SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041100910.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041100910.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
35% identity, 89% coverage: 17:181/185 of query aligns to 86:248/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
H
 
H
R
 
R
G
x
D
P
 
P
V
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
W
S
 
S
G
 
T
T
 
P
M
 
L
L
 
L
F
 
Y
A
 
L
A
 
K
C
 
G
F
 
F
N
 
H
P
 
A
R
 
-
M
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
I
V
 
Q
L
 
S
L
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
T
E
 
H
Y
 
Y
F
 
L
H
 
W
G
 
N
R
 
Q
R
 
N
I
 
R
G
 
K
L
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
L
F
 
Y
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
Q
N
 
I
V
 
S
L
 
V
V
 
A
F
 
F
G
 
D
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
M
L
 
F
P
x
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
E
A
 
T
R
 
S
I
 
V
G
 
I
D
 
E
N
 
N
-
 
D
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
G
S
 
T
E
 
G
P
 
K
E
 
E
I
 
S
G
 
G
F
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
D
A
 
R
R
 
H
P
 
P
V
 
K
V
 
V
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
K
H
 
Y
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
P
S
 
E
H
 
Y
S
 
A
V
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
S
 
D
A
 
K
S
 
A
G
 
A
E
 
K
P
 
P

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
45% identity, 71% coverage: 46:176/185 of query aligns to 122:248/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
Y
 
Y
F
 
L
H
 
D
G
 
G
R
 
R
R
 
K
I
 
T
G
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
A
K
 
Y
F
 
F
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
R
N
 
M
V
 
S
L
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
L
P
x
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
N
N
 
N
C
 
I
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
G
S
 
S
E
 
G
P
 
K
E
 
E
I
 
G
G
 
G
F
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
D
A
x
R
R
x
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
S
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
S
H
 
N
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
R
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
S
S
 
I
V
 
T
A
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
K
V
 
P
L
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
39% identity, 76% coverage: 42:181/185 of query aligns to 118:255/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
R
 
R
L
 
I
A
 
G
E
 
H
Y
 
W
F
 
L
H
 
W
G
 
A
R
 
Q
R
 
D
I
 
R
G
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
I
F
 
Y
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
Q
N
 
V
V
 
S
L
 
V
V
 
A
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
C
G
 
G
L
 
I
F
 
M
L
 
L
P
x
D
H
 
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
N
N
 
D
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
T
x
G
S
 
T
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
K
T
 
T
A
 
S
A
 
G
A
 
D
R
|
R
-
 
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
R
H
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
A
H
 
H
S
 
T
V
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
G
R
 
K
S
 
P
A
 
E
S
 
S
G
 
D
E
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
39% identity, 76% coverage: 42:181/185 of query aligns to 111:248/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
R
 
R
L
 
V
A
 
A
E
 
N
Y
 
W
F
 
L
H
 
W
G
 
R
R
 
Q
R
 
G
I
 
R
G
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
F
x
Y
F
 
F
S
 
Q
A
 
N
I
x
Q
N
 
I
V
 
S
L
 
V
V
 
A
F
 
C
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
M
L
 
L
P
x
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
D
N
 
D
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
Q
G
 
D
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
G
S
 
T
E
 
G
P
 
K
E
 
E
I
 
C
G
 
G
F
 
D
T
x
R
A
 
-
A
 
-
A
 
-
R
x
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
S
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
D
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
H
S
 
T
V
 
T
A
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
G
R
 
R
S
 
P
A
 
Q
S
 
S
G
 
D
E
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8i04A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with serine (see paper)
43% identity, 74% coverage: 46:181/185 of query aligns to 117:248/258 of 8i04A

query
sites
8i04A
Y
 
W
F
 
N
H
 
K
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
A
G
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
A
K
 
I
F
 
F
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
Q
N
 
V
V
 
S
L
 
V
V
 
S
F
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
M
L
 
L
P
x
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
G
S
 
T
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
K
T
 
T
A
 
S
A
 
G
A
 
D
R
|
R
-
x
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
R
H
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
H
S
 
T
V
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
G
R
 
K
S
 
P
A
 
G
S
 
S
G
 
D
E
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
35% identity, 85% coverage: 17:173/185 of query aligns to 86:233/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
H
 
H
R
 
R
G
 
D
P
 
P
V
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
W
S
 
S
G
 
T
T
 
P
M
 
L
L
 
L
F
 
Y
A
 
L
A
 
K
C
 
G
F
 
F
N
 
H
P
 
A
R
 
-
M
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
I
V
 
Q
L
 
S
L
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
T
E
 
H
Y
 
Y
F
 
L
H
 
W
G
 
N
R
 
Q
R
 
N
I
 
R
G
 
K
L
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
L
F
 
Y
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
Q
N
 
I
V
 
S
L
 
V
V
 
A
F
 
F
G
 
D
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
M
L
 
F
P
 
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
E
A
 
T
R
 
S
I
 
V
G
 
I
D
 
E
N
 
N
-
 
D
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
x
L
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
G
S
x
T
E
 
H
P
 
P
E
 
K
I
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
x
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
K
H
 
Y
A
 
A
K
|
K
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
|
V
V
 
V
L
|
L
R
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
P
S
 
E
H
 
Y
S
 
A
V
x
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
V
|
V
P
|
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
x
V

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
41% identity, 74% coverage: 46:181/185 of query aligns to 121:252/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
Y
 
W
F
 
N
H
 
Q
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
A
G
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
A
K
 
I
F
 
F
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
Q
N
 
V
V
 
S
L
 
V
V
 
T
F
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
M
L
 
L
P
x
D
H
 
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
N
 
D
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
G
S
 
T
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
K
T
 
S
A
 
G
A
 
G
A
 
D
R
|
R
-
x
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
R
H
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
H
S
 
T
V
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
G
R
 
K
S
 
P
A
 
D
S
 
S
G
 
D
E
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8i09A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with butyl gallate (see paper)
43% identity, 70% coverage: 46:175/185 of query aligns to 120:245/246 of 8i09A

query
sites
8i09A
Y
 
W
F
 
N
H
 
K
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
A
G
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
A
K
 
I
F
 
F
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
Q
N
 
V
V
 
S
L
 
V
V
 
S
F
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
M
L
 
L
P
x
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
|
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
G
S
x
T
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
K
T
 
T
A
 
S
A
 
G
A
 
D
R
|
R
-
x
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
R
H
 
G
A
 
A
K
|
K
I
|
I
G
|
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
|
L
R
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
H
S
 
T
V
 
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
G
R
 
K

Sites not aligning to the query:

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
44% identity, 68% coverage: 46:170/185 of query aligns to 120:240/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
Y
 
Y
F
 
L
H
 
D
G
 
G
R
 
R
R
 
K
I
 
T
G
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
A
K
 
Y
F
 
F
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
R
N
 
M
V
 
S
L
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
L
P
x
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
N
N
 
N
C
 
I
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
G
S
 
S
E
 
G
P
 
K
E
 
E
I
 
G
G
 
G
F
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
D
A
x
R
R
x
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
S
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
S
H
 
N
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
R
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
S
S
 
I
V
 
T
A
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8i06A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with coa (see paper)
44% identity, 69% coverage: 46:173/185 of query aligns to 121:244/244 of 8i06A

query
sites
8i06A
Y
 
W
F
 
N
H
 
K
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
-
G
 
-
L
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
I
F
 
F
F
 
L
S
 
Q
A
 
N
I
 
Q
N
 
V
V
 
S
L
 
V
V
 
S
F
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
F
 
M
L
 
L
P
 
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
x
L
Q
|
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
G
S
 
T
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
K
T
 
T
A
 
S
A
 
G
A
 
D
R
 
R
-
 
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
R
H
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
H
S
 
T
V
x
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
33% identity, 94% coverage: 4:176/185 of query aligns to 81:247/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
L
 
L
W
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
Q
R
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
F
 
-
L
 
-
C
 
-
G
 
-
H
 
D
R
 
R
G
 
D
P
 
P
V
 
A
S
 
Y
G
 
S
T
 
R
M
 
F
L
 
M
F
 
D
A
 
P
A
 
V
C
 
L
F
 
Y
N
 
L
P
 
K
R
 
G
M
 
F
V
 
H
P
 
A
V
 
I
V
 
Q
L
 
T
L
 
H
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
H
Y
 
W
F
 
L
H
 
Y
G
 
K
R
 
Q
R
 
G
I
 
R
G
 
K
L
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
Y
F
 
Y
F
 
L
S
 
Q
A
 
S
I
 
R
N
 
S
V
 
S
L
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
Q
I
 
T
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
P
 
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
G
S
 
T
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
K
T
 
S
A
 
S
A
 
G
A
 
D
R
 
R
-
 
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
R
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
Q
H
 
C
A
 
S
K
 
K
I
 
I
G
x
A
A
|
A
N
 
G
A
x
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
D
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
H
H
 
N
S
 
V
V
x
T
A
 
V
V
x
A
G
|
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
I
L
x
I
A
 
G
R
 
E
S
 
T

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
36% identity, 90% coverage: 7:173/185 of query aligns to 87:233/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
D
 
D
I
 
V
E
 
S
R
 
Y
Y
 
S
Y
 
H
F
 
C
L
 
L
C
 
L
G
 
N
H
 
Y
R
 
K
G
 
G
P
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
-
F
 
F
A
 
L
A
 
A
C
 
C
F
 
Q
N
 
A
P
 
H
R
 
R
M
 
V
V
 
A
P
 
H
V
 
L
V
 
L
L
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
Y
 
W
F
 
R
H
 
Q
G
 
S
R
 
R
R
 
R
I
 
P
G
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
L
F
 
H
F
 
S
S
 
R
A
 
I
I
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
-
V
 
-
F
 
F
G
 
A
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
K
G
 
G
L
 
I
F
 
L
L
 
F
P
 
D
H
|
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
x
L
Q
 
H
G
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
G
|
G
F
 
T
T
 
G
A
 
G
A
 
D
A
 
R
R
 
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
E
H
 
G
A
 
A
K
|
K
I
 
V
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
|
L
R
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
R
S
 
T
V
 
T
A
 
A
V
|
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
L
L
 
V

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
45% identity, 58% coverage: 66:173/185 of query aligns to 138:243/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
V
 
V
F
 
F
G
 
A
I
 
V
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
A
V
 
A
E
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
K
G
 
G
L
 
I
F
 
L
L
 
F
P
 
D
H
 
H
T
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
C
 
V
T
 
S
I
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
G
S
 
T
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
K
T
 
V
A
 
G
A
 
G
A
 
D
R
|
R
-
x
H
P
 
P
V
 
K
V
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
E
H
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
P
H
 
R
S
 
T
V
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
R
V
 
L
L
 
V

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
43% identity, 54% coverage: 66:164/185 of query aligns to 161:257/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
V
 
V
F
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
G
V
 
T
E
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
N
G
 
H
L
 
F
F
 
F
L
 
I
P
x
D
H
|
H
T
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
W
C
 
C
T
 
R
I
 
V
M
 
Y
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
A
S
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
M
G
 
S
F
 
F
T
 
K
A
 
G
A
 
N
A
 
K
R
|
R
-
x
H
P
 
P
V
 
T
V
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
F
V
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
S
H
 
N
A
 
V
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
N
V
 
I
P
 
D
S
 
Q
H
 
D
S
 
Q
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3q1xA Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-serine (see paper)
37% identity, 76% coverage: 23:163/185 of query aligns to 119:264/267 of 3q1xA

query
sites
3q1xA
G
 
G
T
 
L
M
 
S
L
 
L
F
 
I
A
 
I
A
 
R
C
 
C
F
 
Y
N
 
-
P
 
P
R
 
G
M
 
F
V
 
Q
P
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
H
-
 
V
-
 
L
Y
 
Y
F
 
E
H
 
C
G
 
G
R
 
E
R
 
R
I
 
Y
G
 
-
L
 
Y
L
 
C
A
 
R
K
 
E
F
 
M
F
 
M
S
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
H
V
 
S
L
 
Y
V
 
T
F
 
-
G
 
S
I
 
I
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
G
V
 
A
E
 
S
I
 
I
G
 
K
G
 
G
G
 
H
L
 
F
F
 
F
L
 
I
P
 
D
H
 
H
T
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
W
C
 
C
T
 
R
I
 
I
M
 
Y
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
A
S
 
M
E
x
H
P
 
F
E
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
V
I
 
I
G
 
K
F
 
R
T
 
G
A
 
T
A
 
K
A
x
R
R
x
H
P
 
P
V
 
T
V
 
V
G
 
G
N
 
D
G
 
Y
V
 
V
L
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
S
H
 
H
A
 
V
K
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
D
R
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
D
S
 
S
H
 
N
S
 
Q

3p47A Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-cysteine (see paper)
37% identity, 76% coverage: 23:163/185 of query aligns to 121:266/270 of 3p47A

query
sites
3p47A
G
 
G
T
 
L
M
 
S
L
 
L
F
 
I
A
 
I
A
 
R
C
 
C
F
 
Y
N
 
-
P
 
P
R
 
G
M
 
F
V
 
Q
P
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
H
-
 
V
-
 
L
Y
 
Y
F
 
E
H
 
C
G
 
G
R
 
E
R
 
R
I
 
Y
G
 
-
L
 
Y
L
 
C
A
 
R
K
 
E
F
 
M
F
 
M
S
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
H
V
 
S
L
 
Y
V
 
T
F
 
-
G
 
S
I
 
I
E
 
D
V
 
I
S
 
H
P
 
P
L
 
G
V
 
A
E
 
S
I
 
I
G
 
K
G
 
G
G
 
H
L
 
F
F
 
F
L
 
I
P
 
D
H
 
H
T
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
-
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
W
C
 
C
T
 
R
I
 
I
M
 
Y
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
x
A
S
 
M
E
x
H
P
 
F
E
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
V
I
 
I
G
 
K
F
 
R
T
 
G
A
 
T
A
 
K
A
x
R
R
x
H
P
 
P
V
 
T
V
 
V
G
 
G
N
 
D
G
 
Y
V
 
V
L
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
S
H
 
H
A
 
V
K
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
D
R
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
D
S
 
S
H
 
N
S
 
Q

G3XD01 UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-D-glucuronate N-acetyltransferase; UDP-D-GlcNAc3NA N-acetyltransferase; UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-alpha-D-glucuronic acid 3-N-acetyltransferase; EC 2.3.1.201 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
29% identity, 66% coverage: 49:170/185 of query aligns to 14:149/191 of G3XD01

query
sites
G3XD01
G
 
G
R
 
A
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
S
L
 
D
A
 
S
K
 
R
F
 
V
F
 
W
S
 
H
A
 
F
I
 
V
N
 
H
V
 
I
L
 
C
V
 
A
F
 
-
G
 
G
I
 
A
E
 
R
V
 
I
S
 
G
P
 
A
L
 
G
V
 
V
E
 
S
I
 
L
G
 
G
G
 
Q
G
 
N
L
 
V
F
 
F
L
 
V
P
 
G
H
 
N
T
 
K
V
 
V
G
 
-
T
 
-
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
D
-
 
R
A
 
C
R
 
K
I
 
I
G
 
Q
D
 
N
N
 
N
C
 
V
T
 
S
I
 
V
M
 
Y
Q
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
E
T
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
F
S
 
C
E
 
G
P
 
P
E
 
S
I
 
M
G
 
V
F
 
F
T
 
T
A
 
N
A
 
V
A
 
Y
R
 
N
P
 
P
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
Y
-
 
R
-
 
N
-
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
K
N
 
K
G
 
G
V
 
A
L
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
C
K
 
T
V
 
I
I
 
V
G
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
E
H
 
Y
A
 
A
K
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
N
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
S
H
 
Y
S
 
A
V
 
L
A
 
M
V
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A

4mzuB Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
32% identity, 42% coverage: 96:172/185 of query aligns to 49:139/290 of 4mzuB

query
sites
4mzuB
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
C
 
V
T
 
T
I
 
I
M
 
K
Q
 
S
G
|
G
V
 
V
T
 
Q
L
 
I
G
 
W
T
 
D
S
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
x
F
-
 
I
E
 
G
P
 
P
E
x
N
I
 
V
G
 
T
F
 
F
T
|
T
A
x
N
A
x
D
A
x
K
R
 
Q
P
|
P
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
T
V
 
I
V
 
V
G
 
K
N
 
K
G
 
G
V
 
A
L
 
S
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
N
A
 
S
K
 
T
V
 
I
I
 
L
G
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
I
G
 
G
D
 
E
H
 
N
A
 
A
K
 
M
I
 
V
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
x
T
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
D
H
 
N
S
 
A
V
 
I
A
 
V
V
x
I
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
G
T
x
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
37% identity, 43% coverage: 95:173/185 of query aligns to 98:183/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
R
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
H
C
 
C
T
 
M
I
 
F
M
x
A
Q
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
H
L
 
I
G
x
Y
T
 
T
S
x
A
-
 
T
-
x
H
-
 
P
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
V
E
 
E
P
 
R
E
 
N
I
 
S
G
 
G
F
 
K
T
 
E
A
 
Y
A
 
G
A
 
K
R
 
P
P
 
V
V
 
K
V
 
I
G
 
G
N
 
N
G
 
N
V
 
V
L
 
W
I
 
V
G
|
G
A
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
I
V
 
I
I
x
N
G
 
P
G
 
G
I
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
N
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
x
A
A
x
S
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
x
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
N
H
 
N
S
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
G
G
 
G
V
x
N
P
 
P
A
 
A
T
 
K
V
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
35% identity, 44% coverage: 95:175/185 of query aligns to 96:183/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
R
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
C
 
V
T
 
M
I
 
L
M
x
A
Q
 
P
G
 
N
V
 
V
T
 
Q
L
 
I
G
 
Y
T
 
T
S
 
A
E
 
Y
P
 
H
E
 
P
I
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
S
G
 
G
F
 
I
T
 
E
A
 
Y
A
 
G
A
 
S
R
 
P
P
 
V
V
 
K
V
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
N
V
 
V
L
x
W
I
 
I
G
|
G
A
x
G
G
 
G
A
 
V
K
 
I
V
 
I
I
 
T
G
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
N
A
 
V
K
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
S
 
P
H
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
V
|
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
C
T
 
R
V
 
V
L
 
I
A
x
K
R
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_041100910.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041100910.1
MTKLWLDIERYYFLCGHRGPVSGTMLFAACFNPRMVPVVLLRLAEYFHGRRIGLLAKFFS
AINVLVFGIEVSPLVEIGGGLFLPHTVGTVIGAARIGDNCTIMQGVTLGTSEPEIGFTAA
ARPVVGNGVLIGAGAKVIGGITVGDHAKIGANAVVLRDVPSHSVAVGVPATVLARSASGE
PDGPK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory