q
 
G
R
 
R
P
 
A
D
 
-
F
 
-
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
C
x
M
D
|
D
V
|
V
T
 
T
I
 
S
E
 
E
D
 
A
S
 
A
L
 
V
K
 
N
D
 
D
A
 
G
L
 
V
A
 
Q
R
 
R
T
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
M
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
F
x
Q
-
 
I
-
 
I
-
 
D
P
 
P
G
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
-
I
 
I
D
 
H
A
 
K
L
 
M
K
 
A
T
 
F
D
 
E
E
 
D
W
 
W
R
 
K
K
 
K
V
 
M
M
 
L
Q
 
A
V
 
I
N
 
H
L
 
L
D
 
D
A
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
L
L
 
T
M
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
H
 
I
P
 
Q
F
 
H
L
 
M
K
 
Y
L
 
K
A
 
D
P
 
D
R
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
T
V
 
V
V
 
I
I
 
Y
I
x
M
G
 
G
S
|
S
K
 
V
N
x
H
V
 
S
P
 
H
A
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
L
G
 
F
A
x
K
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
V
A
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
L
N
 
L
Q
 
G
L
 
L
A
 
C
R
 
R
V
 
V
A
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
G
G
 
A
G
 
V
D
 
H
N
 
N
I
 
V
R
 
R
I
 
S
N
 
H
S
 
V
L
 
I
H
 
C
P
|
P
N
 
G
A
 
-
V
 
-
F
|
F
D
x
V
T
 
K
G
x
T
L
 
P
W
x
L
T
x
V
D
 
E
E
 
K
V
x
Q
L
 
I
V
 
P
S
 
Q
R
 
Q
A
 
A
K
 
A
H
 
E
Y
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
E
E
 
E
A
 
S
Y
 
V
K
 
V
T
 
N
N
 
D
N
 
I
I
 
M
L
 
L
G
 
V
T
 
N
E
 
T
V
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
F
-
 
T
T
 
T
S
 
V
R
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
A

6zzoC Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
34% identity, 34% coverage: 409:633/659 of query aligns to 8:240/265 of 6zzoC

query
sites
6zzoC
F
 
L
A
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
C
 
I
V
 
A
D
 
E
A
 
T
L
 
Y
L
 
A
A
 
K
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
G
G
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
I
N
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
V
P
 
D
A
 
A
I
 
I
C
 
E
A
 
A
L
 
A
Y
 
G
Q
 
G
R
 
R
P
 
A
D
 
-
F
 
-
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
C
x
M
D
|
D
V
|
V
T
 
T
I
 
S
E
 
E
D
 
A
S
 
A
L
 
V
K
 
N
D
 
D
A
 
G
L
 
V
A
 
Q
R
 
R
T
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
M
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
F
x
Q
-
 
I
-
 
I
-
 
D
P
 
P
G
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
-
I
 
I
D
 
H
A
 
K
L
 
M
K
 
A
T
 
F
D
 
E
E
 
D
W
 
W
R
 
K
K
 
K
V
 
M
M
 
L
Q
 
A
V
 
I
N
 
H
L
 
L
D
 
D
A
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
L
L
 
T
M
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
H
 
I
P
 
Q
F
 
H
L
 
M
K
 
Y
L
 
K
A
 
D
P
 
D
R
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
T
V
 
V
V
 
I
I
 
Y
I
x
M
G
 
G
S
 
S
K
 
V
N
x
H
V
 
S
P
 
H
A
 
E
P
 
A
G
 
S
P
 
L
G
 
F
A
x
K
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
V
A
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
L
N
 
L
Q
 
G
L
 
L
A
 
C
R
 
R
V
 
V
A
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
G
G
 
A
G
 
V
D
 
H
N
 
N
I
 
V
R
 
R
I
 
S
N
 
H
S
 
V
L
 
I
H
 
C
P
|
P
N
 
G
A
 
-
V
 
-
F
|
F
D
x
V
T
 
K
G
x
T
L
 
P
W
x
L
T
x
V
D
 
E
E
 
K
V
x
Q
L
 
I
V
 
P
S
 
Q
R
 
Q
A
 
A
K
 
A
H
 
E
Y
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
E
E
 
E
A
 
S
Y
 
V
K
 
V
T
 
N
N
 
D
N
 
I
I
 
M
L
 
L
G
 
V
T
 
N
E
 
T
V
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
F
-
 
T
T
 
T
S
 
V
R
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
A

2ekpA Structure of tt0495 protein from thermus thermophilus (see paper)
34% identity, 37% coverage: 414:654/659 of query aligns to 4:234/238 of 2ekpA

query
sites
2ekpA
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
S
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
C
 
I
V
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
Y
A
 
R
V
 
V
V
 
A
G
 
I
L
 
A
D
x
S
L
 
R
N
 
N
P
 
P
A
 
E
I
 
E
C
 
A
A
 
A
L
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
R
 
S
P
 
L
D
 
G
F
 
A
L
 
V
G
 
P
I
 
L
A
 
P
C
x
T
D
|
D
V
x
L
T
 
E
I
 
K
E
 
D
D
 
D
S
 
P
L
 
-
K
 
K
D
 
G
A
 
L
L
 
V
A
 
K
R
 
R
T
 
A
V
 
L
D
 
E
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
H
M
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
H
N
x
A
A
 
A
G
x
A
I
 
V
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
N
C
 
V
R
 
R
I
 
K
D
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
E
T
 
L
-
 
S
-
 
Y
D
 
E
E
 
E
W
 
W
R
 
R
K
 
R
V
 
V
M
 
L
Q
 
Y
V
 
L
N
 
H
L
 
L
D
 
D
A
 
V
G
 
A
F
 
F
V
 
L
L
 
L
M
 
A
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
H
 
A
P
 
P
F
 
H
L
 
M
K
 
A
L
 
E
A
 
A
P
 
-
R
 
G
G
 
W
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
F
I
|
I
G
|
G
S
|
S
K
 
V
N
 
T
V
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
G
P
 
P
A
 
V
P
 
P
G
 
I
P
 
P
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
L
Q
 
G
L
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
W
G
 
A
G
 
R
D
 
L
N
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N
 
N
S
 
L
L
 
L
H
 
C
P
|
P
N
x
G
A
 
Y
V
|
V
-
 
E
-
x
T
-
 
E
F
|
F
D
x
T
T
 
L
G
 
P
L
 
L
W
 
R
T
 
Q
D
 
N
E
 
P
V
 
E
L
 
L
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
Y
E
 
E
A
 
P
Y
 
I
K
 
T
T
 
A
N
 
R
N
 
I
I
 
P
L
 
M
G
 
G
T
 
R
E
 
W
V
 
A
T
 
R
S
 
P
R
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
V
M
 
L
C
 
C
G
 
G
A
 
D
L
 
E
F
 
A
A
 
E
K
 
Y
T
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
A
V
 
V
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4cr6A Crystal structure of the n-acetyl-d-mannosamine dehydrogenase without substrates (see paper)
36% identity, 28% coverage: 409:593/659 of query aligns to 3:187/255 of 4cr6A

query
sites
4cr6A
F
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
K
V
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
G
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
C
 
T
V
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
A
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
A
L
 
M
D
 
D
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
R
I
 
L
C
 
A
A
 
A
L
 
T
-
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
R
 
E
P
 
P
D
 
G
F
 
A
L
 
I
G
 
P
I
 
I
A
 
A
C
 
C
D
 
D
V
 
-
T
 
-
I
 
L
E
 
R
D
 
A
S
 
A
L
 
I
K
 
D
D
 
A
A
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
D
T
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
R
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
A
N
 
G
A
 
G
G
 
A
I
 
L
F
 
K
P
 
G
G
 
G
G
 
T
C
 
G
R
 
N
I
 
F
D
 
L
A
 
D
L
 
L
K
 
S
T
 
D
D
 
A
E
 
D
W
 
W
R
 
D
K
 
R
V
 
Y
M
 
V
Q
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
M
D
 
T
A
 
G
G
 
T
F
 
F
V
 
L
L
 
T
M
 
C
R
 
R
E
 
A
-
 
G
A
 
A
H
 
R
P
 
A
F
 
M
L
 
V
K
 
A
L
 
A
A
 
G
P
 
A
R
 
R
G
 
S
G
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
I
I
 
T
I
 
I
G
 
G
S
|
S
K
 
V
N
 
N
V
 
S
P
 
F
A
x
M
P
 
A
G
 
E
P
 
P
G
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
L
 
V
N
 
A
Q
 
M
L
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
W
 
L
G
 
A
G
 
R
D
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
M
L
 
I
H
 
A
P
 
P
N
 
G
A
 
P
V
 
V
F
 
D
D
 
V
T
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5ojiA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
34% identity, 27% coverage: 409:589/659 of query aligns to 8:194/260 of 5ojiA

query
sites
5ojiA
F
 
F
A
 
E
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
A
x
T
S
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
C
 
I
V
 
A
D
 
E
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
x
S
-
x
R
-
x
N
G
 
Q
L
 
K
D
x
N
L
 
V
N
 
D
P
 
E
A
 
A
I
 
I
C
 
E
A
 
Y
L
 
L
Y
 
K
Q
 
N
R
 
K
-
 
G
-
 
L
P
 
T
D
 
K
F
 
V
L
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
C
 
G
D
 
H
V
x
I
T
 
A
I
 
S
E
 
T
D
 
D
S
 
D
L
 
Q
K
 
K
D
 
K
A
 
L
L
 
V
A
 
D
R
 
F
T
 
T
V
 
L
D
 
Q
A
 
K
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
N
M
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
x
H
G
|
G
I
 
I
F
 
N
P
 
P
G
 
A
G
 
F
C
 
G
R
 
H
I
 
I
D
 
L
A
 
E
L
 
V
K
 
S
T
 
D
D
 
Q
E
 
V
W
 
W
R
 
D
K
 
K
V
 
L
M
 
F
Q
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
V
D
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
Q
L
 
M
M
 
T
R
 
K
E
 
L
A
 
V
H
 
H
P
 
P
F
 
H
L
 
I
K
 
A
L
 
-
A
 
K
P
 
E
R
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
F
I
x
N
G
 
A
S
|
S
K
 
Y
N
x
S
V
 
A
P
 
Y
A
 
K
P
 
S
G
 
P
P
 
P
G
 
G
A
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
G
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
T
A
 
T
L
 
L
N
 
V
Q
 
G
L
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
G
W
 
L
G
 
A
G
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N